1F76A

Escherichia coli dihydroorotate dehydrogenase
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
MYYPFVRKALFQLDPERAHEFTFQQLRRITGTPFEALVRQKVPAKPVNCMGLTFKNPLGLAAGLDKDGECIDALGAMGFGSIEIGTVTPRPQPGNDKPRLFRLVDAEGLINRMGFNNLGVDNLVENVKKAHYDGVLGINIGKNKDTPVEQGKDDYLICMEKIYAYAGYIAINISSPNTPGLRTLQYGEALDDLLTAIKNKQNDLQAMHHKYVPIAVKIAPDLSEEELIQVADSLVRHNIDGVIATNTTLDRSLVQGMKNCDQTGGLSGRPLQLKSTEIIRRLSLELNGRLPIIGVGGIDSVIAAREKIAAGASLVQIYSGFIFKGPPLIKEIVTHI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone)
publication title E. coli Dihydroorotate Dehydrogenase Reveals Structural and Functional Distinction between different classes of dihydroorotate dehydrogenases
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 121
structure length 336
sequence length 336
chains with identical sequence B, D, E
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2000-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f76A00
1FDJA 2QEZA 5F1UA 2B7NA 1SSDA 2DZPA 2UV8G 5KZMA 1P0KA 1RPXA 1Q3NA 2QJHA 4FNRA 1KM1A 1LLZA 2A7NA 3PSWA 4KWWA 4FB7A 1T99A 5D09A 2VXNA 1LTDA 4U4MA 4RJEA 2A1YA 3C4UA 4MOZA 3NQGA 2ZZ6A 1QMLA 1JVNA 5AHEA 4MY1A 1VPXA 4YMZA 4K38A 2DZSA 4HT3A 3GDMA 2CW6A 3VFLA 1QPRA 8TIMA 5F4XA 3G0SA 3CM4A 3BLFA 3E96A 4NJKA 3KX6A 1R2SA 3I7RA 5CGQA 1W1ZA 5HR7A 3INPA 1B3OA 1GQNA 3CB8A 3B0UX 4IJBA 3LHWA 1H7NA 2Q3RA 4Q4KA 3TW6A 5LSMA 4MYAA 1XUZA 3TQKA 2DORA 5BRBA 1SZGA 1OX4A 4BWLC 1TYGA 4LVGA 1R46A 3SSJA 1FDZA 1QFEA 4FX8A 4MZ8A 4K6AA 2CZFA 1H61A 2X1SA 3GK0A 1LM1A 1S5TA 2TMDA 5CZ0A 4MLRA 1H7PA 4OV9A 3G1DA 1W3IA 3G1SA 4IXXA 4EF9A 1XDMA 3MWAA 2YW4A 5L9FA 2QCHA 1OFEA 3M6YA 1W0MA 4TU1A 4DO6A 3BW2A 1AW1A 1PL9A 3ZS4A 3OBKA 3JS3A 2OT0A 4NJIA 4MLJA 4R33A 3EWXA 2OZ0A 4LVBA 4UTLA 1K02A 2Y7GA 3HBLA 1O95A 1MEWA 4DPPA 2Y7DA 3F4WA 4JY9A 2EGZA 3ZWSA 4RCXA 3LRMA 4PEKA 5CG7A 1JUEA 1OYCA 3GVGA 3P81A 3S1UA 1W5OA 3T40A 5LNWA 5LGXA 4LV4A 2GJNA 3LBMA 1ZENA 2Z6IA 2HMCA 3R2GA 2ISSA 3PM6A 3W1QA 4Y9AA 2I14A 2TSYA 3PUOA 5CPMA 5EL1A 4B5NA 3TCEA 4WY0A 1W5MA 1N8FA 2XN2A 3FS2A 2P1FA 3L66A 4PL1A 4Y96A 2V81A 1BKSA 1D3GA 4UFLA 