The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
87
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structure length |
87
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Chain Sequence |
MCAVLRQPKCVKLRALHSACKFGVAARSCQELLRKGCVRFQLPMPGSRLCLYEDGTEVTDDCFPGLPNDAELLLLTAGETWHGYVSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein
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| molecule keywords |
CASPASE-ACTIVATED DNASE
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| publication title |
Structure of the heterodimeric complex between CAD domains of CAD and ICAD.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
11
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| structure length |
87
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| sequence length |
87
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF02017 | CIDE-N | CIDE-N domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1D4B A; 1XCT L; 1K53 A; 1IBX B; 1MPE A; 1C9F A; 2JU6 X; 2IGG A; 4KGS A; 1FCC C; 2GI9 A; 1IBX A; 2KAC A; 2PTL A; 1FCL A; 4HJG E; 4IOI E; 4OZA A; 1JML A; 2ONQ A; 2IGD A; 1HZ6 A; 1FD6 A; 2J53 A; 3UI3 A; 1HZ5 A; 3FIL A; 1UWX A; 2JSV X; 2N9K A; 4D2K A; 2KWD A; 1IGD A; 1K51 A; 2K0P A; 5BMH A; 2KN4 A; 2I2Y A; 2LHD A; 2PW9 A; 2EEL A; 5BMI A; 1ZXH A; 1QKZ A; 2I38 A; 1F2R I; 1MHH E; 2QSD A; 1HEZ E; 1Q10 A; 3FIL B; 1XF5 L; 1MHX A; 1YNT E; 4KGR A; 1MI0 A; 2LUM A; 1EM7 A; 2ZW0 A; 2N7J A; 4HKZ E; 4KGT A; 2IGH A; 1PGA A; 2KDM A; 3V3X A; 2N9L A; 1GB1 A; 1P7E A; 1KH0 A; 1GB4 A; 4OZB A; 2OED A; 1IGC A; 2RMM A; 2LGI A; 1MVK A; 2LHE A; 2JZP A; 2KQ4 X; 1YMH E; 1XCQ L; 4WH4 A; 5BMG A; 1K50 A; 5JXV A; 2ON8 A; 5HFY A; 1K52 A; 2JXT A; 4GLS C; 2QMT A; 1F2R C; 3MP9 A; 5HG2 A; 2NMQ A; 5HHD G; 1P7F A; 2J52 A; 5HI1 A; 2ZW1 A; 1PGX A; 2GB1 A; 1PGB A; 2RPV A; 4IKG A; 4MAC A; 3GB1 A; 2PLP A; 4OZC A; 2JWU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2K3U A; 4FXC A; 4TSS A; 3ABV B; 1XLN A; 3EGR A; 1UBI A; 4ZHP A; 4KGS A; 2L52 A; 4RGO S; 1IBX A; 1N60 A; 3M63 B; 3NY5 A; 