The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
STYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein/signaling protein
|
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| publication title |
Novel recognition mode between Vav and Grb2 SH3 domains.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
12
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-08-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5FWB A; 2LP5 A; 1X69 A; 2ECZ A; 1SPK A; 2PZ1 A; 1MUZ A; 2ABL A; 1I07 A; 2LCS A; 1K0X A; 3ULR B; 2OI3 A; 3O5Z A; 1YWP A; 2FEI A; 5I22 A; 2ESW A; 1B3Q A; 1SHF A; 3TVT A; 3UA7 A; 1PRL C; 1HJD A; 1BU1 A; 4J9D A; 1WYX A; 3ZL7 C; 2K6D A; 3EHQ A; 4LE9 A; 1NG2 A; 4JZ4 A; 1OV3 A; 2DRK A; 1BK2 A; 2RQT A; 1OPL A; 3CQT A; 4D8K A; 2L3Q A; 4A63 B; 2F2V A; 1JQQ A; 2I0N A; 1WXB A; 2V1Q A; 2RQV A; 2W0Z A; 2MOX A; 1M3A A; 2FG0 A; 2KRN A; 2X3X D; 2YUQ A; 1X27 A; 2DRM A; 3NHN A; 1ZUU A; 2EPD A; 1G2B A; 2LJ0 A; 1HD3 A; 1T0J A; 3VRZ A; 2RF0 A; 1ZBJ A; 2CUB A; 1PKS A; 4GBQ A; 1RUW A; 3EG2 A; 1NM7 A; 1X43 A; 2KGT A; 4HVU A; 2MCN A; 3VS5 A; 2NUZ A; 4QT7 A; 1J3T A; 3M0R A; 2JM9 A; 2OJ2 A; 1GFD A; 4D8D A; 1HSQ A; 5IXF A; 1UHF A; 2A28 A; 1U5S A; 2DL3 A; 1AEY A; 2EGE A; 4HXJ A; 2KE9 A; 1WLP B; 4JZ3 A; 2GQI A; 1E6G A; 3M0S A; 4RTV A; 2J6O A; 2C0I A; 2J05 A; 2DM1 A; 3VS2 A; 2V1R A; 2L0A A; 2C0T A; 1KJW A; 1JU5 C; 2O2O A; 1YNZ A; 1PWT A; 1VYT A; 1LCK A; 3LH5 A; 2VWF A; 2LJ3 A; 3M0Q A; 4ORZ A; 3H0F A; 3VS3 A; 4LUE A; 4JJC A; 2DF6 A; 1KIK A; 1H8K A; 3EG3 A; 1CSK A; 2C0O A; 2YSQ A; 2JMA A; 3VS4 A; 1RLP C; 2DL8 A; 2RNA A; 3NGP A; 1OEB A; 3REA B; 1IO6 A; 1M3B A; 2AZV A; 2O88 A; 1UJY A; 2RN8 A; 2JXB A; 4KRT A; 2EBP A; 4RUG A; 4J9G A; 4OMO A; 3VS7 A; 2KEA A; 4J9H A; 2BZX A; 4OMN A; 1AOJ A; 4J9I A; 1CKB A; 2K9G A; 4RTT A; 4HVW A; 1K4U S; 2M51 A; 4F14 A; 5IXB A; 2JMC A; 4M4Z A; 1JXO A; 3PVQ A; 1GL5 A; 1AWW A; 2AKL A; 2DYB A; 2F2W A; 4RTZ A; 2EVR A; 3I35 A; 2DL7 A; 1WA7 A; 2BZY A; 2DLP A; 2EQI A; 2KYM A; 1TUC A; 1Z9Q A; 2CH4 A; 1ZUY A; 4CC7 A; 2CRE A; 1ZX6 A; 1M3C A; 1BB9 A; 1QLY A; 4GLM A; 2K3B A; 4AFU C; 1I0C A; 1TUD A; 2KRM A; 1NLP C; 2LZ6 B; 1X2Q A; 1GFC A; 4OMM