The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
119
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sequence length |
284
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structure length |
284
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYRGGVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
PROTEIN (DEOXYHEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN))
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| publication title |
Genetically crosslinked hemoglobin: a structural study.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
119
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| structure length |
284
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| sequence length |
284
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3OZU A; 4JAC A; 2HBE A; 3ZJI A; 1YFF A; 2R80 B; 1Y8I A; 1MGN A; 2QLS B; 1BBB A; 2V1J A; 1G9V A; 2EVP A; 1BAB B; 1HGB A; 3ONZ B; 1RTX A; 1MLR A; 2EF2 A; 3UI0 A; 1O1J B; 4KMW A; 3GDJ A; 3DR9 A; 1Y5J B; 2LHB A; 4TWU A; 1HV4 B; 2W6V A; 3FS4 A; 2RI4 A; 1MLQ A; 3FH9 B; 4O2G A; 3WCT A; 4H2L A; 3ZJP A; 1S5Y B; 2ZSZ A; 2WY4 A; 3QM9 A; 104M A; 3IA3 B; 5HY8 B; 2FRJ X; 1GDJ A; 4ROL A; 1LFL B; 2W6X A; 5CMV A; 3VAU A; 5JGG B; 2QSP A; 3BCQ B; 3WCW D; 5AB8 A; 1BZZ B; 3WI8 A; 4G51 A; 2AUQ A; 1YZI A; 1N9I A; 3OK5 A; 1BZ0 A; 1MBA A; 2HBF B; 1Y8K A; 1M6C A; 1B86 B; 3ARK A; 4N8T A; 2DXM B; 1DKE B; 3V2V A; 1QI8 B; 1X9F D; 3QJC B; 1Y0T B; 2EKT A; 1TU9 A; 5CN4 A; 3H57 A; 2ZT3 A; 3M3B A; 3WFW A; 1HBA A; 1LJW A; 4ROM B; 3UHD A; 3HF4 A; 1BZ1 A; 1QPW A; 2V1E A; 2GNW A; 1ABW A; 3DHT A; 4JYQ A; 4MBA A; 1OBM A; 1NS6 B; 1K1K A; 3LHB A; 4HSW A; 1YHE A; 1CH4 A; 2Z6N A; 3WCU B; 2XKH A; 2MGK A; 1HDA B; 2QRW A; 3LB4 A; 1Y45 B; 3D17 A; 1XZU A; 4ODC B; 1MLK A; 1A3N A; 3QQR A; 2EVK A; 3HYU B; 4HSX A; 1Y85 B; 1RQA B; 3S66 B; 1HGC A; 1Y4V A; 1DO1 A; 1HDB B; 2MGE A; 5EV5 A; 1N9X A; 1DXU B; 4AVE A; 1C7B A; 1FAW B; 1HLM A; 1BZR A; 1Y5K B; 2ZT0 A; 3V2Z A; 3OZW A; 3WR1 B; 4NXA A; 1YEV B; 5CNB A; 1JPB A; 1VHB A; 1DWT A; 1OR6 A; 2LH6 A; 1BJE A; 1FDH A; 1HRM A; 4N7P A; 2H35 A; 1XZ2 A; 2CMM A; 4YU4 B; 3ECL A; 3NML A; 3ZJM A; 4DWU A; 1CH2 A; 3P5Q B; 3CIU B; 4FWX A; 1JL7 A; 3WCV A; 4MQJ A; 2V1H A; 4M4B A; 1FSL A; 3QJE B; 2ZWJ A; 1MBN A; 1QSH A; 