The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
MTTFKLIINGKTLKGEITIEAVDAAEAEKIFKQYANDNGIDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hyperthermophile
|
| molecule keywords |
GB1-C3B4
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| publication title |
Design, structure and stability of a hyperthermophilic protein variant.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp.
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| total genus |
9
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1XCT L; 2N9L A; 2PLP A; 1MHH E; 3V3X A; 4GLS C; 2LHE A; 3UI3 A; 1IBX B; 4D2K A; 2JU6 X; 3FIL B; 2JXT A; 2JZP A; 1PGX A; 2ZW0 A; 2LUM A; 1IGC A; 1ZXH A; 2K0P A; 5BMG A; 2KQ4 X; 1PGB A; 2KN4 A; 5BMH A; 2J52 A; 2IGD A; 5JXV A; 2KAC A; 1Q10 A; 1K53 A; 1MHX A; 1XCQ L; 1GB1 A; 4OZC A; 4OZB A; 3GB1 A; 4HKZ E; 1MPE A; 1KH0 A; 2LGI A; 1QKZ A; 5HHD G; 2IGH A; 1EM7 A; 5BMI A; 1GB4 A; 1MVK A; 1F2R C; 1F2R I; 1K51 A; 1D4B A; 2JSV X; 1JML A; 4IOI E; 4KGT A; 2N7J A; 1C9F A; 2I2Y A; 4OZA A; 1HZ6 A; 1MI0 A; 1P7F A; 2ON8 A; 5HG2 A; 1YMH E; 2KDM A; 2PTL A; 2GI9 A; 1FCL A; 2RMM A; 2KWD A; 1K50 A; 4KGS A; 2LHD A; 4IKG A; 1IGD A; 1IBX A; 2ONQ A; 1FCC C; 1YNT E; 2J53 A; 1P7E A; 3FIL A; 2ZW1 A; 1HZ5 A; 2NMQ A; 1K52 A; 2OED A; 2N9K A; 1PGA A; 4WH4 A; 3MP9 A; 2PW9 A; 4HJG E; 2QMT A; 2GB1 A; 2JWU A; 1FD6 A; 1XF5 L; 5HFY A; 4KGR A; 2RPV A; 1HEZ E; 2IGG A; 5HI1 A; 4MAC A; 1UWX A; 2QSD A; 2I38 A; 2EEL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2K5P A; 4IM3 A; 3ZXR A; 3TMP B; 4Q2J A; 3BYY B; 1T0R C; 4RGO S; 4NAW A; 3ZNH B; 2WS3 B; 1WX7 A; 1FM0 D; 4YSY B; 4K7S A; 3A1Q A; 5BMG A; 2MW5 A; 1YX6 B; 2IDY A; 1E7U A; 5AZF A; 2BVC A; 3CST A; 1MG8 A; 5MPO A; 4M0W B; 4BKT A; 1N61 A; 3PRZ A; 5HKH A; 1MHX A; 1VRA B; 3DDC B; 1ACC A; 4OZB A; 4A90 A; 1XLO A; 1F0Z A; 4XWT A; 1OGW A; 1YQB A; 4CQN A; 3KWV A; 2D3B A; 3C19 A; 1F2R I; 2IND C; 4W9L A; 2HJ1 A; 4A55 A; 1CMX B; 2MH7 A; 1DOY A; 1C9F A; 1YOV B; 2L8J