1CBGA

The crystal structure of a cyanogenic beta-glucosidase from white clover (trifolium repens l.), a family 1 glycosyl-hydrolase
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
490
structure length
490
Chain Sequence
FKPLPISFDDFSDLNRSCFAPGFVFGTASSAFQYEGAAFEDGKGPSIWDTFTHKYPEKIKDRTNGDVAIDEYHRYKEDIGIMKDMNLDAYRFSISWPRVLPKGKLSGGVNREGINYYNNLINEVLANGMQPYVTLFHWDVPQALEDEYRGFLGRNIVDDFRDYAELCFKEFGDRVKHWITLNEPWGVSMNAYAYGTFAPGRCSDWLKLNCTGGDSGREPYLAAHYQLLAHAAAARLYKTKYQASQNGIIGITLVSHWFEPASKEKADVDAAKRGLDFMLGWFMHPLTKGRYPESMRYLVRKRLPKFSTEESKELTGSFDFLGLNYYSSYYAAKAPRIPNARPAIQTDSLINATFEHNGKPLGPMAASSWLCIYPQGIRKLLLYVKNHYNNPVIYITENGRNEFNDPTLSLQESLLDTPRIDYYYRHLYYVLTAIGDGVNVKGYFAWSLFDNMEWDSGYTVRFGLVFVDFKNNLKRHPKLSAHWFKSFLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords CYANOGENIC BETA-GLUCOSIDASE
publication title The crystal structure of a cyanogenic beta-glucosidase from white clover, a family 1 glycosyl hydrolase.
pubmed doi rcsb
total genus 184
structure length 490
sequence length 490
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 1995-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1cbgA00
3FAXA 2WMIA 5JIPA 1V6YA 1V02A 5AY7A 1FH7A 1UHVA 3AHZA 1XCXA 4OIFA 4AZGA 4LQ1A 3A6OA 3L2LA 4H8VA 5AYBA 3WUBA 2VX4A 1H3GA 1BLIA 1HJXA 1XCWA 3NUKA 3OZPA 3MUY1 5I0DA 1SMAA 4QCEA 3GXDA 1R7OA 1LJYA 2PC8A 2PF0A 3KWXA 1JNEA 1JD7A 3B9AA 3VOCA 1PZ3A 3FN9A 1H11A 3N17A 2ZUTA 3UR7A 4ACZA 1C92A 4V27A 5JBDA 5EBAA 4PTWA 1CGYA 2WMGA 3CZGA 1HJWA 4AZ7A 3N1AA 3BH4A 3IJ8A 1WZKA 1V6XA 2VX6A 2XPKA 5CGTA 2D2OA 2EQDA 4MB4A 6A3HA 1KR1A 2OYMA 5D9PA 2VNCA 4MADA 5CJ5A 4AW7A 3W81A 1DTUA 5FL1A 2QPSA 3NCOA 3I3BA 1VAHA 4D6FA 4AD1A 3ARRA 1YQ2A 3FAWA 5D8WA 3SCQA 1MXDA 1CDGA 2X09A 1CEOA 4UOJA 2CBIA 2GSJA 2WBGA 1V0NA 3WDPP 2W66A 4K68A 2ZWYA 1FA2A 2WANA 2OYKA 4AXNA 1FH8A 3WQVA 3VD9A 1W1YA 3U7BA 4WKFA 2WSKA 1HKMA 5BXPA 4M8UA 4S3KA 3RIKA 2VVNA 2OYLA 2W62A 2QLYA 