1E1EA

Crystal structure of a monocot (maize zmglu1) beta-glucosidase
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
490
structure length
490
Chain Sequence
MLSPSEIPQRDWFPSDFTFGAATSAYQIEGAWNEDGKGESNWDHFCHNHPERILDGSNSDIGANSYHMYKTDVRLLKEMGMDAYRFSISWPRILPKGTKEGGINPDGIKYYRNLINLLLENGIEPYVTIFHWDVPQALEEKYGGFLDKSHKSIVEDYTYFAKVCFDNFGDKVKNWLTFNEPQTFTSFSYGTGVFAPGRCSPGLDCAYPTGNSLVEPYTAGHNILLAHAEAVDLYNKHYKRDDTRIGLAFDVMGRVPYGTSFLDKQAEERSWDINLGWFLEPVVRGDYPFSMRSLARERLPFFKDEQKEKLAGSYNMLGLNYYTSRFSKNIDISPNYSPVLNTDDAYASQEVNGPDGKPIGPPMGNPWIYMYPEGLKDLLMIMKNKYGNPPIYITENGIGDVDTKETPLPMEAALNDYKRLDYIQRHIATLKESIDLGSNVQGYFAWSLLDNFEWFAGFTERYGIVYVDRNNNCTRYMKESAKWLKEFNTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE
publication title Crystal Structure of a Monocotyledon (Maize Zmglu1) Beta-Glucosidase and a Model of its Complex with P-Nitrophenyl Beta-D-Thioglucoside
pubmed doi rcsb
source organism Zea mays
total genus 169
structure length 490
sequence length 490
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2000-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e1eA00
3GXDA 1CEOA 4FLQA 3FHAA 4NRRA 2JEQA 4P7RA 5GQBA 2WMKA 4J3TA 2DIJA 2D3LA 4UQEA 3RM9A 5A6MA 1LQ0A 1MW3A 4FLOA 2V5DA 1CECA 1CWYA 1FH8A 2CERA 4OOZA 4B9YA 3VD9A 4IUGA 1EDTA 1XH2A 2WVVA 2NSXA 1JZ2A 3AXHA 1VIWA 4AWEA 6CGTA 2VRQA 2X09A 2ZXBA 4PBGA 4AYSA 4HOWA 2J74A 2B31A 2FGLA 1JYXA 1ODUA 2BY0A 2IUZA 4Z2IA 2AAAA 1JZ3A 1UKTA 3GBDA 3SCVA 2FGZA 3AMKA 3VD5A 3VU2A 1BVNP 4M81A 3UESA 2GJXA 1Q6FA 1H4PA 1BLIA 2OSXA 4PMUA 1RP9A 2XPKA 2E4TA 4TVDA 3SCNA 4HZ6A 1QVBA 1FHDA 2G4FA 4ATWA 3THDA 4C7DA 1AQ0A 3E1F1 3N15A 2CBUA 4MPKA 1H49A 3DYMA 4DWSD 2DEPA 3ZO9A 5CGMA 5CSYA 3VIIA 4UFHA 1GQKA 3ALGA 5D9OA 4Z2KA 3ARYA 3QGVA 1PIGA 1UZ1A 5CPSA 3WH7A 1UOKA 1B31A 4AC1X 1WDRA 2FHBA 3PZIA 4YN5A 1GOWA 4D1JA 3MU7A 4KWUA 5DMYA 3AS2A 2A3AA 2XVGA 4CD6A 1QW9A 1JNEA 1FFQA 2WBKA 1NH6A 4CCEA 1GOKA 