The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSAADKTNVKGVFSKISGHAEEYGAETLERMFTAYPQTKTYFPHFDLQHGSAQIKAHGKKVVAALVEAVNHIDDIAGALSKLSNLHAQKLRVDPVNFKFLGHCFLVVVAIHHPSALTAEVHASLDKFLCAVGTVLTAKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
PROTEIN (HEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN))
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| publication title |
Avian haemoglobins and structural basis of high affinity for oxygen: structure of bar-headed goose aquomet haemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
57
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-08-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VXE A; 3DUT A; 2VEB A; 1GDJ A; 1CH3 A; 3EOK B; 1J7S A; 2ZS0 B; 4MQH B; 1R1Y A; 3HF4 A; 1F65 A; 2D5X B; 1Y5J B; 4N7O A; 4MQH A; 1Y0A B; 1FSX A; 2VYY A; 3ODQ B; 2D60 B; 3QQQ A; 1TU9 A; 110M A; 1Y09 B; 1DTI A; 3G4V A; 3K8B A; 1LFV B; 2BLH A; 3MYM A; 5D1V A; 2EKT A; 4PQC A; 1JF4 A; 3O89 A; 1O1J B; 1OJ6 A; 3TLD A; 1Y4B A; 1A3O A; 5AZR A; 4AVE A; 3KMF A; 1ABY B; 1ECA A; 3UHE A; 1HGA A; 1Y8H B; 3UHC A; 3GKT A; 2OIF A; 1S56 A; 1Y5K A; 1CG5 A; 1Y7G B; 3LR9 A; 3BJ3 B; 5EET A; 1G0B A; 3P5Q B; 4F4O A; 4FWZ A; 1DXV B; 2YRS B; 4MQG B; 1CH1 A; 1JP8 A; 1BAB B; 1UMO A; 2Z6N B; 1JL6 A; 1BAB A; 3MN0 A; 3ARJ A; 1YCB A; 3NFE A; 4QAU A; 3WCW B; 1JP6 A; 1HBB A; 3U3E A; 2VRY A; 3PT8 A; 1XXT A; 1C40 B; 2MGH A; 1Y0T B; 111M A; 2MGF A; 1J3F A; 2QMB B; 1XZ2 B; 1BBB A; 1YHU C; 2LH2 A; 1YE0 A; 1HLM A; 2ZLW A; 4G1B A; 3QMA A; 5ILR A; 1NZ5 A; 2D2N C; 3WCU B; 2GNV A; 2HBG A; 1LJW A; 1Q1F A; 1RQ4 B; 3UH7 A; 1MLK A; 4ESA A; 1JEB B; 1LFZ A; 5C6Y A; 1IRD A; 1VRF A; 3EDA A; 1A9W E; 1BVC A; 2HBE B; 3UHV A; 1YDZ A; 1T1N B; 5ILE A; 1A01 B; 1HDA A; 5F2A A; 1YIE B; 4U8U C; 1A01 A; 2FRF A; 4ODC B; 3WHM B; 4IRO B; 1Y7Z B; 1B86 B; 1MNH A; 1YIE A; 1Y4F B; 4DWU A; 1I3E A; 1KD2 B; 3UI0 A; 2VM0 A; 105M A; 6HBW B; 3QJD A; 3RGK A; 1Y4G B; 1URV A; 112M A; 1A9W A; 1KR7 A; 1XZV B; 3ZJJ A; 1QSI A; 1NEJ B; 1XZ7 A; 1GCV B; 3VRE A; 1YH9 B; 3TM3 A; 2QSS B; 4MQJ B; 2NRM A; 3HYU A; 2LH5 A; 5HLQ A; 1FSL A; 1EMY A; 2ZFO D; 3AQ9 A; 2JHO A; 1YFF B; 2QFK A; 2W31 A; 1A3N A; 1BJE A; 2ZT2 A; 1VWT A; 1C7D A; 2W6X A; 1X3K A; 1HJT A; 2D2M B; 1CPW A; 3D7O B; 