1FDYA 4UFJA 1W56A 2CZDA 3TU9A 3OVQA 3R8RA 4HPXA 4O10A 4UNKA 4LS2A 3O6DA 1RR2A 3P61A 3L68A 3DAQA 3TX9A 4Z1CA 3SIZA 4N02A 3FOKA 1TTIA 1AMKA 3KRSA 5I3FA 3GXTA 3P74A 1H60A 3TK7A 2ZRWA 3LCIA 3MUXA 3TKFA 3LCLA 3M47A 1QO5A 1TPB1 1EWEA 3PUEA 4Z1DA 2Y7FA 1G7UA 3R13A 4KKXA 5IM51 3W87A 4UTMA 1VYSX 4DF2A 1XC4A 5GVJA 4N4QA 3BLIA 4K8HA 5D2WA 3T44A 1VCGA 2CLEA 4A3UA 3V75A 2HSAA 2I9EA 2QCNA 2DZUA 1O60A 1GT8A 2FPTA 3PF3A 5AB3A 5AHIA 3UWUA 1SW0A 4O14A 3QQ1A 1VYPX 2A21A 3IEBA 2CU0A 2FTPA 4K8EA 5ABTA 2EPHA 3TW7A 2E6FA 4JYEA 2ZYFA 4JX5A 5KTLA 4NZJA 2NXIA 4X22A 5D33A 1DJQA 1CI1A 1Q6QA 4G1KA 2VEPA 4P61A 3W07A 3ZFHA 1VLWA 3USBA 4OWGA 1Z42A 1DHPA 3VE7A 4N2YA 5CPNA 4AF0B 4HNVA 5DN1A 3FFSA 1YTEA 3N2MA 1K3UA 3M44A 3E12A 4CLMA 4LS0A 3MHGA 4IXHA 2ZZ7A 3QM3A 3MBDA 2YZRA 4AWSA 1FWRA 1VJIA 1ZAJA 3GNDA 4UMBA 4O52A 3RK8A 4GFSA 5BMWA 3S42A 4LS1A 3DKJA 3MI2A 3HGJA 3BPWA 3U8GA 3RF9A 5CZTA 3W7DA 1SO5A 3GXPA 4FNSA 2V2DA 5K4ZA 1KLYA 2H3BA 5A5WA 1OFDA 2FLIA 4HSNA 5K9DA 1C8VA 4I9AA 2XN1A 4QJ1A 1VH7A 3VCRA 5C54A 1O4UA 3LHTA 3QSRA 3GX9A 2ZTKA 1NSJA 4LRTA 5AYYA 1DL3A 2GQ9A 4HNNA 1XBXA 2JBMA 2LLEA 3CIWA 4A21A 5EYWA 5FF0A 4ZQNA 3STFA 1KFKA 2H90A 1OG0A 1G7VA 1LYXA 2JKAA 1GVOA 3NQFA 3BG9A 4OBTA 4IPJA 1WAUA 3UZJA 4RR4A 2RHGA 4MFDA 2ABBA 3EWYA 3T78A 5F4SA 3PUDA 3YPIA 1M7OA 4ZQOA 1H1ZA 4O50A 5HR6A 5AHLA 3EXTA 4WZHA 4O19A 2B7PA 3PS7A 4CCEA 2C0AA 5C55A 5EMUA 2QCDA 1OX4B 1H63A 2V2CA 3MHUA 4PA8A 3W7QA 4UTTA 2QJGA 2NLIA 2ZRVA 1F05A 4UTJA 1QR7A 3W70A 1VS1A 1ZFJA 4KFNA 2QKFA 1UUOA 3W3OA 3L67A 4JX4A 4PFMA 1FXQA 2NWSA 4AEOA 2NZLA 1OFAA 2VFFA 4QSHA 3NPWA 2A0NA 3UQNA 4MKNA 4UCGA 1E51A 2A7RA 4XTIA 4CCCA 3PBWA 3PR2A 4ZQRA 1FQ0A 1JQXA 5FF2A 2P0OA 3GAKA 2A6LA 3PULA 4EIVA 4DXVA 3LERA 2P10A 5TBOA 4ADSA 1J2WA 5CZJA 1GZGA 3DKLA 3A23A 4N9CA 2X1UA 1XBYA 2J27A 4JEQA 4N4PA 4ADTA 3ATZA 3PG9A 2Y62A 4O18A 1GTHA 1OF6A 3PVFA 4JR5A 4AVFA 3IVTA 4WD0A 4MJZA 3M9YA 2Q8ZA 1GJPA 4ML9A 4BF9A 1JCXA 3TH6A 3A9IA 2Z0IA 4DEFA 3G22A 4O28A 2A4AA 2BSLA 1OYAA 2ISVA 3QZEA 2E09A 5T26A 5EY5A 4OGZA 3TAKA 1T96A 4WY0B 4C1LA 1ALDA 3ABQA 3RMJA 1H7WA 1K7EA 4BWLA 1T8XA 