1DLLA

The hc fragement of tetanus toxin complexed with lactose
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
molecule keywords TETANUS TOXIN
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium tetani
total genus 114
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1dllA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1dllA02
3BRFA 2C5DA 2LIEA 3CRHA 3MEPA 5CA6A 1GBGA 2EXHA 3HSMA 3AKIA 1M2TB 5GZEA 4SLIA 2PHXA 3IM7A 3K1XA 3N36A 1LOEA 3KMVA 4YM2A 2WJSA 2A6XA 4XFSA 1WD4A 2E51A 2JD4A 1NXD1 3PJQA 3V0AB 2WKKA 5EG6C 1FV3A 1G82A 2A75A 4P6AA 1W0OA 4ZLBB 4ZA3B 3OGGA 2ES3A 1GZ9A 3AZVA 4XDQA 2JECA 1FN0A 1IRAX 2ZA9A 2JE9A 1UX6A 2G4IA 4D69A 1QDCA 2CL2A 1JLXA 4FPJA 3ZSJA 1KQRA 3A0NA 1Q8PA 4LBQB 5GLUA 4AGVA 1N1YA 1WCSA 2VW0A 2V5YA 4LBQA 1PZZA 2E4MC 5HPZA 1CQ9A 3O49A 1PC8B 2DVAA 3WCRA 1V6OA 4WV8A 2WT2A 1QQKA 2ZMLA 1LOAA 2D6OX 4R9DA 5FZUA 4Q9GA 1DQ6A 2P3KA 2D24A 1FX5A 4YGCA 3LCPA 3WMUA 1Q03A 3PMEA 1QGLA 4ISRA 5G00A 5JMCA 31BIA 4Y1YA 1WBLA 21BIA 1AVXB 3RMYA 2J3PA 3IAGC 1APNA 3AH1A 4YZ1A 1GICA 4XTMA 1G9CA 2EALA 4FVVA 5IT6A 1IKQA 2A71A 4K20A 1LULA 5F8SA 3WINC 2WNEA 1QQLA 1BLDA 1X50A 2RQ9A 2GMMA 1QU0A 5KXBA 1LEDA 4GXLA 1L2HA 2GMPA 2D23A 2VU9A 1ISVA 1V6UA 4USPA 4QKSA 1JT7A 4D0TA 2ZQNA 3S8KA 3RRDA 4FPYA 1V6XA 1Q56A 1YRZA 3ZC8A 4I3NA 2VSAA 2DVDA 1TOOA 5D62A 2YUGA 2GN7A 2BEAA 1SFYA 3BTAA 3WZ1A 1WLWA 2ESUA 1IS6A 2PHUA 3T2TA 1LJ7A 5EC5A 4HA2A 2DUQA 4I1EA 3L2YA 4AVTA 5BOWA 3OY8B 1MS8A 2AQZA 4LO3C 1QOOA 1BA7A 6I1BA 5JOZA 3OY8A 4LO1C 1D0HA 2GNTA 4XYXA 2M49A 1CN1A 1ITBA 3D5OA 3B69A 1DGLA 3FJ8A 4X39A 2R0HA 1IT0A 1QOTA 2A6YA 3INAA 1KRIA 4DQAA 1O4YA 1V6LA 5T5PA 1N3PA 1SCRA 3M3CA 3RTIB 2E7TA 3FFZA 3WHUA 1FV2A 4YOLA 2A6VA 41BIA 1EV2A 3CQAA 4AGRA 3BAVA 4LO0C 1GKBA 4EEEB 1AX1A 3M3EA 4M3CE 1T4QA 4DCKC 4Z9WB 2DRYA 3CRGA 4GKYA 3O4OA 4YM0A 4ZBVB 2NP0A 1UN1A 2ERFA 4Y22B 1EPWA 3PG0A 4XBNA 5BXPA 1J0SA 3NV4A 5KXDA 4HL0A 2KH2A 1GLHA 1C57A 5BXSA 3BAOA 2VY0A 4OEEA 1TWMA 1YYNA 2D7RA 