1CA3A

Unexpected ph-dependent conformation of his-64, the proton shuttle of carbonic anhydrase ii.
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Unexpected Ph-Dependent Conformation of His-64, the Proton Shuttle of Carbonic Anhydrase II.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1991-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ca3A00
3IGPA 4KUYA 3N0NA 2WD2A 2AW1A 2ILIA 3DVBA 4ITPA 1KOPA 4RUZA 3SAXA 1XEVA 2O4ZA 3MNAA 1LZVA 1RAYA 1XPZA 3ML2A 3T84A 1ZSAA 4E3DA 1I8ZA 3MHLA 1TG3A 3OYQA 5FNJA 1JD0A 3ZNCA 1LGDA 1CVHA 5BRVA 4YGJA 3PJJA 3K2FA 2WD3A 3RYJB 1CAJA 2WEJA 2NMXA 4WR7A 5JG5B 1YDCA 5SZ4A 4MLTA 1G4OA 3S8XA 3F8EA 4X5SA 2WEOA 1HCAA 4XE1A 3M98A 1CZMA 1KWRA 12CAA 1XQ0A 4Q7SA 4YVYA 1IF9A 3TVNX 3M1KA 1UGCA 4KP5A 4BCWA 1F2WA 5DSNA 3W6IA 4M2WA 1Z9YA 5C8IA 3CYUA 3P44A 3M2ZA 3N3JA 4PQ7A 2HL4A 3OYSA 5G0CA 4COQA 3K34A 2NWOA 1CAHA 1DCBA 3RYVB 6CA2A 5BRWA 1FQLA 5CACA 3KLDB 2Q38A 3DAZA 3S75B 3FW3A 3VBDA 1BV3A 2Q1BA 5BRUA 2NN1A 4QK2A 1BNVA 1LG6A 4Q78A 1CNJA 4KUVA 1H9NA 4E9OX 4RUXA 3RZ5A 3KOIA 4G0CA 3T5ZA 5FLRA 1T9NA 1CNHA 1CINA 5JEPB 5CJFA 5DSQA 1KWQA 1TEUX 1BN4A 4FU5A 3DCWA 4DZ7A 5FNGA 2FNMA 5BYIA 3MHMA 4HBAA 1G45A 4ITOA 5DSMA 4YGNA 4YXOA 1RZDA 7CA2A 1G1DA 3RYZA 3RZ8A 4R5AA 2VVBX 3DD8A 4Q87A 1CAZA 4HT0A 5L6KA 1HUHA 3JXHC 3TVOX 1YO1A 1HEAA 3NB5A 1TEQX 5JGTB 3K7KA 4Q8ZA 4Z1NA 1IF5A 1CCTA 2NNGA 4LP6A 5EH8A 3EFTA 3HKUA 1ZFKA 4XIXA 3HKQA 1OKNA 2POUA 3S73B 1KOQA 2VVAX 3S71B 2H4NA 2POWA 3M5EA 1THKA 3T83A 3Q31A 3FE4A 2CA2A 1BN1A 3P4VA 3V5GA 4ZWIA 3IEOA 4HT2A 1TE3X 1LG5A 1TG9A 1YO2A 3P3HA 3DVDA 4ETQC 4Z1EA 5DVXA 1AM6A 1OKLA 3C7PA 3M67A 1ZGEA 1FLJA 5AMDA 2FOYA 3CAJA 5E5RA 4MDLA 4QJMA 5E28A 1FSQA 4Q09A 3DA2A 1CNBA 1IF4A 5FLSA 2H15A 5EKMA 2HNCA 3KNEA 4WUPA 1G46A 1V9EA 4YHAA 3RG3A 3PYKA 3RYXB 3DD0A 4Q8XA 3IBNA 3KS3A 3HFPA 5FNKA 4YYTA 4XZ5A 3S77B 4N0XB 5J8ZA 3S97A 3D92A 4YX4A 3MNIA 4JSSA 5FNMA 5SZ7A 4IDRX 5G01A 4ZWZA 5E2MA 5SZ1A 3JXGA 3S78B 3JXFA 3HLJA 5FL5A 3M14A 2OSMA 1XEGA 5JG3B 4RN4A 5G0BA 2FNNA 2QP6A 3V3FA 3S9TA 3DCCA 3MZCA 3U3AX 5JEGB 1I9PA 