3DH7A 5AN7A 2BZNA 2PRMA 4NX5A 5D30A 4ORIA 2YW3A 3BVJA 3P82A 2JGYA 1SFJA 5TIMA 3MYOA 1HL2A 4NXSA 5F2GA 1W5NA 3QMSA 3G1AA 3W7RA 4PCFA 1H62A 3ABSA 4S2CA 5AC6A 4GC4A 3NOEA 3NEVA 5LKYA 1GVQA 3LRLA 1YXYA 3LCXA 5KZEA 3EX6A 1JCNA 3TQ0A 3W1LA 3DI1A 1B4EA 1QNVA 1S5VA 4GUGA 4RLIA 2HTMA 5LHFA 4UMAA 4JX6A 3LV6A 1G67A 2IQTA 3FYPA 5J5DA 3DI0A 3D0CA 3TSDA 1KBJA 2AAMA 1QWGA 5D03A 4UC5A 4RZ5A 2B7OA 2E68A 1QOPA 3DU0A 1F76A 3H55A 3IGXA 4H6KA 4IPIA 2A5HA 3QEZA 4YXGA 1EB3A 1TQJA 5AHMA 4S1FA 4JTHA 2R14A 2WO5A 1R2TA 3LHYA 4A22A 2ZDRA 3MJYA 3NPVA 5CZSA 1K8XA 2DZVA 5E1QA 1H5YA 4GJ1A 5HJLA 1WXJA 1X1OA 4R53A 3SW6A 1O5KA 1RV8A 3M0ZA 4JTEA 4ZMGA 1SO3A 3QW3A 5DXXA 2QAFA 2ZTJA 3W2MA 2ZZ5A 2QUTA 1TPFA 5C2XA 2V8ZA 1LBMA 2E1DA 3NQ7A 3UXDA 5DY2A 1TQXA 1WV2A 5KINA 3P84A 1XXXA 1ZAHA 4WXYA 3QH2A 3EWBX 3MO7A 4XQ6A 1TTQA 3DBPA 4UFKA 4ZQMA 4JN6A 3L2IA 4TMBA 5AHFA 3ZWTA 2YSWA 3NQCA 3B03A 2GVGA 1JCJA 2CLOA 2B4GA 2QCGA 3OIXA 4X3ZA 2JKEA 2TRSA 5I3KA 1JCLA 1F74A 2PC4A 5AFDA 1TPWA 5F2IA 4M6VA 3TXZA 2FIQA 1TREA 4HN4A 1I8JA 3B0PA 5F2MA 1LROA 5F2LA 2R8WA 3PG8A 2V9DA 3KOFA 1MXSA 3NL3A 5F1VA 2X1TA 4Z1AA 3FEMA 4Z08A 2QDHA 2DJLA 3FLUA 4TR9A 3NXFA 2QCMA 1VQTA 4X2RA 1OX6A 5HULA 1EUNA 1LRTA 5CSRA 3CU2A 2X16A 3GKAA 4WQ6A 1PVNA 1M6JA 3WJZA 1JCMP 4XKYA 4HNTA 4NVTA 3M5ZA 1F6PA 2C1HA 4K7VA 3M7WA 3M41A 5TQLA 3UWVA 4NNCA 2QJIA 2NV1A 1FUYA 1RVGA 2QCDB 3KAOA 2E6DA 2BWGA 2WNNA 3N14A 1EP2A 2C14A 4K36A 4DQWA 1DV7A 1EIXA 4H3DA 1DJNA 1R47A 4M7TA 1DKWA 3KVJA 5BNKA 3BG3A 2NV2A 4DBEA 4KFPA 1GYNA 2D73A 4A2SA 3W7IA 3TFCA 3S6DA 1KFLA 3LM7A 3HO8A 3WJXA 3RNDA 4FNTA 1I2PA 3TXVA 4FO4A 1VCFA 3CEPA 3NQ6A 4MFEA 3WK0A 3S5OA 1QPNA 1TV5A 1YADA 2BX7A 3OEXA 4UTUA 5LNRA 4NNBA 4WOQA 1R2RA 1YPFA 2OT1A 4LTSA 3L0GA 1T0OA 3G8EA 1FWNA 1XM3A 1TRDA 1A5SA 3LV5A 1L6YA 1SPQA 1NVMA 1FXPA 2OMAA 3C2RA 4LV9A 4UFHA 3FYOA 4JTUA 3IVUA 1A53A 5KZDA 2R91A 4LU0A 1DQWA 1JULA 1PIIA 4FNQA 2X1RA 3EWUA 4FEZA 3KHJA 4HIBA 1RQEA 3N2XA 1KBIA 3TFXA 4RKAA 1W37A 6ALDA 1HUVA 3DFOA 4POCA 3MMTA 3K30A 4QIUA 1ZAIA 4ONVA 4RK8A 4XZ9A 4RV8A 3Q58A 5I3GA 4MUZA 2V5BA 2WOQA 1SSGA 1K8YA 3S5ZA 1EP1A 