1C0GA

Crystal structure of 1:1 complex between gelsolin segment 1 and a dictyostelium/tetrahymena chimera actin (mutant 228: q228k/t229a/a230y/e360h)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
375
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMKAYASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKHEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords PROTEIN (GELSOLIN SEGMENT 1)
publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 367
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0gA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0gA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0gA03
2WUSA 1GLCG 4H5RA 5AZIA 4BR5A 2A6AA 4PKIA 3VENA 3LDOA 4BRGA 3FFKB 3FZHA 3CJBA 3WQTA 1MWKA 5AQKA 2D0OA 3TU5A 4O5FA 3MN5A 3D2EA 4JN4A 5EOYA 2E8AA 4K43A 3UKRA 4CZEA 3U8XA 1IG8A 1XC3A 3FZFA 3LDNA 1Z05A 2CGLA 4EAHD 2E20A 3ZX0A 2ASOA 4BRPA 2V52B 1ZBSA 5F0XA 4WQ5A 3FE1A 4BRIA 2Q36A 5KPTA 3L4IA 4CZMA 1BWFO 1HLUA 3EKUA 1ZXOA 2P9LA 3LDLA 5F2RA 2QXLA 1HUXA 1GLDG 1U2VA 2AP1A 1LOTB 4K42A 3VF4A 3QICA 1NGIA 4H0VB 3H3OB 4FWNA 4CBXA 3O80A 3VERA 4FWLA 3GDQA 4DQ8A 3ATUA 3DJCA 2ASPA 2QW9A 3DWLA 5AQMA 2GWJA 2OANA 2Q1NA 1GLJO 4RTFD 2P9UB 3VOVA 1EQYA 2Q0RA 1R59O 4XH1A 3WXIA 1NGEA 4BRKA 3FR0A 4MLEA 5BR9A 2Q0UA 4BC3A 3G25A 1NGJA 1DGKN 4L3QA 3ENOA 5BN9A 2P9PB 2ZWHA 1J6ZA 5AZJB 3R8EA 4WQ5C 3VGLA 5AQNA 1NGHA 2BTFA 2E2QA 3VETA 4WQ4A 5FPDA 4GNIA 3BF1A 3GG4A 1QQOA 1RFQA 4H0XB 1JCFA 4FWRA 4FOEA 4J8FA 3EKSA 3SK3A 3MK6A 2CH6A 4BQLA 3SJHA 4B1UB 3J8AA 3KVGA 2YHXA 3WUHA 3DAWA 3VEYA 4NO7A 4BRCA 2V7YA 4H0YB 5AQPA 4BROA 5BN8A 3DXKB 4BRQA 3H1VX 3CHWA 1GLFO 1NLVA 3AY9A 4F9OA 1Z6RA 3C0BA 1E4FT 1TYQB 2NZTA 3QFUA 1K8KB 4KBOA 1T6CA 2DPNA 4BRMA 4BR2A 4CJ7A 4MO4A 3CJ1A 5AQIA 3A5NC 4EIAA 3CJ7A 1MA9B 2HF3A 3C7NB 4RCHA 3LM9A 3I33A 2A41A 4CZKA 2P9UA 5KPRA 4QS7A 5FPMA 5AQWA 5JLHA 4WQ4C 4BR9A 3U9DA 5F1XA 3MDQA 4CZJA 3A5OC 4QS9A 1DEJA 3SMSA 4CD1A 4EHTA 5AFUH 1P8ZA 5EX5A 3WXKA 4JNEA 4H0OA 3FGUA 3VEVA 2A5XA 1QHAA 3VEZA 3LDPA 3EL2A 2YHYA 2NLXA 2P9KB 2E2PA 3ZEUB 