A; 2WU5 B; 2ON8 A; 1T5X D; 4BFR A; 1QOG A; 2OJW A; 2AX5 A; 2WHI A; 1R4M I; 1WGG A; 1LFD A; 3L4P A; 4TKN A; 4ASW C; 1TJE A; 2DX5 B; 2MRP A; 1DOI A; 3L10 B; 3MJ5 A; 1RFA A; 2LJ5 A; 2FBW B; 2LI5 A; 3X0W A; 1KJT A; 1I35 A; 4HCP B; 3KW5 B; 3RT3 B; 1K52 A; 4BBN F; 4WWM A; 5G5G A; 2GBM A; 4KVG B; 2KXJ A; 3A9K B; 1Z2M A; 2FCQ A; 4M0W A; 2IO0 B; 1WSP A; 4UDU C; 4ITK A; 1WZ0 A; 4ARC A; 2H88 B; 5CTR C; 3AN1 A; 4LNI A; 4P1B C; 3ALB A; 2PLP A; 3O13 A; 3Q3M C; 4W9F A; 1OQR A; 3EA6 A; 3L17 A; 1LQB A; 2BYV E; 3V60 A; 3ZRC A; 1WYW B; 4YTM B; 3VTW A; 1P1A A; 4K3C A; 2L1A A; 3WAP A; 4YSZ B; 5AUK A; 1UBQ A; 1C77 A; 2L7R A; 3OLM D; 4II3 B; 2KQ4 X; 1WR6 E; 3PHX B; 2WP9 B; 3M95 A; 3JW0 X; 3IXS A; 3W1Y A; 3B0A A; 3WAL A; 2M8S A; 1MJD A; 3W9C B; 4C4V B; 1VJK A; 3RN9 C; 3MC0 B; 2MWS B; 2XBB C; 3VRA B; 5IA7 A; 3NS1 A; 4TUU A; 1BT0 A; 5BYR A; 4RF0 A; 2WDQ B; 1R4M B; 3MJW A; 3HUI A; 1D5Z C; 3A9K A; 4L2Y A; 2M0X A; 3RYT A; 1P7F A; 2KC2 A; 4GMV A; 4HKQ A; 2K3U A; 2IO2 B; 3B9J A; 1ZW7 A; 1XT9 B; 2BYT A; 1WGK A; 5JH5 C; 4JX1 C; 3U52 E; 2KWD A; 1Z5S B; 3BY4 B; 1E0Z A; 3PT2 B; 5AEK B; 2WXG A; 3C8Y A; 4C56 C; 4KDL B; 2JRI B; 5D7G A; 1A70 A; 1GG3 A; 1AYF A; 3I5J C; 4DWF A; 1KLG D; 2MLB A; 2PW9 A; 1L7Y A; 1NVI D; 3AEC B; 2RGF A; 3DVG Y; 2LWP A; 1A5R A; 1S1Q B; 1SSN A; 4C4V A; 4ACF A; 3W1S A; 1GAQ B; 2O6V D; 2WQY B; 4RGT A; 1VR9 A; 3ZYY X; 2WXO A; 1WX8 A; 1MHH E; 1V5O A; 3ZTD A; 1FXI A; 3NVV A; 1FNU A; 4ICV A; 2GBR A; 1N60 A; 1YN3 A; 2G4D B; 4BOS C; 1STE A; 4LCD E; 1S3S G; 3W5U B; 1XXG A; 4FHJ A; 2KN4 A; 2R61 A; 4YL8 A; 3WAO A; 2DBY A; 3H1U A; 3TUO A; 3DBL I; 2FIF A; 2MBE A; 1VZ6 A; 2QCZ A; 3W5V B; 3PZD A; 2BBC A; 3DWM A; 2JF5 A; 1HTO A; 3IG3 A; 4ZYS A; 3DVN U; 1SE9 A; 1MVK A; 5IN7 A; 4IWO A; 2W82 A; 3RUL A; 4DBG A; 3VH3 B; 2BPS A; 5G55 A; 2V9H A; 2JSV X; 4FJZ A; 4LTU A; 4PS3 A; 2N7J A; 4M01 A; 4MGK E; 2JRH A; 3B2G A; 4F1S A; 1WFY A; 1WX9 A; 3APD A; 1KM7 A; 2V3N A; 4TMA B; 3S2A A; 4BBN C; 1ZOY B; 1JCK B; 3ZJV A; 3P63 A; 