1E72M

Myrosinase from sinapis alba with bound gluco-hydroximolactam and sulfate or ascorbate
Total Genus 199
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
199
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords MYROSINASE MA1
publication title High resolution X-ray crystallography shows that ascorbate is a cofactor for myrosinase and substitutes for the function of the catalytic base.
pubmed doi rcsb
total genus 199
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e72M00
2DSVA 4AD5A 3CUJA 5C70A 4URIA 3CBWA 4JKMA 2VCAA 5I6SA 3U5UA 4HU8A 4IPNB 1R7OA 2F8QA 1HL8A 1VF8A 3AHTA 4A3YA 3RJXA 1V0LA 3S6TA 3W82A 1TVNA 2GK1A 1I1WA 1GQIA 1EO7A 1BSIA 4P8XA 1NOFA 3T2PA 4LYPA 2D0FA 5IHRA 4IM4A 4Q22A 1W3LA 3ZT6A 3AIEA 1JI1A 3M6DA 4HU0A 4PTXA 3TA9A 5CSYA 4B15A 4Q7NA 1TZ7A 4AD3A 4UFKA 5D8ZA 1E4NA 1O6IA 3L4UA 3W53A 1V6UA 3PZTA 1BQCA 1JYXA 2XVKA 1BF2A 1VFMA 4QLJA 5FCZA 1UD4A 1UH4A 2XHYA 1MYRA 2G3IA 4NF7A 4WSJA 4CCCA 4GZEA 4MPKA 4JKLA 5EFDA 2DT1A 4J28A 1RH9A 4ACZA 3TOPA 4UFMA 4ACYA 1SMAA 1BVNP 1B30A 1JZ5A 1WPCA 1GORA 1CEOA 2XWEA 3CHEA 3K4AA 3TONA 1MQQA 3VGBA 1UA7A 4DM2A 3VD4A 4HTYA 1XCWA 2EPLX 4C7DA 4BS0A 3FNDA 5DF0A 1E55A 1WZLA 2Y2WA 1QBAA 4WLCA 4QFUA 4AXNA 4DWSC 3PTKA 4CN6A 5E0CA 2E0PA 2GJRA 3K8MA 3TTYA 1GPFA 1V08A 3SCTA 2MANA 2QMJA 4GXPA 1W9BM 2VI0A 3CZ8A 3L4TA 1WDPA 3VD5A 3FHQA 3GBDA 3VIIA 2VX5A 4AISA 5I77A 4AYSA 4Y7EA 2GK1B 4FF5A 1G94A 1GOWA 3VMNA 3GXFA 1EDQA 3K1DA 3MUAA 2FHBA 1B31A 3AHYA 4OJYA 3ZQ9A 2WAGA 3U7BA 2ESCA 1V02E 4D6HA 1JF5A 1E73M 1OT2A 4BQ2A 1H49A 1CYGA 3CO4A 4XV0A 4E2OA 5HNNA 4PTWA 1JDDA 2WKLA 5EBAA 4MB1A 1XSKA 2WKGA 3OIHA 3OGSA 2DGAA 3WNNA 4CKQA 1L0PA 1TCMA 4UOQA 3GTNA 1VEMA 3VDBA 2YL9A 4ACZB 3WENA 1GHSA 2WC4A 4FLSA 3LPFA 3W28A 3T09A 2XFYA 3AXHA 8CGTA 3N18A 5CLWA 4NRRA 1WDRA 1B3WA 