2DXM A; 5HBI A; 4UZV A; 1QXD B; 5SW7 B; 1O1I B; 1DKE A; 4H07 A; 4L7Y A; 2G0S A; 1DUK A; 1LFY A; 1S5Y B; 1G09 B; 1J41 B; 1OFJ A; 1YHU A; 3ASE A; 1HBH A; 1OUT A; 1HAB A; 2HBC B; 2D2N B; 3MKB B; 4F6D A; 1CIO A; 4MU5 A; 1NS6 A; 3D17 B; 4FWY A; 5KDQ B; 2NSS A; 1MTK A; 1O1K B; 1SHR A; 3A59 A; 3UHX A; 3GQR A; 1V4W B; 3QZX A; 1YEO B; 1X9F A; 4ZVB A; 3UHS A; 1UFP A; 1YG5 A; 4FH6 A; 1HBR B; 4NI0 B; 1NS9 B; 3WCV C; 2ZLV A; 4U8U B; 5C6E A; 4MBN A; 1JWN A; 3WTG A; 1DWS A; 1YIH B; 1JY7 B; 1OBM A; 2AUO A; 1MLO A; 5AZQ A; 5B84 A; 1S61 A; 1UIW B; 2R4Z A; 2HHE B; 1LHS A; 1UX8 A; 1MWB A; 1Y0W B; 1Z8U B; 2DN2 A; 1Y45 A; 2M6Z B; 1MOA A; 3OVU C; 3WCT A; 2R4X A; 1H97 A; 1NZ4 A; 1UT0 A; 1HCO B; 3ECZ A; 1VXB A; 2SPM A; 3MJU A; 3HHB B; 4KN3 A; 1MKO B; 1LFT B; 1CH7 A; 1DO7 A; 1YEV A; 1S5X A; 4MQK B; 1YZI A; 1Y7D B; 2HZ1 A; 1CH2 A; 1J7Y A; 3S1J A; 1MLM A; 2LH7 A; 1GJN A; 2O5Q X; 3UBC A; 3A5A A; 1MBC A; 4MQC A; 2GKN A; 1HBI A; 2AA1 B; 3AG0 A; 1JL7 A; 2GTL C; 1MLQ A; 2G11 A; 1IBE B; 1LH6 A; 1Y4P B; 3AT6 A; 2DN1 A; 2H35 A; 1RPS A; 2HZ3 A; 1Y4P A; 2MYA A; 1S6A A; 1Y8W B; 2XKH A; 2MHB B; 1J3Z B; 1DXU A; 1ECD A; 1BZ1 B; 3W4U A; 109M A; 4AVD A; 1ABW A; 1Y8I B; 1GDL A; 2LH6 A; 2MGD A; 1Y83 A; 3O7N A; 1GZX A; 1V9Q A; 1FHJ A; 3HEP A; 2BMM A; 4NS2 A; 1YE2 B; 1MLF A; 3RJN B; 1V07 A; 1RVW A; 1MYM A; 1DWT A; 3SDN A; 2PEG A; 1MYT A; 2OHB A; 2QLS A; 1Y4V B; 3KUO A; 1F63 A; 1MYZ A; 3MJP B; 3BJ1 A; 4JAC A; 3ZOM A; 3FS4 A; 2MB5 A; 1MYF A; 5CN6 A; 4WCH D; 3M39 A; 3WCV A; 2H8D B; 2ZLT A; 1MLJ A; 1V4U B; 1RTX A; 3VRG A; 1YHR B; 5JDO C; 5D5R A; 4IT8 A; 1QSH B; 1Y22 A; 1HGB B; 1U7S A; 5CHQ A; 1YOI A; 2ZLX B; 4HBI A; 3CIU A; 4MXL A; 3D4X A; 1V75 A; 1VXG A; 1NIH A; 2R50 A; 2QU0 A; 3IC0 B; 1JW8 A; 3PIA A; 1Y46 A; 2G12 A; 1Y7C A; 5E83 A; 4PQ6 A; 1YVQ A; 5EE4 D; 1MYI A; 4ROM A; 3PI4 A; 1SPG A; 3UGZ A; 3ZJH A; 1VXH A; 1O1P A; 2QSP A; 1RSE A; 4HRR B; 3NL7 A; 1QI8 B; 2B7H A; 3GDJ A; 1PMB A; 4YU3 A; 2R1H B; 2ZSY A; 5EUI A; 3GQP A; 1FLP A; 1G0A B; 5M3S A; 2FRJ X; 2EKU A; 3QM9 A; 1CH4 A; 1Y0C A; 2ZSR A; 4NI1 B; 2IG3 A; 3E4N A; 3WR1 B; 2LH1 A; 5E6E B; 2VYZ A; 2GTL B; 1F5P A; 1J3Y B; 1OUU B; 2HHD B; 3ZJM A; 4C0N A; 1J7W A; 3UHW A; 2WTH A; 1LFQ B; 5CHR A; 3WCW C; 4HHB B; 3RJ6 A; 2PGH A; 3GKV B; 4HHB A; 1MLU