1G6CA

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
HGIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVAAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 80
structure length 226
sequence length 226
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g6cA00
1SSGA 1GQNA 3S8HA 2WPBA 3S6DA 1A50A 5D05A 3NQGA 4R34A 3M16A 4O53A 4BWLC 4JEQA 2OX1A 5FEZA 3UY8A 4LVBA 3MO7A 5D32A 1YTKA 1H62A 5F2GA 3W2UA 1OFEA 3HG3A 2H8XA 5AYZA 3ABSA 5EMUA 2CLLA 5J5RA 2NXIA 4IXXA 1TRDA 3LCXA 4OWGA 2FIQA 3HF3A 2G95A 5F1UA 4FIRA 3WK0A 2JGQA 2WJZA 4UFMA 4D2JA 1TPWA 3P62A 3NM1A 2VELA 5AYXA 2VEIA 3QYQA 4ICNA 3KVMA 5DBUA 5C2XA 3JR2A 3B04A 1AL7A 2VEPA 1I2OA 3CC1A 3P67A 2D73A 5HULA 4JX5A 1VRDA 3M1ZA 5FEPA 3O07A 3GXPA 5G5IA 3GX9A 2RFGA 4DXVA 1DVJA 3DU0A 5KZEA 1J2WA 1DJNA 4MLRA 3M6YA 3P84A 4CLMA 3KVLA 4IX0A 4UMCA 3S1XA 3A23A 3NPWA 2C3ZA 4O4VA 4ADTA 4PEKA 4CCCA 4E38A 3M5XA 1BEUA 3A5VA 3STFA 1X7FA 3NQ2A 5DXXA 3W1RA 1M7OA 5KSWA 4J9JA 3B0UX 5FESA 1G4SA 1I8JA 4YCPA 5LSMA 3NPXA 1KTNA 1AL8A 3EKZA 5BOOA 1KV8A 3CIWA 5AFDA 2HSAA 3S5YA 1QOPA 5AYYA 4O15A 3V75A 1FCVA 1ZAJA 3MHGA 5AHFA 1MZHA 2A5HA 2FFCA 4IUOA 4JYEA 2X16A 3LV6A 3CLMA 2GJLA 4TO8A 1TPH1 2CZEA 3T44A 3G0SA 1OFRA 3LM7A 3T55A 3SR7A 1ICSA 5FF4A 3TSBA 4JX4A 1X8FA 5EKYA 2C15A 4JY9A 2Z6JA 4JTKA 3Q2DA 3B0VC 4CNOA 5K9DA 4O1BA 1K03A 1IXQA 1TTIA 2ZBTA 1OYAA 1H5YA 1S5VA 2EPHA 1JUBA 3UWUA 4ADSA 5F4XA 2XN2A 4H4IA 5D33A 2QCHA 1HO4A 1JUEA 3UXAA 1OFOA 1NEYA 4PFMA 5AN7A 2WNZA 4IMEA 3I68A 3AO0A 1OX4A 2A6NA 3ABRA 1GVFA 1L2UA 4LS1A 1DL3A 4QIUA 4TMCA 3EKLA 3LCHA 4HT3A 3EX6A 1R30A 2I9EA 1OFPA 3QRHA 2DZPA 2HTMA 3OBKA 3TIMA 2RDWA 2V9DA 3IRDA 2QUTA 5CZTA 4EVZA 3WJWA 3C6CA 1TJRA 3HPZA 3G22A 3TDFA 4JIPA 3QQ1A 3TH6A 1QOQA 2ZCGA 5AB3A 1XKYA 1K3UA 5C6MA 1Z48A 1W5PA 4HNUA 2B7OA 1KFLA 4A3UA 4XUGA 4BI6A 1PCKA 3BVJA 1DQXA 3ATZA 3L5LA 1FWSA 1WOAA 3W2LA 4W9TA 2H6RA 5C55A 3FFSA 1OHLA 2WQPA 3BW3A 3PBUA 4FF7A 4A29A 