The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
AKQDYYEILGVSKTAEEREIRKAYKRLAMKYHPDRNQGDKEAEAKFKEIKEAYEVLTDSQKRAAYDQYGHAAFEQGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
|
| molecule keywords |
DNAJ
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| publication title |
The influence of C-terminal extension on the structure of the "J-domain" in E. coli DnaJ.
pubmed rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
11
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| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-08-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2M6Y A; 2Y4T A; 2YS8 A; 3UO3 A; 1GH6 A; 4J7Z A; 2DN9 A; 2N05 A; 2N04 A; 3APQ A; 2DMX A; 2LGW A; 1BQ0 A; 2QWQ B; 2QWO B; 3APO A; 2CTQ A; 2KQX A; 1WJZ A; 2EJ7 A; 2CTP A; 2Y4U A; 1FPO A; 3AG7 A; 2YUA A; 2CTW A; 1FAF A; 1N4C A; 2QSA A; 1BQZ A; 1NZ6 A; 4IT5 A; 3UCS C; 2GUZ B; 1XBL A; 2CUG A; 4J80 A; 1HDJ A; 2QWN B; 2CTR A; 2GUZ A; 2L6L A; 2QWR B; 3UO2 A; 2OCH A; 2PF4 E; 2QWP B; 3BVO A; 2LO1 A; 4RWU A; 1IUR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4O2A A; 2WLM A; 4PA7 A; 2W6J G; 1THZ A; 5LMN B; 3KCY A; 3K5O A; 2BCC H; 2P06 A; 4J10 A; 3CXH F; 3LNM B; 3ASN B; 4GCZ A; 3DC5 A; 2QKA A; 4DUZ B; 4DV0 O; 1H2S B; 2HG5 C; 2P7T C; 1FS0 G; 3K06 A; 3P32 A; 4LH6 A; 5KA6 A; 1UFI A; 1QCE A; 1BSM A; 1TUB B; 3JAK B; 5EBL C; 4BWA A; 4DV3 O; 3H1K H; 2JIZ G; 3AG3 C; 5ITZ A; 4NXM O; 1LUV A; 2GDS A; 2YXY A; 3CCS V; 5IJ9 B; 1QNM A; 2CTW A; 3M8A A; 1OCR C; 1L0N H; 4DUY B; 3OE7 G; 4FM2 A; 4HAM A; 2B1G A; 2QWR B; 3K58 A; 2BSK A; 1H38 A; 4CH3 A; 1P4R A; 4I9W A; 2YXL A; 4BW9 A; 2HVJ C; 2FB5 A; 1ARO P; 4ZOL B; 2VQF O; 5LYJ A; 3R65 A; 3AG2 C; 2HP8 A; 5LHG A; 2CH7 B; 1I5X A; 3JD2 A; 3FD9 A; 1KKD A; 2ZQM A; 4QNH B; 4NXN B; 2V4D A; 4B3R B; 1RSO A; 1N8R W; 1M56 B; 1BGY H; 2WLI A; 3O9O A; 4CH5 A; 2WLH A; 3ABM B; 4IYI A; 1AR5 A; 3Q4H B; 4LWS B; 3OGI B; 5LHI A; 3E8F A; 1OCC C; 3K04 A; 3A2F A; 3F5W C; 2ATK C; 2IJK A; 2ADP A; 4OGQ B; 