1LFT A; 1WMU A; 1V4U A; 1MLL A; 4MQK A; 3AQ8 A; 4F6G A; 3A9M A; 1Z8U B; 1Y31 A; 1XZ7 A; 3HC9 A; 1C7C B; 1R1X B; 2QMB B; 4OOD A; 1RVW A; 3GQG A; 1GDL A; 1DO4 A; 2G0S A; 1CG5 A; 2PEG B; 1Y4P A; 3G4R A; 3PIA A; 4M4A A; 1MYM A; 3AT5 B; 110M A; 1NWI A; 1RPS A; 3VRF B; 3ZJJ A; 1NIH B; 1C40 B; 2XYK A; 2GLN A; 2HHB B; 3OO5 A; 1ECA A; 4AVD A; 5EET A; 1Y0D B; 2DC3 A; 3NFE B; 3VRG B; 2O5T X; 1YMA A; 2DN1 B; 5JDO C; 1QSI A; 1Y0A A; 2VEE A; 3AT6 B; 3S48 C; 1JZL A; 1YHR B; 1M9P A; 3ZOM A; 3RJ6 A; 3HXN B; 1VRE A; 2G14 A; 1Y22 B; 2R1H B; 1EW6 A; 1FSX B; 1MYT A; 4F6J A; 2G3H A; 1Y4G A; 1A4F A; 4OF9 A; 1S5X B; 2MGG A; 5IKS A; 1MWD A; 3R5I A; 2MYD A; 1HAB B; 5JOM A; 1Y4R B; 2BNL A; 1NAZ A; 1J7Y A; 2RAO A; 3QJB A; 5E83 A; 3G4V A; 1UX9 A; 3ZJN A; 3EOK A; 4N7N A; 3DUT A; 2H8D A; 1SPG A; 1JZK A; 3UHE A; 1XY0 A; 1NQP B; 4H0B A; 3AQ5 A; 2OH8 A; 1YH9 B; 3OJ1 A; 1HGA A; 1J41 A; 1CO8 A; 5JDO D; 3OVU C; 2D60 B; 2HZ2 A; 1MDN A; 3WFU A; 2QU0 A; 3LR7 A; 2HBE B; 4NI0 A; 1YFF B; 1Y8W A; 1Y8I B; 2GKN A; 1J7W A; 3BJ1 A; 1G9V B; 2G0X A; 3PT8 B; 3QM8 A; 1KFR A; 1CG8 B; 4MQG B; 2ZFO C; 1Y0C A; 3GDJ B; 5CHQ A; 4FH6 A; 2RI4 B; 2ZSS A; 1LA6 B; 4H2L B; 1DM1 A; 3HRW A; 1BVD A; 3KUN A; 2HBD A; 3A59 B; 1Y5F B; 4NK1 A; 1GVH A; 3D1K A; 1CMY A; 1XZ5 A; 2QSP B; 4MQH B; 4YU3 B; 2M6Z A; 2SPM A; 1MBD A; 1Y8H A; 3MKB A; 1Y0W B; 3BOM A; 1Y2Z A; 4ILZ A; 4H07 A; 1HSY A; 2QSS A; 3IC2 A; 1NXF A; 2OIF A; 1JDO A; 5HLQ A; 1W92 A; 2ZT2 A; 3ED9 A; 2FAL A; 4N8T B; 1Y4F B; 2ZSO A; 3BJ2 A; 5CN8 A; 3WCV D; 1RQ4 A; 5EQM A; 1F65 A; 1AZI A; 1CLS B; 2GL3 A; 2R4Z A; 1DWR A; 1CQX A; 1HBA B; 4MQI A; 4ESA A; 3HF4 B; 2ZFB A; 4PQC A; 2DN2 B; 1RQ3 A; 2DN3 A; 2V1G A; 3WHM A; 1Y46 B; 3A0G B; 2FRI X; 2HHE A; 3ODQ A; 3AQ9 A; 1G08 B; 3OGB A; 1T1N A; 1K1K B; 1MLS A; 3D1A A; 3PI8 B; 3GQP B; 1YHE B; 2Z6N B; 1SDK A; 3HEO A; 4F6I A; 3NMM B; 1YHU C; 2W6Y A; 4HRR B; 1MNJ A; 4MBN A; 1XZU B; 5EUI A; 2KSC A; 1TES A; 1WLA A; 1JF3 A; 5EOH A; 2HHD A; 1MNH A; 2ZSX A; 5E6E A; 4HHB B; 2GTL C; 4MU5 A; 1IBE A; 2VYW A; 2MGJ A; 1HBH B; 2ZLT B; 1UVY A; 1C7B B; 3W4U B; 1MBC A; 5MBN A; 1JY7 A; 2AA1 A; 1MLF A; 1HBR B; 4NS2 A; 1OFK A; 1YG5 B; 2HCO A; 2Z6S A; 1IT3 A; 1X3K A; 5HBI A; 1HBS A; 4N7P B; 2H35 B; 1XZ2 B; 3HHB A; 1FHJ A; 5F0B A; 2ZFO B; 4MXK A; 1JZM A; 1A6M A; 4TYX A; 1O1L