1C91A

Endo-beta-n-acetylglucosaminidase h, e132d
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
KQGPTSVAYVEVNNNSMLNVGKYTLADGGGNAFDVAVIFAANINYDTGTKTAYLHFNENVQRVLDNAVTQIRPLQQQGIKVLLSVLGNHQGAGFANFPSQQAASAFAKQLSDAVAKYGLDGVDFDDDYAEYGNNGTAQPNDSSFVHLVTALRANMPDKIISLYNIGPAASRLSYGGVDVSDKFDYAWNPYYGTWQVPGIALPKAQLSPAAVEIGRTSRSTVADLARRTVDEGYGVYLTYNLDGGDRTADVSAFTRELYGSEAVRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-BETA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE H
publication title Mutations of endo-beta-N-acetylglucosaminidase H active site residues Asp130 and Glu132: activities and conformations.
pubmed rcsb
source organism Streptomyces plicatus
total genus 96
structure length 265
sequence length 265
ec nomenclature ec 3.2.1.96: Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase.
pdb deposition date 1999-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1c91A00
1H0GA 1GOKA 2NSXA 3WQ5A 4B9ZA 4U3AA 1WNOA 3CZEA 1JI1A 4J3WA 3AROA 4MNMA 3BSHA 4ATDA 3AHXA 4XV0A 5EMYA 1W1TA 4W8BA 1PX3A 3OIHA 5AYIA 3EMCA 3BAIA 1WDRA 3L4VA 3PZTA 4QLKA 2W91A 4F9DA 2PI6A 4F79A 1G5AA 4PCTA 3VGEA 2BHYA 5HXMA 2CHNA 3B8SA 2VT0A 4AZ7A 1CECA 3G6LA 2BV9A 3WD3A 4F9JA 1OIFA 1C8XA 1RPKA 2X0YA 5A2AA 3AJ7A 4J3TA 1BTCA 4XB3A 2D2OA 4GI6A 1FFRA 4N0RA 3VOCA 3WF1A 1V3JA 5I77A 1E73M 4PCSA 1C90A 1W1PA 4WSKA 1IZJA 4NRSA 3MU7A 2ZX8A 2V5CA 2VRKA 3OBAA 4D6DA 2VX4A 3UEQA 4M8UA 2EO7A 4XZWA 3GNPA 1UR1A 2WHKA 4QAWA 5A6BA 3MSGA 1W3HA 1MYRA 1TMQA 3N13A 3NDYA 1EXPA 4H8UA 4D1IA 4DWSA 5E70A 4UQAA 2DQXA 1BYBA 1VF8A 1AVAA 1C7TA 4FF5A 4LYPA 2VVNA 1DWAM 2W67A 4A3YA 3S6TA 4XUYA 2VQUA 1KGUA 4M81A 3N1AA 1UQYA 3AHYA 2J78A 3GYCA 2DH3A 5DT7A 4LGXA 1US3A 3ZQ9A 2CEQA 2VX5A 2VZOA 1KB3A 4B15A 1VBUA 1QNPA 5FOOA 3NYDA 1QI5A 1QW8A 1R86A 1MFUA 1US2A 2XG9A 3A6OA 1E71M 1S46A 6A3HA 2VRQA 2WAGA 5F7UA 1JZ8A 1WZLA 1EDQA 2WMKA 4GO8A 