4OHJ A; 2JQR B; 3ZJU A; 1BXT A; 2ONQ A; 1FCC C; 1E8Z A; 4PS7 A; 3ETR A; 3KVF B; 4XE0 A; 1YQ4 B; 1OFF A; 2KJR A; 4WH4 A; 1EF5 A; 4I6P A; 2KVZ A; 2MP2 B; 1WJU A; 3RZW C; 2MSE D; 3H7P B; 5IO9 A; 2DAJ A; 3GE3 C; 3Q8A A; 3N9Y C; 2GLS A; 1NYQ A; 1WGD A; 3EUB 2; 1C4A A; 4DK5 A; 1EF1 A; 2JZ3 B; 4GN1 A; 3AE6 B; 2C9W B; 3MFG A; 3ONS A; 1PGX A; 3KUC B; 4PT5 A; 3LJ3 A; 3DBL B; 4JE3 B; 4OW0 A; 2DYO A; 4NJC A; 1KLU D; 4NNJ B; 1N63 A; 3I57 A; 2IGD A; 1QLB B; 3ENE A; 3TBL D; 4KKJ A; 1TGZ B; 2DWQ A; 2AL3 A; 2N4F A; 2KKC A; 5H8Y E; 1TKY A; 1C1Y B; 3VUX A; 2WU2 B; 3AE4 B; 3N32 A; 2KDE B; 5BMI A; 1T0Y A; 3EC8 A; 1LGR A; 2GMI C; 2I1J A; 2KFK B; 2L76 A; 1L6U A; 4AJW A; 2ZVO A; 2LMC A; 2M56 B; 2MP2 A; 2MEK A; 3K9P B; 3H7P A; 4EZL A; 1UUP A; 1FMA D; 2FAZ A; 1OEY A; 1VLB A; 4HXD A; 2DHZ A; 2M1M A; 1YJ1 A; 4CO7 A; 4RCO A; 3U4E G; 3PGE A; 2AWT A; 3KQ4 A; 3NVW A; 2CJN A; 2BKR B; 2ZEQ A; 2MJ3 A; 3AXC A; 5LNK 1; 1YD8 U; 1HZ5 A; 2ZW1 A; 2J0K A; 4URK A; 2J0J A; 1BUI C; 4WJO A; 2E3T A; 4MGY E; 3CF6 E; 1YN5 A; 4GU2 A; 2GB1 A; 1CQV A; 2G4S A; 4E74 A; 4EZJ A; 2KVR A; 4NAM A; 3IT4 B; 3L13 A; 5IP4 D; 3U7Z A; 3MTN B; 2EMT A; 3QAQ A; 4E71 A; 3B08 A; 2FCN A; 4KIK B; 3AM9 A; 4IWP A; 2WDT B; 3DOW A; 2WXN A; 4MJS B; 4DXA B; 2BWF A; 2KFK A; 2B3A A; 3WAM A; 3AE7 B; 2MHJ A; 3KUD B; 4HJK A; 5IAA C; 4ARI A; 1K8R B; 1Y56 A; 5E6P A; 1SGH A; 2AQ1 B; 1WXS A; 2KQ7 A; 1ZDV A; 3BVG A; 2KYW A; 1WZ3 A; 4BKS D; 2JVC A; 4I6N B; 1V9J A; 4W9H A; 3PO0 A; 2NPT B; 3AE9 B; 3T3O A; 3TEW A; 2JT4 B; 1BML C; 2K39 A; 4TSS A; 2CS4 A; 1AWD A; 1F2R C; 1E5W A; 3W1S C; 4LDT D; 2HJ8 A; 3KYC D; 2HE7 A; 1YJJ A; 3ML9 A; 5HG2 A; 1YMH E; 2KDM A; 4FLH A; 1I4H A; 1KTK A; 4ANW A; 1Q5W B; 4NQL B; 2QIE B; 3PHW B; 4MM3 B; 4L1B A; 4M8N A; 2KK8 A; 4MJS A; 2YLM A; 1UEL A; 1VZ8 A; 4WAF A; 3RUI B; 3VFK A; 1B1Z A; 4HPP A; 1CZP A; 3GS2 A; 3N1X C; 5E6J A; 3I9V 1; 3PS6 A; 4HJG E; 5FK9 C; 5JZE B; 4W9I A; 1FD6 A; 1CJE A; 4JGH B; 1E7V A; 2RPV A; 2ZNV C; 1TTN A; 2D5G A; 3B1L X; 5EE0 