A; 2FAL A; 2BNL A; 1DTM A; 1CLS B; 1ASH A; 1G9V B; 2GDM A; 4M4B A; 1DUO A; 1UVX A; 3LHB A; 3QJC B; 2ZS1 B; 3S65 B; 1CQX A; 1YMB A; 1DO4 A; 4WJG A; 2W6Y A; 3HRW B; 1CQ2 A; 1YHE B; 4YU4 B; 3WCU C; 4G51 A; 3WFU A; 2XYK A; 2SPL A; 3QM5 A; 1PBX B; 3GQG B; 2HBS A; 3EU1 B; 1YOG A; 1LH1 A; 4XS0 B; 5CNB A; 1Y2Z B; 1Y4R B; 3ZJI A; 4LPI A; 4ROL B; 1J40 B; 3EOK A; 2ZS0 A; 2MYC A; 1C7C B; 2D5X A; 103M A; 1Y5J A; 4DC7 A; 1S0H B; 1YHU D; 1VXC A; 2H8F B; 1Y0A A; 3ODQ A; 2D60 A; 2RAO B; 1Y09 A; 2EB8 A; 2HBF B; 1LFV A; 1O1N B; 1YEN B; 1GBV B; 1H1X A; 1IDR A; 1NWN A; 3GOU B; 2RI4 B; 1X9F D; 4G1V A; 1O1J A; 3BCQ B; 4O1T A; 5HU6 B; 1MOB A; 1CMY B; 2V1J A; 3OZU A; 1CO8 A; 3NML A; 1UFJ A; 1ABY A; 1Y8H A; 4NK1 A; 1HDB B; 1Y35 B; 4N7P B; 3V2V A; 3R5I B; 3QM6 A; 1DLW A; 1Y7G A; 1HBS B; 3BJ3 A; 1OR6 A; 2QRW A; 1UVY A; 2O5L X; 3P5Q A; 5JDO F; 1XZ4 B; 1GLI B; 1DXV A; 2YRS A; 1EWA A; 3WCT D; 1MBO A; 1MLG A; 2D2M C; 1Y0D B; 4MQG A; 2AUQ A; 1NQP B; 3IXF A; 4HSW A; 3UBV A; 2Z6N A; 1ITH A; 2BK9 A; 1MGN A; 3E5O A; 3DHT B; 3WCW A; 2V1I A; 3VAU A; 2MGI A; 1C40 A; 1Y0T A; 5AB8 A; 4HSX A; 1BVD A; 1HV4 B; 1YGD B; 1MDN A; 2QMB A; 1XZ2 A; 3AQ7 A; 2MYE A; 2E2Y A; 4F69 A; 3WCU A; 1MNK A; 1RQ4 A; 3AT5 B; 3VRF B; 1JEB A; 3NG6 B; 3UHY A; 1GBU B; 1NWI A; 2HBE A; 2VLZ A; 1T1N A; 2ZST A; 1Y8K B; 5EYJ A; 3UHN A; 1XZU B; 3OO5 B; 4ODC A; 3S66 B; 3WHM A; 4IRO A; 1Y7Z A; 1B86 A; 1ECN A; 1BIJ B; 1Y4F A; 2MGB A; 2MGE A; 1SI4 B; 3ZJL A; 4C44 A; 1KD2 A; 1QPW B; 6HBW A; 1JPB A; 3OK5 A; 1MNO A; 3S48 C; 1Y4G A; 2AV0 A; 4NK2 A; 4WJG 1; 2R4Y A; 4H2L B; 1XZV A; 2HBD B; 3B75 B; 1L2K A; 3G53 A; 4N7N B; 3SZK B; 1NEJ A; 1M6M A; 1GCV A; 1IOP A; 5EV5 A; 1YH9 A; 3UHU A; 1ABS A; 2QSS A; 4ZVA A; 4MQJ A; 3V2Z A; 1YOH A; 2MGG A; 2MYD A; 2D5Z B; 2ZWJ A; 5EOH A; 1LUE A; 4X0L B; 1YFF A; 1O1O B; 3PEL B; 3PI9 B; 1DM1 A; 2NRL A; 1S69 A; 1UC3 A; 4PQB A; 1C7B B; 2D2M A; 3D7O A; 1HDS B; 2R80 B; 1K1K B; 4M4A B; 1QXD A; 5SW7 A; 1O16 A; 1YEQ B; 2W6V B; 4UUR A; 1O1I A; 2ZFB B; 1B0B A; 1LHT A; 2ZLU B; 1YGF B; 2GLN A; 1DXT B; 1S5Y A; 1YVT B; 1G09 A; 1J41 A; 3MYN A; 3AQ8 A; 3EDB A; 3G4U A; 1MCY A; 2HBC A; 2D2N A; 1DO1 A; 3HXN B; 3MKB A; 2ZSS A; 3QQR A; 1DXC A; 4F6J A; 3D17 A; 2W6W A; 2AUR A; 5KDQ A; 2FRK X; 1O1K A; 1V4W A; 1YEO A; 