1F5ZA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form i
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords N-ACETYLNEURAMINATE LYASE
publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
total genus 122
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f5zA00
3NPUA 3W7NA 2XN0A 5AYYA 1JUKA 3O6CA 3DAQA 1ME8A 4K39A 5EKYA 2NXIA 2X1SA 3G24A 1K3UA 2C6QA 2A1YA 2QCNA 4CLMA 1XKYA 1YTEA 2H3BA 1H1YA 5FI8A 2GOUA 1T8XA 4DPQA 2Y61A 4DO4A 1TPC1 2ZRXA 3HGSA 2WSYA 4TU1A 4WQ6A 2G95A 1IIGA 2FQIA 2NV1A 3CB8A 1QOQA 1Q3NA 3RFAA 1OFOA 4IGHA 1HTIA 4Z0JA 1OFQA 4AMAA 1TPH1 3KXQA 4RZ5A 3W2UA 3DH7A 3BG5A 3W7LA 4QJ1A 2C15A 2ATSA 5G4WA 4O1DA 5D33A 4UTIA 5A8GA 2VEIA 1Z44A 3S5OA 3TH6A 4UTHA 3LBCA 4BI5A 3O63A 4MZ1A 4UIOA 3PB0A 3ZWTA 5IBXC 2QUVA 1JR1A 4NZFA 1Z41A 3CU2A 5HWJA 1TSIA 2E5DA 4RJEA 4JTGA 2HS8A 2ZZ7A 3QSTA 3LXCA 3L21A 2OCZA 4YWIA 5FF2A 5BMWA 3G3MA 4OHQA 2V9DA 3P61A 2E6AA 4CQ8A 4E2BA 2ZZ3A 3FIGA 4MY1A 1O95A 4GUJA 1OFRA 4O1AA 4AWUA 1OX4A 1JUBA 1EUAA 4N4PA 3CHVA 4CCEA 1GPWA 1OHLA 3WJWA 1VC4A 3LHTA 5HR6A 4GFSA 2AGKA 2GVJA 2YPIA 1VHCA 2Y63A 1GVRA 3QMRA 3W7EA 4HNTA 4WUIA 3C2FA 1J2WA 4O11A 3KVLA 4O4WA 5KINA 4M6QA 1LRQA 5D04C 2PC4A 1BTMA 5AB3A 3W7HA 2VFFA 3TMQA 4M19A 2A0NA 2AQWA 3DBPA 4DO6A 1TTPA 3MMTA 5IM51 3SSJA 5K2ZA 3BGJA 3BW3A 1W31A 2A7PA 5GVJA 4FX6M 5DBUA 1XC4A 3USBA 3I68A 3HMJG 3W2NA 1FCVA 2TMDA 5KTLA 3MI3A 4BWLC 4LV9A 2Y7FA 1ZAJA 2ZTKA 4Y9AA 3OEXA 1GYLA 4IPJA 4A2RA 1O5KA 1X7FA 1GT8A 4UFJA 3ABSA 3W1PA 1GYNA 2FDSA 2CZ5A 3LCIA 4ZL1A 4MKNA 2KZHA 4ZZ9A 4YMZA 1G7UA 3GB6A 3IGSA 1QR7A 2X1TA 1IXOA 5BOOA 3ABOA 5K9DA 5AHEA 5G2HA 4NU7A 5FEZA 3MBFA 3S1XA 2VOMA 1LDCA 3M9YA 3W1TA 3W73A 3UWQA 3NGJA 4C1LA 2ISSA 5I3KA 2A85A 3LERA 4DXVA 3TUUA 4AF0A 1LOQA 3OVRA 5U4NA 2B7NA 3H55A 2NX1A 2VFIA 5G1YA 3M16A 1A5AA 4OQVA 3S8HA 3IV3A 2GVGA 1YXYA 3V75A 3ZFHA 1FXQA 5KMYA 3C2VA 3WK0A 4CCCA 4GUFA 1VHNA 3NDOA 5BW6A 4E2DA 4LUJA 3GXTA 3DI1A 