1YDAA 5SZ3A 4N16A 4LHIA 4PZHA 1TBTX 3ZP9A 4JS6A 3B4FA 4QTLA 1TB0X 1G4JA 3M2NA 1YDBA 4QJPA 4DZ9A 5E2NA 1CNWA 4L5WA 4ZWYA 3SBIA 4WUQA 1BN3A 2CBCA 5DRSA 3NJ9A 4FIKA 3MHOA 5EIJA 1RZAA 3FFPX 3MHCA 4YWPA 4M2RA 1I9LA 4YGFA 2W2JA 3RZ7A 5A25A 2EZ7A 1JV0A 1BNTA 5EHVA 3RYYA 3LXEA 1YDDA 4QIZA 1ZFQA 2CBAA 1RJ5A 1J9WA 4HEYA 4JSAA 4QK1A 3TMJA 1G48A 1MOOA 2X7TA 3U7CA 5DSKA 5EZTX 4YGKA 1CCUA 3R17B 2WEGA 3KWAA 4Z1JA 1UGEA 4RIUA 2IT4A 4UOVA 3D0NA 4KNNA 4C3TA 3ML5A 2ZNCA 1CVEA 1G54A 1DMYA 2CBDA 3KKXA 1ZH9A 5FDIA 3S74B 5EHEA 2CABA 3N2PA 3M96A 2AX2A 4E3FA 4LU3A 5E5UA 1FR7A 3P3JA 2GEHA 4R5BA 4QJXA 3V2JA 1UGGA 4ZAOA 1I91A 4Q7VA 4RIVA 5FNHA 2FOVA 4Q49A 4K0ZA 1CRMA 2NXSA 4Q7WA 4GL1X 4TWMA 5HPJA 1UGDA 1HVAA 5FNLA 2X7UA 4M2UA 3MYQA 3OILA 4MDGA 3DBUA 1CNYA 3IAIA 2QO8A 1DMXA 3M5TA 2X7SA 4HF3A 1IF8A 4JSWA 5EKHA 1G53A 3MHIA 3DC9A 5JESB 1CCSA 3T85A 1OKMA 4KAPA 1LUGA 1Z93A 4WW8A 1CNKA 4K0TA 4YXIA 3UYNA 4KUWA 1EOUA 3OY0A 3T5UA 1H9QA 4CA2A 3OKUA 1FR4A 3V7XA 5FL4A 4E3HA 3IBLA 1I9NA 1BNMA 2NNOA 4Q08A 1CVDA 4QSIA 4CNRA 1FQNA 1CALA 5DSOA 1KEQA 4TWLA 1G0EA 5JEHB 3N4BA 5SZ0A 3CZVA 5DSPA 5EH7A 2OSFA 5A6HA 3RJ7A 5FDCA 1TTMA 3M5SA 3M1QA 5EKJA 4MLXA 4JSZA 4RUYA 4KNIA 1IF7A 4CACA 3P5LA 2NWZA 3V3IB 3MDZA 3BL1A 4E3GA 2Q1QA 4Q8YA 4MTYA 1DCAA 1I90A 2HOCA 1UGBA 3M1JA 3B1BA 2F14A 3RLDA 4E49A 5JQTA 1AZMA 2FNKA 4RH2A 2FMZA 1CAMA 3P5AA 4QEFA 2HFWA 1BCDA 2NWPA 5CLUA 4Q9YA 4G7AA 1Y7WA 4Z0QA 3DV7A 4Q6EA 8CA2A 1CAKA 1HEDA 2CBEA 4KV0A 4KNMA 4CNXA 1FSRA 2FW4A 4QSAA 3S76A 5FLTA 5DSRA 4QIYA 1HEBA 5AMLA 1MUAA 1RZCA 4ILXA 4Q7PA 1FQRA 3NI5A 1RZEA 3P55A 5EH5A 3UYQA 4CQ0A 2FOQA 5DOGA 1G0FA 4QJWA 2EU2A 4Q90A 5G03A 1CA2A 1UGFA 3RZ0B 1I9QA 5DSIA 1HUGA 4L5VA 3D9ZA 4RFDA 1G3ZA 1G6VA 5CA2A 4FVOA 2CBBA 1CAOA 4BF6A 1BNUA 3F7UA 1CNIA 4HEZA 2FMGA 2WEHA 3M3XA 5FNIA 3MMFA 4L5UA 4E4AA 4QY3A 4PYYA 4QJOA 3GZ0A 1Z97A 3BETA 3M2XA 3RGEA 4KNJA 2HD6A 4Y0JA 5FLOA 5SZ2A 4YGLA 4FL7A 1ZSCA 1UGAA 4YXUA 5L3OA 3M40A 2NXRA 4XIWA 5SZ5A 1IF6A 4Q06A 3MNJA 5IPZA 3V3GB 1HCBA 2POVA 3OIKA 1CRAA 3U47A 3DCSA 1CNCA 2ABEA 3MNUA 3V3HB 1I9OA 4XFWA 