1CAIA

Structural analysis of the zinc hydroxide-thr 199-glu 106 hydrogen bonding network in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSAHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural analysis of the zinc hydroxide-Thr-199-Glu-106 hydrogen-bond network in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1caiA00
1IF9A 3Q31A 3RZ0B 1CNJA 4PQ7A 1Z93A 4CACA 3DVBA 4R5BA 1FQLA 1TE3X 4XE1A 4E9OX 3RG4A 3EFIA 5JDVB 1TBTX 3PJJA 2NWOA 1CILA 1CVBA 3HKTA 1UGGA 5G0CA 1FSNA 3OIMA 4JSAA 2WD2A 1CANA 3NB5A 4DZ9A 2HD6A 1TH9A 1ZNCA 4L5VA 1THKA 1JD0A 4Q6EA 5SZ4A 5EH8A 3OYQA 5JEPB 3T5ZA 1YO0A 3DVDA 3DCWA 2FNNA 4QSIA 3MHCA 4XIXA 1YDDA 4WR7A 3HS4A 1UGEA 4G7AA 1LGDA 3N2PA 4ETQC 3P55A 1G4JA 5SZ6A 4E4AA 4IWZA 4ZX0A 5SZ3A 2FOSA 4XFWA 2H15A 3RYYA 1IF4A 3CA2A 5CLUA 4Z1JA 5DOHA 4LP6A 3VBDA 1AZMA 1G0FA 1UGDA 4Q49A 4KNMA 1BNWA 4WW8A 4Z0QA 4Q07A 4QSJA 1RZBA 1BV3A 3U47A 4XIWA 1HUHA 3M04A 1TEQX 5E2RA 2FW4A 2NNVA 4QJXA 4YXIA 3D0NA 4Z1KA 3BL0A 3RYJB 1I9PA 4E3HA 5FNIA 3MZCA 4Q8ZA 5EH5A 2F14A 1CAMA 1URTA 1HUGA 4HT2A 4HT0A 4Q8YA 4KP5A 1TB0X 1DMXA 5E28A 3MNHA 4QIYA 4TWMA 4FIKA 3K7KA 1ZFQA 4RFCA 2FNMA 3TVOX 5JQ0A 1CVCA 1TG9A 3KKXA 3ZNCA 3M5SA 1RZCA 3CZVA 3M2YA 3N0NA 1KOPA 2EU3A 4Q83A 5E2MA 5FLRA 3U45X 5BYIA 2EZ7A 3OILA 5DSLA 5JQTA 4FL7A 3HKQA 1FQMA 1CCTA 5DRSA 1CAOA 2NMXA 2HL4A 4E3FA 5FLOA 4ZAOA 1OQ5A 3M3XA 1HEDA 5EHEA 3OIKA 3DV7A 4K0TA 4KUYA 4KUWA 4JSZA 4RUXA 2FMZA 1LZVA 5FL4A 2X7TA 1Z97A 3C7PA 5FLQA 2X7UA 4Z1NA 2CBCA 4RUYA 4N16A 1G1DA 2ILIA 4WUPA 1YO1A 4BF6A 5JESB 3S8XA 4R59A 3S75B 3MMFA 9CA2A 4Q08A 4E49A 4KAPA 1OKLA 1I9MA 4ZWZA 1Z9YA 1ZE8A 3F8EA 5E2NA 1TG3A 1UGBA 3U7CA 1F2WA 5EKHA 3RGEA 4K0ZA 5FL6A 3KWAA 4Q78A 4HEZA 4Q09A 2Q1QA 3KIGA 5EHVA 1FSQA 3T84A 2AX2A 3MYQA 4PYXA 3S74B 5EHWA 3DC3A 1BZMA 3S73B 5FNKA 4PZHA 1BNVA 1CCSA 1DMYA 5EH7A 2HOCA 3DVCA 4CNXA 1IF5A 3OY0A 2VVBX 1BCDA 1XQ0A 5SZ0A 3MNJA 1ZSBA 4XZ5A 1CVHA 4C3TA 3T85A 4RH2A 3QYKA 1H9NA 5DSPA 1I91A 5JEHB 1YDAA 3M2NA 3DCSA 2AW1A 3D93A 2POWA 2NNOA 4CA2A 3V2MA 2QOAA 4MO8A 3MNUA 1DCBA 3P3HA 4RN4A 3M40A 