1E51A

Crystal structure of native human erythrocyte 5-aminolaevulinic acid dehydratase
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
328
structure length
326
Chain Sequence
MQPQSVLHSGYFHPLLRAWQTATTTLNASNLIYPIFVTDVPDDIQPITSLPGVARYGVKRLEEMLRPLVEEGLRCVLIFGVPSRVPKDERGSAADSEESPAIEAIHLLRKTFPNLLVACDVCLCPYTSHGHCGLLSGAFRAEESRQRLAEVALAYAKAGCQVVAPSDMMDGRVEAIKEALMAHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAKSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDIVREVKDKHPDLPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLQWLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE
publication title The Crystal Structure of Human Ala-Dehydratase
rcsb
total genus 96
structure length 326
sequence length 328
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2000-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1e51A00
3P7YA 5HQEA 4BF9A 1K7EA 1SFJA 3V75A 1H51A 1YDNA 1LCOA 1VJIA 2WNNA 1FCVA 3W71A 2QCHA 3WJXA 2Y89A 1FDYA 3UPWA 1OHLA 3W1TA 3R13A 4LT9A 1HFBA 5FF4A 1TYGA 4U4MA 4UNLA 3C52A 3MYOA 4UIOA 4N9BA 1R30A 2R8WA 1JUBA 3P8IA 2YFNA 2YW4A 5F2MA 3S1VA 4ORMA 2X2GA 5CZJA 2XN0A 3SSJA 5DY3A 1EB3A 4UMBA 1BEUA 1UCWA 4DEFA 3IIZA 3EX2A 2X1TA 4JD4A 5AC6A 5CPLA 1QNVA 4IMFA 3C2OA 3A21A 3UPBA 3N14A 1F76A 2RDWA 1KW1A 2E5CA 1G4EA 1OK6A 3BLEA 1L6SA 1C8VA 1XDLA 3FKKA 3LGEA 3SIZA 1G69A 2F84A 1FWTA 3O6DA 4MYAA 3M6YA 1OX6A 3UY7A 3DFPA 3HG4A 3G1YA 3O07A 2NXIA 1NF7A 4PL1A 3CC1A 4O4WA 3TA6A 4MOZA 2V2DA 3HO8A 1JCLA 4NU7A 1ICSA 3E96A 4CLMA 3S5NA 2ZFAA 4HSNA 3IV3A 3C2EA 3G0UA 1LOLA 4HPXA 4NZFA 3EXRA 4QNEA 3U6WA 4JIPA 4K36A 2G97A 3W70A 2HS8A 2VELA 5I3FA 1W37A 3DZ1A 3NXFA 2GVGA 4HHPA 1ALDA 1A50A 3SW6A 4Y6GA 3SR7A 3PY2A 2FTPA 3NGJA 5G1YA 3O8AA 3GNNA 2V0TA 2ZZ6A 4JTIA 3TE9A 3FS2A 2DZWA 4OT7A 3WK2A 4NNAA 4N4PA 3L5AA 4EF9A 5J5RA 3G8RA 5F2IA 2G5WA 5C2XA 4N6FA 1O60A 1PS9A 3LDVA 1DBTA 4K39A 1G6CA 3BK0A 3LLDA 1WV2A 3B03A 1H1YA 3UWZA 4MVAA 2A7PA 1QAPA 3M41A 2WV8A 1KM3A 1SUXA 2LLEA 2E77A 5FF2A 4RZ5A 1YXCA 3PG9A 1SSGA 4NT0A 1W3IA 4YCPA 4YWIA 3WJYA 4O1BA 1H5YA 1TV7A 1OFOA 