1G9BA

Crystal structure of clostridium botulinum neurotoxin b complexed with an inhibitor (experiment 1)
Total Genus 401
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
401
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
publication title A Novel Mechanism for Clostridium botulinum Neurotoxin Inhibition
pubmed doi rcsb
total genus 401
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1g9bA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1g9bA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1g9bA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1g9bA01
3DUIA 2H0BA 1XYFA 3WDTA 3C88A 1MS9A 2WKKA 4JC1A 2SBAA 2DV9A 1F82A 1FAYA 4R9AA 4D8HA 1II4A 1PZ9A 5JOYA 2UWBA 5D61A 4Q9PA 1MS5A 3C2UA 3PHZA 1N3OA 4M00A 1XTFA 2GN7A 4I7IA 3ZVXA 4R9CA 2E4MC 3UD7A 4KEIA 2D22A 2IMBA 1I1EA 1RIRA 3JUUA 2HWMA 1LOCA 2VU9A 1AFCA 3WMUA 1BLDA 2XOAA 1Z78A 2ZGSA 4GWNA 4K1ZA 3BA4A 3NBDA 1JOJA 1A8DA 2D3PA 4F83A 5DZEA 1GV9A 1T4QA 4XDQA 4YW2A 1IRAX 3A07A 4JAWA 4FVVA 4XBNA 2K43A 1JT4A 4YG6A 2QN4A 4YZ5A 3B9UA 3APBA 1BJQA 2ZQOA 4QBVA 3D5OA 4XJUA 3Q7YA 3UDAA 2ZBJA 3OBRA 3PVEA 2GNTA 1D0HA 2GALA 1QOOA 3OGGA 2D23A 4GWMA 1K5VA 2EXIA 1RINA 4I4PA 1YF8B 1URXA 3BWIA 1Z2VA 1N1TA 2AUYA 4XJZA 4P0KA 1KJRA 4ZGRB 2ZGRA 3HALA 4WVVA 1GNHA 3VT2A 2NMNA 1YVGA 4USPA 3FGMA 4ATFA 7I1BA 4JKXB 1AF9A 4KEKA 1DGLA 4QC4A 2JECA 2WSVA 1T3CA 2D24A 2A70A 1ABRB 1T3AA 2P3KA 3A21A 2OUJA 5D63A 5HCBA 1AXYA 2PHUA 3HBWA 3C89A 4OWJA 4G1RA 5BXPA 3CA1A 1O4ZA 2NYYA 1LJ7A 3WDWA 4TZDA 2WT0A 5BP5C 3A4UA 3RS6A 1LCLA 2ZHLA 3DDBA 4ISRA 4GKXA 4LO3C 3BB2A 3W9TA 1PZZA 4ISQA 2BQPA 2NVHA 4LBJA 2D6OX 1MVEA 1HQLA 2A3YA 5T5LA 1HKDA 4YGBA 3PMEA 1ZA4A 2WNEA 3P6IA 1W6QA 2MC2A 1ENQA 1S0FA 4EL4A 2P3JA 2AH2A 1W3FA 2X2SA 4PF5A 3FUQA 1GZ9A 3H0OA 1SLCA 1WLCA 1V6XA 1IRPA 4JRAA 2OVUA 3POWA 4FQZA 4Y1YA 4CRQA 3VKMA 1JBCA 5JOWA 1LESA 4LBQA 5CBLA 1VAMA 1WW4A 3DEBA 3MPPG 2P34A 1AZDA 4PQ9A 4OW4A 1NXD1 3UJOA 2MLLB 5IK5A 5KXEA 3CA6A 4TYSA 4ZFUB 4AGRA 2DVAA 3PVNA 3SITA 4GALA 