1BDGA

Hexokinase from schistosoma mansoni complexed with glucose
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
445
structure length
444
Chain Sequence
FSDQQLFEKVVEILKPFDLSVVDYEEICDRMGESMRLGLQKSTNEKSSIKMFPSYVTKTPNGTETGNFLALDLGGTNYRVLSVTLEGGKSPRIQERTYCIPAEKMSGSGTELFKYIAETLADFLENNGMKDKKFDLGFTFSFPCVQKGLTHATLVRWTKGFSADGVEGHNVAELLQTELDKRELNVKCVAVVNDTVGTLASCALEDPKCAVGLIVGTGTNVAYIEDSSKVELMDGVKEPEVVINTEWGAFGEKGELDCWRTQFDKSMDIDSLHPGKQLYEKMVSGMYLGELVRHIIVYLVEQKILFRGDLPERLKVRNSLLTRYLTDVERDPAHLLYNTHYMLTDDLHVPVVEPIDNRIVRYACEMVVKRAAYLAGAGIACILRRINRSEVTVGVDGSLYKFHPKFCERMTDMVDKLKPKNTRFCLRLSEDGSGKGAAAIAASC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hexokinase
molecule keywords HEXOKINASE
publication title The structure of mammalian hexokinase-1.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 148
structure length 444
sequence length 445
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1998-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bdgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1bdgA01
3AAPA 2P9PA 4PL7A 4IJAA 5AR0A 1BG3A 1NGEA 3VEVA 2YCHA 1YUWA 3GBTA 2A40A 3WUHA 5JMVA 3VF6A 3L6QA 3VGLA 4DCHA 3LDQA 3QBWA 4ISEA 3R8EA 1U2VB 4BC4A 4H0TB 1Q18A 1T6CA 2YHWA 3C0BA 4QS7A 5AQVA 4RWTA 2FSJA 5JLHA 3H46O 1RDWX 4ISGA 4H0PA 2GWJA 1HUXA 2V7ZA 3H6EA 2EWSA 4BR0A 5BRDA 4BRHA 5F0XA 3FR0A 3EZWA 3O80A 4J8FA 1IJJA 5F2RA 2IVNA 4RTFD 5BPNA 2IIRA 3EN9A 4H5VA 3BF1A 4BROA 4H03B 5AQFA 1C0GA 2QXLA 3HSCA 4BRAA 4B1UB 1HKCA 4B1WB 3D2FA 1GLFO 5AFUH 2P9SB 5JICA 2YI1A 3G25A 4BRNA 1DGKN 3MDQA 3WXLA 3VENA 1MWKA 5AQRA 3I8BA 1TUUA 3A5OC 3D2EB 3FE1A 2ZF5O 3O4WA 5BPMA 4EFHA 3UKUA 2GWKA 4NO7A 3KVGA 1S22A 3U9ZA 2YHXA 3P4IA 4BC2A 2HF3A 3ATVA 3KHYA 3MN7A 2AP1A 5FPMA 4CBWA 5F1XA 4WQ4C 4IXCA 2QWPA 2FF3B 2Q1NA 3SJHA 3ID8A 3FGUA 2IVOA 1ZXOA 4A61A 4JAXA 4B9QA 3A8YA 3LDOA 3SK3A 4CZIA 4FWNA 3CJCA 5AQZA 2UYTA 3WXIA 4BRGA 1ZC6A 3GE1A 5FPNA 3SLCA 3HI0A 3H45C 4BRMA 4DQ8A 3EKSA 2V51B 5JLFA 4MLHA 1NGDA 3GOIA 3LDPA 4H5NA 3L4IA 3AARA 4PL8A 3D2FB 4CZEA 1GLCG 3UKRA 1E4GT 2W40A 3ENOA 2QWQA 1H1VA 3W3DA 4EAHD 1KAZA 2ZGYA 3ZEUA 4FPAA 3UKUB 5AQLA 4PKIA 1NMDA 3H3OB 2Q31A 