1EX5A

Fructose 1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVAPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title A conserved glutamate residue exhibits multifunctional catalytic roles in D-fructose-1,6-bisphosphate aldolases.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 121
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ex5A00
3C2EA 4NNCA 2QCMA 3HJZA 2NWSA 2H6RA 2J27A 1X1OA 3R8RA 5F1UA 5G1YA 1W5NA 5BW6A 4E2BA 2NLIA 2A21A 3EKLA 4N9CA 3C61A 4IMCA 1LOLA 3G1AA 1BWKA 1F2JA 3QM3A 4AHOA 1JCYA 3W7NA 3H55A 5CSSA 1OFQA 3LRKA 2I9EA 1PCKA 1PIIA 1W54A 3B4UA 5AHEA 2CLFA 2GQ8A 1JQVA 1W5QA 3V1PA 1F5ZA 4MLRA 1MEHA 3FYOA 5EPDA 2ABAA 5G2HA 3LHVA 4RV8A 3W83A 2NUXA 1JCXA 3O8AA 3P81A 1XUZA 4R53A 3W7OA 5D2XA 4UIOA 1FWRA 3DHDA 3OBKA 4FF7A 3SFKA 3UWVA 2NXIA 3HGRA 3W86A 1OF6A 1LTDA 3DI1A 4POCA 4RLIA 4WY0A 4CQAA 4UNLA 1WBJA 1F7BA 4TIMA 1F05A 5G5IA 3FOKA 3O05A 4FNTA 5G4EA 3DZ1A 4FXRA 1SZGA 3W85A 1OK4A 4H6KA 3CWNA 3VI2A 1WDWA 3DHFA 1AW5A 1LORA 3S5NA 2EPHA 4WZHA 2DJLA 1UASA 1QPOA 3M43A 3EXSA 4NJGA 4RKAA 1NAL1 5HWMA 2VEKA 2PRLA 3L21A 4MYXA 3R13A 3NQGA 3G1YA 1TPFA 1GT8A 2UV8G 1DHPA 1GVSA 4LC8A 1ONRA 3EWBX 3S6DA 3G8RA 5HNRA 5AC7A 3L0NA 5LGZA 1R2RA 1ZAIA 3CWOX 2TMDA 3UY7A 3B0UX 3GDKA 1A5SA 3CPRA 1QCWA 1DQXA 2Y7FA 2QCHA 2WOQA 4XKYA 2WV8A 2JKEA 2YZRA 4Z1AA 1LOQA 3LV5A 2DZSA 3U8GA 4YCPA 1R30A 2W6RA 5FEZA 2YDAA 4CQ8A 2CLHA 1KBJA 2HMCA 3BPWA 2CWNA 4H3DA 1L6YA 4MPQA 1ZAHA 4JGDA 1RQBA 4NU7A 4OV4A 4LC6A 1KFBA 3NL5A 5D09A 2EAWA 2ZRYA 2JBMA 3MYOA 2HS6A 1I2QA 4ORMA 4YWIA 5LHFA 2QR6A 4FXSA 1QPNA 3VKJA 2X1SA 2Z0IA 3I7SA 4IGHA 4JX5A 4LV4A 1K03A 4R34A 3C8FA 1G4PA 1FY6A 2XN1A 5AHNA 3G22A 1P1XA 1EPXA 1QPQA 2FLIA 4QAIA 2YXGA 1SSGA 4N6FA 4HIBA 2NUWA 1F6KA 3DU0A 1GTEA 2LLEA 4LVDA 3NQEA 3L67A 4M7TA 1EIXA 5D04C 1G67A 1KM6A 4UMCA 3VCRA 3O15A 1D3GA 4PH6A 2R8WA 3W3OA 4A21A 1SO4A 3SW6A 5C6MA 2X1UA 1VCVA 4M19A 3QW4B 4Y8FA 1WBHA 2BXVA 4JR5A 4CNPA 2P0OA 1AL8A 