3V64A 3OJBA 5GZCA 4LBNA 4AVSA 3INAA 1W6MA 3VKOA 1AVXB 1CR7A 2EAKA 1DQGA 1WD4A 1XZZA 5GZDA 1CQ9A 4I4RA 3VKFC 2DVBA 3VKNA 3NBNA 1TWMA 3QW8A 3CNAA 2UWAA 2DUOA 1W0OA 2P37A 2D20A 3F1RA 2WSUA 2ZGTA 1GZCA 3QIXA 1XHBA 2A6ZA 1G8WA 4R9BA 3AYEA 5F8WA 3U4XA 1APNA 2G4IA 3USUB 3FJHA 3UL2A 3POSA 1SACA 3UK9A 2P39A 3WO2A 2DTWA 1UPSA 1AVUA 3SISA 2A6VA 4Q27A 5T50A 2VY0A 1ITBA 4JP0A 1R1ZA 1F31A 2D3RA 4JQ0A 1Q8OA 1RG8A 3BA5A 2P2KA 4D0ZA 1IHKA 1G9FA 4EJ5A 3B3QE 4EB2B 2ZA9A 5SV8A 2JKBA 1LHVA 3ILAA 3PJQA 3HOMA 3V79C 4XKIA 3ZYRA 2YZ4A 1WUVA 1DQ6A 1EV2A 3WZ1A 1GLHA 3BAGA 1SBFA 3V0BA 1M2TB 2Z48A 3A23A 2CYFA 1FGAA 41BIA 4I1BA 2ZGKA 1JT7A 3VSFA 5T5PA 5T5JA 1TP0A 2Y9GA 2GNDA 4YFZA 2DS0A 5HCAA 3V65A 3ZXLA 1UAIA 1X50A 1AX2A 3AKGA 4Q2FA 3W59A 1SLTA 3CA4A 1PZ7A 3ZXEA 2KKIA 4X38A 2WLQA 5E89A 1LHOA 4LO0C 3Q7XA 3Q9OA 3CAHA 4J23B 3MW3A 4KTXA 3RSJA 1QDCA 3AP9A 5F8YA 3UJ0A 3OY8A 5I1BA 5BP5A 2LTNA 3FLRA 3FJDA 4LO2C 2KLLA 4Y1VA 3FBYA 1W0PA 3UJ4A 1W6OA 4GKYA 5FRAA 4Q9GA 3ZURA 2R0HA 1PUMB 3QYDA 2R9KB 2GZBA 3ASIA 3D6EA 1S0DA 2ISHA 2YY1A 1LEDA 1LOFC 1HWMB 2DRZA 1DZQA 2C5DA 1QQKA 1MS4A 4IZXA 2Z42A 4H9WA 2A3WA 3WDXA 4IY9A 1JTCA 2R0FA 1FMZA 4AGGA 2AENA 3WUDA 3LCPA 1QF3A 1LOAA 1AJOA 1ENSA 2ERMA 2XHLA 4YG3A 2A97A 1MR5A 4YM0A 3R4UA 4OWLA 4P0JA 2WRYA 2KH2A 1AJKA 4HJJA 4PCRA 1CJPA 4ITCA 4BMBA 1VCLA 1BZWA 3N7MA 1B09A 5F8SA 5GZEA 1TFMB 4DQAA 4J2XA 3I2AA 3WINC 5CA6A 1BASA 3ZC9A 4ZOTA 3WOGA 1IS4A 2JDZA 2D7RA 4W65A 1F5FA 1FYUA 1W6MB 3CU1B 3AH4A 3VT0A 3ZYPA 5H9SA 1S1AA 4AGVA 2W08A 5E24E 3AJZA 1UL9A 2GMEA 1KNMA 5EC5A 5IK4A 3PUBA 1BFGA 4QBCA 4XFTA 2G7NA 2ZMKA 3B01A 3Q7WA 1EPWA 3O0WA 2WJSA 2KI4A 1CN1A 4LBMA 1AVAC 3N7KA 4DRVA 1FNZA 1BKZA 1S0IA 1KRIA 4Y1XA 2G7KA 1ISWA 3M3QA 1WCSA 4XJWA 1HCEA 1QU0A 2ZAAA 2HWAA 2YV8A 1PC8B 5D62A 1A78A 4Z8BA 2NN8A 1WLWA 2DU0A 3O0XA 4DENA 2D6NA 1FN0A 4IONA 5T5OA 3PG0A 5DXDA 4GXLA 3D7WB 3N7JA 4XJAA 1JW6A 4XBLA 3R4SA 2HYKA 1DZDA 3ZSLA 4Y24A 2GDFA 3BAVA 4CTEA 4BPZA 5BXSA 3H6SE 3JRRA 1UZYA 1CESA 2VXRA 2CTVA 3T2TA 3O4AA 