2J77A 2NSXA 3SUSA 3MUY1 2DH3A 3WEOA 1E1FA 2DIJA 1KFWA 3LPGA 4OOZA 3AYRA 2FH6A 2CNCA 4KGJA 3N17A 3SCSA 5A8OA 5A94A 3N9KA 1HJUA 1NM9A 4TUFA 3ZMRA 4KWUA 3L4YA 1BYBA 1GOQA 5I23A 6CGTA 1ZJAA 1BYDA 1MW0A 3CZEA 2GVYA 3BXWA 3VTRA 2WLZA 1HJWA 1GOOA 2PWFA 2JALA 2JIWA 1JXJA 3B9EA 4PTVA 4QCFA 3SCNA 1HKMA 2VT0A 4PYSA 1HKKA 4U33A 1C92A 1MFVA 1A47A 1E4MM 1XV8A 4KRUA 3L4XA 3VD9A 2D1ZA 2J4GA 1UD3A 3WDRA 2YIHA 2BY3A 2XG9A 3WDPP 3L4WA 5JUVA 1C3FA 1B3VA 1VFFA 2ZUWA 2BVTA 3IANA 5BCAA 1JL8A 1UR8A 1XYZA 3QOKA 1GZJA 3CHDA 3JUGA 2WHKA 3W6LA 3RO8A 1GOMA 2D3NA 2Z1KA 2WMIA 4BZYA 4P8VA 1J0HA 5CPQA 1ECEA 3BAJA 1OT1A 4UQCA 5BWFA 1XC6A 2JE8A 5I78A 2WLYA 3WDIA 4CGTA 2ZXDA 1R8LA 4D1JA 3AS0A 1HP4A 5DEZA 3MV01 2YJQA 3AMLA 3OGRA 4GQQA 5BRQA 3BAYA 4BCEA 3NUKA 2PC8A 2VC9A 3WELA 1KR1A 1UUQA 2WZEA 1JFHA 4JHOA 3F4VA 4AY1A 3UG4A 2E9LA 3VINA 3RMEA 3BAXA 1JZ8A 3ZIZA 4WF7A 1XD0A 2J62A 1CDGA 4UFJA 3WEMA 2V3FA 5BXTA 3GH4A 4TOQA 3CZLA 4J3WA 3WDQA 1W3KA 1ZS2A 1AMYA 3CZJA 5BYWA 1JDCA 3EDKA 2YL5A 1FP8A 1I75A 4AW7A 1G5AA 2D0GA 3ZR6A 2Y8VA 4B9ZA 3DC0A 3A4AA 2JEPA 5JBEA 3UERA 5D9NA 3K4DA 3WDHA 4LXFA 1SFSA 4GZJA 4W87A 4AD2A 1S46A 2J7HA 3ZJ7A 1H2JA 1C8XA 2A3BA 4P7RA 3THCA 1PIGA 1NOWA 3RM4A 1QI2A 4EE9A 2J25A 4AZGA 3TP4A 3AYSA 4PMYA 3VNZA 4UCFA 3NJ3A 3WF2A 3WL0A 3GYCA 1B90A 2WMIB 3N13A 1MXDA 1V0MA 2Q8XA 4PUEA 2YKKA 4TX8A 4OBRA 2EEXA 4XUYA 2OSYA 2FGLA 1LQ0A 1SR0A 4ATDA 1R87A 5AC5A 3ARZA 1WE5A 3SCQA 1ISWA 7TAAA 3UG5A 1JAKA 4AZIA 2BY1A 5LYRA 1HP5A 4WIWA 5A1AA 1UHVA 1FH9A 2HISA 1NWTA 1X6NA 2JF7A 5F7UA 4GO8A 6A3HA 5ABFA 2ZUMA 4UQEA 1WKYA 1ZBVA 4XB3A 4N42A 3WUBA 1PIFA 4ZENA 1OB0A 3VDAA 1HXJA 4KMQA 2HVMA 1LL6A 3T2QA 1W9PA 1DWFM 1FHLA 2VZUA 3L2LA 1QHOA 1QNQA 5M17A 1W2PA 3K46A 3VNYA 4NI3A 1OWQA 4IUGA 4CCDA 1JZ6A 4TTGA 3A47A 3PZGA 3GBEA 3SURA 2J7GA 2VVNA 3BAWA 5CQ1A 