3EDJA 3LPGA 5A95A 3WQVA 4WKAA 1B3XA 3TOPA 2J8GA 4BQ4A 2Z1SA 4PMXA 3VGHA 2Y8KA 2A3AA 3ZOAA 2WLZA 1KCKA 2DGAA 3AIEA 3THDA 2G3MA 3GH4A 4PUDA 2CITA 2GVYA 4TUFA 4GZEA 1OT2A 1VEMA 3WMBA 1LL7A 3SCRA 5I0DA 4KGLA 2BS9A 1JL8A 4ZFMA 3PTMA 3CHCA 1TVPA 3BCDA 3VTRA 2YL6A 1MW3A 4AEEA 2VZSA 3AMLA 1PIGA 4RE2A 4UZSA 3OZPA 5A6SA 4JFUA 3GBEA 4PMZA 2IXUA 1CZ1A 1H5VA 2DIEA 3U7BA 1KWGA 1FHDA 1Q6FA 2J75A 3AZRA 4PUEA 4UR9A 2UY5A 1JZ5A 1JGIA 3OGRA 3QHNA 1WZAA 1ISWA 2A3CA 3WD4A 3SEPA 1HJWA 1W3LA 3A4XA 2WW5A 1UR9A 1XD0A 4LQ1A 2WCSA 2ZX9A 4X0NA 1MQPA 2WNWA 4CD5A 3B9AA 1B2YA 3IJ8A 1CXIA 3EDEA 2YBUA 1QNQA 4KMQA 2CBVA 3WFZA 3TA9A 4H7VA 1X6LA 4CU7A 4ACYA 1TG7A 5A69A 3W53A 2J7HA 4M24A 3BXWA 4ZXLA 2O9TA 3ZJKA 1ZBVA 4UQ9A 2ZX7A 5ABFA 3GBDA 2GK1B 5DF0A 1E0XA 3UERA 1BF2A 3PZNA 4E2OA 5IFTA 4GI9A 1UD4A 3ZT7A 4PN2A 1ESWA 4ATLA 2OWXA 3K8KA 3MO4A 1E1FA 4CU6A 3EMQA 5FL0A 2CKRA 1C91A 3GH5A 3FXYA 2BY2A 2BVYA 2EXOA 4D6JA 1A47A 5AYBA 3M7SA 2BVDA 1EA9C 5A94A 4H41A 3QOKA 2BY1A 4PYSA 5CZKA 4DWSB 4CKQA 3SCSA 4W7WA 3EMZA 5I79A 3AHZA 4BS0A 1HJUA 1VB9A 1HIZA 1VFMA 2XM2A 3WF2A 1CXFA 1DWGM 4QDMA 1JZ4A 1MXDA 2VURA 1JI2A 3SCVA 4YN5A 3PZVA 3WDHA 4PMQA 2O9RA 1K9TA 2WMIA 4MB4A 2EQDA 3VUPA 4NF7A 3MUZ1 1ODUA 1D3CA 2ZUSA 1IT0A 5HDRA 1ISZA 1FFQA 3OLEA 2UY4A 1PX4A 1ISVA 2DEPA 1JZ2A 1Q6GA 3T09A 4RL3A 2WC4A 2FHCA 2JEQA 3VIPA 3T2PA 3ARPA 1PZ2A 2YDQA 3WDQA 5M3WA 1CGUA 1NP0A 3PBGA 2CESA 1C8QA 2IXVA 1R8LA 1WP6A 1HL9A 1SFSA 1CDGA 5E0FA 4W8LA 2DPEA 1FH9A 1XD1A 5E0CA 1W9VA 5CXPA 4AEFA 5I78A 4AMCA 4GINA 3B9DA 3CPUA 3L2MA 1OINA 3WNMA 1EH9A 2G3NA 4TTGA 1R7OA 1W3KA 2W66A 2XWDA 2DT1A 2XVNA 1KCLA 4CN6A 4OBRA 2X09A 4W5UA 3KL0A 2DSKA 3UESA 5FKYA 5C71A 1XYZA 1V6YA 1AMYA 4BQ2A 1GORA 1MW2A 1JD9A 1GVIA 3GM8A 3VIGA 3BC9A 3MANA 3IAQA 3CUJA 1GUVA 1G1YA 1V02E 3POHA 4NI3A 2VRJA 1QHZA 4OBSA 1VFUA 3AQUA 3SUTA 1C8YA 1BYAA 2CNCA 1G01A 4MJ2A 4P7NA 1ZU8A 2F8QA 1J0ZA 4UNIA 