2KHOA 3CJAA 3EO3A 3LL3A 3M6GA 4H0VB 3RSEA 3CJ1A 2E1YA 1JCFA 3CJ7A 1CZAN 3VEOA 4BRFA 1JCGA 3BUZB 1QZ5A 4JN4A 1MWMA 1NWKA 4XEIA 3WT0A 4H5WA 3EKUA 4CD3A 1X9JA 1BUPA 1YAGA 4FWSA 3MMVA 2H3GX 1LOTB 2E2PA 5AQWA 4EIAA 2VCPA 5FPEA 1QHAA 1C0FA 3I33A 3BEXA 4GY2B 2HOEA 2GTDA 4ISFA 3FZLA 2Q97A 2F9WA 3DXKA 1G99A 2P9NA 3B8AX 4BREA 3LDLA 4RCHA 4FWOA 4EHTA 3U4LA 3DAWA 3VGKA 5AQQA 3UKRB 3JS6A 4CJ7A 3C7NB 3MN5A 1WUAA 3VEYA 3ZETA 4BRIA 2P9LA 5E84A 3CJ9A 3ULEA 2A42A 4CZMA 1ATNA 1GLJO 2FSNA 1GLLO 4XH4A 4H5RA 4CZLA 1GLBG 4BC3A 3H3NO 5BPLA 5LJVA 3H1QA 3CQYA 4L3QA 5LY3A 4A2BA 5EOYA 3EL2A 5BN8A 2P9IA 1BU6O 3M3ZA 4H5TA 4FWMA 2E88A 5AQPA 1X3MA 2QWLA 5AZJA 4BR7A 3CHWA 1LCUA 4XH5A 3R9PA 3L0QA 4CZKA 2P9PB 3FZHA 4F9OA 3VF4A 4M7XA 2CGKA 4H0OA 3HBTA 3QICA 4FOIA 3GDQA 3W0LA 4MLEA 2P9NB 1NGAA 3R6MA 1NGGA 2A3ZA 3CJBA 1HLUA 4QS9A 4BRCA 2E20A 2IVPA 4JHDA 4FWPA 5ADXA 2FSKA 2P9UA 2D0OA 3GG4A 2P9LB 1QQNA 2Q36A 3F9MA 2YJFA 4YDUC 3FFKB 3GL1A 1Y64A 3MCPA 3MK6A 1RFQA 4BRQA 3IFRA 2AA4A 2QW9A 1KAXA 5AQNA 2PBDA 2HF4A 5KPRA 2HMPA 1ATRA 1MDUB 1S3XA 2P9IB 5I9EB 2E1ZA 2QWRA 3QBXA 4WQ4A 2BTFA 4FPBA 4Z94A 3SMSA 3CERA 3VERA 5AZIA 5E26A 1BO5O 1R59O 5KPTA 1GLDG 1XUPO 1ZBSA 4BR2A 1Z05A 4FL9A 4BVOA 4YDUA 3DJCA 2A5XA 4IO8A 2ASOA 1ATSA 2YJEA 4AM6A 4JHDB 3QMLA 4K43A 1BA1A 1QQMA 5KPZA 3A5LC 1HX1A 2P9UB 4B1YB 4PKGA 1KXPA 2NLXA 1MA9B 3HZ6A 3VETA 3A0IX 2QWNA 3OHRA 3LM9A 3CI5A 3TPQA 4EHUA 1GLEG 4E1JA 5EVZA 3VPZA 2A6AA 3J8AA 1NGIA 1YXQA 5AQKA 1XC3A 3VEXA 4JNEA 5BREA 1NBWA 1SQKA 3BF3A 4FWQA 1Z6RA 3O5BA 1QZ6A 1SZ2A 4BQLA 2W41A 4BR5A 2E2OA 1BOTO 5AQJA 1ESVA 2QWMA 5AQXA 3AY9A 1NLVA 2P9SA 1TYQA 4MO4A 5ELZA 5AZIB 4PKHA 4IZ9A 3TU5A 4FOEA 4A62A 2CGJA 3IMXA 2I7PA 3SMPA 5ADXH 2FF6A 3ZEUB 4M7YA 3KZBA 3A5NC 5B8HA 3FZFA 1P8ZA 3D7EO 1BWFO 5AQUA 4BG8A 4BGAA 5AQSA 2CH6A 4C23A 4GNIA 3MN9A 2J4RA 2VYPA 3RSEB 4FWLA 1HPMA 5AQYA 2QM1A 4BC5A 2NRHA 4BRKA 1DKGD 5AQTA 1U6ZA 3IDHA 4BR4A 4A2AA 3ZX0A 1BA0A 4I6MA 4K41A 4Y0WA 5LJWA 1BDGA 3WQTA 2WUSA 1NGJA 3LDNA 2BUPA 4HWIA 5TKYA 1KAYA 4LC9B 4B1ZA 4JD2A 1DEJA 3ATUA 5BR9A 2A41A 1RGIA 1WOQA 1XQSC 4BR9A 2GEMA 3VEZA 4BRLA 4XH1A 5AQOA 3U9DA 4HTLA 3WXJA 4FWRA 4FSVA 3DXKB 1NM1A 3UE5A 2FXUA 4BRDA 4AM7A 2CH5A 5AQMA 1TYQB 2P9KA 3DXMA 2YHYA 1TUYA 4O8KA 5AQHA 4CI6A 2ASPA 2ZWHA 2FLOA 2GUPA 3ZETB 5AQIA 4K25A 4O5FA 3ULEB 3FZMA 3VGMA 4DB3A 3QDKA 4WQ5C 5FPDA 2D4WA 3WXKA 1GLAG 2D0PA 5KQ8A 4CZGA 4DHYA 3FLCO 3H1VX 1NGCA 3UB5A 2V52B 2D1KA 3HM8A 3O6WA 5BN9A 4BG9A 4CD1A 2CGLA 3JXUA 1X3NA 3VF2A 2E2QA 3ENHA 1EQYA 4I6MB 5AZJB 4CZHA 4BRPA 4B1VA 4H0XB 1HKGA 4K42A 3WQUA 1NGHA 3VEWA 1K8KA 2ITMA 3VOVA 1YVNA 1JCEA 2Q0RA 1NGBA 1V4SA 3QFPA 3WEEA 5BRHA 3O1WA 2E2NA 4JD2B 4CBXA 3S41A 2F9TA 4WQ5A 2GELA 1T44A 4BVPA 2ASMA 3ZX3A 1D4XA 3BP8A 5AFUA 5KQDA 4IJNA 5CE3A 4CBUA 3A5MC 5EY4A 3AAQA 2E8AA 4MO5A 1U2VA 2P9KB 5EXWA 2QWOA 3DXMB 3C7NA 2NZTA 1E4FT 3QFUA 3ZX2A 3CQXA 3IUCA 2OANA 3M1FA 3QB0A 3O08A 4CZFA 4KBOA 3CETA 3O1BA 2DPNA 4NB4A 2I7NA 2ZGZA 4QS8A 4FO0A 3DWLA 5EX5A 1J6ZA 1OKJA 4CZJA 2VWBA 1V4TA 2V7YA 3U8XA 5AQGA 3VESA 1HKBA 1QQOA 1NGFA 4H0YB 3MN6A 2Q0UA 4BQZA 4BGBA 4WYBA 4M63C 3LM2A 4FWKA 2Q2RA 3HTVA 1IG8A 1HJOA 4B1XB 3CIPA 1SAZA 5BRFA 1K8KB 3O8MA 1T6DA 3D2EA 4IWVA 3FZKA 3WEEB 2PAVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WSJA 1J53A 4J2DA 2QKBA 5AR0A 1BG3A 1IBKK 4CEDA 1BISA 3L6QA 3VGLA 3VA0A 4KHNA 1X1PA 1NMNA 4RW4A 4DSEA 3HVTA 1Q18A 3ZLJA 3LAMA 2HHQA 1QSYA 2V7ZA 3NAEA 2VQFK 5FDLA 3KLEA 4JS5A 4IEIA 1RT1A 4BRHA 5BRDA 3V9ZA 4FLVA 2E6LA 3M8RA 4DV6K 3KKRA 4CK3A 3EN9A 5AQFA 1C0GA 2XY8A 3AVKA 4KH4A 4M45A 4GVEA 3CM5A 2O8CB 4B1WB 3DOKA 2KZMA 1GLFO 3BGRA 4ELUA 5H1SQ 4IKFA 3TANA 1KLNA 3VENA 3CCJN 3T3FA 4HUEA 4DS4A 5GIPA 2ZJRL 2OTJN 3D2EB 3O4WA 3EEQA 3O9UA 1DT9A 4E1NA 3KVGA 1S22A 4CHNA 1FKPA 1LWEA 4BC2A 2G8KA 3ATVA 1KD1O 5HROA 4UY8O 5FPMA 4E1MA 5GAHP 4OPJA 1RBRA 1HMVA 2NNWA 3LPUA 2BDPA 3E9LA 2FF3B 3LDSA 4ZHRA 4B9TA 1BCOA 4FLWA 4AILC 4F2RA 4KRFA 2BANA 3A8YA 3TAQA 3LDOA 3SK3A 2O8BB 4KH5A 4FWNA 2HNZA 3CJCA 1Y97A 3EY1A 3SUNA 4ELVA 3CCLN 3U3GA 4BRMA 2WTUA 4DQ8A 3ULDA 2UXCK 2RHKA 4ILHA 4JI6K 3RTVA 3ZSXA 2PYLA 4LF8K 3L4QA 4H5NA 4PL8A 3AO3A 2BE2A 1E4GT 2NRWA 3K57A 3VQQA 1P90A 2O8EB 3UKUB 5AQLA 4CJSA 1MU2A 2KTQA 2P51A 3H3OB 2KHOA 3EO3A 3PO5A 4JI8K 4O44A 4YOXA 2E1YA 3CJ7A 4MFBA 1CZAN 4FZYA 4BRFA 1QZ5A 1MWMA 4DTMA 1W9HA 2Z1JA 4FK4A 4K0KK 3C65A 5C24A 