3WUFA 1GNXA 1GJUA 4ZXOA 2VNCA 5M5DA 2UWFA 1NWSA 1UR4A 3AZRA 4M56A 3T2OA 2CCRA 4L4OA 2GJXA 1M04A 1K6AA 3W25A 1V0KA 2XWDA 5BXPA 1W1PA 2VR4A 3AIRA 5DT7A 4YHGA 2VUYA 4M80A 3UG3A 3W6MA 2EJ1A 2J7BA 3II1A 4YHEA 4QAWA 2XJ7A 2CERA 3F5KA 4DUVA 4W8BA 3WIJA 3VD7A 3GXIA 1BYAA 4PMVA 4Z2IA 1DWGM 3ZJKA 1JDAA 2XM1A 2VR5A 1UKOA 1V3IA 1QI3A 1EDTA 3VUPA 1JZ3A 2D3LA 1JYWA 3PN8A 4AEEA 4EANA 3MMUA 3ARWA 1OIFA 3PHAA 5ABFB 4HOXA 4PEEA 3WNMA 2XVGA 2V5DA 1YQ2A 4FK9A 1XH1A 5KEZA 1HKJA 4HZ6A 1ODZA 4B3LA 3HJEA 4UTFA 2WVUA 4W5UA 4H2CA 5A8NA 3WKZA 4TVCA 3VKKA 2YOCA 5A8PA 1JIBA 2WK2A 2QLYA 4F9JA 3BH4A 4MB3A 5BXRA 5HPOA 4GQRA 3PZNA 1VFUA 1ZBKA 2XUCA 2VX4A 4HMCA 4D6DA 6TAAA 1TR1A 4HZ8A 2FDMA 1X6LA 2WBKA 2WMFA 2PI6A 4NRSA 2CBUA 4NZCA 2OWWA 4W84A 3AHZA 1GQLA 3EYPA 4MNMA 2VMFA 3I3BA 4AC1X 2CKSA 5BROA 4PN2A 2GJXB 1US2A 1DHKA 1D3CA 1QI5A 3ARRA 3LPPA 5EB8A 3KL3A 4CU6A 1HJVA 5AC4A 1LWHA 2IXUA 1GVYA 2PB1A 2ZX9A 1CXIA 3WQ5A 3N15A 2WZIA 1VAHA 3W81A 2WC3A 3M46A 2V38A 5HXMA 2D22A 3W4RA 1N82A 1V0NA 2VRQA 3QOMA 1HIZA 1J10A 3NIYA 3WF4A 1WAWA 1X1NA 3CIVA 3PZVA 2VX6A 3AIBA 5A3HA 1E3ZA 4CCEA 2EBNA 2VURA 2WCSA 2NW0A 2A3EA 3OZOA 1GW1A 1UOKA 2D23A 2FGZA 2J79A 2QHAA 2W63A 1CXKA 2DSKA 1E6RA 4OZOA 5EMYA 2CBJA 1Q4NX 2ZWZA 5BRPA 2DT0A 4YPJA 4AZBA 4AZHA 2ZE0A 3WNPA 1CXFA 4BA0A 2PWGA 5ABHA 1E70M 1CNVA 5JIWA 1DP0A 3ECQA 2XPKA 1EHAA 3THDA 4PMXA 1UQZA 1UR0A 2GJPA 4XZBA 1BAGA 1OM0A 2Z1SA 3SIMA 2BHYA 1FHDA 1R86A 5LA2A 1G0CA 4MAVA 1IV8A 1J9YA 4GPNA 4JZ5A 2VZTA 4QLLA 4BQ3A 4ML4A 4JFVA 3W29A 1VBUA 4MADA 4PMRA 4H41A 1E6ZA 2X0HA 2CITA 2BNJA 3CHCA 4PCSA 3AMGA 5EFFA 3D5HA 3VGGA 5IHSA 3WF0A 1CLXA 1RD6A 3VIFA 3FAWA 1CBGA 2WC7A 2G4FA 2XYLA 5A6BA 2OYMA 1CGXA 1JI2A 1ODUA 4HA4A 4IISA 3IJ8A 5CJ5A 2F61A 2XIIA 1PX4A 1QVBA 3VIHA 2YL8A 3VMOA 2A3CA 3NYDA 4N0RA 1ESWA 1HT6A 1CXHA 