1CAJA

Structural analysis of the zinc hydroxide-thr 199-glu 106 hydrogen bonding network in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSDHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural analysis of the zinc hydroxide-Thr-199-Glu-106 hydrogen-bond network in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cajA00
5JQ0A 4RFCA 5EHEA 5DSLA 2FOVA 3CAJA 2WD3A 3MNAA 4QK2A 4RH2A 4WL4A 2HKKA 5JEGB 3P3JA 1CZMA 1ZFKA 4JSSA 3DCCA 3VBDA 12CAA 3MNHA 1UGDA 1HUHA 4FU5A 1BV3A 5BRVA 1CAZA 1ZSCA 2HL4A 3D92A 5JGSB 9CA2A 2QP6A 1FQNA 1G4JA 1CNKA 2Q1QA 5FLRA 3RGEA 2CABA 4JSWA 1BN4A 1ZSAA 4LHIA 3IGPA 3N0NA 3S73B 2VVBX 3BL1A 3MNJA 3S74B 3V3FA 1FQRA 4Z1KA 5DSRA 5G0CA 2FW4A 1OKMA 5G0BA 1CNBA 4FIKA 1BZMA 4G0CA 4RFDA 5JEPB 5DOGA 1JV0A 4QSAA 1YDCA 5JG5B 1ZFQA 5SZ0A 1F2WA 3U7CA 4YGJA 4YXOA 5JGTB 1RZDA 2ABEA 3RYXB 3IEOA 1CVBA 1IF9A 3D0NA 4K13A 3IBIA 4WW8A 4YYTA 3KNEA 1CNGA 4MDMA 1CVHA 5EH5A 3N2PA 3DCWA 3P58A 4QSBA 1IF5A 4BF6A 4LU3A 2WEGA 1V9EA 5C8IA 4MLTA 3RYVB 5DSOA 3EFIA 5DOHA 4QIYA 3JXGA 4WW6A 4Q7PA 5DVXA 1H9QA 1CALA 1CNIA 5G03A 4E5QA 1HVAA 3FW3A 4ZWZA 1YO2A 2FMGA 4Q90A 4TWMA 3U47A 4WUQA 1CA2A 5E2KA 1JCZA 3D9ZA 5AMDA 1OQ5A 4L5VA 3V3JA 4Q99A 1FSRA 3DVCA 5EIJA 4RUYA 2Q38A 1I8ZA 4YX4A 4X5SA 4Q83A 3K7KA 4HEWA 1CAYA 3F7BA 1HCAA 4G7AA 4R59A 2AW1A 2FNKA 3B1BA 3HKUA 4YHAA 1CILA 3DD0A 1JD0A 2X7UA 3MHIA 2NXRA 5DSPA 3FFPX 2OSFA 4KUWA 4JS6A 3M96A 3MWOA 3HKTA 4RIVA 3PO6A 1CNWA 1KEQA 5FLQA 1DCBA 5LMDA 3SAPA 4R5AA 3DAZA 3KONA 1TEUX 4K0TA 1YDDA 3IAIA 5CA2A 5DSJA 2FOYA 4KP8A 4Q6DA 4QJXA 4QJWA 5BYIA 3MHCA 1ZSBA 4ZX0A 5FNGA 3NB5A 1LGDA 1KWQA 3M40A 5A25A 3RLDA 4Q8ZA 3RG3A 5E2MA 4YXIA 4Q7SA 4FL7A 1UGGA 4PXXA 4C3TA 1BCDA 5EKHA 1ZE8A 3P44A 3LXEA 4N0XB 3T83A 4QK1A 4K1QA 4LP6A 4Q07A 4QJPA 3S72B 3TVOX 1CAJA 1MOOA 3M2YA 5EH8A 4CNVA 4FVNA 4Q6EA 1CVFA 5AMGA 4KUYA 1ZH9A 1LG5A 2O4ZA 4IDRX 4XFWA 4UOVA 2NWZA 4COQA 4ZWIA 5E2RA 4QEFA 4Q08A 3PJJA 3P3HA 3NI5A 1Z93A 1AVNA 4HU1A 4ZWXA 4Z1EA 3KS3A 1RZCA 5EHWA 5SZ7A 3QYKA 1YO0A 1HEBA 1H9NA 2NWPA 5BNLA 4DZ7A 3HFPA 3MNUA 3M1WA 3KIGA 