1G9AA

Crystal structure of clostridium botulinum neurotoxin b complexed with an inhibitor (experiment 3)
Total Genus 395
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
395
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
publication title A Novel Mechanism for Clostridium botulinum Neurotoxin Inhibition
pubmed doi rcsb
total genus 395
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1g9aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1g9aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1g9aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1g9aA01
4G9MA 1IOBA 4D69A 1GKBA 4J2KA 1T9FA 4GWNA 4I4OA 3NBDA 3FFZA 3ZYPA 4LO2A 2A6YA 4XYXA 1SR4A 3V0BA 1PC8B 1D2SA 2G4IA 3ILAA 1ENSA 3B01A 4EFQA 4Q8LA 3M1HA 2ZACA 1T4QA 2FPQA 2QN0A 5F5QA 2FFVA 1JXNA 2A97A 2WT2A 2P2KA 3A23A 3R4UA 2A7AA 3WO2A 1XTFA 1M16A 3NWKA 1QOTA 4ZJXA 4XTMA 2DVGA 1ONAA 4Q1PA 2D1ZA 4R6UB 2DS0A 3T1LA 1V6XA 1N4KA 2NZ9A 1XHBA 2OVUA 3NF3A 4DCKC 2A5ZA 2GZBA 1URXA 2ZHNA 1N3OA 4AGGA 1QOOA 4YGBA 4I4VA 2UUSA 4ZFWB 3RTJB 3HBWA 1HQWA 1SZ6B 4XJZA 2AENA 3FLTA 4JP0A 1CVSA 2Q9XA 1Q8SA 1RIRA 1TP0A 1IS3A 3HOMA 4YGEA 1AVWB 4KEIA 3FIIA 2HWAA 4IQPA 4EL4A 4QKRA 1ISZA 1CN1A 4ATFA 4Q9GA 5DUVA 2LIQA 2AXMA 3BAUA 3AZYA 1TWMA 1UL9A 4XBQA 5DZFA 5DXDA 5T5PA 3AZXA 3B9CA 1FMMS 4YZ2A 2P37A 3ZXEA 2UWCA 1SLLA 3H6RB 4KEJA 2RG9B 2E4MA 4LBQB 1DZDA 4K20A 1ULFA 4MYEA 2F2FA 2P3JA 1SLIA 2K8RA 2M49A 1I3HA 4Q1RA 2ZMLA 1ZL6A 5BXTA 2JDZA 2D43A 2FFUA 2IMAA 2Z42A 1TWEA 1W3AA 2WSUA 1GNHA 2R1DA 3FGMA 2D3RA 2NYYA 4R9CA 3B9UA 5D62A 1Z2VA 3OBTA 1RMLA 1N47A 3WCSA 1IOAA 4JRAA 2AH2A 4OWLA 1RG8A 3OGGA 3CQAA 2P39A 3SNVA 4H9WA 5CB7A 5CNAA 2DWRA 3INAA 3C88A 4DRVA 2Y9FA 1UX6A 4OWKA 3C8BA 1ZB7A 1R8NA 5FNWA 3WUCA 3KM5A 4EKXB 4YM1A 4FPOB 1MS5A 2P3IA 4Q8KA 2ZHLA 2NTDA 1BASA 4XHXA 2HWMA 2YZ4A 3AP6A 3AZZA 4XXPA 4EFRA 2E7TA 4LBKA 3FUOA 3OBRA 4LBQD 2A3YA 4ZKTB 2DYCA 2PHFA 2VSEA 4DS0A 4QD2B 1M2TB 2A75A 3CA5A 3A0NA 4XDQA 3D6EA 4LBJA 4P0LA 2RHPA 3M3QA 4Y1YA 4XBNA 1BFGA 