1DTUA 1UWQA 1U30A 4X9YA 2XVPA 4L4PA 4AIEA 3WNKA 4DWSA 2CEQA 5C71A 2IUZA 2V3GA 1OD0A 2ZUTA 5HPCA 1LWJA 1U2YA 2X1IA 3G6LA 4JFSA 5A8QA 3PZUA 4JL2A 4BF7A 3PZ9A 3CMGA 4JCMA 2OSXA 3PBGA 4JFUA 2WSKA 1E4LA 4PMNA 1EA9C 4TVUA 1AQ0A 1WP6A 1FH7A 2BHZA 1GHRA 1RP9A 3QGVA 1V6YA 2WHJA 4AD0A 1HVQA 2G3NA 3VIKA 3VGFA 4H04A 1EOKA 3SCOA 3FAXA 2ZX8A 3WD0A 1JNEA 5CLTA 1E1EA 1NP0A 4D6GA 5FD0A 2J7FA 4TX6A 4U2ZA 3OB8A 3WMSA 2ZX6A 3RJYA 4CU8A 3WD4A 2XGBA 3MMWA 4QLKA 1BLIA 3KWXA 3WFZA 1J18A 2VO5A 3WQVA 2EPMX 3KL5A 1EQPA 4U31A 4ATWA 5A6SA 3N1AA 2X0YA 2J8GA 1JXKA 3GZAA 4P8UA 1E6SM 1KBKA 1KBBA 1E5JA 4YN5A 1BFNA 3BCDA 1CLVA 2B31A 1KQZA 4UFLA 1H1NA 2ZUVA 1XHGA 2VZSA 4H8HA 3AIUA 2WW5A 4K68A 2YA2A 1VJSA 1W9XA 3VDHA 1ISZA 1MVYA 2QF8A 4DWSB 1FFQA 2EPNA 1UH3A 3WY1A 4D6CA 9CGTA 2YBUA 1GVIA 4C7FA 3I3DA 1LLOA 3D3AA 2EO7A 1WNOA 1UD5A 4PUDA 3TTOA 1ZJBA 4W8LA 2ZIDA 2YA1A 1TA3A 2JIEA 3ZOAA 3OLGA 1V3HA 4D1IA 2DSUA 1AVAA 4F66A 3W26A 1NWUA 1GQJA 2OYLA 3CPUA 4B3KA 1J01A 1K9DA 1CZ1A 2PWEA 3VO0A 5DMYA 1KGWA 3WEZA 4CUCA 4FLRA 3VMPA 1UA3A 1Z32X 3WN6A 1KQYA 1W1VA 3GM8A 4E8CA 4GI9A 2BHUA 3ZT5A 1W3JA 2ZUSA 1JFXA 1V3MA 1E40A 1VB9A 4MNJA 1E0VA 3VGDA 4WSKA 1CGWA 1E5NA 1VEPA 3BMVA 4IPLA 2D0HA 3NSNA 3ARXA 2W61A 4EAMA 1C93A 5E6ZA 1ZB5A 1CPUA 1QOXA 3EMCA 1JYNA 1QI4A 3IJ9A 5A2BA 1HX0A 4U5KA 4BQ4A 1WZKA 2FHFA 2ZUUA 4QP0A 2EQDA 2O92A 3WUEA 3VX0A 1M53A 1QNRA 3SCUA 3BSHA 1CXLA 2G8ZA 3OLEA 1JG9A 5I0DA 3WH5A 1D2KA 1UYQA 3T0AA 5A6JA 2DSZA 5ECUA 1JNDA 4P7QA 4KH2A 1HL9A 2E8ZA 3PTMA 1J12A 3VDCA 1E4IA 1AQMA 4JL1A 5A69A 2F2HA 4AD1A 4DUXA 7A3HA 3A3HA 5ABEA 3AHXA 4PMOA 1V03A 1VEOA 2CBVA 3W0KA 3ARSA 1BVZA 5M3WA 3CHFA 2OSWA 2ZX7A 1SMDA 1QPKA 3J7HA 3KZSA 1CGVA 1XH2A 5I3DA 3QHOA 4LPCA 1TA3B 3BSGA 3EDFA 4JCLA 3SUUA 1PX3A 4PSRA 1UKTA 2GSJA 1EOMA 2CBIA 4LQ1A 3BAIA 1KXQA 3DECA 4W86A 