1MS0A 3AYEA 1I3HA 1JYCA 1QF3A 4AN6A 2Q3NB 1GZCA 2W68A 2A3WA 3P6IA 1AXZA 1YXWA 3AZYA 2ZZJA 2ZMNA 1IOAA 3POSA 4PQ9A 3ILRA 3HALA 4I6IA 1EYLA 2CYFA 3BOPA 3KM5A 1N3OA 1MVQA 4XJ8A 1DQOA 3AKGA 1MD6A 4IZEA 4JKXB 1SLCA 1UPSA 5E24E 2ZGNA 1CESA 4I2SA 4XIKA 1PUUB 2YY1A 2ZKNA 3V79C 4UW6A 1AVWB 5DUXA 1DQ0A 4TZDA 2HW9A 1XG6A 2QN4A 3AX4A 1QOSA 1G9DA 2PELA 3HR9A 3IIRA 3UJQA 3FJFA 2ZHNA 2BFHA 5F8WA 4LO2C 1CIWA 3AYCA 1N47A 4R9CA 1Y7BA 1T9FA 3I4IA 4P0KA 4GKXA 2VLCA 1RZOB 3H6SE 2GZBA 2VW1A 5I1BA 2BEBA 1MS1A 2WSVA 4I4OA 1LHNA 3N7KA 3CA6A 4JC1A 4LBOA 5T55A 4X37A 4I4RA 2UU8A 3B01A 4IQPA 1HKNA 2CY6A 4YW3A 1ULFA 1V6JA 5IK4A 1HLCA 2CNAA 3VKOA 3RMXA 4KC3A 1GNZA 4I4PA 1CE7B 4LO7B 5FZZA 1HWOB 3F1RA 3AP9A 1DJSB 4AGGA 2HZ9A 1UKGA 2P37A 4Q8KA 3VSZA 4YG6A 5IK5A 4QD2C 3POWA 4DPNA 1ULGA 3O0XA 4F83A 3W59A 1AVUA 1Z78A 2E53A 1VIWB 2EIGA 1LTEA 1DIWA 4I4SA 4XMIA 1JW6A 2ARBA 1RY7A 3M1HA 2DV9A 1UMZA 3WG2A 2K43A 4XJAA 4BLJA 1BJQA 3A4UA 1A3KA 2JDZA 1ENSA 2DYCA 1SLBA 1KJRA 3NBCA 2OUHA 1CVNA 3RSJA 2RSTA 1GANA 1G9AA 4XXAA 1SR4C 1BKZA 2NZ9A 4KEJA 2WSUA 4IZXA 1ILR1 4I4XA 1Q8OA 1I1BA 1MVEA 2AGSA 5FNWA 2Z42A 3Q7YA 1S0IA 1CONA 4Z8BA 1MZ5A 1OKQA 2DUOA 4M00A 3CRIA 5E88A 1MACA 5DG1A 5FREA 2EXKA 3WG3A 4I37A 5EXOA 1WW4A 3USUB 7I1BA 3OBRA 2AYHA 3FJDA 5GLZA 3ZSMA 1OQ1A 1LGNA 3BODA 4JQ0A 4WBCA 4Y1VA 3ZXGA 3WG1A 3TC2A 1G9FA 2DWRA 1J1TA 3W58A 2K4AB 2YXSA 2D6KA 4XBQA 2E6VA 3FJIA 3VT0A 3AXDA 1MS9A 5KXEA 2P23A 4GA9A 2GNBA 1LGCA 4PC4A 2LALA 2PHTA 4YG3A 1DZCA 1RIRA 4UW3A 3WDTA 2H0BA 2R1DA 4JPZA 4I7IA 4A7KA 4USOA 3TB0A 2ZHKA 2MC2A 1JT3A 3UJOA 4FPCA 5GZFA 3AJ6A 4AYUA 1MS4A 3B00A 4I30A 2SLIA 2W39A 4YZ2A 1N3QA 1V6KA 3V0BB 3FJ9A 3OJMA 4IONA 4BMEA 1AXMA 3WHTA 3JU9A 2Q5TA 1M16A 1IS3A 3V0BA 1JT4A 4II0A 1CR7A 2FFUA 5JLVA 1SACA 3LSEA 4I4QA 3VEQA 5GLVA 3SH4A 3BB2A 5BP5C 1AZDA 3B3QE 3O4BA 2Z49A 1DLLA 5JOYA 4Y24A 3BAGA 1LOGA 3FJBA 1IHKA 2JKBA 2EXIA 1PWAA 4ZFWB 3SH3A 1ULDA 3M2MA 2DU1A 3FUOA 1JLYA 3V64A 2Z48A 1S0BA 2WBCA 4TYSA 4PF5A 