1F0QA

Crystal structure of the alpha subunit of protein kinase ck2 in complex with the nucleotide competitive inhibitor emodin
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
MSKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords PROTEIN KINASE CK2, ALPHA SUBUNIT
publication title The replacement of ATP by the competitive inhibitor emodin induces conformational modifications in the catalytic site of protein kinase CK2.
pubmed doi rcsb
source organism Zea mays
total genus 97
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2000-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1f0qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1f0qA01
2DQ7X 5ANEA 3NUUA 1A9UA 3D5VA 4ZY6A 1H01A 3GVUA 4J8MA 4EQUA 5H8GA 1ZZ2A 2VO7A 3BHTA 4CFVA 5BVFA 4I3ZA 4G3CA 4EH6A 2B7AA 5AUXA 3VHEA 3L9NA 4RIXA 4IC8A 2QKWB 3OZ6A 4C0TA 1UU9A 3R9HA 4I0TA 3ZEPA 5JH6A 3R9RA 3GU5A 4D9TA 5G6VA 4TYIA 3OMVA 3C0IA 3AMAA 2P3GX 2Q83A 4IDTA 3CTHA 4O2PA 4DFZE 2Y4PA 3DNDA 1F3MC 3P08A 4JAIA 3WYYA 4L7FA 3MA3A 5CSPA 2EXEA 4UALA 5HIBA 1PRYA 5AP4A 4FEUA 3DK6A 4JS8A 3FJQE 1SZMA 1OIRA 1GZKA 2YWPA 3EQPA 3II5A 4R3CA 5EDQA 4FNWA 4BCJA 4G16A 3ANQA 3FZRA 4OTDA 2XKDA 4DTKA 5BVNA 2RGPA 2W1GA 2IW9A 4UMTA 3RWPA 4B9DA 4B4LA 3BGQA 2GS7A 4M15A 3QTZA 4FIJA 5CF6A 2CPKE 3KULB 4OTFA 4XH6A 2PVYA 4AW2A 4V01A 3VBTA 2HZNA 4MHAA 4HYIA 4UMQA 4XLIA 4PP7A 4QP8A 4YMJA 4X21A 1R0PA 1WBSA 3TCPA 1SNUA 3IKAA 3OY1A 4RA5A 3EKNA 3Q9ZA 1XHAA 3LMGA 4CEGA 2PMIA 1HCLA 2P55A 3A4PA 2VGOA 1ERKA 3BHHA 3EQFA 3MBLA 4CV9A 4QQTA 5EK7A 3T3UA 4I4FA 3OTUA 5J95A 3MJ2A 4O0RA 4PNKA 4G6NA 5BUJA 4ZS4A 2WU6A 4HPUE 4FTQA 4G1WA 5DR2A 4PDPA 4FKTA 1U5QA 4CZTA 5HOAA 2ZDUA 1CKPA 5ETAA 2OZAB 2FSOX 3Q3BA 4QP2A 2PE0A 1Q4LA 4P4CA 4RIYB 2HXLA 2C5VA 4IJ9A 3H3CA 4DFUA 3P4KA 5GJDA 1G8SA 5KO1A 3ORNA 3BV3A 4E4MA 3CCNA 3QA8A 2OZOA 3FE3A 3L8PA 4M0YA 4QMUA 4RIOA 4YGAA 3R8ZA 4A9RA 4IACA 3N4UA 1UKIA 3LCKA 2WMUA 5L8KA 4MXXA 2VO0A 4V0GB 2ITPA 4X6QC 4YJSA 5TOZA 4MXZA 4IVBA 4QP9A 2WHBA 3GUBA 3LHJA 4OT6A 3ET7A 