1EGZA

Cellulase cel5 from erwinia chrysanthemi, a family gh 5-2 enzyme
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
SVEPLSVNGNKIYAGEKAKSFAGNSLFWSNNGWGGEKFYTADTVASLKKDWKSSIVRAAMGVQESGGYLQDPAGNKAKVERVVDAAIANDMYAIIGWHSHSAENNRSEAIRFFQEMARKYGNKPNVIYEIYNEPLQVSWSNTIKPYAEAVISAIRAIDPDNLIIVGTPSWSQNVDEASRDPINAKNIAYTLHFYAGTHGESLRNKARQALNNGIALFVTEWGTVNADGNGGVNQTETDAWVTFMRDNNISNANWALNDKNEGASTYYPDSKNLTESGKKVKSIIQSWPYKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDOGLUCANASE Z
publication title Type II protein secretion in gram-negative pathogenic bacteria: the study of the structure/secretion relationships of the cellulase Cel5 (formerly EGZ) from Erwinia chrysanthemi
pubmed doi rcsb
total genus 119
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1999-03-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1egzA00
2FHBA 1QNPA 4MB5A 3VX1A 3AHYA 3ALGA 2A3HA 1JD9A 2VX4A 1P6WA 3ZR6A 3VIJA 4JKMA 2F61A 2G8ZA 2E4TA 5A8PA 1UA3A 1E6XM 3DHPA 1JI2A 1BYCA 4OKDA 1XRVA 2J7EA 3MUZ1 1VAHA 3ZMRA 2ZUWA 2GJXA 1C91A 3L4YA 4QAWA 4KRTA 3AS0A 1Q6DA 4PTVA 1R8LA 3ARUA 2RGLA 3PZIA 1WO2A 2CNCA 3IJ7A 4ZXLA 5A3HA 2AMGA 3PZMA 4GI9A 3WNOA 3U5YA 1CLVA 3ZO9A 2CETA 1TMQA 1QNSA 4FK9A 1BHGA 4RE2A 4BQ3A 1OT1A 4CD6A 3L2LA 4KRUA 1V0LA 2VZTA 4HMDA 1CECA 4JHZA 1XSJA 3N1AA 1SMDA 1F4HA 5A2AA 3O2LA 2XVGA 1XSKA 4GQQA 1Q6FA 4WKHA 1HKMA 3WDIA 1FA2A 1MVYA 1EO7A 2WVTA 1E6NA 1JZ4A 2V3DA 2V5DA 4WKFA 4CN6A 4TX8A 3ZQ9A 1V0NA 4GXPA 3G6MA 3J7HA 2E40A 1XD0A 2BY1A 2G3JA 2DT0A 1HT6A 1DWGM 2VI0A 5D9NA 4P7OA 4JAWA 1IV8A 1E4LA 2VTFA 1UD3A 3A47A 2QHAA 1GCYA 3FN9A 1PIGA 4V2XA 3WBEA 1C8XA 3UESA 1BTCA 3SCUA 3AIEA 5FL0A 4ACZA 1W9XA 1OBAA 1GPFA 3ARVA 3T0BA 2YKKA 5CSUA 2IXVA 2UY3A 3MUAA 2PF0A 2VOTA 1MW0A 3EBVA 2DH2A 3TA9A 4PMRA 2VVSA 2XGBA 4GI8A 3W26A 2Y2WA 2ZX7A 3TOPA 3VIIA 5I77A 1PX8A 1GQIA 4N0RA 4TOQA 1CBGA 1JAEA 3A4AA 