1G53A

Carbonic anhydrase ii complexed with 4-(aminosulfonyl)-n-[(2,6-difluorophenyl)methyl]-benzamide
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Contribution of Flourine to Protein-ligand Affinity in the Binding of Flouroaromatic Inhibitors to Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1g53A00
3PO6A 2FNKA 3M1QA 1Y7WA 3IEOA 5SZ7A 3RZ8A 2F14A 4WW6A 2QP6A 4ZX1A 1CA2A 3MNUA 5JG3B 5CLUA 1CZMA 3M3XA 1BN4A 5BRWA 3MNJA 4PQ7A 5DVXA 3DVBA 4BF1A 3OYQA 1G46A 3NB5A 1JV0A 1RZBA 4QK2A 4COQA 3M5SA 4M2RA 2FNMA 1JCZA 4JSAA 5AMLA 1UGCA 3T84A 3T85A 5G0BA 4M2UA 3P4VA 5J8ZA 3Q31A 4Q9YA 4RUXA 2FOVA 4Q7VA 1MOOA 3S97A 3M2ZA 5EH7A 2H15A 5EKMA 5SZ1A 2ILIA 3OKVA 3S76A 4ZWYA 3RZ1B 4CA2A 1YO1A 2NXRA 3CA2A 3C7PA 3KIGA 2FMGA 3DVCA 3PJJA 4K0SA 1G4JA 1H4NA 3UYQA 3U3AX 3IBNA 1FSNA 1KWQA 1KWRA 1ZFKA 2CBBA 3OKUA 5FL4A 1MUAA 5JDVB 1G52A 1IF8A 6CA2A 4Q83A 1IF9A 3V3JA 3TVNX 3JXFA 1G53A 1YDCA 3KOIA 4YGFA 4CNVA 4Q8XA 3MHLA 4RIUA 1CNJA 2CBCA 3OIMA 4QY3A 4ITOA 1OKLA 5E5UA 1BN3A 1LUGA 1CNGA 4KP5A 1CVHA 3BETA 3MZCA 1UGBA 2VVBX 3MNIA 1I8ZA 1KOQA 4ILXA 3CYUA 4PYYA 2HD6A 1BNTA 1ZFQA 2VVAX 5EH5A 5E2SA 4M2WA 4RFDA 5DSMA 3KS3A 4E49A 1CNIA 1FQMA 3MHIA 1CNWA 3W6IA 1TB0X 1OKNA 3SBHA 4HT0A 4IDRX 3N2PA 3UYNA 2FOSA 5FLRA 5FNHA 3N0NA 3N3JA 5FLQA 4ZX0A 5DSQA 2FNNA 1FQLA 2HOCA 4YX4A 1BICA 2NMXA 2X7UA 4L5VA 1CALA 3BL1A 2FOUA 3MNKA 4Q07A 1HEDA 4QSBA 3V7XA 3S74B 5FDIA 1CNKA 1H9QA 5DSNA 4FU5A 3JXGA 4E3FA 4QJWA 5EHVA 3M2NA 4E3HA 2WD3A 2NWZA 2WEGA 4Q87A 2NWPA 3B4FA 5AMDA 2EU2A 4KV0A 3FW3A 4ZAOA 1LG6A 1TG9A 4N16A 2ZNCA 4ETQC 3KOKA 3S78B 3DC3A 1ZH9A 3HKUA 3MHMA 3RYZA 4MTYA 1BNNA 4KNMA 3M2XA 1CANA 1G0EA 1FQNA 5SZ4A 5JQTA 3L14A 3V3GB 5EKHA 5JQ0A 5EHEA 1Z93A 1CAOA 4Q78A 3MHOA 4RUZA 4CNXA 1BNVA 1JD0A 1DMXA 4TWLA 3FE4A 1BN1A 2X7SA 5EHWA 3M14A 2Q1BA 4MLTA 4KUWA 4KAPA 1RJ5A 2ABEA 2NNOA 2X7TA 3MYQA 4QJOA 3V3IB 1IF5A 3MNHA 4UOVA 3HKQA 3P3JA 4KUYA 1BNWA 2CBAA 1FLJA 1CRMA 4QK3A 1CNXA 5SZ3A 3PYKA 1BNQA 1CINA 4QJXA 4XE1A 5BNLA 5BRUA 4QJ0A 5L6KA 3DC9A 5E2RA 3IBLA 4G0CA 4DZ7A 5FNKA 1BZMA 