1CIMA

The positions of his-64 and a bound water in human carbonic anhydrase ii upon binding three structurally related inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Positions of His-64 and a bound water in human carbonic anhydrase II upon binding three structurally related inhibitors.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cimA00
4Q0LA 1AZMA 1I9QA 3DVBA 4KAPA 3M5EA 4N16A 1IF7A 4COQA 4MDLA 3PJJA 3JXFA 1BNVA 1ZGFA 3HLJA 3VBDA 3U3AX 3RG4A 1BCDA 1FSNA 1KEQA 1CCUA 4QJOA 1I9LA 2HOCA 5DOHA 1TG3A 1THKA 1A42A 1ZNCA 2CBBA 3RLDA 4JSZA 2FW4A 1CVCA 1I8ZA 1FQMA 1UGFA 1ZE8A 1CRMA 3IBUA 3M98A 4QY3A 4CQ0A 4Q83A 4Q6DA 5FLQA 1RZCA 4Q6EA 1HEDA 3MNAA 5FNLA 5DOGA 3ZNCA 1CNYA 3TVNX 5G0CA 1TE3X 1FR7A 1FSQA 5EKMA 3RZ7A 4GL1X 5CA2A 3SAXA 5EKHA 1Y7WA 3L14A 1OKMA 4XIXA 2FOVA 4E49A 4FL7A 5FL6A 4WW8A 1HEAA 3MHCA 3P5AA 1CALA 1CZMA 2VVBX 4Q06A 4YGNA 3K34A 3GZ0A 3RJ7A 3P58A 3M04A 4PYXA 1FLJA 1HEBA 6CA2A 3K7KA 4Q9YA 4Q8ZA 3RYZA 4WL4A 5DVXA 4K0SA 1TG9A 3M96A 2NXSA 5EOIA 3T82A 1LZVA 1CVDA 3PO6A 1HUHA 3UYNA 3M2XA 1G4JA 5JGTB 3IBLA 2FMZA 3JXGA 1G6VA 4HEZA 3T84A 4FU5A 5DSOA 1I9PA 5AMDA 3HKTA 4FRCA 1I9NA 2NNOA 4QTLA 5FLPA 1OQ5A 1BV3A 1FQRA 1CAOA 4JS6A 5DSQA 4Z1KA 2X7TA 3MNUA 1AM6A 5EHWA 4Q09A 3UYQA 5JQ0A 4PZHA 4ZWZA 3M2ZA 2AX2A 2NXTA 3HS4A 3DVDA 3FW3A 2Q1BA 3Q31A 3DBUA 3U7CA 4ZWIA 1LG6A 1I9OA 5G03A 3D0NA 5SZ3A 1YDAA 2NXRA 4Q7WA 4TWMA 2FOUA 1UGDA 4X5SA 4WR7A 4Q08A 2QOAA 2FMGA 4YGFA 12CAA 1KOPA 3P44A 1CANA 1F2WA 3M3XA 3DCWA 4LP6A 1ZSAA 4JSWA 1FQLA 3N0NA 1UGAA 5EHVA 4QSBA 5FLSA 5IPZA 4HF3A 1CNHA 3MHLA 5BRWA 1V9IC 4QIYA 3ML5A 5HPJA 4FIKA 1BICA 3NJ9A 4M2VA 1ZFKA 2CBDA 2Q38A 3S9TA 1RAYA 4XFWA 3HFPA 1JV0A 3MDZA 2OSFA 3D92A 3OKVA 5EH7A 4ZWXA 1CNJA 3S75B 3P55A 1XQ0A 5SZ2A 5FNHA 1G52A 4YGKA 5SZ6A 4Q8XA 5J8ZA 3MHMA 5EIJA 3MZCA 4WW6A 1IF4A 1IF5A 5C8IA 4XE1A 4Q81A 2CA2A 1YO1A 4WUPA 5BRVA 4RIUA 1CVBA 3HKNA 3KONA 1CNGA 2W2JA 1H9QA 2NN1A 1KOQA 5A6HA 3KOKA 1G53A 3V3HB 1ZH9A 4YX4A 1RZBA 3MYQA 3JXHC 1TBTX 5DSPA 9CA2A 5AMLA 5E2KA 2WEHA 3RYJB 5CLUA 2NWOA 4ZWYA 5JEHB 1I9MA 2FOQA 5EHEA 3D8WA 3SAPA 