1G99A

An ancient enzyme: acetate kinase from methanosarcina thermophila
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
398
structure length
398
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords ACETATE KINASE
publication title Urkinase: structure of acetate kinase, a member of the ASKHA superfamily of phosphotransferases.
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina thermophila
total genus 139
structure length 398
sequence length 398
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1g99A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1g99A02
2FSJA 2FXUA 3L0QA 4CZEA 4DQ8A 1X3MA 2FF6A 1TUUA 3VETA 4BC4A 1RGIA 5AQTA 2Q0RA 4RCHA 3FZFA 1HKBA 1ESVA 3MN5A 5AQRA 3UKRB 1NGFA 3ID8A 3ENOA 2YHXA 3P4IA 1SQKA 1U2VA 2QWOA 3TPQA 4A62A 2I7NA 1S3XA 1NGBA 4AM7A 1GLLO 2QWRA 4BG8A 1TUYA 5B8HA 3O80A 1HKCA 4WYBA 4A2AA 3HSCA 3DXKA 4PKHA 1CZAN 2NLXA 3U9ZA 4BRGA 3O8MA 3MDQA 2CH5A 1GLEG 4JN4A 1NGEA 3VOVA 2P9SB 3VEZA 4MLHA 2P9IA 3BF3A 5FPDA 1HPMA 2E2PA 5EXWA 2P9NA 2ITMA 2E88A 4EFHA 3LM9A 4O5FA 4BRLA 1QHAA 3GDQA 3SJHA 4WQ5A 3RSEA 2CGKA 3CJ7A 4CBWA 1E4FT 4BQZA 2QW9A 3DXMA 5FPEA 3EKSA 3CJAA 3O5BA 5F0XA 3MN6A 3VEYA 1JCEA 3D2FA 1NGAA 5KQDA 2KHOA 5AZJA 3FFKB 5AQGA 3QICA 4Z94A 3WT0A 1HUXA 3O4WA 4FWQA 5EOYA 3ZX0A 3DWLA 3DXKB 2J4RA 1WOQA 1T6DA 2E1YA 3FZLA 5AZIA 4BRMA 3ATVA 1V4SA 3GE1A 2HMPA 1HJOA 1YVNA 3O1BA 1TYQB 5BRHA 1GLFO 3FR0A 3B8AX 4CD3A 5BRFA 3QDKA 3H1VX 2W40A 3RSEB 4K25A 4BRCA 4DHYA 4CZJA 1QQMA 3KVGA 2P9LA 2GWJA 5BN9A 3WQTA 4MO5A 4FSVA 3LM2A 2A42A 1BU6O 5AFUA 4BRDA 2GEMA 5FPNA 1SZ2A 4CZGA 4AM6A 1MDUB 5AZJB 5BPNA 2EWSA 4JAXA 1MWMA 4FWLA 4HWIA 3MN9A 1K8KB 5LJWA 1GLJO 3ZETA 4LC9B 1J6ZA 4EHTA 1P8ZA 4JHDA 4FWRA 5F2RA 5AQVA 5AQQA 2Q1NA 2FF3B 4B1ZA 2QWQA 3VEVA 4CBXA 5KQ8A 3A5NC 2F9TA 1T6CA 2E2NA 2VWBA 1YAGA 4FL9A 3UE5A 4BRKA 4BVPA 1NGJA 3U4LA 3QFUA 3VEXA 4WQ4C 4BRAA 1H1VA 4DB3A 2FSKA 2ASMA 4GNIA 4BC3A 3R6MA 3ULEA 3EZWA 5AQMA 3O6WA 2A41A 5AQPA 2P9UB 4IWVA 3UKUB 3O08A 4M7XA 1NBWA 4BRIA 3H45C 2IVNA 3HI0A 4JHDB 1BA1A 2YJEA 