1C0FA

Crystal structure of dictyostelium caatp-actin in complex with gelsolin segment 1
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
368
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords GELSOLIN SEGMENT 1
publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 367
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0fA03
5JLHA 5AQNA 2E8AA 1H1VA 5EVZA 3BF1A 3UKRA 2UYTA 3WQTA 3L4IA 4H0OA 3A5NC 3QBXA 5AQZA 3MK6A 3TPQA 3CJ1A 1Z6RA 3U9DA 3I8BA 4EHTA 2BTFA 3VF6A 3KVGA 3RSEA 4FWLA 1K8KB 3AARA 2CGJA 5JLFA 3A0IX 3O6WA 4ISEA 5AZIB 4IWVA 2FLOA 3QICA 4EHUA 3UE5A 3WEEB 4AM6A 4CI6A 1ZXOA 1DEJA 4GY2B 5FPDA 3TU5A 1HLUA 3CHWA 1T44A 3U4LA 4PKHA 3M6GA 4BR2A 3EKUA 2P9SA 2WUSA 3ULEB 3LDPA 2YI1A 1HJOA 3C0BA 4BROA 2ZF5O 1D4XA 3HZ6A 1NGGA 4CZGA 5AQIA 2W40A 1IG8A 2PAVA 4IZ9A 4O8KA 4CZIA 1MDUB 1X3MA 3ZETB 1V4SA 2HF4A 1MWMA 2VCPA 3LL3A 2J4RA 1T6DA 4B1YB 4QS9A 2A41A 1C0GA 4NB4A 1HUXA 2P9UA 3FZHA 4J8FA 4CBXA 2CGLA 4JHDA 3AAPA 1IJJA 4AM7A 2QWRA 4JD2A 4EIAA 1HPMA 4MLHA 3WUHA 4PKGA 5BN9A 4IO8A 3DXMA 1KAYA 1NLVA 3CJCA 3C7NA 3QMLA 3A5LC 4XH5A 4DHYA 2HF3A 3H3NO 5AQRA 4BR4A 2D0OA 1QHAA 3CJ7A 4MO4A 5ADXH 5AQTA 2QWQA 2IVNA 4MLEA 5ELZA 3A5OC 4PKIA 3FZKA 3LDQA 1NGDA 5AZJB 5AQLA 1NGIA 1HKCA 1RFQA 2GELA 4BRGA 3RSEB 4DQ8A 3H6EA 4ISFA 1YUWA 3VEWA 2IVPA 4HWIA 4IJAA 3EO3A 4H0TB 2Q97A 4RTFD 5E26A 3O80A 3ATVA 2FXUA 3O8MA 4FWOA 2P9NA 2D0PA 1GLDG 5AQJA 3QB0A 4JAXA 3D2EA 3MMVA 4FPAA 5BPNA 1RDWX 5AQPA 5LY3A 3VGMA 4BRMA 2E2QA 4BC5A 2CH6A 4CZLA 3CIPA 1LOTB 3SJHA 4B1XB 4B9QA 1YVNA 4FWSA 2GWKA 3UB5A 3H46O 3VF2A 3SK3A 3BP8A 3AY9A 1ATRA 2FF6A 5AQWA 4BRHA 4WQ5A 2Q36A 3M1FA 3SLCA 4BVOA 3L0QA 5CE3A 5F0XA 4K42A 1NGBA 3VGLA 4H0YB 5B8HA 3H45C 3KHYA 3VEYA 5AQVA 2P9UB 4RCHA 5EY4A 1HKBA 3VF4A 4FOIA 3ZEUA 3OHRA 1T6CA 2I7NA 4PL8A 3IUCA 4CJ7A 5BPMA 5AQSA 1QQNA 1J6ZA 3G25A 4I6MA 3VENA 1XUPO 3DXMB 2QWLA 3ENHA 1U6ZA 2YHXA 2ZGZA 4QS7A 2GEMA 1G99A 4FL9A 3O5BA 5FPNA 4H0XB 4CZHA 3FGUA 5AFUH 3BUZB 1ZC6A 2A5XA 1BA0A 