3D8WA 4YGLA 1OKNA 1FQNA 3R16A 3DC9A 2NNGA 1RAYA 1AM6A 3S71B 1BN1A 3HLJA 2ZNCA 2WD3A 3V3JA 1CA3A 5DSKA 2O4ZA 4QJ0A 4RIUA 1BNNA 5SZ1A 3IBNA 1CAZA 4YX4A 3RJ7A 1FR7A 1RJ6A 4Q90A 1CZMA 5BRWA 3D92A 4QK2A 4MDMA 3FW3A 1CAYA 4MLXA 4MLTA 5FDCA 2X7SA 3W6HA 4BF1A 5DSJA 3HFPA 5JG5B 3LXEA 4HEWA 3RZ8A 5DSMA 5JEGB 3T82A 3K34A 4RUZA 1ZH9A 1ZGEA 4Q81A 1CINA 5BNLA 4K0SA 3F7BA 4ZWXA 3EFTA 4FVOA 4KUVA 1YO2A 3HKNA 2NWYA 2NN1A 4JS6A 3OKVA 4KP8A 1V9EA 5FLPA 5SZ2A 2HNCA 5DVXA 1CAJA 4HF3A 3P44A 1BNTA 1FSRA 4HBAA 3UYNA 3DAZA 4FVNA 3S97A 3T5UA 4QJOA 1KEQA 3P5AA 4FPTA 5FNGA 2W2JA 4TWLA 2CA2A 5AMGA 5JG3B 4YGJA 2FOYA 1KWRA 3SBHA 4QIZA 3V3IB 5E2SA 3KLDB 4M2WA 3GZ0A 3SAXA 5EZTX 1CVAA 3KS3A 4GL1X 4QJWA 2EU2A 1BICA 1H4NA 1CIMA 3V2JA 1G3ZA 1Y7WA 3MWOA 4Q7VA 5FL5A 3M14A 2FOVA 1CA2A 4RIVA 4DZ7A 1IF7A 1CNBA 2GD8A 2Q1BA 5E2KA 4QY3A 1BNMA 3DA2A 2ABEA 3NI5A 2CBDA 3L14A 3MHIA 3KNEA 3NJ9A 4QJPA 4YWPA 5EIJA 1CVEA 5BRUA 3D9ZA 1G46A 4QK3A 5HPJA 3IBLA 3MNKA 5JGSB 2POVA 3M2XA 5SZ7A 5FNHA 5BRVA 4L5UA 3MNAA 2CBBA 1HEAA 1HCAA 4M2VA 2GEHA 5FDIA 3M5EA 1I9OA 1IF8A 1UGCA 3UYQA 4K1QA 1CCUA 5CJFA 1ZSCA 3HKUA 4G0CA 7CA2A 3M2ZA 5G0BA 5DSQA 1MUAA 4E3DA 4JSSA 4LU3A 1LG6A 3RZ5A 3DD0A 1DCAA 1XEGA 1HECA 1I90A 4KV0A 1I9QA 4Q8XA 3KONA 3MHMA 1XPZA 1J9WA 4WL4A 3ML2A 3IBUA 3IEOA 4M2RA 3SBIA 4CNWA 5A25A 4PXXA 2HFWA 1CVDA 3DD8A 2VVAX 1HVAA 3MHOA 3M1WA 3RYXB 4JSWA 5E5RA 4Q7WA 3DCCA 4YGFA 2WEJA 1CRAA 3S76A 2FOUA 3MNIA 5AMLA 5A6HA 4N0XB 5DSNA 2CBAA 5FNLA 4ITPA 1FR4A 1I9NA 1CNCA 4CNRA 2POUA 1LUGA 3M1QA 2QO8A 3V7XA 1RJ5A 1RAZA 4QEFA 3ML5A 3B4FA 3K2FA 5G01A 3JXHC 3M67A 4Y0JA 3M96A 3OYSA 1CRMA 3PO6A 1ZGFA 3RZ7A 4CQ0A 3M1KA 4X5SA 1BN4A 2WEGA 8CA2A 3DBUA 1RZDA 4YXOA 1G52A 4YVYA 3M5TA 5C8IA 3FFPX 1YDBA 3V5GA 4UOVA 3S9TA 3P58A 2OSFA 1A42A 2CABA 3RYZA 1CAIA 1KWQA 1G48A 1KOQA 1CALA 4E5QA 1G45A 1BN3A 4Z1EA 1RZAA 3ZP9A 2NN7A 4QSAA 3BETA 4IDRX 4E3GA 2QP6A 3P3JA 4COQA 3N3JA 1ZSAA 5G03A 4M2UA 5JGTB 4BCWA 4YGKA 5FLSA 3CAJA 2Q38A 3MDZA 4YXUA 3V3FA 1FQRA 4QJMA 1CNXA 1HEBA 1LG5A 2NWPA 4QTLA 4QSBA 3U3AX 4Q6DA 4Q7PA 2FNKA 3M1JA 