4UTKA 1TO3A 3EWUA 3STGA 5AC7A 2DP3A 4TMCA 1DL3A 1OX4A 2DZXA 3NQ8A 4TR9A 1W54A 4UCGA 4BFAA 1TTQA 2A21A 1TTJA 2WPBA 4FB7A 1K8YA 2ZRWA 5K7JA 1O5XA 3UNDA 4ORIA 5D04C 4OU1A 1OFAA 4MY1A 1LBLA 1IXPA 1SU5A 5LNSA 1K7XA 5G4EA 3TV8A 4RR4A 2YW3A 1TJRA 3NQGA 4CNNA 2O7QA 3N19B 2ZA3A 5FEWA 1JULA 4UFHA 3S6DA 1ZCOA 4AWSA 3QSTA 3ATYA 3W9ZA 2Z6JA 4DO4A 1W1ZA 3LXBA 1BWKA 3R5EA 2C15A 1GYNA 3RFAA 3I7SA 4NJIA 4Z0JA 4OV4A 5U7SA 2ZCGA 1KFCA 2QCMA 5LHFA 4AH7A 1TQJA 3W86A 4N9CA 3C61A 2BXVA 4JEQA 2E6DA 1X1ZA 1ZAJA 4JTUA 5DCDA 3SGUA 2AQWA 3HGOA 2GQ8A 5KINA 3IGSA 1VHNA 2V2HA 2D73A 1R47A 4HIBA 3TQKA 2KZHA 1SW7A 1V5XA 3LHZA 3LRMA 1QR7A 4HNUA 1WYIA 4FX7A 3W7QA 1TPDA 3EWWA 1KFJA 4GJ1A 3FKRA 4QSHA 2NUYA 2DZTA 4K8EA 1DKWA 1F5ZA 2DZPA 2ZZ7A 1VPXA 3C56A 3NQMA 2Y63A 4TX9A 2NUXA 4ML9A 1BWLA 1YXYA 5AYYA 1ICPA 2VEKA 4PTNA 4DELA 3W1MA 3W3OA 4XBKA 2ZBTA 3HPZA 4YCOA 3UXDA 4JTFA 2Y70A 3IVTA 3HGRA 1NVMA 3QMTA 3AJXA 4X3ZA 4ZQNA 4E2DA 3C4UA 4JTEA 5EY5A 1M5WA 5HWNA 4AXKA 2BLEA 5KSWA 4FIRA 2V2CA 3BARA 3KX6A 3E49A 2ZZ5A 3GXNA 3DFOA 5I3HA 1LROA 1H62A 2GQAA 2NX3A 4PH6A 2JKPA 5DN1A 1H1ZA 1AG1O 2BSLA 1QO5A 1DQWA 4HNTA 5CSSA 3W7IA 3W2UA 2R94A 1OFQA 5DBUA 1ML1A 3QQ1A 4DPQA 3C2FA 3NYZA 3TFCA 2I1OA 4O14A 3PG8A 4H3DA 1O4UA 4R7JA 1DOSA 3A22A 5D32A 1YADA 1FCUA 4AEOA 3EXTA 4PFMA 2EKCA 4JN6A 2JGQA 1JCXA 3GR7A 3CWOX 3LBMA 3OVPA 5F4WA 1IF2A 5AB3A 4ZMGA 3P81A 4O54A 3EEGA 2WSRA 2GJNA 1J4EA 3BVJA 3TW6A 1J2WA 3LCLA 3TQVA 4O11A 3PBUA 1FQ0A 1I2OA 1SZNA 5G2IA 1T8XA 1SW3A 2FQIA 2Z0IA 3CWNA 1D3GA 2X1RA 2TSYA 4O16A 3W7HA 3I7QA 1X1OA 5SWUA 2J9XA 1FXQA 1S5VA 2DU2A 4IMGA 4LRTA 5G1TA 1JCYA 4A29A 3THAA 4LVAA 4N9EA 1G4TA 3EX4A 3C6CA 3W7OA 1XCFA 4MLJA 2WOQA 1FXPA 1SSDA 4Q4KA 2B0MA 1JRCA 3W7EA 1LZOA 3LHVA 4IXHA 1RV8A 3QMRA 4DO6A 4S1FA 1AW5A 1G67A 2JK2A 2V30A 4JY8A 3LXAA 1NAL1 3HF3A 4J9JA 3LX9A 4LC8A 3MUXA 4RZ4A 3VE7A 4XKYA 5KTLA 3NA8A 1HTIA 3MYPA 3PBWA 4RXFA 1H7PA 4QNWA 5I3JA 5BMWA 4FNUA 3L67A 3NM1A 4C1KA 1ME8A 4LOCA 4EOUA 1TRDA 1T0OA 4TO8A 1Z44A 5GVJA 4JR5A 4NX5A 4O4VA 3GAKA 3S9YA 2A85A 2C16A 2CFFA 3GK0A 4MIMA 5HWMA 3A5FA 1LBMA 