2G97A 3AJXA 2NXGA 5DELA 2GQ8A 2PC4A 2NX9A 1ME8A 4TMBA 1O5XA 2V30A 3C2EA 1DKWA 1O4UA 1KFCA 4OU1A 3SZ8A 3NGJA 4MY9A 5D2XA 1YXDA 4NX0A 1OABA 1WA3A 4YXGA 1OX5A 4DQWA 2OZ0A 1JCLA 2DZSA 2A0NA 1KFEA 5HR7A 1KM4A 3Q94A 1X1OA 2V0TA 5D2WA 5K4XA 1XUZA 4NNAA 1VJIA 3HGJA 3PG9A 3W7LA 2DJLA 1MSSA 3G18A 3NQEA 4EF8A 3G24A 3H54A 4FHAA 2FB2A 4EIVA 3QMRA 1I2QA 1SZNA 4WXZA 3DFSA 3ZS4A 2VFEA 1ZNNA 1LCOA 3GNNA 5LHEA 3STGA 2J9ZA 3EWXA 4GJ1A 2EHHA 3N14A 2ZRXA 4NJJA 2Y70A 2LLEA 4WOZA 3NQDA 5T26A 5K2ZA 2J27A 4OT7A 5IBXA 2A7NA 1L6SA 3UPBA 3O1NA 2ABBA 3W1MA 3W1XA 1XUUA 1O5KA 2ALDA 4RCXA 1UASA 3W84A 3W22A 2QCDB 1KM6A 3LRMA 3G3DA 4GUGA 1ZENA 3M9YA 5D2YA 3R5EA 3P8IA 5HUPA 5DN1A 5F4SA 4FO4A 1JUKA 2NUXA 3UY7A 1KV5A 3W85A 1SO5A 3F03K 3ABQA 4JDYA 2C6QA 3P61A 1H7WA 3OEXA 3IVSA 4LUJA 1T99A 1JVNA 4Y6GA 5CPMA 4Z0SA 3L66A 2PCQA 4N6EA 2ZZ3A 5I3JA 1DJQA 4S2CA 2X1TA 1Z42A 2DZTA 3G1HA 2Q3RA 3O06A 1EB3A 3QEZA 4LNYA 4L4MA 1OF6A 1ZY9A 3TXZA 4JNMA 3WK2A 3LCLA 2PRHA 4UTHA 2Z2UA 4HSNA 4UTTA 4LRTA 2VFDA 2J6XA 3MI3A 3PSWA 2NUYA 2FQIA 2P1FA 4I9AA 1YXYA 2R14A 1AW1A 1MXSA 4IGHA 4LUIA 3WJYA 3W7EA 3PBYA 4FXRA 3JRKA 3NM3A 1F74A 4Z1BA 5H2ZA 1GVOA 3NYZA 1YYAA 1LRNA 1YDNA 5C5YA 3RK8A 1XCFA 1GG0A 5SWUA 1EP1A 1C9DA 1AW5A 3LLDA 3MI2A 3CPRA 4O16A 3QM3A 1F7BA 3W83A 1HUVA 3LTYA 1VHNA 4X22A 2E77A 2P10A 5D03A 4IPIA 5KINA 4I7UA 1YLVA 1P0KA 1PVNA 4E2BA 1VC4A 2JKEA 4HNVA 4PC8A 2QCMA 4KFPA 3DFOA 4O1AA 1ZCOA 1EWEA 3L5MA 3W1NA 3LCIA 4QITA 2E6FA 3KVJA 3NOEA 2J9XA 3QZEA 3A5FA 4OV9A 4NT0A 4JTEA 4K7VA 3L5AA 4KFNA 1A53A 3N19B 2FJKA 1TRIA 2ZA2A 3O15A 4ALDA 2BZNA 4FNTA 3C2VA 4QM1A 1EP2A 2ATMA 1P4CA 4IMGA 5G2IA 4O17A 4LV9A 1XC4A 3NAVA 4ML9A 5F2MA 2V82A 1JCNA 1LBMA 3GZ3A 1PE1A 2CLIA 4GE8A 3E12A 4N2YA 2CLOA 2XFWA 1PL9A 4H6KA 3W7GA 3OVQA 1XFBA 2E6YA 2WKJA 4WY0F 1FDZA 1FX6A 4GUHA 1KTCA 3PUDA 4AF0B 2X30A 4M19A 3G1SA 1OFQA 4IMFA 2TMDA 3D0CA 3DBPA 1Q45A 1YPFA 1EIXA 1OX6A 2VENA 5D2TA 3LXAA 3HPSA 