3FLPA 4LO8B 3N7MA 5BQUC 1VLNA 1YF8B 2DTYA 1WD3A 1DHKB 4GWMA 1BQPA 4C1WA 3WMVA 8I1BA 2E4MA 1R8OA 2VW2A 3LLPA 3ZXKA 4QBVA 5FZYA 2PHRA 3BADA 3ZXJA 1DQGA 2KLLA 1BFGA 5JOXA 4PBPA 4FPKA 2L5XA 1QNYA 3IM6A 5DSSB 5DUUA 4EFQA 2P34A 3MALA 4GOVA 1N1SA 1XQNA 4XHXA 2DS0A 4DRVA 3AP7A 2JJ6A 4I4UA 1UL9A 5GJ6A 1A8DA 4Z8SB 1S0FA 2A6ZA 1YBIA 1V6IA 4FGFA 1PUMB 2WT0A 3WO4A 4XJWA 1PZ9A 3FLTA 5DVHA 2R49A 3WINA 4UW4A 2D3PA 2A7AA 3BA7A 4Y1ZA 4FQZA 1C1LA 1C4RA 4KEKA 1FNZA 3F62B 3BA4A 3VKFC 1MS3A 3VSFA 5CAZA 4DFSA 1G86A 4YLZA 1JUIA 2DURA 4BLIA 3HN1A 5JVVA 1BFBA 1K5UA 1R8NA 1LHUA 4XMAA 2RHPA 1HWNB 4L4IA 4YG0A 3MW4A 1CJPA 2ZHMA 4JAWA 1AFCA 4XILA 4A7YA 1SBDA 1LODA 1O4ZA 1AX2A 4YW2A 4U36A 5DZUA 3BX1C 1Q1UA 5F9TA 3LSDA 2KI4A 4QKRA 3NBDA 3QLQA 4M3CB 3O0VA 4QALA 2GO2A 5T5LA 4M3CA 5DZGA 5GZCA 1FWUA 4WZFA 2I1BA 2QYIB 4LO3A 3NBNA 2AREA 1JBCA 1JHNA 2A6WA 2F2FC 4LO1A 3WNXA 1R1ZA 1IILA 3O4AA 4ZFUB 3NV1A 3MW2A 3FUQA 1S0JA 4GAIA 4P9WA 5AVAA 1LECA 4JRAA 3AZZA 2UUSA 1N4KA 2C9AA 2ERMA 1WW5A 2FO1A 5H9PA 4TLPA 3OGFA 2P2KA 5IK7A 2DVFA 4LO0A 3PVEA 2ZGQA 2A3XA 5EYXA 2VSEA 3IM5A 3KQRA 1ONAA 4YW5A 4GAFA 3R4UA 1BZWA 1G7YA 4RA0A 5T50A 4LBNA 1SCSA 1JY0A 3RTJB 2BQPA 5IK8A 4I96A 4ISQA 3Q7WA 2ZGMA 1FYUA 3CAHA 2FHRA 1DZQA 3O4CA 2AH2A 4PCRA 1EVTA 2UURA 1ISZA 3A0KA 5JOWA 2AAIB 3QYDA 1HKDA 1AX0A 3AJZA 3AYDA 1GZWB 3AK0A 4G1RA 3T8SA 1SLLA 4ZKTB 1GZWA 5HCAA 1HDKA 4LBMA 3ZSLA 3ZXFA 4I4VA 4P9YA 4YZ3A 3NV2A 1Q8QA 4GALA 3VV1A 1LESA 3ILFA 4I1BA 1S0DA 3AP4A 2NMNA 2A5ZA 2Y9WC 1LCLA 1HWMB 2D43A 3S8JA 3CA0A 2DVBA 2OVUA 2YV8A 5L73A 3BRDA 3GNEA 4A7ZA 2HWAA 1G9BA 4ENDA 5GALA 4ITCA 3R4SA 1AXYA 4JCKA 4Y20A 3BIWE 1LGBA 4OWJA 4XJUA 1AVBA 4M01A 4XXPA 4LBLA 1PZ8A 4LO2A 3SNMA 3V65A 3RG0A 1F9KA 3PVOA 5GZDA 3H0OA 4M3CF 3IM0A 5CB7A 3A21A 3M3OA 4J23B 3JUUA 1DYPA 5F90A 1FGAA 3QR5A 5KXCA 3SLIA 1NZKA 1K5VA 1QKQA 1DQ2A 3FJCA 3CNAA 3WDUA 2Y9GA 4EFRA 3UK9A 1GYKA 4WVWA 5BYNA 4PBOA 3R05A 3OJBA 5DUVA 2Y9XE 5FRAA 3BRGC 1W3GA 2PHWA 4BOWA 1KJLA 2MIBA 