1V6MA 3WG4A 1W3AA 5FNWA 1SCSA 1V6KA 2ZGMA 5JDBA 3V0BB 4NO4A 1G9BA 1LENA 4ZFYB 2Q5TA 3USUA 3AJ6A 2VH9A 2GO2A 3V0AA 3CA0A 1HWOB 1DFQA 2I1BA 1DIWA 1N1YA 3VSZA 3ZXKA 3TB0A 1MZ5A 8I1BA 3FIEA 1QOTA 4I4XA 4ENDA 3VEQA 4LO0A 4FPLA 4ZKTB 1JLYA 1BFCA 3SH5A 2A7AA 2VW2A 2IHOA 3E8LC 3M2MA 4FPHA 2FHRA 2ZGPA 2A6XA 1NUNA 3H6QA 2AAIB 2W2DB 3IM5A 4X37A 1ULCA 3O4CA 1RY7A 2VSEA 3MW2A 3WG2A 2A6YA 4MYEA 5DVHA 1Q8QA 1WBLA 1JY0A 3QW5A 2DU1A 3O5SA 4FPFA 1ZKXA 4YM3A 3OY8B 4AN7B 3ATGA 3AYAA 4FGFA 2NMOA 1RITA 3FJAA 4I37A 1IS5A 4OWKA 3IPVA 4P6AA 1G9CA 1YO8A 3WDUA 4AVVA 4HA2A 3I2XA 1W6OB 2ARXA 1O4YA 1ENRA 2XG3A 2EIGA 1K5UA 4GAIA 3CA3A 3NF3A 3QCWA 3BTAA 3AX4A 5DG2A 4Y1ZA 3WVJA 2A75A 3VT1A 1FWUA 3P6JA 4ZLBB 1DFCA 3A0NA 4DRRA 3LSEA 1H9WA 1V00A 5BOWA 4YGEA 2LIEA 4P9WA 1ONKB 1FWVA 1GZWA 5JOXA 3W58A 3ZUSA 2XHLB 4BQ1A 3N36A 1ULDA 3WV6A 1GBGA 2GMPA 5EG6C 4UW4A 1ULEA 3VV1A 2UU8A 1LECA 2XB6C 3WCRA 1V6NA 4P9XA 3VUOA 3T8SA 2VW0A 4XMAA 3RRDA 2R1BA 1VIWB 3AKHA 2D7FA 3WCSA 1TWEA 4I8MA 3WUCA 1WW6A 2EF6A 4M3CA 3DSEA 4ZA3B 3IMNA 2AYHA 1IS3A 4WV8A 3FJCA 1Z7HA 3AZWA 4XFUA 4QKSA 1UX6A 1ISVA 3P53A 3T1MA 1N4KA 1SZ6B 3FJFA 3OPZA 4OUJA 2B7YA 4FPKA 1ONAA 1T9FA 1GNZA 3AYDA 4XZPA 4HANA 4XFSA 3VWCA 1S0GA 1WW7A 1ULGA 4I96A 1VAVA 4PBOA 1LGNA 2ERFA 2E7TA 4ATEA 2FMDA 1BXHA 3M3OA 1DJSB 1VALA 3NV4A 1ZN3A 4A7KA 4GOVA 1IKQA 2D6MA 1C4RA 2D43A 5GJ6A 3OBTA 4Q8KA 5T55A 5DUVA 2ISEA 3RMXA 5FNXA 3WMVA 4J2SA 1V6JA 2IWTB 4XXAA 3CRGA 1QMJA 2E6VA 1MS3A 1C1LA 4HR6C 4JCKA 1W6PA 2NM1A 4XTMA 2WT2A 1HLCA 4KUFA 2AREA 1IJTA 5GLTA 4ASMB 5GZGA 4YZ1A 5JLVA 3FJIA 5HPZA 2E4MA 4FOYA 3SH4A 1SBDA 5AVAA 3V0AB 4FOWA 2KM2A 4QD2B 2ZACA 3CRIA 1ZM1A 2DUPA 1JYIA 3M3CA 3FLTA 4EEEB 3ZC8A 4P9YA 1G7YA 3MEPA 4FPJA 4BOWA 3NV3A 3O4BA 4XMIA 1UMZA 4LBOA 3ZX7A 4A7YA 4GP3A 4JPZA 4L4IA 4YM2A 4LO1C 4Y22A 1BARA 1OFSA 5JVVA 2GNBA 5DUYA 2K4AB 2BFHA 4EFPA 3WO3A 2VUAA 1SLLA 1OKQA 2G7PA 1S0JA 5KXDA 3F62B 5EYYA 2FFUA 1MZ6A 1ISZA 5CB7A 3IPVB 4I0YA 4K21A 2BEBA 4Z8SB 3UJQA 5FZUA 4PBPA 3S8KA 5H9PA 1LHUA 