4CU6A 4AWEA 4GKLA 2V3GA 1MXGA 2D0FA 4AIUA 2WHLA 3I3DA 4W7VA 3ARPA 1V02E 4UQBA 2J7FA 2XFFA 3SUVA 1PX3A 2WVUA 4HZ6A 4JIEA 3ZJKA 3WIJA 1V3MA 1NWUA 3GBDA 1B3XA 1JZ3A 4EE9A 2X05A 2OYMA 2CIPA 3K1DA 1QNOA 5ABFB 2X0YA 5JIWA 3B9EA 1ITCA 1V3HA 4PCSA 4M56A 2WKLA 1C8QA 4QLKA 1NOUA 4DWSA 3NUKA 3OBAA 1B9ZA 2GSJA 4CCCA 3AZTA 5I0DA 1PPIA 1HKJA 2ZX5A 5D9PA 2WMGA 3B8SA 4AD1A 2CYGA 3OLDA 1EGZA 2GJRA 3GZAA 5I3DA 1JZ2A 1WCGA 2ZUMA 4RL3A 3CZKA 1UWRA 3SCWA 1VFMA 2QF8A 4M24A 4H04A 2PWHA 5I79A 5A69A 3ALFA 1DTUA 5JUVA 2UY5A 3WDPP 3ZIZA 1UWIA 2WKGA 2ZXQA 3WFZA 1ZBVA 4MDPA 2E0PA 2YLLA 2EXOA 4E4PA 4WJXA 4LPCA 4DUWA 1H5VA 1ITXA 3VOCA 3MUY1 3WDRA 3MSDA 1HP4A 5IDIA 1RPKA 1UQYA 4U3AA 2YLAA 1KWKA 4PSPA 5GNZA 3AIVA 5GNYA 2RGMA 5CJ5A 4GZJA 1E5NA 1SFSA 4JFSA 8A3HA 3OA5A 1WE5A 4GPNA 3AFBA 3GDBA 3ZM8A 1GJWA 3FHQA 1V08A 1KR1A 1ZJBA 1LL6A 1M7XA 3IK2A 1B1YA 1LWHA 1XD1A 1KXTA 4WIWA 1JI1A 3IJ8A 1NQ6A 3CZ8A 4H8VA 1AQHA 1G5AA 2WNWA 1G1YA 4P7NA 2X0HA 4UOZA 2ZUTA 3T2PA 1QW9A 1J0HA 5LA2A 4UQEA 2VX5A 4K68A 1SYTA 4PUEA 5LA0A 2YL5A 2EJ1A 4Z2IA 5HPOA 1CGTA 4UQAA 3VGDA 4AZ7A 4Q22A 2V38A 2J7BA 2FGLA 1PEZA 2WZIA 2WHKA 3AXXA 2PWGA 3VNYA 2BXYA 3BCFA 4F8XA 6A3HA 2WMFA 1XH2A 4D6EA 3WDQA 4CN4A 4Z2KA 4AZHA 3THDA 4GO8A 1GW1A 3CGTA 4AZCB 4J3XA 2CCRA 2XVNA 2G3NA 1W32A 1GOQA 4PMZA 4JCLA 2XVKA 1VBRA 1Z32X 2X2YA 3NIYA 3M7SA 4W85A 2Y8KA 4J3TA 5A6AA 2WANA 1FH9A 1W9BM 2AAAA 3W37A 1HXJA 1A3HA 2WXDM 1U33A 1ZU8A 4JL2A 2G3MA 4QLLA 4TVUA 8CGTA 3AHZA 1Y7VA 2CHOA 4GIAA 4BQ5A 5FL1A 3WH8A 3B9DA 2TAAA 3MS8A 2YDQA 2WC3A 4D1IA 1OWQA 5BXSA 5IFPA 1VF8A 2W62A 3A6OA 2A3AA 2Y8VA 3OGVA 2WMIB 4H2CA 3F5KA 3TTOA 3PBGA 3VU2A 4DM2A 3ZSTA 1GHSA 4BF7A 3UETA 3SIMA 2VCAA 4TVCA 1XCXA 3ECQA 1JYNA 5A94A 3AQUA 3AMDA 2JE8A 3EDFA 4BQ2A 1LL7A 4OOUA 2WYSA 1H3GA 1HL8A 3BXWA 3WELA 4D6CA 2WVVA 5EBAA 1I1XA 5A8OA 4MADA 3T0AA 3WMSA 1W1VA 1AQMA 1OM0A 2VL4A 3VDBA 3ZR5A 1HKKA 