5DSJA 1CNXA 1BNWA 3M04A 3MNHA 1V9IC 5EHWA 2QOAA 4Z1KA 3BL0A 5E2RA 4Q6DA 4FVNA 2HKKA 1AVNA 2GD8A 5FLPA 1RJ6A 4HU1A 3RG4A 4R59A 4RFCA 1A42A 4K1QA 1BICA 1BNQA 5DSLA 4QK3A 1ZE8A 4WW6A 1CIMA 1FQMA 2NN7A 3W6HA 5BNLA 2NNSA 5JDVB 1CAIA 1I9MA 4M2VA 2NNVA 3DVCA 4PYXA 2EU3A 4BF1A 3F7BA 4Q07A 5SZ6A 1URTA 3KONA 4E5QA 4CNVA 3HKNA 2NXTA 3T82A 4QJ0A 1ZSBA 4FPTA 5EOIA 1CAYA 1RAZA 1CILA 1CVCA 3HS4A 5FL6A 4FRCA 3D93A 4Q81A 4HEWA 5FLQA 4Q0LA 3IBUA 3OIMA 1CVFA 3KIGA 3M1WA 5JQ0A 3MWOA 3R16A 2FOSA 9CA2A 1CANA 1G52A 1BZMA 3P58A 3CA2A 4ZX0A 5DOHA 4PXXA 4K13A 1JCZA 1CVBA 2NWYA 5E2KA 3DC3A 3RZ1B 3MNKA 4KP8A 4ZX1A 1HECA 1ZNCA 4WL4A 2FOUA 3U45X 3V3JA 4IWZA 4Q83A 4CNWA 4QSJA 1RZBA 3D8WA 4QSBA 3IBIA 3KOKA 3SBHA 1BNNA 4MO8A 3L14A 3HKTA 1H4NA 4ZWXA 3M2YA 3S72B 5LMDA 3V2MA 4Q99A 1FSNA 4K0SA 1YO0A 3SAPA 3PO6A 5JGSB 1OQ5A 1TH9A 1CA3A 1ZGFA 3OKVA 3QYKA 3EFIA 1CNGA 5E2SA 1CVAA 5AMGA 3F4XA 4MDMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IGP A;  4KUY A;  3N0N A;  2WD2 A;  2AW1 A;  2ILI A;  3DVB A;  4ITP A;  1KOP A;  4RUZ A;  3SAX A;  1XEV A;  2O4Z A;  3MNA A;  1LZV A;  1RAY A;  1XPZ A;  3ML2 A;  3T84 A;  1ZSA A;  4E3D A;  1I8Z A;  3MHL A;  1TG3 A;  3OYQ A;  5FNJ A;  1JD0 A;  3ZNC A;  1LGD A;  1CVH A;  5BRV A;  4YGJ A;  3PJJ A;  3K2F A;  2WD3 A;  3RYJ B;  1CAJ A;  2WEJ A;  2NMX A;  4WR7 A;  5JG5 B;  1YDC A;  5SZ4 A;  4MLT A;  1G4O A;  3S8X A;  3F8E A;  4X5S A;  2WEO A;  1HCA A;  4XE1 A;  3M98 A;  1CZM A;  1KWR A;  12CA A;  1XQ0 A;  4Q7S A;  4YVY A;  1IF9 A;  3TVN X;  3M1K A;  1UGC A;  4KP5 A;  4BCW A;  1F2W A;  5DSN A;  3W6I A;  4M2W A;  1Z9Y A;  5C8I A;  3CYU A;  3P44 A;  3M2Z A;  3N3J A;  4PQ7 A;  2HL4 A;  3OYS A;  5G0C A;  4COQ A;  3K34 A;  2NWO A;  1CAH A;  1DCB A;  3RYV B;  6CA2 A;  5BRW A;  1FQL A;  5CAC A;  3KLD B;  2Q38 A;  3DAZ A;  3S75 B;  3FW3 A;  3VBD A;  1BV3 A;  2Q1B A;  5BRU A;  2NN1 A;  4QK2 A;  1BNV A;  1LG6 A;  4Q78 A;  1CNJ A;  4KUV A;  1H9N A;  4E9O X;  4RUX A;  3RZ5 A;  3KOI A;  4G0C A;  3T5Z A;  5FLR A; 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