1ESVA

Complex between latrunculin a:rabbit muscle alpha actin:human gelsolin domain 1
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein
molecule keywords GELSOLIN
publication title Latrunculin alters the actin-monomer subunit interface to prevent polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1esvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1esvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1esvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1esvA04
4BRDA 3VOVA 4EIAA 1GLDG 2QWPA 4ISEA 1NGEA 3ZETB 4A61A 4KBOA 4BQLA 3HM8A 1NLVA 2FSNA 4DB3A 5BRDA 1K8KA 3O5BA 4FWKA 3H1VX 4H5WA 5AQVA 4IO8A 1HKCA 4RCHA 3AARA 4M7XA 3VGLA 3BF1A 5JLFA 1X3MA 4BROA 4BR2A 3VETA 2E88A 2ASPA 4IWVA 2VYPA 4O5FA 4BC2A 5AQGA 3R8EA 1NM1A 3O8MA 3GBTA 5AQMA 1GLJO 3A0IX 4H0VB 3BUZB 3EL2A 4PKGA 3DAWA 4O8KA 4AM7A 1ATSA 5F2RA 4FWRA 4QS8A 1BDGA 2V7YA 3LDLA 3R9PA 3UKRB 4CZLA 3OHRA 2YJEA 2HF3A 4CD3A 2E2OA 2W40A 5ADXA 2FLOA 1J6ZA 5EY4A 4HTLA 2Q97A 3QB0A 3ENOA 5AQIA 4EFHA 5LJVA 1BA1A 1HUXA 1Z05A 2CH6A 2E8AA 3CQYA 4H5VA 1SAZA 3A5NC 2J4RA 2QWOA 3HI0A 3MDQA 3L6QA 4F9OA 3D2FA 2W41A 3WXIA 2Q0UA 4K42A 1IG8A 3C0BA 2IIRA 3H1QA 4BVOA 3U9ZA 3QFPA 3LDOA 3S41A 3QBXA 4FWSA 3CI5A 2ASMA 3IMXA 3R6MA 5EXWA 3M1FA 2A42A 2NZTA 3LDPA 2YHXA 1K8KB 2AP1A 5B8HA 2D0OA 3H45C 2F9WA 4NB4A 5AQTA 5EX5A 1E4GT 3L0QA 3I8BA 2QWLA 3VF4A 3CJAA 3DXMA 1ZXOA 4B1UB 5BPMA 1DEJA 3VESA 2P9IA 4BR9A 4BREA 3B8AX 4WQ5A 5E26A 1G99A 4BRMA 4I6MA 2FF6A 3JS6A 3O1BA 4FOIA 5AQNA 4BVPA 3U4LA 1HX1A 2I7PA 3L4IA 5FPNA 5AZIA 4CZEA 3M6GA 1QHAA 5AQXA 2Q1NA 3IUCA 4CBWA 4FWPA 1NGFA 1Y64A 4BRPA 2GTDA 2V52B 4CZFA 3HZ6A 4CBUA 1JCEA 4CBXA 1LOTB 2HF4A 1LCUA 2A6AA 2A3ZA 5AQUA 2QWMA 2OANA 2KHOA 5BN8A 3D2FB 3FZFA 4IXCA 3O1WA 2BTFA 4BRFA 3ID8A 3FZMA 3LM2A 4XH5A 3KZBA 5JICA 1ZBSA 4DCHA 2YI1A 5AFUA 3CETA 3M3ZA 4FWMA 1MWKA 3HBTA 4K43A 5AQYA 3BF3A 1JCFA 1R59O 5AZJA 3MK6A 3FFKB 4DQ8A 1BG3A 3KVGA 2VCPA 4BG8A 2CGJA 3MN6A 1TYQA 1YAGA 5AFUH 1Z6RA 3EKSA 3ZX0A 4BRQA 2DPNA 4BRIA 3HSCA 4QS9A 