5EOIA 4WR7A 3RZ1B 3IBLA 1I9NA 2Q1BA 1BNQA 1DMXA 2QO8A 1UGFA 1CCTA 1HCBA 2FNNA 1G0FA 4BCWA 4Q9YA 4QSIA 4ILXA 1FLJA 5FLPA 2AX2A 1CAOA 1AM6A 1RZAA 4MTYA 3M2ZA 5L3OA 4ITOA 3MZCA 1FSQA 5A6HA 1RZBA 4Q8XA 1YO1A 2HD6A 4MO8A 1CRAA 3DC3A 1HECA 1FSNA 4QSJA 3D8WA 1AZMA 1BNVA 2WEOA 4KNMA 3FE4A 5FNMA 5FL5A 1T9NA 4MDLA 4CA2A 5FNJA 4E3HA 5SZ4A 4XZ5A 1UGEA 2NNSA 2NNGA 1CVAA 2CA2A 1ZGFA 1ZNCA 4FVOA 4JSAA 3RZ7A 1XEVA 1UGAA 2ZNCA 3M98A 4HT2A 5CLUA 5DSKA 4WUPA 1TH9A 4MLXA 4HEZA 1KOPA 1OKNA 2FOUA 3M5TA 3OIMA 3V2MA 5FLOA 3W6IA 1I9MA 4CNWA 4N16A 1CNCA 1TB0X 3IBNA 3P5AA 4JSZA 5BRWA 4E49A 4Q7VA 7CA2A 4Y0JA 4M2WA 1CCUA 3BL0A 3MNKA 1G6VA 4L5UA 1KOQA 3RG4A 3HLJA 2GD8A 1TG3A 2W2JA 3RZ5A 1TBTX 3JXFA 1CAHA 4CACA 3Q31A 1I9QA 3PYKA 5HPJA 3BETA 4GL1X 4YGNA 4CNRA 1G0EA 3F7UA 2NWOA 5EHVA 1CAMA 3M2NA 1BNMA 4ZX1A 3MHOA 2NN7A 3UYQA 4FPTA 5SZ3A 1CIMA 4ZAOA 1KWRA 4E9OX 4HBAA 3RYYA 1UGBA 3M04A 3CA2A 3SAXA 3V2JA 1G53A 5JDVB 1IF7A 3MNIA 1FQMA 3S9TA 1OKLA 4QJMA 1CVEA 4YWPA 1BN3A 5E5RA 1YDAA 3F4XA 1J9WA 5EKJA 4Q7WA 2H15A 3KOIA 5FLTA 4Q49A 3KWAA 1CANA 3M2XA 3RYJB 2NWYA 3V3IB 2GEHA 1CRMA 4HF3A 5E2SA 4Q09A 3M3XA 2HNCA 3TVNX 3OKUA 1RJ6A 3DA2A 3KOKA 2CBCA 4CQ0A 1RAZA 3T82A 3D93A 2CBBA 3S8XA 4M2RA 3C7PA 1TTMA 2WEJA 4KNNA 4ZWYA 1G3ZA 4QJOA 3V3GB 1I9LA 2POVA 1Y7WA 3M67A 1YDBA 3S76A 4YGKA 4Q81A 5DSNA 8CA2A 1G46A 3M5EA 3OKVA 4QJ0A 3OIKA 3OY0A 1FQLA 4BF1A 2HOCA 3HKNA 5FNHA 3DC9A 4PYXA 5CACA 5FNKA 3TMJA 4Q0LA 1G52A 1G54A 4RN4A 3T85A 4Z0QA 1RAYA 3T5ZA 2POWA 1HUGA 5AMLA 3RYZA 4YGLA 5DSMA 4XE1A 4QTLA 3M5SA 4E3DA 1HEDA 1BNTA 1Z97A 5CJFA 2NNOA 5J8ZA 2H4NA 5FLSA 3V5GA 3RZ8A 4XIXA 4Z1JA 3OYSA 4CNXA 4RUXA 3ML2A 4M2UA 4IWZA 2FOQA 5EH7A 1LZVA 3DV7A 3P55A 5JESB 1IF8A 1Z9YA 2F14A 5E2NA 4PQ7A 5EZTX 1CAIA 5E5UA 1BNUA 3OILA 3B4FA 3GZ0A 2X7SA 2POUA 5BRUA 5FL6A 4Q78A 3KKXA 3DBUA 1FR4A 2ILIA 3CYUA 3CZVA 3DCSA 3MYQA 1G48A 1CNHA 1I9OA 5DSQA 4FRCA 3DD8A 2FOSA 4K0ZA 1DCAA 5DSIA 1CINA 4QY3A 1RZEA 2IT4A 5SZ2A 3ZNCA 3V7XA 3MDZA 3RJ7A 4RIUA 1URTA 2WD2A 3HKQA 4ITPA 1H4NA 3K34A 3W6HA 3IBUA 3M1QA 1CVCA 5G01A 1ZGEA 3MHMA 