1UJW B; 4DR5 B; 3QF7 A; 4O4H A; 3UQ8 A; 3GWK C; 2DWE C; 3HKC A; 5CA0 A; 1VQO V; 3ZS8 C; 4YY3 O; 1K92 A; 2Q9L A; 3P3N A; 2AZ2 A; 4FM1 A; 2LFR A; 1AI6 A; 2ZE8 A; 4UV8 A; 5H5N A; 3CXC U; 3ZRS A; 1N32 B; 1ZSP A; 4I50 A; 1MOF A; 3TJT A; 5FLX N; 4YJ3 A; 4MVM A; 5KMG B; 5C8Y B; 4JF3 A; 2OCC B; 1FXH A; 3JD0 A; 2M6Y A; 4NR1 A; 2LGW A; 2EX3 A; 3CCE V; 4FLV A; 4B3M O; 3AK1 A; 4DR3 O; 1MMM A; 3C90 A; 3RGB A; 3CC7 V; 5E79 Z; 3TK1 A; 1NVP B; 3ZHT A; 4DR6 O; 4JAS A; 1Q8I A; 1NH2 D; 3JAR B; 4MVQ A; 2QKC A; 2OT5 A; 3CX5 F; 1FXK C; 4UCO A; 2QTS A; 2QR4 A; 3OAA G; 2Z0A A; 4TV8 B; 4ZKI A; 3JCU Z; 3VBB A; 1JVM A; 3CP1 A; 2YEV A; 1M57 B; 2FML A; 3L75 H; 3A0B Z; 1SER A; 4DYL A; 2R9I A; 2UUA B; 2QKS A; 4X64 B; 1K34 A; 4O4L B; 1G1X B; 3KCX A; 1YVW A; 5EYP A; 3BY6 A; 4LNU B; 3CYO A; 3JAT B; 5IE9 A; 1SKV A; 4LFA B; 2RNB A; 1BZK A; 4ZI7 A; 2QGN A; 3E89 A; 2P5O A; 5EBM C; 3WG7 B; 3W7W A; 1YF2 A; 2Q68 A; 2E5L O; 4LC1 A; 3C3T A; 4H37 A; 1FFT B; 5BZB A; 1M4U A; 3BHP A; 2XAH A; 2GSM B; 2B5U A; 2ILM A; 2MK3 A; 4MVS A; 1IXB A; 2EBO A; 4LFC B; 4O4J B; 5JQG B; 2YIA A; 4FJC C; 2VWJ A; 4I9Q A; 1K4D C; 3FAV A; 1LR1 A; 3M7M X; 3ZRV A; 1VQK V; 2GHY A; 1FKA O; 1IBK B; 4D7S A; 3LDD A; 3CRA A; 2ZDI A; 3RYF A; 4EB6 B; 3STZ C; 5CA3 A; 4JPR A; 3WB2 A; 5GTI Z; 3N2K B; 1K97 A; 3BCC H; 2UXD O; 1Z5W A; 5DM6 V; 4LF4 B; 3ASO B; 3CE2 A; 2Y4U A; 3SJC C; 3A0H Z; 2FKX A; 4TOI A; 1AR1 B; 1NZ6 A; 2VQE O; 1XBL A; 5L3G A; 3OTO B; 4XDK A; 3CHX A; 1WB8 A; 2GUZ A; 1FD9 A; 1SS3 A; 4PI0 A; 1QVG U; 1OCZ B; 1H2K A; 3JD1 A; 2A7W A; 5JVD A; 1SF9 A; 3FB5 C; 1ZL8 A; 4DK1 A; 5JJN B; 3AK2 A; 5BR8 B; 4R7C A; 4OX9 B; 1AIL A; 5B3S B; 4QPK A; 4LF7 O; 3HKB A; 1H8E G; 1NBM G; 2ZE6 A; 4F4L A; 3JAS B; 3CEI A; 2ZM6 B; 1S0V A; 2YID A; 1L1F A; 2ITD C; 3C3S A; 4MW8 A; 4DR1 O; 1LNQ A; 4O4I A; 3QTC A; 2ITC C; 1IDS A; 3OEE G; 3OD4 A; 5L3B A; 1N0J A; 3CCR V; 4BW5 A; 2DWD C; 4JI2 O; 1WB7 A; 3FYE B; 5FNV B; 1N36 O; 1NQT A; 3SGI A; 3ML0 A; 4LF6 O; 1XHX A; 3AG4 C; 4X1I B; 2NN4 A; 4FFB A; 2CE4 