2ZGYA 1TUUA 1XQSC 3HSCA 1C0FA 4CI6A 2QM1A 3EO3A 3VEOA 1QZ5A 3A0IX 4H5NA 4CBWA 2W41A 3ENHA 2FSNA 5AQJA 1NMDA 3MMVA 4JHDB 5EY4A 2E2NA 3DXMA 4H5WA 3KZBA 3LM2A 2A40A 2BUPA 3VF2A 1MDUB 5BRHA 1YUWA 3CJAA 5E84A 3H46O 1ATSA 5EXWA 3IUCA 1JCGA 1TYQA 1SZ2A 3TPQA 4MLHA 5AFUA 2GEMA 1RDWX 4H5VA 1KAZA 4M63C 1G99A 3C7NA 5E26A 3SLCA 2ASMA 4AM6A 1NBWA 3D7EO 2YCHA 2YHWA 1NM1A 4PL8A 1JCEA 3AAPA 3L6QA 5JICA 1E4GT 4HTLA 5BRFA 4IXCA 3H6EA 3H1QA 2QWLA 5ADXA 2P9NB 1KAXA 5FPEA 2QWMA 2ZF5O 1DKGD 3W0LA 4M7XA 3LDQA 3CJ9A 2E2OA 4BRHA 1SQKA 3IDHA 3B8AX 4ISEA 1CZAN 2P9IA 3O8MA 2P9KA 3S41A 2PBDA 1T44A 2H3GX 2NRHA 2ITMA 4CD3A 4IZ9A 4DB3A 4BRNA 2QWQA 5BPNA 4AM7A 5FPNA 4A61A 3H3NO 4I6MB 2W40A 1NWKA 4BC5A 3R6MA 5AQUA 4BG8A 1Y64A 2CGKA 4BC4A 4B1VA 4PKGA 4CZGA 3D2FB 4FWOA 1V4TA 4C23A 4BVOA 4BRLA 3A8YA 5AZIB 2IVPA 2F9WA 4B1ZA 4BREA 3CQYA 3M1FA 4ISGA 4M7YA 4FL9A 2FXUA 5CE3A 3HTVA 2IVOA 3FZKA 1HKBA 4IJNA 3D2EB 2E88A 1WOQA 3UKRB 4CZIA 1QQMA 3BUZB 3L0QA 2QWPA 3CETA 1D4XA 2P9NA 1RGIA 2FSJA 4PKHA 3O08A 3ZETB 4JAXA 4CBUA 3U9ZA 1BUPA 3F9MA 2FF3B 2I7NA 2P9LB 3QBWA 4Y0WA 4B9QA 3ULEB 1S3XA 2P9PA 5AZJA 3MN7A 3MN9A 1ESVA 5AQRA 2GELA 1BDGA 1X3NA 2HOEA 3OHRA 4BVPA 1BA1A 3CIPA 3FLCO 1H1VA 4K25A 5B8HA 3CERA 1WUAA 3H45C 4IO8A 1IJJA 1KXPA 3VGKA 2EWSA 3QBXA 5ADXH 5BREA 4LC9B 1S22A 4FSVA 4BC2A 5AQFA 4BQZA 4FO0A 5AQGA 3EZWA 5AQSA 4CZLA 2IVNA 1SAZA 4Z94A 5BPMA 1GLAG 1V4SA 1BU6O 2FF6A 5AQOA 5AQLA 5AQVA 4DCHA 4FWSA 1U6ZA 4BR7A 2QWNA 2GTDA 3A5MC 3DXKA 2D1KA 4HWIA 3O5BA 2V51B 3FZLA 3HI0A 1NGBA 4CZFA 3VGMA 3HM8A 2AA4A 1K8KA 1NGAA 3IMXA 4BRAA 3QB0A 2VYPA 4GY2B 5ELZA 2KHOA 5AQXA 4H03B 3VEXA 2GUPA 4FWQA 1QZ6A 2VWBA 4H0TB 5EVZA 4XH5A 5TKYA 5AQZA 5JLFA 3VESA 3WXLA 1YXQA 1NGGA 3VF6A 4ISFA 3RSEB 3GOIA 3O4WA 4YDUA 4JD2B 4BRDA 2YI1A 3U4LA 3ZETA 1LCUA 4XH4A 4H5TA 5AQYA 3ULEA 3O6WA 5AQTA 2YJFA 3BP8A 3UE5A 3UKUB 4EFHA 1T6DA 2P9SB 3WEEB 2E1ZA 4DHYA 2A3ZA 4CZHA 3ZX3A 4O8KA 3CJCA 4B1XB 3KHYA 4BGBA 5KQ8A 3ZEUA 1NGCA 3IFRA 4B1WB 4K41A 3MCPA 2CH5A 3MN6A 5AQHA 4FOIA 4BRFA 1X9JA 1KAYA 4JHDA 4IJAA 3GL1A 3AAQA 1YVNA 4FWPA 