1BWFO 1NWKA 1QQMA 1BOTO 1YUWA 4FL9A 3TPQA 3ATUA 3O08A 4HWIA 5FPDA 3EO3A 2HMPA 2P9IB 4H0PA 3AAPA 4A2AA 3I33A 4B1ZA 3UKUA 2GUPA 2ASOA 1HLUA 4CZJA 3VF6A 1Q18A 5AQQA 4ISGA 5AZIB 3VEXA 3MN9A 1EQYA 1DKGD 5KPZA 2P9PA 4CZIA 1S3XA 1NGCA 2D0PA 2YCHA 4JHDA 4CZMA 2P9LA 3MN5A 5AQZA 5TKYA 3WQUA 4MLHA 3CERA 1KAZA 1GLAG 5JMVA 2FSKA 5AQLA 3BP8A 1SQKA 4BRCA 3ULEA 3VENA 3DXKA 3QFUA 3WXLA 2YHWA 1MWMA 2Q0RA 5AQFA 4C23A 5ELZA 5E84A 1NGIA 4H0YB 4B1WB 3EN9A 4M7YA 2P9KA 4QS7A 1GLEG 1GLLO 2H3GX 4EHTA 3CJBA 4A62A 3VEZA 1QZ6A 3MCPA 4IZ9A 3VPZA 4BRHA 5BREA 2FXUA 5AZJB 3A5LC 3ZX3A 4BGBA 2QWNA 1DGKN 4GNIA 4AM6A 3ENHA 2ZGZA 4WQ4C 1TYQB 1HJOA 3EKUA 1ESVA 4YDUC 3H46O 4FPBA 5F1XA 4BR0A 1CZAN 2QWQA 3AY9A 5KQ8A 3U8XA 3D7EO 3AAQA 3CJCA 3FZKA 3MMVA 1ATNA 3W3DA 2GELA 5BRHA 2YJFA 3VERA 2A41A 3UKUB 1C0GA 3P4IA 1SZ2A 1MA9B 4B9QA 4CI6A 3H3NO 4BC4A 1X9JA 2AA4A 3JXUA 2P9PB 4PKHA 1NGHA 2IVPA 1GLCG 1GLBG 2P9LB 4FWNA 3SMPA 4EAHD 4JNEA 4BRGA 2E20A 1NGAA 1XQSC 3FZHA 4IJNA 2V51B 2CH5A 3ULEB 4M63C 1BU6O 3DXKB 4WQ4A 1GLFO 4RTFD 1BUPA 4YDUA 3BEXA 1WOQA 4H5RA 5AQPA 2E1ZA 3VEWA 2IVNA 2P9KB 3UE5A 3VGMA 2NRHA 2QM1A 3GE1A 3FZLA 3H6EA 3GG4A 4LC9B 3VEVA 3CIPA 3GDQA 2FSJA 3FR0A 3WEEA 5AQRA 4MO4A 5EVZA 4BR4A 5BPLA 2ZGYA 3GL1A 4FOEA 1HKBA 1TUYA 1U2VA 4K41A 4BC5A 5CE3A 3MN7A 1WUAA 4FWLA 3RSEB 1NMDA 1T6DA 2ZWHA 4K25A 5AQSA 3WXJA 4MO5A 3D2EA 3DXMB 3W0LA 1KXPA 5AR0A 3FLCO 1KAYA 3ZEUA 4XEIA 1U6ZA 3CQXA 4B1XB 4Z94A 4I6MB 3C7NA 1OKJA 3VEYA 5KPTA 3VEOA 1T6CA 2P9NA 3LDNA 4MLEA 4A2BA 2D4WA 4H0TB 3LDQA 4FSVA 1RDWX 1D4XA 1XC3A 1RGIA 2V7ZA 2GWKA 2QWRA 2QXLA 4CZHA 4EHUA 5BR9A 1RFQA 4JN4A 2P9UA 2YHYA 3CHWA 5AQWA 4CZGA 5KQDA 5FPMA 4BR7A 3EZWA 1IJJA 4JAXA 5KPRA 4BRKA 5LJWA 3SMSA 2A5XA 4BG9A 4FWOA 1X3NA 4H03B 5BPNA 1NGBA 2CGKA 2GEMA 2Q36A 2Q31A 4DHYA 3ATVA 3G25A 1C0FA 3GOIA 4JD2A 4IJAA 1V4SA 3SJHA 3H3OB 2PBDA 2E1YA 2P9SA 2EWSA 3WEEB 3A5OC 1HKGA 3LM9A 3QBWA 1H1VA 4H0XB 4FWQA 4WQ5C 2D1KA 1YXQA 2GWJA 2E2NA 5ADXH 1U2VB 3A5MC 5AQOA 1BA0A 4GY2B 2BUPA 2NLXA 3O6WA 2F9TA 2FF3B 3SLCA 