3GL1A 4BQLA 1DKGD 5JICA 4BGBA 3WXKA 2VWBA 3LDLA 5TKYA 5I9EB 4M63C 3U8XA 1MA9B 2E1YA 2YHWA 2P9IA 2GWJA 3KZBA 3LM9A 4BR5A 1QZ5A 2OANA 3ZX0A 3J8AA 1E4GT 1OKJA 3QFUA 2IIRA 3D2FA 4BR7A 5AQHA 4CZEA 1S3XA 3MCPA 4CD3A 1NGEA 1U2VA 3CJBA 1BG3A 2GTDA 2CH5A 4L3QA 1R59O 4BRCA 4H0PA 2P9PA 4NO7A 2FSKA 4BC3A 2YJEA 3O1BA 3FZFA 2V51B 4CZJA 3BF3A 4E1JA 4A2BA 1JCFA 1GLFO 4A2AA 2Q1NA 5BPLA 2D1KA 1GLCG 2BUPA 3FFKB 3FLCO 4BRPA 4H5TA 3IDHA 3IMXA 1TYQA 1NGAA 1Q18A 2FSNA 4DB3A 5F2RA 2QW9A 3JXUA 3HI0A 2E2NA 3DAWA 4QS8A 2F9WA 2GUPA 3B8AX 1KAXA 4JNEA 4K25A 3FZLA 5BRFA 3FZMA 1NWKA 2F9TA 3VEZA 4Y0WA 3CQYA 2ZGYA 4CD1A 2E1ZA 3CQXA 3UKRB 4BC2A 4BRIA 2QWNA 1SZ2A 1NM1A 4H0VB 1XC3A 3GDQA 3M3ZA 4WQ4C 5AQUA 4BR9A 4F9OA 1TUYA 3LDNA 3QDKA 3A5MC 1NBWA 3VPZA 4O5FA 1X3NA 5E84A 4BRFA 4BRNA 3S41A 2P9LA 3I33A 3AAQA 4BQZA 4H5RA 4CZKA 2ASMA 2P9KA 1K8KA 3CERA 5KQ8A 3IFRA 4A61A 5AQKA 4BRDA 3O1WA 3CJ9A 5BRDA 3WEEA 2HMPA 2E2OA 2P9SB 3VEOA 1ATSA 1NMDA 2FSJA 3D2FB 3WXIA 1P8ZA 4H5NA 4YDUA 3H3OB 4B1WB 3LM2A 4PL7A 3SMPA 2P9PB 1QZ6A 5BREA 3ZX2A 3H1QA 3ZETA 3MDQA 5AQXA 4EFHA 1HKGA 1EQYA 3ENOA 2V52B 3A8YA 3CI5A 4GNIA 5EOYA 3VEXA 2V7YA 5JMVA 3VERA 4HTLA 4JHDB 3DWLA 1JCGA 4XEIA 5LJVA 3W0LA 4JD2B 3WXLA 4B1VA 2QWOA 3DXKA 1BWFO 4IXCA 1KXPA 2ITMA 4CZMA 4RWTA 3SMSA 1KAZA 1C0FA 3C7NB 3O4WA 1QQMA 5KPRA 2A6AA 2DPNA 2I7PA 1BA1A 4FWRA 3WT0A 2QWPA 3R6MA 3O08A 4FWPA 1JCEA 1GLLO 1LCUA 2Q0RA 3EKSA 3ZX3A 5AQGA 1NGCA 2NLXA 1E4FT 3GG4A 3MN7A 2E88A 2KHOA 3LDOA 4BG9A 4FWQA 2P9LB 1YAGA 5AQOA 5AZJA 2P9KB 4BRAA 2QM1A 2NRHA 1NGHA 4H03B 1S22A 1DGKN 4BVPA 3VETA 3MN9A 2P9NB 2YJFA 2A40A 5KQDA 1TUUA 2QWMA 5EX5A 5F1XA 5ADXA 3D2EB 4B1UB 3VESA 2W41A 5AQYA 1BUPA 4KBOA 2ZWHA 3VOVA 2Q0UA 4IJNA 1Z05A 2CGKA 3VEVA 2EWSA 3FR0A 2A3ZA 2D4WA 5AQMA 5AR0A 2FF3B 5BRHA 1WUAA 2QXLA 4MO5A 3HM8A 4CBWA 3DJCA 3L6QA 4M7XA 2IVOA 3JS6A 4CZFA 3HSCA 5FPMA 4Z94A 4K43A 4EAHD 5EXWA 1BU6O 4BR0A 4FWKA 4ISGA 3UKUA 3H1VX 4WYBA 1SAZA 3ID8A 3R8EA 1ESVA 3QFPA 3ZEUB 1HX1A 2AA4A 4A62A 