1CAHA

Structure of cobalt carbonic anhydrase complexed with bicarbonate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structure of cobalt carbonic anhydrase complexed with bicarbonate.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cahA00
1HCAA 4R5BA 1BNQA 4R5AA 3RZ8A 3N3JA 5SZ6A 3C7PA 3TVNX 4N0XB 4LP6A 3U3AX 3M98A 2OSFA 1CNGA 4KUVA 1ZGFA 3KWAA 4ZWZA 2GD8A 1IF9A 5J8ZA 3SBIA 4CNVA 3P5LA 4PYYA 3MNIA 3V5GA 3R16A 5FLRA 1G53A 5JEHB 3DAZA 3GZ0A 2FNNA 3M96A 4LU3A 4YGJA 4RH2A 4ITPA 4E49A 2POVA 5FNIA 2Q1BA 5EH8A 3R17B 1I9NA 2EU3A 4K0SA 1AM6A 3HKQA 4Q09A 3HLJA 4Q90A 5FDCA 3D92A 3D0NA 3M67A 1CVHA 5DSRA 2HD6A 5HPJA 2NWZA 1G52A 3T5ZA 5E2RA 1IF7A 5DSOA 1I9OA 3D8WA 3F7BA 3IEOA 3F8EA 3HKNA 4KP8A 3S75B 3RZ5A 1G0FA 1KOQA 3V7XA 1AZMA 5DSKA 5FDIA 4KNJA 1LG5A 4QJXA 5EKHA 2NWOA 5FNGA 5JQTA 2EU2A 4Z1EA 1V9EA 3ML5A 4Q6DA 5DVXA 2HFWA 1IF6A 3P44A 4E3DA 12CAA 3SAXA 1YDCA 3K34A 5E28A 4YX4A 4CNWA 1YO2A 1I9PA 2AX2A 5SZ7A 1IF4A 4MO8A 1CANA 1J9WA 1CAMA 3DC3A 4E3HA 1OKLA 1XPZA 3W6IA 5FNMA 2NN7A 4Q78A 1HEAA 1I8ZA 4TWLA 4XZ5A 4FVOA 3S72B 1THKA 3FFPX 1CNIA 2GEHA 1CVDA 5SZ5A 4BCWA 4QK3A 5BRUA 3P55A 3ZP9A 4RUZA 4YGLA 1CNYA 3OYQA 4ZWIA 4QJ0A 1BN4A 5CACA 2X7UA 1RAYA 1ZSCA 3M2ZA 2NMXA 4Q7PA 7CA2A 5E2SA 3RJ7A 4Q7WA 3MNKA 3M3XA 1HUGA 5BYIA 4Z1KA 2FOYA 1YDBA 4PXXA 4CQ0A 1DCBA 1CNJA 4YXOA 5E2MA 1UGCA 3RYXB 4PYXA 3F4XA 3MDZA 2NNGA 3T85A 6CA2A 3VBDA 1HCBA 2IT4A 2NWYA 3OKUA 4HEWA 4PZHA 4Y0JA 3P3JA 5G01A 3EFTA 1OQ5A 3OKVA 4JSAA 1CAHA 1H9NA 1HEDA 3RZ7A 1CRAA 1CILA 2NXRA 1FQRA 5DOHA 4M2RA 5FL4A 3S8XA 4G0CA 4FVNA 3JXHC 4COQA 3IAIA 3T82A 3M5SA 4YXIA 3CYUA 2POWA 1H4NA 4Q08A 1KEQA 4DZ7A 4YGKA 3M5TA 2CBBA 5JGTB 1Z93A 4Q07A 3T84A 3PYKA 4KAPA 3K2FA 3V2JA 3CAJA 4E5QA 3RYZA 2EZ7A 4BF6A 1FSQA 5SZ2A 5DSPA 4YVYA 2POUA 5E2KA 3SAPA 3B1BA 5EHWA 4WL4A 3V3FA 3HS4A 3S73B 4C3TA 5DSNA 1I9QA 4QTLA 3N4BA 1ZFKA 3M2NA 4FU5A 1HVAA 3P58A 4RUXA 3MHMA 4YGFA 3V3GB 4YYTA 1CNWA 2QO8A 4Q6EA 3UYNA 1IF5A 3KONA 5JEPB 4Q83A 5SZ3A 4L5VA 4LHIA 1BN1A 1CA3A 1UGGA 3P5AA 5EH7A 1CNCA 3CZVA 3M2XA 1OKMA 