1E4NA

Crystal structure of the inactive mutant monocot (maize zmglu1) beta-glucosidase zmglue191d in complex with the natural aglycone dimboa
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
LSPSEIPQRDWFPSDFTFGAATSAYQIEGAWNEDGKGESNWDHFCHNHPERILDGSNSDIGANSYHMYKTDVRLLKEMGMDAYRFSISWPRILPKGTKEGGINPDGIKYYRNLINLLLENGIEPYVTIFHWDVPQALEEKYGGFLDKSHKSIVEDYTYFAKVCFDNFGDKVKNWLTFNDPQTFTSFSYGTGVFAPGRCSPGLDCAYPTGNSLVEPYTAGHNILLAHAEAVDLYNKHYKRDDTRIGLAFDVMGRVPYGTSFLDKQAEERSWDINLGWFLEPVVRGDYPFSMRSLARERLPFFKDEQKEKLAGSYNMLGLNYYTSRFSKNIDISPNYSPVLNTDDAYASQEVNGPDGKPIGPPMGNPWIYMYPEGLKDLLMIMKNKYGNPPIYITENGIGDVDTKETPLPMEAALNDYKRLDYIQRHIATLKESIDLGSNVQGYFAWSLLDNFEWFAGFTERYGIVYVDRNNNCTRYMKESAKWLKEFNTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE
publication title The Mechanism of Substrate (Aglycone) Specificity in Beta -Glucosidases is Revealed by Crystal Structures of Mutant Maize Beta -Glucosidase-Dimboa, -Dimboaglc, and -Dhurrin Complexes
pubmed doi rcsb
source organism Zea mays
total genus 187
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2000-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e4nA00
2BXYA 4M80A 1R7AA 1TG7A 1HN1A 3CUFA 2D23A 4GZIA 2XSAA 2OWCA 2WKLA 1XGZA 4B9ZA 4Z2LA 1CTNA 2DT0A 3MKKA 2EQDA 5D9OA 1E0XA 3OIHA 1XV8A 3PZQA 1E6SM 2ZX7A 5F7UA 1Q6DA 4OBRA 4CD7A 2CNCA 4M1RA 1FFQA 2BHZA 3GXFA 2JIWA 5AYBA 1X6NA 4JFUA 2NW0A 4TTUA 4PMOA 1HJWA 1BQCA 4PTWA 2WAGA 1CXIA 2OWXA 2VMFA 2UY4A 2WVTA 2NT1A 4E2OA 1ISYA 2VZUA 1EQCA 5E70A 3ZT7A 1KQYA 4UZSA 1SFSA 3VD3A 2W61A 3VM7A 3L4TA 5ABFB 1MW2A 4IUGA 1E6QM 4HA1A 2BXZA 2CXGA 3FAWA 5GNXA 2CKRA 1LQ0A 1AQ0A 4V27A 2X0HA 2DGAA 1TVNA 3M6DA 5LA2A 1E6NA 3THDA 2OSXA 3BXWA 1WZAA 5CLTA 3AICA 3BMVA 5CQ1A 1NH6A 5AYIA 3VIIA 4CU6A 3MUY1 4XUYA 3AHVA 3TOPA 1VB9A 2D24A 5BXSA 1GUVA 3L4XA 4GINA 1OT1A 1Q4NX 1NOWA 2YA0A 3UCQA 4TVDA 3WH6A 2C7FA 2DQXA 4R27A 4Z2HA 2XVNA 7A3HA 5CJ5A 4NRRA 1J11A 2WMIB 