The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
GTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
PHOSPHOTRANSFERASE FYN
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| publication title |
High-resolution crystal structures of tyrosine kinase SH3 domains complexed with proline-rich peptides.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
16
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| structure length |
62
|
| sequence length |
62
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1995-05-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1TUD A; 3H0I A; 3CQT A; 2HCK A; 1GL5 A; 2FRY A; 2P4R A; 4LE9 A; 4JJB A; 2GBQ A; 2DL7 A; 1WXT A; 2CRE A; 2RQW A; 1RLP C; 1E7O A; 1OPL A; 5FWB A; 1AOJ A; 2O31 A; 1WYX A; 2M0Y A; 2J06 A; 1YWP A; 2KYB A; 2RQU A; 2KRO A; 4F16 A; 4OML A; 1BU1 A; 3NHN A; 4OMM A; 1VYT A; 1M30 A; 2ED1 A; 4RTX A; 5EC7 A; 4J9D A; 2CSI A; 3M0T A; 2IIM A; 5HCK A; 2JMC A; 4Z89 A; 4HCK A; 1QKW A; 5IXF A; 2H8H A; 1HD3 A; 4E6R A; 1PRM C; 2FG0 A; 5IHI A; 3O5Z A; 2KRM A; 3UA6 A; 2O2O A; 3UF4 A; 1PHT A; 4RTT A; 1H92 A; 2HBW A; 3A98 A; 1WIE A; 2LCS A; 4J9F A; 2ABL A; 2RMO A; 1KIK A; 1AWO A; 1CKA A; 2GTO A; 1HJD A; 1M27 C; 3EHR A; 2FEI A; 1JQQ A; 3H0H A; 1NEG A; 2EBP A; 3JV3 A; 2C0T A; 3NPF A; 1H3H A; 2QDL A; 2DE0 X; 2L3S A; 3UA7 A; 2RQV A; 3VS1 A; 1ZBJ A; 3R6N A; 1JXO A; 2DL3 A; 1AZE A; 1WLP B; 2V1R A; 2C0I A; 2BZX A; 1JXM A; 2D0N A; 5GJV B; 4OMO A; 1JO8 A; 5L23 A; 4ZNX A; 2CDT A; 4GBQ A; 4Z88 A; 1ZLM A; 1K0X A; 4Z8A A; 1NLO C; 1UHC A; 1U5S A; 3U23 A; 4HVU A; 3M0Q A; 1H8K A; 1UJY A; 1GBR A; 2W0Z A; 1HSQ A; 2A37 A; 4HXJ A; 1X2K A; 2CH4 A; 2D8J A; 2XMF A; 4JJC A; 1K76 A; 2KXC A; 1BBZ A; 1UHF A; 1E6G A; 2ROL A; 1E6H A; 1NEB A; 4QT7 A; 2EYY A; 1GBQ A; 2YT6 A; 1CSK A; 3ULR B; 1JU5 C; 2LQN A; 1B07 A; 1AEY A; 2JS2 A; 3KFV A; 4OMN A; 2LQW A; 1K0S A; 2F2X A; 1M3B A; 2J6K A; 2RN8 A; 1G2B A; 4RTY A; 2YUO A; 1AWX A; 4LUE A; 2CT3 A; 4GLM A; 2DYB A; 2YDL A; 2GQI A; 1UUE A; 4X1V A; 1MUZ A; 2BZY A; 2DNU A; 5I22 A; 2MCN A; 1V1C A; 2J7I A; 2EKH A; 4WCI A; 2JW4 A; 2EPD A; 1NG2 A; 2D1X A; 2KBT A; 3I9Q A; 4R0K A; 4AFS C; 3EG2 A; 1AZG B; 3C0C A; 1PNJ A; 1FMK A; 