1DMYA

Complex between murine mitochondrial carbonic anyhdrase v and the transition state analogue acetazolamide
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
Knots found
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
GTRQSPINIQWKDSVYDPQLAPLRVSYDAASCRYLWNTGYFFQVEFDDSCEDSGISGGPLGNHYRLKQFHFHWGATDEWGSEHAVDGHTYPAELHLVHWNSTKYENYKKASVGENGLAVIGVFLKLGAHHQALQKLVDVLPEVRHKDTQVAMGPFDPSCLMPACRDYWTYPGSLTTPPLAESVTWIVQKTPVEVSPSQLSMFRTLLFSGRGEEEDVMVNNYRPLQPLRDRKLRSSFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords MURINE CARBONIC ANHYDRASE V
publication title Structure determination of murine mitochondrial carbonic anhydrase V at 2.45-A resolution: implications for catalytic proton transfer and inhibitor design.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 67
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-10-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1dmyA00
3U3AX 1HUHA 2Q38A 2POVA 4YGNA 1LG5A 4Q6DA 3P58A 1CAZA 1UGEA 3IBUA 4KUVA 2FNNA 4R5BA 2EU2A 2NWYA 1THKA 3SAPA 2WEGA 1AM6A 3M67A 1I9NA 5E5UA 4JSWA 4CA2A 1CAKA 1CNGA 1YDDA 2X7SA 5FNMA 4E49A 1KWQA 2NNVA 3MWOA 3M96A 1DCBA 4N16A 1OKNA 3M14A 1BV3A 4CNVA 1DMXA 4HBAA 2CBAA 3ML2A 4R59A 1CNXA 1H9QA 4YGJA 4ZWXA 2Q1BA 4M2VA 5FDIA 5JEGB 3MHOA 6CA2A 5FLQA 4YXIA 1IF7A 2EU3A 3R16A 1BN4A 1RJ6A 4QSJA 1CA3A 1G4OA 4YWPA 3M40A 3DAZA 1JCZA 5FNKA 2H15A 1J9WA 5JGSB 4KUWA 3BL0A 1I9MA 3B1BA 3EFIA 1CNJA 3M2ZA 2HKKA 1ZSCA 1UGGA 5BRUA 1AZMA 3MYQA 3S73B 2HL4A 4Q8YA 1HEAA 1ZSAA 2VVAX 5FNGA 1IF9A 5JG3B 2FOQA 1G46A 1LZVA 3OKUA 1UGFA 3V2JA 1KEQA 3V3IB 1Z93A 3S76A 2HFWA 4RIUA 3RYYA 1G6VA 1A42A 4FRCA 5E28A 2ZNCA 4LP6A 1I90A 3RG3A 4Q09A 3RYJB 1I8ZA 1LG6A 5BRVA 2NNGA 3W6IA 3MHIA 3R17B 4KNJA 3HFPA 2OSMA 1TEQX 4ZWYA 1DCAA 4Q08A 4K0TA 3DVDA 4QJOA 4KNNA 3ZNCA 1TH9A 1EOUA 2W2JA 4WW6A 5EHEA 2OSFA 1I91A 3HKQA 3OKVA 3RYXB 4HT0A 1MUAA 1YO0A 2CBBA 3CYUA 4E3GA 1F2WA 1CVBA 3F7UA 1BN3A 3DVBA 5FDCA 3T5UA 1RAYA 2FOYA 3GZ0A 4YYTA 3CA2A 4L5WA 5DSIA 3T84A 4HEZA 4QSBA 4HT2A 1TEUX 3FFPX 4MLTA 4DZ7A 3IBLA 3V3FA 5G0CA 4KAPA 1RZAA 1RZEA 3P3HA 5BYIA 3EFTA 3CAJA 1HCAA 4ITOA 5E2SA 3S9TA 2NWZA 1CINA 4X5SA 4YGLA 1FQMA 4Q49A 3RYVB 5E2RA 1V9EA 5JG5B 2QP6A 4RUYA 4ZX0A 2FNKA 5SZ7A 4DZ9A 3S75B 3S78B 2VVBX 