1F05A

Crystal structure of human transaldolase
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
MESALDQLKQFTTVVADTGDFHAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQELVEEAIAYGRKLGGSQEDQIKNAIDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARRLIELYKEAGISKDRILIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKSYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFSYKTIVMGASFRNTGEIKALAGCDFLTISPKLLGELLQDNAKLVPVLSAKAAQASDLEKIHLDEKSFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRKFAADAVKLERMLTERMFN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords TRANSALDOLASE
publication title The three-dimensional structure of human transaldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 133
structure length 322
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2000-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f05A00
1X6UA 3HGOA 3TSDA 1WDWA 4NNBA 1SO6A 2ZRZA 3GDLA 1FCBA 1D9EA 2Y88A 3O1NA 3W74A 4N6FA 4IJBA 3P60A 4JX5A 1H61A 1YTDA 4OT7A 1XL9A 1E51A 4CCEA 1PIIA 1S5WA 3HPSA 3WK3A 4QISA 3S42A 1L9WA 4IUOA 3L21A 4JYFA 3DFSA 5C55A 5GVJA 4DO5A 4O8RA 5I3JA 2Y61A 1JRBA 1AK5A 4CQ9A 1ICSA 1OF6A 1PV8A 1TB3A 4LS1A 5HULA 2I9EA 5HR6A 4UTHA 2OCZA 2EGZA 2A7RA 4E38A 1DORA 4IMCA 2Z0IA 3G1AA 5KSWA 3M5ZA 3NL2A 1R30A 1YDOA 5LHEA 2ZA1A 2C1HA 2X30A 1FWTA 3NQ2A 1KM4A 4ZVJA 3BPWA 1JCMP 1G69A 1EA0A 3CT7A 4M6QA 4R34A 3PULA 5I3IA 5EY5A 3EB2A 3M7WA 4UNKA 4WX2A 4Y90A 5AHMA 1A5SA 5D04C 1EP3A 2Q8ZA 4RXGA 3G3DA 2FIQA 3IEBA 1JR1A 1FY6A 3JRKA 1QPOA 2GVGA 3UXDA 3TKFA 3TIMA 3G1HA 4RJEA 3SGZA 2ATSA 4YL2A 1OABA 1O94A 1VCVA 3FLUA 4FNPA 4R7JA 3B03A 4UR7A 3P61A 1NFBA 1G6CA 3OG3A 7TIMA 2V30A 5AC8A 3TJLA 1K7EA 4IXHA 3UYCA 4JX6A 4TR9A 4KFPA 3TXVA 4JY8A 2DORA 3GDKA 2FPTA 3PUDA 1S3HA 3CIXA 4QIUA 4GUFA 1GVQA 1OF8A 2QUTA 3W7RA 3E9AA 4O1CA 4WD0A 5K4ZA 3SSJA 4XTDA 3PVFA 1ZALA 4LWWA 4BF9A 1TIMA 1TCDA 5H91A 1LRTA 3IGXA 2ABBA 4FXRA 3WJSA 2VEIA 1X1OA 1UB3A 3TSMA 2Y6ZA 1LOLA 4RR4A 4O14A 2QCHA 3M1ZA 3IGUA 4IX0A 4JYEA 1J5TA 3CEUA 1U5JA 2ISWA 4IWWA 1TO3A 1K02A 1KTNA 2YW3A 5E0KA 3W83A 3PUOA 3W7QA 3S1XA 4UMCA 5D2XA 4IMDA 4ADTA 2DZVA 3LCGA 1NEYA 1VH7A 2C13A 3LI0A 5F2GA 4YCOA 4MY8A 1I45A 3HG3A 3HO8A 3TA6A 3A9IA 3E0IA 1I2OA 4YMZA 5HR7A 2ZA3A 3LHTA 4XWUA 3OVQA 1YADA 4Q33A 1WOAA 2VFEA 1S5VA 2GOUA 1QOPA 3S5ZA 1OYCA 3Q58A 3UD6A 4MIMA 4DO6A 4JNMA 4UTMA 1TV5A 5D2YA 1FQ0A 3HGRA 2FB2A 4GWEA 1KFBA 3DI1A 1SSGA 3FEMA 3GAKA 1H7XA 1RVGA 1ZAHA 4XBSA 1TTQA 4HNTA 3W1XA 1RD5A 1T96A 1OFAA 1MSSA 4K7VA 2RDWA 3I7QA 1O5XA 4LVGA 4ZQNA 4K39A 4TMBA 3M43A 2J9YA 3N14A 2JBMA 3SR7A 4WXYA 3PM6A 4IQLA 3RLVA 3BV4A 2QCMA 5K9XA 1SQ7A 3SI9A 4TIMA 3WJWA 1ICPA 4N9EA 4JTUA 4NZJA 4FXSA 2VEKA 3W1NA 5HINA 4MZ1A 3U2OA 3P82A 4FNRA 3C4UA 5CPLA 1TPVA 4ZMGA 1YTEA 2J9ZA 3VE9A 1EP1A 1K03A 1X1ZA 2QF7A 3LCWA 3LTSA 4O54A 1PHWA 1GPWA 4NNAA 2HMCA 3STCA 3CWOX 4DBDA 4FNTA 5U4NA 5A8GA 3GR8A 4HSOA 3TXZA 3NGJA 2BSLA 1DHPA 3NQEA 3TFCA 4TMCA 1Z42A 4JTSA 4XZ9A 4UCGA 1H1YA 1CX9A 3DFQA 4HPJA 5FF3A 3W7MA 2DJLA 2QCLA 3DHFA 3QF0A 2H8ZA 3ELFA 3NA8A 3KX6A 4K36A 5HMSA 3W72A 1FDJA 2WNZA 4AVFA 1Q6LA 4WOZA 3NPVA 4UFIA 2ZZ4A 5G2IA 4JXCA 2E77A 2ZZ7A 4UTTC 3F4NA 4DELA 3QW3A 4NU7A 2NXIA 3TNOA 1LZOA 5FF4A 4AHOA 1KV8A 2UV8G 4OGZA 1JUEA 3FA5A 4LW7A 1F76A 3EWZA 3W73A 2NLIA 1ME7A 3P74A 3C0JA 1LLWA 4UMBA 5EPDA 4NJHA 1IIGA 1ZENA 3W7NA 4HHPA 1G7VA 3G22A 3GAYA 1Z44A 3L66A 4JTTA 1SZGA 4JTJA 3LXBA 2WSQA 4UR8A 5CSSA 1OVDA 2Y85A 4JTLA 3TK7A 4TX9A 2NX1A 4UNLA 4JTGA 1KTBA 1H63A 4M6VA 3M6YA 5D05A 2Q3OA 2Y62A 3EWYA 4DF0A 1JCJA 1G4TA 1PS9A 2NUXA 2QJHA 3W1QA 2E5CA 1FWSA 3Q37A 1LBLA 1XBXA 2Y63A 4AHPA 1XCFA 4NVTA 1VGAA 2PCQA 3B0VC 3BGJA 2VFFA 2Y7FA 2ZRYA 1R2TA 2ZA2A 1ZHAA 4O57A 2Z6JA 4UFMA 2HS8A 2NV1A 2J6XA 1Q6QA 1H7OA 3U8GA 3T4CA 5F2MA 1XFBA 3M9YA 1PE1A 3ZWTA 2Y7DA 1KM6A 5CPOA 1BWLA 5BOOA 1HTIA 1OYBA 1JCNA 1GQNA 3E02A 4O1AA 1GTHA 1A5CA 3NQVA 1AL8A 1JUKA 2NV2A 3KFTA 2ZZ3A 4OU1A 4FNSA 1VYPX 2TRSA 1ZFJA 2PURA 3NYZA 2YFNA 2V9DA 1V5XA 3F4WA 3W2KA 1QPQA 4FEZA 4JDBA 1RQBA 2XN2A 2BWGA 2Y89A 2C0AA 4RLIA 3WFAA 3I68A 3V75A 5EA9A 2WSRA 4LY8A 1UBSA 3TQVA 2B7OA 3DFNA 1WV2A 4JDYA 3C2FA 2DZTA 4BI5A 2TMDA 1EEPA 2RFGA 4LU0A 4LRSA 4N6EA 1SO5A 3W23A 3W1PA 2R14A 3M5YA 1L6WA 5H2ZA 5CGQA 4MVAA 1QMLA 1GYNA 2TYSA 3CPRA 4UTTA 1Z41A 3C2RA 1TPUA 2H90A 1P1XA 3HBLA 1TMHA 1GVRA 1TQXA 2V8ZA 2E09A 3W84A 5D37A 1BTMA 3T7VA 5AB3A 2QCDB 4I7UA 4A22A 3DKJA 4R53A 3EKLA 4POCA 1KM3A 3TX9A 3NZ1A 2ALDA 3IIOA 1TYGA 3EWWA 3HF3A 4C1KA 3LM7A 3CWNA 1I2NA 1F05A 2W6RA 5LNSA 2NX9A 1HO4A 1B4KA 1H7PA 4KKXA 2V2CA 3VFLA 1HL2A 1PL9A 5AN7A 2J9XA 3QRHA 5CKSA 5LSMA 3BLFA 1SZEA 1G4SA 3NQ6A 4DF2A 1YXCA 4JS3A 3G1XA 5FEZA 3QQ0A 1NVMA 5FF7A 3TMLA 3MW7A 3OBKA 4O16A 2YW4A 1ZJIA 5FI8A 2ZRXA 1P4CA 3A5VA 1QFEA 3CQ0A 1OX4A 3HQ1A 3KHJA 3M0ZA 2VOMA 1H7WA 3I6RA 3TC6A 3W1LA 1H50A 1DVJA 3FYOA 2Z6IA 4A2RA 4DEFA 4RZ4A 3C2VA 1Z48A 1TTJA 4WY0A 3LHYA 5F4XA 4CCDA 3MYOA 1QPRA 2FTPA 1HUVA 1M5WA 4UTUA 3MI3A 1JQXA 3EXRA 4WY0F 2JGYA 3LLFA 1JQVA 3TAKA 1ICQA 1J4EA 4NJJA 1FUYA 3P62A 5FEXA 5FEWA 3LDVA 5D03A 2FLIA 2GJNA 3W7IA 1K3UA 1DJNA 1K7XA 3PS7A 4PEKA 1LLZA 1JUBA 4UMAA 5IBXC 1OFDA 3H53A 1B9BA 1NF0A 3S5NA 1IF2A 4M5PA 4DBEA 3NAVA 3LHZA 1B4EA 4O28A 3TC7A 3NQ8A 4HT3A 3G1SA 3C2EA 3W3OA 1ZAJA 3G1FA 4AXKA 1SU5A 3PBYA 4XUGA 2ZFAA 3W7OA 3O15A 1GG0A 5ABTA 3M5XA 1LDCA 1O4UA 1IXPA 5AC7A 6TIMA 1W5OA 4O18A 1FCVA 1OFBA 3KXQA 5D2TA 4ZQPA 4MYAA 5F2IA 5AHNA 1VLIA 3Q94A 4ZQOA 2CW6A 1YLVA 4GBUA 2AAMA 1N8FA 2G97A 3W71A 4BI6A 5HWNA 3ATYA 1KFKA 3NM1A 4O52A 1W5NA 2A1YA 3N9SA 4YWIA 1UCWA 1FDYA 2WKJA 4JTKA 3BW2A 3BW3A 1EWDA 3KRSA 2XN0A 2C16A 2X1RA 4MFEA 2VFHA 2A85A 1DBTA 3O6CA 3P8IA 2X2GA 3W76A 3UY8A 3MWAA 3W6YA 2QKFA 4RZ6A 3KAOA 3UWWA 3OHIA 1A5AA 4JTIA 1CW2A 3NL3A 3TU9A 1EIXA 3PC0A 5D2VA 3FYPA 5G4EA 3THQA 3IRDA 4LV9A 4OE7A 5SWUA 3MHFA 3ZFHA 3M41A 5G5IA 3N34A 4MOZA 2FB3A 1QPNA 1AG1O 5C2XA 4HIBA 3M16A 1M7OA 5C5YA 4GUHA 2YX0A 1MZHA 2Q8LA 2CZDA 4HKPA 1SFJA 2VFDA 1VLWA 1J2WA 2ZYFA 2E1DA 4QITA 1W5PA 2HSAA 3AO0A 3CLMA 3QEZA 4MLJA 1VCFA 2QCEA 4IMGA 1OYAA 1FXPA 3V1PA 3I7RA 5I3FA 1OHLA 3E96A 2YSWA 4H3DA 2FPVA 4NQ1A 1X8FA 4MJZA 3W7CA 1EX5A 3G0UA 5IBXA 2QJIA 1QNVA 3C2OA 4DPPA 3MBFA 4PTNA 1K8ZA 3EX4A 4LS2A 3GNNA 3TW6A 1LRQA 3LHVA 5K3VA 5D2WA 5G1YA 4K7YA 1MEHA 4O0KA 5D09A 1ZNNA 4Z1AA 3LLDA 3P7YA 1GG1A 4YXGA 4CNNA 3NQGA 3BARA 1TRIA 5CZSA 3LCXA 3P80A 2WV8A 4NT0A 3JR2A 1XBZA 4UFHA 3EX6A 1H7RA 3I7SA 5AHEA 2CFFA 3FFSA 2BXVA 3STGA 4QNWA 2P0OA 1GVSA 4LUIA 3QPYA 1FWWA 1TPB1 4O4WA 3S0CA 3NG3A 3HMJG 5CZ0A 1S5TA 2DU2A 5KMYA 2O7SA 2WOQA 3QYQA 2RKXA 3G1YA 4KWWA 3QMSA 3W7KA 3W1TA 3VKJA 2B4GA 4Z08A 3UWQA 2P1FA 2A4AA 3T44A 5DXXA 2PC4A 4O11A 1DQWA 4MLRA 4EIVA 4FF7A 3WK0A 4AWTA 1JCLA 1F2JA 3UPWA 3S1WA 3NNTA 2C3ZA 1P0KA 3NL6A 1EWEA 4BFAA 2ZZ6A 3MHUA 2DZSA 4TU1A 2ZQ0A 2QAFA 5AHIA 1LBMA 1IXOA 3EEGA 3DXIA 4PL2A 4NJGA 3L5LA 2C19A 4PH6A 3G8EA 1TRDA 2ISSA 1H1ZA 4LVDA 3MI2A 2EKCA 3T78A 2WSYA 3S5YA 1DV7A 4Z1BA 1QCWA 3C52A 3DZ1A 3E49A 4ML9A 2BZNA 5KINA 2OT1A 2J24A 5C6MA 3WK2A 3LX9A 4GFSA 3I65A 1KFEA 3SFKA 1DOSA 4RCXA 1FDZA 1W56A 5I3GA 2WNQA 2QCFA 3DBPA 4CQAA 1G67A 4PCFA 5F2LA 4RK8A 1VHCA 5L6UA 1XUZA 1DL3A 1A5BA 3HG5A 4LVBA 1OK6A 3MP4A 4C1LA 2GJLA 4ZQRA 1SFLA 3CU2A 1LYXA 1O60A 3NM3A 4YLWA 5FF0A 4MZ8A 4Y96A 2EPHA 3IVSA 3FKKA 1P5BA 3A24A 5HWMA 5KZMA 1LP6A 4FB7A 2VELA 1D3GA 4LT9A 5CPMA 2NUWA 4RZ5A 1YPIA 1TPC1 2ZDRA 4GJ1A 3W1AA 2CWNA 3CTLA 2X16A 3OIXA 1TJRA 1EPXA 3OEXA 1YYAA 3S6DA 3G1DA 2PE4A 2V81A 2CLKA 3R5EA 1KTCA 1XBVA 4LC6A 2HTMA 2FDSA 2E6AA 2QR6A 1TPWA 1B3OA 3UQNA 1WOBA 3C61A 3N9RA 5TBOA 1W31A 1BWKA 1TV7A 4XBKA 3DFOA 4Y9AA 5LGXA 5AHFA 1R46A 4OWGA 5LHFA 4I9AA 6ALDA 3L65A 1GWJA 3GKAA 1TV8A 2C15A 5EL1A 5HQEA 4A29A 4D2JA 1F73A 3LB0A 5BMWA 4FNUA 3GDMA 4XKYB 3DGRA 4CLMA 1IXNA 1X7FA 3MHGA 5FESA 5K4XA 3YPIA 3TSBA 1XBYA 1OK4A 3M44A 3STEA 1A50A 2CLHA 4QAIA 5DN1A 3N73A 3CHVA 3UWVA 3UXAA 4GRSA 2YDAA 3KOFA 3TJXA 1ZAIA 2QUUA 4GUJA 4U28A 1XM3A 1WYIA 2VEMA 3IIZA 5DCEA 1EB3A 2X1SA 3O07A 4XKYA 3GX9A 3QSTA 4UTIA 1PCKA 3LCIA 3S5OA 4IMFA 1IXQA 3PAJA 1Q45A 3MJYA 2GVLA 2H3DA 3KRZA 4UIOA 3S1VA 3PWAA 4TO8A 4ADUA 4JX4A 3MP5A 1BKSA 4QNEA 4S2BA 2G96A 3BK0A 4AWSA 1LOSA 4JTHA 5U7SA 2QCGA 4NX0A 1GJPA 3GLCA 4K6AA 4LNYA 3LV6A 4WOQA 1W54A 2OZ0A 3UWYA 5E93A 1TREA 2R8WA 4KWVA 3G18A 1YXDA 4O15A 4MY9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WDW A;  3CBW A;  1SO6 A;  2ZRZ A;  3WH7 A;  1HJQ A;  3W74 A;  6TAA A;  4IJB A;  1HN1 A;  3OZY A;  1YTD A;  4OT7 A;  1XL9 A;  3VNZ A;  2D0F A;  3MO4 A;  4F2U A;  2BGQ A;  1R8L A;  3RUB L;  4IUO A;  4EKJ A;  3FAX A;  3S2L A;  3T4W A;  4Q6J A;  5BOE A;  1XLC A;  5C55 A;  4LAO A;  4JFV A;  4DO5 A;  2VP8 A;  2O0T A;  2AQO A;  3ITT A;  5D8W A;  1KXH A;  1ICS A;  4BF7 A;  2ZAD A;  4LS1 A;  1HJX A;  5HUL A;  4J27 A;  4UTH A;  1C9W A;  1OT2 A;  3IUH A;  3LM3 A;  1DOR A;  4IMC A;  1ZSX A;  2PMQ A;  2ZX5 A;  3F2D A;  1QAS A;  1IR1 A;  2VMF A;  2ZA1 A;  4YTQ A;  1RK5 A;  2FHB A;  1KM4 A;  4ZVJ A;  4PMO A;  3OGS A;  3BPW A;  1BG9 A;  1JCM P;  3CT7 A;  4LPC A;  1ODZ A;  1DWH M;  1E4L A;  3QBU A;  4RE2 A;  1RA0 A;  1DTU A;  2DDX A;  5EY5 A;  3M7W A;  4WX2 A;  4Y90 A;  5AHM A;  2PLM A;  2YDQ A;  2Q8Z A;  3G3D A;  4QE1 A;  3VNI A;  3CXO A;  4YIW A;  4Q4R A;  3UXD A;  3DHP A;  1HKV A;  3VAV A;  1UR8 A;  1VP5 A;  2HVO A;  2R1N A;  3R10 A;  4HN8 A;  5CJN A;  3SGZ A;  4AD0 A;  2ATS A;  2VCB A;  4S23 A;  3T0D A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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