1FCB | Genus

Total Genus 147

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	147
sequence length	511
structure length	494
Chain Sequence	EPKLDMNKQKISPAEVAKHNKPDDCWVVINGYVYDLTRFLPNHPGGQDVIKFNAGKDVTAIFEPLHAPNVIDKYIAPEKKLGPLQGSMPPELVCPPYAPGETKEDIARKEQLKSLLPPLDNIINLYDFEYLASQTLTKQAWAYYSSGANDEVTHRENHNAYHRIFFKPKILVDVRKVDISTDMLGSHVDVPFYVSATALCKLGNPLEGEKDVARGCGQGVTKVPQMISTLASCSPEEIIEAAPSDKQIQWYQLYVNSDRKITDDLVKNVEKLGVKALFVTVDAPSLGQREKDMKLKFSNGASRALSKFIDPSLTWKDIEELKKKTKLPIVIKGVQRTEDVIKAAEIGVSGVVLSNHGGRQLDFSRAPIEVLAETMPILEQRNLKDKLEVFVDGGVRRGTDVLKALCLGAKGVGLGRPFLYANSCYGRNGVEKAIEILRDEIEMSMRLLGVTSIAELKPDLLDLSTLKARTVGVPNDVLYNEVYEGPTLTEFEDA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase (ch-oh(d)-cytochrome(a))
molecule keywords	FLAVOCYTOCHROME B2
publication title	Molecular structure of flavocytochrome b2 at 2.4 A resolution. pubmed doi rcsb
source organism	Saccharomyces cerevisiae
total genus	147
structure length	494
sequence length	511
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.1.2.3: L-lactate dehydrogenase (cytochrome).
pdb deposition date	1990-01-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00173	Cyt-b5	Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain
A	PF01070	FMN_dh	FMN-dependent dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.120.10	Alpha Beta	Roll	Flavocytochrome B2; Chain A, domain 1	Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain	1fcbA01
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1fcbA02