A; 3WCV B; 4MQJ B; 3LB1 A; 4M4B B; 1A0Z A; 1CIO A; 4WJG A; 1MLO A; 2O5O X; 1DLY A; 1DO7 A; 1LFT B; 1WMU B; 2LH7 A; 1VXD A; 3MYM A; 4FC3 A; 4PNJ A; 4X0L A; 2G0V A; 4MQK B; 4MQC A; 2GTL D; 1BUW A; 4XS0 A; 1Y31 B; 1XZ7 B; 1Y09 A; 1FN3 A; 3UHS A; 4F6D A; 1Y7D B; 2SPL A; 3MN0 A; 1S0H B; 3WCW C; 1PBX B; 2FRK X; 3PT7 A; 1XQ5 A; 1SHR A; 3PIA B; 5JDO F; 1YE0 B; 3ZJQ A; 3EDA A; 3UHI A; 1HHO B; 1RPS B; 3ECZ A; 1V4W B; 1SI4 A; 2BLI A; 1YMC A; 1YVQ A; 2G0Z A; 1MKO A; 1ECO A; 1EBT A; 4KMV A; 3VRE A; 3ZH0 A; 4QAU A; 2VHB A; 1GCW B; 2O5Q X; 2MYB A; 3SDH A; 1GBU A; 3H58 A; 1YIH A; 3UHX A; 1YIE A; 1X9F C; 1G0A B; 1IDR A; 2O58 X; 1HBB A; 2ZT4 A; 2V1K A; 1G09 A; 1MNI A; 1EWA A; 2PGH A; 1Y4G B; 1A4F B; 4ZVA A; 2VLY A; 1MLH A; 1UIW A; 1V75 A; 2D5X B; 3KMF A; 1Y7C B; 3R5I B; 3UBC A; 4F4O A; 1A01 B; 1YHU B; 1AJ9 A; 1XXT A; 3D4X B; 3MJU A; 4G1V A; 1J7Y B; 1N9F A; 3A2G A; 1GBV A; 1ECN A; 1O1K A; 5E83 B; 1FDH G; 1O1O A; 1ABY B; 2W72 A; 4N7N B; 3DUT B; 2JHO A; 1SPG B; 3S1I A; 1LFZ A; 2BMM A; 1C7D A; 2GTL B; 2OHA A; 2IG3 A; 1HGA B; 1RSE A; 1A00 A; 1LHT A; 2O5S X; 3OO4 A; 1LFV A; 1R1Y A; 2ZS1 A; 1J40 A; 2QU0 B; 3GQR A; 1O1M A; 4VHB A; 3WTG B; 1HDS B; 4DWT A; 1Y8W B; 2IN4 A; 1Y7Z A; 1CH3 A; 4UIQ A; 2MHB B; 2YRS A; 1A9W E; 3UH7 A; 1GLI A; 4WJG 1; 2MYC A; 2OHB A; 1YEQ A; 1YDZ A; 3HRW B; 1QXE B; 2HBD B; 1LFY A; 1YGF A; 2MBW A; 5AZQ A; 2ZLU A; 101M A; 1YE2 A; 3PEL A; 1MBS A; 5HLU A; 3G4U A; 1CH5 A; 1Y01 B; 2G12 A; 2LH5 A; 1CMY B; 3EDB A; 5KDQ B; 4U8U C; 1MYZ A; 1GZX A; 1ECD A; 2M6Z B; 2MGF A; 1URV A; 1XYE A; 2GKM A; 1OUT A; 5CHR A; 3WCW B; 3K3U A; 4IRO A; 3E4N A; 1MNK A; 3MKB B; 3BOM B; 3D7O B; 1QXD A; 6HBW A; 3EU1 A; 3QJD A; 1SWM A; 3DHR B; 3UHR A; 1YVT A; 1KD2 B; 1UT0 A; 1NEJ A; 4SDH A; 1PMB A; 1V4X A; 2O5M X; 3BJ2 B; 1LFQ A; 2MGD A; 1DXV B; 1RQ4 B; 3UHN A; 1VWT B; 4G1B A; 1Y35 A; 2HZ1 A; 3WCT C; 3B75 B; 2ZSR A; 1MBO A; 1X9F B; 2H8F B; 4MQI B; 4ESA B; 2ZFB B; 2BWH A; 2MGI A; 3QMA A; 4U8U D; 2NSS A; 2HHE B; 3IC0 A; 3S65 A; 3KMF C; 1V07 A; 2QFK A; 1CQ2 A; 2ZSN A; 3D1A B; 3BJ3 B; 1SDK B; 5E29 B; 2AUR A; 3WCP B; 2ZT1 A; 2XKI A; 5ILM A; 108M A; 1F5P A; 3NL7 B; 3ZJO A; 2R4W A; 1GDK A; 2ZSY A; 1Y4B A; 1S56 A; 1CO9 A; 1YEN B; 5E6E B; 1K0Y A; 4PQ6 A; 1IBE B; 2WTG A; 5AZR A; 3U3E A; 1D8U A; 5EYS A; 3WCT D; 2D6C A; 