2EVK A; 2O5M X; 1HBR A; 3D1A B; 1A6M A; 4NI0 A; 1NS9 A; 1SDL B; 3LB3 A; 4U8U A; 5CNE A; 5MBA A; 3G52 A; 3A5B A; 2ZSO A; 1YIH A; 1JY7 A; 1NZ3 A; 3DHR B; 1A4F B; 1AZI A; 1BZ6 A; 1HAC B; 1XY0 B; 4F6G A; 5F0B A; 1CH9 A; 1UIW A; 1RTE A; 1HHO B; 2HHE A; 2OH8 A; 2EB9 A; 3BOM B; 3LR7 A; 104M A; 4MPM A; 4O4T A; 2V1H A; 1Y0W A; 5CN8 A; 2M6Z A; 3ARK A; 1MBS A; 1Y4Q B; 2ZFO C; 1HCO A; 1WLA A; 1FAW B; 2ZS0 D; 1MLL A; 5ILP A; 3A0G B; 5CN7 A; 1FN3 B; 2QFN A; 1LA6 B; 3HHB A; 1FN3 A; 1HGC B; 1LFT A; 1MKO A; 4F6F A; 2DHB B; 1Y5F B; 4MQK A; 2HZ2 A; 1Y7D A; 1CG8 B; 2VLY A; 3G4W A; 4HRT B; 5HY8 B; 2LH3 A; 1NXF A; 2ZSX A; 3OZV A; 1CBL A; 1VHB A; 4MQI B; 1GCW B; 2AA1 A; 1THB B; 3KUN A; 1AJH A; 1XZ5 B; 1IBE A; 1GDK A; 2ZSP A; 4TWU A; 1W92 A; 3DR9 A; 1Y8W A; 4VHB A; 2MHB A; 1J3Z A; 1LTW A; 1BZ1 A; 1BZ0 B; 1SDK B; 1A0Z B; 3PI8 B; 3LQD B; 3GYS B; 3ZJO A; 1DWR A; 3WFX A; 1Y8I A; 1EW6 A; 3ONZ B; 1JZM A; 1MLN A; 1COH B; 1FDH G; 2ZS1 C; 1WMU B; 1XYE B; 1K0Y B; 1YE2 A; 4B3W A; 1XYE A; 4FC3 B; 3QJE B; 1MNI A; 1URY A; 1F5O A; 1RQ3 B; 2GRZ A; 1Y4V A; 1VXD A; 3BJ2 B; 2DN3 B; 3QM8 A; 3MJP A; 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1V4X B; 1O1L B; 4MXK A; 4XS0 A; 2BLJ M; 3G46 A; 5JGG B; 1R1X B; 2O58 X; 1Y2Z A; 1Y4R A; 4ROL A; 1J40 A; 2WY4 A; 1J52 A; 1C7C A; 5HAV A; 3DUT B; 1S0H A; 2MGA A; 2H8F A; 1J7S B; 3UHR A; 1R1Y B; 3HF4 B; 5EE4 C; 1HLB A; 4KJT A; 2RAO A; 2NX0 A; 2D2N D; 4N7O B; 5CMV A; 1FSX B; 1JF3 A; 2HBF A; 2WTG A; 1O1N A; 1YEN A; 2AUP A; 1LH5 A; 1GBV A; 3GOU A; 3K8B B; 1YCA A; 3UHH A; 2RI4 A; 2GRF A; 3BCQ A; 1XCH A; 3ZOL A; 5HU6 A; 2EF2 A; 5HLX A; 1CMY A; 3MBA A; 5CN4 A; 4U8U D; 1Y4B B; 1A3O B; 3ZJR A; 1DLY A; 1HDB A; 1Y35 A; 4N7P A; 2GRH A; 3K9Z A; 3R5I A; 1HGA B; 2ZT4 A; 2G3H A; 2O5T X; 1HBS A; 2V1G A; 1Y5K B; 5HLU A; 1CG5 B; 1JZK A; 3ED9 A; 1XZ4 A; 2GNW A; 1GLI A; 1G0B B; 3SDH A; 5MBN A; 1GVH A; 4F4O B; 1Y0D A; 1NQP A; 3E5I A; 3DHT A; 1Y01 B; 1N9F A; 3NFE B; 2MGM A; 1HBB B; 1HV4 A; 1CH5 A; 1YGD A; 2VLX A; 4UIQ A; 3QZZ A; 4F6I A; 3PT8 B; 1XXT B; 3BA2 A; 4BJA A; 2MGC A; 6HBI A; 1BBB B; 2ZT3 A; 1YE0 B; 2ZLW B; 5ILM A; 2V1K A; 4NZI A; 3AT5 A; 4F6B A; 3VRF A; 3A5G A; 1LJW B; 1MOH A; 1SWM A; 2V1F A; 3NG6 A; 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