3VIGA 2GJXB 1Q6EA 3GH7A 3AISA 3RJYA 4BQ3A 1UD2A 2BHYA 5EB8A 3K4AA 3SCWA 1UD4A 3AHTA 1DP0A 2EPNA 3AS2A 3DHPA 2PF0A 4UZUA 1ISZA 1JF6A 2YL6A 2VX5A 2BFGA 3EMCA 2DH3A 4PMNA 4UQCA 1XYZA 4WKAA 1GVIA 2G3NA 2A3BA 1E1EA 4UFLA 2AMGA 4U5KA 3AIRA 3WF1A 1OIFA 1G94A 3SCVA 4CU7A 4FMVA 2CHOA 3VGEA 1UYQA 3VINA 3POHA 2XGIA 5A94A 1CGWA 3WQ8A 1GQIA 4AZBA 2A3CA 5E09A 2VZSA 3NYDA 3MV11 4W93A 1HKIA 4MJ2A 1E3ZA 1NM9A 2YDQA 5HNNA 2DPEA 2DSZA 1BYDA 1YQ2A 1B1YA 4J3SA 1UZ4A 3ARRA 4UFJA 1H0GA 1GJUA 1WB0A 2WVUA 4TOQA 3W28A 1CXFA 4BA0A 3WD3A 1HP5A 4P7RA 1UH4A 2C0HA 5HPOA 2Q8XA 1E6XM 4RE2A 1HT6A 4NZCA 2JIEA 1U33A 1UR9A 2GJRA 2ZICA 3VGBA 3QOKA 3ZIZA 3N17A 1BYCA 4J3WA 4S3JA 4KGJA 3AMGA 1NOUA 4MB4A 1OD0A 1R87A 4PUEA 1KR1A 1UD5A 3VD7A 2X8RA 2D1ZA 1JIBA 3WD0A 2VX4A 3VX1A 4AIOA 2VX6A 1LLOA 4HZ8A 1BGGA 1ISWA 1FH9A 3AS3A 4W86A 4WK9A 2J25A 1A47A 1UA7A 4GKLA 2G3JA 2VNCA 3BSHA 5E0FA 4BQ5A 5CLWA 1BTCA 1ITCA 3M7SA 4W85A 4H8UA 2YLLA 1LL6A 3RCNA 4NSBA 3WKZA 1JZ7A 1ODZA 3VU2A 1E5JA 3W29A 4GZEA 2WMHA 1QNRA 2VRJA 4XX6A 5I2UA 3GXMA 4OOZA 2NT0A 2DIJA 3WQVA 5M5DA 4F9JA 1BVZA 4MB5A 4Z2KA 3AHZA 1MXDA 1GOOA 2WLYA 4PCSA 5DF0A 1E70M 1RPKA 1JYNA 2BY0A 4M29A 1OGGA 1WDQA 1RD6A 1DWFM 1HKKA 2VQTA 4W7WA 5TD4A 4UFHA 2XVGA 4P8WA 5A2CA 3CHDA 1C7TA 3U5UA 2Y5EA 5ECUA 1XH0A 3WEMA 3N9KA 4LPCA 1DWGM 1GORA 1SMDA 5DO8A 3RM8A 1VEPA 2W63A 1G01A 3UR7A 1V6YA 2XM2A 3PZMA 4QFUA 4DM2A 4MADA 3U57A 2X2YA 1M04A 4JAWA 2GK1B 1FOBA 1UKSA 2DT1A 4AD1A 1G1YA 1WAWA 7CGTA 1MW3A 4GXPA 3QOMA 4QDMA 3AIQA 4D6DA 1K9EA 2YLAA 4QCFA 1BHGA 1C8XA 2E0PA 3WIJA 1NOFA 2VURA 2VVNA 3NUKA 1KCLA 2XSBA 2IXVA 1MFVA 3N13A 3CPUA 3FAXA 3OB8A 4WJXA 3IK2A 4PMRA 3LPFA 2EPMX 3SEPA 1B3WA 3UR8A 2FH6A 2VC9A 5HBFA 4CCDA 3J7HA 1M03A 5IFPA 4AD2A 3NIYA 1E6PA 2XVPA 4LXFA 4WIWA 2VX7A 4UCFA 3L2LA 4P7QA 1O7AA 4HU0A 1CGVA 2WANA 2C8NA 2WC3A 4IISA 3A6OA 1TUXA 3UG4A 4W5UA 1QI5A 4J3XA 1YHTA 4GQQA 2XVKA 4BCEA 4QLLA 4DWSA 1TZ7A 1OSEA 1KCKA 1OB0A 1XH2A 5CPTA 