1GOQA 4KRTA 4P7LA 3CHDA 1SMAA 1Q6EA 4YPJA 4CVUA 2VCAA 3UG3A 3VD7A 3NDZA 1HKJA 2CBIA 1W91A 1E0XA 1B0IA 4AMCA 1QW8A 1R7OA 1VFOA 3UR7A 3AQUA 4PMRA 4M1RA 1QPKA 1CLVA 3PTKA 4CD5A 4JIEA 4QLLA 1W3KA 5A6LA 1W9BM 1ZJAA 5HPCA 3WQ5A 4WKFA 1W32A 2BY3A 4JFWA 8CGTA 5BYWA 4IISA 2DGAA 3AICA 3HN3A 3CO4A 2D22A 4UQAA 4OOUA 4BZYA 2DPEA 4X9YA 1FP8A 2WMGA 2E0PA 1M03A 4ZFMA 1B3ZA 1OGBA 1NOWA 2VZVA 4TTGA 3RMEA 3W82A 4D6FA 1UD5A 2G8ZA 3B9AA 4UR9A 2VQUA 3I3BA 4W88A 1HVXA 3RM4A 2YL5A 3AXIA 3OZOA 1ZU8A 3U7BA 2J7FA 3T2OA 5JBDA 3M46A 1J0KA 5FL1A 3PN8A 1CNVA 3W26A 3ZIZA 3TTSA 1MFVA 3VPLA 1GCYA 3ZJ6A 4D72A 1OGSA 2XFRA 4C7FA 1MXGA 2GK1B 3CUGA 4B9ZA 4M8UA 3GDBA 2X0HA 2VQTA 2BHUA 1NOFA 5HBFA 2GDVA 3SCWA 1E6RA 3ARRA 5ECUA 1KBBA 4M82A 1LL4A 3G6MA 3VGDA 1B2YA 1HKIA 5CGTA 4R27A 3W6LA 4LXFA 4MAZA 4MB5A 1E71M 2QPSA 3BMWA 4DM2A 1EDGA 3AJ7A 5LA0A 1VFMA 1QI2A 4GKLA 3O6AA 4XZWA 2DT3A 4J3VA 2QMKA 3VDAA 3AMLA 4W89A 5JIPA 4W7VA 3AHXA 5I79A 1YQ2A 4BQ5A 3AOFA 1VEOA 3ZR5A 3THCA 4KGLA 1JZ8A 2VR4A 2E9MA 2WCAA 5EBAA 4AXNA 3MS8A 1JFXA 2RGMA 5HXMA 1B90A 2G3NA 1C8XA 1TA3B 2Y8VA 2DT1A 1J0JA 2EQDA 4PRWA 4CGTA 7TAAA 5GNYA 3NUKA 4P8WA 3ZM8A 1AQHA 1B9ZA 4YHEA 3TTOA 2W62A 3A4XA 3VIHA 2DSKA 2A3CA 3WN6A 1V3IA 2VTFA 5I0DA 4MB3A 3SCSA 1QBAA 1W1TA 1V02E 2WZEA 3LPOA 2CXGA 5FOOA 5I3DA 2E3ZA 1E6SM 1GONA 3DHPA 3ZMRA 3WNKA 4AZ5A 2WLYA 4ZXLA 2XGBA 3MV11 3TP4A 3CUIA 3VMNA 3AZRA 1C91A 1WCGA 2BXYA 1V3KA 3SCUA 3CIVA 5EMYA 2VT0A 1M01A 3WQWA 4CN4A 5A6BD 4N0RA 2CESA 4L4OA 3CPUA 5HDRA 1E0WA 3WUEA 4MDOA 4XB3A 3WF2A 3IJ8A 3RCNA 1MW1A 2UY4A 4W8LA 4U5KA 5IFTA 1SR0A 4U31A 2YIHA 2ZUMA 3SCOA 1UD3A 4AIOA 4ATLA 1JDCA 3KL3A 4CU8A 1UR9A 2XFYA 1I75A 5A2BA 1V3HA 2F8QA 3ARVA 4TVCA 1J0YA 3VIJA 1LWJA 3N9KA 3J7HA 5M17A 1AVAA 1V0MA 3VGEA 2WPGA 2J77A 3K8MA 4GO8A 4D6IA 1W2VA 1B3XA 2WVUA 1UR8A 1JI1A 1OT1A 5DT5A 2XSAA 4GQRA 1FH7A 4CU6A 3MUIA 2J7DA 4TTUA 1DWHM 1CXEA 4C7GA 3SCPA 4UOJA 3N04A 3WDQA 3GBEA 3PZGA 2QF8A 