1CNWA

Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase ii influence binding constants
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase II influence inhibitor binding constants.
pubmed doi rcsb
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cnwA00
4XIWA 4KP5A 2EU3A 3MNUA 1YDBA 5E5UA 3KOKA 1I8ZA 1TTMA 3SAPA 4QSAA 5SZ3A 5DSKA 2F14A 6CA2A 3FFPX 3M1JA 3OY0A 3Q31A 1CIMA 5JQTA 1BN1A 1MUAA 1CNJA 4Z0QA 4LHIA 2CBDA 1CNHA 3FW3A 3M98A 5G03A 4YWPA 1CCSA 3MNAA 3KIGA 4Q87A 1IF4A 1A42A 4Q7VA 3PYKA 3BL0A 1IF7A 3P55A 1YDCA 4KV0A 1RAZA 4L5UA 5FNIA 2CA2A 1I9NA 1HEDA 5EHVA 4FRCA 4E9OX 3P58A 5JGSB 3HKTA 4LP6A 2FOSA 3IBUA 3V7XA 1CINA 1RZCA 1CAYA 1BV3A 4E49A 2H15A 5C8IA 1CNYA 1ZGFA 4Z1JA 1XPZA 5E2MA 3P3JA 3HKUA 3RZ5A 5FLTA 1CNCA 1BNWA 5CACA 1LG5A 5J8ZA 3M67A 3V3GB 3M5EA 2FW4A 3D92A 4X5SA 3VBDA 4R5BA 2CBAA 3M04A 4MLXA 3IBIA 3S77B 1URTA 4HT2A 4RUXA 5DRSA 1LG6A 2NNVA 3V3JA 1I9MA 5DSNA 3R16A 1F2WA 1XEGA 2FMZA 1EOUA 4HEZA 3PO6A 1I90A 1I9OA 2IT4A 1LZVA 3DC3A 4E3GA 5E2NA 1CNKA 3HKNA 1Z9YA 3U47A 2NXRA 5SZ1A 3RYVB 4ZX1A 1IF6A 5FLPA 4MDMA 3C7PA 1CVFA 1BNMA 3DVBA 1BZMA 3T5UA 5EHWA 4ZWYA 4E3HA 1RJ6A 2HNCA 3PJJA 5EHEA 4ETQC 3P3HA 1KEQA 5JEGB 4QJMA 5FNMA 3RGEA 2NXSA 3IAIA 2EZ7A 4YVYA 5E28A 1UGBA 5JESB 1FLJA 3OKUA 3MHLA 3UYNA 1BN3A 5DSIA 3ML5A 1G54A 4M2WA 3KLDB 1JCZA 2QP6A 4TWMA 1G48A 2AW1A 2WD2A 2WEOA 3DCWA 5JEHB 2HL4A 4ZWXA 1V9EA 4L5VA 5AMDA 3MHMA 4MLTA 4YXUA 1BNUA 3T84A 1KWQA 2H4NA 4QJOA 3RYXB 4RFCA 1TG9A 3D93A 4TWLA 3RG4A 5FNGA 3M2ZA 1FQRA 1RZAA 2FNKA 2VVAX 3ML2A 1TEUX 2POWA 4K1QA 4KNJA 4RN4A 4QSJA 4Q8YA 2Q1QA 4CNXA 1I9LA 3B1BA 4BF1A 4PYYA 1HUGA 1KOPA 4KNIA 1YO2A 1TH9A 1CRMA 3KNEA 4E3DA 1RZEA 3M2NA 1G0FA 3CZVA 4Q7SA 5FLOA 3W6IA 2NWOA 4Z1EA 2OSFA 4MDGA 5A6HA 3N0NA 4Q6DA 1CVEA 1ZFQA 4QSIA 3U3AX 5FL5A 4CNRA 3M5TA 4YGJA 5EH5A 4XIXA 4ZWIA 4DZ9A 2ILIA 5FNKA 4Q78A 1BNNA 4Q99A 1FQNA 1FSQA 2Q1BA 3OIMA 1BNVA 4M2UA 1IF5A 3S74B 3S78B 3RZ0B 5LMDA 5DSJA 5FL4A 4CQ0A 1RZBA 3KS3A 2CBEA 3MZCA 1DMYA 3F7UA 3OYSA 2VVBX 1OQ5A 4Q49A 7CA2A 1IF9A 