1KTCA 2VXNA 3SGZA 3NPUA 1TPUA 3G18A 3LBCA 3HGJA 3O15A 3M0ZA 3G1FA 3O1NA 4JTHA 1XBVA 1FWWA 1SFLA 1GEQA 3E9AA 1FX6A 3G22A 2E5DA 4XKYB 5D38A 4RCXA 1M7PA 5MHBA 2NV1A 1YPFA 3W1NA 3NAVA 3GLCA 3ZR4A 3HOJA 3KRZA 1P0KA 1JCMP 3Q58A 5AHMA 3UWWA 4AB4A 3DAQA 2J88A 2E68A 4UR8A 4Q33A 3OEXA 2QCLA 4RJEA 1JQXA 3AO0A 3W2JA 1OFRA 4D2JA 3KFTA 3MI6A 3NQ2A 3NEVA 4O0KA 1W5QA 1YTEA 3QF0A 2C3ZA 4BWLC 3NPVA 3UWQA 4P2VA 4QIUA 3U8GA 3W1LA 3TX9A 4M7SA 4WJEA 3W72A 3TH6A 3VNDA 4AWUA 3INPA 3PUOA 1J5TA 4UFKA 1GPWA 1OG0A 2B4GA 1KLZA 1SO5A 3HPSA 1H7OA 3TQ0A 2J9ZA 2DZSA 2PCQA 1PVNA 2CZEA 3IIPA 5I3GA 3O05A 5DELA 1WA3A 4UTWC 1B9BA 1RVGA 1IIGA 1JRBA 3LM7A 3H55A 5TIMA 3P5ZA 1DVJA 1W0MA 1B4EA 4UTTA 1CW2A 5K2ZA 2A7NA 4I7WA 5LNRA 3PS7A 3RK8A 4FF7A 2C1HA 1EPXA 4ZVJA 3DFSA 4FNPA 3W1PA 1VS1A 4HSOA 4O1CA 1U5JA 1LBFA 3KXQA 3H54A 1H61A 3W75A 1F05A 5AHEA 3DI0A 5DCBA 1Z48A 2C19A 3RLUA 2NZLA 3CB8A 3BW4A 1KM5A 1TREA 4LC6A 3WJSA 2FPYA 1JUEA 4FNRA 2YYUA 3N34A 1S3HA 3B0UX 4O52A 5CSRA 4R34A 1EEPA 1EX5A 3CQ0A 3FJ6A 1H7NA 4DF1A 1TB3A 3RNDA 4BWLA 1VCFA 3NQ7A 2ZRUA 4HT3A 3OVRA 3BGJA 5AYZA 1OYBA 3TXZA 3QPYA 3UWUA 3B06A 5FESA 2NLIA 2QCCA 1N55A 4JTKA 4JTLA 5K4ZA 3G3DA 2QUVA 4HN4A 5FI8A 3NR0A 3B4UA 3TMLA 4GWEA 2P0OA 1WBJA 4EF8A 2ZZ3A 4UTWA 3STCA 2B7QA 4FXRA 1PCWA 1ADOA 2UV8G 2A1YA 1TTIA 5AHFA 3TFXA 4A2RA 2QCGA 4N6EA 3S42A 3OIXA 2CLOA 3TIMA 1OX5A 4OHQA 2ISVA 3EX1A 4AF0A 3W1AA 5DXYA 3HQ1A 3KVKA 2VC6A 2ZA2A 1OFPA 1O5KA 4GRSA 4E38A 5D33A 1LOQA 3CLMA 3KVLA 5AOUA 1SO4A 2Y7EA 2CZ5A 3W22A 3M5YA 2YDAA 2CLLA 2BWGA 1FCQA 3P5YA 4WXYA 3UQNA 3T44A 4O13A 1IIHA 4JTSA 4K7VA 4LW7A 3ZS4A 1RPXA 3IVUA 1ME9A 3HMJG 1XDMA 1P1XA 2CZFA 1YXDA 4XZ9A 4KFNA 3EX3A 4AF0B 4EVZA 3TAKA 1ZY9A 3TR2A 5CG7A 3EWXA 5BOOA 2H3DA 5BMXA 3MHFA 2GQ9A 4LVGA 1SW0A 2OCZA 2QCEA 3HG2A 3QFEA 3NQVA 4OQVA 2RDTA 1XUZA 3JR2A 4KFOA 3ANYA 4LVFA 1ZAHA 1Z41A 6ALDA 1H7RA 2A5HA 3CHVA 3T4CA 4FXSA 3F4NA 3FOKA 2FJKA 2A2IA 2VFIA 2GOUA 1UJPA 3LHTA 4UFLA 1C9DA 1TPEA 3IVSA 3GKFA 1NF0A 2A6LA 2B7NA 4NJGA 3TU9A 3QZEA 1OABA 1GG1A 3P67A 2ZQ0A 3PVFA 3W7KA 1RQEA 4MUZA 5EMUA 3PAJA 3CT7A 