2BMCA 3WOWA 4EK5A 3HDNA 5DN3A 4NEUA 3ATSA 2A4LA 3FI3A 4I21A 4RWLA 4N0SA 5HG8A 4CG8A 2G01A 3LLTA 4A7CA 2XP2A 3C4CA 3HA8A 1P5EA 2YISA 3NCZA 4HCVA 5DPVA 5L2TA 3UYSA 4F9YA 2C6DA 5TR6A 5HNIX 1E1VA 3FSFA 3IGGA 4PPAA 5GIPE 3FMHA 3NPCA 5HQ0A 1B6CB 1PW2A 1ZWSA 4C33A 5AX3A 2OF2A 4U97A 4BI0A 3D83A 5CEKA 4X6RA 1M17A 3FMDA 3KL8A 4EOPA 3BYMA 1ZMUA 1H1WA 2HZ0A 4NTSA 4WT6A 3SW4A 3O17A 1JQHA 4DFLA 4MH7A 5E7RA 4O86A 3VO3A 3EQRA 4BCQA 3FZ1A 3MSSA 3MVLA 4FZ6A 3R8UA 2R0UA 3DK7A 4II5A 3RGFA 1PXPA 2XRWA 1U46A 3SVVA 1NW1A 5KUPA 3PY3A 1YVJA 2R9SA 3HMPA 3Q4CA 3UBDA 3W2QA 5L4QA 3V5PA 2BUJA 1MP8A 3U4UA 2QOQA 2XM9A 4BYJA 4LUEA 1H24A 3C0HA 4ERKA 2C1BA 2BFYA 3WZEA 5DWRA 4BDDA 2B9JA 4DLIA 2X7OA 4BGHA 4UN0C 3KMMA 3QTUA 3IS5A 2ITWA 5HICA 4YJVA 1PY5A 3ZOSA 4C61A 4FZFB 5A4EA 3O8TA 2QO7A 4R78A 1DM2A 1FMKA 4WA9A 4YPSA 5AUUA 3M42A 4BDHA 1XH8A 1WBOA 4FTOA 4U3ZA 5IA5A 2OK1A 2Y4IB 2PZPA 3WZUA 4ANOA 5A6OA 3KKVA 4WNKA 3EOCA 2VTQA 4BDBA 4YJQA 5IU2A 3HAMA 5IQEA 3BCEA 4ITIA 5J87A 3PA4A 3MS9A 3WF6A 4CCUA 4FIHA 1IRKA 4PL5A 4XLVA 3TZ7A 1MRUA 3E87A 4FEVA 1YDTE 3LFQA 5G1XA 4XP2A 4ACDA 3A62A 2X6EA 3CQUA 3MVMA 4WUAA 3TI1A 5A46A 5EDRA 3DJ6A 4D0WA 4PPCA 3OC1A 5AUWA 3O7LD 4AZVA 5IH5A 3R8MA 3EQHA 2JKKA 4YLLA 4EK8A 1GZNA 4F0GA 2J7TA 4JOAA 1PF8A 5CEIA 4IAIA 4AZTA 4CQGA 4YZCA 4HVDA 5JFXA 1GZ8A 1QCFA 1O6LA 3IOKA 4GMYA 4PMMA 4A9TA 2CSNA 4YLKA 3D7ZA 2CHLA 2QG7A 4CXAA 3DCVA 1Q8ZA 5I3OA 3PXFA 3SOCA 4FTNA 4JX7A 2CNUA 1BYGA 4ZSJA 1YDRE 2UW5A 3A61A 4WNOA 4DG0E 3A7IA 1Y57A 2C6EA 4IQ6A 5CVFA 5FDPA 4E73A 2JDOA 5FLFA 1H1PA 1SVGA 3S95A 3JYAA 4AWIA 2IVTA 3MPAA 3G51A 3RP9A 4QMLA 3UMXA 5CT7A 4BCOA 4BGGA 4FIEA 4YTIA 4ZAUA 1Q8UA 3CC6A 3LE6A 1WBPA 4L3JA 4FX3A 2BRHA 2I0YA 1O6KA 3LJ0A 5FM3A 5LVOA 1PXOA 4J71A 1MQ4A 2R3QA 2RFNA 3CR0A 3ORMA 1F0QA 3KCKA 4K1BA 3GFWA 3A7JA 4GYGA 4X3FC 5FGKA 3RK5A 4EHGA 3CTQA 4W8EA 4H05A 3NX8A 4M68A 3W2PA 4WSYA 3PVUA 3V3VA 5I9VA 4ZTSA 5KE0A 4XG7A 4F64A 2XM8A 2XUUA 3QKLA 2I0EA 5E8UA 5DRDA 2YN8A 4FOBA 5ANIA 2A27A 2QOOA 5I5ZA 1XBCA 3BYUA 1XWSA 2FYSA 4C4JA 2W05A 