4LO7C 4KC3A 4Y1UA 1Z0HA 4NOTA 4BLIA 4Q8LA 1IOBA 1W3GA 4Q1PA 2NP0A 3O4DA 2ZHKA 3GNEA 2W2DA 4K1YA 1AXKA 4UW5A 1CPMA 3O4OA 1F9KA 1GZWB 4U36A 1JQZA 1WBFA 3BAHA 2PHFA 4I4QA 5DSSB 3BADA 5KXCA 4G6JA 4XIKA 3HMYA 3ZXFA 3R05A 4G9MA 4EFQA 1ILR1 2V5YA 1GKBA 3C8AA 4JKQA 4Y20A 2D3SA 4QO3A 3DGTA 5EXOA 4GP0A 2Q3NB 2D6LX 4LO3A 1FQ9A 2VLCA 3ILFA 2ES3A 3AH1A 1CVNA 3IM7A 2P23A 3DDAA 4OEGA 3NWKA 3KM5A 2FFVA 1AXZA 4Q1RA 1ZB7A 1YTOA 1CPNA 2L5XA 1W6NA 4WBCA 2DVFA 2NTDA 1MC9A 1N47A 2A6WA 4FPOB 4M3CB 5JOZA 1S0BA 1YIFA 3O0VA 3B9CA 1DQ2A 5DG1A 3RMYA 2D6PA 3S8JA 31BIA 3N3HA 3BRDA 1QOSA 3KQRA 1V6OA 3O44A 1Q1UA 1G9AA 1DQOA 4YG0A 4K20A 2SLIA 4Q26A 1OQLB 4YLZA 1KQRA 1Q04A 1SCRA 3OYWA 3ENRA 1DQ1A 2MIBA 1JN2P 3POKA 4BLJA 2D7IA 5IK8A 3C8BA 3AJYA 3I8TA 5IT6A 3N7LA 1Q8PA 4DCKC 1Z4SA 2YUGA 4J2KA 3K1XA 4TLPA 3FJ9A 1LOEA 2A8AA 4RL7A 1AVBA 1LOBA 3ILRA 4L4HA 1MACA 3BAOA 3WO4A 2ARBA 4QALA 1YYNA 3FJ8A 4H55A 2E7QA 1IOAA 3O3QA 3ZSMA 2K8RA 3TAYA 2AQZA 1JXNA 1AX0A 4Y26A 1LULA 3ZUQA 3ILNA 1W6PB 1PWAA 2ISGA 4XJ8A 5EYXA 4I2SA 2FO1A 1U0AA 2ESUA 4X39A 2ZABA 3BOKA 1H9PA 1XTGA 1UKGA 3CQAA 4KBBA 4YW4A 2ZMNA 4A7ZA 1LHWA 1S0CA 4YZ4A 3WG3A 1WBAA 2WT1A 2PHRA 1LGBA 3KMVA 3PVOA 4YZ2A 5FREA 1MS8A 2D6KA 1JLXA 4UW6A 3B69A 5CNAA 3BOOA 1SLIA 4XBQA 1BYHA 3AP6A 2FDBM 4II0A 2JE9A 3NJ5A 3VKLA 3ZPYA 1WD3A 3AP7A 4QKRA 3FIIA 4XXPA 3IKWA 1JT3A 4Y22B 1TIEA 5KXBA 3WNXA 4D69A 1HKNA 2JE7A 2ZHMA 3BX1C 2FGFA 5GLWA 1NLSA 1XQNA 4M3CE 3MW4A 4AYUA 1DZCA 4U2AA 1LHNA 5GLZA 1QDOA 1SLBA 4XHXA 3A0KA 4XYXA 9ILBA 4IY8A 2AGSA 1Q03A 3AKFA 3NV1A 3FLPA 2RHPA 3M1HA 4IYBA 5F5QA 1HWPB 5BVPI 4FOQA 2PELA 2E53A 1SLAA 4YW3A 4I4OA 4XE9A 2RG9B 5H9RA 2ZGQA 3WG1A 1D2SA 1KDKA 4LO2A 2WBCA 4DFSA 3FJEA 3WHUA 4Y20B 3BRFA 1R8NA 4SLIA 5F90A 1FV2A 2A71A 4G9NA 2F2FC 1GANA 1LOFA 3I4IA 4I3NA 1BFFA 1HWNB 1BFBA 1C1FA 2CNAA 4DEPA 21BIA 1KDMA 2E51A 3LTQA 3OGFA 1W6NB 1EVTA 5DUXA 1V6LA 5GM0A 3O5WB 1SBEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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