4OWLA 3ENRA 2AXMA 4QD2B 2TEPA 3N7LA 2D1ZA 2ZGTA 1BASA 5BXRA 3FJHA 9ILBA 5HCBA 1WBCA 1BARA 3I2AA 4D8HA 4CZSA 3EF2A 2DUPA 3ZYPA 1BYHA 4XJZA 4FOWA 3JUTA 2GMEA 1SBFA 1DQ4A 2VUAA 1JOJA 1FATA 2WLQA 4J2KA 3IKWA 2D20A 5GZGA 2W52A 2WQZC 3SH5A 1V6NA 2EXJA 4IYBA 4Q1RA 2NN8A 1CPNA 1DYKA 3VWCA 1AF9A 3WO3A 1SR4A 2JE7A 3AP5A 4K1ZA 3IPVB 1ZM1A 2HYKA 4I4YA 3N35A 2VH9A 4Q91A 1LHOA 3IPVA 2ZGRA 3P53A 1UZZA 1TFMB 3SISA 4QO3A 1WW7A 1AXKA 1FNYA 4YGBA 1HWPB 1S0EA 4LBQD 4C1XA 4EKXB 4AVVA 2YMZA 2E7QA 3O44A 1DQ1A 4W65A 1B09A 1LOFC 4QBCA 3ZXLA 1HCEA 1GGPB 1S0CA 5T5OA 1DBNA 4DRRA 3AXEA 4P0LA 1V6MA 2UWAA 3HBWA 5JDBA 3AYAA 2OUJA 4YGDA 4K1YA 4ZFYB 2SBAA 5DZEA 2HWMA 1C1FA 1OFSA 1RMLA 1W6PB 3I29B 4Q2FA 4XJ9A 3VT2A 1NLSA 2ZGUA 2D7IA 2V73A 1ISWA 1IOBA 2CWSA 3NV3A 1W6PA 2DRZA 2P3IA 4R9AA 1HQWA 2CTVA 4FPFA 1URXA 1WLDA 1BFCA 1ISXA 3CU1B 1A78A 3AJYA 3GALA 4YM3A 1FMZA 3T1LA 4XHBA 5DG2A 2GN3A 1VAVA 3D6EA 1ISYA 4J2XA 1H9WA 2I2SA 1DZDA 5T5JA 4IY8A 4CRQA 5DUWA 2R16A 3O12A 2NTDA 3APBA 4DEPA 3OPZA 1BLAA 3CA5A 2VXRA 3O4DA 3AH2A 2VXTI 4EFPA 4HJJA 4HR6C 1SZ6B 1KDKA 2D6LX 2ZGSA 1ENQA 4YZ4A 4CJMA 4X3AA 3FJKA 4WVVA 1YTOA 4HANA 3JRRA 1S0LA 4Q1PA 4ZGRB 3PHZA 5DUYA 5GAQA 4J2SA 1SLIA 2Q9XA 5BP5A 4FPHA 3ZYRA 4FOQA 3AH4A 4AWDA 1GV9A 1IKPA 3NWKA 2YROA 4OEFA 3CA1A 2FDBM 4XIOA 1LOBA 1S0GA 3BAQA 1RG8A 1H30A 3UJ4A 1FAYA 4ASMB 3V0AA 3D7WB 4L4HA 4DS0A 3VT1A 3B9CA 5BQUA 1JTCA 3WOGA 1XHBA 4XE9A 2UWBA 3I2XA 2OW4A 1IJTA 1TEIA 2X2SA 3AP6A 3A23A 1GSLA 1LU2A 1ULEA 4MYEA 5SV8A 4XBLA 3WDXA 1CPMA 3FGMA 4YFZA 3Q7XA 3RS6A 3ZC9A 1PZ7A 1N1TA 4P9XA 1II4A 3AFKA 2UWCA 2DVGA 4FPGA 2ZR1B 5GLWA 1VCLA 3C2UA 1WLCA 1G8WA 3CA4A 1W6MB 1YO8A 3AZXA 1D2SA 3ZSKA 1LEMA 1W6MA 4FOVA 2MLLB 2ZGLA 3POKA 3O3QA 4I0YA 3B9UA 3SITA 2NMOA 1F31A 1W3FA 3M3QA 3U4XA 2XOAA 1XYFA 1GNHA 3N3HA 4R6UB 4G6MA 2KKIA 5EHAA 3I8TA 2XB6C 2ENRA 4FP3A 3WCSA 1S1AA 1Z4SA 1RITA 1MS5A 1TP0A 1JT5A 3H6RB 1AVAC 2IHOA 1MZ6A 1Q04A 1LOCA 3PUBA 4FOYA 2ZACA 3H6RA 4J2YA 3AJ5A 2R9KB 4NOTA 