7CA2A 1EOUA 4Q8YA 5CACA 1CCSA 5SZ2A 4YXOA 3JXHC 3MDZA 4WUQA 1H9NA 3OIKA 1YDDA 3HKNA 3M04A 3MWOA 4Z1JA 2AW1A 3S72B 5IPZA 1HEBA 4ZWIA 3DCWA 2HFWA 3KKXA 1CCTA 4WR7A 3MHCA 4JSZA 5FL6A 1CCUA 3IGPA 4MDMA 5FNLA 4YGNA 5DSRA 4KUVA 1ZNCA 1I9NA 3N4BA 4FRCA 5CA2A 1LG5A 3RGEA 1LGDA 5JEGB 4Y0JA 3D8WA 3IBUA 3W6HA 4E3DA 1CAZA 1FQRA 1FR4A 1ZE8A 1I9MA 1HUGA 3RG3A 4DZ9A 1CILA 3QYKA 4YYTA 2WEJA 4WL4A 3P55A 5EIJA 5G03A 5DSIA 3RZ5A 2WEHA 3VBDA 4Z0QA 1HVAA 2AX2A 1XQ0A 3MNAA 3RG4A 4HBAA 4QTLA 2HL4A 3M1JA 3P44A 4K0ZA 1IF4A 5FLSA 3HLJA 4MDGA 4ITPA 3D92A 4FL7A 5DSJA 3KWAA 4KNIA 4Q06A 5CJFA 4QK1A 5EOIA 1HCBA 1G4OA 5A6HA 1DCAA 1ZSAA 4XFWA 1CIMA 4TWMA 2HKKA 3M98A 9CA2A 5DOHA 4K0TA 1CAJA 1TEQX 4RUYA 3RZ7A 1CNCA 3M5EA 5DSLA 2NWYA 1Z97A 5LMDA 2EU3A 4WUPA 4YXIA 4KNJA 2W2JA 3IAIA 1HCAA 4Z1NA 1BV3A 1RAYA 5BRVA 5FNMA 4E5QA 5JEHB 4RFCA 4YHAA 2POUA 4FVNA 1TEUX 4GL1X 1CVAA 4G7AA 5FLTA 3S75B 3T83A 3R16A 1I9PA 1G3ZA 4ZWXA 5DSKA 5G01A 3OY0A 3M2YA 5JEPB 1F2WA 3D0NA 1CVBA 2QOAA 3V3HB 2CBEA 2O4ZA 3R17B 1G0FA 1XEGA 4MDLA 3S9TA 5FLPA 4IWZA 3F7BA 5SZ0A 4LU3A 1ZSBA 4CNRA 4KNNA 5HPJA 2H4NA 1G45A 1TBTX 4MO8A 3OYSA 4XIXA 4LP6A 1TH9A 5E28A 1CAHA 4C3TA 3HS4A 3NJ9A 4CACA 5FDCA 4YVYA 3DCSA 3P5AA 3TMJA 4N0XB 3U47A 4QSJA 4Z1KA 1CVFA 1DMYA 3DA2A 4YGJA 3DBUA 5EKJA 4R59A 3V2JA 3U7CA 3P5LA 4RN4A 3F8EA 2OSFA 2NWOA 5EH8A 2WD2A 4E3GA 3V2MA 4YGLA 3IBIA 4YWPA 4KP8A 1CAKA 1CVCA 5BYIA 1RZCA 3P58A 3ML2A 1CNHA 1KOPA 4R5AA 2FMZA 1URTA 5JGSB 1FSQA 5L3OA 5FNJA 1G48A 4BCWA 3DVDA 1RAZA 3DD0A 3B1BA 3CZVA 1OKMA 1RZDA 4Q90A 1YDBA 2POVA 2HNCA 3S73B 3LXEA 4Q81A 4L5WA 3EFTA 4ZWZA 1THKA 4FIKA 3RZ0B 5A25A 3T82A 2GEHA 3S8XA 4XIWA 4Q6DA 1CNYA 2CA2A 1I90A 1T9NA 5E5RA 1G1DA 3F4XA 1HUHA 1TE3X 4WW8A 4RH2A 1G6VA 4QSAA 3DAZA 1UGDA 4QIZA 4CQ0A 1UGEA 1YDAA 1BNMA 3D93A 5SZ6A 4JS6A 1V9EA 1I9QA 1J9WA 3RJ7A 5G0CA 2IT4A 1UGAA 4HEYA 3M1KA 1A42A 3F7UA 1G54A 4HF3A 2GD8A 3T5UA 3T5ZA 3K7KA 2NN1A 4Q08A 4PXXA 5SZ5A 2Q38A 3DCCA 3KNEA 3ML5A 4R5BA 4BF6A 2FOYA 4X5SA 5AMGA 3RYXB 4HEWA 1AZMA 4Z1EA 4QJMA 4E4AA 4Q99A 1TTMA 4PYXA 2FOQA 3SBIA 