5LMDA 3S77B 1BNUA 1G0EA 1TTMA 2OSMA 4LHIA 3PYKA 3R17B 4YGNA 1JCZA 4PYYA 4YHAA 2IT4A 3V3GB 4Q06A 3S72B 1IF6A 3RZ1B 3FE4A 5J8ZA 1UGAA 1T9NA 5SZ5A 3RG3A 1CNWA 5DSOA 1G53A 2FMGA 3RLDA 1CAHA 3CYUA 3OKUA 4Q87A 3IGPA 1CNIA 4HEYA 4QK1A 3SAPA 1JV0A 4ZWIA 3F4XA 3V3HB 3KOIA 3W6IA 5AMDA 4YYTA 3MHLA 4ITOA 3IBIA 5DSRA 4KNIA 4ILXA 1YDCA 5L3OA 3KOKA 2NXRA 3RYVB 2NXTA 1CNHA 3N4BA 4ZX1A 2WEOA 1EOUA 2FOQA 1CNGA 2NWZA 4L5WA 1V9IC 2HKKA 12CAA 1UGFA 1CNYA 1G4OA 2CBEA 5L6KA 1TEUX 5EKJA 5FNJA 1G6VA 1CAKA 1G54A 1RZEA 3B1BA 3BL1A 3F7UA 3IAIA 1MOOA 4FRCA 4Q9YA 4ZWYA 5IPZA 3JXFA 2H4NA 4KNNA 2NNSA 5CACA 3JXGA 4WW6A 5DOGA 5E5UA 1I9LA 5FNMA 6CA2A 1HCBA 3M98A 4KNJA 1H9QA 4MDGA 4CNVA 4FU5A 5DSIA 4Q99A 1OKMA 4HU1A 3TMJA 4K13A 5EOIA 4MTYA 4RFDA 4Q7SA 3P4VA 4WUQA 5CA2A 3P5LA 4R5AA 5FLTA 5EKMA 1XEVA 4Q0LA 1FLJA 2NXSA 1I8ZA 3T83A 4MDLA 1CVFA 1CNKA 3S78B 1ZFKA 1AVNA 1BNQA 3TVNX 2WEHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IF9 A;  3Q31 A;  3RZ0 B;  1CNJ A;  4PQ7 A;  1Z93 A;  4CAC A;  3DVB A;  4R5B A;  1FQL A;  1TE3 X;  4XE1 A;  4E9O X;  3RG4 A;  3EFI A;  5JDV B;  1TBT X;  3PJJ A;  2NWO A;  1CIL A;  1CVB A;  3HKT A;  1UGG A;  5G0C A;  1FSN A;  3OIM A;  4JSA A;  2WD2 A;  1CAN A;  3NB5 A;  4DZ9 A;  2HD6 A;  1TH9 A;  1ZNC A;  4L5V A;  1THK A;  1JD0 A;  4Q6E A;  5SZ4 A;  5EH8 A;  3OYQ A;  5JEP B;  3T5Z A;  1YO0 A;  3DVD A;  3DCW A;  2FNN A;  4QSI A;  3MHC A;  4XIX A;  1YDD A;  4WR7 A;  3HS4 A;  1UGE A;  4G7A A;  1LGD A;  3N2P A;  4ETQ C;  3P55 A;  1G4J A;  5SZ6 A;  4E4A A;  4IWZ A;  4ZX0 A;  5SZ3 A;  2FOS A;  4XFW A;  2H15 A;  3RYY A;  1IF4 A;  3CA2 A;  5CLU A;  4Z1J A;  5DOH A;  4LP6 A;  3VBD A;  1AZM A;  1G0F A;  1UGD A;  4Q49 A;  4KNM A;  1BNW A;  4WW8 A;  4Z0Q A;  4Q07 A;  4QSJ A;  1RZB A;  1BV3 A;  3U47 A;  4XIW A;  1HUH A;  3M04 A;  1TEQ X;  5E2R A;  2FW4 A;  2NNV A;  4QJX A;  4YXI A;  3D0N A;  4Z1K A;  3BL0 A;  3RYJ B;  1I9P A;  4E3H A;  5FNI A;  3MZC A;  4Q8Z A;  5EH5 A;  2F14 A;  1CAM A;  1URT A;  1HUG A; 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