2XBB C; 1I7H A; 3VH4 B; 2WYQ A; 4LDT B; 3TIX A; 2DBY A; 3CWI A; 4BFR A; 4NAW A; 5LXH A; 2K0P A; 2KT7 A; 1GG3 A; 3MC9 A; 3DCG A; 3ZIM A; 1FFU A; 3W5V B; 1SGH A; 3P42 A; 4DXA B; 4GIV A; 2JPH A; 3FIL B; 2M0A A; 3UQB A; 2RR9 A; 2KNB A; 1ZUD 2; 3R7R A; 2N7J A; 4HKZ E; 4KGT A; 4HJK A; 5LNK 1; 1QIL A; 5DPT A; 5CHF A; 4P1C C; 1A70 A; 1P7E A; 1FRR A; 1B9R A; 4BVU C; 4N58 A; 2KKC A; 2DZM A; 2OED A; 2RMM A; 2XK5 B; 1FRD A; 3X23 A; 1LO5 D; 2WP9 B; 3EEC A; 4TV3 A; 3L17 A; 3AEE B; 2KQ4 X; 3NHE B; 3VXW A; 1T0Q C; 2MLB A; 2NBV B; 5G5H A; 5H8Y E; 1WWT A; 3RFZ B; 3L0W B; 2QMT A; 3VTU A; 1I35 A; 5D3I B; 3VRB B; 2D10 A; 2QCZ A; 1L2N A; 2V1Y A; 3DHI C; 1NVI D; 2FCS A; 1EF5 A; 2I1K A; 3EFC A; 4PS8 A; 3JVZ X; 3ZW3 A; 4ZRI A; 2MW5 A; 2L32 A; 2RDH A; 2UWQ A; 1WJN A; 3ZO5 B; 2CU1 A; 2MBH A; 3PZ7 A; 1V1P A; 1K53 A; 1ZDV A; 3Q3N C; 1MPE A; 4N59 A; 3RPF C; 4OVZ A; 2IGG A; 4ZYS A; 4LK0 M; 2EKE C; 1F1H A; 3ZRC A; 2K6D B; 1P3Q U; 4WAF A; 2WDR B; 4LCD E; 2DYB A; 4ANU A; 4DK5 A; 1V9J A; 3ZNI D; 3RUI B; 2WX0 A; 4PYZ A; 4M02 A; 2BF8 B; 4P6V F; 1M94 A; 3ZRF A; 3X0W A; 5AZH A; 5D7G A; 4KKI A; 1T3Q A; 5BMI A; 2C60 A; 3AE1 B; 3Q8A A; 4IWQ A; 3MC0 B; 2AX5 A; 1N63 A; 2OJR A; 3VDZ A; 4NNJ B; 1JWM D; 2BYE A; 3GP7 A; 4W9L A; 5IAA C; 3W1S A; 1FXI A; 3ALB A; 2DHZ A; 4XZ4 A; 2FCQ A; 1HQR D; 1R4M B; 3W1Y A; 3MJ5 A; 5FKA C; 2W55 A; 2RDB C; 2MBB B; 3CST A; 3BVM A; 3H6N A; 4ZRP A; 1FXA A; 2IO2 B; 3VAW A; 2QHO A; 5IN7 A; 2HJ8 A; 3V60 A; 3PS6 A; 2N1W A; 2AYO B; 2JYE A; 2WXI A; 3AE4 B; 1E9M A; 1QOB A; 3DBL B; 3L16 A; 3PHW B; 1PGX A; 3MTN B; 3GOE A; 3AEG B; 4IM0 A; 1I4R A; 3ZTC A; 3AE5 B; 1UNS A; 3AMZ A; 1PFD A; 1VDV A; 2WX1 A; 4DWF A; 1UBQ A; 1DOY A; 1WFY A; 2CHX A; 4PYU A; 2K39 A; 4TMA B; 3HM3 A; 2EKI A; 3MHS D; 1HTO A; 2C5L C; 2MBO A; 2ASQ A; 4NJ7 A; 1WJU A; 3FIL A; 4KDI C; 1MFW A; 4J6I A; 3RNF C; 2KWD A; 2AL6 A; 4WAA A; 2WHI A; 2B3A A; 2WXL A; 2H89 B; 3ZNH B; 2L3Z A; 1J7C A; 1L6V A; 2EEL A; 3BK1 A; 3U30 A; 2J42 A; 2INP E; 4GU2 A; 2JVC A; 4W9G A; 3AE9 B; 2IO1 B; 3UIP B; 2IYD B; 4GB9 A; 1XF5 L; 1SE2 A; 3BVZ A; 4EKU A; 