2EEXA 1KR0A 4MNLA 3K46A 2YJQA 2CBIA 3RO8A 2WC4A 3PZQA 3CTTA 2YA1A 1HP5A 2DEPA 4HOXA 1XGZA 1ZBWA 3PZTA 3WQWA 1UD2A 4CCEA 1QI2A 1KGUA 2FHFA 3PZGA 5E0FA 2VZOA 3VINA 5KZ6A 3WQ6A 1EA9C 3IAPA 2J77A 5EB8A 3NDZA 1HF6A 4EKJA 1KCKA 3ZT5A 1OGSA 4OBRA 3MMUA 5F7UA 5HBFA 4M80A 4CGTA 2D3LA 3VIKA 2DT1A 3VD3A 4CD8A 3BLPX 1GQKA 1UH2A 1BVNP 4HMEA 3VMOA 3PZVA 2QPUA 1JIBA 3VIFA 3WMCA 1DWHM 2ZXAA 2WLZA 3ARTA 1X6LA 1KXVA 1ISZA 2XM2A 2OSWA 3FXYA 1H2JA 2CBJA 3L4ZA 4KGLA 5IXEA 1JD7A 4PRWA 4GZEA 4MB1A 3VGEA 2E9LA 3GM8A 1ISWA 4R5EA 3RILA 1UYQA 3ARYA 3FAWA 1GUVA 3KL5A 1CWYA 3GXMA 4EAMA 3VGHA 1QW8A 1ISVA 4X0NA 3L4UA 1C90A 4J3WA 1ECEA 3UR8A 1JZ5A 1E4NA 1J0JA 1W3LA 1V6YA 4NZCA 5DF0A 1M04A 1WZMA 5A6JA 1E6PA 1E55A 3HJEA 3WF4A 3W4RA 1MW2A 3CMGA 1QVBA 4KMQA 4P8WA 1AMYA 3TTQA 3CHDA 2F2HA 1UD5A 4OUEA 1DEDA 3VIGA 2UY2A 1EDGA 2DSUA 1RP9A 2WSPA 4AZ5A 2DH3A 1B30A 2CKRA 1CNVA 2VRQA 5A2CA 3KL0A 4PYSA 4JFUA 4MNKA 5LYRA 1C8YA 3SCQA 3ARSA 2J8FA 2WC7A 2BVYA 2VUYA 1UD6A 1ZS2A 1EOMA 3WH6A 1BGAA 5GNXA 1UOKA 3ARRA 1QHPA 1TVNA 4ATWA 1SMAA 2BS9A 1LJYA 3WBAA 1XHGA 1MW3A 5BXTA 4QDMA 3NCOA 5E6YA 2DQXA 3D3AA 1HVXA 3G6LA 2X1IA 2XVPA 2YDRA 4V28A 3KEHA 2V3FA 5A1AA 3LPPA 5BRPA 2D2OA 3SEPA 4TTGA 3EYPA 3WL1A 5I2UA 1JAKA 2BV9A 4QFUA 4GQRA 1W9UA 4IPNB 1CLXA 1JFXA 3RJYA 1E15A 1C93A 1EH9A 3BSGA 2Y4SA 2OWXA 1JZ7A 1NWRA 4LGXA 1JYWA 2VQTA 3B9AA 3T09A 4LYRA 1J12A 2ZXBA 1MYRA 1NP0A 5ABGA 1W1PA 3MO4A 4PSRA 1BLIA 4R27A 3MMDA 4UQCA 1ZL1A 2DDXA 1EQPA 1ZJAA 4B3KA 4MJ2A 4UFJA 3RDKA 2WW5A 1Q4NX 3II1A 3MMWA 1V0KA 1E0XA 2A3CA 3AMCA 2CBVA 5AYIA 2YL9A 3VD9A 3JUGA 4HOZA 4JZ5A 3GNRA 4UQDA 1GOWA 1OIMA 1TZ7A 4P7QA 4A3HA 4UOQA 2EPNA 4XZWA 2WB5A 1LQ0A 4J28A 3CMJA 5FOOA 5CGMA 1HJWA 1VENA 5D9OA 1CXEA 1FHDA 3WMBA 3PTMA 3WF3A 1V6VA 4U33A 4P8XA 1B3VA 1CGXA 1VEPA 1DWJM 1M01A 4PMUA 2ZICA 3QHNA 3OB8A 2VVNA 1PZ2A 4M8UA 3MUIA 1TVPA 4ATLA 3U57A 2BY0A 4W84A 2QLYA 