1CNBA

Compensatory plastic effects in the redesign of protein-zinc binding sites
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFCFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 70
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cnbA00
2W2JA 1A42A 4HEZA 2NXRA 5FL5A 3V3FA 2POVA 4Q7PA 3OYQA 5DOGA 6CA2A 3RYYA 3KKXA 4YHAA 3RGEA 1LG5A 1TE3X 1KOPA 4Q83A 4G0CA 5SZ6A 4FIKA 5FNLA 1CALA 2NN1A 3RYJB 3HKNA 3P44A 1RAZA 3NB5A 5EHVA 3DA2A 3IAIA 1DMXA 3MDZA 3M40A 2POUA 1OKMA 5C8IA 5SZ7A 3UYNA 3MNJA 4Q7WA 1BV3A 3DCSA 3M1JA 4KNJA 1BICA 4JSZA 4E3DA 1CAJA 4DZ7A 5FDIA 1CAKA 1THKA 2EZ7A 3C7PA 2CA2A 2NWOA 1I90A 1CANA 3RYZA 5SZ5A 3DD8A 3M14A 4BCWA 3D0NA 4KAPA 1IF9A 3F7BA 4Q9YA 1CAIA 2WEGA 1Z97A 5DSMA 1CIMA 3KS3A 1TB0X 4KV0A 3S76A 4TWLA 1Y7WA 1CNCA 2FOYA 2NWYA 3M1KA 3P3JA 3IEOA 4RUYA 3T83A 5CJFA 4K0SA 4QK1A 4QJXA 5DVXA 4KUWA 3RLDA 3IBUA 3RG4A 4Z1JA 1H9NA 5G0CA 3RYVB 5IPZA 1ZSBA 3RZ7A 4ETQC 3DC3A 4YXIA 5SZ0A 1YO1A 3ZP9A 4M2WA 5BRVA 1Z9YA 1I9OA 4PQ7A 5AMGA 4UOVA 2NXTA 1XEGA 5JQ0A 4Z0QA 3KOKA 2AX2A 3DAZA 1CNYA 1JCZA 1FQLA 1UGEA 4HU1A 4WUQA 3M04A 5EH8A 5EHEA 4Q07A 1YDDA 2CBDA 5FNJA 5FLQA 1UGDA 4RUXA 5FL6A 3B1BA 5FLOA 1CAMA 4FPTA 1CAHA 1CVEA 5JG3B 3U47A 4GL1X 3W6IA 3JXHC 4KP5A 5J8ZA 4XIXA 5DSRA 1DCBA 4Q87A 5FNKA 2Q1QA 5E2RA 4YGFA 2CBEA 1G0FA 1XPZA 3BL1A 5BRWA 4E49A 4CNWA 1ZGEA 5CA2A 1ZH9A 3M98A 4RH2A 4XFWA 2NMXA 3M5SA 4QJ0A 3RG3A 1YDAA 4KP8A 3RJ7A 1HECA 4L5VA 1OKLA 1BNMA 3OIKA 4HT2A 4PXXA 3DVBA 4Q6EA 5SZ2A 1G53A 3P4VA 3VBDA 2HKKA 3M2ZA 1V9EA 4MLXA 1CNXA 1FQNA 3Q31A 4Y0JA 1CVAA 3SBHA 1BCDA 2Q38A 5JEGB 1FSNA 4COQA 12CAA 4CA2A 1I9NA 4YXUA 5JG5B 1CZMA 1G1DA 1I8ZA 2HD6A 3MNUA 1CVDA 3K2FA 4YGLA 1URTA 2Q1BA 3CZVA 4Q7SA 1CNKA 3M3XA 4E4AA 5DSJA 1CAZA 1UGFA 1ZSCA 3OILA 3OKVA 2AW1A 4Q8ZA 5DRSA 2FOQA 4WL4A 5FLRA 3R16A 2FOSA 1TH9A 4E3GA 3NI5A 4Q7VA 5LMDA 1J9WA 1TG3A 4QEFA 3OKUA 4ITPA 2NWPA 2FOUA 3KWAA 5EKJA 4QK3A 5L6KA 3ML5A 1HEAA 4Z1NA 1XQ0A 4YGKA 1LZVA 1AVNA 1KOQA 3S97A 1G0EA 2NXSA 5SZ4A 2EU2A 5E28A 5E2SA 2X7TA 3NJ9A 3MWOA 1YO2A 2VVBX 4WW8A 4E3HA 