4IC7 B; 3QC8 B; 3ZYY X; 1T6B X; 4K7S A; 2RD0 A; 4B0E A; 1WF9 A; 3B0A A; 4G50 A; 4DHZ E; 3P4S B; 1A5R A; 2KTR B; 1KLU D; 4ZRK A; 1KH0 A; 1GB4 A; 3V6E B; 3L10 B; 4I6N B; 3H7P B; 4BKS A; 3ZVV A; 1C77 A; 4GDL B; 2NBU A; 1E0Z A; 4K81 A; 1WGR A; 2EMS A; 1WR1 A; 3C0R B; 2HDE A; 1Y56 A; 4MEM A; 3QJZ A; 3RZW C; 3VRA B; 2PJH A; 2WU5 B; 3PTF C; 1FIQ A; 2O6V B; 2NR2 A; 2INN E; 5CHW A; 3HVD A; 4WIP A; 1GAQ B; 1WIA A; 1D3Z A; 2M56 B; 4MGY E; 5CX3 A; 3IXS A; 1AN8 A; 3SDL C; 2QDF A; 3DVG Y; 5EE3 A; 2WNM A; 4TQ1 A; 4TQ0 A; 1C4P A; 1E90 A; 1KJT A; 2KAN A; 3RNB C; 4WWN A; 2QJL A; 2CJN A; 1VRA B; 4RM9 A; 4AQ7 A; 4MT5 A; 3KH0 A; 4HJG E; 1WXQ A; 2KJR A; 2KTF A; 4W9F A; 2JUO A; 2WXH A; 2IGD A; 2BS3 B; 1SE9 A; 3K9O B; 4L1B A; 4MH0 E; 2M1M A; 3WAM A; 3ETR A; 1UH6 A; 1WXA A; 4C56 C; 1IPG A; 1MJD A; 3RNE C; 4A3O A; 2AQ2 B; 4FHJ A; 1WM2 A; 4AJW A; 1WGH A; 2M4N A; 3TUO A; 1L0X B; 2IY0 B; 5AZF A; 1TZ1 A; 4TUU A; 3CSF A; 5C2T B; 1CJE A; 2GRI A; 2REX A; 2G45 B; 3APF A; 2LRW A; 3U7Z A; 1ZOY B; 2N9P C; 1YN3 A; 3R66 C; 2KAJ A; 1I42 A; 4DHJ D; 1NDD A; 2KVR A; 3ZNZ B; 1YMH E; 3VR8 B; 4W9I A; 3AE2 B; 3AH7 A; 1K50 A; 2JXT A; 3QHT A; 2KZR A; 4YL8 A; 2JZZ A; 2KN5 A; 1J7B A; 3B9J A; 2K1F A; 2Z0D B; 1XXG A; 1WGG A; 2J0J A; 3RD2 A; 4LNO A; 2ZNV B; 2PE6 B; 1XD3 B; 1XEE A; 3C8Y A; 1TT5 B; 3IG3 A; 2M0X A; 2V0G A; 3O65 B; 2BS2 B; 1Y8R C; 4M8N A; 1PDX A; 1ZW7 A; 1Q1O A; 2L1A A; 4BOZ B; 3ZNG C; 1YQB A; 4YTP B; 4KSK C; 2KAC A; 1WM3 A; 1SSN A; 2KMA A; 4ICV A; 1ZE3 D; 3MC8 A; 1EWY C; 2BVC A; 3OWE B; 3SHQ A; 1UWX A; 2FUG 1; 2BKR B; 4A8X C; 3KWV A; 2LUE A; 1YIW A; 3ZLZ A; 2ZJD A; 2LFI A; 3PRZ A; 2GMI C; 3N1Z C; 5MPO A; 4WWO A; 1MHH E; 4MJS A; 2WXK A; 2RSU A; 1Q5W B; 1JW9 D; 2KTR A; 2LXA A; 1XLQ A; 2MRP A; 5IKC M; 1WH3 A; 1FPY A; 2CR5 A; 2LRU A; 3PSE B; 3AI5 A; 3VTV A; 1D5Z C; 1VJK A; 4KKJ A; 4CO7 A; 4GDL A; 1AW7 A; 3HM6 X; 4NPN A; 1WRD B; 1ZGU B; 2KDM A; 1UGM A; 4JL9 A; 2O6V A; 1RM6 C; 3QX1 A; 5H92 C; 1HA5 A; 2L00 B; 2UYZ B; 4XDC A; 1DOI A; 2K6Q A; 1EF1 A; 1HTQ A; 4JWS C; 3T3O A; 4EFO A; 2KYW A; 4NJ6 A; 3Q8F A; 4A3P