3PZOA 1M7XA 4W88A 4HOZA 4ZE5A 5D9OA 1UWIA 4PMDA 5CSUA 1NP2A 2WMJA 2E3ZA 4CD7A 4V27A 2ZICA 1C8YA 1E9LA 1VENA 1EGZA 1V02A 4JFWA 2AOSA 4UQBA 1H0GA 1UD8A 5CZKA 4HA3A 1FOBA 1ISYA 2WMHA 5A6LA 3AOFA 1HNYA 2WVTA 5AYIA 1FFRA 2DIEA 4TXEA 2BV9A 1LG2A 2WCAA 3ZSSA 2DH2A 2QMKA 3A4XA 1W9VA 2YBTA 4S3KA 1R85A 1JD9A 1J0KA 4CN4A 3S2CA 1PJ9A 2UY2A 1NOUA 4MTVA 3GH5A 5JBDA 1WDQA 3AQUA 1CGUA 1QNSA 4HMDA 3SCWA 2J78A 1B0IA 4XZWA 5E9AA 5I79A 1OSEA 3RILA 5GPRA 4CU7A 3AFBA 2WHMA 2WPGA 5D9PA 3WBAA 1E72M 4H7VA 2O9RA 1L8NA 5GNYA 5I5RA 4R5EA 4WKHA 3OG2A 1BTCA 1H09A 1E6QM 2J7DA 2CHNA 2EPKX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DSV A;  4AD5 A;  3CUJ A;  5C70 A;  4URI A;  3CBW A;  4JKM A;  2VCA A;  5I6S A;  3U5U A;  4HU8 A;  4IPN B;  1R7O A;  2F8Q A;  1HL8 A;  1VF8 A;  3AHT A;  4A3Y A;  3RJX A;  1V0L A;  3S6T A;  3W82 A;  1TVN A;  2GK1 A;  1I1W A;  1GQI A;  1EO7 A;  1BSI A;  4P8X A;  1NOF A;  3T2P A;  4LYP A;  2D0F A;  5IHR A;  4IM4 A;  4Q22 A;  1W3L A;  3ZT6 A;  3AIE A;  1JI1 A;  3M6D A;  4HU0 A;  4PTX A;  3TA9 A;  5CSY A;  4B15 A;  4Q7N A;  1TZ7 A;  4AD3 A;  4UFK A;  5D8Z A;  1E4N A;  1O6I A;  3L4U A;  3W53 A;  1V6U A;  3PZT A;  1BQC A;  1JYX A;  2XVK A;  1BF2 A;  1VFM A;  4QLJ A;  5FCZ A;  1UD4 A;  1UH4 A;  2XHY A;  1MYR A;  2G3I A;  4NF7 A;  4WSJ A;  4CCC A;  4GZE A;  4MPK A;  4JKL A;  5EFD A;  2DT1 A;  4J28 A;  1RH9 A;  4ACZ A;  3TOP A;  4UFM A;  4ACY A;  1SMA A;  1BVN P;  1B30 A;  1JZ5 A;  1WPC A;  1GOR A;  1CEO A;  2XWE A;  3CHE A;  3K4A A;  3TON A;  1MQQ A;  3VGB A;  1UA7 A;  4DM2 A;  3VD4 A;  4HTY A;  1XCW A;  2EPL X;  4C7D A;  4BS0 A;  3FND A;  5DF0 A;  1E55 A;  1WZL A;  2Y2W A;  1QBA A;  4WLC A;  4QFU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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