1FAYA 4FPFA 5EC5A 2AR6A 2VH9A 2UURA 1VLNA 3B69A 4XJUA 4U2AA 4D8HA 3AH4A 4XFUA 3AH1A 2E7QA 1MS9A 3DS9A 2PELA 4XJAA 4RL7A 1WCSA 3USUB 1YVGA 4FP3A 2OW4A 1SLBA 5DUUA 4GOVA 1HLCA 1W6NB 2AGSA 3WHTA 1PUUB 1VAMA 3O4OA 1LGNA 3BAQA 1WLCA 3A07A 4JCKA 3A22A 3FLRA 1Q03A 4FVVA 4X38A 3RTIB 5DUWA 1S0GA 1F5FA 1WW6A 1UMZA 1A8DA 5LK5A 2R9KB 4D0TA 3D4KA 2YY1A 2ZHMA 2GN7A 3SITA 1TTUA 1W6OB 2ZQOA 1FATA 3WINC 3HSMA 3AXDA 3R4SA 1LOFA 3VWCA 2D3PA 2PHWA 4ZGRB 2IWTB 1BZWA 1LECA 5DG2A 1L2HA 4G9NA 1Q8OA 2TEPA 3RMXA 5E88A 3ZSLA 2L5XA 4J2YA 3ILNA 1SLTA 2AUYA 4I4QA 4JPZA 2X2SA 3VKNA 3VKOA 5GAQA 5JVVA 2EF6A 3BAOA 1AJOA 3FJ8A 3UJ4A 1ABRB 1HWNB 21BIA 4GXLA 1DIWA 1HWPB 1GNZA 1FWVA 2ZGNA 3MW2A 1SLCA 3WA1A 2DU1A 4OW4A 1S1AA 3ZVXA 1S0BA 1Q8PA 4F83A 4KBBA 3BODA 3T2TA 1UKGA 2CYFA 5AVAA 4IHZA 5E89A 4XFSA 1WUVA 3AH2A 1RINA 4AGRA 4M00A 1W6NA 4YFWA 1IS4A 1OFSA 1F9KA 3VT0A 2HYKA 1A78A 2ENRA 4ZXKA 2MC2A 4GKYA 1PZZA 2VW2A 3AYAA 3C89A 2ZHKA 3ZPYA 3POYA 3ZXKA 2FMDA 4ZLBB 1ZKWA 1WBFA 4HL0A 3PG0A 2KM2A 3FJJA 3AJZA 2SLIA 5BQMB 1QQLA 5E8AA 4XJ8A 2DVBA 5GLTA 1DZCA 1W6OA 2VSAA 4YZ5A 1II4A 3F1RA 3P6IA 2VY0A 1KITA 4BMBA 3FLPA 1AXYA 3TC2A 2ZZJA 1CIWA 1JT3A 2WT0A 3L2YA 2D44A 3UJOA 2XHLB 1JTCA 3AJYA 1CESA 4A7KA 5FRAA 2NN8A 1ZN3A 1MZ6A 5BXSA 3MW4A 4QKSA 2Q5TA 2DTYA 1SCRA 3LSEA 2EALA 2FHRA 4PCRA 4L8QA 5FZZA 3IM6A 3AKHA 3UJQA 2WSVA 1Z78A 2BQPA 5BQNA 1S0EA 3A4UA 2HW9A 4Y24A 2G7NA 4UW4A 2VXTI 1JYIA 3WDXA 4FOQA 4QC4A 4FPCA 3AJ5A 1HQLA 1LGBA 4Y22B 1JN2P 5IUQA 4YM3A 3VSZA 1GZ9A 6I1BA 2CY6A 3OYWB 3FJBA 5GZCA 2W39A 4YZ3A 5GZEA 1JYCA 1JLXA 4XKIA 3BTAA 1LOCA 1XZZA 5BVPI 4I2SA 4YLZA 3TAYA 1YI7A 4A7YA 2PHXA 1JT4A 3UD9A 1LODA 3GALA 2D6KA 3LTQA 1DZQA 1JOJA 4I4PA 3BA4A 2KI6B 5BQMA 2ARBA 4FPYA 3FJIA 1FGAA 4LO3A 2AQZA 1DHKB 2D7IA 3BWIA 3WVJA 3AP9A 3HR9A 3BA7A 3ZUQA 5H9SA 3VSFA 2WQZC 5KXCA 1GLHA 1BXHA 2ERFA 3HN1A 1BLAA 1CJPA 4PC4A 2XHLA 4Y1VA 4YM0A 2W2DB 4DPNA 5JOZA 5D61A 5F8WA 4NOTA 5CAZA 1Z7HA 1UN1A 1JUIA 5GLUA 4I4UA 4QO3A 1PWAA 1GANA 5EYYA 3BA5A 4J2XA 3NBCA 