A; 4HDO A; 1R7S A; 1MG4 A; 1Z2M A; 4RH6 A; 2L8J A; 1UWM A; 4CYE A; 4MGZ E; 4C4V B; 4W9J A; 3SFE B; 2Z8L A; 4K3B A; 1FNV A; 2JWU A; 2KDF B; 2EMT A; 2FCN A; 4M0W B; 5TSS A; 1WGY A; 3KVF B; 2GI9 A; 4BBN C; 2YVC A; 3AXC A; 2DZJ A; 4EZJ A; 1SF0 A; 2M19 A; 1HZ6 A; 3DDC B; 1HZ5 A; 3P1M A; 3QAR A; 2DZK A; 2BYT A; 3EHV A; 2O2V A; 4B0M A; 4KV2 A; 1ENF A; 4EE2 A; 1P98 A; 3N1X C; 2MCN B; 4BOS C; 3S2A A; 3Q2A C; 2A5U A; 1C3T A; 2WQY B; 1Q10 A; 3NG0 A; 4B9K A; 2X8X X; 2MBE A; 1E8W A; 1WMH B; 1YOV B; 3J9C A; 5BYS A; 3Q8B A; 3KYD D; 4W9E A; 1AWD A; 4JWU C; 4RFB A; 3NVZ A; 3P63 A; 1VZ7 A; 2N9L A; 3LXF A; 3E9S A; 3SEB A; 4P16 A; 2L76 A; 4J3O D; 1TY0 A; 1SEB D; 1X1M A; 2D3B A; 1ISN A; 2LGX A; 4R3D A; 1N6Z A; 4ACF A; 4JE3 B; 4M8M A; 1XQQ A; 2LD9 A; 1T5X D; 1H8C A; 1WI0 A; 3ONS A; 2BBC A; 3Q6B A; 4DXG A; 1ESF A; 2L05 A; 1WR6 E; 2L0T A; 4ARC A; 4F7Z A; 4MGI E; 5L83 A; 5DPR A; 4HKQ A; 3H9D A; 4DQO C; 1P7F A; 3R8B A; 3CF6 E; 1QOF A; 4RGN A; 2WXP A; 1WX8 A; 1UZX B; 3Q8E A; 4ZYN A; 4WQO B; 2TSS A; 4KZC A; 1WJ4 A; 1ZKH A; 1ET9 A; 2PTL A; 4IOI E; 3O13 A; 2ONQ A; 1I4G A; 2KXJ A; 3GE8 C; 3AE3 B; 1EU4 A; 4DDG D; 3A9K B; 2MJE A; 4WUR A; 2L83 A; 4XC2 A; 3RYT A; 2RPQ A; 1WYW B; 2KLG A; 2PW9 A; 2WDT B; 1C76 A; 3VUW A; 1HE8 A; 1T0Y A; 3UGB B; 1QOA A; 3FC4 A; 3OJ3 A; 4NQK E; 2ICI A; 5JHB A; 4FJY A; 1L4D B; 3TCA A; 3A33 B; 1QT9 A; 4HWI B; 3N9Y C; 2HD5 B; 2NTT A; 4IUM B; 3AB5 A; 3DVG X; 5E6O A; 5EE0 A; 4JPS A; 4EOY A; 2OHF A; 1GC6 A; 3N20 C; 3V3X A; 2MX2 A; 1L4Z B; 1SIJ A; 4HPM B; 2MP2 B; 4LLG M; 1NYQ A; 2KC2 A; 4URK A; 3WA0 A; 3A9J A; 2DNF A; 3HHM A; 4N6E B; 4MSM B; 1M4V A; 2CKH B; 3Q14 C; 3APC A; 2Y5P A; 2E6X A; 2SAK A; 4L2Y A; 2FCM A; 2ON8 A; 4K1R B; 1K52 A; 3PRP B; 2BS4 B; 1WXV A; 3N3K B; 4DHJ B; 3N30 A; 1N5X A; 1I4X A; 2R61 A; 4M0W A; 1OQR A; 4UDU C; 5HI1 A; 1PQS A; 1TKY A; 2PMV A; 1PGB A; 3GB1 A; 2WS3 B; 4OVV A; 1WJ6 A; 2LXC A; 1EO6 A; 4YXD B; 3OLM D; 5DCN A; 2KQ7 A; 2WGS A; 4B6W A; 3NVW A; 1VCB A; 1RLF A; 4JGH B; 5DPW A; 3TEY A; 1KM7 A; 2J53 A; 4FBJ B; 3KYC D; 4F1S A; 4JQW C; 5J18 A; 3LB8 C; 3BY4 