3RSEA 3VGKA 3O4WA 3WQTA 3ZX2A 4BR5A 2UYTA 3D2EB 3TU5A 1QQOA 1NGDA 3ZETA 4B1VA 2I7NA 3QMLA 3ZEUB 1T44A 4BC3A 3LL3A 3HTVA 1V4TA 1NGJA 4CZKA 5JLHA 5LY3A 4ISFA 2QW9A 3KHYA 3DWLA 4RWTA 3C7NB 3IDHA 5FPEA 5AQJA 2PAVA 2P9NB 3WUHA 4J8FA 4NO7A 1TUUA 4PL8A 4FPAA 1MDUB 4JHDB 2CGLA 2A40A 2Q2RA 2P9UB 4BRAA 3A8YA 1BO5O 3CJ1A 2WUSA 3DJCA 3QICA 3UB5A 4PL7A 1XUPO 1S22A 3F9MA 4XH1A 3WT0A 1ZC6A 4BRLA 5BRFA 4B1YB 2E2QA 4E1JA 4BGAA 1P8ZA 4L3QA 4CD1A 3UKRA 1E4FT 3J8AA 3CJ9A 4JD2B 2HOEA 2ITMA 3WXKA 1YVNA 4BRNA 3QDKA 4BQZA 3CJ7A 5BN9A 1QQNA 4Y0WA 3O80A 1NBWA 5AQHA 4CJ7A 3VF2A 1HPMA 5F0XA 5I9EB 2P9SB 5EOYA 5AQKA 2VWBA 4FO0A 4PKIA 1JCGA 4H5NA 4H5TA 2IVOA 1QZ5A 4WYBA 1KAXA 2E2PA 2ZF5O 3FGUA 4XH4A 4H0OA 3SK3A 1ATRA 3U9DA 3IFRA 1NGGA 3FE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRDA 4EIAA 4CJUA 2JWKA 4E89A 4JI7K 3AO4A 3OYKA 3ZETB 4N56A 3F9KA 2ZM6K 3VQAA 4KHPK 4CHYA 1WSHA 3SAHA 1S6PA 4J2DA 4CFCA 3H1VX 2HBLA 1U47A 5AQVA 3VGLA 4BROA 1Q7YO 4DQRA 4BR2A 4JI3K 3VETA 4FYDA 1VSJA 2VYPA 5KTQA 3MXMA 3AGKA 3SAFA 3I0SA 3C6HA 4H0VB 3BUZB 4PKGA 3L2QA 1RDAA 1BDGA 1HQEA 3ITHA 4DUYK 3MEEA 2OTLN 4JKBA 2E2OA 2FLOA 5EY4A 1D9DA 2Q97A 2G8VA 2KW4A 3MEDA 1ZBFA 3BY5A 2HSTA 4EFHA 5GADP 1N34K 1BA1A 2CH6A 4FZYA 4Z4HA 4H5VA 4Z4EA 2J4RA 2QWOA 4X64K 3LANA 3WXIA 3SBGA 3V9XA 2HBMA 3THYA 4K42A 4CEEA 3C0BA 3SJJA 1FK9A 3QFPA 4OO1J 1REVA 4W5NA 4FJGA 3S41A 1DLOA 2P5GA 1FW6A 2ASMA 3SQ0A 5EXWA 3NVKA 3V6DA 2NZTA 4CEZA 2HHWA 3V1OA 3WXMB 3G4SN 2B4JA 3MWTA 4NB4A 5AQTA 4DR4K 3CYMA 2QWLA 3M8PA 3ASMA 3L3VA 2JLEA 5BPMA 3WNHA 1DEJA 4CF2A 3J7YP 5SWMA 2FC0A 3AVLA 2F4VK 4PY5A 2P9IA 5E26A 3OYEA 1T8EA 4FOIA 5AQNA 4BVPA 4CEOA 3L2RA 2WFBA 2VQFK 3L4IA 1SL0A 5FPNA 1JL1A 1QHAA 4K8XA 3NF7A 5KRTA 3RVCA 2X74A 3O3GA 1Y64A 3AVBA 4BRPA 3HZ6A 2HBJA 1JCEA 4M3WA 3VQDA 1WLJA 3EY1A 2A3ZA 2OANA 2BE2A 4Z4GA 4KTQA 4DWIA 3FZFA 4FLVA 4IXCA 4HCBA 2BTFA 4BRFA 3ID8A 4XH5A 4JK7A 3L2UA 4PHTX 5AFUA 3AVJA 3M3ZA 1MWKA 4FWMA 4K43A 1NKCA 1S5JA 4M3TA 1JCFA 1RT7A 3DM2A 3V9UA 3SUPA 4JI4K 3FFKB 2VCPA 3ZYYX 