1CVHA

Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFCWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydro-lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-11-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cvhA00
1AVNA 5SZ6A 1AM6A 2H4NA 5JG5B 1CNWA 5CA2A 1ZFQA 1CNBA 1YDAA 5BRVA 4QJ0A 4QJMA 3RG4A 3KNEA 3T5UA 2W2JA 3F4XA 4XIWA 3RYJB 1BV3A 2CBCA 3BL0A 3HKUA 1I9OA 3DVBA 5BRWA 3MNKA 2OSMA 1FQRA 4Q7PA 1F2WA 5A25A 2FOSA 3OY0A 5A6HA 3IAIA 6CA2A 3NJ9A 3DD8A 4YYTA 5DVXA 4DZ7A 1CINA 1BICA 1MOOA 4QJWA 1I9MA 5JDVB 1G4OA 1EOUA 5FNKA 5DOHA 1CAIA 2FOQA 3KONA 4WR7A 5G0BA 4Q8ZA 2FNNA 4PYXA 5E2NA 3S9TA 2HFWA 1CCTA 1RJ6A 1XEGA 5E5RA 1RAYA 4XFWA 4Q8XA 4WUQA 3UYNA 3IBUA 1Y7WA 3FE4A 5FNHA 2FMGA 3T85A 4IDRX 3V3HB 1H9NA 1TB0X 1TG3A 1BN4A 1KEQA 8CA2A 5G0CA 5DSQA 3D93A 3RYYA 1Z93A 5IPZA 4K1QA 3TMJA 3M1WA 2NNSA 3NB5A 1V9IC 1URTA 2NWPA 3K34A 2WEGA 4XIXA 5EH5A 5EH8A 5EHEA 5AMDA 1CA2A 4M2VA 4CNWA 3IBIA 4WL4A 1KOQA 4KUVA 5CACA 3CA2A 3HLJA 1FR7A 3OKVA 5EIJA 5FL4A 4QIYA 4XE1A 4RFDA 1YO2A 4DZ9A 3EFTA 3U47A 1G48A 3OYQA 2WEHA 3M1KA 4K13A 3D92A 4HT0A 3S72B 3S71B 1CAKA 1G45A 2POVA 4G7AA 3D9ZA 5FNIA 3W6IA 3VBDA 3HFPA 5E2RA 3F7BA 4MTYA 4Q99A 3CZVA 1V9EA 5JEHB 3GZ0A 4WUPA 4E3GA 4QJXA 4KP5A 4L5WA 4FRCA 4PQ7A 4YGLA 5JESB 2POWA 5FLRA 1BNMA 3V3FA 1RZCA 3U3AX 1CILA 4CNRA 1LGDA 2EU3A 1OKNA 1TH9A 3MNIA 1FSQA 2HNCA 1HEDA 3N0NA 1MUAA 4E3HA 3KOIA 1HUHA 4FL7A 4Q6EA 5DSPA 5E28A 4R5BA 2IT4A 3P3JA 1BZMA 5FLPA 4CNXA 4QK1A 2ZNCA 3MHOA 4ZWIA 4YXUA 4Z0QA 4N16A 3CAJA 3OILA 2Q1QA 1RZEA 3K2FA 5DSOA 1ZGEA 4UOVA 4RIUA 3MDZA 2NN1A 2EZ7A 1CNKA 1G3ZA 4FPTA 3M1QA 3DA2A 5E5UA 4KNMA 3PO6A 4WW8A 4HEWA 5FNLA 1I9PA 2HOCA 1CANA 2HL4A 3OIMA 4QSIA 3M3XA 1ZE8A 4CNVA 5DSNA 1IF8A 3LXEA 1HECA 5AMLA 4Z1NA 4E49A 4JSWA 3M40A 4RN4A 3DVDA 3V2MA 1LUGA 4MO8A 4Q08A 4ZX1A 1H4NA 4LHIA 4KNIA 1BNTA 4G0CA 4QJOA 4RFCA 3RZ0B 2WD3A 5L6KA 4TWMA 2NNGA 1CAMA 3IBNA 3S77B 3V7XA 4KV0A 2CBEA 5C8IA 4JSAA 1JD0A 3V3JA 4COQA 4R59A 1BNVA 3RYXB 4YWPA 3R17B 3TVOX 1XPZA 4YGJA 4Q09A 12CAA 