B; 2KX3 A; 3WAL A; 3P4P B; 2J0M A; 4IDI A; 4IM3 A; 3A4S C; 1F2R I; 3OJ4 B; 2MWS B; 1WXM A; 2MH7 A; 3ECI A; 5E6N A; 1YNT E; 4W9C A; 1L7Y A; 2LUM A; 1H4R A; 2GBN A; 3WAP A; 2X38 A; 4YT0 B; 1CK1 A; 3WIM A; 2Z0E B; 3MJW A; 4HRS A; 1RFK A; 5AUK A; 4KZ0 A; 5D6J B; 2J0K A; 4K3C A; 4W9D A; 4GOC A; 2WXR A; 2M8S A; 4OVU A; 2FUH B; 5BO4 B; 2WXJ A; 3AE8 B; 4OW0 A; 4DXF A; 4ICU A; 4MM3 B; 1PYW D; 2XK5 A; 1SE3 A; 4ANX A; 3WAN A; 3AEC B; 3QAQ A; 3GS2 A; 1LXD A; 4YTM B; 4HCN B; 2QEJ C; 5FK9 C; 3RNC C; 2K9X A; 2K25 A; 3VUY A; 2XN9 C; 2A4Z A; 1S3S G; 4IW0 A; 1KF6 B; 3ZJU A; 1GNU A; 4USA A; 1R4N I; 1VZ8 A; 4HXD A; 1TBE A; 2SEB D; 2UU7 A; 2ZW1 A; 3AM9 A; 1G6J A; 4GGQ A; 4MEL A; 3DHH C; 3R2I A; 4IKG A; 4RNA A; 2NTS A; 5D3D A; 5HKH A; 4NQL B; 2N4F A; 3NUH B; 3N32 A; 2VH1 A; 4XX5 A; 1N62 A; 1J19 A; 4BKT A; 1V97 A; 4LJP B; 3QA8 A; 2JX5 A; 2WXG A; 2GBM A; 3I63 C; 1K8R B; 3DPD A; 1TKG A; 4ARI A; 2R2O A; 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2MQJ A; 1I4Q A; 2LHD A; 5GXG B; 2AEH A; 4LTU A; 3RUL A; 2KVZ A; 4ANV A; 1FXT B; 1XLP A; 3B2F A; 4WJN A; 3PV1 A; 3DOW A; 2QSD A; 4KVG B; 1GPX A; 4X57 B; 4JX1 C; 1LM8 B; 1E8X A; 1WGD A; 1XLO A; 2PEA A; 5JZE B; 3KW5 B; 2H88 B; 2KJH B; 1KLV A; 3CIR B; 2L0F A; 1I4H A; 2IO3 B; 2GBK A; 2LGI A; 3UIO B; 2IY1 B; 3V61 A; 5AEK B; 2MSE D; 3NRZ A; 2J4X A; 1WX7 A; 1F77 A; 4LNI A; 3H7P A; 4BBN F; 1C1Y B; 3ZQ4 A; 4WJQ A; 3K9P B; 2K5P A; 3APD A; 4E3C A; 2WXF A; 4DBG A; 4KDL B; 1T0S C; 5E6P A; 3RCZ A; 2NMQ A; 1WZ3 A; 3TBL D; 3TEZ A; 2WDQ B; 1AYF A; 4Q2J A; 1TS3 A; 3DVN V; 4G3X B; 3LYY A; 1V80 A; 1RWS A; 2G3Q B; 3VHT C; 2LAS A; 4MAC A; 4C80 A; 4EZL A; 2D07 B; 2JY6 A; 1NEN B; 1NBF C; 4JLC A; 3PRM B; 2JZ3 B; 3NZU A; 3RT3 B; 1JCK B; 2BB6 A; 2JU6 X; 3PGE A; 3RN9 C; 4FLH A; 4NJC A; 1CMX B; 2E3T A; 4OZA A; 2N0S B; 3AU4 A; 3NZS A; 1UF0 A; 4HK2 A; 5J17 A; 1E6E B; 4HDQ A; 2ACZ B; 3N1Y C; 2I2Y A; 2G1E A; 1IYF A; 1VD2 A; 4G11 A; 3LJ3 A; 1QKZ A; 1E8Z A; 1EUV B; 4M00 A; 2D5G A; 2ZVN A; 1OQY A; 4II2 B; 4FJZ A; 4AOF A; 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