3VDAA 1EOKA 5BYWA 1E56A 6CGTA 3DC0A 4P8UA 4PSPA 1KGWA 2CBJA 3L4VA 3CO4A 4F9DA 3VDBA 1BG9A 4D72A 4UQDA 4HPHA 1HNYA 4UOZA 1TMQA 2QMJA 2QPSA 1OINA 3ARQA 5I6SA 1B90A 3UETA 1JXJA 1EDQA 1W2PA 1SMAA 4BQ4A 5LYRA 2WZHA 4DWSC 4J3UA 4H8HA 1QW9A 1BG4A 3JUGA 2JF6A 5JIWA 1EH9A 1UWRA 2W62A 1JI2A 3AYRA 1GPFA 2VQUA 1GQJA 4D1JA 4PMUA 5DT5A 3PZUA 4ACYA 5C71A 3CMGA 3VOCA 1FFRA 3ECQA 3WNPA 1C8YA 1JG9A 2VVSA 4JFTA 5CPQA 3BAXA 8CGTA 3WL1A 5DEZA 3K1DA 4QCEA 3N12A 1WO2A 1TFVA 1ZBWA 2WK2A 4J7RA 4AZGA 1H5VA 2E9MA 4V28A 2XFRA 2Y8VA 4B15A 4Y7EA 3M46A 1UWSA 1JNEA 3DHUA 3A4WA 3W27A 3WEZA 5I3DA 4AC1X 4P8VA 3EMQA 2EXOA 2D0GA 3KWXA 2CIPA 5I23A 3HMCA 3EDFA 2VL4A 1XSIA 3OBAA 3L4ZA 4XZWA 3WH5A 3AZSA 4D71A 1OBAA 2WSPA 1Q6FA 1FP8A 4GO8A 1AMYA 1EHAA 1PX4A 3WD4A 3ZJ6A 3CTTA 1IT0A 1U30A 4AYSA 1J0IA 4X9YA 1B31A 5CPSA 4BS0A 2BVTA 2WZEA 2FGZA 2WCGA 5A6AA 1C91A 1S46A 4DUVA 3SURA 1PBGA 3IJ9A 4WSJA 2CCRA 1HJSA 1ESWA 3W53A 2UY3A 4TUFA 4OUEA 5CXPA 5ABEA 1GOIA 4WSKA 1C93A 3T2PA 1WDSA 4OJYA 4IPNB 1VRXA 3ARWA 1SR0A 2XFFA 3IAQA 4HZ7A 1QI0A 3WENA 1C92A 1KXVA 2J78A 5LA0A 3VGFA 1IV8A 1W9VA 1MWOA 3IANA 1WP6A 3K8MA 1C8QA 4OIFA 1W3HA 1JYWA 5A95A 4YPJA 2Y8KA 2J77A 3F5KA 3CGTA 2WC7A 3E1F1 3GH4A 5ABFA 1E15A 2BY2A 1VF8A 5GNZA 4XV0A 4HU8A 3OGSA 3VKKA 3TA9A 1OGBA 4TVCA 4XZBA 2YBTA 2FDMA 5A6KA 3FNDA 1XSKA 1LG2A 4TX6A 3VD9A 3W37A 2VCBA 1XHGA 2EBNA 2OYMA 3N18A 2F61A 3WDQA 1HIZA 1O6IA 5I24A 3KL5A 3I3DA 3WELA 3OLDA 4GI9A 4AZ5A 2AOSA 3TTSA 2WMGA 3O2LA 2RGMA 2ZIDA 1CZ1A 1JD9A 3WMSA 3CIVA 1R86A 5C70A 1UHVA 1QI4A 1WKYA 4AZ7A 3EDEA 3WDPP 1W1VA 2WMIA 1TE1A 2W66A 4CN4A 3ZM8A 2XPKA 4Z2IA 1K9TA 4OKDA 1KGUA 1HKMA 3W6MA 1E0WA 3DYOA 1QOXA 1HJQA 3TTOA 2X1IA 5A69A 2D3LA 1CEOA 1JNDA 4HZ6A 1E72M 1F4HA 1H4PA 2BY1A 2J75A 1FH7A 2FHBA 4YN5A 2ZX5A 3G6MA 1I75A 4CD6A 1VBUA 3VIMA 1W9BM 2V38A 1J0HA 4L4PA 5A6SA 5BXPA 3N1AA 1TR1A 2RGLA 1UUQA 4C7FA 3TTYA 4PSRA 2OWWA 3PTKA 3BAJA 3PZNA 3RO8A 1EIBA 3WDHA 1PX3A 3W25A 