3LPGA 1W9XA 4Z2KA 4AWEA 3BCDA 1RPKA 2HVMA 3AFBA 4QLLA 3PZOA 1GOIA 3OLIA 5HNNA 1D2KA 1XH1A 4JFTA 3L4ZA 3I3DA 3KL0A 5LA0A 5I2UA 3CUFA 5I5RA 2WYSA 1OIFA 2NW0A 4C7DA 2WK2A 3AS2A 4D6DA 1UR9A 1FHLA 3D5HA 1QHOA 1JDAA 2E0PA 4ZEPA 1UA7A 2FHFA 2JEPA 3U57A 1LG1A 1KXVA 3OLEA 3PBGA 2EJ1A 5HDRA 1E6SM 2WVSA 4P7RA 3MMWA 3WNLA 1E40A 4H2CA 2JEQA 1MQPA 4PUDA 1SMDA 4PMDA 1TR1A 4HP5A 3WD1A 1WDRA 5DMYA 4P7NA 1MXGA 1OWQA 1BYDA 4AD3A 1E6RA 5EFDA 5IHRA 4GIAA 2ZX8A 2W91A 1KFWA 1C90A 2G3NA 4D71A 4IPLA 3GDBA 4AYSA 5CXPA 3KL3A 3AXIA 4CKQA 4MDPA 4ATWA 3VGDA 1HP4A 3BCFA 3WF0A 3MKKA 2XM1A 4J3TA 4A3HA 2WB5A 4Z2HA 3GXIA 1M03A 3DC0A 4AZCB 3PTMA 1CLXA 4QP0A 3VGFA 3TTSA 2AAAA 3GTNA 1GZJA 2VZVA 1E9LA 3BAYA 3W29A 1EQCA 2YJQA 4CGTA 2GUYA 2PBGA 4CVWA 2QPUA 2J7CA 2J8GA 4OOZA 2E9LA 3ARVA 3WQ8A 3VIGA 5A6AA 3ZJ7A 5GQBA 3F5LA 3CPUA 3VIIA 1ISZA 3W28A 2J8FA 4UQCA 3WBEA 3EYPA 4AZ6A 5FCZA 4DWSB 1KWGA 2CIPA 4JZ5A 1CGTA 1HJQA 2WM0A 5GNXA 4ACYA 4UFKA 2OWCA 1LL6A 1FFQA 1B30A 1J0HA 4CD7A 2PWHA 1BG9A 4N0RA 5DFAA 2D3LA 3T0DA 1W32A 3CIVA 2F61A 2V3DA 3G6MA 1XYZA 2WCSA 1WDPA 1ZL1A 1UYQA 2W4XA 3WY1A 3BAKA 1KGXA 2WC3A 1WE5A 3WL0A 1ZJAA 4BZYA 3PZIA 1QNPA 3E1F1 4OUEA 2C0HA 1E72M 2XIBA 2GK1B 3EMQA 1WDQA 1JDDA 1HL9A 4GI8A 3RM4A 1WCGA 4E8DA 2E3ZA 3ZJKA 4JFUA 4HTYA 3ARXA 3CBWA 3N9KA 1E4LA 1E3ZA 1GUVA 2CERA 3VO0A 2BFGA 4D72A 3ARYA 3UEQA 1XD0A 4PBGA 1TFVA 1H1NA 1J11A 2EPMX 4WSKA 1OCQA 1QBBA 4MNLA 4PMZA 2XFYA 3PZ9A 3EDEA 3SCUA 4PTMA 1ISXA 4L4PA 2VX7A 4ZFMA 2ZUUA 5ABGA 1OBAA 4UZSA 2XWDA 1MW1A 2QMKA 3TOPA 2X2YA 3W25A 2ZX7A 1UQYA 2WMJA 2WVVB 4J3WA 3KE0A 4FF5A 4AZIA 3GBEA 2BS9A 1CGUA 1DWHM 4B16A 2XVPA 3GH5A 4W7VA 3AIUA 2VCAA 2UY5A 3AXHA 5DF0A 1KQYA 3ARZA 5A94A 1JYVA 1NARA 5IFTA 1C8XA 4JFWA 1UOKA 3AIRA 3BGAA 2VI0A 2OSYA 1GCYA 3ZR6A 2DIJA 1CGVA 5CPTA 4CN4A 3AS1A 2XVNA 1MW0A 4F9DA 1L8NA 3DYPA 4AZHA 4MB5A 1VBUA 5CPSA 3VDAA 3VTRA 3O9NA 1E71M 2XIIA 3MUZ1 2ZICA 1TE1A 4MJ4A 2QMJA 1E3XA 1QNOA 3T2PA 