2Q0UA 4FWNA 1MA9B 3HTVA 3QBXA 5CE3A 3ATUA 4MLEA 2V7YA 2UYTA 4CZFA 1YXQA 4JD2B 2ZGYA 3GG4A 4H5WA 3D2EA 3TU5A 4H0YB 4BRPA 3HBTA 2CH6A 2ZF5O 5AQYA 1BWFO 4IJAA 4M63C 4BRFA 5BRDA 2F9WA 4BRQA 3GL1A 1JCGA 3LDPA 1SAZA 1QQOA 5E26A 5AQUA 1LOTB 3D7EO 1NMDA 2GTDA 5JMVA 2GUPA 4H5VA 1X9JA 3BEXA 1ATNA 2ZWHA 3IDHA 4IO8A 3KHYA 2D1KA 1DGKN 5AQXA 5JLFA 1WUAA 2D0OA 3R9PA 5KPRA 4PL8A 4BGAA 2PBDA 4CZHA 4E1JA 2CGJA 2QWLA 3CJCA 4WQ4A 1X3NA 4H5RA 4EAHD 5AQNA 2V7ZA 2V52B 1ZC6A 3J8AA 4BVOA 1NGGA 3WXIA 2IVOA 1ATSA 1U2VB 3FE1A 3CJBA 3ENHA 2E2OA 5EVZA 3G25A 3OHRA 3U8XA 3A5LC 4BR7A 4H0PA 4BR0A 4A2BA 2P9PA 1NWKA 3HM8A 4H0VB 4FOIA 4BQLA 4IXCA 3CHWA 2DPNA 1T44A 5BPLA 5F1XA 5LY3A 3M6GA 3ZEUA 2P9IB 3JS6A 4PL7A 3LDOA 2P9NB 5AQJA 2HOEA 1QQNA 3C0BA 4CZKA 3ZX3A 5AFUH 2A3ZA 4DCHA 2VCPA 3SMSA 2YJFA 1KXPA 3VGKA 1E4GT 3VPZA 1ATRA 2GWKA 4FO0A 2CGLA 1XQSC 1NLVA 3DXMB 2HF3A 1DEJA 3MMVA 4FWPA 4XH4A 4I6MA 3D2FB 2QWMA 5AQSA 1GLCG 1BA0A 3CI5A 2YI1A 4K42A 5ELZA 1Y64A 5AR0A 3VEWA 3LDQA 4CD1A 4CZMA 4HTLA 3SLCA 3H3NO 2P9PB 1LCUA 5KPTA 3EN9A 2P9KA 3HZ6A 1V4TA 2YHYA 4H0OA 5AZIB 4C23A 2E1ZA 1RDWX 2FSNA 2Q31A 4YDUC 2E20A 3LDNA 1C0GA 4XEIA 1S22A 1BDGA 1NGCA 2I7PA 3WEEA 5FPMA 3QMLA 3BP8A 3WXLA 1ZXOA 4H5TA 2P9LB 4NB4A 4H0XB 5AQHA 1KAXA 4BG9A 4L3QA 2GELA 4XH1A 4FWOA 3VF6A 2ZGZA 4XH5A 5E84A 4PKGA 3JXUA 2PAVA 3ZETB 1R59O 1Z6RA 2A6AA 4KBOA 1BO5O 1NM1A 5BN8A 3GOIA 1C0FA 2ASPA 3IFRA 2A40A 3KZBA 3AAQA 3CERA 2YHWA 3O1WA 4FPBA 2YCHA 2WUSA 3WEEB 3SMPA 2E2QA 4ISFA 1OKJA 3VGLA 2VYPA 2AA4A 4NO7A 2AP1A 3VESA 5ADXA 3U9DA 4YDUA 3ULEB 3VEOA 1DKGD 1NGHA 3ZX2A 3L6QA 2NRHA 4O8KA 1Q18A 3EO3A 5AQZA 4K41A 4BR5A 1YUWA 4GY2B 3FZMA 2W41A 3FZHA 4B1XB 3SK3A 3CQYA 1HLUA 1ZBSA 3WQUA 1HX1A 2ASOA 4CZLA 3L4IA 3M3ZA 4B9QA 3VENA 5I9EB 1NGIA 3VF2A 4BR4A 5BREA 2Q36A 5BR9A 3A5MC 3CQXA 5TKYA 1NGDA 4Y0WA 3D2EB 4JNEA 1TYQA 1GLBG 3F9MA 1GLDG 3BUZB 4IJNA 2H3GX 3CJ1A 3CJ9A 4B1YB 3DAWA 3A5OC 4BC2A 2BTFA 4H5NA 4FOEA 4FWSA 3FZKA 3H1QA 1G99A 2IIRA 5JICA 3CIPA 5AQFA 2BUPA 5EY4A 1Z05A 1EQYA 3BF1A 4QS8A 3EKUA 2Q2RA 4FWKA 5AQWA 3S41A 