1DMXA

Murine mitochondrial carbonic anyhdrase v at 2.45 angstroms resolution
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
GTRQSPINIQWKDSVYDPQLAPLRVSYDAASCRYLWNTGYFFQVEFDDSCEDSGISGGPLGNHYRLKQFHFHWGATDEWGSEHAVDGHTYPAELHLVHWNSTKYENYKKASVGENGLAVIGVFLKLGAHHQALQKLVDVLPEVRHKDTQVAMGPFDPSCLMPACRDYWTYPGSLTTPPLAESVTWIVQKTPVEVSPSQLSMFRTLLFSGRGEEEDVMVNNYRPLQPLRDRKLRSSFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords MURINE CARBONIC ANHYDRASE V
publication title Structure determination of murine mitochondrial carbonic anhydrase V at 2.45-A resolution: implications for catalytic proton transfer and inhibitor design.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 68
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-10-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1dmxA00
5SZ6A 12CAA 3B1BA 2OSMA 4JSWA 4QK2A 6CA2A 5FNJA 5SZ2A 1F2WA 4E3FA 2POWA 3S74B 4M2VA 2EU3A 2NN7A 2H15A 3MNHA 1CNJA 5L6KA 2FNMA 3EFTA 4KAPA 2NN1A 4KP5A 2FW4A 4YGLA 3RG3A 3DA2A 1RJ5A 4QJ0A 5DSKA 4Z1JA 1CIMA 3M5SA 5E2NA 2CBAA 4YVYA 5EKJA 5BRVA 1G45A 3PJJA 2Q1QA 3KOIA 4Q8ZA 1A42A 3V7XA 1H4NA 1CVEA 1ZSBA 1UGDA 3B4FA 4FU5A 4ITOA 3RYVB 2FOQA 4CNWA 4R5BA 5G01A 4BF6A 1BNMA 1UGGA 4Q7SA 1CVCA 3CZVA 1TH9A 3NJ9A 1URTA 5FLQA 3SAXA 1G54A 1KOPA 4FVNA 2CBEA 1V9IC 3DVCA 2FOSA 1ZGEA 1LG5A 1RJ6A 3SBIA 3RJ7A 3MMFA 1BN1A 5AMGA 1LGDA 1HUHA 5EKHA 3SAPA 4X5SA 2WEOA 1G6VA 4M2UA 3R17B 5FDIA 5EHWA 4BF1A 3LXEA 4MDMA 4Q09A 3OY0A 4RUXA 4MLTA 1CAJA 2WD3A 4YHAA 3T84A 3P44A 3T83A 3V2MA 4ITPA 1RAYA 4YYTA 5DOGA 2QP6A 1FSRA 1Z93A 5EHEA 3S8XA 3RZ5A 1G48A 2CA2A 3M2YA 2FMGA 2NNGA 1V9EA 1CNBA 1CVFA 4YGJA 4YGFA 5FNMA 4CNXA 3KWAA 3T82A 1DCBA 3M96A 3S78B 7CA2A 1RZAA 2FOUA 3IBIA 4RIVA 3GZ0A 2NWZA 2CBCA 2HFWA 5SZ4A 3V3GB 4ZWXA 3HKTA 5DSLA 3S9TA 2Q38A 3KLDB 4PXXA 3P5LA 4HT2A 3UYQA 5G0BA 1BN3A 5EHVA 1KEQA 5FLPA 5BNLA 3TVOX 1Z9YA 3K2FA 3P3JA 3BL0A 4Q07A 5EKMA 2POVA 5DOHA 3QYKA 5FLSA 1ZFKA 3IBUA 4QJWA 1BICA 1UGFA 4Y0JA 3S77B 3V5GA 4XFWA 3RG4A 3U45X 4C3TA 1TG9A 1RZDA 5DSIA 3RYJB 5JEGB 4JSZA 4E3HA 2VVAX 2QOAA 4K1QA 5JQTA 3R16A 1FLJA 3DCCA 3K34A 1TE3X 3BL1A 4FL7A 3F7BA 4K0TA 1I9QA 3M2NA 3RZ0B 3M40A 1G3ZA 3N3JA 1ZSCA 1JV0A 3ZNCA 3MHLA 4CNRA 5BRUA 3IAIA 