1C8XA

Endo-beta-n-acetylglucosaminidase h, d130e mutant
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
KQGPTSVAYVEVNNNSMLNVGKYTLADGGGNAFDVAVIFAANINYDTGTKTAYLHFNENVQRVLDNAVTQIRPLQQQGIKVLLSVLGNHQGAGFANFPSQQAASAFAKQLSDAVAKYGLDGVDFEDEYAEYGNNGTAQPNDSSFVHLVTALRANMPDKIISLYNIGPAASRLSYGGVDVSDKFDYAWNPYYGTWQVPGIALPKAQLSPAAVEIGRTSRSTVADLARRTVDEGYGVYLTYNLDGGDRTADVSAFTRELYGSEAVRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-BETA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE H
publication title Mutations of endo-beta-N-acetylglucosaminidase H active site residues Asp130 and Glu132: activities and conformations.
pubmed rcsb
source organism Streptomyces plicatus
total genus 91
structure length 265
sequence length 265
ec nomenclature ec 3.2.1.96: Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase.
pdb deposition date 1999-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1c8xA00
2BY3A 4W89A 3HU7A 3VVGA 4OJYA 4ZXOA 4HA1A 3VPLA 1H41A 2EPMX 3TA9A 2X0YA 1QOXA 1VB9A 4KGLA 4HZ8A 1EGZA 1G01A 3AHVA 3WH9A 1XH2A 2WVUA 2DGAA 7TAAA 1WCGA 1BPLB 5A6LA 1BSIA 4BQ3A 2FHCA 3A4XA 3W26A 3CZEA 3FN9A 1FHDA 4D72A 5I2UA 2W62A 3SCUA 4MNMA 2W66A 4TTUA 3D5HA 1W2PA 1LWHA 1EA9C 2W61A 3OLGA 4QLLA 3ZMRA 1D3CA 1W9BM 1KXQA 2XYLA 4UFMA 1E15A 3AISA 3WMSA 5LYRA 4PTVA 3CTTA 2VURA 1A3HA 3WF1A 4BCEA 1TR1A 2CBJA 1R87A 1VBRA 1H4PA 2YDSA 1Q6DA 3ZSTA 3ZIZA 4Q22A 3DHPA 2BVTA 2J7HA 2AMGA 2E9BA 4Z2KA 2GVYA 4PMYA 1VFFA 4CGTA 2WKLA 3BAIA 6A3HA 2J77A 4NSBA 4U3AA 1JZ8A 3T0DA 5E09A 4JKLA 1WZMA 3VIMA 4AEFA 2VZTA 1DWJM 4GO8A 3CLWA 3APGA 1E73M 4OOUA 4EKJA 1JDDA 3JUGA 5CGTA 4Z2HA 4JIEA 5E0CA 1S46A 3TTOA 1MQPA 1XD1A 3DC0A 4TVDA 4AZGA 4Z2GA 1LG2A 5D8ZA 1UOKA 1HX0A 3AIEA 4MDPA 3OBAA 3OGSA 2E40A 4CN6A 1HP4A 4FMVA 3PTMA 4MNJA 1CNVA 3QHOA 3WQ6A 1QI4A 4EANA 4P7RA 3U5YA 1K9FA 5FL1A 1BTCA 1JDCA 3L4YA 2WVSA 4LXFA 3U7BA 3RDKA 