3W38A 3O9NA 3RDKA 3SUUA 1D2KA 1UZ1A 2WWDA 4M56A 1QHZA 1BGAA 2YA2A 1PAMA 2ZXAA 1FA2A 5E9AA 1RP8A 1KQZA 4FLQA 1UA3A 3GTNA 3GBEA 1KFWA 3VNZA 1XSJA 1J9YA 2PBGA 1KXQA 3CUHA 2J7BA 4B3LA 4JFSA 4W7UA 2YL5A 3OA5A 2WM0A 1QHPA 2ESCA 1WZMA 3T09A 1E9LA 4ATDA 3ALGA 1VEOA 1J0KA 5DMYA 3PZIA 4IM4A 2CBVA 4W7VA 3AI0A 1I1WA 4WKHA 2WNWA 4UQEA 2DSWA 1BYBA 2EPLX 4BZYA 3WDIA 3UEQA 1GHSA 1H41A 3WMBA 4AIEA 5IXEA 4CN6A 3WNNA 2DT2A 1HJUA 1BF2A 1UOKA 2ZWZA 3FN9A 3AIBA 1UR1A 4QLJA 3VVGA 3VM5A 3RILA 2W91A 5FOOA 1B3YA 1V02E 3W81A 9CGTA 3FY1A 1ZL1A 3RM4A 1KB3A 4W87A 3VMNA 4H7VA 1NQ6A 4JKMA 3NSMA 1LG1A 3OG2A 3AQUA 4N42A 4FF5A 3TONA 1J0YA 5FCZA 3L2MA 4ATWA 6TAAA 2ZWYA 1OGSA 4WLCA 1E4LA 3B8SA 4MAZA 4PTVA 1JFXA 1KXHA 3W6LA 2WYSA 3SCQA 1HXJA 1G0CA 5D9MA 1J0JA 1BSIA 2PWHA 3AHXA 2F2HA 1B30A 1QW8A 3MMUA 4AEFA 1FH8A 2CBUA 3BCFA 1W32A 1V3JA 4GPNA 3TTQA 4PN2A 3OLIA 1QVBA 1DWJM 1UKPA 3MMDA 4Q7NA 3W24A 1JYVA 1V08A 1XD0A 2BHUA 3MSDA 4HMCA 4EK7A 1H49A 1P6WA 4FLSA 5A2BA 4EAMA 4HOWA 2WC4A 4E4PA 1QNQA 5JBDA 2WHKA 1US3A 1CPUA 2YDRA 2JF7A 1L0PA 3N11A 4AIUA 1WPCA 1KWKA 1OD8A 4JFVA 2GK1A 2WXDM 2O9PA 1KR0A 4UFKA 1EXPA 5I78A 1C90A 3UG3A 5A8MA 3VD5A 4GI8A 2ZXBA 1X1NA 2XGBA 1UR0A 1CXHA 4UQ9A 1UH3A 1CYGA 3WNKA 4JIEA 1WCGA 3CZLA 1BYAA 1H3GA 4ZXOA 1UQZA 4KWUA 1V0KA 4P7LA 5BCAA 1C3FA 2FHCA 3WQWA 1VFFA 3WF2A 4DM1A 1JZ5A 2FH8A 4GI6A 5D8ZA 3OLGA 3T0DA 3VIFA 1FHDA 2GUYA 4J27A 4AZCB 2X09A 4GZJA 4DWSD 2WBGA 3WSUA 2VT0A 2OYKA 3EDDA 1CENA 1KBBA 1V3MA 2WVSA 1JDDA 2ZUMA 5I77A 3PN8A 1X6LA 3IJ7A 1CGYA 1E40A 4AZ6A 2QF8A 3WNLA 1W1PA 3D3AA 3F5JA 2CPUA 1DWAM 1E6ZA 2DSKA 5HXMA 4PMDA 4M82A 2CKSA 2XM1A 1CGXA 1JF5A 4Q22A 2VCCA 2ZX8A 2CEQA 3VTRA 1TA3B 3WUEA 5EFDA 3BGAA 4AISA 4CN1A 2W67A 1E5NA 3NCOA 3RIKA 3CZJA 1JZ3A 2VZOA 1K6AA 3W0KA 4AWEA 5A2AA 4QP0A 4MNJA 2W5FA 1E6RA 4CVWA 2VR5A 5BRQA 2EPOA 3ZSTA 1H11A 4FLOA 1JZ8A 2JEPA 1CLXA 5I0DA 3CH9A 1OT2A 4GQRA 1E71M 3CZGA 3QGVA 2V3GA 3VO0A 5KZ6A 3DECA 3EYPA 