The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
51
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sequence length |
136
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structure length |
136
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Chain Sequence |
LSADQISTVQASFDKVKGDPVGILYAVFKADPSIMAKFTQFAGKDLESIKGTAPFETHANRIVGFFSKIIGELPNIEADVNTFVASHKPRGVTHDQLNNFRAGFVSYMKAHTDFAGAEAAWGATLDTFFGMIFSKM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
ERYTHROCRUORIN (AQUO MET)
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| publication title |
Structure of erythrocruorin in different ligand states refined at 1.4 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Chironomus thummi thummi
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| total genus |
51
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| structure length |
136
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| sequence length |
136
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1979-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FRJ X; 1RQ4 A; 3M38 A; 1V4U B; 2MB5 A; 5EYJ A; 2ZSN A; 3UHK A; 1DO7 A; 2ZS0 B; 1UT0 A; 1MYT A; 2OLP A; 1O1O B; 1S0H B; 1Y4Q B; 3OO4 B; 2MYB A; 3W4U B; 3QM5 A; 1IRD A; 3G4V A; 2R80 B; 2MGD A; 1Y7C A; 1G0B A; 4N7P A; 3G53 A; 4MAX A; 4ROM B; 2HBF A; 2O5M X; 2HHB B; 3G52 A; 2HZ1 A; 3V2V A; 1FSL A; 5C6E B; 3VRE A; 2ZFO A; 3U3E A; 2QLS B; 1Y0D A; 1OJ6 A; 1VWT A; 6HBW B; 2D2M C; 1HBI A; 1UVY A; 4DWT A; 3EU1 A; 5HY8 B; 5SW7 A; 5EE4 C; 1HHO B; 1H1X A; 3WCT A; 1YCA A; 2QSS A; 1JP6 A; 2ZLT B; 4OF9 A; 1CO9 A; 1SDK A; 1A01 A; 1AJH A; 2ZT0 A; 3S65 B; 1OR6 A; 1JEB A; 3ODQ A; 2R4X A; 3OO5 B; 4QAU A; 3RJN B; 3WI8 A; 2G12 A; 1CLS B; 1NS9 B; 3GOU A; 1LA6 A; 2GTL D; 4BJA A; 1XZ2 B; 1YIH A; 4U8U A; 2HBC B; 1Y7Z B; 1FHJ B; 1CG5 B; 1C7D A; 2W6Y A; 1I3D A; 1J7Y A; 1YHU A; 1FSX B; 1C7B A; 1FLP A; 4JYQ A; 1HBH B; 4HHB B; 1RQ3 A; 4MQC B; 1YHR B; 1THB A; 4O2G A; 4H2L B; 4VHB A; 1SWM A; 1LFQ A; 4MQG A; 2ZS1 B; 3K3U A; 1COH A; 1MLS A; 4HSX A; 5D1V A; 2ZFO C; 1JPB A; 2ZLW A; 1Y4P B; 1DTM A; 1OUT B; 101M A; 1DXU A; 3MN0 A; 2D2N D; 1IOP A; 1K1K A; 1C40 A; 1YEO A; 2V1E A; 1Y5K B; 5AB8 A; 1MYF A; 3M3B A; 4ROL A; 1B0B A; 1Y01 B; 1R1Y B; 1O1K A; 1DXV B; 2VLX A; 5HLQ A; 4FC3 B; 1HGC A; 3WCT C; 1SI4 A; 1C7C A; 3BJ2 B; 3BOM A; 4NS2 A; 3PI2 