5D2XA 2VFHA 3TSMA 1XKYA 2G95A 5AN7A 3UD6A 4IX0A 3PULA 3UY8A 4DO5A 1FWSA 5F1UA 1I2PA 3DH7A 5K4XA 4S2CA 4A3UA 4OBTA 2YXGA 4LRSA 3G0SA 1R2RA 2YYTA 4Y9AA 4CQAA 5G5IA 1Y0EA 2ZRXA 4AHPA 1VQTA 3DFTA 1OYAA 5A5WA 3M16A 2PRLA 4NJKA 3R8RA 3C2VA 3NQDA 5K9XA 1I2QA 4EIVA 1TIMA 1OF6A 1LRTA 1XBZA 5G2WA 4LV4A 3KOFA 3I6RA 3L0NA 4U28A 5H2ZA 2QJGA 3NQFA 2C18A 4S2BA 5HULA 4R53A 4I9AA 4Z1BA 2CW6A 2P10A 4K37A 5HR7A 4O15A 1F2JA 3C0JA 1IXQA 2J24A 5EPDA 2R14A 1JVNA 1JCJA 4WQ6A 4DXVA 2ABBA 1B4KA 1RQHA 3LCGA 1SZGA 2FDSA 5C5YA 3TJXA 4WXZA 4P61A 3FEMA 4M6QA 2QJIA 3NNTA 3E02A 4K7YA 2QCFA 3RU6A 1MEWA 1EUAA 3B8DA 5D03A 3M5VA 1F6PA 1LM1A 3P62A 2CLEA 3W87A 3KVMA 1LLZA 3Q94A 5AHLA 1TPFA 5CZSA 5G2HA 1DJQA 3C3NA 3OBKA 4IJBA 4MFEA 3W23A 1DORA 4Y8FA 4R33A 4ZQMA 1EIXA 1TPH1 3CIWA 2ATMA 4UFIA 3VFLA 2PURA 2HTMA 3NDOA 3VE9A 4KWVA 4NNBA 5AHNA 4A21A 3QJAA 2CWNA 3LCWA 2ALDA 4CQ8A 3W76A 3EWYA 3ABQA 3LI1A 3O6CA 5F1VA 3A24A 3WJZA 2BTMA 3W2LA 1I2RA 3FYOA 1H60A 2TRSA 1JUKA 2H3BA 4A2SA 1VH7A 1EUNA 1GVFA 1XXXA 3TXVA 4FNQA 1VC4A 4LWWA 3QRHA 3FJLA 5KZDA 4WUIA 1THFD 5H91A 3C2RA 1KM1A 5LNVA 4ZQPA 1H7XA 3GNDA 2ISSA 3NZ1A 1UUMA 3L21A 4JX4A 3B0PA 4MYXA 3G1VA 5AHIA 3LLFA 5LNUA 3EB2A 5DY2A 1F7BA 1U83A 2A7RA 2PRHA 3QYQA 3MI2A 2Q8ZA 4FX8A 3MWAA 2JGYA 4AHQA 4Q32A 1K03A 4KWWA 1RD5A 4ZQOA 3F1QA 5CPNA 5L6UA 3SI9A 3LV6A 2CZDA 1X6UA 4UFMA 3TC7A 5AFDA 1CI1A 1R2SA 1G4PA 4IGHA 2ZZ2A 3OA3A 4MZ8A 4IMCA 2Y85A 3B05A 2NXGA 1L6WA 3PSWA 1H50A 1QOQA 4JDBA 2NUWA 3W7MA 3W74A 2QJHA 1K8ZA 3LTSA 3P84A 1GZGA 5LNWA 4XQ6A 1MSSA 3DFQA 4MZ1A 4GE8A 4OE7A 4C1LA 1W8SA 3O6YX 4RX0A 5KZEA 1ZALA 1F6KA 1W31A 3N73A 4WX2A 2NX1A 2IQTA 3W83A 4O18A 4WY0B 4UXDA 4Z1DA 3ABOA 1G4SA 2V9DA 1DJNA 3A5VA 2CLIA 4KKXA 3QPZA 2Y6ZA 3BGGA 3A9IA 1CX9A 1VYSX 3SFKA 3SECA 1A5CA 3UXAA 1QCWA 3HIJA 4UUIA 1SO3A 2DORA 3T40A 2RFGA 4L4LA 2H6RA 4MPQA 4M5PA 1WOBA 2ZTKA 3G24A 3LERA 3CEUA 4UFJA 2ISWA 4MY8A 3NPWA 3EX6A 2AAMA 1K8XA 4GUFA 3QQ0A 5CZTA 3W7CA 1W5PA 1WOAA 3U2OA 2G96A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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