4HA3A 3VD4A 2EEXA 2J7EA 3AOFA 4MJ4A 2OSYA 4JZ5A 3VGGA 3GM8A 3A47A 1BAGA 3AIEA 3PHAA 4W5ZA 2E8YA 3SCUA 4TVUA 5HDRA 4HMEA 4DUWA 2V5CA 2W92A 1E73M 1EOMA 1LJYA 1W3LA 2J7HA 1MQQA 4D6IA 1VJSA 5A6JA 2ZUVA 1JZ6A 3POCA 3AS0A 3ZO9A 2J8FA 2XUCA 1J12A 3PZVA 4W89A 4U31A 2BVYA 2PBOA 2Y2WA 4NRSA 3BAWA 4HP5A 5EFFA 4H8VA 1MQPA 1LL4A 1VAHA 2WMKA 3BMWA 1F4AA 4JHZA 1JXKA 3VIPA 4JL1A 4AD4A 2E40A 3OLEA 4CU8A 3SCRA 2J74A 1QBBA 3W82A 4U2ZA 1BFNA 1Z32X 4E8DA 1PPIA 1VBRA 4QAWA 1J0ZA 1WNOA 3SCTA 1UH2A 1U2YA 3VNYA 2BY3A 4AMCA 1V3HA 4HPGA 1VENA 4ACZA 4H04A 1UWTA 1V0LA 2V3DA 4D1IA 1JDCA 2DH2A 5JBEA 2PWEA 1E4IA 3N04A 1HF6A 5A8NA 4UOQA 1GQLA 1W9XA 1BLIA 8A3HA 5M3WA 1JI1A 3IJ8A 3RJXA 4XB3A 4D6FA 1NWTA 4M81A 5A8OA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BXY A;  4M80 A;  1R7A A;  1TG7 A;  1HN1 A;  3CUF A;  2D23 A;  4GZI A;  2XSA A;  2OWC A;  2WKL A;  1XGZ A;  4B9Z A;  4Z2L A;  1CTN A;  2DT0 A;  3MKK A;  2EQD A;  5D9O A;  1E0X A;  3OIH A;  1XV8 A;  3PZQ A;  1E6S M;  2ZX7 A;  5F7U A;  1Q6D A;  4OBR A;  4CD7 A;  2CNC A;  4M1R A;  1FFQ A;  2BHZ A;  3GXF A;  2JIW A;  5AYB A;  1X6N A;  4JFU A;  2NW0 A;  4TTU A;  4PMO A;  1HJW A;  1BQC A;  4PTW A;  2WAG A;  1CXI A;  2OWX A;  2VMF A;  2UY4 A;  2WVT A;  2NT1 A;  4E2O A;  1ISY A;  2VZU A;  1EQC A;  5E70 A;  3ZT7 A;  1KQY A;  4UZS A;  1SFS A;  3VD3 A;  2W61 A;  3VM7 A;  3L4T A;  5ABF B;  1MW2 A;  4IUG A;  1E6Q M;  4HA1 A;  2BXZ A;  2CXG A;  3FAW A;  5GNX A;  2CKR A;  1LQ0 A;  1AQ0 A;  4V27 A;  2X0H A;  2DGA A;  1TVN A;  3M6D A;  5LA2 A;  1E6N A;  3THD A;  2OSX A;  3BXW A;  1WZA A;  5CLT A;  3AIC A;  3BMV A;  5CQ1 A;  1NH6 A;  5AYI A;  3VII A;  4CU6 A;  3MUY 1;  4XUY A;  3AHV A;  3TOP A;  1VB9 A;  2D24 A;  5BXS A;  1GUV A;  3L4X A;  4GIN A;  1OT1 A;  1Q4N X;  1NOW A;  2YA0 A;  3UCQ A;  4TVD A;  3WH6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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