3M46A 4A3YA 3F4VA 2ESCA 2NT1A 5BXTA 1E5JA 1XSJA 1V6WA 5A6BD 1TA3A 3AYSA 3NSXA 2NSXA 1G0CA 4RE4A 4KGJA 1UH3A 1JDCA 4F79A 4NF7A 3AIVA 3WEMA 1AVAA 1ODZA 4B3LA 4ZXLA 4DM2A 2VRKA 2XFFA 4UTFA 2Z1SA 4GO9A 4AY1A 3VU2A 3N11A 2WLYA 3WN6A 4EAMA 3OGSA 3WH8A 3VIKA 4TXEA 4AD2A 4E8CA 2OSWA 2BXYA 3AMKA 3PHAA 4MNKA 4XZWA 4URIA 2AMGA 3N13A 2DIEA 4HU0A 1JAKA 3WH6A 1AQ0A 3PTQA 4MB3A 4M29A 2WHLA 3AMDA 4HA1A 5E70A 2DSZA 1Y7VA 1UWRA 3ARWA 4OZOA 4Z2JA 3WSUA 4LYPA 1A47A 1QNRA 4W8BA 3SCPA 5I78A 1DWFM 4PMOA 2W63A 1C91A 1GPFA 1UKSA 1ITXA 4AMCA 3CUIA 3SCSA 4CUCA 1DP0A 4HU8A 1ZBVA 1E4IA 4IISA 4MNJA 5CZKA 3L2MA 2ZUWA 2Y5EA 3WNNA 4R27A 1EXPA 1QNSA 5C8BB 4DM1A 3D3AA 2EPNA 3W37A 4MB1A 2DDXA 4HMEA 1W3JA 2WHJA 3PZVA 5HPOA 1RH9A 1ESWA 3J7HA 2XTKA 5FKYA 4TVUA 4HOWA 1UG6A 1SYTA 4UFIA 3T09A 4YPJA 1CGWA 4M82A 2UWFA 3AJ7A 1ISWA 1H41A 1H4PA 2YDQA 1HP5A 2G3JA 2WAGA 1PX8A 4A4AA 1O7AA 4P8XA 4UNIA 1P6WA 2CYGA 4MJ2A 1K9EA 4GZEA 4GQQA 1CXHA 1HVQA 2D22A 4U3CA 1K9TA 4QLJA 1W91A 3O2LA 3VDCA 2WZIA 4TX6A 1GORA 1MYRA 4JAWA 1KCKA 4PUEA 7CGTA 2JF6A 3ALFA 5D9MA 4U5KA 4YHGA 2BY3A 1W9DM 3VIMA 5F7UA 1PX4A 1TG7A 2XVLA 2ZUSA 1LLOA 1OM0A 1Q6CA 3NDZA 3OGVA 2WW5A 1FFRA 2WHKA 1VEPA 4TX8A 5ABHA 4OKDA 3AHVA 1EDGA 2G3IA 1CXLA 2D0GA 5A2CA 1K6AA 2JIEA 3ARSA 2RGLA 1ZS2A 2O9OA 3MU7A 1PIFA 9CGTA 1CXEA 3VNZA 4ZENA 1CTNA 1NP2A 1UQZA 3APGA 4CN1A 2UY4A 1IZJA 4YHEA 1UH4A 1E0VA 1V02E 4MAVA 3SUTA 4PMUA 5I79A 3WFZA 1QW9A 1RD6A 3BAWA 1VEMA 3A3HA 1E0XA 2V3FA 1MW3A 4QAWA 2ZX6A 1AQHA 1HJUA 3WQ4A 5A8MA 4JL1A 2VC9A 1B3YA 2WZEA 5I24A 3GM8A 2CEQA 2D20A 2J7HA 4U31A 1XRVA 1V3LA 1UR8A 4P7OA 1KCLA 3CTTA 2CKRA 3WD4A 2PWDA 2Y4SA 1ZBKA 5A2BA 2XGBA 2XM2A 2PBOA 2GFTA 1PZ2A 5ABFA 1KBBA 4UR9A 1R86A 3VD4A 3VMOA 1EOMA 4PMXA 3HU7A 2VL4A 3A4XA 4FLOA 3W6LA 1EH9A 3RPMA 2A3CA 3VMNA 4F8XA 2XUCA 3WD0A 5EFFA 4W85A 2J4GA 4MTVA 1CXFA 1JI2A 4W87A 3GXMA 1QPKA 2O9RA 1Q6GA 2XGIA 3WMCA 1AQMA 4HZ6A 1WAWA 2CCRA 1X6LA 4XV0A 4BQ5A 5CGMA 2O9TA 