4QTLA 5DRSA 4QK1A 1G4JA 4YXUA 3T5ZA 3M1WA 1CCTA 4QJMA 1YDBA 1CILA 1CALA 4YGNA 4Q9YA 1FR4A 4RH2A 5JDVB 4HEWA 2NXRA 3P4VA 4FIKA 4XZ5A 3S73B 4Q87A 1G1DA 1CNIA 3DCWA 1CAOA 4DZ7A 3V3FA 1JD0A 2NWPA 3U3AX 2NNOA 4RN4A 3N0NA 4R59A 4E3GA 1I91A 4Q06A 4G0CA 2HKKA 3KOKA 1FSNA 1FQRA 1UGEA 3ML5A 1CNYA 5SZ0A 4ZX0A 4COQA 2NWOA 1RZEA 2EZ7A 3M1KA 5FLTA 4KUWA 2X7SA 3HKUA 1YDAA 5FNIA 5JEPB 1AVNA 1BNWA 4RIUA 3V3IB 1CVDA 4WUPA 3M98A 4DZ9A 3U7CA 4Z1EA 3T85A 1IF9A 1FQMA 3V3HB 4ZWYA 1XPZA 1CRAA 1HUGA 1ZH9A 4QSAA 5FDCA 1CNGA 4Z0QA 4PQ7A 3V3JA 4KNJA 4KUYA 4MDLA 4YGKA 1G46A 3MNAA 5FNLA 5E2RA 3IBLA 2AW1A 4QJPA 1H9NA 4WW6A 1CVAA 4XIXA 2FNNA 5JG3B 1BZMA 4JS6A 1BV3A 1CAMA 4G7AA 4FVOA 1Y7WA 3TVNX 9CA2A 3MNIA 5DSJA 3S76A 1TTMA 3DV7A 3KIGA 4Q08A 4Q7PA 1BNVA 1FR7A 1AM6A 4IDRX 1UGBA 4RFDA 1IF4A 1XEGA 3MHMA 3JXFA 3F8EA 4RUYA 4MLXA 1G0FA 1UGAA 5SZ7A 1CAHA 1XQ0A 4YWPA 4XE1A 1JCZA 5JG5B 2H4NA 4LU3A 4N0XB 1TEQX 2GD8A 4PZHA 1LUGA 5FLRA 3Q31A 1BNQA 3D0NA 2WD2A 1ZSAA 1CNCA 1HECA 2OSFA 4QJOA 3DVDA 3K7KA 1KWQA 4K0ZA 4TWMA 3M2ZA 5E5RA 4HEZA 2ILIA 1YO1A 5FNHA 2FNKA 1HVAA 5CLUA 4E49A 2POUA 3W6HA 1YDCA 3VBDA 4Q6EA 4Q8XA 4Z1KA 1ZNCA 3T5UA 4QJXA 3SBHA 5DVXA 5JESB 5DSOA 3M14A 3MHIA 4JSSA 3KNEA 5SZ1A 4ZWZA 3RGEA 2WEJA 3OIKA 3MNUA 5JQ0A 1TG3A 1ZGFA 4QSBA 4WL4A 4Q90A 1TBTX 1BN4A 5JGTB 5FLOA 4QSJA 3D9ZA 3MHOA 5LMDA 3IGPA 4ETQC 3KS3A 4QK3A 5FL5A 1UGCA 4GL1X 4TWLA 4HEYA 4K13A 1IF7A 1CAYA 4WW8A 3ZP9A 3DAZA 4LHIA 2ABEA 4FRCA 3CYUA 1IF8A 2WEHA 1OKNA 4MO8A 5CA2A 4QSIA 1CZMA 4L5UA 5SZ3A 1YO2A 2Q1BA 3RYYA 1Z97A 3S71B 1DMYA 1CRMA 1BNNA 4Q83A 4Q99A 3MNKA 1CCUA 1I9PA 3S75B 3M04A 3S97A 4UOVA 3DCSA 4CACA 1LG6A 1CNWA 2IT4A 2X7TA 4R5AA 4WUQA 4FPTA 1LZVA 4Q7WA 4E4AA 1HEAA 1I9MA 3TMJA 1CNXA 1ZFQA 3OIMA 5EZTX 5L3OA 1FQLA 4KNNA 4HBAA 4ZAOA 3M1QA 3ML2A 1AZMA 1H9QA 5G03A 1XEVA 3MHCA 4HT0A 5EOIA 3IBNA 2FMZA 1BNTA 3N2PA 5FL6A 3C7PA 3L14A 2CBBA 5DSNA 4CNVA 4Q8YA 2W2JA 1CVHA 3NI5A 3UYNA 4M2WA 4KNMA 3M2XA 2AX2A 5BRWA 1CNKA 3P3HA 1HEDA 2X7UA 5AMDA 3MWOA 5JEHB 2HOCA 5CACA 5E2KA 2HD6A 4L5WA 2F14A 3N4BA 4KP8A 3MYQA 1RAZA 3D93A 5E5UA 4IWZA 3W6IA 4BCWA 5C8IA 5E2MA 3M5TA 2HL4A 3OYQA 1CAKA 2ZNCA 1BCDA 4HU1A 4K0SA 3EFIA 5J8ZA 3RZ7A 1CINA 1FSQA 1I90A 4KUVA 5SZ5A 1I8ZA 1YO0A 1I9LA 