1RGIA 4BREA 4FPBA 2YHYA 3F9MA 5BN8A 3DXKB 1V4TA 3QBWA 5FPEA 2Q2RA 4I6MB 4FSVA 3BEXA 5LJWA 4JN4A 1WOQA 4YDUC 3FE1A 4FOEA 3D7EO 2AP1A 4WQ5C 4BGAA 3CETA 3EN9A 2PBDA 1Y64A 2VYPA 5AZIA 3EZWA 4FWMA 3CJAA 4H5WA 5KPZA 4XH4A 2A42A 2P9IB 2E2PA 3R9PA 4FO0A 4M7YA 1BOTO 3HBTA 4FWNA 2ASOA 3ULEA 5KPTA 2YCHA 1SQKA 1GLBG 4BRLA 4BC4A 4CBUA 2HOEA 1U2VB 1YXQA 4BRQA 5AFUA 2ASPA 2Q31A 4LC9B 1GLJO 3GBTA 1ZBSA 3P4IA 4H5VA 3GE1A 3VGKA 3WXJA 1BO5O 3GOIA 1NGFA 2E20A 1GLEG 3MN6A 1MWKA 3HTVA 4WQ4A 2H3GX 4DCHA 1TYQB 1NGJA 4K41A 5BR9A 1X9JA 4B1ZA 1XQSC 1GLAG 3MN5A 4BG8A 5AQQA 3W3DA 2V7ZA 3ATUA 4C23A 1ATNA 3UKUB 1QQOA 3WQUA 5AQFA 4BRKA 2NZTA 3U9ZA 3EL2A 1BDGA 1CZAN 4XH1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQNA 1H1VA 4CIGA 3HVRA 5EVZA 3MAQA 3WQTA 3A5NC 3V4IA 1KRPA 1DTTA 4PHTX 4CESA 1RT6A 3MK6A 3U9DA 3CCLN 1EWRA 1W9HA 4KI6A 2HHSA 1WB9A 3O3FA 2UXCK 4ISEA 5AZIB 3TTFA 4LF5K 4E7IA 2G8HA 1ZXOA 4GY2B 1HLUA 2D5RA 2O8CA 4B9UA 4BR2A 3EKUA 2Z1HA 4DV0K 3I56N 3BDPA 3IKMA 3K2PA 3C0BA 4NLCA 1NGGA 3SUNA 2W40A 1NU0A 4H8KA 3TAPA 2HHIA 1V4SA 2J4RA 2P5OA 3J80O 4KI4A 2WOMA 2HHHK 3O9RA 3QO9A 1C0GA 3ZSRA 1HUXA 3O9UA 3D45A 1B92A 3K5NA 4JHDA 5HLFA 3QEWA 4M3RA 4A5BA 2GUIA 3TAFA 4JD2A 5KGWA 4C8NA 1C0TA 4MLHA 4PKGA 4OPJA 3OY9A 4Z4HA 4DU1A 3JSMA 1IBKK 1RT4A 3HXMA 5AQRA 4I9QA 1EXQA 5HOOA 3CJ7A 3WNFA 1JLQA 4DG1A 4IEEA 2QWQA 4PKIA 3FZKA 3BGRA 5AZJB 5DMRA 3I0SA 2XY8A 1RFQA 4BRGA 4OPAA 4ISFA 3A2FA 4IEIA 1YUWA 4MQ3A 3EO3A 2Q97A 3VTIA 3OTOK 5E26A 4Y1CA 4C8LA 4MDBA 3ATVA 3VQEA 2W6KA 4HCBA 3SZ2A 5AQJA 4CF1A 3QB0A 1I94K 4FPAA 4IFVA 3OYAA 5LY3A 1BL3A 3NF9A 4FJMA 4BWMA 3SJHA 2UUCK 4IG0A 3VF2A 3BP8A 3G71N 3AY9A 3HT3A 1BI4A 1RDUA 2GX9A 1RTJA 2Q36A 4OKEA 3DLHA 5F0XA 4CJ3A 2Q3SA 4DS5A 3VN5A 3HRGA 4KB1A 3ZEUA 4BACA 3TABA 3HM9A 1J6ZA 4CFBA 1D5AA 4YNQA 1U6ZA 1WNSA 1C0UA 1RCHA 2YHXA 2ZGZA 1L3UA 3S3NA 2HHQA 3K0SA 3QINA 4H0XB 3FGUA 5AFUH 2KZMA 2KLAA 1Q81O 1BCMA 3GL1A 4JK9A 2VG5A 2OPQA 5JICA 4BGBA 4IBNA 1EETA 3IS9A 4M63C 3OYFA 3H08A 