3H46O 5KPZA 1HKGA 2OANA 3IMXA 2E8AA 4BRNA 3MCPA 1K8KA 2V51B 3AY9A 1QZ6A 4FWMA 2HF4A 4RWTA 4BREA 4QS9A 1RFQA 3MN7A 4F9OA 3IUCA 1BOTO 3VF4A 4ISEA 1MWKA 4ISGA 4BROA 4CJ7A 2QWNA 3CETA 2D4WA 4FPAA 4M7YA 4BRHA 3M1FA 3A0IX 3MK6A 3QBWA 3A8YA 1XC3A 3ZEUB 3C7NA 3VGMA 2D0PA 4CI6A 3VERA 1XUPO 2IVPA 4A61A 3AARA 2QXLA 5AQIA 3WXKA 2P9UA 3H6EA 1D4XA 3DJCA 3UKUA 4EHUA 3WUHA 3R8EA 3H3OB 4H0TB 3EL2A 4BC5A 4MO4A 3AAPA 4K43A 2A5XA 4I6MB 3UKRA 3FGUA 4CBUA 3LL3A 4CZIA 1JCFA 4J8FA 5AQLA 1IJJA 4IZ9A 1BG3A 2NZTA 4B1VA 4JD2A 3LDLA 3FLCO 3W0LA 4H03B 4EIAA 4QS7A 4BGBA 4RTFD 5JLHA 5BPMA 4PKIA 1KAZA 4B1UB 3I8BA 5EX5A 3I33A 2P9KB 3WXJA 5LJVA 5AQOA 4WQ5C 5AQKA 2FLOA 4BR9A 4BR2A 3C7NB 4B1WB 1IG8A 2QWPA 2P9SA 1GLAG 1U6ZA 3QB0A 3QFPA 5ADXH 1QZ5A 2Q97A 3UB5A 2QM1A 1BUPA 3W3DA 3GBTA 1KAYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B3SK 3DM2A 1TUUA 3OA9A 3VETA 4BC4A 1RGIA 2NRRA 5SWMA 4E7HA 5HOOA 4KPYA 5E41A 3O9UA 4G9ZA 3ID8A 2GUIA 4UY8O 1RCHA 4N5SA 4ELVA 1RTIA 3TI0A 1G15A 4BG8A 2IDOA 4FJNA 2XHBA 4DF4A 1T7PA 1HKCA 3HSCA 4PKHA 3PO5A 2NLXA 1EKEA 3O8MA 4FYDA 3QERA 2P9SB 4MLHA 2P9IA 1JJ2M 1HPMA 1WLJA 2P9NA 2ZQBA 5C2DA 3T3FA 2DFEA 4C1NK 5J1EA 5J2NA 3GDQA 3SJHA 2CGKA 3CJ7A 3DLHA 4FK2A 4IOAL 4KI4A 4CF1A 2BE2A 3LP0A 3WNGA 4FM0A 2LSNA 3MN6A 3VEYA 1JCEA 1REVA 4BACA 1RT6A 5KQDA 4CEBA 2XRIA 1QHTA 4GVEA 3FFKB 4EP5A 5AQGA 3E9PA 3ZCMA 4FJMA 4CVNE 3BZCA 1VSMA 3F2KA 2J4RA 2E1YA 1Q86O 1D9DA 4FJLA 2OZMA 5CZ1A 4BRMA 4FJKA 4M42A 2HMPA 3O1BA 5BRHA 4CFDA 4PWDA 4GV3A 5LMNK 3MCAB 5JS2A 4K25A 5DMRA 4CZJA 1K73O 3E01A 4FJ7A 1N33K 4IG0A 4PUOA 1LAWA 3TAEA 4ICLA 4M3RA 3DRPA 1SZ2A 1TK5A 1QQCA 5BPNA 2XY7A 4JAXA 1NJIO 1MWMA 4FWLA 1K8KB 3QEXA 2YV0X 3ZETA 4EHTA 1HQUA 4FWRA 5AQQA 3EY1A 2FF3B 4BE1A 3K5LA 1JLAA 1NKEA 4DSEA 2OPQA 3VEVA 4DFJA 2OTJN 1T6CA 5CR4A 2VWBA 3AA2A 3NVMA 1YAGA 4CHPA 4FL9A 3UE5A 1C1BA 3U4LA 3QFUA 1IKWA 1C0UA 4DLEA 3QIPA 4CHYA 5AQMA 4O4GA 1B9FA 5AQPA 5M1NA 4CE9A 4YOXA 1VRTA 4X62K 3OYFA 3QINA 3ZSWA 3UKUB 1HRHA 5HRPA 2RE2A 1FK9A 3H45C 3QEVA 1VQ5N 2Q0UA 3AO2A 1NKBA 2O8FA 