4IX2A 4ZQNA 5BOOA 1XDMA 4A21A 5E1QA 3QSRA 2VKZG 3QMRA 3C8FA 1D3GA 1WQ5A 4BR1A 1OF8A 2C14A 3S1VA 3UXAA 1PIIA 4DQWA 4K8EA 4LY8A 5LKYA 3L5LA 2GOUA 1F03A 3TFCA 1ZNNA 5CPNA 1W3NA 3FFSA 3THQA 5BMXA 3B04A 4KKXA 1OVDA 4AEOA 3LOTA 2IQTA 3LXBA 1GQNA 2VFGA 5FF4A 2X16A 1G7UA 3TQ0A 4NU7A 3L5AA 3NPXA 3P5YA 2CZ5A 1TPEA 2BLEA 4PCFA 3OVPA 4H6KA 4IOTA 3W2LA 1VYRA 3W9ZA 3B03A 3NZ1A 5H2ZA 4O0ZA 3ABOA 1SZEA 1L2UA 1FCVA 3STFA 1S5WA 4JDBA 1XFBA 4FXSA 2E5DA 1DVJA 3TH6A 1GPWA 1JQVA 2Q8ZA 4YLWA 4LW7A 3HGOA 1MEWA 4MY8A 4BI7A 4WXZA 3DFSA 4UNLA 1UASA 1OHLA 2B7QA 5AYZA 3LCLA 3W7GA 1B5AA 1OFPA 2ZTJA 3DBPA 3EWZA 5K9CA 3LTPA 2FB3A 4UUIA 3TW6A 4NZFA 3QEZA 2ZZ3A 4ZQRA 2RFGA 4KWVA 1XBZA 3QJAA 4CNNA 1GZGA 1TRIA 4K39A 4DEFA 1H7XA 3QF0A 1W31A 3FS2A 2QCHA 3HMJG 4WJEA 4Y6GA 2XN1A 4LS1A 3MBDA 5BRBA 4M7TA 1TQXA 2H3BA 2FPTA 5D2VA 4RK8A 1OF6A 5I3JA 4LOCA 2GVLA 2G5WA 1X1OA 4JIQA 4FIRA 3E9AA 4AHOA 3QQ1A 3S9YA 2G97A 1TJRA 4DF1A 4Q33A 5CPLA 1XBYA 3BW3A 4LV9A 2Q3RA 2W79A 3HGJA 4AVFA 3WK0A 3S8HA 5F4XA 1W3TA 2A5HA 1AW2A 3TSDA 3UY7A 3O63A 1QFEA 1QAPA 2ZA3A 1X6UA 3HJZA 2OT1A 4HKPA 2DORA 2XN2A 3KVLA 5U4NA 2VFIA 3EEGA 3MMTA 1TPUA 4HIBA 3HG4A 4QJ1A 2WV8A 3CEPA 5ABTA 4OV9A 3W2UA 1NF0A 3PM6A 1TV7A 4JTEA 2V82A 2OT0A 3L68A 2TSYA 4AH7A 5HWMA 3P7YA 1I2QA 2JGYA 3V75A 4K36A 4TO8A 1VS1A 3G18A 1K02A 5D2WA 3W85A 1O60A 2BWGA 2QAFA 2QUVA 5FEXA 3L65A 3MHGA 1SQ7A 1R46A 2Y7EA 1KM6A 5EL1A 4GXMA 3BARA 3NQ6A 1OG0A 3TXVA 1Z42A 4KWWA 3W75A 4GUFA 3A5FA 3N19B 3NG3A 1J03A 3STGA 4N9BA 3TXZA 2VEMA 1OJXA 1OFEA 4N9CA 3MJYA 2NXHA 3R5EA 3P82A 3M0ZA 1G67A 4O13A 5AHIA 1BEUA 1TV8A 1VYSX 3L0GA 4AXKA 4H4IA 4JTGA 3NQAA 1KM0A 3GDMA 3LHZA 2TPSA 2NUYA 4OU1A 2ATMA 3LBMA 1GTEA 4M6QA 5TIMA 1IXNA 1FWRA 3A5VA 2A21A 5LNSA 1ES1A 2C19A 7TIMA 4KFNA 3CPRA 3SGZA 1JVNA 4O53A 1UB3A 3RMJA 2V81A 1OYBA 2H3DA 1RVGA 4IPIA 3ZFHA 1SPQA 3W87A 1YDVA 1F74A 3GB6A 1A53A 3UWVA 1LZOA 1I2NA 1XC4A 1U5JA 5BMWA 4UTKA 3E49A 3F1QA 2I9EA 1W1ZA 3OIXA 4NNAA 1THFD 1KFCA 1VPXA 3T44A 2FQIA 3STEA 1W0MA 1W56A 4O19A 2CWNA 4E2DA 2WNZA 1YPFA 3HGRA 1LOSA 