A; 5C3J B; 2HDE A; 1RAX A; 3IAM 1; 3AEE B; 5E6N A; 2DYM A; 3V61 A; 4IUM B; 2INP E; 3PRP B; 3QCA A; 3ZKJ C; 4LJO B; 2GBJ A; 2BB6 A; 5DPW A; 1WI0 A; 3NHE B; 4W9E A; 3OJ4 B; 4K3B A; 1GC6 A; 1RM6 C; 3P4P B; 3QK0 A; 2A5U A; 2KX0 A; 5D3D A; 2ZCB A; 5D6J B; 1TS2 A; 4KDI C; 2J0M A; 1M4V A; 2E6X A; 1WGH A; 2W3S A; 3AEG B; 2M4N A; 4MM3 A; 4OZC A; 1ENF A; 1E90 A; 1RWS A; 4GDK A; 3ZQ4 A; 1NEK B; 2BQQ A; 2V1Y A; 1C4C A; 2CU3 A; 4OVV A; 2OJR A; 4XDD A; 3AB5 A; 4FBJ B; 1AN8 A; 2XK5 B; 4RF1 A; 2PEA A; 2N1V A; 4KV2 A; 1J19 A; 1E10 A; 3ZIM A; 2INN E; 3N3K B; 4MGI E; 4DHJ D; 5EE1 A; 5LXI B; 2V4I B; 4GXB A; 1HZ6 A; 1WGR A; 2KFJ A; 3WA0 A; 3PZ7 A; 3O65 B; 4HRS A; 1X1M A; 1ZDX A; 2WXH A; 4HRO A; 4NY0 A; 5DPS A; 3P4S B; 4F8C B; 1OQQ A; 3NVZ A; 1PQS A; 3HVZ A; 1SB3 C; 3N1Y C; 2J53 A; 1TY2 A; 3ZRF A; 4A20 A; 3ZNI D; 3RD2 A; 1RYJ A; 2KMA A; 2KOX A; 4MH8 A; 3KUZ A; 4KSL C; 2Q5W D; 1L4D B; 3MHZ A; 3TCA A; 5J17 A; 4IW0 A; 4S0R A; 4YTP B; 5HFY A; 2LVQ A; 2V3S A; 5H92 C; 1QZE A; 1R4N I; 1WJ6 A; 2V4L A; 4HDO A; 1AW7 A; 2CKH B; 1XCT L; 2XK5 A; 3NVY A; 3V3X A; 1SE4 A; 1TS3 A; 4XZ4 A; 5AZG A; 3GE8 C; 4ICU A; 1GC7 A; 4KZC A; 3AED B; 3DBH B; 3AE3 B; 2DEN B; 3FC4 A; 3N20 C; 4P1C C; 2BW2 A; 2JX5 A; 4PYU A; 1WWT A; 5BMH A; 3I3T B; 3OAW A; 4MEL A; 4RGN A; 1LO5 D; 4JLC A; 1T3Q A; 3DHI C; 2LVP A; 2QEJ C; 3GB1 A; 2MJE A; 4W9G A; 4G50 A; 5L95 C; 2BF8 B; 4MT5 A; 3H9D A; 1GB4 A; 1FO4 A; 4QAY A; 2XNA C; 2RDH A; 1E8Y A; 1WJ4 A; 5I4D A; 2VZK D; 2YEP F; 3OWE B; 2KLC A; 4EUT A; 2KWV B; 2DLB A; 1TZ1 A; 3MC8 A; 4C00 A; 3PTF C; 1QT9 A; 4DQO C; 4H2A A; 4RH6 A; 3BVM A; 4K7U A; 2WXJ A; 4BKS A; 4BOZ B; 4BKG A; 1WGY A; 2CU1 A; 1JWU D; 4KGS A; 2FCM A; 1WMH B; 4AQ7 A; 3TEY A; 3QJZ A; 1TIF A; 2C7H A; 1TYG B; 2W54 A; 4XX5 A; 1JWS D; 2NMQ A; 1F77 A; 1V6E A; 2Z0E B; 1C4P A; 3MP9 A; 4A3P A; 4BVU C; 1OEY J; 3TIX A; 2HTH A; 4G3X B; 1ZXI A; 1ESF A; 1R4N B; 2RPQ A; 3V6E B; 1XLP A; 2SEB D; 3QIJ A; 2Z8L A; 1F9J A; 3DBS A; 3RNA C; 4MAC A; 1C78 A; 2LRU