1QO5A 3L9CA 2OMAA 3HMJG 3DI0A 5HQEA 5BW6A 3F4WA 3FKKA 3VE9A 3TSDA 2ZYFA 1JCXA 1TJPA 4POCA 3W7KA 3MWAA 2E6DA 1OFDA 3HB9A 2Y61A 3LHUA 2Q3OA 4WQ6A 4O52A 1VQTA 2X2GA 4TX9A 1GT8A 3QC3A 4JTHA 4RLIA 3W71A 2W6RA 1KM2A 5KMYA 3HGRA 4DF1A 3B05A 3A21A 3V1PA 3KOFA 3SGZA 1KW1A 2V8ZA 3SW6A 3O8AA 2NXHA 3LI0A 1LORA 5LNRA 1BKSA 1Q3NA 1O94A 3PY2A 4B5NA 5KTLA 1W8SA 4MYXA 2QR6A 4UTWA 3G1DA 4RR4A 3MBFA 2A85A 3TC6A 1WBHA 4ORIA 1XL9A 3KVKA 4NXSA 5J5DA 3NQ7A 2CLMA 5CG7A 3CB8A 5DY3A 1XBYA 3RNDA 1W3TA 2E5DA 1ME7A 5HJLA 4AXKA 4HPXA 2NX3A 3R13A 2C14A 3T7VA 4CQ9A 2CU0A 5A5WA 5I3FA 3L0GA 4Z08A 5BMXA 3NQAA 1FY6A 1X1ZA 1KFBA 3USBA 3NQ8A 4HNTA 3W7NA 1EX5A 4PL1A 4AWSA 1WDWA 3T78A 1SSDA 2VFFA 5G2WA 3LRKA 4DF2A 4G1KA 4XTDA 3BARA 4NJKA 1FCBA 3HQ1A 3FJLA 4UTLA 4ZQPA 4GXMA 4WZHA 1W3IA 1LM1A 4JTSA 3EWBX 3LHTA 3W75A 2CFFA 1VYRA 2ZRUA 2Z1BA 1BWLA 3M5VA 4MUZA 4ORMA 4O54A 4IJBA 1TV8A 5KZMA 2Y7GA 3DKLA 3G0XA 4CNPA 4P2VA 1OF8A 2KZHA 3RU6A 2OJPA 1M7PA 4RZ6A 5GVJA 4PTNA 4JTTA 4M7TA 3M5YA 3S5ZA 1Z44A 1TPEA 3H55A 1S3HA 4JD4A 3L67A 2WSRA 5LHFA 3KRUA 2C1HA 4LVAA 1TTQA 4QJ1A 3LTSA 2RDTA 3H53A 3EEGA 1WAUA 3TW7A 5D02A 1LROA 3QQ0A 1WYIA 2CZDA 2YX0A 2QCLA 5DCBA 3C2FA 3BV4A 1XBXA 5H91A 5CSSA 3TFXA 1GTHA 3FIGA 4IX2A 3W7MA 1M6JA 2JKPA 3QSTA 1HO1A 4O0KA 3C2RA 3HG2A 3EXSA 1DOSA 3I7QA 3W7IA 3N9RA 3E9AA 4LOCA 4UNLA 3W7PA 2QDHA 1JCJA 1VS1A 5FEXA 1AK5A 5AC8A 2ZTKA 2PRMA 1BWKA 1OG0A 3M44A 5KZDA 4MZYA 4ZMGA 1QDSA 1GG1A 3UWVA 4IPJA 1I45A 3W6YA 3W7JA 3BGJA 3CQ0A 1QWGA 2BTMA 4RXFA 3GNDA 3IGXA 4NVTA 4JYFA 3TC7A 2EGZA 3PULA 4L4LA 5CKSA 3UXDA 3BG5A 1DBTA 5BMWA 3W88A 2F7FA 2YYUA 1NFBA 5U4NA 2ZRVA 1F76A 1QPNA 5G1YA 1ZJIA 4KWVA 1TYGA 3Q58A 4NZFA 5L9FA 4O28A 2GVJA 2PE4A 1P5BA 3P8JA 5F4WA 3TJXA 1H51A 2HS8A 1TCDA 2X1SA 2ZA3A 3E96A 3TR2A 3L0KA 3B0PA 4BWLA 2H8ZA 2GUUA 1K8ZA 5EL1A 3FKRA 3NQFA 3EWYA 2V81A 1E51A 2WSYA 4WY0A 4MY1A 2O7QA 4C1KA 1CW2A 3EXRA 3LOTA 3NG3A 3NZRA 1VCVA 3CHVA 4OHQA 1T0OA 