4Q26A 2KI6B 4Q9PA 2KM2A 2CWMA 2DREA 5T52A 4XZPA 1TTUA 1QXMA 1SLTA 3UD7A 3C9ZA 3FJJA 4G6JA 5D61A 3WA1A 3P6JA 3FLRA 5CNAA 2R0FA 4BQ1A 2D6PA 5FNXA 2EF6A 4FPEA 3OJVA 2W08A 1TIEA 4CTEA 2F2FA 3UL2A 1ZA4A 2IWTB 4OWKA 2GALA 1LHWA 3UD9A 4Q27A 1JN2P 5HCFA 4YW1A 1ONKB 5B2HA 2A3YA 1AJKA 4G9NA 3WG4A 1I1EA 1N1VA 3BA5A 4BPZA 1MC9A 3WV6A 4BMBA 3W9TA 2LTNA 3ASIA 2P3JA 4YFWA 1U0AA 1QMJA 4Y1XA 4R9BA 1QNWA 2ZGKA 1HIBA 5IUQA 3HOMA 4EB2B 3IMNA 4XOGA 3WLUA 4KEIA 3WDYA 3UDAA 1ENRA 2D44A 1V6VA 2D6MA 3ZX7A 2FFVA 4U2AA 3ZXEA 2RG9B 4P14A 3OJ2A 2D7FA 4OEGA 4X38A 3WVJA 5EWSA 1V00A 4OUJA 5LK5A 1DFQA 4ZOTA 3PVNA 4Y22A 4XTPA 3WDWA 4GP3A 2LIQA 4YZ5A 4D0ZA 2ZGOA 1W3AA 1DQ5A 3BAUA 3ZVXA 4G9MA 3NBEA 2DTWA 4BM8A 4JP0A 4IHZA 4XKIA 5DXDA 3MPPG 4ZXKA 3MW3A 2ZHLA 2D22A 3LTQA 3IN9A 2F8XC 1Z2VA 4H9WA 2GNDA 5BXTA 3FBYA 4IY9A 3NJ5A 3AKHA 1JXNA 3WUCA 2XG3A 2FGFA 5F8YA 1Q8SA 1V6WA 3TAYA 4OW4A 2AUYA 2ET2A 4Y20B 1P63A 4XFUA 3BAHA 1SLAA 1JYIA 2FMDA 5CBLA 2X2TA 4FPLA 2ZBJA 1LU1A 3VKLA 4YGEA 5E8AA 3N0KA 3ATGA 2WRYA 3WUDA 1FQ9A 3AZWA 2AFGA 4KBBA 1LENA 3DUIA 2A70A 3SNVA 3AKFA 4YM1A 4UW5A 2Y9FA 1YI7A 2GDFA 5H9QA 2NYYA 5F5QA 4GWNA 3FJAA 1UZYA 1Z0HA 2DU0A 2PHFA 2ZAAA 1NUNA 4JKQA 2NM1A 1JQZA 1QDOA 3OBTA 2ZABA 4FP2A 3N7JA 3O5SA 4LO7C 2B7YA 1W6QB 3WO2A 4LBKA 1KDMA 4YW4A 4GP0A 1WUVA 2ZGPA 3Q9OA 1H9PA 2R1BA 4DENA 2EAKA 3WDVA 1W6QA 1AJOA 5GLTA 4Y1UA 1W0PA 1CVSA 2D3RA 2D6NA 1VAMA 3O5WB 1UAIA 1W6NB 3UD8A 2AENA 5EYYA 1VALA 3VKNA 1W6NA 1WW6A 4FQ4A 5GM0A 3QCWA 2AR6A 3OYWB 3T1MA 1E0OA 1FMMS 2P39A 1OQLB 5H9SA 4QC4A 3O0WA 1W6OB 1F5FA 3OYWA 4LBJA 1FWVA 4FPOB 5DZFA 1IS4A 2K8RA 3ILAA 4AN7B 1W6OA 3FJEA 1IRPA 1TWEA 1XZZA 1LOFA 3H6QA 3DGTA 4RL7A 3CA3A 3HMYA 3E8LC 1BFFA 4L8QA 1Q8VA 1HQLA 1SBEA 4Q8LA 1WBAA 2ZQOA 4K21A 1KITA 3UJ0A 1BXHA 4H04A 3USUA 1KNMA 2NVHA 2ARXA 5D63A 3A22A 4NO4A 4P0JA 3RQ0A 3ILNA 1DFCA 5BVPI 4GOYA 5E89A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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