A; 4UCU A; 4JYA B; 5LXT A; 3CPW U; 2GBO A; 4PD4 F; 1VF5 B; 2ZE7 A; 3CMA V; 2JVD A; 1FJG O; 3CSX A; 1KB9 F; 4QE7 A; 4GT1 A; 4X1Y B; 3ZN1 A; 4DRX A; 4DR2 O; 1GM7 A; 1N33 B; 4GX1 A; 4GUN A; 3J7A U; 1WAZ A; 4FIP C; 4X20 B; 4FZ0 A; 2AGA A; 1IUR A; 3AG1 B; 1I94 O; 5J2U A; 1DK1 A; 2XAS A; 4MTG A; 2JJ2 G; 2DYS B; 4FLU A; 3ABU A; 3ZHQ A; 1FXK B; 1IZ3 A; 3E22 B; 1R6K A; 4J80 A; 4X1K A; 4U7N A; 1OCO B; 1K8A W; 2KKW A; 2LO1 A; 2Q7E A; 1KQS U; 1TVK B; 2JRI A; 1HNW O; 5CBG A; 1KP3 A; 1QQC A; 4MVZ A; 1M56 C; 3L72 H; 1BQ0 A; 1WJZ A; 3VQV A; 4J7J A; 1E79 G; 4TWK A; 1RPR A; 1SZT A; 4PHZ A; 4LCU C; 3CCM V; 1E1Q G; 5K1P A; 1WN7 A; 4TV9 B; 2M7W A; 4JI0 B; 1AP5 A; 2ZCE A; 4U7O A; 5KX5 A; 2F93 B; 3H1J H; 1F51 A; 4DV1 O; 1PKX A; 1N0N A; 5B1A C; 3GB7 C; 2CDY A; 5CA1 B; 1XNR O; 1HNZ B; 2EIL B; 1Y4M A; 2QWO B; 4FVM A; 1MNG A; 2QE7 G; 1SQB H; 2ZIM A; 1IXM A; 4YXW G; 1KMI Z; 1VF6 A; 3CJH A; 1AI7 A; 2A79 B; 1K5S A; 5LMN O; 3RVY A; 4ABM A; 4RAI A; 2AHY A; 2CGN A; 1QHT A; 3J80 N; 4DUZ O; 1AJQ A; 5AG2 A; 1QLE B; 1XOU A; 2EIM C; 1NU1 H; 2HR3 A; 5J9P C; 1VQ6 V; 3UT5 B; 3ZED A; 2VRZ A; 3DXR A; 4G27 B; 2LFS A; 5BXZ A; 1FYJ A; 2VS0 A; 2F95 B; 4K8Z A; 4UCR A; 5IY5 C; 2A06 H; 1XMO B; 1I7F A; 1OJH A; 5LA6 A; 2F4V B; 4TUY A; 2EIK B; 4DW1 A; 4DUY O; 4B3T O; 1QR8 A; 1I0H A; 3D36 A; 3SPC A; 5IJ0 B; 1U97 A; 2Q8V A; 3ZIA G; 1S3J A; 1M57 C; 5BY1 A; 5LGU A; 2IBZ H; 3OR6 C; 3SJA C; 3HPL C; 1ENV A; 5EK0 A; 4NXN O; 1ZTE A; 2ZIN A; 1R1B A; 4JI7 B; 2MW2 B; 1EZJ A; 4B08 A; 1YHQ V; 1R6N A; 2BOC C; 5B66 Z; 1P7B A; 3IC9 A; 3JSL A; 4LH7 A; 5E1A C; 1NH2 B; 4X88 A; 4I0X B; 4WBN A; 3EVK A; 1Q6H A; 4YHH B; 4DR5 O; 5ITZ B; 5CB4 A; 3E2E A; 1VAR A; 1ROP A; 3IC7 A; 1SES A; 4EEQ A; 4Z2W A; 2FL4 A; 1GN6 A; 1F4M A; 3ZHS A; 2R72 A; 4QIW F; 4IL6 Z; 4JI4 O; 3MD0 A; 4H33 A; 1IX9 A; 2ZKO A; 3ZMT A; 4PJ0 Z; 1TGO A; 2YI9 A; 2BSK B; 5LP6 A; 3QNE A; 4I4T B; 1O9G A; 2L6L A; 3CCL V; 3DGE A; 3CME V; 1N32 O; 5LYJ B; 4DV4 B; 1VQN V; 3T1Y B; 4QPJ A; 3W7X A; 3AG4 B; 4HZ3 A; 4GKJ B; 