1Z5MA 3PJCA 3LQ8A 5GZ8A 3JR1A 3MI9A 4I5MA 4DC2A 3OY3A 1BL7A 5EHLA 5F1ZA 3P7AA 1FPUA 5JGAA 3N51A 5E1SA 2OJJA 1YHWA 5AAEA 2GTMA 3FPMA 3R9DA 4IZ7A 4BGQA 5LXMA 1G8AA 3GI3A 3HMIA 3E8EA 2IJMA 2AC3A 4G2FA 3NR9A 4ZJVA 3NUPA 4CV8A 3RZBA 1GOLA 2XJ1A 4IAYA 3TEIA 4NU1A 4DEHA 4YR8A 4EOOA 3MIYA 5GHVA 1MRVA 3RAIA 3W16A 4RVMA 5TO8A 1AGWA 3NW6A 4HGSA 2YWVA 1H25A 4C35A 3JVSA 1YXTA 1DS5A 1FGKA 4LV5A 3HUCA 3LZBA 3FC2A 4K6ZA 4QPMA 4U41A 5GJFA 4O96A 3QC4A 4EBWA 2DWBA 2WELA 4IWOA 3E8CA 3D5UA 5AA8A 1JNKA 4ZTRA 3ZXZA 3EMGA 3SRVB 4ACHA 5DT3A 3JVRA 3UZTA 2UUEA 3VBYA 5C27A 3WF9A 4EOQA 4EH7A 3W2CA 4PX6A 4U42A 4TRLA 3C50A 3F3WA 5IISA 4FTKA 2X7FA 3FMMA 5DGZA 3RPRA 3S1HA 3ZFYA 3TV7A 3E7OA 3QXOA 4TWNA 3DDPA 4UWBA 4DH7A 4RIXB 4JT3A 3QTSA 4FV7A 3K3JA 4X2JA 4D28A 4ZOGA 2W17A 5J1VA 4GH2A 4X3FA 2OIDA 4P90A 3O23A 4USEA 5KMMA 1ZXEA 5BVEA 4Q2AA 4AX8A 3VJNA 1YWVA 3LJ1A 2UW0A 5LVNA 4WSQA 3L8SA 5CAQA 5HX6A 3ZSGA 4RLLA 3NIEA 4ZK5A 4FG9A 3UC4A 2C3IB 3ZLWA 5IA1A 4XOYA 2ITNA 3PZEA 3ZRLA 2QO9A 4YZMA 4XBRA 2WU7A 1XH9A 4M12A 4O1OA 4AGUA 4DHFA 4O0WA 3QXPA 4DGLC 1FINA 2BTRA 3OG7A 1APME 3QD4A 4AFEA 2VO3A 3TN8A 3PJ1A 4DFYA 4IWQA 2W5AA 2BHHA 3OWKA 5HTCA 3WZKA 4O81A 5IQHA 4P5QA 1OUYA 4ZS0A 3Q53A 3GGFA 2OXXA 5H3QA 4DYMA 2J2IB 3RI1A 2ZV8A 3CQWA 3OW3A 4X2GA 3VUIA 3W2SA 1BKXA 2UZLA 3RK7A 3H0ZA 4JG6A 2A1AB 1M52A 4FBXA 2NRYA 3FLSA 1DI8A 3Q6UA 4FTMA 3QBNA 4GKIA 4BWPA 2YA9A 4UV0A 4AA0A 5FBNC 4I93A 3O71A 1UU3A 2EXCX 3RALA 3VUDA 3TM0A 4B8MA 4R5SA 3PFQA 2XIRA 1BLXA 5BPYA 1PKGA 2HENA 4QMZA 4MQ2A 3GENA 1JKTA 4TNBA 3SXRA 2Z60A 4G9RA 5BMSA 2HZIA 1TQPA 4BKZA 4G3GA 3PVWA 4BBMA 3I5NA 3PUPA 5JZNA 2XNMA 2YM8A 1Q3DA 3KXHA 5F94A 4D5HA 3MFRA 2W7XA 5HBEA 3A99A 2X9EA 2BRGA 4GFGA 4JQ7A 2R3OA 1W82A 3NIZA 4UXQA 1OL2A 3FMNA 2ERZE 5EQYA 2QOKA 3F7WA 4M67A 1FVVA 2DS1A 2EU9A 5FEQA 2A2AA 2R3LA 2B54A 2W1FA 3EL7A 4FTLA 4YC8A 3VBVA 3Q9XA 4BCGA 3FPQA 1G3NA 5BVKA 3NUAA 3OHTA 2ITYA 4JRNA 3SAYA 4D2RA 4EH8A 1Q8WA 4ANQA 3GCVA 3LXLA 5K5NA 4BR3A 1FBNA 2F9GA 2QKRA 2H6DA 3QZGA 2BRBA 4N70A 4WIHA 3D5XA 3DJ5A 