1GOMA 3IAPA 1FP8A 4CCCA 2WZHA 3F5LA 5CSYA 4R27A 1FHLA 3VMPA 4U33A 1CGVA 1MQQA 1KXQA 5BRPA 3NSXA 3WQ8A 5GQBA 3CHEA 3KL5A 3VILA 3ZJ7A 1M03A 1UH3A 1QI2A 4CD7A 1LQ0A 3SUUA 1BGAA 1X6NA 1CBGA 1K9EA 1NWRA 4D6CA 4AWEA 3DECA 1JZ3A 4Z2GA 5D8WA 4CUCA 5ECUA 1UR0A 3A47A 3VMNA 1E6QM 2WWDA 2WSKA 2NT1A 3DHPA 2WANA 2XM1A 1KGXA 3FAXA 1JYXA 4X0VA 5JIWA 3AXXA 4MADA 3RO8A 2XPKA 1W32A 1E5NA 5KZ6A 4CN4A 3D5HA 1JFXA 3OGSA 4CD8A 1V6UA 2J7CA 5AY7A 1K9FA 4ZE4A 4V27A 4HOXA 3ZSTA 1WDSA 5E09A 4E8CA 2J62A 2WXDM 2FHBA 2D0HA 3AS1A 1K6AA 2WB5A 4UOQA 4BQ5A 2D24A 2W62A 3WSUA 5E9AA 3OB8A 2WMIB 1W91A 1JYVA 2WVVA 4DUWA 4JFTA 1WCGA 4JL1A 2G8ZA 2JF7A 2BY3A 1H49A 1E6ZA 5HPOA 3GDBA 4MTVA 1KQZA 3MSDA 5LA2A 4E4PA 5A2BA 4Y7EA 1KXTA 3BMWA 1LG2A 1BAGA 2Y4SA 1XC6A 4KRUA 5DT5A 4TVUA 4U2YA 1RP9A 4Z2KA 1XYFA 3RM9A 2WC3A 1CXEA 5CPTA 1UA7A 5AC5A 1KGWA 4AZ5A 5LA0A 4GXPA 4P8WA 1CLVA 1CLXA 3WNLA 1B31A 2Y8VA 1VAHA 5DO8A 3TTYA 2D1ZA 2V3EA 2QLYA 5A8OA 4FLSA 1G94A 1OD0A 4ZXOA 4M1RA 3UG3A 1HT6A 2BFGA 2UY2A 1BVZA 2VOTA 2YOCA 1NH6A 4H04A 3GTNA 1UWIA 4S3KA 4GPNA 4PTVA 2D22A 5DFAA 4GZJA 3N15A 1DWHM 2XGBA 3AICA 1BFNA 4HMDA 1UWQA 4AIEA 5A6MA 2JIWA 1V3LA 1VIWA 2VX7A 1QI4A 3KEHA 3FY1A 5BCAA 2PBGA 1BG9A 1UKTA 2CBUA 3D3AA 2YLLA 4OOUA 1CIUA 4FMVA 4D6IA 1ZB5A 1KBBA 1E55A 1NOFA 4NZCA 2J7BA 2AOSA 1U2YA 3VMOA 3CUHA 1L0PA 3EYPA 2Q8XA 4B3KA 3PZIA 5ABGA 4PMVA 3QOMA 1QVBA 1JG9A 3L4TA 5IHSA 3HJEA 1V6WA 3THCA 4J27A 2ZWZA 4EE9A 2D3NA 5JBFA 1XH2A 4ML4A 3AIWA 3RM4A 1TVNA 4J3XA 3NSNA 3NCOA 3AISA 1HF6A 5LYRA 2GDVA 2ZICA 1V3KA 3ZR6A 2AMGA 1HL8A 3VU2A 1AQMA 3ALFA 2CCRA 1WDQA 1XSJA 1E4MM 3CUGA 3IJ7A 3WD2A 5CJ5A 4Z2IA 2WHMA 2XIBA 1G0CA 1OCQA 2E40A 3UG5A 1JDAA 1GQJA 4PTMA 4QP0A 2OSXA 2PC8A 3VD3A 3WF3A 1UD6A 2X2YA 3WNNA 1OM0A 4CN1A 5BXSA 4ZE5A 5EB8A 2JFEX 2OSWA 3CZ8A 1HNYA 1JD7A 4AZCA 1MWOA 4AD0A 5A8PA 2CBIA 4GQQA 1J0HA 1FH8A 1EO5A 1H09A 1WZKA 3PHAA 3K8LA 1HKJA 4PEEA 