4JFTA 3RM9A 4X0VA 2EPOA 2UWFA 3WN6A 3AS2A 2YL6A 3RM8A 2ZX6A 3UR7A 4CKQA 4HPHA 2VX6A 3E1F1 4KGJA 3NSXA 3CUHA 5HOSA 1JDCA 4N42A 4AZGA 3AMLA 1WDQA 1UR2A 4ATDA 1XH1A 4XB3A 2OSXA 3U7BA 3AHVA 1D3CA 3UERA 1XCWA 4YN5A 4UR9A 1HJXA 3W6LA 3IAQA 5HXMA 5CPTA 6CGTA 3KE0A 3N9KA 4FMVA 4ZENA 1IZJA 1WPCA 4HZ8A 4XUYA 4AY1A 1CGWA 4EANA 5E09A 4ZEPA 2WZHA 3AI0A 3EDKA 1EXPA 3CUFA 4MNMA 1JXKA 1HJQA 2O9TA 5A6LA 3RIKA 1E71M 2W61A 5IHRA 5JBEA 3WQ8A 2WBKA 5A6MA 3GXDA 5ABFA 1EHNA 1HNYA 2GDVA 2YL8A 3CBWA 1UWQA 2QPSA 2ZUSA 3ZJ8A 1HIZA 3WENA 4W93A 3U5UA 5I24A 1MFVA 1ZBCA 3PN8A 1CTNA 1H49A 3F4VA 4UFMA 5AC4A 1BG9A 2YOCA 2OWWA 3VMNA 2EBNA 4M29A 4E8DA 3LPOA 2WK2A 4CD5A 1V0MA 2PC8A 4AEEA 3GYCA 3AIBA 1D7FA 3BAIA 3KZSA 5FCZA 2J75A 1LL4A 2IUZA 3BC9A 5CLTA 2D1ZA 1QHZA 1XC6A 2XVLA 3WDJA 4S3KA 1QPKA 4JFWA 2XIIA 1XV8A 2D3NA 1QI5A 2EQDA 3MV11 1M03A 2EPMX 3SCPA 2DGAA 1WZKA 5DO8A 2WWDA 4Q7NA 3POHA 1VBUA 4U3CA 3WSUA 2DIJA 1LG2A 3WNPA 4GINA 1U2YA 4J7RA 3L4TA 3VIMA 2J7GA 1BF2A 1XSIA 3WEMA 1HX0A 1CGYA 5BXPA 3F5LA 2E8ZA 3QHMA 1ODZA 3VMPA 4NI3A 1PBGA 2Q8XA 4Z2LA 2Y5EA 2DSKA 5BROA 3ARQA 4C7DA 3WNKA 1W91A 1E0WA 1FFQA 1BFNA 3MU7A 1VEMA 3VILA 5DT5A 5C8BB 1J0IA 1C7TA 1E9LA 3WF0A 4PTWA 1WDRA 1ODUA 5C71A 1FH8A 7CGTA 4CVWA 1J10A 1JZ8A 3L2MA 1KXHA 4FLQA 1JYVA 1PX4A 4Z2HA 1MWOA 4P8VA 4P7RA 2A3BA 3GH5A 1E40A 1TG7A 2WZEA 1W9PA 2ZOXA 3DYPA 4W88A 1OT2A 3VIOA 3W82A 3AMGA 3FY1A 2XUCA 5CPQA 5CPSA 2V5CA 2VCBA 1CGVA 3GH7A 5I5RA 3AJ7A 1NM9A 4KWUA 1GJUA 4LYQA 3N13A 4MPKA 4FF5A 4PUDA 1Q6GA 3FAXA 2JEPA 2VT0A 1VRXA 4YHEA 4F66A 2VCCA 1GVYA 4V27A 4AZCA 2G41A 4HU8A 1W2VA 2WCSA 3WNLA 1ESWA 1HN1A 4PMNA 1W9DM 4D6GA 3A3HA 2BFGA 1HVQA 1UR4A 4JKLA 3W81A 1GQLA 2FHCA 2PBOA 3RPMA 1E6QM 5ABHA 4S3JA 1VIWA 1B3ZA 1J01A 4GO9A 4AZBA 4W89A 3N18A 1FOBA 1HL9A 3CHEA 2FDMA 3AISA 2OSYA 5FKYA 1UKPA 4AD2A 3NSNA 4W7UA 2W5FA 5BWFA 1NWSA 2XM1A 1JGIA 4UQ9A 4TVDA 