5SZ6A 3HS4A 5DSOA 5FNJA 5G03A 3PJJA 4Q90A 3P5LA 2WD3A 2Q1QA 1CRAA 1CALA 3M1JA 5EKMA 3KIGA 1CNYA 4Z1KA 1BNTA 4E9OX 1ZNCA 3P44A 3MNKA 3MDZA 2X7TA 5G01A 1KOQA 5FL4A 1G53A 4Z1NA 5DOGA 4HF3A 2AX2A 2POUA 4UOVA 1BN1A 1I9PA 3NB5A 4FU5A 3RG4A 4MO8A 3OYSA 1ZGFA 1CNKA 4ITPA 3KKXA 4YGFA 4ZAOA 4Z0QA 5L3OA 4Q81A 3MZCA 2F14A 1CVDA 3RLDA 3V7XA 5DRSA 3DC3A 1T9NA 3M2XA 1XQ0A 4G7AA 1CVHA 3OY0A 2H4NA 4KUYA 4E3HA 2FW4A 4QK2A 5FLSA 1G48A 3TMJA 3U45X 4Q8XA 3KOKA 3IAIA 3S71B 1URTA 5EZTX 3DCWA 5DSJA 5IPZA 4MDGA 3DA2A 3M2NA 5E2MA 3RZ1B 4Q7VA 3IGPA 1KOPA 3RZ0B 3S8XA 1FQRA 3F4XA 2FMGA 5DSRA 3HKTA 4FIKA 4RUXA 3M1QA 4RH2A 9CA2A 1BNVA 4RUZA 5FLPA 3CZVA 3U47A 4E3FA 3T83A 1BNNA 4IDRX 2GD8A 4ETQC 1CCUA 3P55A 5EOIA 3MNIA 4COQA 1TTMA 3S77B 3JXHC 2QO8A 1CAIA 1HECA 4ILXA 5FLTA 1CA2A 1RZBA 3DCSA 4HEYA 4CNXA 4Q83A 1RZDA 5EKHA 3RZ7A 8CA2A 1G1DA 3RZ8A 1BNMA 1XEVA 2NXSA 2POWA 3K7KA 4JS6A 4RIVA 4XE1A 5DOHA 1CCSA 1IF5A 4QJXA 1KWRA 3IBNA 5BNLA 3UYQA 2WEJA 3V3GB 4KP5A 4K0ZA 3M5EA 5AMGA 5FL6A 2CBEA 2X7UA 3P3JA 5JGTB 3MNHA 3F8EA 5CA2A 5CLUA 5FLRA 5HPJA 3MNAA 4QTLA 4RFDA 3KOIA 2O4ZA 2NWOA 4Z1EA 5SZ1A 1CNBA 2HD6A 1I9LA 2FNMA 4Q99A 1BNQA 1RAZA 3BL1A 4C3TA 4FVOA 5L6KA 1YDBA 2ILIA 4WR7A 3TVNX 1BNWA 4K0SA 1FR4A 1XPZA 2EZ7A 4QK1A 1CNIA 5SZ3A 2NMXA 3P5AA 1FQNA 5SZ2A 1G45A 1YO2A 1Z97A 3OIKA 3M5TA 2NXTA 4BCWA 1G0EA 5DSPA 1AVNA 1CANA 1CNHA 3DC9A 3T5ZA 5SZ5A 1YDAA 5LMDA 3MHCA 4MLXA 3F7BA 1OQ5A 5FLOA 3K2FA 4CNRA 3DBUA 1G54A 1G52A 5EH8A 1CCTA 1BCDA 1CAHA 3D0NA 2ABEA 1I9OA 2WEOA 3S74B 4KP8A 4QK3A 1TG3A 4Q07A 4CQ0A 4QY3A 5EKJA 1CVEA 1CAOA 1UGCA 3SBIA 1H9NA 3SBHA 4BF6A 4L5UA 3KONA 4WL4A 4Q9YA 4IWZA 1HEDA 3N3JA 3TVOX 1Y7WA 4Q06A 7CA2A 4KV0A 2CA2A 4R5AA 4TWMA 1JV0A 3V3JA 3KWAA 4QSAA 5JEHB 1CNCA 1CAYA 1RJ5A 5DVXA 3V3HB 1RZCA 3D93A 5E5RA 3P4VA 3M2YA 3KLDB 4E4AA 1YO1A 3OILA 3MHLA 1TE3X 3KS3A 4M2WA 1FSNA 3T82A 1CIMA 1ZFKA 5FNLA 3JXGA 3V2MA 3IBIA 4XIXA 4CACA 4G0CA 4ZX1A 4WUPA 3RZ5A 4KNMA 4QJ0A 3NI5A 4MDMA 1TB0X 3HKUA 2WEHA 1IF6A 3DD0A 2HNCA 3U7CA 1I9QA 5A25A 4Z1JA 3FE4A 4L5VA 4N0XB 4FPTA 4Q78A 4QJMA 1CAJA 5CACA 1CVAA 4PXXA 1ZSBA 3Q31A 3D9ZA 4JSZA 3M1WA 5FNHA 4RN4A 4Q6EA 4JSAA 3ZP9A 3MNUA 3K34A 4WW8A 4Q0LA 3B4FA 5JQ0A 3FW3A 4K1QA 3M1KA 4YX4A 2HOCA 5E2KA 5EH5A 1FR7A 4QIYA 2GEHA 1FQLA 4FVNA 1ZE8A 