4XX6A 5BRQA 3ARQA 4PMYA 4UFJA 1BYDA 2ZUTA 1RH9A 3VX1A 1UH4A 3RMEA 4W84A 1B3VA 1VRXA 4JFWA 5JBEA 3U7VA 4D6EA 2CBJA 5E6YA 6CGTA 5D9OA 1CTNA 1HXJA 1V3IA 1O7AA 1QHPA 3WBAA 2C0HA 1NM9A 3RJXA 5DEZA 3VM7A 4JCMA 3W27A 2VTFA 4Z2HA 2XTKA 3L4UA 1J0JA 3BLKA 3BGAA 2GJPA 3AIBA 1NWTA 4PSPA 2A3BA 3AZTA 3CZKA 5GNZA 5I2UA 1UWSA 3WKZA 1UD5A 5CPQA 1ECEA 4D6GA 2W61A 1OGSA 1Q6EA 4JKKA 1J01A 3VX0A 4JKLA 5A6AA 4MJ4A 4N42A 2WVSA 3SCUA 1E3ZA 5EFFA 1P6WA 4JIEA 1CENA 3WH7A 1DEDA 1E5JA 4U5IA 1CPUA 2D0GA 4ATWA 1HX0A 2Y2WA 3G6MA 3DYMA 2FH6A 1HJXA 1D2KA 2FH8A 1EDGA 1H2JA 3VIJA 1GCYA 3U5YA 3DYPA 4AD5A 3A4AA 1A3HA 1V3MA 1WPCA 3ZO9A 1UR4A 4L4PA 3CTTA 1LL6A 1CXLA 2E0PA 4WLCA 2GDUA 4HTYA 4KWUA 5ABEA 4BF7A 5LA1A 3ARXA 1QI3A 2PWFA 1DTUA 2ZX6A 3KE0A 3WUGA 5HBFA 4DM1A 4M82A 2GFTA 3RCNA 1TR1A 3WDJA 1V02A 3CHDA 1W9UA 4Q22A 1VEPA 2RGLA 1I1XA 1J0KA 4MB3A 4W5ZA 3OZOA 4LYQA 1WB0A 2OYLA 2E4TA 1GNXA 2E9LA 2NW0A 2JE8A 1OIMA 5FD0A 1HVQA 1OSEA 3EDKA 3GH7A 4XZBA 4PMDA 3SCWA 1I1WA 3VIOA 3CO4A 4RE3A 2EBNA 3CUFA 3HN3A 1GOOA 3WDPP 3WELA 3T08A 5IDIA 2BXZA 5HNNA 4DM2A 1TE1A 3KL3A 3CZGA 1UKQA 3VGFA 1TA3A 2XVKA 1J18A 2CKSA 1J0YA 1E6PA 4TX8A 3TTOA 1DHKA 3SUVA 3T2QA 2WVUA 4WF7A 3BCFA 1PJ9A 5D4YA 4W89A 1MVYA 4AZCB 1D7FA 3PZQA 3AIUA 2OYKA 3N18A 1ZBWA 4HZ7A 1BQCA 1UA3A 3NSMA 5GNYA 3F5KA 2D23A 4RE4A 4TVCA 3F5JA 1U33A 4JL2A 5IXEA 3FNDA 3WMSA 5ABHA 2PWDA 3BAWA 1KXHA 5JUVA 1E0WA 2ZUVA 4GZIA 3RILA 4CCDA 5A6LA 2XFYA 3W4RA 3SCQA 4KGJA 3K46A 1TFVA 4UFMA 3VDHA 1UH2A 1VEOA 2JEPA 3AHTA 4AZ6A 2HVMA 2OLHA 2WSPA 3QHMA 4GIAA 1BGGA 3RPMA 3SCNA 3AYSA 1U30A 4AC1X 5A8MA 2X05A 2EPMX 2A3EA 3WL0A 3ZSSA 2X0HA 3UR7A 4UTFA 4D72A 5D9NA 1UZ1A 2J77A 1ITCA 3VDBA 2YIHA 3VINA 5A3HA 1FOBA 4WKFA 1N82A 3L2LA 2WM0A 1E1EA 2JF6A 4C7GA 3W82A 3CZJA 5C8BB 3CUIA 1E43A 2A3HA 3DC0A 1UKPA 3WD0A 4LXFA 4J3VA 3MMWA 5CSUA 3ARVA 1GOWA 3AS3A 1BVNP 4WSJA 2QPUA 1W1VA 3EDFA 1ZJAA 5EFDA 3NJ3A 