3B9DA 1LLOA 2A3HA 2XWDA 5DO8A 3OBAA 1W9PA 3L4YA 5I78A 1MFUA 4PTWA 3VGFA 3W38A 1XH0A 4H7VA 3RJYA 1JAKA 1XYZA 3BMVA 5D8WA 5ABHA 1DP0A 3TOPA 4H8HA 3NDYA 3RO8A 1PX8A 1UKOA 1JDAA 3WD2A 4W87A 3PZVA 1V08A 3GM8A 1BQCA 4FLRA 1KB3A 1EOMA 1UD6A 1WPCA 4PTXA 1WZKA 3WSUA 1BPLB 1VAHA 1VENA 3PHAA 2UY2A 3OLIA 1CZ1A 3A47A 3WDJA 1XHGA 4OUEA 1HJWA 3F5JA 3FXYA 4CUCA 4RE2A 2WAGA 1JDDA 3T2QA 2TAAA 5A6AA 3VIPA 3VTRA 1J0HA 2DSWA 3FN9A 3OGVA 3PBGA 3GYCA 2D24A 2WWDA 2GFTA 1GPFA 3K4DA 1R7AA 4Q22A 4ACZB 3PTQA 3PZOA 1CPUA 4HA1A 5A2AA 1GUVA 4A3HA 1S46A 1EO5A 1PEZA 4ACYA 1UD8A 2CBVA 3K46A 1PIFA 4AZHA 1HVQA 3VIFA 1V03A 4FF5A 1QNPA 4HPHA 2O9OA 3T0AA 1W1PA 3W27A 1FH9A 3L4TA 1KWKA 2WM0A 3TTQA 3IANA 2VZSA 1J12A 1W9VA 4GO9A 1BG9A 1P6WA 4TX6A 4AD0A 4GZEA 3AZTA 1ECEA 1M53A 2X2YA 4E8CA 2DSZA 1BVZA 3FAWA 2ZX6A 1CENA 1OWQA 1G01A 3QHOA 2GUYA 4JFUA 1EOKA 3APGA 4J7RA 1GOOA 4PSRA 1WB0A 4WSKA 4CD7A 2WC7A 2Y24A 4L4PA 2FH8A 3IAQA 4J3SA 2F2HA 1M04A 2XWEA 1NWTA 2DT2A 1UZ4A 4PUDA 2QV4A 4MADA 3EDJA 3RJXA 1JZ5A 2EPNA 4CN1A 1BYBA 3T09A 5C71A 4PCTA 4UQCA 3BAJA 3A3HA 1TMQA 2J7BA 5M03A 1JI2A 1GOMA 4H2CA 1HNYA 3AIWA 5A8OA 3KE0A 1BG4A 4WKAA 3BLPX 4WJXA 1C7SA 1HF6A 2ZE0A 2UY5A 1GNXA 4JZ5A 1HJQA 3W0KA 1JG9A 4GQQA 4UFMA 1LJYA 4GZIA 3AI0A 3O9NA 4PMZA 4Z2HA 3L4ZA 2JIWA 1E43A 5CLWA 3SUUA 3WD0A 1O6IA 1E4LA 4ACZA 1TCMA 2A3EA 3B8SA 1LG1A 2J7HA 5JBFA 5I77A 1ZL1A 4JCLA 1ZB5A 4TVUA 4PMQA 1E6ZA 3MMWA 2PWEA 2YLLA 3MSDA 3VX0A 4QCEA 2CETA 1HKKA 3W24A 1A3HA 4DM1A 1E3XA 1TVPA 1HJVA 2ZUNA 3CUJA 3ZJ8A 1K9DA 4DWSB 1PX4A 3UR8A 3VGBA 3WMSA 4LPCA 4JCMA 1VF8A 4ML4A 3I3EA 4M80A 3WUBA 5KZ6A 2FDMA 4H04A 4BQ4A 2WSPA 3SUSA 1C8QA 2V3DA 1J11A 4UQ9A 1K9EA 2X1IA 5E0FA 5DF0A 1ESWA 2WVTA 4QFUA 1Q4NX 5E6ZA 3EBVA 4HPGA 1GVYA 1DWFM 3WQ4A 3FY1A 2PBGA 4HA3A 2WZHA 1CLXA 1RP8A 2EBNA 2G3IA 2ZICA 5AC5A 3UEQA 4PMXA 3WUFA 1VRXA 3AYRA 3WUGA 2VMFA 3OIHA 3VDBA 1Q6DA 4UQBA 5ABFA 2C0HA 4R5EA 2HVMA 1MWOA 4QLKA 3WH5A 3N17A 