A; 1JZM A; 2DN3 A; 4PNJ A; 3EDA A; 1SPE A; 1HDS B; 4HSW A; 1LFZ B; 1YE0 A; 4G51 A; 1AJ9 A; 4O35 A; 3VRF B; 2G0V A; 1EBC A; 3PT7 B; 4F6I A; 1RQA B; 1BIN A; 4NI1 B; 2ZLU A; 1XZ4 A; 1Y4B A; 4FH6 A; 2R4W A; 3A5G A; 2OH8 A; 1O1I A; 1FAW B; 1NWI A; 1VXD A; 1MOC A; 1YHU C; 1DXT A; 4PQC A; 3UH3 A; 3QQQ A; 1Y0T A; 2DN1 B; 1UX9 A; 1JWN A; 1MOB A; 3PI8 A; 4MQI A; 1A6K A; 1PMB A; 1BZZ B; 3VRG A; 3AG0 A; 1CBL A; 1YVQ B; 2ZSP A; 3LR7 A; 4MQK A; 3ZOM A; 3PEL A; 1MLR A; 5HU6 A; 3PT8 B; 2ZT4 A; 1B86 B; 3G46 A; 3K9Z A; 1HDB B; 1G08 B; 5HAV A; 1GCV B; 2VRY A; 5CNG A; 1MYJ A; 1A3N A; 3E4N A; 1DTI A; 1MNH A; 3HC9 A; 2NRL A; 2O5S X; 2GTL A; 4WJG A; 2AUP A; 3PI4 A; 5EUI B; 1HGA B; 1MLQ A; 5JDO D; 4MQJ B; 3OZU A; 1YMA A; 2G14 A; 1M9P B; 1NZ4 A; 1CBM A; 3G4W A; 1OUU A; 3HRW A; 1MLH A; 1M6M A; 2G0R A; 1CH3 A; 5JOM A; 4MQH A; 1EW6 A; 1EMY A; 3WFX A; 3UI0 A; 4TYX A; 3UHY A; 3GLN A; 3ZJM A; 3QM7 A; 3DHT B; 1YIE A; 1V5H A; 4MBA A; 1XQ5 A; 1YH9 A; 1DWS A; 3NML A; 1YVT A; 1HBB A; 1JEB B; 3ODQ B; 3WCW D; 3GOU B; 5CND A; 2G0Z A; 3A5A A; 3GYS A; 4U8U B; 1MLU A; 1IBE B; 1J7Y B; 1VXB A; 4KN3 A; 1DWR A; 1JY7 B; 1RQ3 B; 3NMM A; 1J7S A; 1BAB A; 1G9V A; 111M A; 1Q1F A; 1COH B; 1SPG B; 1Y8H B; 1IT2 A; 1F5P A; 3IXF A; 4H0B A; 2QSP B; 2R50 A; 3HEO A; 1QSI A; 1CIK A; 1MNJ A; 1JZL A; 3IC2 A; 2BKM A; 3KUO A; 3QZZ A; 5CNF A; 3LB2 A; 1U7R A; 1S61 A; 2VYY A; 3VAU A; 3BCQ A; 5KER A; 2M6Z A; 5E83 A; 3PIA B; 1CH5 A; 1Y46 B; 1HBS A; 4O4T A; 1MOH A; 1O16 A; 3MJU B; 4N7O B; 1LFV A; 1FDH A; 1Y45 A; 5C6Y A; 1YEN B; 1BZR A; 1Y8W A; 3G4U A; 1MCY A; 1Y31 B; 3HHB B; 3FS4 A; 1HBG A; 1JP8 A; 1A0Z B; 1MLJ A; 2QRW A; 1R1X B; 1VXH A; 5B84 A; 2MGG A; 3UHS A; 1X9F D; 2LH7 A; 4B3W A; 1HDA A; 2W6V B; 3TLD A; 2D2M D; 3PI1 A; 3RGK A; 1YG5 A; 1J7W B; 3PI8 B; 1YZI A; 3S48 C; 3B75 B; 1BVC A; 1JL7 A; 2MGL A; 3WFW A; 2HCO B; 3OZV A; 1CO8 A; 2HBS A; 2GKN A; 1RPS B; 1J40 B; 1M6C A; 1PBX B; 3ZJI A; 4KJT A; 1N9X A; 2OHB A; 5CHR A; 2PGH B; 4N7N A; 3D4X A; 2GTL B; 4TWU A; 2ZSX A; 2V1K A; 4FWY A; 1K0Y A; 1ECD A; 3AQ8 A; 1HAB A; 1Y4R B; 4ESA B; 2Z6N B; 2GRH A; 5CMV A; 1Y8K A; 2DN2 A; 5E6E B; 4C0N A; 3QJC A; 2R1H A; 2V1F A; 1CH7 A; 2G0S A; 3UHZ A; 1LFY A; 2D2N B; 5CN8 A; 3BJ1 B; 1JL6 A; 1S5Y A; 3UGZ A; 1Y7D B; 3A2G A; 3ONZ A; 1O1P B; 102M A; 3ARJ A; 1Y0C A; 3GQP A; 1ABS A; 1SHR B; 1HBA B; 2VLY A; 1O1N A; 5F2A A; 1O1L A; 