3VGGA 1B1YA 4D6FA 4AIUA 2D3LA 3NUKA 1HP5A 3VD5A 1WZMA 1QNSA 3BAYA 4MAVA 3OLGA 4D1JA 1VFOA 2BXYA 2WMHA 4AIOA 2EPKX 3I3DA 1PPIA 3NIYA 3WUFA 3ECQA 2W4XA 1DP0A 2XVGA 4PRWA 5A6KA 4GI8A 1PEZA 2BHZA 1V03A 2O92A 1QHOA 3M07A 3L4WA 3W6MA 3VD9A 3WH9A 3WH8A 4AZBA 2J7DA 2PWGA 3GXFA 5ABFB 1ITXA 3MS8A 1E9LA 1NQ6A 3T2OA 2YBTA 4D6HA 4A4AA 1E40A 1B30A 2IUZA 1CXHA 4CCEA 3VKKA 2XFFA 2Y24A 1KWKA 1ZJBA 2WMJA 3CMGA 1E15A 2DSUA 4M29A 1H1NA 5FL1A 2VJXA 5CQ1A 4U3CA 4HOWA 1SMAA 1WAWA 4R5EA 1DWJM 3CHFA 1CGYA 3WIJA 4JKMA 1EOMA 1TA3B 4W8AA 2UWFA 1JZ7A 2VZTA 3N9KA 2RGMA 3VVGA 1L8NA 3L4YA 4YPJA 1NARA 4J28A 1NOWA 5A8QA 2OYMA 1C92A 4MPKA 1GOQA 4OKDA 3VD4A 3W81A 1UD8A 2WCGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1H0G A;  1GOK A;  2NSX A;  3WQ5 A;  4B9Z A;  4U3A A;  1WNO A;  3CZE A;  1JI1 A;  4J3W A;  3ARO A;  4MNM A;  3BSH A;  4ATD A;  3AHX A;  4XV0 A;  5EMY A;  1W1T A;  4W8B A;  1PX3 A;  3OIH A;  5AYI A;  3EMC A;  3BAI A;  1WDR A;  3L4V A;  3PZT A;  4QLK A;  2W91 A;  4F9D A;  2PI6 A;  4F79 A;  1G5A A;  4PCT A;  3VGE A;  2BHY A;  5HXM A;  2CHN A;  3B8S A;  2VT0 A;  4AZ7 A;  1CEC A;  3G6L A;  2BV9 A;  3WD3 A;  4F9J A;  1OIF A;  1C8X A;  1RPK A;  2X0Y A;  5A2A A;  3AJ7 A;  4J3T A;  1BTC A;  4XB3 A;  2D2O A;  4GI6 A;  1FFR A;  4N0R A;  3VOC A;  3WF1 A;  1V3J A;  5I77 A;  1E73 M;  4PCS A;  1C90 A;  1W1P A;  4WSK A;  1IZJ A;  4NRS A;  3MU7 A;  2ZX8 A;  2V5C A;  2VRK A;  3OBA A;  4D6D A;  2VX4 A;  3UEQ A;  4M8U A;  2EO7 A;  4XZW A;  3GNP A;  1UR1 A;  2WHK A;  4QAW A;  5A6B A;  3MSG A;  1W3H A;  1MYR A;  1TMQ A;  3N13 A;  3NDY A;  1EXP A;  4H8U A;  4D1I A;  4DWS A;  5E70 A;  4UQA A;  2DQX A;  1BYB A;  1VF8 A;  1AVA A;  1C7T A;  4FF5 A;  4LYP A;  2VVN A;  1DWA M;  2W67 A;  4A3Y A;  3S6T A;  4XUY A;  2VQU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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