1GBGA 4A7ZA 1NUNA 5T54A 1E1HA 3N7KA 2PHUA 1G8WA 1FV2A 5H9PA 3O4DA 3NBNA 3WLUA 2MLLB 4Z8BA 2D7FA 4Y22A 3QW6A 4TLPA 1HKDA 2ERMA 3OYWA 4OEGA 5HCAA 3FJCA 4AWDA 1EV2A 4WV8A 1DYPA 2P23A 3DDBA 2CWSA 2D6PA 2GMEA 2UU8A 3JUTA 3CAHA 3PHZA 1GZWB 2EXHA 5T5OA 1ULEA 5GLZA 3S8JA 4M3CB 5JLVA 3BAVA 4I1EA 3TB0A 2NM1A 1LEMA 1V6LA 4LO1A 2ZKNA 2JE7A 4K1YA 4P14A 1IRPA 3WO4A 2A8AA 1DBNA 3BRGC 2AFGA 5JOYA 3POKA 3N3HA 2SBAA 1XTGA 3ZXLA 3VT1A 1S0DA 4DRRA 2D23A 2W52A 2KLLA 4EFPA 3FJFA 3PJQA 2R0FA 1G9AA 3OGFA 4CTEA 1YRZA 2YV8A 2W2DA 3WDYA 2ILPA 2D22A 5EG6C 4GP0A 3NV4A 4ZFUB 5F90A 3ZSKA 5CA6A 3VKFC 4Y1UA 5H9RA 3WDVA 3WG2A 4G6MA 2E53A 4CZSA 3ZXDA 2B7YA 4ATEA 4YZ1A 4Q27A 4BMEA 4AVVA 4GWMA 2D24A 1WLWA 1N1YA 4I37A 3WG3A 1DQ6A 1GZCA 1LHVA 3RQ0A 4I1BA 4JQ0A 1PZ9A 4BLJA 3JUUA 4Z9WB 3I2XA 1H9WA 2A6VA 3ASIA 1QDCA 2ZBJA 4Y26A 2V5YA 4JAWA 3AJ6A 3POSA 2AAIB 3VUOA 1EYLA 1GZWA 2CWMA 2EXIA 1LESA 3BAGA 1CE7B 3OJBA 1S0JA 4LBMA 1GSLA 2FDBM 2ZGKA 4YFZA 4I3NA 3NV1A 2E51A 1LGCA 1RZOB 3N36A 1FQ9A 4G6JA 1IKQA 2DUQA 3DGTA 4OWJA 4AGVA 8I1BA 4EB2B 3OJVA 1YYNA 2BEAA 1VCLA 1IHKA 4XIKA 4ZOTA 4RA0A 4KS6A 4AYUA 3BAHA 3FIEA 4P9YA 2Q3NB 5F8YA 1MZ5A 3IMNA 3QJ0A 1C57A 1ULCA 5BP5A 2D6OX 4AVSA 1QNWA 1GYKA 3QW5A 4SLIA 3W59A 2DREA 3IM0A 4PBPA 3V64A 2GN3A 4JKXB 2F8XC 5HCBA 1N3PA 1LEDA 5JOWA 2WT1A 1AXMA 4HR6C 4ZBVB 1W6QB 3C8AA 3O4BA 2D3SA 3OY8B 3UK9A 5FZUA 4KEKA 1Q8VA 1BFCA 4LO0A 3IPVB 3H6RA 3I4IA 4LBNA 1PZ8A 1UAIA 1W3FA 3WUDA 4LBQA 2ZGMA 1YTOA 1V6OA 1XG6A 2KH2A 4YW5A 4GALA 3CNAA 1BARA 2VLCA 5I1BA 3ATGA 1C1FA 3I29B 5FNXA 4J1LA 2NMNA 1V6MA 2CL2A 5GZFA 4EJ5A 3PMEA 2CNAA 1V00A 1SCSA 2GNTA 1RITA 2ZGSA 3UL2A 3FJKA 5DZUA 3ILRA 4JKQA 1AX1A 2AREA 3ZX7A 5G00A 4I4RA 1DQGA 2FGFA 1HCDA 4XJ9A 4HA2A 3CRGA 1ENRA 1QXMA 2ISGA 4Y1XA 3JU9A 2UWBA 5GLVA 4BPZA 1U0AA 1S0IA 1ISXA 3I8TA 2E6VA 1AVBA 2GALA 5T5LA 1BFFA 2H0BA 3WDTA 3QLQA 3O12A 4U36A 3PVNA 3HMYA 2DV9A 3AKGA 2Y9XE 5GLWA 4ISRA 1BQPA 4YGCA 4L4HA 1LOAA 2VW0A 5KXDA 5BYNA 1W6QA 4M3CF 4YW3A 3QW7A 4Z8SB 2I2SA 3VKMA 3CA0A 