1D2KA 3ZOAA 1H0IA 3LPFA 4B16A 1E73M 4PMOA 5I6SA 1UH4A 1GOOA 1E43A 5A8QA 4UZSA 4HP5A 4HA3A 2WMIA 3TTSA 3WEOA 4B9YA 1J0YA 4PMXA 5DMYA 3WD0A 4CCDA 3SCRA 4D6IA 1J0ZA 1F4AA 1UG6A 4M1RA 2NT0A 1H1NA 4CN1A 1EHAA 1JXJA 1MQRA 1KGWA 4F9DA 4MAZA 1I75A 2VURA 2WM0A 1JNDA 1CYGA 1WZLA 1UWSA 2NW0A 4HU0A 4GI6A 1ISXA 4D71A 1L0PA 1YQ2A 4ZE5A 1S46A 3VGBA 1TA3B 4PEEA 1QOXA 2XG9A 1ZB5A 2WMJA 3N12A 3THCA 1CXIA 3OIHA 2WCAA 3M6DA 3VKKA 2XTKA 4AW7A 1RD6A 2J7HA 5IHSA 4MB4A 4W7WA 1EIBA 3VPLA 4X9YA 5DT7A 1VEOA 3HU7A 1J18A 5FIPA 4AD4A 2CERA 2ZXDA 3ZJ6A 4MNJA 4BZYA 1UQZA 2QMJA 1ZBKA 4NRSA 5EMYA 1TE1A 4Z2JA 2VO5A 4H8HA 4UFHA 3WFLA 4F9JA 2BXZA 1KQZA 2E9BA 2GDUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2FHB A;  1QNP A;  4MB5 A;  3VX1 A;  3AHY A;  3ALG A;  2A3H A;  1JD9 A;  2VX4 A;  1P6W A;  3ZR6 A;  3VIJ A;  4JKM A;  2F61 A;  2G8Z A;  2E4T A;  5A8P A;  1UA3 A;  1E6X M;  3DHP A;  1JI2 A;  1BYC A;  4OKD A;  1XRV A;  2J7E A;  3MUZ 1;  1VAH A;  3ZMR A;  2ZUW A;  2GJX A;  1C91 A;  3L4Y A;  4QAW A;  4KRT A;  3AS0 A;  1Q6D A;  4PTV A;  1R8L A;  3ARU A;  2RGL A;  3PZI A;  1WO2 A;  2CNC A;  3IJ7 A;  4ZXL A;  5A3H A;  2AMG A;  3PZM A;  4GI9 A;  3WNO A;  3U5Y A;  1CLV A;  3ZO9 A;  2CET A;  1TMQ A;  1QNS A;  4FK9 A;  1BHG A;  4RE2 A;  4BQ3 A;  1OT1 A;  4CD6 A;  3L2L A;  4KRU A;  1V0L A;  2VZT A;  4HMD A;  1CEC A;  4JHZ A;  1XSJ A;  3N1A A;  1SMD A;  1F4H A;  5A2A A;  3O2L A;  2XVG A;  1XSK A;  4GQQ A;  1Q6F A;  4WKH A;  1HKM A;  3WDI A;  1FA2 A;  1MVY A;  1EO7 A;  2WVT A;  1E6N A;  1JZ4 A;  2V3D A;  2V5D A;  4WKF A;  4CN6 A;  4TX8 A;  3ZQ9 A;  1V0N A;  4GXP A;  3G6M A;  3J7H A;  2E40 A;  1XD0 A;  2BY1 A;  2G3J A;  2DT0 A;  1HT6 A;  1DWG M;  2VI0 A;  5D9N A;  4P7O A;  4JAW A;  1IV8 A;  1E4L A;  2VTF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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