2CGJA 3MN6A 3G6EN 1WAFA 3NF8A 2VG6A 4FW1A 3EKSA 3ZX0A 4BRQA 4DFMA 3HSCA 4BWJA 4KHSA 1XHZA 5IWAK 1SL1A 1BOTO 4FL9A 1K73O 3DRPA 1NK5A 3ATUA 4L8RB 2HVIA 4BE7B 3NGYA 3ZT1A 5FPDA 3EO3A 2HMPA 2NRXA 2OZSA 5SZTA 4KH5A 4NXNK 3UKUA 2GUPA 3J7AP 3T19A 4CEQA 4FLTA 2UU9K 4O4GA 3VF6A 1KC8O 1RT1A 3NH1A 4OLAA 1EQYA 1DKGD 3HK2A 3HPOA 2YCHA 1NGCA 4HCCA 3P5JA 4DR1K 4F3TA 5TKYA 4EZ6A 4KHUA 4C8LA 3CERA 1GLAG 1LAVA 3P31A 5AQLA 3FFIA 3LPTA 4TSXA 3P1GA 4WCEL 5FROA 4BRCA 2ATQA 2O8EB 5J2QA 3WXLA 2YHWA 1MWMA 5K14A 4C23A 5E84A 3HOTA 2XHBA 1RNHA 2RPIA 1A5XA 3RTVA 4O5BA 2VWKA 2KQ2A 1FJGK 1QZ6A 2FXUA 4G1QA 1DTQA 5AZJB 1C0MA 1EETA 3ZX3A 2QWNA 4AM6A 3TAMA 4C1NI 5BR8K 1W9HA 3VQCA 3HPGA 1RTIA 1VRUA 2ZD1A 3FZKA 4I2QA 2ZJQL 2GELA 2YJFA 4OGEA 3TARA 3PSFA 4IFVA 3T3FA 2F7TA 1J9AA 3OYFA 1WSGA 5J2NA 4LFCK 4WFAL 1SUQA 3H3NO 1VQON 3HXMA 1IV0A 1NGHA 2IVPA 1OH7A 4W5RA 4EAHD 1TK8A 4BRGA 3EEQA 1M1KO 2O8DB 2QA4N 3HSTB 1LW0A 2D0AA 4FK4A 2V51B 3MEGA 3K5OA 4E72A 3CMAN 3VA0A 4M63C 1Q8IA 1J5OA 4N5SA 1VSHA 1EKEA 3IRXA 4H5RA 5AQPA 3SBTA 1L3UA 3DLLL 1Q9XA 2IVNA 3GE1A 2BANA 4LC9B 3VEVA 2Z1GA 1VSLA 4B9TA 4FW2A 4FOEA 4FJ8A 1BIZA 4I7FA 1U2VA 4K41A 4MDAA 4F3OA 3OA9A 4WFNL 1EXQA 5AQSA 1LWCA 4FJJA 1F21A 3O3HA 1RDUA 4DTUA 1B9FA 3D2EA 5C42A 4CHNA 3W0LA 5MLCQ 3OYAA 5J2PA 3LP3A 4CJEA 3CPWM 2ZJRL 3AVNA 4N41A 2KFZA 4RW9A 4I6MB 3C7NA 1A5WA 2P9NA 3LDNA 4A2BA 4C8OA 3LDQA 4FSVA 3VQQA 1D4XA 5GAGP 3SNNA 1HNXK 3L4QA 2V7ZA 2O8CA 2HHHK 4CZHA 3RMCA 3CHWA 1ASWA 3EZWA 3CFPA 3JAMO 4B3TK 2QKBA 4BG9A 1NGBA 4HTUA 3LDSA 4IFEA 4JKFA 1NJZA 1EO1A 3V81A 2GEMA 2Q36A 4IOCL 1T3VA 3LP1A 3THXA 3GOIA 1C0FA 4IO9L 3EE9A 3CC4N 3N4QA 1SV5A 2P9SA 2EWSA 4UQGA 3K5NA 3P39A 5C2DA 3CM5A 3PLAA 3ALYA 4FK0A 1B9DA 3O6WA 4KV8A 4DV7K 2F9TA 2OYQA 2HW3A 3WQTA 1VQ6N 1WSEA 2NRRA 3ULDA 4B9LA 1IBLK 3V4IA 5LMUK 3K57A 1T44A 4E7LA 1NGJA 4CZKA 5HRRA 3TANA 3SI6A 4H8KA 3MAQA 2QW9A 1FKPA 4RWTA 1U49A 5FPEA 4DTXA 4DU4A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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