1RZEA 1V9IC 5JESB 1UGGA 1IF6A 1Z9YA 4Q0LA 4QIYA 3ZP9A 2NXTA 5EZTX 2WEOA 5FL5A 4FPTA 3RYVB 5FLOA 1I9LA 1XEVA 5E2NA 1LZVA 4YXUA 2OSMA 4Q6EA 3RYJB 3M40A 5DSPA 1OQ5A 5FNGA 3RYYA 12CAA 5DSOA 2CBDA 1DCBA 1AVNA 1CA3A 5DRSA 5JG5B 1BCDA 4HEZA 3M5TA 3HFPA 2NNSA 1IF7A 1FR7A 1UGFA 2EZ7A 3SAXA 1AM6A 4CNWA 1CAIA 3NI5A 1XPZA 2Q1QA 4MLXA 3ZNCA 1BNUA 1CAMA 1CRAA 3GZ0A 5JGTB 1ZGEA 3CAJA 3FFPX 3M67A 3K2FA 3RLDA 3DD8A 3V5GA 3U45X 3TVOX 3K34A 2NN7A 4YGKA 2QO8A 1RJ6A 4E9OX 1ZSCA 4K1QA 1I91A 5FNIA 4Q7PA 2NXSA 3KLDB 3M96A 4JSWA 5E2MA 1CNBA 1CVEA 5DOGA 4XZ5A 3SAPA 1I9OA 3MMFA 1ZGFA 4Q8ZA 8CA2A 1CVDA 3S71B 2NNGA 1KEQA 3HKTA 3KONA 1YO2A 4L5UA 3BL0A 4LHIA 5C8IA 4Q7SA 4QJPA 2CABA 2POWA 1FSRA 4HU1A 2NNVA 1TG3A 5E2KA 4RIVA 4HT2A 4Q09A 3DV7A 4FVOA 4QEFA 3D9ZA 3S77B 3V3FA 2FW4A 1RZAA 1HECA 1YO0A 3OILA 4QSIA 4PZHA 4JSSA 4M2VA 4Q49A 3M1WA 1CAYA 3P3HA 3EFIA 4K13A 4Q7WA 1HEAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3PO6 A;  2FNK A;  3M1Q A;  1Y7W A;  3IEO A;  5SZ7 A;  3RZ8 A;  2F14 A;  4WW6 A;  2QP6 A;  4ZX1 A;  1CA2 A;  3MNU A;  5JG3 B;  5CLU A;  1CZM A;  3M3X A;  1BN4 A;  5BRW A;  3MNJ A;  4PQ7 A;  5DVX A;  3DVB A;  4BF1 A;  3OYQ A;  1G46 A;  3NB5 A;  1JV0 A;  1RZB A;  4QK2 A;  4COQ A;  3M5S A;  4M2R A;  2FNM A;  1JCZ A;  4JSA A;  5AML A;  1UGC A;  3T84 A;  3T85 A;  5G0B A;  4M2U A;  3P4V A;  5J8Z A;  3Q31 A;  4Q9Y A;  4RUX A;  2FOV A;  4Q7V A;  1MOO A;  3S97 A;  3M2Z A;  5EH7 A;  2H15 A;  5EKM A;  5SZ1 A;  2ILI A;  3OKV A;  3S76 A;  4ZWY A;  3RZ1 B;  4CA2 A;  1YO1 A;  2NXR A;  3CA2 A;  3C7P A;  3KIG A;  2FMG A;  3DVC A;  3PJJ A;  4K0S A;  1G4J A;  1H4N A;  3UYQ A;  3U3A X;  3IBN A;  1FSN A;  1KWQ A;  1KWR A;  1ZFK A;  2CBB A;  3OKU A;  5FL4 A;  1MUA A;  5JDV B;  1G52 A;  1IF8 A;  6CA2 A;  4Q83 A;  1IF9 A;  3V3J A;  3TVN X;  3JXF A;  1G53 A;  1YDC A;  3KOI A;  4YGF A;  4CNV A;  4Q8X A;  3MHL A;  4RIU A;  1CNJ A;  2CBC A;  3OIM A;  4QY3 A;  4ITO A;  1OKL A;  5E5U A;  1BN3 A;  1LUG A;  1CNG A;  4KP5 A; 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