1BNMA 1CAZA 2FMZA 2WD2A 3BL0A 1CNHA 4R59A 1FSNA 5FNLA 1URTA 3QYKA 4KNNA 1RZBA 3M04A 4MLXA 4CNXA 4ZX0A 3IBIA 1BNVA 3Q31A 1BV3A 1Z9YA 4KNIA 4Q06A 1CVEA 3FE4A 4QJMA 3S77B 5DSQA 5FL5A 1RAZA 4ZX1A 4HT2A 4K0ZA 1TB0X 5EHVA 4FIKA 4MDMA 1LGDA 1I9LA 4QEFA 1TH9A 2FOSA 4K1QA 3LXEA 4M2VA 4MLTA 4Q81A 4XIXA 3RZ1B 3V3IB 4CNRA 2X7SA 1I9MA 1CAKA 4Q87A 3HKTA 3S97A 5AMDA 1TEQX 1FR7A 3MHCA 1CRMA 1BN3A 5FNJA 4QSBA 5DRSA 3M2YA 4ILXA 3UYQA 2FOQA 1FQNA 3TMJA 4ZAOA 1KOPA 5EIJA 3DCCA 5AMLA 5JEGB 3S9TA 1CVFA 1CVCA 4Z0QA 4Q0LA 1DCAA 3DCWA 4RIVA 3DBUA 4L5UA 1ZGEA 4QSIA 5E5UA 3V3JA 1Y7WA 3T5UA 1BZMA 2NNSA 3DC9A 4RUYA 1CAYA 1TBTX 5LMDA 4KP5A 3MNUA 5FLOA 1ZNCA 1BNNA 1CAOA 1CAIA 1RJ6A 1CALA 1MUAA 3P4VA 5G0CA 3V2MA 4ZWYA 4K13A 5L6KA 3M1JA 3KOKA 2HNCA 1FSRA 4Q8ZA 5EH5A 3NB5A 5SZ1A 4QJWA 1OKNA 2WEJA 3RG3A 4E3FA 2ABEA 4ZWXA 4HBAA 1CCTA 1CVAA 1HECA 2WEOA 2W2JA 3FW3A 2QP6A 1ZSBA 3PJJA 1I90A 4HEZA 4N16A 5FL6A 4E4AA 1XQ0A 1CZMA 1EOUA 3S74B 3HKUA 4WUPA 4DZ9A 2CABA 4Q49A 3IBLA 4WR7A 5SZ4A 3L14A 1BNTA 1CAJA 5E2NA 2CBDA 2Q38A 4Q9YA 3S76A 1TG9A 1BICA 2X7TA 2H15A 4JSSA 3KNEA 4KUWA 1TG3A 1CA2A 2VVAX 5EKMA 1TE3X 4Q8YA 2HOCA 3DD0A 3NI5A 3M40A 1G0EA 2FW4A 3IBUA 3MHLA 3F7UA 3ML2A 1JCZA 3RGEA 2CBAA 2WEGA 2FOVA 3MNAA 1G46A 3KOIA 1XEGA 4L5WA 3DD8A 3KIGA 4QY3A 3T83A 4ITOA 5DSMA 2ZNCA 4QIZA 3DV7A 4WUQA 1UGAA 2NNVA 4UOVA 4ETQC 1CCUA 2CBEA 1CIMA 4Q8XA 2H4NA 2HL4A 1FR4A 3DVCA 4RFDA 3DA2A 1G4OA 3PO6A 1XEVA 1YO0A 1RZDA 4M2WA 4RIUA 5DOGA 4IDRX 5CLUA 3MYQA 3OYSA 3K7KA 4YWPA 3N0NA 4Z1JA 3DCSA 4RFCA 3KLDB 1CINA 5EOIA 4BF1A 1FQLA 1KWRA 2CA2A 4X5SA 4QK2A 4Q7VA 4FPTA 2Q1QA 1I91A 1LZVA 3SBHA 3M1QA 1G1DA 1ZE8A 1TTMA 3IBNA 4MDLA 3RYYA 4Q7SA 1LG6A 5A6HA 5BNLA 1BNUA 4XFWA 3HFPA 3P3HA 3D93A 4WW8A 5JQ0A 4HU1A 3TVOX 3N2PA 4JSWA 1G6VA 3V3HB 2CBCA 3OY0A 3RLDA 5EKJA 3BETA 1G4JA 2ILIA 5EZTX 3BL1A 3MNJA 1BNWA 3M1KA 1G3ZA 2NXTA 4JSZA 1YDDA 1ZH9A 5G03A 4G7AA 4HT0A 4RN4A 3RYVB 1KWQA 1MOOA 1T9NA 1DMYA 4KV0A 3MMFA 5DSJA 1G45A 1RZAA 1YDAA 5IPZA 4FL7A 1ZFQA 3MZCA 1CCSA 2NN1A 1A42A 2NXSA 1TEUX 4KNMA 5AMGA 2FNKA 