2WA3 A; 2E75 B; 2EIN B; 3T1H B; 3JAW A; 5KHI A; 1JCH A; 1HW7 A; 1XMQ B; 1RSO B; 3HKD A; 4OPA A; 2WLI B; 3SPI A; 3ASO C; 2L35 A; 3ABL B; 4JI1 B; 2WLK A; 3ZHR A; 1PNK A; 4BAY A; 2PF4 E; 1WP7 A; 1K33 A; 3T4D A; 2Q7G A; 1CPY A; 1Y74 A; 3LSS A; 2DMX A; 1KU9 A; 3F5T A; 2CTQ A; 1VQL V; 3G80 A; 4KUM A; 1DF4 A; 1OCZ C; 4O4H B; 2N74 A; 3I55 V; 3OMI B; 3HKC B; 4KXR A; 3IAY A; 5CA0 B; 3OM3 B; 3CRR A; 1P84 F; 1W0J G; 3MDS A; 2XAJ A; 5LOV B; 2P22 C; 1MZE A; 5FPO A; 3CCQ V; 2ZE5 A; 2BOB C; 3CS5 A; 5B3S C; 4JI3 O; 4NTW A; 3K5N A; 1K4C C; 5BMV A; 3EHB B; 4U3F H; 4OPH A; 2UUA O; 4X64 O; 4I50 B; 1QLN A; 3BAA A; 4YJ3 B; 1V54 B; 1BHA A; 1FFX A; 1MA1 A; 4LFA O; 3D3I A; 1NR1 A; 1YCI A; 4DV5 O; 4AHC A; 2ZXW B; 1P49 A; 1T5E A; 3ETE A; 3SDL A; 1JA8 A; 2XTA A; 2LP7 A; 1JR9 A; 1YJN V; 1D2D A; 3E86 A; 1HR0 B; 1COW G; 3ETD A; 5B1A B; 2BTO A; 3SJB C; 4LFC O; 1YJ9 V; 4E2L A; 4GX2 A; 1YEW A; 3KKY A; 3RW0 A; 4RWU A; 1SQQ H; 4L8J A; 3UO3 A; 2YEV B; 2QWQ B; 4EFE A; 4F6R A; 3L9D A; 3TXS A; 3JYC A; 1IBK O; 4PDM A; 4UVB A; 1XRE A; 4PA3 A; 5EZY B; 2UUC O; 1XDC A; 1K5Q A; 3K79 A; 1X4T A; 3W7S A; 1SC5 B; 4D6T H; 1Q43 A; 3ZMV A; 5KUM A; 1MG1 A; 1GRJ A; 5EYP B; 2Q5Z A; 2EIM B; 1VQ5 V; 5JH7 B; 3OTO O; 2JEX A; 2UXB B; 4AQY B; 4AI8 A; 3AG1 C; 4ZI7 B; 5DEC A; 3N2G B; 2JEU A; 5IY5 B; 5EC2 C; 2RN9 A; 3ZRX A; 1AI4 A; 4JGS A; 3RYI A; 2DYS C; 5BR8 O; 4OX9 O; 1Y76 A; 1Q7Y W; 4IHJ B; 1SET A; 2HFE C; 2X0L A; 4CH6 A; 3Q4H A; 3BFR A; 1OCO C; 2UXN A; 4LWS A; 3ZMS A; 1MSD A; 2NNU A; 3FAV B; 4YIP A; 3MAQ A; 4ZHQ A; 2ZM6 O; 3T4Z A; 4H44 B; 3VQX A; 5GON A; 2HLD G; 2R9R B; 1W2B U; 2OTL V; 3T2M A; 3SYA A; 3OMA B; 1MAB G; 3JAL A; 1L8D A; 3ICX A; 4FM0 A; 3IGA C; 2HHH B; 3ZMZ A; 3I56 V; 1JJO A; 3K5L A; 4JI5 B; 2CTP A; 3SYO A; 1RPO A; 1WNS A; 2Q67 A; 2EIL C; 5H9C A; 2GUZ B; 3OUS A; 3QO8 A; 2PTM A; 4DR4 B; 2ZR2 A; 2VWK A; 1S72 V; 5C8Y A; 1PNL A; 1ZL8 B; 1SRY A; 4FLY A; 4JYA O; 2OWO A; 1R3K C; 3HKB B; 4Z1M G; 4R50 A; 1QLE C; 5B1N A; 1M9N A; 4K35 A; 4DW0 A; 1JFF B; 2P6J