1QDSA 5D2YA 2FTPA 3P61A 2ZRUA 1M59A 2PCQA 5LNRA 5GVJA 3VKJA 1SR9A 3LB0A 4K6AA 4XUGA 4JTLA 1QCWA 1LQXA 2O7QA 3IRDA 1TTIA 2YW4A 1M5WA 1DJQA 1A5SA 4ORMA 2O7SA 1VHCA 3LHUA 1OFRA 1FQ0A 2WNQA 1UCWA 1M7PA 4O11A 1F05A 4UMBA 1KA9F 2WOQA 3MWAA 4JYDA 1A5CA 3W71A 4M5PA 3NPVA 1F7BA 5HNRA 1LP6A 4TMCA 5LGZA 4IQLA 4UFMA 5CPOA 3S1WA 3FEMA 3G0SA 1T0GA 5LNVA 3LCIA 5LNWA 3GK0A 5L9FA 4XTIA 3PBYA 3QQ0A 2R14A 3KAOA 3W7PA 1KM4A 4MY1A 1YYAA 4MJMA 4X2RA 3BPWA 3FA5A 3JRKA 4WQ6A 4X22A 3U6WA 3DFNA 3W1AA 1JCYA 4OT7A 3CTLA 3HPXA 1WV2A 3NQ7A 3ABRA 3T78A 3HPSA 3W2MA 1F6PA 3IIVA 3PY2A 4WY0F 1H50A 3G8EA 4A29A 1JCLA 4RR4A 1P5BA 1AQAA 1WOAA 4JDYA 2QDGA 1SZGA 1AG1O 1TTJA 3LI1A 5C6MA 4GJ1A 1EX5A 4LVFA 3E02A 3UY8A 4FIQA 2ZA2A 3O15A 2DZPA 3M6YA 1LOQA 3GYEA 3Q2DA 1GYNA 1MO0A 3IEBA 4LWWA 5CZSA 3TK7A 4O50A 1VHNA 1AW5A 1IXQA 5KMYA 5CPMA 1LYXA 1J5TA 4GNJA 3W23A 2ATSA 2A6LA 1YADA 1ZALA 1R2TA 2CLIA 2VEIA 4JTUA 2E09A 3BO9A 1TPFA 3H54A 4S2CA 2QCMA 1AWPA 1H60A 2ZYFA 3F03K 5DCDA 2NX9A 3MP3A 3TA6A 3VE7A 3T7VA 4O8RA 3UWUA 1OX4A 3GAYA 4P2VA 4UR8A 1RD5A 5F4SA 3NQ2A 3P8IA 4GUJA 2VEPA 3G8RA 3GR7A 1W8SA 5EKYA 2FJKA 4Y8FA 5DBTA 1W5QA 1QO2A 1DHPA 5F2LA 3UYCA 2V30A 3P5ZA 3FJ6A 5HWJA 4EF8A 2JKEA 1FXQA 4GWEA 3ZS4A 1LRNA 3BVJA 2QJIA 2ISWA 4OHQA 2C13A 3TUUA 2EKCA 4JR5A 1FBAA 1T99A 1LRTA 1M6JA 3ANYA 1DQWA 2FFCA 4RCXA 3RK8A 1MNYA 1TYGA 4NX0A 3UWZA 4O4WA 4Y96A 3QFEA 4R33A 3KHJA 1TPWA 4RZ4A 4PTNA 3EXSA 2J9XA 3KOFA 4QSHA 1HL2A 1IETA 3M43A 3EB2A 3H55A 4UFHA 5F2IA 1G69A 5KITA 4MLJA 3W86A 5KTLA 1YDOA 3DZ1A 4B8NA 3KRUA 2CLHA 1U83A 3M1ZA 3NM3A 3UD6A 2NV2A 4ZQCA 1F76A 4TX9A 2DZWA 3N2MA 4EVZA 1O94A 3LRKA 3NQCA 5AHFA 1EA0A 1OX4B 1VLIA 4GE8A 2Y61A 4UNKA 5IM51 1LRQA 1ME8A 1QNVA 4JN6A 1VQTA 3CQ0A 3P67A 1OFQA 2DZXA 4L4LA 5FEZA 1MEIA 3W7NA 4O16A 1ML1A 3WJYA 4BFAA 