3AARA 1BOTO 1Q18A 2CGJA 2FLOA 2VCPA 2D0PA 3M6GA 4MO5A 4QS8A 1HKGA 5KPZA 5JMVA 1GLEG 2Q2RA 4YDUC 3P4IA 1ATRA 5AQQA 3LL3A 4H0PA 4PL7A 3O1BA 1HKCA 3M3ZA 1BO5O 1HJOA 1ATNA 1OKJA 2GWKA 5LJVA 2PAVA 3ID8A 1X3MA 1NGDA 2E1YA 2ZGZA 3RSEA 3FZMA 2YJEA 3WT0A 4E1JA 5AR0A 4JD2A 3DXMB 1HX1A 2F9TA 4NB4A 3JXUA 3W3DA 4BGAA 4BR4A 3EN9A 1TUYA 4XEIA 1BA0A 2A42A 3WQUA 2Q31A 5BPLA 3A5LC 1HPMA 2J4RA 1BG3A 3GE1A 5BRDA 1XUPO 4FPBA 3GBTA 1NGFA 3UKUA 4EHUA 2Q97A 3CI5A 2P9SA 3WEEA 4BR0A 2UYTA 3ZX2A 3QMLA 1YAGA 3WXJA 3HBTA 4FPAA 1U2VB 1GLBG 4FWMA 2QWRA 4BG9A 2HMPA 2FSKA 2QWOA 3I8BA 2V7ZA 1QQNA 4RWTA 4FWKA 4A62A 4A2AA 3QDKA 3JS6A 3CQXA 3HZ6A 2I7PA 3SMPA 4IWVA 1GLLO 4B1YB 5LJWA 3ATVA 3QFPA 4I6MA 3R9PA 2HF4A 1C0GA 3BEXA 3BF3A 3O1WA 3VEWA 4A2BA 4WYBA 3D2FA 3UB5A 2IIRA 5LY3A 1MWMA 1ZC6A 2D4WA 3VPZA 5I9EB 5KQDA 2P9IB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UUAK 5AZIA 3MEEA 3VENA 4BRGA 1HNWK 1X9MA 3CJBA 1U48A 1C1AA 1KVAA 4WF9L 3KIOA 5CZ1A 3BDPA 4RW6A 3I0RA 1SUQA 3EZ5A 3VQBA 4A5BA 3G0ZA 3MN5A 2UXDK 2BE2A 1I39A 3ASMA 3OJUA 3U8XA 3NGZA 2FBVA 3FZFA 3LDNA 4CFAA 5J2QA 2ASOA 4BRPA 5GADP 3FE1A 2Q36A 3HO1A 3QEXA 4CZMA 1HLUA 4LY7A 2P9LA 1BQNA 3LDLA 4KTZA 3BY5A 4DV3K 3VTIA 3L3VA 2AP1A 1B92A 1S1VA 4OGCA 4WFNL 2E6MA 3SUPA 4JK9A 4NYFA 3H3OB 1J54A 3LWMA 2YNGA 2KTQA 3GDQA 3ATUA 4CEZA 2QW9A 3DWLA 1KVCA 2ATQA 4CEEA 4CGFA 2Q0RA 1R59O 4CJTA 1BISA 2WONA 3TI0A 5HRSA 5J2PA 4M3XA 5C0YA 3CYGA 1OH5A 4LF9K 3DRSA 3MXIA 1P90A 1U45A 5AQNA 1NOZA 3TARA 3C6HA 3PSFA 1WLJA 2HHVA 4OO1J 4E7JA 1BI4A 4DG1A 1RFQA 1RTHA 4FWRA 1C6VA 2BGGA 3EKSA 4JKHA 3VQDA 4M3RA 3PIOL 3PX4A 4B9VA 5C15A 4CHYA 3F73A 2HHHK 3P39A 4BRQA 2OPSA 3O4QA 3ZT0A 4F9OA 4ZTFA 4ID5A 1Z6RA 3ZSRA 2G8UA 1FW6A 3QFUA 4WFAL 3KWIA 4MDBA 1EETA 4HTUA 1OVQA 4H4OA 4CK1A 4F4KA 3K5NA 3A5NC 2NRZA 4CGJA 3U3YA 5SWMA 1S1UA 2P9UA 2PZSA 3AA4A 1YHQN 3U9DA 4CZJA 4X62K 4DFPA 4LF7K 3K9JA 5IT9O 3TSUA 3HPGA 4QS9A 4EHTA 5AFUH 1WSHA 3DLRA 1P8ZA 5EX5A 5C12A 3FGUA 1TKXA 1KD1O 4Z4IA 3VEZA 3LDPA 3EL2A 4DF4A 5HOOA 3O9QA 1SL1A 4E7LA 3HSCA 3CFRA 4CI6A 3VQ8A 3EO3A 