A; 3NPF A; 2GBQ A; 3QWY A; 1UHC A; 1G83 A; 1M30 A; 2ENM A; 3RBB B; 2DE0 X; 2QDL A; 2HDA A; 4LN2 A; 4CC4 B; 2X3W D; 2D1X A; 2JM8 A; 2D0N A; 1W6X A; 1AD5 A; 1B07 A; 3H0I A; 3JV3 A; 1FYN A; 3PVL A; 1GBR A; 1SSH A; 2FRW A; 1NLO C; 2L2P A; 3VS6 A; 2FPD A; 2GTO A; 1QWF A; 2O31 A; 2OAW A; 4CC3 A; 2ED0 A; 2H8H A; 1PHT A; 2KBT A; 1U06 A; 3UA6 A; 2A36 A; 2FPF A; 2KT1 A; 2FO0 A; 2NWM A; 1E6H A; 2PTK A; 2W10 A; 2A37 A; 2LMJ A; 1N5Z A; 2DMO A; 1JXM A; 1WDX A; 2LQN A; 2CT3 A; 1WXU A; 4R0K A; 1RLQ C; 1KSW A; 3M0T A; 4DEX A; 4DEY A; 1QKX A; 1VYU A; 2ED1 A; 4E6R A; 2J6F A; 2KNB B; 2AK5 A; 1K1Z A; 1WFW A; 2DL5 A; 2B86 A; 2DIL A; 1WXT A; 2D8J A; 2EKH A; 2LQW A; 1PKT A; 2F2X A; 4F17 A; 3SHW A; 3VS0 A; 3PE0 A; 1T0H A; 4ESR A; 2FRY A; 1YCS B; 5HCK A; 4J9E A; 1WI7 A; 1ABO A; 1K0S A; 2P4R A; 2KRS A; 1M8M A; 2YUO A; 2AKK A; 5IHI A; 4RTU A; 1AZG B; 1WIE A; 3TSW A; 3UAT A; 1OPK A; 4HVV A; 5IHK A; 1VA7 A; 1X6B A; 1KFZ A; 3I5R A; 2PNI A; 1W70 A; 4Z88 A; 3H0H A; 1T3S A; 1MV0 B; 1UDL A; 2DJQ A; 2RMO A; 3QWX X; 1K76 A; 2J06 A; 2GGR A; 1CKA A; 2EYX A; 1W1F A; 2K79 A; 1Z9Z A; 1UG1 A; 4AFZ C; 4X1V A; 1AZE A; 3UF4 A; 1BBZ A; 3SEM A; 2FPE A; 4K11 A; 2LJ1 A; 5FW9 A; 2BZ8 A; 4AFQ C; 5EC7 A; 1UEC A; 4AG2 C; 2J6K A; 1AVZ C; 1NEB A; 4IIM A; 4OML A; 1NYG A; 3C0C A; 2LX7 A; 3U23 A; 4J9B A; 5IH2 A; 4AG1 C; 1I1J A; 1S1N A; 2KR3 A; 3EGU A; 1YN8 A; 4F16 A; 2JS0 A; 2AZS A; 3NMZ C; 3KFV A; 1X2K A; 3R6N A; 2DL4 A; 5ECA A; 2YDL A; 2EYW A; 1T3L A; 3M0P A; 2HBW A; 2EW3 A; 3IQL A; 4Y92 A; 1Y57 A; 2KT8 A; 4RTX A; 1MV3 A; 2IIM A; 2O9V A; 2O9S A; 1K9A A; 3THK A; 1X6G A; 2RPN A; 4Z89 A; 1H3H A; 1PRM C; 1AWX A; 1YP5 A; 4LUD A; 2M0Y A; 4J9C A; 2GNC A; 4WCI A; 3I9Q A; 2JT4 A; 4CC2 A; 1FMK A; 2LNH B; 2BTT A; 1VYV A; 2JS2 A; 1ZSG A; 2CSI A; 4OMQ A; 2DBK A; 2CT4 A; 1SHG A; 4JPB W; 1Y0M A; 2D8H A; 2HSP A; 2CDT A; 3RNJ A; 1H92 A; 1GCQ C; 1NYF A; 2DA9 A; 2RQU A; 3TSZ A; 2JTE A; 2K7A A; 2KXC A; 1AWO A; 2SEM A; 3GBQ A; 4JJD A; 1E7O A; 1QKW A; 3VRY A; 2CH4 W; 2KRO A; 2YUP A; 1UGV A; 4RTW A; 3VS1 A; 2SRC A; 1GCQ A; 2CUD A; 2MIO A; 2YT6 A; 1AWJ A; 1QWE A; 5GJW B; 2CSQ A; 1OOT A; 4IIO A; 1GBQ A; 3EG1 A; 2GTJ A; 5IHN A; 