3GNRA 3HMCA 1WZMA 5DT5A 3WFLA 1FP8A 3EDKA 3CHDA 3ZMRA 3SIMA 1V08A 1PJ9A 1B3XA 3ZOAA 4KWUA 2Y24A 3K4AA 2PWGA 1B90A 1CECA 1R87A 1XH2A 1HL8A 2VQTA 2ZUNA 4HZ8A 4DWSD 4W93A 4GPNA 3L4VA 1VIWA 2F8QA 5E6ZA 3W53A 3OLDA 3CUJA 4MNMA 5IDIA 2ZOXA 2BVYA 3K1DA 4J3SA 2BY1A 5JBFA 3VGHA 4BCEA 2BY0A 3GH7A 2FGZA 3O6AA 3GZAA 3TTOA 4PCTA 3SCVA 3CH9A 2CESA 2YBUA 2WWCA 3CHEA 5LA2A 4GI6A 1ZJBA 2BVTA 5CSYA 1GJUA 1J10A 2YLAA 2Y8VA 3DYMA 1O6IA 3SCWA 1BFNA 1NWSA 1ISYA 5D9OA 4C7FA 1EDTA 3OBAA 3A47A 1KR0A 2BHUA 2J47A 3W4RA 4AD4A 4B9YA 4Z2GA 2CBJA 2GJXB 1JZ6A 1FOBA 1GHRA 4IUGA 2C8NA 4X0VA 3ZJ6A 3BAIA 1J0IA 3VGBA 4CCEA 2A3AA 4UQ9A 1VB9A 1JF5A 1UR1A 3QOKA 4LYQA 5FL0A 1QOXA 3PZUA 2ZE0A 5BXRA 3QOMA 3BSGA 3TA9A 1BQCA 3NYDA 4WLCA 5M5DA 3WDJA 3FHAA 4KGLA 5DEZA 3WD2A 3WDHA 4X0NA 1SFSA 3DHPA 4M24A 1W1VA 3VM5A 3W6MA 3WH9A 3CZLA 2C7FA 3BLKA 2DT1A 1EO5A 5A95A 3W27A 1UKOA 4HPGA 1DWIM 4JCLA 1NM9A 1I75A 4P8WA 3WDRA 3NIYA 2J77A 4UZUA 4AC1X 2ZX5A 1CYGA 4AIOA 1EHNA 2BHYA 1M53A 3K8LA 3BAJA 2MANA 4EANA 3ZT5A 4DUXA 3W0KA 3VIPA 2A3BA 1Q6EA 3EDDA 4Z2LA 3ZR5A 4M81A 2VOTA 7A3HA 1JG9A 1IZKA 2CHOA 1W9VA 1NWRA 1C8QA 1UR2A 1HF6A 2F2HA 1D7FA 2GVYA 3VIFA 1BF2A 3SCNA 3AISA 1LG2A 1HIZA 2BV9A 5IHSA 1V03A 3K8KA 1KGUA 2WMIB 1JZ5A 1KGWA 1KXQA 1PIGA 4D6EA 1M04A 1OD8A 1WO2A 3U5UA 1CBGA 5GNZA 4PSRA 2ZUVA 1V3KA 1C3FA 4XX6A 1E1FA 1JZ7A 3VX1A 5A6BA 1W1PA 1NWUA 4W7WA 3M07A 1VF8A 4ML4A 5E9AA 2EBNA 5D9NA 2RGMA 3VDHA 3VD3A 4D1JA 7TAAA 1U33A 4QFUA 5DO8A 3IJ7A 2VR5A 3BC9A 1J0ZA 1QW8A 1WPCA 1JI1A 3RJXA 4ACZB 3U7VA 1LWJA 1KB3A 3CHCA 4H41A 3BLPX 1BVNP 3PZQA 3GYCA 1VFOA 4UCFA 1UUQA 1MQQA 4WK9A 2CKSA 3VINA 3CZJA 3FHQA 5JIWA 3WMSA 2VCCA 3PZTA 1GOMA 4P7QA 4OBSA 3CGTA 3WF2A 3WH7A 1H2JA 4AZBA 2FH8A 2YL8A 3WNPA 5GPRA 3VMPA 2CBUA 2CNCA 3WNOA 3TTQA 2XVKA 1UKPA 1UKQA 1EA9C 3WQ5A 1OINA 2WPGA 3KEHA 3T0BA 3IK2A 4J7RA 1E55A 1TVNA 2DSWA 2G8ZA 2GJPA 2JIWA 3AMCA 1OSEA 1JF6A 3VNYA 4UQEA 1FHDA 1XC6A 2IXUA 1I1XA 5FD0A 