1BNNA 2CBAA 1Z97A 2VVAX 4HU1A 1BN3A 5DSJA 3R16A 1G52A 4M2RA 2H15A 4PZHA 3P5LA 2FMZA 4JS6A 4ZAOA 3S97A 3KWAA 4E4AA 1IF4A 2NWYA 3CYUA 3JXHC 3MWOA 1ZGFA 4L5VA 1UGGA 4ILXA 3SAPA 1FR4A 1G1DA 1XEVA 5DSLA 4JSSA 5LMDA 3DC9A 3S73B 5DSRA 1THKA 1CCUA 4HBAA 3DD0A 1J9WA 5SZ1A 5G01A 4Y0JA 1I90A 2NMXA 2WD2A 4MLXA 3MHMA 3RZ1B 3P4VA 4QIZA 3P5AA 4K0SA 3MNUA 2NXRA 5EZTX 2FNMA 1CVHA 5FL6A 1G6VA 4ZWYA 1CALA 3V5GA 3M2XA 1CAOA 3F7UA 3T82A 3MZCA 2GD8A 1DMYA 1T9NA 2WEJA 5FNJA 4K0TA 1CVEA 4BCWA 2OSFA 3T84A 1ZSCA 4YX4A 4ITPA 4R5AA 5SZ0A 1YO1A 3M5EA 1UGAA 1CAJA 4Q8YA 5FLTA 5SZ4A 5EOIA 1CNGA 1TTMA 3HS4A 3ML2A 3MMFA 4Q78A 5EKJA 4YXOA 4Q83A 1RZBA 4HT2A 4Q7VA 5SZ5A 9CA2A 1I91A 1KOPA 4C3TA 2EU2A 5CJFA 1RJ5A 1HVAA 4RUXA 2NWOA 1Z9YA 3NI5A 1IF5A 1CVFA 2FOVA 1CVAA 4Q6DA 1FSRA 1CNYA 4RUZA 4QJPA 4RUYA 3DBUA 4RIVA 3RLDA 4BF1A 2CBBA 2F14A 4MLTA 4ZX0A 3N3JA 1ZSAA 2X7TA 1G53A 3W6HA 5JQTA 1CVBA 3DVCA 4FU5A 4Q7SA 5FLSA 3EFIA 5BRUA 5G03A 1HEAA 4YGKA 5SZ3A 3JXGA 5DOGA 3PJJA 4M2WA 2NNOA 3RYVB 4FIKA 4YHAA 1G54A 3RZ8A 1CNCA 2ABEA 1CNHA 1ZFKA 4BF6A 1AZMA 5FLOA 2NXSA 5J8ZA 3T5ZA 1BNQA 5JEPB 3M2NA 1A42A 5JEGB 4GL1X 4XZ5A 1CAHA 5E2MA 1RZAA 1FQLA 3HKNA 3DCCA 4K0ZA 3M98A 4E3FA 3M04A 4Q87A 1OKMA 1CAYA 1CNJA 3U45X 4FVNA 2NXTA 1CRMA 1KWRA 3RZ5A 3RYZA 1CVDA 4PXXA 4QEFA 5FDCA 3MYQA 4QK3A 1IF6A 3L14A 3DV7A 3SBHA 1FLJA 5EHVA 3P3HA 3U7CA 2HD6A 3M96A 1G0FA 1HEBA 2FOYA 1G0EA 4L5UA 1FQMA 1DCAA 4PYYA 4CACA 1I9LA 4Z1EA 4QY3A 2FW4A 3IGPA 4YGFA 3S75B 3P58A 1HCBA 1HUGA 1OKLA 3KS3A 2AW1A 5DRSA 1YDCA 4E9OX 5FNMA 1DCBA 3M2YA 3MNJA 1JV0A 4ITOA 4YXIA 3F8EA 3HKTA 4KNNA 4TWLA 4HEYA 4Q07A 1G4JA 1BCDA 1TG9A 4Q7WA 1CA3A 1UGFA 2X7UA 2POUA 4IWZA 3DAZA 3RGEA 3RJ7A 3D0NA 1KWQA 4Q81A 1YO0A 1CCSA 1UGDA 4KP8A 4E3DA 3MHIA 1CZMA 1RAZA 2NNVA 2AX2A 3IEOA 4JSZA 1JCZA 2GEHA 3M1JA 3V3IB 3HKQA 5L3OA 2VVBX 3RG3A 5EKMA 3DC3A 4Q0LA 3QYKA 3UYQA 3M5TA 5DSMA 4X5SA 1IF9A 2NWZA 3D8WA 1BNUA 1UGBA 5FL5A 3OYSA 4YGNA 3MNAA 3S76A 5FNGA 3M5SA 3OIKA 3Q31A 3N2PA 1CNXA 3BETA 3ZP9A 4N0XB 2X7SA 4E5QA 4QSJA 4KUWA 1OQ5A 3MNHA 4Q90A 5JG3B 4KAPA 3PYKA 3S8XA 2QP6A 4KUYA 4QSAA 5BNLA 4FVOA 3BL1A 3C7PA 3KIGA 4M2UA 1BN1A 1ZSBA 3K7KA 3DCSA 1TEUX 2NN7A 5HPJA 2ILIA 4RH2A 1UGCA 2O4ZA 1YDDA 4QK2A 3FFPX 5EKHA 2QOAA 1H9QA 3JXFA 4LU3A 1FQNA 3P55A 1XQ0A 3V2JA 2CABA 1ZNCA 5DSIA 5SZ2A 1BNWA 4HF3A 4Q06A 3MHCA 4ETQC 3M67A 5JGSB 5EH7A 2CBDA 4WW6A 3B4FA 4QSBA 4ZWXA 3KKXA 3P44A 5DSKA 4CA2A 3FW3A 4QTLA 1TEQX 1RZDA 4Z1JA 3KOKA 5FLQA 4MDMA 5EHWA 3M14A 1LG5A 2FNKA 2CA2A 4HEZA 3V3GB 5E2KA 1CRAA 4CQ0A 1HCAA 1I9QA 1FSNA 1G46A 1YDBA 3SBIA 5SZ7A 5BYIA 5AMGA 1UGEA 3KLDB 1IF7A 4MDGA 4ZWZA 4YVYA 1CVCA 2HKKA 4Q49A 4Q9YA 1DMXA 3S78B 7CA2A 3DCWA 2Q1BA 3TVNX 5JQ0A 2FOUA 1I8ZA 1LZVA 3S74B 5FDIA 5JGTB 3MHLA 3ML5A 3M2ZA 1CNIA 4KNJA 1ZH9A 5E2SA 3RZ7A 3IBLA 1CAZA 1I9NA 2WEOA 4Z1KA 2Q38A 3N4BA 3B1BA 4LP6A 3T83A 2QO8A 3ZNCA 3SAXA 5CLUA 1TBTX 1LG6A 3OKUA 4MDLA 1CIMA 1TE3X
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1AVN A;  5SZ6 A;  1AM6 A;  2H4N A;  5JG5 B;  1CNW A;  5CA2 A;  1ZFQ A;  1CNB A;  1YDA A;  5BRV A;  4QJ0 A;  4QJM A;  3RG4 A;  3KNE A;  3T5U A;  2W2J A;  3F4X A;  4XIW A;  3RYJ B;  1BV3 A;  2CBC A;  3BL0 A;  3HKU A;  1I9O A;  3DVB A;  5BRW A;  3MNK A;  2OSM A;  1FQR A;  4Q7P A;  1F2W A;  5A25 A;  2FOS A;  3OY0 A;  5A6H A;  3IAI A;  6CA2 A;  3NJ9 A;  3DD8 A;  4YYT A;  5DVX A;  4DZ7 A;  1CIN A;  1BIC A;  1MOO A;  4QJW A;  1I9M A;  5JDV B;  1G4O A;  1EOU A;  5FNK A;  5DOH A;  1CAI A;  2FOQ A;  3KON A;  4WR7 A;  5G0B A;  4Q8Z A;  2FNN A;  4PYX A;  5E2N A;  3S9T A;  2HFW A;  1CCT A;  1RJ6 A;  1XEG A;  5E5R A;  1RAY A;  4XFW A;  4Q8X A;  4WUQ A;  3UYN A;  3IBU A;  1Y7W A;  3FE4 A;  5FNH A;  2FMG A;  3T85 A;  4IDR X;  3V3H B;  1H9N A;  1TB0 X;  1TG3 A;  1BN4 A;  1KEQ A;  8CA2 A;  5G0C A;  5DSQ A;  3D93 A;  3RYY A;  1Z93 A;  5IPZ A;  4K1Q A;  3TMJ A;  3M1W A;  2NNS A;  3NB5 A;  1V9I C;  1URT A;  2NWP A;  3K34 A;  2WEG A;  4XIX A;  5EH5 A;  5EH8 A;  5EHE A;  5AMD A;  1CA2 A;  4M2V A;  4CNW A;  3IBI A; 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