4EIK A; 2A08 A; 1M27 C; 1JEG A; 2ROT A; 4RTY A; 3H41 A; 2DBM A; 4J9F A; 1U3O A; 2J7I A; 1TG0 A; 2EYZ A; 1PNJ A; 2EGA A; 2EGC A; 1EFN A; 1UJ0 A; 4Z8A A; 1UE9 A; 1RI9 A; 4AFS C; 2VVK A; 2RQW A; 2L3S A; 1SRL A; 4LNP A; 4OMP A; 1UTI A; 2EYY A; 1UUE A; 3FJ5 A; 4FSS A; 4JJB A; 1GRI A; 3I5S A; 2HEQ A; 1V1C A; 1ZUK A; 5GJV B; 1SEM A; 1ZLM A; 2DVJ A; 1UFF A; 2JW4 A; 2G6F X; 3EHR A; 3REB B; 2HCK A; 1A0N B; 5I11 A; 2YUN A; 4ZNX A; 2VKN A; 2KYB A; 2DX1 A; 2DNU A; 3A98 A; 4HCK A; 1ARK A; 1XOV A; 1QCF A; 2L3P A; 2XMF A; 3EG0 A; 2KXD A; 1YWO A; 2K2M A; 1ABQ A; 5L23 A; 2RQR A; 1NEG A; 3M0U A; 1GCP A; 1WX6 A; 5FWC A; 1SRM A; 2ROL A; 1JO8 A; 2E5K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3A8M B; 3CCV A; 2WSE E; 2PQW A; 3L2R A; 1SPK A; 1MUZ A; 2XDD A; 3M4G A; 2CZ0 B; 2IPO B; 3ULR B; 2HAX A; 3EFO B; 3O5Z A; 1M2V B; 5GMK h; 2L3R A; 3X28 B; 3OW2 A; 2PVG B; 1Q7Y U; 1B3Q A; 2G3R A; 5KCO A; 2DIG A; 1S72 Q; 2EQJ A; 3CCS T; 2CZ6 B; 4A4E A; 3V8K A; 2K6D A; 2OTJ A; 3RMQ A; 3CCR Q; 4C92 A; 3FEO A; 1K73 U; 4LE9 A; 1NG2 A; 1KQS P; 4PLI A; 1OV3 A; 2RQT A; 1OPL A; 5FLX E; 2WSC E; 5DLO A; 4EMK C; 3EAE A; 2I0N A; 2RQV A; 2X4J A; 3E9G A; 4OF1 A; 4PJM A; 3L2Q A; 4XU0 A; 4FYX B; 1X27 A; 2EPD A; 1G2B A; 2LJ0 A; 1HD3 A; 1IB8 A; 3VRZ A; 2RF0 A; 1G3T A; 5J3B A; 4GBQ A; 3ZBD A; 1KQS S; 4C92 G; 1X43 A; 2KGT A; 4MZP A; 2NUT A; 2NUZ A; 1QCO A; 2JM9 A; 3OMC A; 3I56 Q; 4D8D A; 1HSQ A; 3FB9 A; 1RL2 A; 2KMT A; 1IHW A; 1QCN A; 5IT9 E; 4O5V A; 3RDV A; 2J05 A; 3BFM A; 1G3Y A; 2M9U A; 2O2O A; 3M5A A; 2JJ9 A; 4M75 D; 2YWW A; 1FMW A; 2COW A; 2VWF A; 3QII A; 4XQ3 A; 1VQ6 T; 4ORZ A; 3H0F A; 1WJR A; 3MEV A; 4JJC A; 3G4S T; 1KIK A; 3A5Z B; 1BI1 A; 1WHG A; 2P0P A; 1MNE A; 5J26 A; 1RLP C; 2DL8 A; 2E41 A; 5GAM g; 3VV0 A; 2RA2 A; 3LGF A; 1BI2 A; 1IO6 A; 4C0F A; 2QEX T; 3OYE A; 4PK4 A; 4B6M A; 4KRT A; 3CD6 A; 5KYW B; 1VQO A; 4OMO A; 1YIJ Q; 4OMN A; 2JOY A; 4J9I A; 4RTT A; 1CKB A; 2ZZD A; 2K4Y A; 2M51 A; 5IXB A; 2JMC A; 2DZC A; 1I8F A; 3V7S A; 1VQ7 A; 4BB7 A; 1LJO A; 2CP3 A; 3M58 A; 1Q86 C; 4RTZ A; 4JRP A; 2DEU A; 3OA6 A; 3E19 A; 4PJO G; 1YJ9 Q; 1TTH B; 2V8K A; 1ZUY A; 3CCE Q; 4CC7 A; 2CRE A; 3CC2 T; 1ZX6 A; 