3I8DA 1J5OA 1CXUA 1Z26A 4X65K 1YJWN 1X9WA 4FVMA 2UYTA 1YXQA 4KKOA 4H5WA 3TU5A 2G8VA 4BRPA 4MDBA 5AQYA 4B9NA 4KHYA 2HB5A 3ZT2A 1VQ6N 3P83D 4DLGA 2ATQA 4CJ4A 1JCGA 3LDPA 1LOTB 3CQ8A 1WSJA 4BDYA 3SQ1A 2GTDA 4CGGA 4YORA 5JMVA 2I5JA 4JS5A 2GUPA 4KB0A 3R1XA 3NAEA 1X9JA 1ATNA 2JLEA 2ZWHA 5KPRA 2F8SA 4O55A 2PBDA 1VSEA 4E1JA 3RMDA 2CGJA 3CJCA 3TAFA 4H5RA 1R0AA 1T8EA 3ZT3A 2V52B 1QSLA 1ZC6A 1EP4A 1I94K 2O8FB 1HYZA 2P5GA 5MLCQ 3WXIA 5FDLA 1U2VB 2DTUA 3VQ9A 3P1GA 5EVZA 4LSLA 1VQNN 2HNZA 4IBNA 4IFEA 4J2BA 4BR0A 1NWKA 3HM8A 3THVA 5HRNA 5A2QO 5LY3A 1I3AA 3JS6A 3T19A 1RNHA 1TKTA 3C0BA 3ZX3A 2VGNA 1U4BA 4DCHA 4JYAK 2VCPA 3QIOA 3SMSA 1UA1A 1KVCA 3CM5A 1E4GT 5CHIA 1HQEA 3CFOA 3OYHA 3AVNA 4HCCA 1NLVA 3DXMB 2HF3A 4KH4A 4FWPA 4PA1A 1BGXT 3I0RA 3LDQA 4HTLA 4DR3K 3VMFB 4ELUA 4DS5A 4DV1K 3V6DA 3EN9A 4OPAA 2P9KA 3E1YA 5AZIB 4AHSA 4DSJA 3VA0A 1BDGA 2YHBA 4B9SA 2G8HA 5FPMA 1XC9A 4DTMA 3WXLA 4I2PA 3L3VA 1T05A 1KAXA 4CF0A 2GELA 4DV4K 4FWOA 3HJFA 2IAJA 3NGIA 4M45A 1J9AA 2ZGZA 4CJKA 4JI3K 1Z25A 1TL1A 3LANA 5HRRA 1VSIA 4JI1K 4PY5A 3RMCA 3MEEA 3GOIA 4DV0K 1HNXK 3MXMA 5M1KA 1BIZA 4RG8A 5H1SQ 3RMAA 4YOWA 2A40A 3CERA 4DUZK 2O8CB 4JKFA 2WUSA 1X1PA 3SMPA 2E2QA 4ISFA 3THWA 3L2VA 3M8PA 2NUBA 2BH1A 1KLMA 4HHTA 3CG7A 5GINA 4NXNK 3ULEB 3PSIA 3ZX2A 2NRHA 4HTUA 3I56N 2HHTA 2BDPA 2W41A 3FZHA 4B1XB 3E9OA 2HSTA 1TL3A 1XNQK 3LP2A 3WQUA 1VSLA 2ASOA 4CJ5A 4CZLA 3PX0A 1UOCA 2HVHA 5I9EB 4BR4A 4Z4FA 2O8DA 2D0AA 5FRNA 3M8QA 3KIOA 4Z4EA 4Y0WA 1YTUA 3OS2A 3V1OA 3F9MA 3THWB 2IGIA 3ISNC 4DV5K 2ZD1A 3O4NA 1ZBUA 4CFBA 5J2PA 3THXB 3MX5A 1FJGK 4CEEA 3QETA 1U48A 3IKMA 4FWSA 4BWJA 1QVFM 2BUPA 5EY4A 1Z05A 4NLCA 3S3OA 2X74A 4FWKA 2B6AA 1HKGA 2E8AA 3VQDA 1XNRK 4E3SA 3AO5A 3MCPA 4ELTA 3MWPA 4C8NA 4YOVA 4M3YA 1K6YA 4KV8A 4FWMA 3J7YP 2O8DB 4CEZA 3TAMA 4DQRA 1YIJN 1TAQA 5HROA 1W2BM 3CF5L 4BY9C 3AA5X 4FXDA 4ZTJA 1NK4A 4CEAA 4ISGA 4PHTX 4DFKA 4M7YA 1NG9A 1VSDA 5KRSA 4HCBA 3VGMA 4YOTA 2D0PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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