3W6YA 2TYSA 3E02A 3I7QA 4X22A 2CLKA 4JTSA 1MEHA 4YL2A 3NPVA 4LUIA 5FF7A 1G6CA 3W7MA 3MP5A 4MUZA 2CLIA 1VS1A 2YYTA 3GAKA 5HUPA 1PHWA 3Q2DA 3F03K 4XBSA 3DFOA 4QM1A 5LNWA 2YZRA 3NQDA 3W75A 1KTBA 5KZEA 3ZS4A 5DY3A 4MFDA 5T26A 2ZYFA 1YYAA 3O8AA 3C2OA 3QC3A 5CZJA 1W37A 4BK9A 5CZSA 2FPYA 1TRDA 3CLMA 4FXSA 2J24A 3QW4B 4Q4KA 2W79A 4FX8A 5BRBA 1ADOA 3SECA 3KRUA 2QCMA 3VCRA 4O50A 4XTDA 1H7WA 1SW3A 5F1UA 3VE7A 3DENA 2BWGA 2NZLA 3M5VA 1LOSA 1YDVA 1VGAA 3TW6A 4N02A 1KM4A 3C61A 4IXXA 3FOKA 1AL7A 3KHJA 4L4LA 3KAOA 1EPXA 3CIXA 2ZRUA 3GDTA 1WQ5A 4HSOA 5HNRA 1H51A 1LTDA 1SZFA 3IGXA 2E5CA 1I2QA 1OFDA 1DVJA 3GDLA 2BZNA 2X1RA 1B4KA 3HPSA 1QPQA 4NX5A 3LCLA 5CPMA 4XUGA 1H1ZA 4JX4A 1ZNNA 3QJAA 3SJ3A 3W72A 1LLWA 1AG1O 1XXXA 1R46A 1IIHA 2CZFA 3LHYA 4UUIA 1MEWA 1TCDA 2NXGA 3LXAA 1YXCA 3LDVA 3HGRA 1X1OA 4TIMA 2FB3A 2H8XA 4JN6A 3L67A 3E12A 1TV8A 1WYIA 3PAJA 1DL3A 1JJKA 2JGYA 5D2XA 2X16A 2UV8G 1A50A 1PV8A 2FPVA 2DZVA 1G69A 2GPTA 4IWWA 2PE4A 1W0MA 1O5XA 2G5WA 1DJNA 3HB9A 3QMSA 1HO1A 5FF3A 3O6DA 1BKSA 2RHGA 3TXZA 3L0GA 3W2LA 4FNSA 5KITA 3F1QA 3TFXA 2WV8A 5C54A 3P74A 5DCBA 3CEPA 5CSRA 3WJXA 5SWUA 2P0OA 4GUGA 4A3UA 4Q32A 1VJIA 7TIMA 1GQNA 1ICSA 4A22A 1GVSA 5K7JA 3DFQA 1ME7A 4LVDA 1GVQA 2YX0A 1VCGA 3CPRA 3TKFA 3STEA 3W7PA 3OIXA 1GVFA 3L65A 4TO8A 3HF3A 5DLCA 3T55A 3UYCA 2V81A 1SUXA 3G1XA 2PRMA 3W1LA 4UTJA 1GG0A 1LM1A 3DFSA 3W87A 4NXSA 1A53A 2QKFA 4LS0A 4UCGA 2HSAA 3BG9A 4FXRA 2E77A 5F1VA 1F74A 3NQVA 1FCUA 2GJLA 1IGSA 3WJZA 4A21A 5HWMA 1H7XA 4FIRA 3TDFA 4CQAA 1WV2A 2GQ8A 3LOTA 4NNAA 4RZ6A 3PM6A 3AO0A 4LOCA 4NQ1A 4ALDA 1O4UA 2ZA3A 1XDMA 3QYQA 3W2JA 1OX5A 2Y62A 3M0ZA 4UTTA 3BLIA 1KBJA 4IMEA 3N34A 3TE9A 4JY8A 1P0KA 3T7VA 2PURA 4XKYA 2B7QA 2RFGA 3STGA 1FX6A 3QSRA 4G1KA 3WK2A 2ATMA 1YPIA 2W0UA 1X8FA 4O28A 1CX9A 2V2CA 1OX4B 3KX6A 3TAOA 4OE7A 5CG7A 4UTWA 5H2ZA 1SO5A 1LZOA 4PL1A 4UNLA 3DI0A 2JGQA 2HTMA 2QEZA 1ZY9A 3DU0A 4ZMGA 4LC6A 4ORMA 3O15A 1JVNA 4WOZA 