1XRVA 3D3AA 1EHAA 4PTMA 1KXTA 3CTTA 2E9LA 2YDRA 3CLWA 4OIFA 1OD0A 2D3NA 5BXRA 2J75A 1PX3A 2VJXA 4OKDA 4OJYA 1UUQA 4W5UA 1QHZA 1H5VA 3ARUA 1XD0A 4D6JA 3BAYA 2AOSA 3WY1A 1WDSA 3DHUA 4JKKA 2XSBA 5I24A 1C90A 1HXJA 1OGGA 1E70M 4JFSA 2O92A 3ARZA 4EKJA 4XUYA 1UH4A 1UWUA 2WKLA 4Y7EA 4F9DA 4XV0A 3ARWA 2QMJA 5EFFA 3IAPA 5LYRA 3WQ8A 4RL3A 5IDIA 3EMZA 5A8NA 3U57A 4DWSA 3OA5A 3VM5A 3WIJA 3NSNA 4F79A 2W67A 4AD4A 1WO2A 5BRPA 1BTCA 3KZSA 3RILA 3N18A 1UQYA 4Z2JA 1OIMA 3WH9A 3L4XA 2J25A 1C93A 5A8MA 4BA0A 1EQPA 6A3HA 4F66A 4Q7NA 4LYPA 1CBGA 4FMVA 4EAMA 3MMUA 1VB9A 4HP5A 3W6MA 4MAVA 3ZSSA 1W9DM 4ZENA 2YJQA 2PBOA 3LPFA 1GHSA 3AS1A 1K9FA 3WH8A 1LL7A 3WNLA 3LPGA 3CMJA 2YKKA 2WANA 2OWCA 3K1DA 2W66A 1VEPA 1WAWA 1WE5A 1BFNA 4AW7A 1OB0A 2XVNA 3DC0A 1JYNA 3EDKA 3CZLA 1V0LA 3PZTA 3G6LA 2DSUA 5A6SA 1CDGA 1UHVA 3SUVA 2VVNA 1R87A 2WMJA 4NF7A 2PWGA 4JL1A 3VINA 2ZXDA 3BAXA 1D7FA 4BF7A 1BGGA 4E8DA 1W2PA 4XX6A 3CUHA 1CXFA 5D8ZA 2OYMA 3VIGA 4W84A 1C7TA 2XVLA 3MUAA 3NYDA 1H09A 4UQDA 5BROA 4HOZA 2D0HA 4UOZA 2WVSA 3UERA 1BSIA 1CXHA 3A6OA 5GNZA 3L2MA 4TOQA 1UD2A 3L2LA 4V28A 1L8NA 1JZ7A 4P8UA 1E6XM 1N82A 2EPOA 2PWHA 4DUWA 5IHRA 1X1NA 2NT0A 2ESCA 5BRQA 4ZE5A 5CXPA 2O9TA 3ZJ7A 4DWSC 2CNCA 2AMGA 1C8YA 3HMCA 1KQYA 4LQ1A 1DWJM 4LX4A 1UR1A 2ZUWA 4GI9A 4F9JA 2DT0A 2J4GA 3VKKA 4NSBA 3WD1A 3BCDA 1GW1A 1HP4A 1XC6A 3WNPA 4ZE4A 3DECA 2JF6A 4ZEPA 3RIKA 2ZUVA 2JIEA 1K6AA 4OBRA 2BS9A 4PMDA 1TE1A 1Q6CA 2EEXA 3AMGA 3VIMA 1WP6A 2GK1A 1E6NA 3NSXA 2QLYA 2WNWA 2J7CA 5A8QA 1UWIA 1J01A 4P7NA 1CXKA 1E15A 4URIA 4A4AA 4CCDA 3AYSA 1XYFA 2G3JA 3GH4A 4M24A 4F8XA 1H41A 3WMBA 3QOMA 4FK9A 1CGUA 3S6TA 1KCLA 2YLAA 3VMOA 1OBAA 1H3GA 3AIEA 3GNRA 3T08A 1QI4A 2BVDA 4W8BA 1BGAA 4D6HA 4WSJA 3AIQA 2OWXA 1ZBKA 1WZLA 1UG6A 2VCCA 2J7EA 2YOCA 4BS0A 1W9UA 4GINA 5IXEA 4AD1A 3HU7A 1MW0A 2C7FA 2OSWA 4QDMA 2QHAA 3B9EA 1UH2A 2WMIB 1R86A 2VC9A 1XD1A 2W63A 2NT1A 4XZBA 1J18A 2RGLA 4HU8A 2GJPA 1WDQA 3VDHA 