A; 2IH1 C; 1VQ8 V; 2UXX A; 1XNQ B; 3RYC A; 4RO2 A; 1N33 O; 1GN4 A; 2AW9 A; 2HEP A; 4DV7 O; 3HKE A; 2BTQ B; 5C93 A; 3K9S A; 3U0Z A; 1I5Y A; 5GW7 A; 3LNN A; 3JCZ A; 3JD4 A; 4J9Z B; 1GAX A; 3K08 A; 1FAF A; 4BIU A; 2EIK C; 1LUW A; 2QM7 A; 4UB8 Z; 5JCO A; 1ZAU A; 3KZI Z; 2P4K A; 1O9H A; 1ZX3 A; 1JMK C; 4DV2 B; 4O4L A; 4NB5 A; 4JYY A; 2DQ3 A; 3BA8 A; 3JAT A; 5F2V O; 2QTO A; 4I55 B; 1J5E B; 4LF5 B; 1WA8 A; 1V9P A; 3RYH A; 3B77 A; 2WWW A; 3OT7 A; 5LXT B; 1XEQ A; 1MZF A; 3ZRW A; 3NR7 A; 2WLL A; 5KHJ A; 1F4N A; 3K59 A; 5HFM A; 4JI0 O; 4LF8 B; 3U10 A; 2YSU B; 3FB6 C; 4DRX B; 4D7T A; 5IWA B; 5JJJ B; 4JTA B; 2WPD G; 3HB3 B; 1XL6 A; 2JDI G; 2EZP A; 3UCS C; 2Q73 A; 1HNZ O; 3G6E V; 1JQ0 A; 5IDJ A; 1ZUQ A; 3CCJ V; 3P3P A; 2P4V A; 3WFV A; 4NKG B; 4BIO A; 4O2B A; 3JSN A; 4GX5 A; 2ZIO A; 5J2U B; 1M1K W; 5TIS Z; 2H3O A; 4J7K A; 2WLJ A; 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4CZZ A; 4DV4 O; 1R3L C; 1XIL A; 4X1Y A; 3PJS K; 4GKJ O; 3PN1 A; 3T1H O; 1XMQ O; 2X6C A; 3J81 N; 1DTO A; 1Z2G A; 5KHH A; 2HJD A; 2W6I G; 4I7Z B; 4JI1 O; 1QR9 A; 3FFQ A; 5EBW C; 1NTM H; 4MW3 A; 2QSA A; 4X66 B; 3JD3 A; 2EIJ C; 1H8H G; 3OR7 C; 1FXK A; 3SJQ C; 5JJE B; 3E22 A; 3THO A; 5CB4 B; 1DLB A; 3D3Q A; 1G6U A; 1PL4 A; 4ZIB A; 1G4Y B; 3SYP A; 1TVK A; 2EJ7 A; 3E8G A; 5B1B B; 4PI2 A; 4AIL C; 1BS3 A; 4TV9 A; 3RBZ A; 2Y0I A; 4K0K B; 4O2A B; 3ZMU A; 5K1X A; 1H2M A; 4LP8 A; 4X89 A; 1V55 C; 3JAW B; 4DR7 B; 1W0K G; 2ZDI C; 4B3R O; 4BR6 A; 1NKD A; 1K7D A; 3HKD B; 1S5H C; 3CB2 A; 3ZN0 A; 1KD1 W; 5LL6 Y; 4P9P A; 1BQZ A; 4LBE C; 4MS2 A; 4X62 B; 1Q3E A; 3ABT A; 2B9Z A; 4JYC A; 1PP9 H; 2R70 A; 4HBN A; 2HJF C; 4JAV A; 1CP9 A; 4I5S A; 1Y74 B; 1XUQ A; 1HR0 O; 5JWP A; 1N34 B; 3BPZ A; 4W4K A; 3RFR A; 2KQX A; 2ZD9 A; 4TQD A; 1JJ2 U; 4GKK B; 1XI1 A; 1K3E A; 1WPX A; 3LSQ A; 3KG2 A; 2Z5U A; 3LUT B; 4FPP A; 1NTZ H; 1IBM B; 4UFZ A; 5L3C A; 1M93 A; 1AR4 A; 2H94 A; 4DK0 A; 4N21 A; 5BMV B; 5KHK A; 2R9A A; 3T1C A; 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