1CINA 5DSRA 5JEGB 4RUZA 4E3GA 2HFWA 4ETQC 2NWZA 3MNJA 4BCWA 1ZSBA 3BL1A 1ZSCA 4K0TA 4CNVA 1IF6A 2FNNA 2ZNCA 4MTYA 5DSMA 1JD0A 4E3HA 2ILIA 1EOUA 1RZDA 3RZ5A 1RZAA 4MLXA 4QJ0A 4QK3A 1CILA 2NNGA 2FNKA 3T83A 3S74B 4MO8A 3DAZA 2FOSA 4KV0A 4E9OX 5DSLA 5G01A 1CNKA 4MLTA 3M1WA 3IBIA 1DCBA 1UGCA 4HEWA 5FNJA 5JDVB 1BNWA 3FE4A 4FVOA 1Z93A 4K1QA 4YGLA 1J9WA 1Z97A 1CAIA 1DCAA 3M14A 4MDGA 5FL4A 1FR4A 4JSAA 1YO2A 2NWPA 5FLRA 4E4AA 1URTA 4Q78A 1CAZA 1XEGA 3CAJA 3RYVB 3RYYA 1I91A 5DSJA 2WEGA 3M1QA 1CAHA 1AVNA 2GEHA 4PXXA 1G3ZA 4KNIA 5JG5B 1YO0A 3P3HA 4MDMA 2WD3A 3R16A 3T85A 1G0EA 2HL4A 4ILXA 1G4OA 3S77B 3BETA 2Q1QA 3OYQA 4Q8YA 3S8XA 2HD6A 2IT4A 3NB5A 4L5WA 5EH5A 3S73B 3C7PA 4CA2A 5JG3B 3BL0A 2POWA 1LUGA 2H4NA 3SBIA 3IAIA 5E2MA 5EKJA 1BN3A 8CA2A 1G45A 4L5UA 4N0XB 4QSIA 1BNNA 4CNWA 2QP6A 3V7XA 2VVAX 1BNMA 1LG5A 5DSKA 1MUAA 3V5GA 3U47A 3V2MA 1XEVA 1YDCA 3RYXB 5CACA 1OKNA 2POVA 1FSRA 5FNMA 4Z0QA 3RG3A 1UGBA 1DMYA 4Q90A 3CZVA 1BN4A 1RAZA 3DV7A 3DC9A 3M2YA 4YWPA 4YYTA 3M1JA 3MWOA 3KOIA 2NWYA 1RJ6A 3M5SA 4HT2A 5FNIA 3T5ZA 3KIGA 1HECA 2AW1A 4KNNA 4Z1JA 3S71B 5BRUA 3MMFA 3DC3A 1KWQA 3T5UA 4ITOA 4IDRX 3SBHA 1HUGA 3M67A 1CVEA 4HT0A 3ZP9A 4KP8A 4QJPA 4ZX1A 5SZ0A 3OIMA 2NN7A 3DCCA 4R59A 4CNXA 2O4ZA 3OILA 2HKKA 5BYIA 5E2RA 3P3JA 2WD2A 4Z1NA 4RIVA 4ZX0A 1FQNA 4QEFA 1Z9YA 3K2FA 3TMJA 5SZ4A 4Q7SA 4E3DA 4K13A 7CA2A 3U45X 5FL5A 1JCZA 1G0FA 5EH8A 3D9ZA 1H9NA 5FNGA 2NMXA 4QK1A 3CYUA 2CBCA 2QO8A 1CNXA 5JQTA 3DD8A 5A25A 3MNKA 4YXIA 1IF9A 3RZ1B 3N2PA 1T9NA 3S72B 4G7AA 5FDCA 3M40A 1CVAA 1ZGEA 3KNEA 3KWAA 3RGEA 5E28A 5L3OA 4BF6A 1G46A 5CJFA 3HKUA 3PYKA 4QSAA 1CVFA 3OYSA 4RFDA 4CNRA 2WEJA 5JESB 5AMGA 4Q7VA 4UOVA 3V3JA 1BZMA 2ABEA 3S78B 5SZ7A 1LGDA 1YDBA 3V3FA 3W6IA 4R5AA 4KP5A 3MHIA 1HCBA 1G1DA 1TTMA 1CAYA 4QK2A 4M2RA 3EFIA 5JEPB 3OKUA 3KKXA 4QIZA 5E2NA 3IEOA 4G0CA 1CRAA 1TEUX 4RH2A 3F4XA 1XPZA 3DCSA 1CAMA 2FOYA 1MOOA 5G0BA 4RUYA 4E3FA 2CBEA 4WUQA 5L6KA 4K0ZA 2F14A 2CBAA 4CACA 4R5BA 3N3JA 2NNVA 3V2JA 3ML2A 4RN4A 3M1KA 4KNMA 1HCAA 3B4FA 4Q87A 4Q07A 4KUVA 1V9EA 5DSNA 1CCSA 1BNQA 3P5LA 4M2UA 3NI5A 1UGEA 