4UC4 A; 3QO3 A; 1PG5 B; 1QLY A; 5LJ3 f; 1I0C A; 2KRM A; 3OB9 A; 1JB0 E; 1X2Q A; 1GFC A; 4M77 E; 7AT1 B; 3EG9 B; 1UHC A; 3M54 A; 5CQY A; 3FC3 A; 3CXC P; 4C5H A; 2X4W A; 2Y90 A; 2RM4 A; 3CBM A; 2MWO A; 2DE0 X; 1H64 1; 1Q82 C; 2LTO A; 4ZN3 A; 2E64 A; 2FZG B; 5CO7 A; 1R77 A; 1N27 A; 1M90 U; 3A8L B; 2E6N A; 2O4X B; 1PHT A; 3CCM Q; 2R58 A; 4JLG A; 1H3Z A; 2FPF A; 2FO0 A; 1WHH A; 5FRM A; 2K2V A; 3CME T; 3CCQ Q; 3RKY A; 2QA4 A; 1VQM T; 1QMC A; 4R0K A; 1RLQ C; 5LJ5 e; 3M0T A; 4WF2 A; 3CC4 Q; 2CKK A; 2ED1 A; 1NPR A; 2V26 A; 1PSE A; 2DL5 A; 1TUG B; 2EIF A; 2RJD A; 2CP7 A; 4E47 A; 2DIL A; 4FU6 A; 2D8J A; 4M77 C; 3P8D A; 4FW1 A; 1YI2 A; 3CCV Q; 3X24 B; 2XHC A; 2IVW A; 2F5K A; 2F2X A; 3CXC A; 4D6W A; 4C8Q F; 2BE7 D; 1VQ8 T; 1T0H A; 2QG9 B; 5FU7 C; 3HTR A; 5CAI A; 1UGP B; 1UGQ B; 1M8V A; 1WHJ A; 2KRS A; 3OS1 A; 2MPX C; 2AKK A; 3DLM A; 3M9Q A; 1X6O A; 4RTU A; 1TOV A; 1AZG B; 3TSW A; 5FRN A; 1OPK A; 4HVV A; 4KUI A; 2OTJ Q; 2PNI A; 4ZGE B; 2ATC B; 3H0H A; 2DK3 A; 4PJO B; 3M53 A; 4L6V 5; 2RMO A; 3G71 A; 2VYT A; 1ZSZ A; 4BD3 A; 1CKA A; 2EYX A; 4X34 A; 3MP8 A; 2ZPH B; 2K79 A; 1Z9Z A; 4AFZ C; 4ZTF A; 1BBZ A; 3OYG A; 4FT4 A; 3V7C A; 4K11 A; 2LJ1 A; 5FW9 A; 1N9R A; 2KY9 A; 3INZ A; 3OSV A; 2CZ7 B; 2GQV A; 5EG2 A; 2J6K A; 2Z0W A; 1AVZ C; 2DZ9 A; 4XTX A; 1NEB A; 4OML A; 1NYG A; 2LT4 A; 3C0C A; 3NTI A; 3PIO A; 5IH2 A; 4M7D F; 1KK7 A; 1D3B A; 2AIR B; 2DAQ A; 2JS0 A; 5CKD A; 5GAN g; 3KFV A; 4GLK A; 2PUO B; 2DL4 A; 1T3L A; 3TQ7 P; 4E7H A; 3AT1 B; 4EMG A; 1Q7Y C; 2L8D A; 1YJN A; 3LW5 E; 3QSU A; 2LCC A; 3JAM E; 1M1F A; 2O9V A; 3KXT A; 5CKH A; 2AT1 B; 3CPF A; 3UPU A; 1YP5 A; 3ZEH A; 1N8R R; 4E7K A; 4M78 E; 3SWN C; 8ATC B; 5C0M A; 2RJC A; 2K5L A; 3CC7 T; 2JT4 A; 1K73 C; 4HT8 A; 1SSF A; 4OMQ A; 2P84 A; 5LJ3 j; 4JPB W; 1Y0M A; 3CBP A; 2D8H A; 1YHQ T; 1M5Q 1; 3HP9 A; 2JUF A; 3NTK A; 3JCM e; 1BI3 A; 3MEW A; 2K7A A; 3GBQ A; 2OAU A; 1QVG P; 1YJW A; 3CD6 Q; 3VRY A; 1VUB A; 2VGN A; 4KGV B; 1VQO Q; 1HK9 A; 2MIO A; 3HKS A; 4E7I A; 5HKC A; 2RD1 A; 4ZTJ A; 1GBQ A; 4M7A E; 2A08 A; 1VQ7 Q; 2COZ A; 3RKX A; 3OMG A; 2ROT A; 3H41 A; 2DBM A; 2RHX A; 1QVG S; 5GAN 6; 3GNG A; 5LJ5 h; 4PJJ A; 4C92 F; 1UJ0 