3S75B 1ZSAA 3V7XA 1BNVA 2OSMA 2QOAA 4CNVA 4XZ5A 5AMDA 3TMJA 3F7UA 1UGGA 3ML2A 4K0ZA 1BNNA 5DSOA 1Z93A 3RZ1B 4IWZA 4HBAA 4YGNA 2NNVA 3HKQA 2FNKA 1CNWA 3N3JA 4BF6A 4CNXA 5BNLA 3P5LA 1BN1A 4ZAOA 1MUAA 1TTMA 5BYIA 4L5UA 5FNGA 5DSIA 4Q6DA 1IF8A 5E2MA 4PYYA 1KWRA 4KNMA 1CCTA 3MHOA 4TWMA 1IF7A 1OKNA 4JSSA 1IF6A 4LHIA 1TBTX 4RIVA 4HEWA 4Q99A 3F8EA 4RUZA 5EKMA 3JXGA 2QP6A 5JGSB 7CA2A 1YDBA 3IBIA 3TVOX 3DVDA 1CA3A 1KWQA 4XIWA 1DMYA 5EH5A 1LG6A 4G7AA 2HL4A 1FSQA 4ILXA 5E5UA 2FNMA 1I9PA 3TVNX 1UGAA 1LUGA 1CVBA 2HOCA 4FL7A 4E3FA 1CA2A 2CBBA 4WW6A 2HFWA 3MNAA 5JDVB 3N2PA 1TG9A 4L5WA 2QO8A 3CA2A 1LGDA 2O4ZA 3FFPX 5SZ1A 4QSAA 4Z1EA 3RZ8A 3DBUA 4MDGA 5FNIA 3R17B 5A6HA 1ZGFA 4Q90A 4Q8YA 1CNHA 2NN7A 3F4XA 3RZ5A 5E2KA 4QK2A 5HPJA 2NWZA 4ZWZA 1HVAA 1G48A 4LP6A 3T84A 4RFDA 3V3IB 3ZNCA 4K13A 1UGCA 1FR4A 1RZDA 3IGPA 2GEHA 4MTYA 1IF5A 5DOHA 3RZ0B 1TEUX 3KOIA 3T5ZA 3FW3A 3OYSA 2WEJA 1DCAA 4ZWIA 1RZEA 1UGBA 4QJMA 3BL0A 3M1WA 3KLDB 4Z1KA 3M67A 1OQ5A 3IBLA 3RYXB 1YDCA 4E9OX 3D93A 3P5AA 2POWA 3DD0A 4CACA 5EKHA 4DZ9A 3PYKA 1G4OA 2FW4A 9CA2A 1ZFKA 3M2YA 3DCWA 4LU3A 3MYQA 4N16A 1CRAA 3SBIA 2WD3A 1ZFQA 1BN4A 3MHCA 4K0TA 3V5GA 4R5AA 4QJWA 4QTLA 4HT0A 5SZ3A 4M2RA 1ZE8A 4ZWXA 5DSLA 5FNHA 2F14A 3MHMA 1T9NA 2ILIA 3HFPA 5L3OA 3V3HB 2X7SA 3K7KA 4QJOA 1HEBA 3MHLA 5EZTX 1CNIA 3IBNA 3OIMA 4XE1A 4Q0LA 4YX4A 4R5BA 4C3TA 4RN4A 5AMLA 2EU3A 5FNMA 1KEQA 4X5SA 1G45A 5JQTA 4MO8A 3M2XA 5DSNA 3D92A 3OY0A 1G54A 3MNKA 1YO0A 1MOOA 3HLJA 3K34A 2ZNCA 2FNNA 3CAJA 4QIZA 3HKUA 1EOUA 4Q08A 2CBAA 1FLJA 2WEOA 4QSBA 5E5RA 3MNHA 3P3HA 1AZMA 1I9LA 1FQMA 4RIUA 1RAYA 1CNJA 3LXEA 3QYKA 4CQ0A 5EOIA 5DSQA 5FLTA 5BRUA 4HEYA 4E5QA 1CCSA 4JSWA 4ITOA 5CACA 4QIYA 3PO6A 4FU5A 4PZHA 1HCAA 1CNGA 3MHIA 4Q78A 4Q06A 1CVCA 4M2UA 4JS6A 2CBCA 1V9IC 4M2VA 4Q49A 1CRMA 1HEDA 1RZBA 5JGTB 5EHWA 3S77B 1H4NA 3P58A 4QSIA 1BZMA 5FLPA 3HS4A 5G03A 1I9QA 4MLTA 2H15A 4KNNA 3U3AX 4QSJA 1HUHA 1JV0A 2NNSA 4QY3A 4MDLA 2GD8A 4CNRA 5JEHB 1RJ6A 1XEVA 4FRCA 4R59A 1RZAA 4K1QA 4N0XB 3KNEA 4YXOA 1G6VA 2X7UA 5FL4A 3MNIA 3W6HA 3S78B 1CILA 1RJ5A 1FR7A 1G52A 5CLUA 4WUPA 1CNBA 3D9ZA 5FDCA 3MZCA 2WD2A 3BETA 3JXFA 5EIJA 4PYXA 4JSAA 5FLSA 3M1QA 1G3ZA 1TEQX 2CABA 5G01A 3S74B 1CAOA 3N4BA 3DC9A 4QJPA 1CINA 5DSPA 3DVCA 3PJJA 3M2NA 2VVAX 1CVFA 3V3GB 3V2JA 1BN3A 4Q81A 2IT4A 1ZNCA 1I9MA 3N0NA 5E2NA 4YWPA 2FMGA 3EFIA 3SAPA 3U7CA 3EFTA 3MMFA 1BNUA 3KONA 4YYTA 2NNOA 2HNCA 1BNTA 1JD0A 1CCUA 1HCBA 1BNWA 3U45X 1CVHA 1I91A 5EH7A 4ZX1A 1G46A 3GZ0A 8CA2A 4ZWYA 3S9TA 4Q09A 3HKTA 3M5EA 4KNIA 3V2MA 3P55A 4BF1A 4MDMA 3SAXA 5JESB 3KIGA 3L14A 3D8WA 3B4FA 4FVOA 4KUVA 4YVYA 1IF4A 1F2WA 2FOVA 3CYUA 4WR7A 1BNQA 3S73B 1HUGA 5G0BA 2H4NA 5DSKA 4ZX0A 4IDRX 4YGJA 1FSRA 3S72B 5JEPB 3M96A 2ABEA 4Q8XA 1FQRA 1H9QA 1G4JA 2OSFA 3M5TA 2NNGA 4FVNA 3T85A 5A25A 3DV7A 4KUYA 1RZCA 2WEHA 3FE4A 2FMZA 4HF3A 3V3JA 1CAYA 3DCCA 4RFCA 3S8XA 3T5UA 1AM6A 3UYQA 3T82A 3S71B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2W2J A;  1A42 A;  4HEZ A;  2NXR A;  5FL5 A;  3V3F A;  2POV A;  4Q7P A;  3OYQ A;  5DOG A;  6CA2 A;  3RYY A;  3KKX A;  4YHA A;  3RGE A;  1LG5 A;  1TE3 X;  1KOP A;  4Q83 A;  4G0C A;  5SZ6 A;  4FIK A;  5FNL A;  1CAL A;  2NN1 A;  3RYJ B;  3HKN A;  3P44 A;  1RAZ A;  3NB5 A;  5EHV A;  3DA2 A;  3IAI A;  1DMX A;  3MDZ A;  3M40 A;  2POU A;  1OKM A;  5C8I A;  5SZ7 A;  3UYN A;  3MNJ A;  4Q7W A;  1BV3 A;  3DCS A;  3M1J A;  4KNJ A;  1BIC A;  4JSZ A;  4E3D A;  1CAJ A;  4DZ7 A;  5FDI A;  1CAK A;  1THK A;  2EZ7 A;  3C7P A;  2CA2 A;  2NWO A;  1I90 A;  1CAN A;  3RYZ A;  5SZ5 A;  3DD8 A;  3M14 A;  4BCW A;  3D0N A;  4KAP A;  1IF9 A;  3F7B A;  4Q9Y A;  1CAI A;  2WEG A;  1Z97 A;  5DSM A;  1CIM A;  3KS3 A;  1TB0 X;  4KV0 A;  3S76 A;  4TWL A;  1Y7W A;  1CNC A;  2FOY A;  2NWY A;  3M1K A;  3P3J A;  3IEO A;  4RUY A;  3T83 A;  5CJF A;  4K0S A;  4QK1 A;  4QJX A;  5DVX A;  4KUW A;  3RLD A;  3IBU A;  3RG4 A;  4Z1J A;  1H9N A;  5G0C A;  3RYV B;  5IPZ A;  1ZSB A;  3RZ7 A;  4ETQ C;  3DC3 A;  4YXI A;  5SZ0 A;  1YO1 A;  3ZP9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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