4R53A 1FWTA 1JULA 1A5BA 1QMLA 3NXFA 1QPRA 1XL9A 1TV5A 2DZUA 4TIMA 4ALDA 4R34A 3LXCA 2CLFA 1Q6LA 4QITA 4LUJA 2Y7GA 4J9JA 5CZ0A 4ICNA 4LU0A 3TJLA 3PF3A 2NWRA 1KFKA 4CNOA 2ABBA 3G0UA 1HFBA 2ZA1A 4ZZ9A 3DENA 3L67A 1AMKA 2M33A 1C9DA 4FX8A 1OFBA 1RR2A 1NX7A 4O0KA 1IIGA 4NXKA 5HINA 4UTUA 2OZ0A 4LS0A 1UBSA 1O5XA 3M7WA 4IX0A 1XDLA 3SFKA 4WUIA 1SO4A 1T8XA 3WK3A 3IGSA 2YYTA 4I7UA 3MHFA 4QQ3A 2FDSA 3N2XA 2E6DA 2V2DA 2Y7DA 3NL6A 2P10A 1DKWA 2B7OA 2ZDRA 1QO5A 1PS9A 4R7JA 5G2HA 2DU2A 4Q32A 3SECA 1UUOA 2X1UA 2ZFAA 1FDZA 4X3ZA 3PBVA 3EX3A 4OV4A 1FWSA 1JJKA 3TQVA 1WAUA 2X30A 5I3IA 2CZEA 2ALDA 3ABSA 3EKZA 3QM3A 4JY9A 4M6PA 4DBEA 2VFEA 1LTDA 1EUAA 2AAMA 2VENA 5CSRA 3UZJA 3CLMA 3GDRA 2PE4A 3R13A 1KLZA 4LT9A 2W6RA 1HTIA 4AF0A 1IGSA 3GAKA 2EAWA 2DZSA 1Q6OA 2V5LA 4HPXA 1KLYA 1W54A 3V1PA 4YL2A 3TFXA 3PSVA 1R2RA 3W07A 3NPWA 3BG9A 1EP1A 1I2OA 3NQMA 3C2FA 2A85A 2QJHA 1TPB1 4O4VA 3O1NA 1HO1A 1ADOA 1K7FA 1M20A 3MHUA 3G1DA 1WYIA 2V9DA 3GDKA 2ISSA 4O28A 4WOZA 4Z1BA 4UXDA 1DORA 3F4WA 3FYOA 2HMCA 2ZQ0A 1S5TA 2EPHA 1AXXA 1BLVA 3DGRA 3PVFA 1G4EA 4BI6A 3WJWA 1JCXA 2H90A 3KX6A 3W7CA 1SW0A 4XZ9A 2RKXA 2I89A 4LTSA 2H8XA 4I7VA 4CCDA 4FHAA 1RV8A 3CC1A 4LV4A 3M5YA 2NZLA 5F1VA 1XBVA 2PRMA 5DXYA 1TPDA 1H5YA 2V8ZA 3P8JA 3LRMA 4IXXA 2JKPA 3KVJA 4A2SA 1R2SA 2B7PA 1XM3A 1QWGA 4QNEA 5FEWA 1JR1A 3QPYA 3EKLA 3LHYA 3W74A 3E12A 3W2NA 2CLEA 2AQWA 1BTMA 3KXQA 3LM7A 1ALDA 3W2JA 1H51A 1JUKA 4HHPA 1W3IA 5HWNA 1G7VA 3G1SA 2A7PA 3S5ZA 4PH6A 4RJEA 1AW3A 3NEVA 3LI0A 3DFTA 3NQGA 4AF0B 3IVUA 3C61A 4K8HA 4PODA 3W7LA 1DO9A 1K7XA 2FPYA 2ZRWA 4NJGA 4WY0A 4W9TA 2QKFA 2J27A 4UTWC 1KTNA 1EPXA 2UV8G 1YDNA 3W88A 4MJZA 3W84A 4JEQA 3C56A 4DF2A 2CLOA 3B0PA 1ZENA 3TROA 2CLLA 1FX6A 2FIQA 2QCDA 1HKOA 1RZMA 3ELFA 5EY5A 1H62A 4CQ8A 1OYAA 1SFLA 4CQ9A 4UTTC 3UPBA 4AWUA 