2UWFA 1CTNA 3W81A 1ZJBA 1TA3A 3ARXA 2OLHA 1XSJA 2ZUTA 4LGXA 3F4VA 1B3WA 4AZCB 1EH9A 4PMYA 2J47A 2YDSA 2E8YA 1CGXA 4AZGA 2G3MA 1QBBA 5GNXA 1E1FA 3MANA 4J3WA 1HN1A 3L4UA 2JFEX 3OLDA 1VFFA 3WQVA 1YHTA 3DYOA 1J0IA 1FHLA 2YBUA 1UYQA 2CITA 1UA7A 2CBJA 3AFBA 2XTKA 3CH9A 4J28A 3AS0A 4KMQA 1J9YA 1V0NA 1EXPA 3VOCA 2BFGA 4DUXA 3A4AA 4IPNB 2WLZA 1NWSA 1MXDA 3AIUA 2BNJA 5D9NA 3JUGA 2W91A 3CHEA 4KRUA 1AQMA 2WSKA 3MKKA 1W1YA 1W9XA 3U7VA 1E40A 4QLJA 2CPUA 2VI0A 1VEMA 1W1VA 1V6UA 2OWWA 4GI8A 2UY3A 3EDEA 1E4MM 2PI6A 2BVYA 1U2YA 4JKMA 1JYWA 3EMCA 4B15A 4HTYA 3OLEA 3DYPA 3CHFA 1JXKA 5A6KA 3M6DA 4BQ3A 3ZR6A 1JGIA 2F61A 1IZJA 1B3YA 4AIUA 4AZ6A 2YL6A 4HOXA 3AMDA 1PBGA 3WDRA 1MYRA 1V6XA 3UCQA 2CIPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3GXD A;  1CEO A;  4FLQ A;  3FHA A;  4NRR A;  2JEQ A;  4P7R A;  5GQB A;  2WMK A;  4J3T A;  2DIJ A;  2D3L A;  4UQE A;  3RM9 A;  5A6M A;  1LQ0 A;  1MW3 A;  4FLO A;  2V5D A;  1CEC A;  1CWY A;  1FH8 A;  2CER A;  4OOZ A;  4B9Y A;  3VD9 A;  4IUG A;  1EDT A;  1XH2 A;  2WVV A;  2NSX A;  1JZ2 A;  3AXH A;  1VIW A;  4AWE A;  6CGT A;  2VRQ A;  2X09 A;  2ZXB A;  4PBG A;  4AYS A;  4HOW A;  2J74 A;  2B31 A;  2FGL A;  1JYX A;  1ODU A;  2BY0 A;  2IUZ A;  4Z2I A;  2AAA A;  1JZ3 A;  1UKT A;  3GBD A;  3SCV A;  2FGZ A;  3AMK A;  3VD5 A;  3VU2 A;  1BVN P;  4M81 A;  3UES A;  2GJX A;  1Q6F A;  1H4P A;  1BLI A;  2OSX A;  4PMU A;  1RP9 A;  2XPK A;  2E4T A;  4TVD A;  3SCN A;  4HZ6 A;  1QVB A;  1FHD A;  2G4F A;  4ATW A;  3THD A;  4C7D A;  1AQ0 A;  3E1F 1;  3N15 A;  2CBU A;  4MPK A;  1H49 A;  3DYM A;  4DWS D;  2DEP A;  3ZO9 A;  5CGM A;  5CSY A;  3VII A;  4UFH A;  1GQK A;  3ALG A;  5D9O A;  4Z2K A;  3ARY A;  3QGV A;  1PIG A;  1UZ1 A;  5CPS A;  3WH7 A;  1UOK A;  1B31 A;  4AC1 X;  1WDR A;  2FHB A;  3PZI A;  4YN5 A;  1GOW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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