A; 1KD1 U; 4Z8A A; 1RI9 A; 4M78 B; 2XID A; 4AFS C; 3CCS A; 5D6X A; 3A8O B; 1SRL A; 4LNP A; 1VQ9 T; 1IGQ A; 4DBH A; 5GAM d; 4JJB A; 4QQD A; 4JUV A; 3GLX A; 3V7R A; 3X25 B; 4C0D B; 4RG2 A; 2G6F X; 4N4H A; 1RAB B; 3RKW A; 3F70 A; 3REB B; 3JCM d; 4LXC A; 3OYI A; 4OGE A; 2CGH A; 5CKE A; 5I11 A; 2ZPG B; 4ZNX A; 5DY9 A; 1FX7 A; 2DX1 A; 1ARK A; 1Q86 U; 1QCF A; 2L3P A; 2JVV A; 4J83 A; 3EG0 A; 4M7A B; 5GMK e; 4PFP A; 2O01 E; 3PIP A; 5L23 A; 4LD6 A; 2RQR A; 2X51 A; 5D7U A; 1QW1 A; 2E5K A; 1Y7X A; 2MI6 A; 2ECZ A; 3EGX A; 3G6E T; 2ABL A; 1K0X A; 1I07 A; 4TVR A; 4C0G A; 2QA4 Q; 3JCM W; 1YWP A; 1D1B A; 2FEI A; 3OYF A; 2B8A A; 3G7Z A; 3JCM J; 1YCY A; 4BE0 A; 2ESW A; 3M57 A; 1SHF A; 1UGS B; 3HFN A; 4RCC A; 1PRL C; 1YI2 Q; 4DA4 A; 1VQ6 A; 3ZL7 C; 3CCJ A; 4C8Q A; 3G4S A; 4AT1 B; 2KK4 A; 3GIB A; 1IRE B; 3VJP A; 3QDR B; 1D09 B; 4ZGD B; 1ZA1 B; 5A0D A; 3LLR A; 6AT1 B; 2V1Q A; 5GMK l; 2QGG A; 2QEX A; 3CMA A; 3CPW P; 2DTO A; 2YUQ A; 4EPC A; 1ZUU A; 2LCL A; 1RI0 A; 1ZBJ A; 5KYU A; 4JJN K; 4EMK A; 4C8Q G; 3EG2 A; 1M90 C; 3JCM c; 3M56 A; 4ATO A; 4J6Y A; 3OYK A; 3V8J A; 3G71 Q; 1ACM B; 2OJ2 A; 1RAA B; 1IXD A; 1YFN A; 1UHF A; 2QAS A; 4DOW A; 3CPW S; 3T9N A; 3RIR A; 3H6Z A; 1AEY A; 4HXJ A; 2NUP A; 3C95 A; 1BKB A; 2GQI A; 2FHD A; 1E6G A; 4BDY A; 1BIB A; 2VB6 A; 3CC2 A; 1ZHI A; 2L0A A; 2DKG A; 4FIB A; 1D0Y A; 4PL6 A; 1JBM A; 4IUR A; 2KVQ G; 1GXI E; 2QQ9 A; 1PWT A; 3OW2 P; 3J80 E; 1LCK A; 2LJ3 A; 4HCC A; 4M77 D; 1QP2 A; 4LUE A; 3TCJ A; 4P5N A; 1D1A A; 1YJN Q; 2E70 A; 3EG3 A; 1QQJ A; 2RHU A; 1AHJ B; 1CSK A; 1VQ5 T; 1EIF A; 2AHJ B; 2JMA A; 1NJI U; 4M7D G; 2GFA A; 2KI7 A; 3OW2 S; 2O88 A; 1UJY A; 3JB9 D; 2GFU A; 2XDP A; 4MMK A; 4JRQ A; 4DBR A; 4RUG A; 2DET A; 3PNW C; 1K9M U; 4J9H A; 4OB3 B; 2BZX A; 1AOJ A; 2K9G A; 1I5L A; 1N9S A; 3CME A; 2MMP A; 1I5O B; 4M4Z A; 2M1H A; 1VQM A; 1R0C B; 5LJ5 g; 1AWW A; 2DYB A; 3L2V A; 5CK9 A; 1BI0 A; 2MK5 A; 2DL7 A; 5GAN d; 1YJW Q; 1WA7 A; 2BZY A; 4M75 F; 1C0M A; 1TSF A; 2KYM A; 1M1K U; 1NBE B; 1M3C A; 1XTD A; 1BB9 A; 2EYQ A; 1VQ8 A; 2P0K A; 4AFU C; 3BDL A; 2QTV A; 1TUD A; 4Y28 E; 1VQK T; 2HQH A; 4C8Q B; 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