3HPXA 4N6FA 1WBJA 4I7VA 2B7NA 4LVDA 2A2IA 5ABTA 1JCYA 5K4ZA 3W86A 4UFHA 3B03A 4NNCA 4HHPA 3WFAA 3G1VA 4WY0B 5DBTA 5E1QA 3W7RA 1IGSA 1OX4B 2HMCA 2V2CA 4LC6A 3LHWA 3UNDA 2DU2A 3DFNA 1TSIA 3GKAA 4NU7A 3ATYA 2R8WA 4M6QA 1QFEA 5EPDA 2B7PA 4DO6A 1LOQA 1W3NA 4DPPA 1SW7A 5E93A 5K9CA 1H7OA 4JTGA 5D30A 3KRZA 3DFPA 3I65A 4TR9A 1NF7A 2I14A 4AB4A 2JGYA 2FPTA 2V2DA 3W7OA 2YCEA 4MLJA 5IBXC 3W23A 2VC6A 4AHPA 5HR6A 2C19A 1EWDA 4FNPA 3TMLA 1ONRA 3PR2A 1UBSA 1Q6QA 3W7QA 3RLVA 1ZHAA 1J5TA 1JR1A 5D09A 3OVPA 2CLEA 3O6CA 1YTDA 1SUXA 1KTBA 3O05A 3ABOA 3R2GA 3LRLA 1WOBA 3UZJA 3I6RA 4ZQNA 3RF9A 2Q8ZA 2YXGA 4JXCA 3TE9A 4FX7A 4AHQA 1VR6A 3WJSA 2F84A 3NEVA 4UTIA 1YDOA 4JICA 4GC4A 3G1XA 3W1UA 2ZRZA 3MP4A 1JCMP 4DELA 1TTJA 1HL2A 8TIMA 4DF0A 3K30A 1D3GA 2FPYA 1TPFA 4GUJA 5EBUA 4YWIA 4K6AA 1VH7A 1VCFA 2CLKA 4QISA 4M6VA 3BK0A 3IEBA 4O13A 4A22A 3LI1A 1LDCA 3DENA 3QJAA 4FX6M 3RLUA 4UTTC 1R46A 2DORA 2GVLA 2ZZ1A 1SU5A 1FWTA 4HSOA 4PH6A 4AAJA 5K9XA 1W54A 3TQVA 1R2TA 2QJIA 2QCNA 3MP5A 3SJ3A 4BR1A 1OK4A 3U8GA 2YW4A 3DH7A 3RFAA 3VCRA 3NPVA 2WNNA 2GOUA 3BG9A 3GR7A 1GJPA 1XBVA 2J9YA 2V2HA 3PBVA 1FDYA 1PHQA 1G67A 2OT1A 1H61A 4LVGA 1K8XA 1YXCA 3TNOA 4ZQMA 5D2VA 1TREA 3G1YA 4MIMA 3TXVA 4JTUA 3EX3A 4R33A 2A7RA 4KFOA 4M7SA 4YL2A 3S9YA 3FA5A 2A21A 4JYDA 2ZA1A 1UB3A 1OJXA 4CCDA 4K7YA 1G69A 4AHOA 2ZZ5A 4Y90A 3A22A 3P60A 4M5PA 5FF0A 3MI6A 5F2LA 4FB7A 5D04C 3RMJA 1KBIA 1FXPA 1P0NA 4ZQOA 1GPWA 1R2SA 1LOLA 3BLIA 3BLEA 3QH2A 4P61A 3HO8A 3DAQA 1IIGA 3TUUA 1FWNA 3P80A 4O18A 4EOUA 4NJGA 1VYSX 1PV8A 3PBWA 5MHBA 1TPC1 3WJZA 4IXHA 2RH9A 2JKAA 3M5ZA 2ABAA 2ZZ4A 4WXYA 5KITA 1VLIA 2Y7DA 4WD0A 1B4KA 1OK6A 1S5WA 2J88A 1YADA 1THFD 1GVQA 1SZEA 1H60A 4ADUA 4N4QA 2ZRWA 2ATSA 4JS3A 3C4UA 3NQCA 2GVGA 4UTKA 2V5BA 3O16A 3PVFA 2VOMA 3GXNA 1NVMA 2DZUA 4O4WA 4K39A 3TU9A 2JK2A 3KRSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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