2A08 A; 1UG1 A; 2EYW A; 4OMQ A; 2KR3 A; 2KT8 A; 4JJD A; 3VS0 A; 2DRK A; 1KJW A; 2KNB B; 1SRM A; 1SRL A; 1UDL A; 2BZ8 A; 2GNC A; 2J6O A; 1YWO A; 1GRI A; 2V1Q A; 2JMA A; 2EVR A; 1WXU A; 2F2W A; 3I5R A; 1ARK A; 2DM1 A; 4J9G A; 1AVZ C; 2SRC A; 3I35 A; 4RTV A; 2K3B A; 1N5Z A; 1GFD A; 4RUG A; 1QWE A; 4DEX A; 1B3Q A; 3EG0 A; 4AFU C; 2YSQ A; 1I07 A; 2A36 A; 4ESR A; 4JZ4 A; 2DF6 A; 2CUD A; 1X27 A; 2CSQ A; 1WX6 A; 3VS2 A; 1S1N A; 1XOV A; 5IH2 A; 2L3Q A; 3M0P A; 2PNI A; 2X3X D; 3VS6 A; 4Y92 A; 2NUZ A; 2DL4 A; 1M8M A; 2EYZ A; 4LUD A; 1NM7 A; 1SSH A; 1NLP C; 1CKB A; 2FPD A; 2DMO A; 2ED0 A; 1RUW A; 1GCP A; 2DRM A; 2OI3 A; 2EGC A; 2LNH B; 1A0N B; 2A28 A; 3PVQ A; 3LH5 A; 1FYN A; 1AD5 A; 2JM8 A; 4KRT A; 1Z9Q A; 1ZSG A; 2DL8 A; 2VVK A; 2DBK A; 2M51 A; 3QWX X; 2KEA A; 1T3L A; 2EW3 A; 2L0A A; 4IIO A; 3VS3 A; 3QWY A; 2JM9 A; 2B86 A; 1T0H A; 5IXB A; 1UJ0 A; 2FPF A; 1IO6 A; 4RTZ A; 1SEM A; 1W6X A; 1BK2 A; 2CUB A; 4RTU A; 2G6F X; 1K4U S; 1OPK A; 3ZL7 C; 4J9H A; 2SEM A; 2VWF A; 2O9V A; 2KRS A; 1PKS A; 3RNJ A; 2RNA A; 3THK A; 1T3S A; 5FWC A; 1SHG A; 1RLQ C; 2KRN A; 4HVV A; 2RQT A; 2BTT A; 1EFN A; 2DVJ A; 2HSP A; 3M0R A; 3VS7 A; 2J05 A; 2ECZ A; 1JEG A; 4RTW A; 1ZUY A; 2X3W D; 3H0F A; 1U3O A; 1OOT A; 1TUC A; 2GGR A; 4FSS A; 3REA B; 1K9A A; 2J6F A; 2LX7 A; 1OV3 A; 1VA7 A; 2YUP A; 1QCF A; 2JS0 A; 1VYU A; 5GJW B; 1ZX6 A; 1G83 A; 1TG0 A; 2D8H A; 4D8D A; 1UGV A; 1MV0 B; 2KXD A; 4JZ3 A; 1SHF A; 1W70 A; 2GTJ A; 1U06 A; 4D8K A; 2ROT A; 1VYV A; 2K79 A; 4LNP A; 1RI9 A; 2LMJ A; 2AKL A; 4JPB W; 2DBM A; 4CC2 A; 2AKK A; 1YCS B; 1X6B A; 2K2M A; 1M3A A; 2JXB A; 3EHQ A; 2DX1 A; 2OAW A; 4EIK A; 3H41 A; 2YUQ A; 1KFZ A; 1AWJ A; 3RBB B; 4J9E A; 1ZUK A; 1I1J A; 2JTE A; 2DLP A; 2KT1 A; 1Z9Z A; 2F2V A; 1NYF A; 3EG3 A; 2DL5 A; 4IIM A; 1WFW A; 1GCQ C; 2DIL A; 2AZS A; 2HEQ A; 2W10 A; 4LN2 A; 3NGP A; 1Y0M A; 2L3P A; 3SEM A; 2YUN A; 1T0J A; 2K7A A; 4K11 A; 1UE9 A; 3PVL A; 3VRZ A; 5IHK A; 3M0S A; 1ZUU A; 1WA7 A; 2ESW A; 3GBQ A; 3VS4 A; 2I0N A; 3TVT A; 1QKX A; 2AK5 A; 1WDX A; 1PKT A; 2O9S A; 1ABQ A; 2LJ3 A; 1ABO A; 1UEC A; 5I11 A; 1Y57 A; 1LCK A; 4DEY A; 2K9G A; 4OMP A; 3I5S A; 4ORZ A; 3UAT A; 1W1F A; 3TSW A; 3REB B; 3EGU A; 5FW9 A; 4AG2 C; 1AWW A; 2K6D A; 4HVW A; 2FO0 A; 2KYM A; 1MV3 A; 1X69 A; 2EGE A; 2AZV A; 4CC4 B; 2LJ1 A; 1X43 A; 2E5K A; 2RF0 A; 4AFZ C; 2RQR A; 1BB9 A; 2LZ6 B; 2KE9 A; 3IQL A; 4CC3 A; 2FRW A; 2O88 A; 1YN8 A; 2KGT A; 1M3C A; 2EYX A; 1GCQ A; 2NWM A; 4AG1 C; 1YP5 A; 2L2P A; 3VS5 A; 1OEB A; 2C0O A; 4AFQ C; 1UTI A; 1PRL C; 1QWF A; 2OJ2 A; 3M0U A; 2MIO A; 2HDA A; 1K1Z A; 4CC7 A; 1PWT A; 4A63 B; 2CT4 A; 2DA9 A; 1YNZ A; 3SHW A; 1GFC A; 2CH4 W; 1NYG A; 3VRY A; 4F14 A; 2VKN A; 5ECA A; 2FPE A; 1SPK A; 1KSW A; 4J9I A; 4F17 A; 3EG1 A; 3PE0 A; 1WXB A; 3NMZ C; 4M4Z A; 1QLY A; 1I0C A; 2PTK A; 1UFF A; 4J9C A; 3FJ5 A; 4J9B A; 2JT4 A; 1J3T A; 2DJQ A; 5IHN A; 2MOX A; 2EQI A; 2ENM A; 1X6G A; 3TSZ A; 1WI7 A; 2LJ0 A; 1X2Q A; 2RPN A; 2PZ1 A; 2LP5 A; 2EGA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1TUD A; 1AHJ B; 1JRI A; 2QAS A; 5KYU B; 3L2W A; 1H64 1; 4XAX B; 8AT1 B; 3QDF A; 1K73 U; 4LE9 A; 1D0Y A; 2DXB A; 3OMG A; 2GQV A; 3UWN A; 2F5T X; 4LDY A; 1AOJ A; 1OZ2 A; 2WSF E; 3QZ9 B; 3QJ6 A; 3S6W A; 1B34 B; 1M30 A; 1Q82 U; 3CCS T; 3M59 A; 1WQW A; 1JBM A; 1RAC B; 2YRD A; 1R8O B; 3CCL T; 4HCK A; 5CO7 A; 3CPW A; 2XK0 A; 5GAN d; 2ZPB B; 3CCM Q; 5I2S A; 3S3O A; 2ZCF B; 3UF4 A; 5GAN e; 2LT1 A; 1JJ2 P; 4M7A C; 4C92 E; 3A98 A; 2RMO A; 3OYI A; 3CCJ A; 2KAF A; 5GAM d; 3EHR A; 2CZ6 B; 1HYO A; 2C0T A; 3NPF A; 4DBQ A; 2ZPH B; 2DER A; 1IRE B; 5GAN h; 2RQV A; 1QVG A; 1ZBJ A; 3R6N A; 2XD0 A; 1AZE A; 3SD4 A; 2CP0 A; 2V1R A; 1V29 B; 3EGD B; 1JXM A; 2DFU A; 3V8L A; 3WVE B; 1SF9 A; 5GJV B; 4OMO A; 4OGE A; 4ZNX A; 4GBQ A; 1ZLM A; 5HKC A; 4Z8A A; 1X6O A; 1Y7X A; 5GAM h; 1Q81 R; 2F1L A; 4PJL A; 1O9S A; 1MMD A; 1GBR A; 3SWN B; 1PD1 A; 4LDV A; 1HSQ A; 2CP7 A; 4BE2 A; 1LOJ A; 2A37 A; 1G3S A; 2D8J A; 3M58 A; 1K76 A; 1BIA A; 1E6G A; 4QT7 A; 3RKX A; 3EG9 B; 2K5L A; 2XIC A; 2CP2 A; 3ULR B; 2RHX A; 1NE8 A; 2H3J A; 1JU5 C; 1BCM A; 4RG2 A; 1ZBX A; 3KFV A; 2QQB A; 2LQW A; 3HRT A; 2F2X A; 1G2B A; 4MZP A; 1IRX A; 4C8Q D; 3C95 A; 3KXT A; 4GLM A; 2M0O A; 4RKU E; 1ZA1 B; 4WTO B; 1KHC A; 4HCC A; 5GAN 8; 5FRN A; 4J6X A; 5DLQ E; 1ZQ1 A; 3CBM A; 2QI2 A; 5KH6 A; 4M7D D; 2RJC A; 3I55 A; 2MCN A; 4IKF A; 3OYF A; 2EKH A; 4C92 A; 2DTO A; 3FB9 A; 2JW4 A; 2EPD A; 2OTL Q; 3CD6 A; 2DTI A; 2VAS A; 2LNV A; 3PIP A; 2A08 A; 1VQ9 T; 1UG1 A; 2E6N A; 4F7U A; 2RK2 A; 3VS0 A; 4M78 E; 2LCL A; 2WSE E; 5KYU A; 1SRL A; 2R58 A; 2HSE B; 3EH1 A; 5GMK l; 2MAM A; 2JMA A; 4O5V A; 2EVR A; 1WXU A; 1X01 A; 4BD3 A; 1ARK A; 3OB9 A; 4J9G A; 2SRC A; 5M9O A; 4PJO E; 3URG A; 1VQ8 Q; 3BDL A; 3LX7 A; 1N5Z A; 4PKC C; 4OP0 A; 4RUG A; 1B34 A; 2EJ9 A; 3QHS A; 5D7U A; 4XU3 A; 3UT1 A; 1QWE A; 3GLX A; 1B3Q A; 3G6E T; 1KC8 R; 3JCM X; 4XQ3 A; 3G4S A; 3SFM A; 1WGS A; 2FYK A; 2CUD A; 4HCB A; 1WX6 A; 2E65 A; 2GFA A; 4C5G A; 4C8Q G; 3MCA B; 5IH2 A; 1C1A A; 1ZA2 B; 5GAN f; 3RKY A; 1BI3 A; 5AT1 B; 4C5H A; 4M7D G; 1M5Q 1; 3L2U A; 1WHK A; 1NM7 A; 1SSH A; 1WJQ A; 1VQ8 T; 5GAM f; 3L2V A; 1RAE B; 1RUW A; 2PVO B; 5FRO A; 1R0B G; 4M77 B; 3PVQ A; 3LH5 A; 1K9M U; 1VUB A; 2QQA A; 3P8B B; 1Z9Q A; 2DL8 A; 2KK4 A; 3EGD A; 4FM4 B; 2DBK A; 5D6Y A; 1VQK Q; 4IIO A; 2JM9 A; 1NJI U; 1N27 A; 1MMG A; 4E7Z A; 4RTZ A; 1KQS P; 2OTJ A; 2LTO A; 1SEM A; 2RI2 A; 3SWN A; 3NTI A; 4RTU A; 2G6F X; 1AT1 B; 4N4G A; 3OW2 A; 4M78 A; 1FMV A; 1I4K 1; 3HTR A; 1OPK A; 2JNG A; 4N4I A; 1PKS A; 3THK A; 1WQ7 A; 4C8Q F; 1IGU A; 1SHG A; 2RQT A; 4EMH A; 1M2O A; 4PJO A; 3CCR Q; 3OYH A; 2X4W A; 2YHT A; 2IPO B; 1YHQ A; 1EFN A; 3VS7 A; 4M7D F; 2ECZ A; 2HKN A; 3OYK A; 1VQK T; 4FCY A; 3GF5 A; 3REA B; 5DLO A; 1K9A A; 2J6F A; 5GAO p; 1VA7 A; 1QCF A; 4QVZ A; 3QBY A; 2CP5 A; 2XDD A; 5GJW B; 2ZZD A; 1MV0 B; 2KXD A; 1K8A C; 4QVC A; 1U06 A; 3QPH A; 4EMK C; 5CR2 A; 2AKL A; 4JPB W; 3I55 Q; 2VV5 A; 1ACM B; 4M7D C; 1YI2 Q; 4C0F A; 3EHQ A; 4EIK A; 5AYF A; 1VQ7 A; 1ZSZ A; 2DXC A; 1I1J A; 3CCR T; 2DLP A; 1F1B B; 3EG3 A; 1UB4 A; 1VIE A; 4V2S A; 2DL5 A; 5GMK i; 2DIL A; 2AZS A; 4P5N A; 1SSF A; 4C0Z A; 1K8A U; 2W10 A; 4ATO A; 5LL6 S; 3NGP A; 2QYZ A; 3BE3 A; 3SEM A; 1T0J A; 5KE3 A; 4K11 A; 4RG8 A; 1UE9 A; 2O01 E; 5IHK A; 3OMC A; 2QTV A; 1G5V A; 3VU3 C; 1M9S A; 2ESW A; 1OX9 A; 3VS4 A; 3VKI A; 3CCE A; 2PQW A; 3LLR A; 2V8J A; 2QGF B; 3X24 B; 3C94 A; 1Y57 A; 1YI2 T; 2K9G A; 4ZTF A; 1R77 A; 3I5S A; 5IN1 A; 1W1F A; 3TSW A; 3G1J A; 3JRZ A; 1N6A A; 1SKU B; 2RF0 A; 1RAI B; 2E3H A; 2MYS A; 5I2M A; 3IQL A; 1RAB B; 1LJO A; 2IG0 A; 1M3C A; 4EDU A; 3OY9 A; 4M77 A; 4MDX A; 2RK1 A; 2C0O A; 1RAF B; 2EQK A; 3CCS A; 3ZFJ A; 4BDY A; 1KQ1 A; 3MKD A; 1PRL C; 2HDA A; 2NUT A; 3X26 B; 3CCL A; 4PLI A; 4A63 B; 1OYX A; 3L2Q A; 3JB9 I; 3M5A A; 2RHU A; 3A8H B; 2CH4 W; 4BI4 A; 4KH1 B; 3NTK A; 2EJG A; 1QMC A; 5A0G A; 1SPK A; 2FZK B; 2KMT A; 2EQM A; 4FU6 A; 3EG1 A; 3SB2 A; 1Q81 C; 1QLY A; 4RMO A; 2PUK B; 1W4S A; 4IUQ A; 1UFF A; 3J81 E; 3FJ5 A; 3M9Q A; 2QGG A; 2PU9 B; 1J3T A; 2ZPG B; 3VUB A; 2DJQ A; 5IHN A; 3CPW S; 1WI7 A; 3OBY A; 2PZ1 A; 1YHQ Q; 4A4K A; 2EGA A; 4FSX A; 4BDZ A; 4E7L A; 3H0I A; 2QQS A; 3A8O B; 3OYN A; 1QCN A; 4JJB A; 2AHJ B; 1WXT A; 1RLP C; 2VXE A; 1Q81 U; 1I8F A; 4M7A D; 3A8M B; 4XTW A; 2MWP A; 2K3Y A; 2KYB A; 4J5Y A; 4F16 A; 4MZT A; 1VYT A; 2ED1 A; 1Q86 C; 5KCO A; 2QK0 A; 3M0T A; 2IIM A; 2NUP B; 3EFO A; 2JMC A; 5HCK A; 1QVF S; 5IXF A; 4ZN3 A; 1O75 A; 4J6W A; 3JB9 G; 4E6R A; 4XTZ A; 4QQ6 A; 5IHI A; 3CXC P; 4NOY A; 1NPR A; 5CKE A; 2K57 A; 1WIE A; 5C0M A; 2O4X B; 1KIK A; 2EQJ A; 1BI2 A; 5LJ3 d; 4ZGJ B; 3O8V A; 2GTO A; 1HJD A; 3QII A; 1JQQ A; 4PLL A; 4C8Q B; 3I56 T; 2EBP A; 3JV3 A; 1H3H A; 4EMK B; 2QDL A; 1M2V B; 5LJ3 e; 4VUB A; 3VV0 A; 3EFS A; 3UA7 A; 2P0Q A; 1FMW A; 3VYG A; 4M7D B; 2DL3 A; 5GAN 2; 3PMT A; 4WF2 A; 2H3E B; 1W2B P; 5CIU A; 4AT1 B; 4XU2 A; 2CDT A; 4IUT A; 1VQ9 A; 3WXM B; 1D0X A; 4M7A G; 3U23 A; 3M0Q A; 4KGX B; 1M1F A; 1UJY A; 3E19 A; 2CP3 A; 2LQ8 A; 3WVD B; 4BY6 C; 4DBR A; 2CH4 A; 3ZBD A; 4ZGD B; 4C5E A; 2RI5 A; 5I21 A; 3JCM h; 1GBQ A; 1KC8 U; 3BW1 A; 1NZ9 A; 1YJ9 T; 1K73 C; 4DBH A; 3BDU A; 3G6E A; 2DD5 A; 1PC0 A; 1RAG B; 4A4E A; 4PJN A; 3GP8 A; 2RI3 A; 2YUO A; 2JN0 A; 1M90 R; 1QCO A; 4X1V A; 2BZY A; 2DNU A; 1PCX A; 1TWB A; 4A4H A; 2X4X A; 1V1C A; 2KVQ G; 3DB3 A; 4B9X A; 2D1X A; 3I9Q A; 1VQ8 A; 3CC2 T; 1D1B A; 1FMK A; 5GAN 4; 4M7A F; 1KD1 R; 1YFN A; 1JB0 E; 2KR3 A; 3A1P A; 2DRK A; 2XHC A; 2HQX A; 2KNB B; 1SRM A; 2NLU A; 3QJY A; 4OF1 A; 2BZ8 A; 2GNC A; 2J6O A; 1YWO A; 4PJM A; 5GAO l; 2V1Q A; 1BI0 A; 2F2W A; 3I5R A; 3M4G A; 1PSF A; 2DM1 A; 4GY5 A; 3HRS A; 3I35 A; 1C6V X; 2COY A; 2X4Y A; 3JCM V; 3EG0 A; 3VYH B; 3TRE A; 2E70 A; 4OB0 B; 4AFU C; 2VYT A; 2CZ7 B; 3L1A A; 1I07 A; 3CMA Q; 3OYB A; 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