1BNWA

Carbonic anhydrase ii inhibitor
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Structural analysis of inhibitor binding to human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
total genus 73
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bnwA00
4K0TA 3RZ0B 1BZMA 4XZ5A 5G0CA 3K34A 4ILXA 1KEQA 2Q1BA 5E2MA 1FR4A 3KOIA 2GEHA 1XQ0A 1AM6A 3M2NA 1CNKA 4Z1NA 3DVDA 4MLTA 5SZ1A 3M96A 4XIWA 4E3HA 3P4VA 4LHIA 3R16A 5EZTX 4Q6EA 2CBAA 5JESB 4QK3A 5FDIA 3MNIA 1FLJA 3SBIA 4RUXA 2HKKA 3DAZA 3ML2A 4GL1X 1HUHA 1RZEA 3DC3A 4YXUA 4YXOA 2EU3A 4Y0JA 6CA2A 4ZX0A 3KOKA 5FLOA 2VVBX 4WW6A 1CAIA 1V9IC 5A6HA 4QEFA 3DVCA 5DSLA 5EH5A 4IDRX 2HD6A 3K2FA 4G0CA 5JGSB 1OKNA 2NXRA 3S76A 1G54A 1YO2A 1KWQA 3S78B 3DV7A 3RZ7A 1CNYA 5FLSA 4M2UA 5AMGA 3N4BA 3N2PA 1ZH9A 2QP6A 4M2WA 3JXHC 5AMLA 3MNHA 4TWLA 2WEOA 2NNGA 1YO0A 4YWPA 3CAJA 4HT2A 4CACA 3M1KA 1T9NA 1H9QA 4Q8XA 3KWAA 1YDCA 4Q99A 2HNCA 5SZ2A 3M98A 1CAOA 5FL5A 1DCBA 3P3HA 5JQ0A 3IBIA 4FL7A 4Q9YA 1CVAA 1AZMA 1BN4A 4Q81A 4YGLA 2WEGA 4E9OX 1RJ6A 5CLUA 4L5WA 3MDZA 1OKLA 1HEDA 1BNMA 3V3JA 1TB0X 5A25A 1CVEA 5JEHB 5DOGA 3OILA 3TVNX 1UGBA 5FNMA 2Q38A 4CQ0A 3OYSA 1G6VA 5EIJA 1DMXA 3KS3A 5EKJA 4PYXA 1FR7A 2NNSA 4JSWA 4Z1KA 4YVYA 5DSNA 4YHAA 3T85A 4QIZA 4WL4A 5BNLA 3RZ1B 3IAIA 5HPJA 3S75B 4YGNA 5FNIA 3JXFA 1LZVA 3S97A 4IWZA 4WUPA 3FE4A 4N16A 4HBAA 3RYVB 1YDBA 2CBEA 4K13A 4Z1EA 4C3TA 5JGTB 1RZBA 1BNNA 1F2WA 5SZ4A 1TBTX 3NJ9A 4L5VA 1UGDA 3M2YA 4Q0LA 3PYKA 1CNCA 5DSQA 5BRVA 4QK1A 1V9EA 4RFDA 1CNHA 4COQA 4YXIA 4CNXA 4KUYA 1DMYA 1Y7WA 5E2NA 1UGEA 2H15A 4RFCA 4BCWA 1LG5A 5FLPA 3W6IA 2NXTA 4BF1A 1JCZA 1CCSA 3U7CA 4E3DA 3PJJA 3U45X 1FSNA 4FRCA 1ZSCA 1Z9YA 3D93A 3S71B 3M2XA 4LU3A 3ZNCA 4HT0A 4ITOA 5JG5B 2NMXA 5FL6A 4MDMA 5DSKA 4Q7SA 2X7SA 5BRWA 1OKMA 4E3FA 3KNEA 4ZX1A 3V3HB 1G46A 4RIUA 5SZ0A 5E5RA 1CNJA 3MNAA 3T5ZA 3V2MA 1CVHA 4MDGA 1IF6A 1FQMA 1OQ5A 3DC9A 3LXEA 3M5TA 2CA2A 3V5GA 1CVFA 1CNXA 3HKTA 4FIKA 4QJPA 5G03A 4E3GA 4QSAA 4DZ9A 2W2JA 4E4AA 1I9OA 3KIGA 3M67A 3OYQA 1CILA 5DSOA 3BL1A 4XIXA 2Q1QA 4Q7VA 3M1QA 3P58A 4RIVA 1FQNA 4JSAA 4M2RA 1URTA 2H4NA 1I9MA 1FSQA 3S73B 3HLJA 4Q8ZA 4KNJA 4WW8A 1I9QA 3V2JA 3RYZA 4FVOA 5JEGB 1G0EA 2FOVA 3DCWA 1H9NA 3ZP9A 2AW1A 3Q31A 2WD3A 4Q7PA 4HU1A 3U47A 1TH9A 1XEGA 1LG6A 1CNWA 3RG3A 1Z97A 3TVOX 2FOQA 3D8WA 2NWZA 3F4XA 1IF7A 1G1DA 3SBHA 4TWMA 3PO6A 1HCAA 3TMJA 2FOYA 2NWPA 1I9LA 3P5AA 3RYYA 1TG3A 3RGEA 1UGFA 1CVCA 1IF5A 1KOQA 1TE3X 3D92A 4ZWXA 1RZAA 4MLXA 2POVA 5EOIA 5G01A 5SZ3A 1EOUA 1MOOA 4RUYA 3UYQA 3M14A 2EZ7A 5EHVA 3MHOA 1J9WA 3R17B 1CAYA 4MTYA 1BICA 4UOVA 4M2VA 2HL4A 3MMFA 1BNTA 3CA2A 3T84A 4QJWA 5E2SA 4E49A 1CAJA 1KWRA 1CCUA 3DD8A 5DSPA 1LGDA 2NWYA 3M1WA 3M2ZA 3N3JA 5FL4A 5DSMA 4Q07A 5FNLA 3SAXA 1CA2A 3HS4A 4YX4A 2FOSA 5SZ6A 3IBUA 1FQRA 4K0SA 4LP6A 1IF8A 2HFWA 5DOHA 1BNQA 1RAZA 4Q09A 3OIKA 3V3IB 3RZ8A 1CVBA 1JD0A 1G48A 1I9PA 3M5EA 4PQ7A 4HEYA 5BRUA 1ZNCA 1BN3A 3FW3A 4CNWA 4QY3A 1UGAA 3NB5A 4QJ0A 4MDLA 4ZWIA 5J8ZA 1HEAA 1AVNA 1BNUA 5EH8A 1YDAA 3GZ0A 2QO8A 5IPZA 3L14A 5JQTA 1ZSBA 4RUZA 3RYJB 4KV0A 4HEZA 3DD0A 5EKHA 2EU2A 3V3GB 2AX2A 4YGKA 3K7KA 4Q49A 5FLRA 1CAZA 4N0XB 3P55A 4KNMA 2ZNCA 1ZGEA 2X7TA 4MO8A 4QJOA 2FMZA 1CA3A 4KUWA 3MNJA 2WEHA 3MYQA 2WEJA 3DBUA 3V3FA 1FSRA 3VBDA 3S72B 1A42A 1G4OA 4Q90A 1ZE8A 2OSMA 5FNJA 4KUVA 3S8XA 8CA2A 1BV3A 4FPTA 5FLQA 1RZCA 4ZWZA 4ITPA 2FNMA 3EFTA 5EHEA 1ZSAA 1G3ZA 3DCSA 4KP5A 3IGPA 3MHMA 3IEOA 4WUQA 3RZ5A 1H4NA 4QK2A 1I91A 4KNIA 5FNHA 3OIMA 2HOCA 1THKA 3OY0A 4FU5A 4BF6A 2WD2A 1HEBA 3DVBA 1YDDA 1CNBA 3P44A 3M04A 3RYXB 2FW4A 3F7BA 3OKUA 3S74B 5SZ7A 3MNKA 5EH7A 5E2RA 5CACA 1CVDA 3B4FA 4CA2A 2FMGA 4PXXA 3OKVA 5DSRA 3F7UA 3DCCA 1I90A 4HEWA 4JSZA 1G0FA 2NNVA 2FNNA 4Q08A 1MUAA 1IF9A 1G52A 4KP8A 3MZCA 3M40A 1LUGA 4KAPA 1CIMA 3HKNA 3HKUA 4PYYA 3U3AX 3ML5A 2POWA 2F14A 2NXSA 5CA2A 1CINA 3MHCA 4QSIA 1XEVA 3C7PA 1I8ZA 3NI5A 1TG9A 3IBNA 1ZGFA 3MHIA 4QJMA 1HECA 5FLTA 1CAKA 2NN1A 4KNNA 4RN4A 5FNGA 5EKMA 3KLDB 5E5UA 4XFWA 1CAHA 3N0NA 5C8IA 3QYKA 1XPZA 1HVAA 4K1QA 5E28A 3DA2A 2VVAX 3BETA 4WR7A 3W6HA 1Z93A 5JG3B 1CCTA 3HKQA 3KONA 1CZMA 3P5LA 4Q8YA 1I9NA 4Q78A 1CALA 3CZVA 5FNKA 3T82A 1ZFQA 1CNIA 4HF3A 4PZHA 4QTLA 3MHLA 2ABEA 4R59A 1BNWA 3MNUA 1CNGA 2ILIA 1TEUX 3M1JA 3CYUA 3F8EA 2NN7A 2NNOA 3MWOA 4JSSA 1BNVA 1RZDA 5CJFA 4X5SA 5DSIA 4Z0QA 4ETQC 5DRSA 3P3JA 2X7UA 4R5BA 1IF4A 4R5AA 4DZ7A 5BYIA 1G4JA 2GD8A 4G7AA 2O4ZA 4YGJA 5EHWA 1BCDA 5SZ5A 1JV0A 5DVXA 5L6KA 1CAMA 4Q83A 3IBLA 1G45A 5G0BA 1BN1A 3HFPA 5JDVB 4Q6DA 3T83A 1UGCA 3S77B 3EFIA 4CNRA 1HCBA 4YYTA 5E2KA 1HUGA 2FOUA 2CBCA 2FNKA 3JXGA 4Q06A 1CRAA 2CBBA 4Q7WA 7CA2A 1CRMA 4K0ZA 3FFPX 4QSBA 3BL0A 4QIYA 2OSFA 4L5UA 5DSJA 4ZWYA 3SAPA 3M3XA 1G53A 4QSJA 4YGFA 1TTMA 1ZFKA 2IT4A 4Q87A 1RJ5A 4XE1A 3KKXA 4E5QA 3RLDA 4RH2A 3T5UA 2NWOA 3B1BA 3D9ZA 4QJXA 5FDCA 4CNVA 1YO1A 2QOAA 1CANA 3RG4A 1DCAA 3D0NA 4JS6A 4Z1JA 2CABA 3RJ7A 1FQLA 4ZAOA 3M5SA 2POUA 1UGGA 5AMDA 12CAA 5JEPB 9CA2A 5LMDA 2CBDA 3S9TA 3V7XA 1RAYA 1KOPA 1TEQX 5L3OA 4FVNA 3UYNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4K0T A;  3RZ0 B;  1BZM A;  4XZ5 A;  5G0C A;  3K34 A;  4ILX A;  1KEQ A;  2Q1B A;  5E2M A;  1FR4 A;  3KOI A;  2GEH A;  1XQ0 A;  1AM6 A;  3M2N A;  1CNK A;  4Z1N A;  3DVD A;  4MLT A;  5SZ1 A;  3M96 A;  4XIW A;  4E3H A;  3P4V A;  4LHI A;  3R16 A;  5EZT X;  4Q6E A;  2CBA A;  5JES B;  4QK3 A;  5FDI A;  3MNI A;  1FLJ A;  3SBI A;  4RUX A;  2HKK A;  3DAZ A;  3ML2 A;  4GL1 X;  1HUH A;  1RZE A;  3DC3 A;  4YXU A;  4YXO A;  2EU3 A;  4Y0J A;  6CA2 A;  4ZX0 A;  3KOK A;  5FLO A;  2VVB X;  4WW6 A;  1CAI A;  1V9I C;  5A6H A;  4QEF A;  3DVC A;  5DSL A;  5EH5 A;  4IDR X;  2HD6 A;  3K2F A;  4G0C A;  5JGS B;  1OKN A;  2NXR A;  3S76 A;  1G54 A;  1YO2 A;  1KWQ A;  3S78 B;  3DV7 A;  3RZ7 A;  1CNY A;  5FLS A;  4M2U A;  5AMG A;  3N4B A;  3N2P A;  1ZH9 A;  2QP6 A;  4M2W A;  3JXH C;  5AML A;  3MNH A;  4TWL A;  2WEO A;  2NNG A;  1YO0 A;  4YWP A;  3CAJ A;  4HT2 A;  4CAC A;  3M1K A;  1T9N A;  1H9Q A;  4Q8X A;  3KWA A;  1YDC A;  4Q99 A;  2HNC A;  5SZ2 A;  3M98 A;  1CAO A;  5FL5 A;  1DCB A;  3P3H A;  5JQ0 A;  3IBI A;  4FL7 A; 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