3KUN A; 3EOK A; 1BUW B; 1NEJ B; 1XXT A; 1HGB A; 1YMB A; 1ITH A; 1MYZ A; 2AV0 A; 4L2M A; 2LH2 A; 1O1M B; 1DWT A; 3GYS B; 3QZX A; 1CG8 A; 2XKG A; 3ZJS A; 1A00 A; 3AT5 A; 1NS6 A; 1XZV A; 2GKM A; 1DKE A; 2WTG A; 3ECZ A; 1BAB B; 1X9F A; 2B7H A; 2ZSQ A; 2SPL A; 1LHT A; 5ILE A; 1URV A; 1YOH A; 1Y09 A; 2ZLV B; 4ZVB A; 2VEE A; 2H35 A; 1Y0W B; 5JGG A; 4YU3 A; 1V75 B; 3WCU A; 1A4F B; 2AA1 A; 3P5Q B; 3LB1 A; 2D60 A; 3LB3 A; 3A0G B; 1Y4G A; 3BCQ B; 1YHE B; 2QMB B; 4X0L B; 2KSC A; 5KER B; 5ILP A; 3S66 B; 2HHD B; 2BK9 A; 1Y2Z A; 3NFE A; 1V4W A; 1VXF A; 4DWU A; 2MHB A; 2MGF A; 4O4Z A; 1G0A B; 4FWX A; 1Y8W B; 1XYE A; 2DHB A; 1GLI A; 2BW9 M; 5E29 A; 1U7S A; 2PEG B; 1G09 A; 1ASH A; 1O1J A; 1DO1 A; 1J41 A; 1AZI A; 3HYU B; 3AT6 B; 5D5R A; 3WR1 B; 2AUO A; 110M A; 1MYG A; 1Y83 A; 1X9F C; 1MLO A; 1CH2 A; 3CY5 A; 1EBT A; 2YRS A; 2DXM B; 1OBM A; 1YDZ A; 112M A; 1BZ0 A; 3SZK B; 1EWA A; 2ZLX A; 3HF4 B; 3ARL A; 3ECL A; 3ZH0 A; 5MBN A; 3UH6 A; 1Y7G B; 3UHC A; 3WCU C; 2HBG A; 2XKI A; 1Y8I A; 2SPM A; 1NGK A; 1IT3 A; 3WCW B; 3GKV A; 2QU0 A; 1Y4F B; 1BZP A; 3ZJJ A; 1MBO A; 2G3H A; 3MKB B; 4IRO A; 3D4X B; 2RI4 B; 4N7N B; 1XY0 A; 2ZWJ A; 2ZST A; 3UHX A; 4YU4 B; 5HLU A; 3QQR A; 1Y5F B; 4HRR B; 3UHT A; 3UHN A; 1ECN A; 3D1A A; 1QXE B; 1GBV B; 2O58 X; 1LH1 A; 1RTE A; 1BIJ A; 1HBR B; 2SPN A; 3UH7 A; 1KD2 B; 3QJC B; 2R1H B; 1HLM A; 1GDI A; 2GDM A; 1MNO A; 4ZVA A; 1T1N A; 1MKO A; 1AJG A; 3ZJR A; 1FDH G; 1Y35 B; 1UC3 A; 1MLN A; 3ONZ B; 2GRF A; 4XS0 A; 3VHB A; 2W6X A; 1HAC B; 3ASE A; 2LH1 A; 3LQD A; 5EYS A; 1Y85 A; 1NXF A; 1NQP B; 4PQ6 A; 2HBE A; 3GKT A; 1QXD B; 3EOK B; 3UHI A; 1A6G A; 1GVH A; 1BZ6 A; 1S69 A; 1HGB B; 2EB9 A; 3WTG A; 3UHB A; 1LFT B; 5CN4 A; 3ZJO A; 1V4X A; 2MGE A; 1A9W E; 1CP5 A; 1NS6 B; 1YEV A; 1GCW B; 1DKE B; 2ZSS A; 1A6N A; 3BJ3 B; 3QJD A; 5ILR A; 1LJW B; 5EV5 A; 2D2M B; 1CH1 A; 1UMO A; 1J3Z B; 2R4Y A; 3PI9 B; 1YFF B; 3A5B A; 5JGG B; 3M39 A; 1KR7 A; 2BNL A; 1RQ4 B; 3AQ9 A; 4F6D A; 2AV3 A; 2ZT3 A; 1GZX A; 3NG6 A; 4NI0 A; 1XZ7 A; 1JZK A; 2ZSR A; 1YEU A; 3NFE B; 1Y2Z B; 2G10 A; 1IWH A; 1IRD B; 1Y7C B; 1DUK A; 2BMM A; 1MBD A; 3AQ5 A; 2HBD A; 1HV4 A; 2D5Z A; 1G0B B; 4N7P B; 1LFL A; 2DHB B; 4NK2 A; 1V9Q A; 1NIH A; 2HBF B; 1YGD A; 3M3A A; 1DXC A; 3VRE B; 1LH5 A; 2ZFO B; 2D5X A; 2V1G A; 2EKU A; 3HEP A; 1RVW A; 4F69 A; 1WMU A; 2Z6S A; 1Y0D B; 1FCS A; 1VWT B; 104M A; 3AQ7 