2NWPA 1FQMA 3JXHC 1AZMA 1ZNCA 1UGDA 2NXTA 2ZNCA 1J9WA 4N0XB 4K0SA 4Z1KA 4RIVA 4Q83A 5BYIA 4DZ7A 3TMJA 1BICA 1MOOA 3DC9A 1G6VA 3D8WA 3MHIA 4WL4A 5SZ6A 3HLJA 1BNQA 1CNBA 3V3HB 4FVOA 1RAYA 3IBLA 3ZP9A 3S73B 3MMFA 3S75B 1YDDA 1AM6A 4HF3A 4N16A 3S76A 5BNLA 1CANA 3MDZA 2NNOA 1CVDA 3RYJB 1G4OA 1UGFA 4MDLA 2NN1A 4QJXA 5SZ7A 4K13A 5FLSA 4QIYA 3JXGA 1CILA 1TG3A 3NB5A 5L6KA 4G0CA 1XQ0A 3M2YA 3P4VA 4PYXA 5E2RA 4ZX0A 3MNHA 5DSMA 1BN4A 3M1QA 5EIJA 2HKKA 3TVOX 1CNWA 2FNMA 4G7AA 4QJ0A 3JXFA 4M2RA 4KUYA 4WUQA 5E2SA 3D0NA 3M40A 4BF6A 2EU2A 1BCDA 3FE4A 1FR4A 2FOVA 3MHOA 3CAJA 3HKQA 1G1DA 1CA2A 3KWAA 3R17B 3N4BA 1OKNA 1FQLA 4KNNA 3OYQA 3DV7A 1TB0X 4YGKA 4Q09A 2WEGA 5EOIA 4UOVA 3GZ0A 3RJ7A 4QTLA 1CVCA 5EH7A 5E5RA 1ZSCA 1ZFKA 3QYKA 4PXXA 5SZ0A 1HVAA 5G01A 2AX2A 5DSOA 1CA3A 5BRVA 2NWZA 1YDAA 1ZSAA 4RUYA 3F4XA 3HS4A 4ILXA 5E2KA 5FNJA 8CA2A 3MNJA 2FOYA 3EFIA 4PZHA 1CAMA 5CA2A 4QY3A 3ZNCA 3S72B 1UGAA 3RZ7A 5G0CA 1CNXA 4CA2A 1ZE8A 3DVDA 5SZ5A 1G45A 3U7CA 4K0ZA 4MO8A 1G52A 3CA2A 4RUZA 5FDCA 2GEHA 4FU5A 1HCAA 3MWOA 9CA2A 3SAXA 1I91A 4Y0JA 1CAIA 5EKHA 2HFWA 2FMGA 3M5SA 4FL7A 3F7BA 3MHCA 3V2MA 4YGFA 5DOGA 4Q8ZA 4QK1A 2X7UA 3RZ8A 2ABEA 3L14A 2CBCA 5DSPA 3IEOA 1LUGA 2GD8A 3OIKA 1FSRA 3NJ9A 4COQA 3K7KA 3M1WA 4YXOA 5JGTB 2NNSA 4Q90A 5SZ4A 5FL6A 1CVBA 1H9QA 5BRWA 3EFTA 4PQ7A 1KWRA 1FSNA 12CAA 3T82A 5SZ2A 1ZGEA 1DCAA 3OILA 3D9ZA 2NMXA 5CLUA 1G46A 1FR7A 1CAJA 4E5QA 4YXIA 4JSWA 1G53A 4KUWA 2NNGA 1UGEA 4R59A 5AMGA 5JQ0A 1TBTX 3CYUA 5EKMA 4IWZA 5JG3B 3M2XA 4WUPA 4Q08A 4QSBA 3BETA 3V5GA 4HT0A 3DD8A 4Q0LA 3DCSA 3RYYA 4Q8XA 1DCBA 1CVHA 5G0BA 1V9IC 5L3OA 5JG5B 4YGLA 3P5LA 1CAZA 4KP8A 1CNIA 5BRUA 1TEQX 3KOIA 1CZMA 1CNGA 5JEPB 3T5ZA 3HFPA 4E3FA 1Z93A 3S9TA 1CCUA 1T9NA 5DSQA 4Q9YA 4XZ5A 1CAOA 1G0EA 1OKLA 4BCWA 5FNHA 4RIUA 4JS6A 4Q07A 4Q81A 4E4AA 3DVCA 2POVA 1DMXA 4GL1X 3RLDA 3T85A 2WEHA 5JDVB 3S97A 3DBUA 3BL1A 4IDRX 4HU1A 4HEYA 2QO8A 4QK3A 2X7TA 4CNVA 3DAZA 3IBNA 3V3FA 3N2PA 1KOQA 5FLQA 5IPZA 2Q38A 4JSZA 5EKJA 4Z1NA 3MYQA 3S71B 4ITPA 3K2FA 1HECA 1TE3X 1YO1A 1THKA 