3VQAA 2RKIA 2YHWA 2GWJA 3TAEA 3NH0A 3T1HK 4WCEL 3ZX0A 1I3AA 1QQCA 3J8AA 4DFMA 4BR7A 1S3XA 4BWJA 1U2VA 3CJBA 2GTDA 3QNOA 3V1RA 2VG6A 4EP5A 3FZFA 2V51B 3C6TA 4A2AA 1KVBA 5BPLA 3CPWM 1HR0K 3FLCO 1KVCA 4BRPA 2VQEK 2KW4A 3TWHA 3MWPA 3CF5L 1SKRA 4DTPA 3CC4N 2JLEA 1VQNN 4JI8K 3V6DA 4JI1K 4RW4A 1FKOA 4WE1A 1TV6A 4JKBA 4QS8A 4C1NK 2GUPA 3B8AX 4FLVA 1YIJN 1W7AA 4M45A 5M1KA 1NG9A 5BRFA 2NRZA 4CJ5A 3DRPA 4BRIA 1SZ2A 3GDQA 4WQ4C 5AQUA 1DT9A 4CF8A 1TUYA 3L2VA 3SUPA 1VQ8N 3E9OA 3AA3A 2FBTA 4B3TK 4FJJA 4B9TA 5EU7A 3HSTB 3HPHA 1S6QA 1YJWN 4BQZA 1JL1A 2ASMA 4AHVA 4LSLA 1K8KA 3CERA 4CK2A 1N33K 3EEQA 4FLUA 4DFPA 3TAGA 2W00A 2P9SB 2C1IA 3JYTA 4CGJA 3OS0A 1QE1A 3AVMA 1IKYA 1P8ZA 3C95A 2GBZA 1WSEA 3VQ7A 1TKDA 4ZTFA 1S1WA 4G1QA 4KB0A 3CCVN 3ZX2A 3SQ4A 3ZCMA 4DF4A 1HKGA 4DTSA 3ENOA 2V52B 2XY7A 4QAGA 2V7YA 4H4OA 2JWLA 3TSUA 3VERA 5DM7L 4YOVA 3AVAA 4KTZA 1K9MO 1JCGA 4BE1A 4KHWA 4CF0A 3W0LA 1VK0A 4N76A 4DR5K 1HYVA 4CHYA 1SKWA 2KZZA 4B1VA 1BWFO 4IXCA 1KXPA 4RWTA 4CZMA 1S72N 4J2EA 2UXDK 2PYJA 3QESA 4FLXA 4DSLA 4BDPA 1JXEA 3S3MA 3L3VA 2I7PA 3WT0A 1U48A 4OGCA 5J2NA 4FWPA 1GOAA 1FXXA 2Q0RA 1ZBHA 3C65A 2NLXA 4ZTJA 2XY6A 2E88A 2KHOA 3V9UA 4DF8A 2Z1IA 1YAGA 3E01A 1OVYA 4IOXA 1C0MA 4JKAA 1BHLA 2QM1A 2NRHA 4H03B 5KRTA 1TKTA 1DGKN 1RTDA 1ASWA 3HP6A 3VETA 3MX5A 3LP0A 2P9NB 2YJFA 3AO4A 2G8UA 2QWMA 1EX4A 3C94A 3PO4A 3D2EB 4B1UB 1QVFM 2W41A 3IG1A 1BUPA 4CEQA 3C6UA 4JI0K 3VOVA 2CGKA 3VEVA 2EWSA 3FR0A 2OPRA 1LWCA 3G10A 3AVLA 4KKOA 5AQMA 4CJUA 3RMDA 2WTUA 3O3GA 4NXNK 3NE6A 3DJCA 4CIEA 1QTMA 3HSCA 4BEBA 4JLHA 2WONA 1JLFA 3SPYA 3V9ZA 1YITN 1SAZA 4FW1A 3R8EA 3P83D 1XNQK 3OBWA 2JGUA 3OW2M 3I55N 4FPBA 5BN8A 1V4TA 3QBWA 3OYKA 4LF6K 3V1QA 1GOCA 5FROA 4EP4A 2RF2A 2NRWA 3DI6A 3FE1A 4B9SA 2AP1A 4X66K 1WBDA 1Y97A 3VTHA 4H5WA 4CHPA 1NNEA 1SV5A 2A42A 4XH4A 4CW7B 3U6FA 2P9IB 4KPYA 3O3HA 4YOWA 4ICLA 4FO0A 4R79A 4CJSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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