4IMFA 2O7QA 3C2FA 3HG3A 2ALDA 4IWWA 3EEGA 1FCBA 4EOUA 2JK2A 1EA0A 4MZYA 3W7LA 1GG0A 4ZZ9A 3UXAA 5CPOA 3PBUA 1BWLA 4TO8A 4UTHA 3GR7A 1KM3A 2WSYA 4L4MA 2YGYA 4I7VA 4CNNA 3GNNA 1XUUA 4PTNA 2ZZ3A 4E2DA 3B06A 4M6QA 3W86A 1OK6A 3TAOA 3M16A 3STCA 3TJLA 1XKYA 3EX3A 2ZA1A 4GUIA 3IIOA 3W1RA 3DZ1A 4GUJA 3B0VC 2QCFA 3TMQA 2E5DA 4GWEA 2PCQA 1Z44A 3L0KA 2PRHA 3CEUA 1TPUA 1QPOA 1KW1A 3IIPA 2C15A 3CT7A 3HGRA 1GEQA 3LGEA 4M7SA 1AK5A 3LTYA 4DPQA 1D3HA 1MO0A 5I3HA 3LXBA 3LLFA 3SECA 1JCYA 2G5WA 3LI1A 1YPIA 4JTKA 3NNTA 1N55A 4DO5A 3C8FA 2GVLA 3G1FA 1CW2A 1UASA 1X1ZA 1KLZA 1P1XA 4RX0A 4QM1A 3TSMA 5EKYA 4O15A 4JTLA 3MP3A 4N9DA 1ZY9A 5K7JA 3WJSA 3W84A 4LUJA 1GG1A 4QAIA 2H3DA 3EWWA 5SWUA 2CLIA 4UR8A 1GVSA 1J5TA 2DU2A 2VELA 3CIXA 3NL2A 5HINA 2YCEA 5G2HA 3HB9A 4O0ZA 4AXKA 3P5YA 1HO4A 1O94A 3S8HA 4NUWA 1MEHA 3GKFA 1DOSA 3OG3A 2OJPA 1TRIA 2W6RA 1C9DA 2GQ8A 3NQ8A 5C6MA 1VZWA 3ZR4A 3HPSA 4E38A 1OX5A 4O1BA 4FIQA 3G3MA 2OX1A 1VC4A 2VEMA 1IXPA 4DELA 5HWJA 3TQVA 1QCWA 1N7KA 3O16A 4NJJA 3QPZA 3UD6A 3W74A 5K2ZA 2TYSA 3EKZA 4XKYB 3IIXA 4O13A 3LI0A 3N9SA 3TA6A 4MIMA 3O05A 4AMAA 3BO9A 1I4NA 4NU7A 1TTJA 2PURA 1XL9A 1ZNNA 4FX7A 4IX0A 5D02A 4HPJA 3MI6A 5U4NA 4ZQCA 1TIMA 4K7YA 5AHNA 2NX9A 1F73A 4R7JA 4MPQA 2NUYA 4OV4A 4AB4A 4O16A 2QDGA 4GBUA 2B7QA 4MVAA 3WJWA 4S2BA 5HNRA 3W85A 1KA9F 1IXQA 4CCDA 3R5EA 1PHQA 1FCUA 2VFHA 2ZCGA 1QOQA 3IGUA 3T4CA 3W73A 3MYPA 2W0UA 1I2NA 2WV8A 3CWOX 1SO6A 2RFGA 3E9AA 4YL2A 3H53A 5FEZA 2GUUA 3W76A 3G0UA 3G0XA 1KFCA 3W1XA 2HS6A 2E5BA 3O07A 3O1NA 3M5YA 3SGUA 2ABAA 1ICSA 5FF7A 1LZOA 4IMGA 3S5YA 3NZ1A 2ATMA 1YDOA 2R94A 3A22A 4DF1A 3HOJA 1XCFA 2CZEA 1OVDA 3C52A 3TJXA 1XBVA 1H50A 2V82A 4QISA 3LBCA 2J9XA 3UZ5A 4XBKA 4Z0JA 3AO0A 4O0KA 4GUFA 3DENA 4JY8A 5J5RA 1AL8A 3R89A 1V5XA 4LC8A 4WXZA 3TDFA 3NQVA 3I68A 4JIPA 5D2YA 3STGA 1TJRA 2QUVA 3DFQA 4FXRA 3NL6A 4JNMA 1LCOA 3W7JA 3BW3A 2WSRA 3SZ8A 1G69A 2HS8A 3LCGA 4JTJA 1XDLA 3KVKA 3N9RA 3I7QA 2G95A 1AW2A 2ATSA 1HTIA 4L4LA 4YCOA 2EF9A 4JD4A 3MW7A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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