4Y20B 1TEIA 1ULDA 3OY8A 3O5WB 2P34A 2LALA 3O49A 3ILFA 3IPVA 2LTNA 2ZMNA 3M3CA 2GO2A 1ONKB 1V6VA 1WW4A 2ISEA 1SFYA 1AFCA 4AN6A 4QBVA 3D3XA 3AFKA 2QN4A 3I2AA 2WJSA 4XZPA 4I96A 1B09A 1ZL5A 5F9TA 3N7JA 2X2TA 4P9WA 4YOLA 4K21A 3USUA 5BQUC 1QNYA 1Q8QA 4XTPA 3AZWA 2ZR1B 1KNMA 4FPJA 1G7YA 1UZYA 3AYEA 5DG1A 3WINA 1J1TA 3QW8A 1FYUA 3RRDA 5DSSB 3NV2A 1W6MB 1MS4A 3AYDA 2D7RA 4BOWA 1Z0HA 3CA3A 3UD7A 4PF5A 1G9FA 4YG3A 1MVQA 3Q7XA 4YW4A 4XMIA 2A3XA 1Z4SA 2HZ9A 1SBEA 2ARXA 3W58A 1ITBA 3UDAA 1HKNA 3ZXJA 4I6IA 1AX2A 2R0HA 2ZGQA 4Y20A 1NLSA 1ISWA 3FJEA 3OJ2A 2FO1A 1MS3A 4XE9A 2ISHA 5FZYA 1IS6A 3KQRA 1BA7A 2YROA 4XXAA 3MPPG 4DQAA 3MALA 2ETFA 4P6AA 3NJ5A 2Y9WC 5DVHA 3AKIA 4PBOA 5IK4A 3CA4A 3FJHA 2YXSA 4FQZA 3FJDA 1X50A 2RSTA 2PHRA 5F8SA 5GM0A 1E0OA 3C9ZA 3QIYA 5GALA 3AX4A 1ISVA 4G1RA 3MW3A 3CRIA 2ZGOA 2JKBA 1W6PB 3P53A 2VUAA 2NMOA 5JMCA 5HPZA 3BOPA 4LBLA 1IKPA 1LTEA 2IHOA 4C1WA 1G82A 1EVTA 3ZYRA 3T8SA 3N35A 4LO2C 1IJTA 1ENQA 5SV8A 2I1BA 2WRYA 4YG0A 1SR4C 2GNMA 1FNZA 4HEVA 3WHUA 1G86A 4BQ1A 3CA1A 3PVOA 1WBAA 2XB6C 1BKZA 3QIXA 1N3QA 1JQZA 1Y7BA 5D63A 1JHNA 1LU1A 1TOOA 1LHOA 4FP2A 4Q91A 1DYKA 4CRQA 4XJWA 3UJ0A 3AP4A 1F82A 2GMMA 41BIA 2D20A 3NV3A 1I1BA 4LO7C 4FOWA 2DUPA 1KDKA 3S8KA 2XOAA 1TIEA 3BX1C 2GDFA 4YW1A 1XYFA 1V6KA 4KC3A 3U4XA 1D0HA 4YM2A 1QKQA 3WO3A 2JD4A 3AP7A 3POWA 3V0AB 3HALA 3W9TA 4GKXA 3BOOA 4FOYA 4LO8B 2NVHA 3SH5A 2R49A 1Q04A 4TZDA 3N7LA 4ZA3B 2Z49A 1OQ1A 3APBA 1DFQA 4Q26A 1HWMB 4USPA 3R05A 1KDMA 3K1XA 4II0A 2G7PA 1W6PA 1QGLA 3BIWE 4IZXA 5JOXA 3ZURA 4I0YA 1S0CA 3F62B 3D5OA 1OQLB 2VXRA 3MEPA 2VW1A 1CVNA 1OKQA 1GICA 1QOSA 3CU1B 1QDOA 4UW5A 2WKKA 1MS8A 1TFMB 1MACA 3B3QE 3WDWA 1Q1UA 2A6ZA 2YUGA 1WD4A 2EXKA 3BOKA 3M3EA 2G7QA 2E4MC 4ZFYB 4XILA 3ZC9A 1PZ7A 1HIBA 3A0KA 2ZMKA 4XFTA 2F2FC 2ZGLA 2ZGUA 31BIA 1APNA 2A3WA 2VU9A 1O4YA 3CRHA 5GZGA 4FPLA 1AVAC 3O44A 1DQ4A 2EIGA 4P9XA 1WBCA 1S0LA 5T52A 5BXRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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