1AVNA 2WD3A 4QJPA 5JG3B 1RZCA 2NNOA 5BRVA 3U45X 5FLPA 1DMXA 4MTYA 4QIYA 3EFIA 1HUHA 5BRWA 1YO1A 5FNHA 5CA2A 4YXUA 1G48A 4XE1A 4KUYA 5EHEA 2F14A 3RZ0B 5SZ0A 4E3GA 4QSAA 3M5EA 1RJ5A 4M2UA 1ZSAA 1UGDA 5FLSA 2O4ZA 4CACA 2HKKA 5JG5B 5G0BA 2WEHA 3M1WA 3MWOA 4QSJA 4QJOA 4WW6A 4IWZA 1CNXA 4QK1A 5JGSB 2QOAA 5FLQA 4CA2A 3OIKA 3S78B 1JD0A 4TWMA 1FLJA 2OSMA 3DVDA 4Q99A 5CJFA 1F2WA 1CNKA 1FQMA 4YGNA 1V9IC 1CNBA 3CA2A 5DSIA 2VVBX 3D9ZA 4XIWA 2NWPA 3IGPA 3JXGA 3S71B 3OIMA 1H9QA 1G54A 1Z97A 4JS6A 1HEBA 3DVBA 3RYJB 5A25A 3W6HA 9CA2A 3U47A 4Z1NA 3B4FA 3ZNCA 4PQ7A 3JXFA 5FNKA 4K0TA 4YHAA 3MHOA 5E5RA 1UGEA 5L3OA 1BCDA 5JDVB 3OILA 3U7CA 3NJ9A 1UGFA 3M14A 2FOUA 2FNMA 4HEYA 4MDGA 2FMGA 5JESB 2AW1A 1LUGA 3MHIA 1UGBA 5C8IA 1RZEA 4GL1X 5DSLA 1JV0A 8CA2A 1IF8A 4HF3A 3RG4A 3KS3A 3MNHA 5FLTA 3KKXA 4FRCA 4E9OX 1CVBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HCA A;  4R5B A;  1BNQ A;  4R5A A;  3RZ8 A;  3N3J A;  5SZ6 A;  3C7P A;  3TVN X;  4N0X B;  4LP6 A;  3U3A X;  3M98 A;  2OSF A;  1CNG A;  4KUV A;  1ZGF A;  3KWA A;  4ZWZ A;  2GD8 A;  1IF9 A;  5J8Z A;  3SBI A;  4CNV A;  3P5L A;  4PYY A;  3MNI A;  3V5G A;  3R16 A;  5FLR A;  1G53 A;  5JEH B;  3DAZ A;  3GZ0 A;  2FNN A;  3M96 A;  4LU3 A;  4YGJ A;  4RH2 A;  4ITP A;  4E49 A;  2POV A;  5FNI A;  2Q1B A;  5EH8 A;  3R17 B;  1I9N A;  2EU3 A;  4K0S A;  1AM6 A;  3HKQ A;  4Q09 A;  3HLJ A;  4Q90 A;  5FDC A;  3D92 A;  3D0N A;  3M67 A;  1CVH A;  5DSR A;  2HD6 A;  5HPJ A;  2NWZ A;  1G52 A;  3T5Z A;  5E2R A;  1IF7 A;  5DSO A;  1I9O A;  3D8W A;  3F7B A;  3IEO A;  3F8E A;  3HKN A;  4KP8 A;  3S75 B;  3RZ5 A;  1G0F A;  1KOQ A;  3V7X A;  1AZM A;  5DSK A;  5FDI A;  4KNJ A;  1LG5 A;  4QJX A;  5EKH A;  2NWO A;  5FNG A;  5JQT A;  2EU2 A;  4Z1E A;  1V9E A;  3ML5 A;  4Q6D A;  5DVX A;  2HFW A;  1IF6 A;  3P44 A;  4E3D A;  12CA A;  3SAX A;  1YDC A;  3K34 A;  5E28 A;  4YX4 A;  4CNW A;  1YO2 A;  1I9P A;  2AX2 A;  5SZ7 A;  1IF4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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