1JZ4A 1OGGA 3NDYA 4AISA 5A6MA 2CBVA 3VD5A 1HKKA 4UOZA 4H8UA 1US2A 1M01A 3VGEA 3AQUA 3GH4A 1H0IA 3AYRA 4GZJA 1CZ1A 1Z32X 1NWTA 4UQBA 2YOCA 1W2VA 1GONA 4UFJA 1QNQA 5BRPA 3CUHA 4NRSA 3THDA 3LPPA 1R7AA 1E70M 1XV8A 2V38A 2XWEA 3WBAA 1HJVA 2VZOA 1WDSA 2DT2A 3MMDA 1L0PA 3PZMA 4B15A 4JHOA 3AHYA 4WF7A 1UD2A 3AHXA 4FK9A 2VT0A 3AMLA 2E4TA 2WMKA 5AC5A 3WUEA 3OGRA 3AS3A 3AIWA 2E8YA 3SUSA 1BYAA 1W9BM 1VJZA 1H09A 3WUFA 1C93A 1ZU8A 2V5DA 5CSUA 4MPKA 1JGIA 1E5NA 5BRQA 3UETA 4AZ5A 3QGVA 4BQ2A 1QI2A 4XUYA 4P8UA 1HN1A 4FMVA 4WIWA 1PPIA 1BHGA 4JHZA 1UWUA 4WKAA 2VO5A 2B31A 4W88A 5TD4A 2JALA 1B3VA 4ZE4A 3CMJA 4M56A 2JF7A 3UG3A 1R8LA 1H0GA 4V28A 4X9YA 4EE9A 2EEXA 3CZKA 1CWYA 1UWQA 5D4YA 2WWDA 3SUUA 2VRJA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FAX A;  2WMI A;  5JIP A;  1V6Y A;  1V02 A;  5AY7 A;  1FH7 A;  1UHV A;  3AHZ A;  1XCX A;  4OIF A;  4AZG A;  4LQ1 A;  3A6O A;  3L2L A;  4H8V A;  5AYB A;  3WUB A;  2VX4 A;  1H3G A;  1BLI A;  1HJX A;  1XCW A;  3NUK A;  3OZP A;  3MUY 1;  5I0D A;  1SMA A;  4QCE A;  3GXD A;  1R7O A;  1LJY A;  2PC8 A;  2PF0 A;  3KWX A;  1JNE A;  1JD7 A;  3B9A A;  3VOC A;  1PZ3 A;  3FN9 A;  1H11 A;  3N17 A;  2ZUT A;  3UR7 A;  4ACZ A;  1C92 A;  4V27 A;  5JBD A;  5EBA A;  4PTW A;  1CGY A;  2WMG A;  3CZG A;  1HJW A;  4AZ7 A;  3N1A A;  3BH4 A;  3IJ8 A;  1WZK A;  1V6X A;  2VX6 A;  2XPK A;  5CGT A;  2D2O A;  2EQD A;  4MB4 A;  6A3H A;  1KR1 A;  2OYM A;  5D9P A;  2VNC A;  4MAD A;  5CJ5 A;  4AW7 A;  3W81 A;  1DTU A;  5FL1 A;  2QPS A;  3NCO A;  3I3B A;  1VAH A;  4D6F A;  4AD1 A;  3ARR A;  1YQ2 A;  3FAW A;  5D8W A;  3SCQ A;  1MXD A;  1CDG A;  2X09 A;  1CEO A;  4UOJ A;  2CBI A;  2GSJ A;  2WBG A;  1V0N A;  3WDP P;  2W66 A;  4K68 A;  2ZWY A;  1FA2 A;  2WAN A;  2OYK A;  4AXN A;  1FH8 A;  3WQV A;  3VD9 A;  1W1Y A;  3U7B A;  4WKF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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