2Y7GA 3TJLA 2A5HA 4YLWA 3HQ1A 4KWWA 3G1DA 3ANYA 4MFEA 1G4SA 3N9RA 5AC7A 1CW2A 1L9WA 1D9EA 3FS2A 4UR7A 5F4SA 2NUXA 1VLWA 2QCDB 3PWAA 1JCLA 1YDNA 3LHVA 1F5ZA 5HMSA 3NL5A 5DBTA 1K7XA 2VFDA 3HBLA 2ZA1A 2ZRVA 1EP1A 1OYCA 1SO6A 1TPEA 3G1AA 1FBAA 2WQPA 5D37A 4TR9A 4AWSA 1G4PA 4IMGA 4JTJA 1RQEA 3TROA 3NYZA 1SZEA 3A5FA 4U28A 4UNKA 2BSLA 1VRDA 3NPWA 4PC8A 3TV8A 3DGRA 2RDWA 4NT0A 1F6PA 2CLOA 2PRHA 5DXYA 4UTUA 5DCDA 3R89A 3NQ8A 3HPXA 3M5YA 3S6DA 3MP3A 3GKAA 3MHFA 3TMLA 4DBDA 3BG3A 4N2YA 1LROA 1IXQA 4S1FA 1KFCA 1F2JA 1ZHAA 4CNOA 2DZTA 3RF9A 1I2RA 3IVSA 1TPDA 2GQAA 3LX9A 1QNVA 1QPNA 1RQBA 4AF0B 5LHEA 3CTLA 1V5XA 3TSDA 4KKXA 3P5YA 3TXVA 1YDOA 1VCFA 2Z2UA 1AMKA 3WFAA 1ZALA 1Y0EA 4PFMA 1QPOA 4RKAA 5KZMA 1TQJA 1ZAHA 1TYGA 4JTEA 2Z0IA 2Y89A 3LTYA 2V30A 5G2IA 3P84A 1JULA 4K36A 3W22A 1XBXA 1R2TA 3HIJA 1FCBA 1TQXA 4JYEA 1GJPA 1B3OA 3QW3A 1FWRA 4H4IA 2HMCA 4MOZA 3KVKA 2IQTA 1EX5A 3UQNA 3DFNA 1C8VA 3FYOA 5FF4A 5CSSA 1G67A 4M5PA 2ZZ5A 2J27A 4GE8A 4ML9A 1SR9A 1KTNA 3NOEA 1XDLA 1EUNA 4UMAA 2J9YA 1OFEA 2OMAA 1TJPA 1F6KA 2O7SA 1NVMA 1FDJA 1L2UA 3L9CA 2QCEA 3W9ZA 4O19A 3S1WA 2Q8ZA 1PIIA 4MY9A 2ZRYA 3UNDA 2ZTJA 2DZUA 3IIOA 1XM3A 4HNNA 1E51A 1K7FA 1FY6A 1GTHA 5I3IA 3BLFA 4XQ6A 5BNKA 1OFBA 4JTFA 4AEOA 2EHHA 1PCWA 3HJZA 3PUEA 1QOPA 3E96A 3NQ7A 3UWVA 5I3FA 2ZBTA 3OG3A 1F76A 3C8FA 4QITA 4WZHA 4PODA 2B4GA 2XN2A 2A21A 3C0JA 3L68A 1EP3A 4ONVA 2NUYA 2YCEA 1DKWA 2G96A 1VYRA 4JTIA 3QM3A 1NF0A 5K4XA 3SI9A 4DELA 5AHIA 2ZZ1A 4ZQMA 1R2RA 5FEXA 1NSJA 1KM6A 2P10A 3EEGA 2J9XA 4O1BA 2QDHA 3PULA 3HOJA 5LNSA 3W1UA 3NM1A 2WKJA 3RK8A 3DXIA 2NWSA 3TC7A 1OF6A 4JR5A 2Q8LA 4HHPA 1W1ZA 3EX1A 3SGUA 3THQA 1M7PA 3YPIA 1JQXA 1U5JA 1UUOA 1FCQA 4A29A 3FKKA 2ZCGA 3W1RA 1FWTA 2YSWA 3LCXA 2QCCA 2CW6A 3PG8A 1UB3A 1H62A 4Q33A 3MYOA 5G4EA 2WO5A 3GNNA 3N9SA 1IF2A 1P4CA 4XZ9A 4AHPA 2QCDA 1HUVA 3A23A 3M5ZA 1J5TA 3KVJA 1A5SA 2F7FA 1K03A 3IIVA 1LRNA 3N19B 3ELFA 3CEUA 6TIMA 3C56A 3DHFA 