1BG9A 5A6BA 1ITCA 1E3ZA 2GJRA 2YLAA 1N82A 3UETA 4F79A 3NUKA 3TP4A 2VX4A 4P8XA 4DUXA 4CD7A 3AIRA 1UWIA 3QOMA 4E2OA 4FK9A 2D1ZA 1AVAA 4MJ4A 1UA3A 5ABHA 5EFFA 1UA7A 5DO8A 1MW1A 1M04A 2JFEX 2AAAA 1KWGA 4J3SA 2YL9A 3WMCA 5BYWA 5I77A 1W9UA 2DDXA 1GOQA 2GSJA 4J3VA 2ZE0A 4PCSA 2WWDA 1ISXA 1PX8A 2DSVA 4UZUA 3UG4A 7A3HA 3VD9A 1MFVA 4JFWA 4JHZA 4JL1A 3NYDA 1B3XA 1E56A 1K9DA 4CU7A 1QNQA 3OLEA 1CXHA 1CXIA 1SMAA 1OT1A 1XHGA 2CHNA 3EDKA 5BXPA 1MQQA 4BF7A 2Z1KA 2BHYA 1UWQA 2CITA 1WAWA 3ARWA 3AMCA 4CKQA 3CHDA 2O92A 1BVNP 3AMGA 4M24A 5CSYA 2XJ7A 3T0AA 1JYWA 3VIPA 2GUYA 1FP9A 5BROA 1J18A 3MS8A 3AMLA 1KXTA 1GHRA 4JAWA 5EB8A 4AXNA 1W3KA 4YN5A 2WKGA 4KH2A 4AISA 3UG5A 2Q8XA 4XZBA 4E4PA 2ZXAA 4CVWA 1C8YA 1VJZA 1B2YA 1E4MM 1AQ0A 3N12A 1JXJA 3MUAA 4MAVA 1OD0A 2XM2A 4R27A 4X9YA 5CPSA 5EMYA 5TD4A 2J47A 1UKQA 4UNIA 5FOOA 2BY1A 2UY5A 1BAGA 1R85A 4IM4A 4DWSA 5D9PA 1BYBA 4D6FA 3MMWA 2OWWA 3KL0A 4LYPA 3WQ5A 1HNYA 2WZHA 5A6MA 1FOBA 4W86A 1LG1A 4GIAA 3VNZA 4HPHA 5BRQA 3SUWA 2DQXA 3GYCA 1UWSA 1HJSA 2A3HA 4PMXA 2CHOA 4LPCA 5CPTA 3GNOA 2XWDA 3ZR6A 1UYQA 1HIZA 3MMDA 1OT2A 3K8LA 1V3IA 1HN1A 1E6NA 4CD6A 1V6UA 1Z32X 4U31A 2J25A 4CN4A 3PZ9A 1JDAA 1D7FA 3KZSA 5A6SA 1E5NA 4JCLA 1TE1A 1NWTA 1E5JA 4LYQA 1UWUA 2E9MA 2WC3A 3NIYA 1CGUA 1CXEA 3W37A 1G5AA 2EEXA 1TA3B 4RE2A 1HVXA 4QLKA 4J3XA 4CD5A 2XIIA 4ATDA 4ACYA 4WF7A 2GFTA 2WMHA 3L4TA 1JG9A 4KMQA 3UR8A 3WUEA 1EO5A 3N04A 3BSHA 3N18A 4Q7NA 3WD4A 2OYKA 5IHSA 1JYVA 5CLWA 2WVTA 1VRXA 3AMDA 2C8NA 4TOQA 4GZIA 1WZKA 3NCOA 1V3MA 3WNNA 4HMDA 4B9YA 3OGVA 2YKKA 1CLVA 3EDFA 1FFQA 4FF5A 2EO7A 2W5FA 2IXUA 4HPGA 1XCXA 4OKDA 2ZX5A 1VEOA 4ZE5A 1NWUA 1SYTA 1JZ4A 1QPKA 1DP0A 3AZTA 4DM1A 1ZS2A 4HA4A 1E4NA 3RM9A 3CH9A 3KE0A 3PZQA 2A3EA 4JCMA 2WMKA 1DWGM 3WFLA 5F7UA 1TUXA 1C92A 3WQ4A 1HJVA 4AD3A 1H49A 4NRSA 1ISWA 3VIFA 2JEPA 4E8CA 3BAXA 3AIQA 5I24A 1NOWA 1V6YA 2E0PA 2XSBA 2NT0A 1IZJA 2XUCA 3AIWA 3WD0A 