2BZNA 4JTGA 3TNOA 1LOSA 2V81A 2E6AA 2E1DA 3PBUA 2HS8A 1JUBA 4ICNA 1A5CA 3NPWA 1KTBA 3M5XA 2WNZA 4I9AA 4P61A 3W22A 1G7UA 3P60A 3NDOA 3NGJA 1SZFA 4K38A 5CG7A 1DJQA 4P2VA 4HKPA 1UBSA 5EMUA 4NUWA 5I3FA 3NPVA 4M5PA 2J88A 3WFAA 3O16A 1O5KA 4PC8A 2ZTJA 5F2IA 2CZDA 3VE9A 3QPYA 2CFFA 3G0XA 4BR1A 3S1VA 4KKXA 1CI1A 3OHIA 1KFLA 2GUUA 4GFSA 5F4SA 2V5LA 4UR7A 1TPC1 3M9YA 2GOUA 2Z2UA 4CNNA 4QQ3A 1ME7A 1H1ZA 1W5OA 4NX0A 4JD4A 2QDHA 3OEXA 3GDRA 3FFSA 2Z1BA 3W1TA 2X2GA 1YDOA 5DBUA 3W2KA 1YTEA 4A3UA 2Q3OA 3P7YA 1VC4A 5DBTA 1RR2A 3UWZA 4O16A 2E5BA 2H90A 4JTSA 2QAFA 3B06A 1GZGA 3GXNA 3W7CA 3QW3A 3W2UA 1PL9A 3IGSA 2RH9A 4ALDA 3E02A 4UNKA 4UTKA 4O12A 2ZZ7A 1DOSA 3EX4A 3C6CA 2EHHA 4JTLA 1OX4A 2FB3A 4WXYA 4CNOA 1T99A 3MI3A 1VS1A 5FF4A 5BOOA 1M5WA 3EX2A 2H3DA 1L6WA 2CLOA 3MP3A 3IEBA 2A7NA 5I3KA 4LNYA 5FEWA 2CU0A 2DU2A 2R91A 4NT0A 3P5ZA 1KLYA 4RZ6A 3ZWTA 4I7VA 1OFPA 1ICPA 4HHPA 3L2IA 2ZQ0A 4QJ1A 4DQWA 1A53A 2YPIA 2VFFA 3TROA 5G2WA 3JRKA 5LZLA 2BTMA 1H51A 1DQWA 4LT9A 3CHVA 2V5BA 2B0MA 5DXYA 3G1VA 2W0UA 1K3UA 4GNJA 2YCEA 1RQEA 4FX8A 1OFBA 1QNVA 2W79A 5AHIA 4UTUA 1VZWA 4XQ6A 4CCCA 3MBDA 4JTIA 3M5ZA 4Z0SA 3GAYA 5LHEA 3E12A 4O54A 1ICQA 3LRMA 4UMAA 5D2WA 5I3IA 4WUIA 4OU1A 3N34A 1TTJA 4OV9A 4AB4A 3G1XA 3SGZA 2RFGA 2CZFA 3D0CA 3QPZA 2P10A 5HJLA 3STGA 1XBXA 1GWJA 1N55A 4QITA 2FJKA 3LV6A 1W0MA 3SZ8A 3RFAA 5SWUA 2ZFAA 3BK0A 2EKCA 2OT0A 1Q6LA 4HT3A 4JYFA 4FX6M 4IMFA 4BWLA 3TCEA 3NQMA 5AC6A 3W9ZA 3RLVA 3P61A 5LNUA 3W1MA 4IPIA 1YDVA 4IJBA 3TW7A 3LRLA 3QMTA 4BF9A 3SJ3A 4DF1A 1OX6A 3O6YX 1ZFJA 3ABSA 4AVFA 3UY8A 3UXDA 3Q37A 2RDUA 1H50A 2CLKA 3TC6A 2WQPA 3UZ5A 1OFEA 3TKFA 1J2WA 3W1QA 1PE1A 1EP2A 1EA0A 2QJHA 3AO0A 3CT7A 3EX3A 1LLZA 4LW7A 3NR0A 3FA5A 1Y0EA 1HO1A 5J5DA 2VFHA 3QF0A 4FIQA 4ZQMA 3W7GA 4NQ1A 4OQVA 3QQ0A 4WD0A 5D37A 5HWNA 4X3ZA 3PUEA 2PRHA 4PL1A 5F2GA 3OA3A 3LCHA 4AWSA 3ABOA 3QQ1A 1A5AA 3FIGA 1VR6A 4DO5A 2ISSA 3R5EA 4ZQCA 3A9IA 3S9YA 2BWGA 1EWDA 4FNSA 2RHGA 2D73A 1X8FA 1GVOA 3AJXA 3S1XA 4O28A 1RZMA 3M5YA 1JUKA 5D32A 1IIGA 3TSDA 1FXPA 2FQIA 1R2TA 2QCDB 1EEPA 4Z08A 5HUPA 2WKJA 3W87A 3LCWA 3TQKA 3GZ3A 4HSNA 4XTIA 3GR8A 4IMGA 4Q4KA 3TJXA 1OF8A 2WPBA 2ZA3A 2EGZA 3TK7A 1X6UA 2Y61A 1IGSA 2ZCGA 1TV5A 2Z6IA 4K8HA 4JDBA 4TO8A 1SO6A 5F4XA 1HL2A 3PBYA 3ABQA 5C5YA 4LVBA 2IQTA 3GNDA 1TTIA 4RXFA 2QCCA 3MI2A 4UTHA 3SIZA 1H5YA 3E9AA 1KFJA 2X16A 3LXAA 4IWWA 2OX1A 3UWWA 4TX9A 3P67A 2VFDA 1ADOA 2RDTA 4LVFA 1TRDA 1WAUA 1Q6QA 1X7FA 2ZA2A 1HO4A 2PCQA 2DP3A 3IIVA 4NNAA 5K4XA 4NXSA 1KM0A 3GDLA 1LLWA 3S0CA 1BEUA 3LERA 1I4NA 3L5MA 4Y6GA 1UUMA 5BMXA 2Y63A 4MYAA 4N2YA 4BI6A 2B7QA 3U2OA 5D33A 4PODA 1XDLA 2QF7A 1FWNA 4YLWA 3G24A 5AYZA 2GVLA 3W2LA 1IXOA 2JGYA 4KFOA 1F73A 3A5VA 3IIZA 1XM3A 4CCDA 1WOAA 5F4WA 2O7QA 4N02A 3NQVA 3VNDA 1WYIA 3WK2A 2YYTA 2VKZG 1WOBA 3LTSA 3CM4A 1JUEA 1UJPA 2A0NA 2A5HA 2V82A 3M6YA 3W7DA 5AHMA 3NQFA 1SO5A 3ZFHA 3NOEA 3W7JA 4JNMA 2RDWA 2QKFA 1JCJA 3PY2A 5HQEA 2DJXA 4B5NA 3OVPA 1FWTA 4RR4A 3UYCA 2PE4A 3O1NA 5DELA 3T78A 2E5DA 4OHQA 1I8JA 1YTDA 3BLIA 4AF0B 4CCEA 4BFAA 3M1ZA 3HF3A 2ATMA 4O50A 5DCDA 2HTMA 5CPOA 2ZRUA 1CX9A 5E1QA 4IX0A 1TB3A 1YYAA 3G1SA 1G69A 3TR2A 4WXZA 4JTJA 3IGXA 1I45A 3VFLA 5D2YA 4GRSA 4JTKA 2XN2A 5CPMA 1JCMP 3SSJA 4S2BA 4A22A 5AN7A 3INPA 1H7RA 1XI3A 2ZRVA 1LDCA 3QZEA 4LTSA 4GE8A 1G4SA 2RKXA 4TMBA 2WSYA 4HNVA 2QCFA 1TJPA 4UR8A 4XUGA 5C2XA 3HBLA 3NVTA 1W3TA 4HPJA 2VFIA 2EF9A 1V5XA 3M47A 4FB7A 2FPYA 3PBWA 2C18A 4ORIA 2QJIA 4LV9A 2QCLA 3UXAA 2JKPA 3E0IA 1H61A 3HQ1A 4MY8A 3IVTA 3TQVA 3WJZA 3RK8A 1LCOA 1W37A 3MI6A 1KFEA 3M44A 4HSOA 3S5OA 3PWAA 2YW3A 4FX7A 1QR7A 2B7OA 1TTQA 1H63A 1TV7A 3EWWA 3FEMA 3ZS4A 2NX3A 3GYEA 1U5JA 5F2MA 1IXNA 4I7WA 2V2DA 3IRDA 1TTPA 3NM3A 3FKRA 5HR7A 3MBFA 3MJYA 2WJZA 4PCFA 4MFDA 4JTEA 3NQ7A 1KM5A 2WSRA 4EVZA 1VYSX 3LDVA 4O11A 3I7RA 2DZXA 1TQXA 5J5RA 3TDFA 3MP5A 1VYPX 1LRTA 1ML1A 3LCXA 4NXKA 4DO6A 3K30A 3S8HA 4D2JA 1XCFA 4UTWA 1LRNA 3NQCA 3I7QA 4LRTA 1WXJA 