5A6HA 4KNIA 4YXOA 4QIYA 1RZBA 3DBUA 1OKLA 2NMXA 4E5QA 3HLJA 4Q6DA 1G53A 2FOYA 1G0EA 2NXTA 1YDDA 2HNCA 1KOQA 3P58A 1J9WA 8CA2A 1KWRA 4XIWA 4QEFA 3OKUA 2CBDA 3KKXA 3CA2A 1ZE8A 5A25A 4LP6A 4YXIA 1DMXA 4QY3A 4YX4A 1I9NA 1BNUA 5EH7A 1G52A 3M67A 3OILA 5FL4A 4KV0A 5EH8A 5FNGA 1T9NA 2EU2A 1FQNA 4CQ0A 4Q49A 3RYZA 5FNKA 1G4OA 4MTYA 5EH5A 2NNVA 3CAJA 1TEUX 4WR7A 3RZ8A 3M3XA 4L5VA 3BETA 3MNJA 1CA2A 5BYIA 4E3DA 3D8WA 4Z1NA 3RZ1B 5DSPA 1OKMA 4M2RA 4PYXA 3FW3A 3IEOA 4Q0LA 1CNHA 1TB0X 4N16A 1HEBA 3S72B 3DVBA 3DD8A 5E2SA 1OQ5A 3D92A 4QIZA 5JGSB 3MZCA 1HCAA 5DSRA 4PYYA 5AMLA 1MOOA 3HKQA 3M5EA 5EIJA 4RFCA 1IF5A 5DSMA 2NXSA 3KONA 3DD0A 3PYKA 2O4ZA 3FFPX 3HKNA 3HFPA 4ZWIA 3F7UA 4RUZA 3PO6A 4E9OX 1DCAA 4CA2A 1CVBA 4JSAA 3DC9A 3NB5A 4ZX1A 1CANA 2QO8A 1CAIA 2VVBX 5IPZA 3P55A 5E28A 3RYXB 4Q7VA 1EOUA 2NNSA 4HF3A 5G0CA 3P5AA 2GEHA 3MDZA 4ILXA 1CCSA 3HS4A 1CAZA 3DC3A 3F4XA 4MDGA 4Q81A 3FE4A 3OKVA 2CABA 1CA3A 3U47A 1MUAA 3M1JA 2FOVA 1HCBA 5CJFA 3OYSA 2WEGA 3RLDA 5HPJA 2NWYA 4Q78A 1THKA 3V2JA 3JXGA 1RZCA 5DSQA 1I9OA 1IF6A 3JXHC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5SZ6 A;  12CA A;  3B1B A;  2OSM A;  4JSW A;  4QK2 A;  6CA2 A;  5FNJ A;  5SZ2 A;  1F2W A;  4E3F A;  2POW A;  3S74 B;  4M2V A;  2EU3 A;  2NN7 A;  2H15 A;  3MNH A;  1CNJ A;  5L6K A;  2FNM A;  3EFT A;  4KAP A;  2NN1 A;  4KP5 A;  2FW4 A;  4YGL A;  3RG3 A;  3DA2 A;  1RJ5 A;  4QJ0 A;  5DSK A;  4Z1J A;  1CIM A;  3M5S A;  5E2N A;  2CBA A;  4YVY A;  5EKJ A;  5BRV A;  1G45 A;  3PJJ A;  2Q1Q A;  3KOI A;  4Q8Z A;  1A42 A;  3V7X A;  1H4N A;  1CVE A;  1ZSB A;  1UGD A;  3B4F A;  4FU5 A;  4ITO A;  3RYV B;  2FOQ A;  4CNW A;  4R5B A;  5G01 A;  4BF6 A;  1BNM A;  1UGG A;  4Q7S A;  1CVC A;  3CZV A;  1TH9 A;  3NJ9 A;  1URT A;  5FLQ A;  3SAX A;  1G54 A;  1KOP A;  4FVN A;  2CBE A;  1V9I C;  3DVC A;  2FOS A;  1ZGE A;  1LG5 A;  1RJ6 A;  3SBI A;  3RJ7 A;  3MMF A;  1BN1 A;  5AMG A;  1LGD A;  1HUH A;  5EKH A;  3SAP A;  4X5S A;  2WEO A;  1G6V A;  4M2U A;  3R17 B;  5FDI A;  5EHW A;  4BF1 A;  3LXE A;  4MDM A;  4Q09 A;  3OY0 A;  4RUX A;  4MLT A;  1CAJ A;  2WD3 A;  4YHA A;  3T84 A;  3P44 A;  3T83 A;  3V2M A;  4ITP A;  1RAY A; 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