2KW4A 2Q3SA 4DTUA 4TSXA 2E2PA 4CF1A 3RR7A 2VCPA 5FPEA 3I55N 3E66A 4DG1A 4WFAL 3R3LA 3OS0A 3NF6A 3SAHA 3FZLA 4BY9C 4B9VA 4BACA 4DWIA 3SQ2A 2D0BA 4FW1A 1G99A 2P9NA 4FWOA 4GMJB 3U4LA 3DAWA 3VGKA 4YORA 1UA0A 1WUAA 1YJWN 4OO1J 5CHIA 5E84A 2A42A 3SV4A 1W7AA 3K5LA 1GLLO 1YI2N 3RRGA 4H5RA 4BC3A 1DTTA 3H3NO 2G8WA 5BPLA 4IOXA 4FLXA 4KHSA 3H1QA 4E7KA 4M3XA 2OCEA 3QIOA 4A2BA 3E1YA 2P9IA 3H08A 3OYKA 3M3ZA 2E88A 2IS3A 4CJVA 4CJLA 1X3MA 3B6OA 4BR7A 4OPHA 4DFPA 2E6MA 4CE9A 2P9PB 4IO9L 4FXDA 1N8RO 3CPWM 4M7XA 4DR4K 1JL2A 2HW3A 1BI4A 1ZBLA 1NGGA 1QE1A 2IVPA 2HNDA 3JAMO 3WNGA 4KHUA 1NOYA 2P9UA 4AHTA 3THWA 2JWKA 1J5OA 4C1NK 1JLCA 1JKHA 2ZE2A 3GL1A 4KHQA 4J2BA 4NLCA 1KVBA 5HRPA 1U45A 3D0PA 1UWBA 2VWJA 2HF4A 5KPRA 1TL1A 2YV0X 2HMPA 3P83D 3CFOA 4CEBA 3KJVA 2OPPA 1TVRA 3QBXA 4FPBA 1VSDA 4IG0A 5E26A 3AGKA 4JI5K 1BO5O 1R59O 4F4KA 4ZTJA 1GLDG 2NUBA 4JKAA 3DLEA 1ZBSA 1VSMA 1BGXT 4BR2A 2YNFA 3L2RA 3L2QA 1VQ6N 2OPSA 3ZYYX 3KK1A 1J5EK 1VQPN 1C6VA 3AVFA 1Z25A 4U67L 2ASOA 3QERA 4MDAA 4JKCA 1M1KO 3OBYA 5KPZA 1BA1A 1QQMA 4CFBA 3A5LC 3SAGA 1WSHA 4PKGA 2NLXA 2W6KA 3T19A 4YFUA 1LAVA 3OHRA 2DY4A 4IEEA 3K5MA 4B08A 1VQ7N 3ASMA 5AQKA 1VQLN 5BREA 1XHXA 3BF3A 4B9MA 4FWQA 1Z6RA 3TAGA 5E41A 1IV0A 2W41A 1NK4A 2VG6A 3MAQA 3VTHA 2QWMA 3DOLA 1RBVA 1YTUA 3MEEA 3AY9A 3AO4A 1IH7A 3J7AP 1J54A 3DLLL 4FK2A 2HHTA 3AVNA 2B6AA 3N4PA 4KHYA 3TAFA 3K5OA 3CMEN 3O3FA 4HUGA 2UUCK 4FJGA 2ITGA 2CH6A 4G1QA 5AQSA 1TKDA 1TAQA 3P39A 1HPMA 1U48A 4B3SK 4BC5A 4BE0A 1VQKN 4BRKA 3LP1A 1DKGD 4RW7A 1N5YA 1Q82O 3HYFA 4I6MA 3NBPA 4NYNA 3O9TA 5TKYA 5HLFA 3IAYA 3TAMA 4HCBA 4PQUA 1FKOA 2A41A 1RGIA 2GEMA 1K8AO 2HHVA 2E4LA 5CYMA 4HTLA 3U9DA 3NVMA 4FSVA 3CCMN 5GAEP 1NM1A 3DMJA 1JLFA 3UE5A 1ITGA 1VK0A 5AQHA 2ZWHA 3VA3A 3C6AA 2A1RA 5M1OA 5CZ2A 3PO4A 4NLBA 3VGMA 3QDKA 4HCCA 5FPDA 3WXKA 1GLAG 4CGFA 2D0PA 4FM0A 4DSLA 3KKSA 5KQ8A 4CJTA 2KKZA 4CZGA 1NGCA 3UB5A 4FLZA 1Q9XA 3RMCA 4BG9A 3HXMA 3JXUA 3VF2A 1OVQA 2E2QA 3ENHA 5DMRA 3HPGA 4DFKA 4FJIA 1RT3A 3WQUA 3VEWA 2ITMA 4JKGA 1V4SA 3K2PA 4JD2B 4CJEA 1WB9A 1BIZA 3S41A 2GELA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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