A; 3ZDT A; 1ROE A; 4A6Q A; 2EMS A; 4D2K A; 3HM6 X; 3U7D A; 2MCN B; 3NOB A; 4JWS C; 2JU6 X; 2ZNV B; 5G2N A; 2CHX A; 5BO4 B; 2LAS A; 3HK0 A; 1N62 A; 2WXM A; 1V1P B; 4JWU C; 2NVU I; 1UBI A; 4MGZ E; 2V3P A; 2LJI A; 4JQW C; 4FAD A; 2C60 A; 3NG0 A; 1XCQ L; 4XYC A; 1FXT B; 3A4S C; 3ZGZ A; 1WMH A; 4HKZ E; 1KH0 A; 4EOY A; 3NUH B; 2KTR B; 3ZLZ A; 4FA6 A; 1FFV A; 4IC7 B; 4B0M A; 3QQ8 B; 1VZ7 A; 3EEC A; 2G9H D; 3AE5 B; 4RM8 A; 4MSQ B; 1AAR A; 4IOI E; 3ML8 A; 4OZA A; 2INC C; 1V97 A; 3IBE A; 1JWA D; 1M94 A; 3BYT B; 5DCN A; 2O2V A; 4N9F 4; 1N5W A; 1KFY B; 4EE2 A; 3CMM B; 2PVO D; 1HQR D; 1EU4 A; 3NJT A; 1IPG A; 4WIP A; 4HCN B; 2EKE C; 2CR5 A; 3U2S C; 2YVC A; 1VDV A; 2MX2 A; 1PGA A; 2JYT A; 3VTU A; 1ZP0 B; 4ZOH C; 1JWM D; 4DXG A; 1V1P A; 5GMV A; 3H6N A; 3A9J A; 2DNF A; 3Q3N C; 3AE2 B; 2ACZ B; 4RNA A; 4REZ A; 2JWU A; 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2ZW0 A; 5L83 A; 4WQM A; 1PFD A; 2VH2 A; 1XO3 A; 1ZPS A; 2KX3 A; 3R66 C; 1Q1O A; 3ZNG C; 1WRD B; 4HEA 1; 3RCZ A; 2KTF A; 1GB1 A; 5IKC M; 1SIF A; 1P9D U; 4WAA A; 2KT7 A; 4GB9 A; 1MPE A; 3J9C A; 1WM3 A; 3DBR I; 1QKZ A; 4W9D A; 1JWB D; 2IYD B; 3ZNZ B; 2J4X A; 3NZU A; 4S17 A; 4ZDV A; 2KAN A; 1V8C A; 2ZJD A; 1GUA B; 5EE9 A; 2KDF B; 4ZRJ A; 3R7R A; 2BKF A; 2IY0 B; 5T8I A; 1I4G A; 2TSS A; 3FKY A; 2I1K A; 3KH0 A; 2M19 A; 5FR3 A; 1QIL A; 3VUY A; 1NYR A; 2AQ3 B; 2QJL A; 3Q69 A; 2O6V A; 2K25 A; 4GDL A; 1JW9 D; 3PSE B; 1GOZ A; 4ZRK A; 2LHD A; 1IGD A; 2IPK D; 1WXM A; 1I7H A; 3HHM A; 4ZRQ A; 1WF9 A; 4OVU A; 1LXD A; 3M63 B; 2WXL A; 2K8C A; 4LK0 M; 4E3C A; 1E7P B; 5EE3 A; 1ISN A; 4W9J A; 4KZ0 A; 4LNF A; 2K22 A; 2FNJ B; 3L54 A; 4GSW A; 4GDK B; 3RZF A; 4AS1 A; 4RFB A; 3P1M A; 1ZUD 2; 2KAJ A; 3GOE A; 5C23 A; 1N5X A; 4P16 A; 1T0Q C; 2C7M B; 3BVZ A; 2AQ2 B; 3FIL B; 4ZRI A; 2WXK A; 3HVD A; 3DVN V; 1IYF A; 3AU5 A; 1TY0 A; 4EKU A; 3IAS 1; 1KOT A; 3DBR B; 3ZDM C; 3BK1 A; 3APF A; 1C76 A; 2LXA A; 3RMK C; 2LGY A; 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