1NVMA 1T96A 1CI1A 2ZRYA 1Q3NA 3FLUA 3P84A 3HO8A 4LVBA 1IB7A 2RDWA 1CXYA 3LV5A 1EP2A 1YXCA 3W1TA 1W5PA 1WXJA 1X3XA 5AC6A 2WQPA 4AB4A 1WOBA 3TV8A 2OJPA 3W6YA 3LHVA 4DPQA 2E5CA 2GJLA 1VCFA 3G1AA 2H8ZA 2I14A 5FI8A 4BWLA 2XFWA 1Q45A 2B0MA 5F4WA 1EWEA 3ABQA 2ZZ5A 3UPWA 1TB3A 2Z6JA 3I7RA 3FJLA 5G1YA 1DBTA 3HOJA 2B7NA 3DKLA 3NM1A 3SI9A 4CLMA 3W7MA 4LS2A 4RZ6A 2VFHA 1J2WA 4TMBA 3UNDA 3TC7A 1NAL1 5I3HA 1OFAA 5AHLA 4ORIA 3G0XA 3IVSA 3TIMA 1UJPA 4QISA 3GXTA 4WY0B 5HUOA 4JTKA 3SR7A 3LTYA 1EHBA 1ZAIA 2ZZ2A 3BLFA 5LNUA 5FEPA 5K4XA 2E77A 3KVMA 2ZZ7A 2QCDB 1FCUA 1CYOA 1MJ4A 4FEZA 4U28A 3W7DA 4FX6M 1U9MA 3X34A 4N9EA 1ICPA 4Y9AA 4Z1AA 4NT0A 3GNDA 3W22A 2FLIA 3DU0A 4N2YA 3NO5A 3DI0A 2QUUA 5G4WA 5K2ZA 3OZZB 2C3ZA 5DXXA 4A3UA 2ZBTA 3R89A 3M9YA 3P81A 5F1UA 1VCVA 1DQXA 4DELA 1FWNA 2Y88A 3PWAA 5HUPA 3OVQA 3G1FA 3OHIA 3AJXA 3LX9A 3CU2A 1NF7A 1HG3A 3BGJA 4RV8A 3N9SA 4NQ1A 3KRSA 3NGJA 4JS3A 3LGEA 1PV8A 4NJJA 3UZ5A 4G1KA 5G2WA 5AC7A 1AK5A 4N4PA 4O14A 5KZMA 5LZLA 3HF3A 2BTMA 1VLWA 3A9IA 3QW3A 3VNDA 4MLRA 3EWYA 1P0KA 4WX2A 3PUOA 3LHWA 1GYLA 1TTQA 4MZ8A 4UFLA 4JIPA 3NL2A 1RQBA 3P60A 2Y63A 2YXGA 3ATYA 2Y70A 3N9RA 1K03A 3BGGA 1ME9A 4Z0SA 1PCKA 1H7OA 3HPZA 4L4MA 2RDUA 1C8VA 1FWWA 3TX9A 1KM1A 1YLVA 3W3OA 3PG9A 3TE9A 1JRCA 1A50A 2LLEA 3GLCA 3LLDA 2VC6A 1HO4A 2DP3A 3P80A 3TCEA 4NJKA 2YYUA 3PR2A 4UFIA 4JTHA 1H7NA 2HS6A 3R12A 1GVRA 3B06A 3CWOX 5D05A 4EIVA 3DFQA 2X1TA 4FO4A 1H1YA 3M5VA 3PUEA 4CCCA 5AB3A 4IGHA 3FIGA 1G4TA 1F6KA 4FF7A 1HUVA 2GVJA 4ADTA 5J5DA 3AO0A 1V7YA 3LBCA 3B0UX 1IEUA 4MZYA 3EWWA 2EHHA 2YGYA 1IIHA 5LHEA 3IIOA 5IBXA 2GVGA 4EWND 3H53A 4UC5A 3EX6A 5BW6A 3W1MA 1ZCOA 3C4UA 2BXVA 5I3KA 1CW2A 3HGSA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1FCBA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations