1DEJA

Crystal structure of a dictyostelium/tetrahymena chimera actin (mutant 646: q228k/t229a/a230y/a231k/s232e/e360h) in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
375
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMKAYKESSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKHEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords GELSOLIN
publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 367
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1dejA03
2FSNA 1NGEA 3H1VX 4IJAA 5AQYA 4BRMA 3W0LA 4B1UB 4BGBA 3VF2A 3O4WA 4Y0WA 5BRHA 2Q2RA 3BEXA 3IUCA 4DHYA 4BR2A 4CZGA 2EWSA 1R59O 2GUPA 2P9NA 4WYBA 3KVGA 3LDNA 2E88A 1JCFA 2FF3B 1X3MA 1NGFA 1JCEA 1NGDA 3R6MA 4B1XB 3KHYA 1T6CA 4HTLA 1CZAN 3BF1A 4CZMA 4XH5A 1ZC6A 3CJCA 4CZFA 4QS8A 3AAQA 3SMPA 5AQGA 5AQIA 3G25A 1MA9B 2GELA 3VEOA 4H5TA 5EXWA 3UKRA 5BPNA 4F9OA 1TUUA 3R9PA 2I7PA 3JS6A 5AQSA 4AM7A 3FZKA 2YHYA 2J4RA 3O8MA 3TPQA 4JD2A 2V7ZA 3DJCA 3GOIA 4GY2B 4RCHA 1QQNA 2YJEA 4CZJA 5BN9A 3CHWA 1U2VB 1RFQA 3W3DA 4B1ZA 3QMLA 1J6ZA 4XEIA 2ZWHA 1T6DA 1D4XA 2E2QA 1BG3A 3C7NA 1RDWX 1ATSA 5ELZA 3GE1A 3SMSA 2V7YA 4Z94A 1GLBG 4IO8A 2QWLA 3I8BA 3ENOA 5E26A 3D2FB 4A2AA 3O6WA 3QBXA 3FZMA 3HTVA 4JNEA 5AQVA 3QICA 2D4WA 3EO3A 4CBXA 2P9UB 4FWRA 5B8HA 1U2VA 4M7XA 3H6EA 2VYPA 3FZHA 3CIPA 5FPEA 4FWLA 5F0XA 4CZEA 4E1JA 4AM6A 5KPRA 2BUPA 3A5LC 4H0XB 3VERA 4BG8A 1WOQA 1BA1A 3QFUA 3DWLA 1QQMA 2CH5A 4IXCA 5AQHA 4BC4A 3ATUA 4M7YA 5AQWA 4BG9A 2GWKA 3QBWA 2FSJA 3LDOA 3ULEB 2IVNA 4H0OA 5KPTA 4BRCA 3EN9A 1QZ5A 2F9WA 2OANA 3QFPA 4H03B 5AR0A 3ZEUA 5AQZA 4BRQA 3VF6A 1LCUA 1HJOA 1NM1A 3O80A 4CD1A 2QM1A 1DEJA 1KXPA 2HOEA 4B1YB 4EFHA 2FLOA 4FO0A 1T44A 2ZGYA 4EHUA 3CETA 4BR0A 3UE5A 3CI5A 2BTFA 3WQTA 3H3NO 4FWMA 5AQKA 3DXMA 4FWOA 3VEXA 4LC9B 1BO5O 1C0GA 3ENHA 1X9JA 4BR4A 4YDUA 1ATNA 3FZLA 3FGUA 4BVPA 3FFKB 3RSEB 4A61A 3WEEB 1S22A 2YCHA 3EZWA 3H46O 3A5OC 2AP1A 1GLLO 4BRKA 1NGGA 4JHDA 4EHTA 1NBWA 2QXLA 4CZIA 1KAXA 3MK6A 4IZ9A 4BRLA 4PKGA 1BUPA 5AQPA 3FR0A 2YJFA 2Q36A 3CJBA 5AZIB 1P8ZA 2GTDA 2VWBA 2Q1NA 5FPMA 5KPZA 5AQXA 4CBWA 5AFUA 3D7EO 3AY9A 1GLFO 2Q0UA 2E1ZA 2FSKA 5ADXA 4BC5A 5JLHA 1YAGA 1DKGD 4NB4A 3WXKA 3VOVA 1ESVA 2P9LB 4JAXA 1GLEG 5AZJB 5EX5A 4K42A 1YVNA 3VENA 4BRHA 3LDPA 4FWQA 5F2RA 3WEEA 5AQFA 2YHXA 3FLCO 5BPMA 3S41A 1HX1A 3ATVA 1NGJA 4ISFA 5KQ8A 1XQSC 4H0VB 5AQQA 4PL8A 4NO7A 2QWMA 4EIAA 3ID8A 5AZIA 4FSVA 4FWKA 2QWOA 4BREA 3H1QA 2A3ZA 2ASPA 3VGKA 4K41A 2V52B 1MDUB 4H0TB 3CJAA 1V4TA 4PKIA 5BR9A 4DCHA 2VCPA 2CH6A 3B8AX 1BOTO 1BWFO 5EOYA 3GL1A 3FZFA 4FPAA 4ISGA 3VGMA 4BR9A 5AQLA 5BPLA 1XUPO 2D0OA 5AFUH 5AZJA 5F1XA 5JICA 1YUWA 2GWJA 5FPDA 2QWPA 3M6GA 3CJ7A 2W41A 3VGLA 3HSCA 4K25A 4MLEA 5BREA 1V4SA 3WQUA 4O8KA 4CJ7A 4QS9A 3QDKA 3A8YA 4BRDA 2V51B 3TU5A 2KHOA 3GG4A 5TKYA 1TYQB 2E2PA 2AA4A 3MN9A 3EKSA 2IIRA 2ASMA 5BRDA 2NLXA 4BC3A 4DB3A 3O08A 2FXUA 2P9IB 1NMDA 1LOTB 2QWQA 3M3ZA 4BVOA 3U4LA 4IJNA 3A5MC 3D2FA 3DAWA 4I6MB 1Z05A 4H5RA 3VEZA 4BQZA 2E8AA 3LDLA 3IFRA 4C23A 2P9UA 3D2EB 4BRFA 1BA0A 1RGIA 3HM8A 4BR5A 4CD3A 3QB0A 5AQNA 2E20A 5BRFA 1NGIA 1TYQA 2QW9A 3DXKB 3UKUB 4FOIA 3ZX3A 4WQ4C 1MWKA 3VETA 2IVPA 3AARA 3LL3A 2GEMA 3L6QA 3LM9A 3ZX2A 1QZ6A 2ZF5O 2Q97A 3GBTA 3SK3A 4CZKA 3ULEA 4FWSA 1WUAA 1EQYA 4H0PA 4XH1A 3O5BA 4JN4A 4DQ8A 4BROA 1GLJO 1BDGA 4I6MA 3SJHA 3R8EA 2QWRA 3HI0A 4O5FA 3HBTA 3OHRA 1HKGA 3UB5A 1OKJA 3L4IA 2FF6A 4WQ5C 4CZLA 2A5XA 2P9PB 2E1YA 5AQRA 3UKUA 1HKBA 1BU6O 4BRGA 4HWIA 5FPNA 1ATRA 3UKRB 2CGLA 3BUZB 4RTFD 5JLFA 3IMXA 1U6ZA 4IWVA 2A40A 3EL2A 4FPBA 1HLUA 1ZBSA 4JD2B 1NWKA 3RSEA 2A41A 4WQ4A 3JXUA 3SLCA 2YI1A 4BGAA 4FL9A 3MMVA 2IVOA 4FWPA 3WT0A 5AQTA 3WUHA 2P9KB 2P9SB 5AQUA 1HPMA 3HZ6A 4J8FA 5EY4A 3VEWA 3O1BA 3AAPA 1IG8A 3EKUA 5EVZA 4M63C 3BP8A 2P9PA 1SZ2A 3U9DA 5LJVA 3C7NB 3VEVA 3MDQA 5AQOA 1HUXA 3FE1A 3U9ZA 1GLAG 2H3GX 1DGKN 2HMPA 3CQXA 1NGBA 3CJ1A 4BC2A 4WQ5A 4MLHA 1SAZA 3CQYA 2P9LA 5E84A 4KBOA 2NZTA 3GDQA 4B1VA 5I9EB 3MCPA 5ADXH 4BR7A 4H5VA 3LDQA 3ZETB 4BRPA 2P9KA 2P9SA 1NGCA 4B9QA 1E4FT 2E2OA 2Q31A 2QWNA 3WXJA 4XH4A 3WXLA 2CGJA 1KAZA 5BN8A 1Y64A 2ASOA 2UYTA 2D0PA 2I7NA 2NRHA 1H1VA 4K43A 2YHWA 3VEYA 5KQDA 1TUYA 4BQLA 2PAVA 1SQKA 1Q18A 2DPNA 3WXIA 4A62A 3ZEUB 4H5NA 4L3QA 1IJJA 2E2NA 5AQJA 3U8XA 1KAYA 2PBDA 3ZETA 2F9TA 1MWMA 3MN5A 2ZGZA 3A0IX 5AQMA 2WUSA 4YDUC 2HF4A 3VESA 4CI6A 1C0FA 5JMVA 1K8KB 2ITMA 2W40A 4H0YB 3DXMB 3P4IA 3VPZA 4B1WB 1GLDG 2HF3A 1S3XA 3A5NC 3C0BA 4MO4A 3L0QA 3H3OB 3H45C 1X3NA 1ZXOA 4CBUA 4CZHA 3M1FA 4BRNA 4QS7A 4PL7A 3BF3A 2CGKA 1GLCG 1YXQA 3MN7A 5CE3A 3KZBA 4H5WA 4A2BA 4EAHD 1NLVA 3VF4A 4FWNA 4JHDB 4FOEA 2P9IA 4GNIA 1QHAA 1NGHA 3J8AA 3CJ9A 1G99A 4BRAA 2A42A 1JCGA 1E4GT 4ISEA 2P9NB 2D1KA 4BRIA 1Z6RA 1K8KA 3LM2A 4MO5A 3CERA 3D2EA 3IDHA 5LJWA 1QQOA 2Q0RA 3ZX0A 4RWTA 3MN6A 3DXKA 4PKHA 1HKCA 2A6AA 5LY3A 3I33A 1NGAA 3O1WA 1XC3A 3F9MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CESA 3H1VX 1NGEA 3QEXA 2G8HA 4NXNK 2E6MA 3VQQA 3CCUN 4B1UB 2QI2A 2HHTA 1U48A 1KVBA 5BRHA 5GADP 4DHYA 2XO7A 4BR2A 4H4MA 2KFZA 4W5NA 3LDNA 3TANA 2E88A 1TK8A 3ULDA 3QIPA 3OYMA 3M8QA 4I2QA 4E7HA 3T7ZA 3AVGA 2GELA 3CMEN 4CJ5A 4M3TA 5BPNA 2ETJA 4AHTA 2IC3A 3FZKA 2YHYA 3TPQA 5JS1A 4O4GA 4FZYA 3DJCA 4RCHA 1KD1O 2YJEA 3SQ4A 3CHWA 1L3UA 1WSHA 1YI2N 2F8SA 3QMLA 1E3MA 4WFBL 1D4XA 3SQ2A 3TWHA 2E2QA 1BG3A 4DV7K 4DUZK 2GV9A 1EXQA 3GE1A 5JS2A 4IO8A 4FXDA 1W9HA 3SZ2A 3AO3A 3ENOA 2RKIA 3D2FB 1S1TA 4CEOA 4HCCA 1VHXA 4KRFA 4NCGA 4Z4FA 3TI0A 2D4WA 1NKCA 3U3GA 5B8HA 4ICLA 4BDYA 2VYPA 5F0XA 1C0UA 4CZEA 4E1JA 3K0SA 1BCOA 1NK7A 3VERA 1WOQA 1RBRA 3QFUA 1QQMA 3ATUA 3HK2A 4V19S 1TK5A 1RT1A 4JKEA 3E9PA 1YF5L 3QFPA 4H03B 1FKOA 5AQZA 3DLGA 3CCEN 1NM1A 2NRXA 2IAJA 4ILJA 4OGEA 4FO0A 3CPEA 1T44A 1ASVA 4EHUA 1N33K 4DV4K 4DS4A 2BTFA 3PIPL 3JYTA 1QVGM 4FZXC 5DM7L 2WOMA 4B3SK 3DXMA 3OJSA 4F2RA 2OPSA 4LFBK 1VSHA 3ZYYX 3RR8A 4E72A 3FZLA 3CCQN 3RR7A 4BVPA 5KRSA 3FFKB 4Z4EA 3WEEB 1S22A 2YCHA 1NK4A 3A5OC 3TAPA 2UXCK 1NBWA 3HM9A 3ZSRA 1S1XA 1BHLA 2Q36A 4YNQA 5FPMA 2VQFK 4NCAA 2P5OA 4IFVA 2D0CA 3DI6A 4CBWA 5CZ2A 2G8FA 4CECA 3K2PA 1XHZA 4DTNA 4YOTA 1BIUA 4GKJK 4BC5A 3WXKA 3M5RA 2P9LB 4BRHA 3LDPA 5AQFA 3JSMA 2YHXA 4OPJA 5BPMA 3ATVA 3VQCA 1XHXA 5HRNA 1FJGK 3AGRA 3L4QA 3HOSA 2QWMA 4A57A 4FM0A 5AZIA 2QWOA 3H1QA 4K41A 3CM5A 2V52B 4H0TB 3ZSOA 1V4TA 3MEEA 4JK8A 4RW4A 1WSIA 3V81A 2E5LK 1BOTO 4F8RA 5CZ1A 4ISGA 3VGMA 1VK0A 4BR9A 3T1HK 5BPLA 1XUPO 5AZJA 1JXBA 1YUWA 1CLQA 2HHWA 1B92A 5LL6Z 1W2BM 4CF0A 4OLAA 2EX3A 2PYJA 2RE2A 4JS4A 1HPZA 4LY7A 4H4OA 4FW1A 4MLEA 3BGRA 3NHGA 4CJ7A 1NJZA 3PX6A 3ZSVA 1C1AA 1MU2A 4FJ8A 3I0RA 1SV5A 3S3NA 3GG4A 4LSNA 4CJSA 2IIRA 4JI1K 1WBDA 5M1KA 3Q7BA 2Q3SA 4DR3K 5BRDA 1X9MA 4DSFA 4BC3A 3O08A 2FXUA 4LD0A 2HBKA 1K6YA 3M3ZA 4BVOA 4M3RA 3D2FA 4I6MB 2VWKA 3VEZA 1RTDA 3IFRA 4CD3A 1BA0A 4BR5A 4YHHK 3SNNA 1VRTA 4OKEA 4CHZA 1U45A 1UAXA 1RTHA 1NGIA 1TYQA 2QW9A 1RDCA 3UKUB 4WQ4C 3ASMA 3J81O 3V9UA 4B3MK 1TKTA 3LL3A 1S1VA 2GBZA 4LF4K 3L6QA 3LM9A 3ZX2A 1QZ6A 4RW8A 5JVGL 4DV5K 4CZKA 1VQ6N 3O5BA 4DQ8A 4M3UA 1GLJO 4NYFA 3SJHA 3MXMA 3E01A 3HI0A 3HBTA 3O4NA 5CYQA 1ZYQA 3OHRA 1HKGA 3DOKA 1HJRA 1G15A 4WQ5C 2A5XA 1T3VA 2E1YA 2FC0A 1LAWA 4BRGA 3I0SA 4HWIA 1ATRA 5M1NA 1TKXA 3SPZA 4DQSA 3SI6A 4IWVA 3V9SA 3EL2A 4FPBA 3OYLA 4FZZA 4I2PA 1NWKA 1S1UA 4KAZA 1RTIA 1OVQA 4WQ4A 1EP4A 2Z1IA 3SCXA 1QSLA 2YNGA 2IVOA 4FWPA 1KFSA 1RDAA 2Z1JA 2GX9A 4CJ3A 4ZTJA 2VGMA 3TARA 1VSFA 2IS3A 4YFUA 5EY4A 3QETA 1IG8A 3EKUA 3LZIA 1HNIA 5EVZA 4X66K 2QKBA 4BE1A 4FM2A 5C25A 3KD5E 3HVRA 1IKYA 4IG3A 5AQOA 1RDDA 5CYMA 3K5MA 3KWIA 3QERA 4XJXA 3U9ZA 2KTQA 2HHVA 1DGKN 3KLFA 1IO2A 2E4LA 4BC2A 3PSFA 4WQ5A 4MLHA 1SAZA 2P9LA 3MWPA 3JAMO 2NRWA 4FJXA 1UWBA 5ADXH 3HSTB 3LDQA 4YOXA 3VQ5A 2HNZA 2P9KA 1NGCA 1EWRA 2O4GA 4M41A 4CW7B 1E4FT 5GINA 3LP3A 3HVTA 4XH4A 2RPIA 3WXLA 1KAZA 1VQON 1Y64A 4IFEA 4LH4A 3OYEA 1N8RO 1Q7YO 2NRHA 1IBLK 1P90A 3VEYA 5KQDA 4HUGA 4FVMA 2BH1A 4BQLA 2HVHA 2YHAA 3WXIA 1JLAA 3ZEUB 3LDSA 1RBVA 2P51A 2E2NA 5EU7A 3U8XA 4KB0A 2PBDA 2D0BA 4KH4A 5J2PA 3K5LA 3ZSWA 4DV3K 1MWMA 3CC7N 2WUSA 2LSNA 4C1NK 2PYLA 2YX6A 3BZCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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