1UH2A 4TUFA 4HZ7A 1QHOA 1DEDA 3VIHA 3WNMA 1OIMA 6CGTA 3EMCA 2NSXA 5KEZA 4ACZB 1VEMA 2D0GA 2XVKA 3RPMA 4H8UA 1E70M 5A6JA 3WL0A 4WKAA 2XTKA 1QW9A 1H0IA 2E8ZA 3L4XA 1NQ6A 3WFZA 3SCQA 3VIOA 3ALGA 3CUIA 3W27A 1TCMA 3IJ9A 1L0PA 4JL2A 4CCEA 1WDRA 5M03A 1VF8A 1Q6EA 2BVYA 1QHPA 2D3NA 1LL4A 1V3LA 3WDHA 2GJXB 4PSRA 4BA0A 5FCZA 3WY1A 5AY7A 4EAMA 2G3JA 3HMCA 3VIIA 4H2CA 3U7VA 2XHYA 1WDPA 4W84A 5CPQA 4HTYA 1TVNA 1RP9A 1GOIA 4N42A 1OCQA 2PWHA 1R8LA 2DIJA 1IZKA 1E4IA 2XWEA 4WK9A 3TTSA 3ZJKA 2V5CA 1US2A 1MVYA 4JFUA 1V0MA 3GXMA 1VFMA 1UG6A 1GONA 4XB3A 1YHTA 4AZBA 4A4AA 2CCRA 1V6WA 3THCA 5I23A 3DYOA 3PZIA 2PI6A 5DT5A 2QLYA 4AZHA 4QLJA 2VQTA 1DTUA 4AWEA 5GNYA 2OSXA 4BS0A 2PWGA 2Y8VA 3WDQA 2RGLA 2TAAA 5D8WA 5GPRA 1C7TA 1NP0A 2ZIDA 4NZCA 4PSPA 4W88A 3AIVA 1UH3A 3MSGA 1QI5A 2WC7A 1NARA 3NJ3A 3PTKA 1OBAA 1XSKA 2IUZA 3T0BA 3GTNA 1FFRA 2CNCA 3BAWA 3M7SA 3POCA 3ZO9A 2VNCA 4U3CA 4AIOA 4H8VA 1DHKA 3L2LA 2BXZA 2JALA 3UESA 4J7RA 4N0RA 3VX1A 2VC9A 3CZ8A 1PBGA 3MUZ1 3NSMA 1E71M 5ECUA 1EDGA 5AYBA 1UKTA 1GPFA 3L4UA 3WUBA 2CYGA 3MMUA 2PF0A 2DT1A 3WUGA 1LL6A 1VAHA 4V27A 2VT0A 1J0YA 2WLYA 4FLRA 1JAKA 1LWJA 4HZ6A 3QHMA 4UZSA 2WCAA 1H11A 3L4WA 2BV9A 4GZJA 2D22A 1KBBA 1HXJA 1JZ5A 2EPOA 4QP0A 5A6KA 1BQCA 1F4AA 2ZICA 4WIWA 2VX5A 1W32A 3PZUA 3PZMA 3J7HA 4PMZA 3W81A 4CCDA 1V0KA 4OUEA 4J3UA 4M56A 3GXDA 2XVNA 3WH8A 4A3YA 2A3AA 3AXXA 4MNKA 3PZNA 3NSXA 2GK1B 4MJ2A 4PUDA 1OIFA 5JBEA 4MB5A 2YBTA 1EQCA 1HJUA 2HISA 1R86A 1C3FA 4PMRA 3CUFA 2G8ZA 1E72M 2WHKA 4OOZA 4KWUA 1EIBA 1B0IA 1CGXA 4C7FA 1B3ZA 3AS3A 2YL5A 2QV4A 4R5EA 4F9JA 1DWIM 1CENA 2WLZA 3FW6A 1CBGA 4GZEA 4MAZA 2DSWA 3AIUA 1JNDA 2GDUA 3WQWA 5DT7A 1EDQA 1RPKA 5I79A 3WMBA 4NRRA 2VRJA 5DEZA 4FLOA 3WDPP 2XPKA 5CLTA 3SCPA 1R7OA 3IAQA 1LJYA 5A8QA 5A3HA 3VMPA 1V0LA 1KWKA 3W24A 2Y24A 3AQUA 3WQVA 2WMIA 1KR0A 4UQEA 3T2PA 3SCSA 3OLIA 1YQ2A 3LPOA 1JFXA 1MW3A 5E9AA 2FH6A 5ABGA 3VD5A 