A; 1Y0A A; 2ZT2 A; 3UHD A; 3EU1 B; 3PI3 A; 1ABY A; 5SW7 B; 3QJE A; 3WCT B; 2WTH A; 2QSS B; 1BJE A; 1A0U A; 1HSY A; 1SDK B; 1A01 B; 2RAO A; 3UBC A; 1NWN A; 5EU2 A; 3GKV B; 4DC7 A; 5KDQ A; 3E5I A; 1YGF A; 4ODC A; 1N9I A; 1YEQ A; 1LA6 B; 1YIH B; 2ZSZ A; 2MYD A; 3WHM A; 1C7D B; 3DUT A; 1WLA A; 1YHU B; 1Y5J A; 1C7B B; 3AQ6 A; 3GQR A; 3CIU A; 3D1A B; 2NSS A; 1THB B; 5CHQ A; 1LFQ B; 4MQG B; 1KFR A; 1BIJ B; 1FN3 A; 3D17 A; 3MJP A; 1Y22 A; 2ZLW B; 1T1N B; 1F5O A; 2ZSO A; 2GNW A; 1DXU B; 1VXG A; 1DM1 A; 2MYC A; 1LHS A; 1CMY A; 3UGY A; 1K1K B; 3GDJ A; 2O5T X; 1C40 B; 4M4A A; 1YEO B; 4MXL A; 1GBU A; 2W72 A; 4O1T A; 1JP9 A; 3WCV A; 4ROL B; 4FH7 A; 1MGN A; 1O1K B; 1YE2 A; 2V1I A; 3LQD B; 1I3E A; 2HHE A; 1CPW A; 4C44 A; 2MGK A; 1HGC B; 3OGB A; 3QM6 A; 1SI4 B; 1C7C B; 2H8D A; 3BOM B; 2O5L X; 1S6A A; 2V1H A; 1UVX A; 2DN3 B; 3WTG B; 1V4U A; 1MNK A; 1YE0 B; 4G51 B; 5CNE A; 1AJ9 B; 2ZS0 A; 4WCH D; 1W92 A; 1O1O A; 1S0H A; 2ZLU B; 1XZ4 B; 3OO4 A; 1Y4V A; 2MBW A; 1Y4B B; 2EVP A; 1J3F A; 4MU5 A; 3W4U A; 2AUQ A; 4MBN A; 3E5O A; 1O1I B; 1DXT B; 3UHW A; 1Y0T B; 1NZ5 A; 1VXA A; 2XYK A; 107M A; 2O5O X; 4MQI B; 1VXC A; 3VRG B; 4ROM A; 1LH2 A; 2HHB A; 4MQK B; 5C6E A; 3WCU D; 3PEL B; 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5F0B A; 3HXN A; 1Y45 B; 3PT8 A; 2H8F A; 4F68 A; 3FH9 A; 1B86 A; 1HDB A; 1G08 A; 1Y4V B; 1CH9 A; 1GCV A; 4OOD A; 3FS4 B; 4F6J A; 1A6M A; 6HBI A; 3QMA A; 1MBI A; 1HDA B; 4F6B A; 1YG5 B; 3NL7 A; 5EUI A; 1YZI B; 1HGA A; 4MQJ A; 3LHB A; 5IKS A; 2W31 A; 1URY A; 1QI8 B; 3MYN A; 4UZV A; 1M9P A; 1BZ1 B; 3S1J A; 2SPO A; 2HBS B; 3MOU A; 1MLL A; 1DXD A; 5EET A; 3WFU A; 2ZSY A; 4G1V A; 1JF4 A; 1K0Y B; 3DHT A; 3A59 A; 3EDB A; 1XZ5 A; 3R5I A; 4F6G A; 4MXK A; 5B85 A; 1HAB B; 1ABW B; 2MGM A; 3TM3 A; 1SDL B; 1UIW B; 3GK9 A; 3H58 A; 2AUR A; 2JHO A; 1Y8K B; 1J52 A; 1F63 A; 1BBB B; 2DN2 B; 4N8T A; 3ECX A; 1MOA A; 1IBE A; 4LPI A; 1DUO A; 1LFY B; 5JDO F; 3DHR B; 5HBI A; 1JY7 A; 5AZQ A; 1XZU A; 2HZ3 A; 3IC0 A; 1S5Y B; 1MBA A; 3D1K A; 106M A; 5MBA A; 3UHU A; 1SPG A; 1Y0C B; 4L7Y A; 1Y8H A; 3GQP B; 3TM9 A; 2MGI A; 1MWB A; 1O1N B; 1O1L B; 2QSP A; 2LHB A; 1MTJ A; 3D7O A; 3G4R A; 1A9W A; 1XXT B; 2GL3 A; 1GDJ A; 1CQX A; 1CG8 B; 3GQG B; 1QSH A; 1A00 B; 3WCP B; 3AT5 B; 1XZV B; 1WVP A; 5CNB A; 1MNI A; 2FRF A; 3PIA A; 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