4C3TA 3HKQA 4L5VA 4YXUA 2OSMA 5E5UA 3S97A 5DRSA 5E5RA 5SZ1A 4DZ7A 5LMDA 3IBNA 4LU3A 3F8EA 5DSIA 4LHIA 4QJXA 2NNSA 3V3GB 4ITPA 4QJMA 3M2NA 3RZ0B 5EZTX 5FLTA 3OIKA 3V3IB 2GD8A 3S76A 4ZAOA 1G54A 4HBAA 1HVAA 3DD0A 1TB0X 2X7SA 1G48A 1CNIA 3LXEA 3MHOA 4IWZA 3IGPA 3QYKA 4YXOA 3D93A 4XZ5A 5JGSB 4Y0JA 1CA3A 1DMXA 3EFTA 4RUXA 1TEQX 5FNKA 3CA2A 3KLDB 4Q7PA 4M2WA 4XIWA 4DZ9A 4FVNA 2EU2A 4E5QA 4TWLA 1CVHA 1OKLA 4Q49A 2POUA 5E2SA 4FPTA 3MNIA 4KNJA 4HU1A 5BNLA 4QSJA 1I90A 3TVOX 3FFPX 1TH9A 3MNHA 1CNWA 4Q99A 1RJ5A 1CCTA 4PYYA 4PQ7A 3M5TA 5FLOA 1ZFQA 3DVCA 4KUYA 5FDIA 4YGJA 4BF1A 3R17B 2WEOA 4HEYA 3N4BA 1CIMA 4RFCA 4QJWA 1H4NA 2HNCA 1CNCA 3B1BA 3KS3A 1BNTA 1CNBA 4YVYA 4JSSA 1YDDA 3P4VA 2EZ7A 3F7BA 1UGGA 1CAKA 2FNMA 1IF8A 1KWRA 2EU3A 1BNUA 2X7UA 1CA2A 3OY0A 3W6HA 1CAJA 2CABA 3F7UA 1RZEA 4KUWA 1BN1A 5SZ5A 4Z1EA 4YHAA 3RZ8A 3DA2A 2H15A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q0L A;  1AZM A;  1I9Q A;  3DVB A;  4KAP A;  3M5E A;  4N16 A;  1IF7 A;  4COQ A;  4MDL A;  3PJJ A;  3JXF A;  1BNV A;  1ZGF A;  3HLJ A;  3VBD A;  3U3A X;  3RG4 A;  1BCD A;  1FSN A;  1KEQ A;  1CCU A;  4QJO A;  1I9L A;  2HOC A;  5DOH A;  1TG3 A;  1THK A;  1A42 A;  1ZNC A;  2CBB A;  3RLD A;  4JSZ A;  2FW4 A;  1CVC A;  1I8Z A;  1FQM A;  1UGF A;  1ZE8 A;  1CRM A;  3IBU A;  3M98 A;  4QY3 A;  4CQ0 A;  4Q83 A;  4Q6D A;  5FLQ A;  1RZC A;  4Q6E A;  1HED A;  3MNA A;  5FNL A;  5DOG A;  3ZNC A;  1CNY A;  3TVN X;  5G0C A;  1TE3 X;  1FR7 A;  1FSQ A;  5EKM A;  3RZ7 A;  4GL1 X;  5CA2 A;  3SAX A;  5EKH A;  1Y7W A;  3L14 A;  1OKM A;  4XIX A;  2FOV A;  4E49 A;  4FL7 A;  5FL6 A;  4WW8 A;  1HEA A;  3MHC A;  3P5A A;  1CAL A;  1CZM A;  2VVB X;  4Q06 A;  4YGN A;  3K34 A;  3GZ0 A;  3RJ7 A;  3P58 A;  3M04 A;  4PYX A;  1FLJ A;  1HEB A;  6CA2 A;  3K7K A;  4Q9Y A;  4Q8Z A;  3RYZ A;  4WL4 A;  5DVX A;  4K0S A;  1TG9 A;  3M96 A;  2NXS A;  5EOI A;  3T82 A;  1LZV A;  1CVD A;  3PO6 A;  1HUH A;  3UYN A;  3M2X A;  1G4J A;  5JGT B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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