4RJ6A 3RK9A 2J4ZA 4UEUA 1W98A 2XK9A 1WAKA 4FODA 3Q5IA 4GS6A 5KCVA 4N6YA 1XO2B 4RRVA 3GQIA 3TNIA 3UG1A 5C01A 4AQCA 2V62A 3TNPC 4DFBA 3W8LA 3D7TA 4M0ZA 3PXRA 2OO8X 4Q9SA 3LFDA 5C03A 2GHGA 5C26A 4IW0A 5KX8A 2UVYA 3EN5A 2Y8OA 1YHSA 2HCKA 2O63A 5F95A 3TNQB 5CI6A 2QOLA 3M2WA 2UW7A 3ORPA 4A9SA 3RM7A 5FTOA 1V0BA 4KIQA 2PU8A 1PMEA 2I0VA 5JEBA 4O6LA 4I6FA 4ZTHA 4O7ZA 3MY5A 3W2OA 5E8VA 4GK4A 4S2ZA 4B6LA 4FL3A 3BGPA 4EEVA 2C6MA 3O8PA 3ELJA 3QQHA 3R8PA 3V6SA 2G2HA 3PSBA 2Z2WA 5CAPA 4C58A 3G15A 4JBOA 3Q5ZA 3VQUA 3U6JA 3UZRA 4LL5A 3O50A 3EFWA 3L8XA 5CY3A 3WI6A 1WZYA 3EFLA 2FSMX 4C62A 3MN3A 2X8IA 3QHRA 4QQCA 3DY7A 5AR2A 3TTIA 3HRFA 4CTCA 4MYGA 3BU6A 3R7IA 4CD0A 2WQMA 3UO4A 3Q4ZA 4TL0A 2XBJA 3UOHA 3ZSIA 5BYYA 1UV5A 2GS6A 4O7NA 3LOKA 5AIRA 5CSHA 2X4FA 3R7VA 4ORKA 3IQ7A 4FKOA 2XNGA 4PMPA 2Y4IC 4ZSLA 2CJMA 3IW4A 5AX9A 2UW4A 2X2MA 1VJYA 5HD4A 4D9UA 4PMSA 3NGAA 4CYIA 2GHLA 4F9WA 3RBWA 5EHOA 4L52A 4ANMA 2X81A 3NW7A 1E9HA 4FVPA 4U43A 3HV7A 3LMHA 3QZIA 4IHPA 5CS6A 1OL1A 3D9VA 4BN1A 2RL5A 2JDSA 2WQNA 4JG8A 2IZRA 3QGYA 5ITAA 4YC6A 1IA9A 1PXIA 3ALNA 2UZBA 4JX3A 4MQ1A 3UNJA 4C2VA 3JUHA 2ZB1A 2W0JA 2ITTA 2WO6A 3NLBA 5L6PA 2XJ0A 3OUNB 3P0MA 4XV9A 4APCA 5AUYA 5JRSA 4XG3A 5IMEA 1OKWA 4BFMA 4A07A 1YOJA 3QTIA 4QP1A 5BYZA 3ULZA 4FF8A 3PG3A 2P2IA 5D10A 1YXVA 1WFCA 3LPBA 4FL1A 4XG6A 1TVOA 4FKJA 3DAEA 4F7JA 3GCUA 4FGBA 4C7TA 1OIUA 2CGXA 3P7CA 2AYPA 3EYGA 3RM6A 4NM0A 4M66A 2Z02A 1SMHA 3SG9A 1OB3A 4NFMA 2B55A 3NUYA 4FKWA 3AQVA 3DBQA 2OH4A 2WB8A 3OWLA 1FVRA 3FEGA 2JFMA 2JITA 4W9XA 4Q9ZA 3U9NA 4XG4A 4E4XA 3OWPA 4F6SA 3P86A 5CQWA 2REIA 3F3ZA 2C47A 2G1TA 4FTAA 4C36A 1NA7A 3PSDA 2C0IA 4M14A 4CYJA 5H9BA 4AFJA 5CAOA 4L44A 1W8CA 4IM3A 4BDFA 2LGCA 4E3CA 5D41A 5GIOE 3WZDA 5ANDA 4EZ7A 5ETCA 4YTCA 2A0CX 3TT0A 3F5PA 3C0GA 3LXKA 5CSWA 5C1QB 3TIZA 3BI6A 1OKVA 2AC5A 3F6XA 2O2UA 1CKIA 2R5TA 4B7TA 4UYNA 1IAJA 4UWCA 2BDFA 4S32A 4JAJA 5K5XA 3UQCA 4CCBA 4AXAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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