3KLFA 1NJXA 1LWCA 3CD6N 1YTUA 4DTMA 3ENHA 5AQJA 1NMDA 3MMVA 5EY4A 3DXMA 3CCRN 4FM1A 3LP2A 1XHXA 2NRWA 3CJAA 5TKWA 3V9XA 3TAMA 4FJKA 4CHQA 4QCLA 2YKNA 3OJSA 4F2RA 1RCHA 4O0JA 2OZSA 1FKPA 1G99A 2HBMA 2YCHA 2YHWA 4B8AB 5J2MA 4PL8A 1E4GT 4HTLA 4KFBA 4C1NI 3H6EA 1UOCA 2QWLA 3H1QA 3SQ2A 4PQUA 3NBPA 4FJ7A 4HUFA 1WSGA 2P9NB 4NCBA 2VQEK 3PX0A 3ZT2A 1X9WA 1SQKA 1BCMA 4Q5VA 1N33K 1CZAN 4OJRA 3O8MA 4DSEA 3VQAA 2VGMA 3EY1A 4JYAK 1K6YA 3SAGA 2X78A 2BANA 3RR8A 3OS0A 1TAUA 1BCOA 3P38A 3NH1A 3TWHA 4E89A 4DTNA 5BPNA 4DQIA 3L2RA 4NCAA 4M42A 3OW2M 4A61A 1JLQA 4BC5A 2W40A 3RWUA 2B6AA 3K59A 4H8KA 4ID1A 1KRPA 3R1XA 4FWOA 1HMVA 4Z4EA 1KTQA 1YTAA 4N76A 1EO1A 2QTDA 4FL9A 2FXUA 2IVOA 1YF5L 1HKBA 1QTMA 3CCSN 4FJHA 2DFFA 2E88A 4IDKA 1YI2N 5HP1A 3QNOA 4CZIA 3PV8A 5KRTA 2QWPA 1D4XA 3NGYA 4K8ZA 3ZLJA 1Q8IA 4JAXA 4JI2K 4C8LA 3ZT3A 1KFDA 2HMIA 3AA2A 4O8UA 2FF3B 3QBWA 3QO9A 4Y0WA 4F8RA 2IC3A 3AVFA 4CEOA 1LW2A 3MN9A 4GW6A 1L3UA 1J53A 1TK8A 1BDGA 3OHRA 2IDOA 3I0SA 4MFBA 3CERA 3TANA 5HRNA 1IJJA 5ADXH 3KLIA 1SL2A 4LC9B 4FSVA 4B3MK 4JS4A 2ZD1A 5AQGA 3EZWA 5AQSA 3ZSQA 4E3SA 4C8KA 2F7TA 2IVNA 1S9EA 2LSNA 3DI6A 5BPMA 2FF6A 4LF6K 3NF6A 3HP9A 3MWPA 1ZYQA 2QWNA 3FFIA 5DK5A 2D1KA 4NCGA 3VQ7A 2V51B 3HI0A 2NRTA 3KK7A 3LPTA 3OS1A 1NGAA 1JL1A 2VYPA 4KH6A 3SPYA 3VEXA 4FM2A 3CPWM 4OLAA 4J2AA 1QZ6A 1TK0A 4FVUA 1DT9A 4BE0A 5JLFA 3VESA 1YXQA 4GKKK 1NGGA 3ULDA 3OYEA 3K5OA 3LP3A 1NKBA 3O4WA 4YDUA 4K0KK 4BRDA 4JKCA 3ZETA 2XY8A 4DV1K 4H5TA 3V6DA 3P83D 1W2BM 4GVMA 3P1GA 5FDLA 5J2NA 4FJ5A 4O8KA 3CJCA 3KHYA 5KQ8A 1XC9A 1NGCA 4N47A 5SZTA 2O8EA 4CJUA 5AQHA 4KO0A 2XHBA 3AAQA 3IS9A 4AH9A 2ZE2A 1BOTO 3DRPA 4WCEL 1NK8A 2D0PA 3DRRA 1VQ5N 4KH5A 4W5OA 3OY9A 3SV3A 3HXMA 1TAQA 2Q2RA 1G15A 1LW0A 2XRIA 4IOCL 4H0PA 4PL7A 4AHCA 3K9KA 1BO5O 5DM6L 4LF4K 4Z0UA 3D0PA 4DLEA 3QEIA 2NRVA 3OYGA 1DTQA 3NDKA 2YJEA 4PHTX 3SQ1A 4E1JA 5AR0A 4N56A 3CCMN 3JXUA 5HRPA 3S3MA 4XEIA 1BA0A 1A5XA 2WC9A 1A5WA 3A5LC 2J4RA 4DS4A 1XUPO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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