5AYXA 3TCEA 4JDBA 3TW7A 1THFD 1Q6RA 1ZENA 3IEBA 3NNTA 3P81A 1LBLA 5CZTA 2V5BA 3MHGA 3R5EA 3EWBX 1TTQA 3GLCA 3OVPA 5F2IA 3M47A 5L6UA 3GNDA 2Z6JA 2P1FA 1T99A 4K8EA 4YXGA 3LCHA 4O13A 1VYSX 3MWAA 4O4VA 1AW2A 4FX7A 5CKSA 5D09A 2JBMA 5MHBA 2NX9A 1C29A 2RDUA 5D38A 3BV4A 3W70A 4O16A 3MJYA 3QFEA 3UWWA 3W1NA 5I3JA 2C18A 2GVLA 3OVQA 3UPWA 2OT1A 1UJPA 3UWYA 3FLUA 4GRSA 2VKZG 3WK3A 1HO4A 5AN7A 4NUWA 4K7YA 2A6LA 4EVZA 4N9BA 3IVTA 3W2MA 3BO9A 5G5IA 4UTKA 2ALDA 5AHNA 4JIQA 1SU5A 1JCXA 1K8XA 4RV8A 2V82A 3D0CA 2VXNA 4S2CA 4MVAA 2LLEA 1TRIA 3Q58A 4JICA 4POCA 3I6RA 2YW3A 4ICNA 4TX9A 1T0OA 2TRSA 3L5LA 4NJGA 3SZ8A 3KFTA 4K37A 1XL9A 2ZZ4A 4OT7A 1WXJA 4XKYB 3CIWA 1P1XA 5TBOA 5CZ0A 4ADTA 2G97A 2ZFAA 4MJMA 4GWEA 3O05A 2OX1A 4WOQA 4XWUA 4FF7A 1QDSA 3WK1A 2WPBA 4YCOA 1JRBA 1L6WA 3PSWA 5HR7A 1A5CA 2ZZ2A 5EPDA 4R33A 1S5VA 1UUMA 3ABQA 4O14A 4PTNA 2QJIA 3QPYA 1QO5A 4UR8A 3S9YA 4JDYA 3LI1A 3MBDA 4DEFA 1DORA 2EKCA 1P0NA 1L6SA 4NZJA 3W84A 1EWEA 3LXBA 3LI0A 3BARA 4QAIA 3H53A 4NJIA 2F84A 4GJ1A 3G1HA 3A5VA 5DXXA 5AC6A 1EB3A 1F7BA 2QJGA 4JIPA 1R30A 3DFTA 1DHPA 3UZJA 2ZRWA 1OFAA 3BLEA 3PG9A 1YPFA 5AHMA 1R2SA 2Y6ZA 3SFKA 4AXKA 4NNBA 1PS9A 3QQ1A 4JX5A 3LRMA 3MYPA 1XUUA 1D3GA 4FO4A 2Y88A 3E9AA 3PC0A 4HIBA 3S5YA 1FWNA 3LCFA 3JS3A 3SR7A 2V5LA 4ZQNA 1TPFA 4UTTC 5L9FA 4AHOA 4XBKA 1J4EA 5DELA 2WSQA 3LHUA 4ZQOA 4UFKA 1XFBA 2NUWA 1CI1A 4N9EA 5EA9A 4YCPA 2QCLA 5D2VA 1JCNA 1X6UA 4AWTA 1V7YA 2C1HA 4UTWC 1R47A 1OG0A 3GR7A 4IMCA 3R12A 3NAVA 1FXPA 1H60A 1B4EA 4Z1CA 4UMBA 2FPTA 4MZYA 3EKLA 1WDWA 2E6DA 3DFPA 4O12A 4X2RA 3W83A 5FEWA 4GC4A 3G1FA 5EYWA 3DHDA 5C55A 1OJXA 4HNUA 3UY8A 3W1QA 1F05A 5LSMA 5K9XA 3VKJA 3EWYA 2PCQA 4MPQA 3RNDA 5J5DA 3BPWA 1I4NA 2GJNA 3W7RA 2JKEA 1SO4A 2VFGA 4OBTA 3EXRA 2BX7A 2B7PA 4KWVA 3S1UA 3QRHA 2H90A 1TPWA 2QCFA 4LRTA 3S1VA 2YYUA 1DQWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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