5F2A A; 1G0B B; 3G52 A; 1A6G A; 3SZK A; 1MOA A; 1NZ3 A; 3ONZ A; 1SPE A; 1CP0 A; 1MLG A; 2HCO B; 1F5O A; 1NGK A; 2DHB B; 1BVC A; 1OR4 A; 3QM7 A; 2HBS B; 1FHJ B; 1CP5 A; 3LR9 A; 1I3E A; 1O1L B; 3QM5 A; 5HY8 A; 3WFX A; 1MNO A; 1A0Z B; 1UC3 A; 3UH3 A; 5D1V A; 109M A; 3ASE A; 5JGG A; 3BCQ A; 1BZZ A; 1MTK A; 1MYJ A; 2ZLX A; 1MYH A; 4XS0 B; 1Y09 B; 1FN3 B; 1HAC A; 4U8U B; 4F68 A; 1JF4 A; 1VXC A; 3RJN B; 2ZS1 D; 3PT7 B; 1SHR B; 1J7S B; 1LH3 A; 1MOH A; 3NG6 A; 1B86 A; 2DXM A; 1DKE A; 4TWV A; 1FCS A; 2MGL A; 2GRZ A; 3MJP A; 1BBB B; 1LHS A; 2QFN A; 5CNG A; 4HBI A; 3QJC A; 1CH1 A; 1HBI A; 1HGB B; 1LTW A; 2ZST A; 1XZV A; 1YGD A; 3GKV A; 3K9Z A; 2LH1 A; 1CIK A; 3WCV C; 2W6V B; 3FS4 B; 2GDM A; 2VYZ A; 3WCT B; 1OJ6 A; 1UMO A; 5C6E A; 1HBB B; 1Y7G A; 1XCH A; 1NS6 A; 2LH3 A; 3TM3 A; 4ROL B; 4O4T A; 1UFJ A; 2OH9 A; 3QZZ A; 106M A; 2AV0 A; 3WCU A; 2FRF A; 3AG0 A; 1CH7 A; 1HJT A; 1HDA A; 3ZJS A; 1IWH A; 4ODC A; 1V75 B; 3PI2 A; 2ZLV A; 3HYU A; 4F4O B; 2E2Y A; 4G51 B; 2VLX A; 1HBG A; 1YZI B; 2VLZ A; 3MJU B; 1HDB A; 3E5I A; 1BZ0 B; 3UHY A; 1Y8K B; 1BZ6 A; 2AV3 A; 1YEO A; 1DXU A; 2SPN A; 2VEB A; 3UHV A; 1FAW A; 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111M A; 1RVW B; 3GQG B; 2BW9 M; 2WTH A; 1CG5 B; 1A6N A; 1O16 A; 1Y4P B; 3M39 A; 4M4A B; 1VXE A; 5KER A; 1OUU A; 3WFT A; 1A0U A; 1MLN A; 3OO5 B; 3GKT A; 1COH A; 5C6Y A; 1UVX A; 1MOB A; 1DLW A; 3A5B A; 3UHW A; 5HLX A; 1YOI A; 5KKK A; 3UHZ A; 3SDN A; 1DO3 A; 1MLJ A; 1QSI B; 1HCO A; 1Y0A B; 3PT8 A; 3SZK B; 4F69 A; 1IOP A; 2G0R A; 3WCU D; 1CG8 A; 1M9P B; 1DXT A; 4MQG A; 4DC8 A; 4B4Y A; 2D2M C; 3G4Q A; 2XKG A; 2SPO A; 1LA6 A; 1VRF A; 1HLB A; 3KUO A; 2D5Z A; 5HAV A; 1VXH A; 3A59 A; 1Y5F A; 3UHK A; 2FAM A; 1F63 A; 3UHU A; 1NPG A; 1MOC A; 2RAO B; 3QJB B; 4MQH A; 4YU3 A; 1DTI A; 1NS9 A; 1A3O A; 3EOK B; 2H8D B; 2ZLX B; 112M A; 1XY0 B; 2G10 A; 1HAC B; 4GZG A; 1Y0W A; 1UX8 A; 1NZ2 A; 1J41 B; 2D2N C; 2MB5 A; 3A5A A; 3NG6 B; 2EB8 A; 1JW8 A; 1Y4F A; 3GYS A; 1XZ4 A; 2O5B X; 4NI0 B; 1ASH A; 1J7W B; 3BJ1 B; 3MJP B; 2D2M D; 4L2M A; 5M3S A; 1J52 A; 1VXG A; 1CLS A; 1Y0C B; 1XZV B; 1YGD B; 3GKV B; 1RTE A; 1YEU A; 2DN2 A; 3E5O A; 2ZS0 A; 1MBI A; 4IT8 A; 1Y46 A; 3A0G A; 5C6E B; 1O1I A; 2W31 A; 1G08 A; 1Y7G B; 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