4TWLA 5JEHB 2CBEA 5EKMA 2CBAA 5DRSA 3U45X 1BICA 3P4VA 1XQ0A 4KNJA 1G4OA 1I9PA 2EU2A 1HEAA 1XPZA 3OYQA 3SBIA 1MUAA 5JQTA 5FNIA 1TG9A 1IF4A 1I91A 4KV0A 3N4BA 1CVDA 4R5BA 3RZ0B 1A42A 3T84A 5FL4A 1EOUA 2EZ7A 3ML5A 4KNIA 3M14A 2X7TA 3T5UA 4E3GA 1CAKA 2VVAX 3K2FA 4Q06A 4PZHA 1LG6A 4RUZA 4M2VA 1DMYA 3N3JA 5SZ5A 4HT0A 2HFWA 3M1JA 4XIWA 3S78B 1FR7A 5FNLA 1CNXA 2WEHA 3EFTA 3F8EA 4ETQC 5FDIA 3ZP9A 3S77B 3S97A 3HS4A 3P5LA 4YGFA 1LUGA 4KAPA 5SZ6A 5JG3B 2OSMA 1CCSA 1V9IC 4YXUA 4PYYA 1BNNA 1BNWA 1TEQX 3SBHA 1XEGA 4K0SA 6CA2A 1G1DA 2FNMA 4QK3A 4YVYA 3V3HB 3UYNA 2NN1A 3S75B 4E3FA 1G45A 3R16A 3M1KA 3MHLA 1THKA 3DVBA 4MDGA 1CNJA 1CNYA 2NXSA 1CA3A 5SZ1A 5L6KA 3JXHC 2QOAA 4DZ9A 1TE3X 2CBDA 3NJ9A 5E28A 3U3AX 3R17B 3S71B 2NMXA 1UGCA 1BN1A 4E4AA 2EU3A 2NXTA 2NNVA 4Q8YA 3KLDB 4Z1NA 4QIZA 2FMZA 4KUVA 4Q87A 5IPZA 3L14A 1RJ5A 1I90A 4HEYA 1IF6A 3DVDA 3MMFA 5FDCA 4L5WA 4KP5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5JQ0 A;  4RFC A;  5EHE A;  5DSL A;  2FOV A;  3CAJ A;  2WD3 A;  3MNA A;  4QK2 A;  4RH2 A;  4WL4 A;  2HKK A;  5JEG B;  3P3J A;  1CZM A;  1ZFK A;  4JSS A;  3DCC A;  3VBD A;  12CA A;  3MNH A;  1UGD A;  1HUH A;  4FU5 A;  1BV3 A;  5BRV A;  1CAZ A;  1ZSC A;  2HL4 A;  3D92 A;  5JGS B;  9CA2 A;  2QP6 A;  1FQN A;  1G4J A;  1CNK A;  2Q1Q A;  5FLR A;  3RGE A;  2CAB A;  4JSW A;  1BN4 A;  1ZSA A;  4LHI A;  3IGP A;  3N0N A;  3S73 B;  2VVB X;  3BL1 A;  3MNJ A;  3S74 B;  3V3F A;  1FQR A;  4Z1K A;  5DSR A;  5G0C A;  2FW4 A;  1OKM A;  5G0B A;  1CNB A;  4FIK A;  1BZM A;  4G0C A;  4RFD A;  5JEP B;  5DOG A;  1JV0 A;  4QSA A;  1YDC A;  5JG5 B;  1ZFQ A;  5SZ0 A;  1F2W A;  3U7C A;  4YGJ A;  4YXO A;  5JGT B;  1RZD A;  2ABE A;  3RYX B;  3IEO A;  1CVB A;  1IF9 A;  3D0N A;  4K13 A;  3IBI A;  4WW8 A;  4YYT A;  3KNE A;  1CNG A;  4MDM A;  1CVH A;  5EH5 A;  3N2P A;  3DCW A;  3P58 A;  4QSB A;  1IF5 A;  4BF6 A;  4LU3 A;  2WEG A;  1V9E A;  5C8I A;  4MLT A;  3RYV B;  5DSO A;  3EFI A;  5DOH A;  4QIY A;  3JXG A;  4WW6 A;  4Q7P A; 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