1GHSA 4HMCA 4PUEA 1UD4A 4PMQA 1P6WA 2A3BA 2ZXQA 3FY1A 5CXPA 3DYPA 4U5KA 3RO8A 2BY2A 3WENA 1ZL1A 4PN2A 2X8RA 3OG2A 4JKKA 3II1A 1EDTA 3KL3A 4UQ9A 1W91A 1AMYA 1ISZA 1BYAA 2YLLA 3POHA 4MB1A 1FA2A 1MYRA 2DT3A 4D6DA 2VTFA 2PWFA 4AD5A 5D9OA 1XH0A 2ESCA 2C7FA 1GJWA 1JZ3A 2D0HA 3ZSSA 2O9RA 1CGYA 1XCWA 3WD3A 2W67A 4NI3A 1BGAA 1QVBA 5JBDA 1ZB5A 3OA5A 3WUFA 4W8AA 5IHRA 2ZX6A 1W9XA 2VZUA 4IPLA 3DHUA 4PTMA 1ECEA 5C8BB 3N9KA 1PIFA 3GNRA 2CXGA 2JIWA 3CUJA 3BAJA 2YOCA 2D23A 5CSUA 2DH2A 2YL8A 3MUIA 1KGWA 4JHOA 3QHNA 4V2XA 3WKZA 4J3TA 4AD4A 2WB5A 3FNDA 1C8XA 3ZQ9A 2VX6A 1W1VA 4BZYA 1J0IA 2PWEA 1QW8A 4CUCA 3VTRA 2DIEA 5ABFB 1JF5A 5AYIA 5FL0A 3VNYA 4MADA 3OB8A 1UKOA 3BAYA 2O9TA 1OM0A 3QGVA 3GM8A 1H5VA 1GNXA 3CUGA 3SUSA 1E9LA 2RGMA 2QMKA 1V08A 2WMFA 1EH9A 4P7OA 1UR4A 3KL5A 1JYNA 3SIMA 1JFHA 4ZE4A 2V3FA 3WEMA 1WP6A 4UQAA 4DM2A 2D0FA 4W7UA 3W28A 4QAWA 3A6OA 4UQCA 1MW0A 5HPOA 1OGGA 2CKSA 2VCCA 2ZUVA 1G9HA 1XRVA 3WD2A 1W9DM 3THDA 3U5UA 5A8OA 1ZU8A 3FAWA 1BF2A 4TX6A 2VUYA 3AZSA 4EE9A 1J0ZA 2Y8KA 2J75A 3ZT5A 1GVYA 2WWCA 9CGTA 2GJPA 1XYFA 3IAPA 2JEQA 3AS2A 3MANA 4PTXA 1MWOA 3TTQA 1KB3A 5A6BD 2J8FA 1TFVA 2YBUA 2OWCA 2WZIA 2YA2A 3N15A 2PBGA 2QF8A 4W8BA 2E3ZA 4P8WA 4FLSA 4PTWA 3G6MA 5KZ6A 1HP5A 5HXMA 2ZX9A 1CXKA 3EYPA 3AMKA 4S3JA 1GUVA 3AYSA 3WELA 3VIJA 1PJ9A 4B9ZA 1J9YA 5GNZA 1Q6FA 2E4TA 1H2JA 2EPKX 4H04A 1U30A 1VBUA 3ARVA 3TONA 2VZSA 1WZAA 3WH5A 4D6IA 1UD2A 3S2CA 1UD3A 4DWSB 1KFWA 3AICA 3EMZA 2V3GA 3VGDA 1W3LA 3LMYA 4HMEA 2WC4A 2J7FA 3M46A 3RMEA 4J28A 2DSUA 5HBFA 3GZAA 3ZT6A 3PZGA 4AZCA 1ZBCA 3N1AA 5FKYA 1UUQA 2D24A 4UTFA 2WCGA 3CIVA 3UG3A 2WYSA 2VZOA 1NM9A 3ARQA 3AHXA 4UFLA 1JAEA 4M29A 4AY1A 1GOMA 2F61A 1UR0A 4LYRA 1PX4A 3VINA 3VMOA 3ALFA 4XV0A 5M3WA 3AI0A 5JIWA 1HL8A 2WVVB 3AYRA 4F8XA 3CBWA 4AZ6A 3AIBA 2J7CA 1JZ7A 2X09A 3SUVA 1WB0A 3WNKA 4M81A 2VMFA 1UKSA 2WNWA 3KWXA 4PCTA 3NDYA 1U33A 4Z2IA 1PEZA 3RIKA 