5JDVB 1UGBA 1HUGA 2FOSA 3DCCA 3RYZA 4PQ7A 4M2RA 1LUGA 3C7PA 3DV7A 1CVCA 3M5SA 3NJ9A 4FL7A 1G0FA 5DSQA 5A6HA 1H4NA 4QEFA 1IF4A 3MNJA 3N0NA 4HEWA 4LHIA 5EIJA 3T85A 12CAA 5DSKA 5EHVA 3VBDA 1G4JA 3HLJA 4GL1X 5JQTA 4QSIA 3M98A 1BICA 4CNWA 1CAMA 5AMLA 4MDLA 1OKLA 4JSSA 1FSRA 1HVAA 1ZH9A 3OYQA 5SZ4A 3L14A 5EH7A 1BZMA 3V5GA 1HCBA 1CZMA 1DMYA 2NNOA 1FLJA 3KNEA 4ZWIA 3SAXA 1CVFA 4M2UA 5C8IA 2NN7A 2FMZA 2WD2A 3M04A 2NN1A 1UGDA 2NXRA 3QYKA 4MTYA 5EHWA 3IEOA 3OIMA 2CBDA 3HKNA 4PZHA 1TBTX 5E2NA 5G0BA 1IF8A 4ZWZA 5J8ZA 3UYNA 4YXOA 2FOUA 4RFCA 1UGAA 4YHAA 3W6HA 5JESB 4YVYA 1OKMA 3BETA 3MHMA 1G3ZA 1YDCA 2NWPA 4YGKA 1XEGA 4XZ5A 1TG9A 5SZ0A 3RJ7A 4LU3A 3S97A 4Q87A 1CILA 1HEBA 3D92A 3DD8A 3JXFA 4QIZA 5JEPB 4PYXA 3M3XA 3ML5A 3N4BA 4TWLA 4XIWA 5DSMA 1CNWA 3DVCA 5CJFA 2CBCA 5DSNA 2IT4A 1CRMA 1Z9YA 3D8WA 4Q7WA 4K13A 4E3DA 4E5QA 3LXEA 4Q8ZA 2QOAA 3N2PA 4PYYA 3RGEA 4Y0JA 4YXUA 3S72B 1ZFQA 4HU1A 4Q7SA 4QJPA 5FNIA 2CABA 3MMFA 1MOOA 5FL5A 4BF1A 2AW1A 1JD0A 2NNSA 5DSLA 4Q7PA 4XFWA 1FSQA 3PO6A 3PYKA 1BNUA 5BRWA 4QJWA 4KNIA 5AMDA 1LGDA 1V9IC 2FOVA 1ZGEA 4WUQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3U3A X;  1HUH A;  2Q38 A;  2POV A;  4YGN A;  1LG5 A;  4Q6D A;  3P58 A;  1CAZ A;  1UGE A;  3IBU A;  4KUV A;  2FNN A;  4R5B A;  2EU2 A;  2NWY A;  1THK A;  3SAP A;  2WEG A;  1AM6 A;  3M67 A;  1I9N A;  5E5U A;  4JSW A;  4CA2 A;  1CAK A;  1CNG A;  1YDD A;  2X7S A;  5FNM A;  4E49 A;  1KWQ A;  2NNV A;  3MWO A;  3M96 A;  1DCB A;  4N16 A;  1OKN A;  3M14 A;  1BV3 A;  4CNV A;  1DMX A;  4HBA A;  2CBA A;  3ML2 A;  4R59 A;  1CNX A;  1H9Q A;  4YGJ A;  4ZWX A;  2Q1B A;  4M2V A;  5FDI A;  5JEG B;  3MHO A;  6CA2 A;  5FLQ A;  4YXI A;  1IF7 A;  2EU3 A;  3R16 A;  1BN4 A;  1RJ6 A;  4QSJ A;  1CA3 A;  1G4O A;  4YWP A;  3M40 A;  3DAZ A;  1JCZ A;  5FNK A;  2H15 A;  1J9W A;  5JGS B;  4KUW A;  3BL0 A;  1I9M A;  3B1B A;  3EFI A;  1CNJ A;  3M2Z A;  2HKK A;  1ZSC A;  1UGG A;  5BRU A;  1AZM A;  3MYQ A;  3S73 B;  2HL4 A;  4Q8Y A;  1HEA A;  1ZSA A;  2VVA X;  5FNG A;  1IF9 A;  5JG3 B;  2FOQ A;  1G46 A;  1LZV A;  3OKU A;  1UGF A;  3V2J A;  1KEQ A;  3V3I B;  1Z93 A;  3S76 A;  2HFW A;  4RIU A;  3RYY A;  1G6V A;  1A42 A;  4FRC A; 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