3M14A 1OKMA 4YX4A 5FLRA 1RZDA 1CALA 5AMLA 1XEVA 4K0TA 4ITOA 3M3XA 4QK2A 3SBHA 4LU3A 5CJFA 1G4JA 2WEJA 3S8XA 3RYZA 4XE1A 4ZWZA 1CRAA 3P44A 1JD0A 2NWYA 3DCCA 3T83A 3UYQA 4R5AA 5DSRA 3N3JA 2W2JA 4KUVA 2O4ZA 5FNLA 3MNKA 1CVAA 3KONA 2POUA 5HPJA 2FNNA 1HEBA 4Q7WA 3DA2A 4FVNA 4HEWA 1UGGA 1Z97A 4HBAA 3SBIA 4WW6A 4QJWA 2QOAA 5A25A 4M2VA 1RJ5A 2FOQA 1CCTA 4QJPA 5DSLA 2CABA 4YYTA 5FDIA 4JSSA 5EZTX 3F8EA 3V3IB 1I9PA 1LGDA 2HOCA 2NN7A 4WW8A 2X7SA 1UGCA 3LXEA 1HEAA 2OSMA 3M1KA 4MTYA 3DD0A 4JSAA 3P5AA 4ZAOA 3M96A 4FPTA 3V2JA 1H9NA 4YGNA 1JV0A 4QIZA 4XFWA 1I9QA 2FOUA 4RFDA 3K34A 3U45X 4C3TA 3MNIA 2WD3A 1CAHA 4KAPA 4FIKA 4Q06A 3W6HA 3RZ1B 1Y7WA 3OKVA 4Q6EA 3IGPA 3RG3A 4YHAA 1ZSBA 1IF8A 4RH2A 3TVNX 4QEFA 1BNTA 1AVNA 1HCBA 1YO0A 2CBBA 3NI5A 1HUHA 4CNWA 1H4NA 2HD6A 1ZH9A 5DOHA 5DVXA 1G3ZA 3B4FA 4CACA 1CAKA 4Q7PA 4KNMA 3KKXA 4L5WA 4WR7A 5EH8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XIW A;  4KP5 A;  2EU3 A;  3MNU A;  1YDB A;  5E5U A;  3KOK A;  1I8Z A;  1TTM A;  3SAP A;  4QSA A;  5SZ3 A;  5DSK A;  2F14 A;  6CA2 A;  3FFP X;  3M1J A;  3OY0 A;  3Q31 A;  1CIM A;  5JQT A;  1BN1 A;  1MUA A;  1CNJ A;  4Z0Q A;  4LHI A;  2CBD A;  1CNH A;  3FW3 A;  3M98 A;  5G03 A;  4YWP A;  1CCS A;  3MNA A;  3KIG A;  4Q87 A;  1IF4 A;  1A42 A;  4Q7V A;  3PYK A;  3BL0 A;  1IF7 A;  3P55 A;  1YDC A;  4KV0 A;  1RAZ A;  4L5U A;  5FNI A;  2CA2 A;  1I9N A;  1HED A;  5EHV A;  4FRC A;  4E9O X;  3P58 A;  5JGS B;  3HKT A;  4LP6 A;  2FOS A;  3IBU A;  3V7X A;  1CIN A;  1RZC A;  1CAY A;  1BV3 A;  4E49 A;  2H15 A;  5C8I A;  1CNY A;  1ZGF A;  4Z1J A;  1XPZ A;  5E2M A;  3P3J A;  3HKU A;  3RZ5 A;  5FLT A;  1CNC A;  1BNW A;  5CAC A;  1LG5 A;  5J8Z A;  3M67 A;  3V3G B;  3M5E A;  2FW4 A;  3D92 A;  4X5S A;  3VBD A;  4R5B A;  2CBA A;  3M04 A;  4MLX A;  3IBI A;  3S77 B;  1URT A;  4HT2 A;  4RUX A;  5DRS A;  1LG6 A;  2NNV A;  3V3J A;  1I9M A;  5DSN A;  3R16 A;  1F2W A;  1XEG A;  2FMZ A;  1EOU A;  4HEZ A;  3PO6 A;  1I90 A; 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