3LX9A 1SFLA 3E49A 3N14A 2WNQA 3LOTA 2DZTA 5CZJA 2GQAA 1TV8A 5D2TA 1BKSA 4BI5A 3W6YA 4YL2A 4N6EA 2ZZ1A 1C29A 1GG1A 3DFOA 4DO4A 5AFDA 1LROA 3TXVA 2E77A 3FJLA 1O94A 4Y90A 1P4CA 3IIXA 4GWEA 4JTUA 1GVRA 4Q33A 4QIUA 1XFBA 1PHWA 3HIJA 4AH7A 1W5PA 2FB2A 3BW4A 4AEOA 5BRBA 3DAQA 1KM4A 2Q8LA 3W84A 3LI0A 3GDMA 2ZZ3A 4DBEA 3QMRA 4Y96A 3EWYA 3UNDA 2BSLA 2V0TA 5AC8A 3ABRA 1QPRA 4G1KA 3HGSA 4N9DA 3OG3A 1F74A 1WX0A 3NM1A 1WV2A 3T7VA 4IOTA 1OFRA 1SW3A 4E38A 4HPXA 4YCOA 1O4UA 1FUYA 5LNVA 5FF0A 4U4MA 4UFMA 4ZZ9A 2NX1A 1KBIA 3W7EA 4HNNA 2C19A 2VELA 3NA8A 1TPWA 2V30A 3H53A 5ABTA 5DXXA 1ZY9A 4LVAA 4WY0F 2G95A 1KM1A 2YYUA 2VOMA 4C1KA 3HG4A 3LXBA 4NNBA 1H7PA 4IUOA 4NJHA 3C4UA 3TW6A 3VE7A 2C14A 5K2ZA 1JQXA 2NWRA 3R89A 3QRHA 1EX5A 3L0KA 4O0ZA 3DI0A 3QEZA 1UB3A 4L4LA 3S1UA 1FDJA 1K02A 3FKKA 1Z41A 1KTCA 4O8RA 1EUNA 2VEMA 3NAVA 1S3HA 2C15A 3PSVA 4JS3A 5LGXA 3BG9A 3RLUA 1W3NA 2NZLA 4RX0A 1YTKA 2ZA1A 5EYWA 3TC7A 4K37A 4L4MA 2VEIA 1J5TA 3KRSA 3MWAA 1LRQA 1WQ5A 3BGGA 4UCGA 4UFHA 1GPWA 3EXRA 3HGOA 1MXSA 3W71A 1KW1A 1AL7A 5F1VA 4XZ9A 5H2ZA 4RZ4A 3P84A 3GX9A 3QSRA 5IBXA 1YXCA 1PCWA 4JICA 4Z1CA 1TPDA 3NZRA 3M16A 4M6QA 3EXTA 1O5XA 4TR9A 2ABBA 1ZJIA 5CZTA 4HNUA 2OCZA 4XWUA 1G6CA 1W56A 3GK0A 1V7YA 1RQHA 5HUOA 1FDZA 2C13A 2YX0A 3GXTA 3LLDA 2NXGA 2AQWA 3TFXA 1KLZA 4NZJA 3GVGA 3TH6A 3CTLA 4K7YA 1QOQA 2JKAA 2Y7GA 1A5BA 7TIMA 2G97A 2ZRXA 4FHAA 1ZHAA 2CLIA 2ISWA 4LWWA 4O10A 3NPUA 2E6DA 4FIRA 4UTLA 3TE9A 1MEIA 1H7WA 1EWEA 4ZQNA 1THFD 2ZRWA 3GNNA 1T0OA 3L5AA 3LHUA 5D30A 2YGYA 5KTLA 2QUUA 2A85A 5AHLA 3W73A 1A50A 5AOUA 1W31A 5L9FA 4AMAA 1VPXA 4LS2A 4OGZA 3HG2A 3UWUA 1FCQA 4O17A 4DBDA 3G1FA 3W7MA 4AHQA 4RXGA 4K7VA 2E09A 4TMCA 1Q45A 3B0PA 5EKYA 3S42A 2C3ZA 3SI9A 3SR7A 3T40A 2GPTA 4ZL1A 1FDYA 1VJIA 4MZ8A 1KV8A 1AW1A 1G4EA 5DCBA 3DFTA 4WQ6A 4PEKA 1XBZA 1SFJA 1JR1A 4MKNA 2Y7EA 3TV8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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