2J8GA 1ZBKA 4UQDA 3BAKA 3GNPA 3CO4A 1W2VA 4PMDA 2VRKA 4W7WA 3VMNA 5I6SA 1RP8A 4DWSD 2DSZA 3ARYA 2E8YA 5E70A 3QOKA 5D4YA 3WEOA 2J7EA 2F2HA 4QDMA 3GBEA 3O9NA 4Z2LA 3WNOA 3ARTA 3PN8A 3EDJA 4DUVA 1PX3A 4GQQA 3BXWA 4UFHA 1ODZA 2CBIA 3VDBA 3SCNA 3VU2A 1UZ4A 1V03A 1GOWA 4AEEA 4GI8A 1V0NA 4OZOA 4J3WA 8CGTA 3T08A 1I1XA 5E0FA 3FAXA 3AJ7A 2PB1A 1B9ZA 5CGMA 3MUY1 4HOXA 1E6XM 3ZJ7A 3AROA 2VQUA 4PMNA 3VIKA 4DUWA 4C7DA 3W29A 4W85A 1QBBA 2VZVA 4F9DA 3WF0A 4K68A 1DWFM 3OIHA 2DSKA 4UOQA 3CMGA 4ATLA 2IXVA 4RE4A 1UD6A 1E4LA 2XVLA 1HKKA 1MW2A 3WH7A 3LPPA 3FHQA 3VO0A 2WHJA 1E6PA 2ZWZA 3VGFA 2JF6A 1W9PA 3PTQA 1JGIA 4CCCA 1PZ2A 2CEQA 1BYDA 1NOFA 2OYLA 3WN6A 1GJUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BY3 A;  4W89 A;  3HU7 A;  3VVG A;  4OJY A;  4ZXO A;  4HA1 A;  3VPL A;  1H41 A;  2EPM X;  3TA9 A;  2X0Y A;  1QOX A;  1VB9 A;  4KGL A;  4HZ8 A;  1EGZ A;  1G01 A;  3AHV A;  3WH9 A;  1XH2 A;  2WVU A;  2DGA A;  7TAA A;  1WCG A;  1BPL B;  5A6L A;  1BSI A;  4BQ3 A;  2FHC A;  3A4X A;  3W26 A;  3CZE A;  3FN9 A;  1FHD A;  4D72 A;  5I2U A;  2W62 A;  3SCU A;  4MNM A;  2W66 A;  4TTU A;  3D5H A;  1W2P A;  1LWH A;  1EA9 C;  2W61 A;  3OLG A;  4QLL A;  3ZMR A;  1D3C A;  1W9B M;  1KXQ A;  2XYL A;  4UFM A;  1E15 A;  3AIS A;  3WMS A;  5LYR A;  4PTV A;  3CTT A;  2VUR A;  1A3H A;  3WF1 A;  4BCE A;  1TR1 A;  2CBJ A;  1R87 A;  1VBR A;  1H4P A;  2YDS A;  1Q6D A;  3ZST A;  3ZIZ A;  4Q22 A;  3DHP A;  2BVT A;  2J7H A;  2AMG A;  2E9B A;  4Z2K A;  2GVY A;  4PMY A;  1VFF A;  4CGT A;  2WKL A;  3BAI A;  6A3H A;  2J77 A;  4NSB A;  4U3A A;  1JZ8 A;  3T0D A;  5E09 A;  4JKL A;  1WZM A;  3VIM A;  4AEF A;  2VZT A;  1DWJ M;  4GO8 A;  3CLW A;  3APG A;  1E73 M;  4OOU A;  4EKJ A;  1JDD A;  3JUG A;  5CGT A;  4Z2H A;  4JIE A;  5E0C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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