The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
GSTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Adaptor protein containing sh2 and sh3
|
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| publication title |
Solution structure and ligand-binding site of the carboxy-terminal SH3 domain of GRB2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
9
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-06-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4ORZ A; 2OJ2 A; 4Z89 A; 1K4U S; 2PZ1 A; 2OI3 A; 5FWC A; 1UE9 A; 3TSW A; 3VS7 A; 1KFZ A; 4LUE A; 4ZNX A; 1AWW A; 2XMF A; 3H41 A; 2JMC A; 2RMO A; 2J05 A; 2KE9 A; 3RNJ A; 1CKB A; 2RF0 A; 1I1J A; 2CRE A; 2F2W A; 2JM9 A; 2MCN A; 3EG1 A; 2EBP A; 2L3P A; 1ZLM A; 2EYY A; 2J6O A; 1XOV A; 2KYM A; 1RLP C; 2DYB A; 2DX1 A; 2KT8 A; 4RUG A; 2X3W D; 2ECZ A; 2CDT A; 4ESR A; 1WXU A; 2K2M A; 1X2K A; 2LQW A; 1AZE A; 1QKW A; 2M0Y A; 1MV3 A; 2G6F X; 2VVK A; 4F16 A; 5IXB A; 1AWX A; 4JJD A; 4JJC A; 1E7O A; 1WLP B; 1ZBJ A; 2HCK A; 4IIM A; 1QLY A; 1A0N B; 3EHQ A; 2K3B A; 1UEC A; 2LJ3 A; 1YN8 A; 2D8H A; 1GCP A; 1G83 A; 2C0O A; 2FPE A; 2KXD A; 2W10 A; 3TSZ A; 1OPL A; 1FYN A; 3VRZ A; 3VS1 A; 1AZG B; 1NLP C; 4JZ4 A; 1GCQ A; 1K76 A; 1K1Z A; 4KRT A; 3M0Q A; 4HXJ A; 1UJ0 A; 2DJQ A; 1UUE A; 2GQI A; 2EW3 A; 4J9I A; 1PRM C; 1WYX A; 4J9C A; 2DMO A; 2M51 A; 1H92 A; 1K0S A; 2W0Z A; 2IIM A; 2O9S A; 1WDX A; 2A28 A; 3UF4 A; 1QCF A; 3ULR B; 1M3B A; 2MIO A; 4D8D A; 1YCS B; 1M3C A; 2AZS A; 1PHT A; 2KRO A; 3M0T A; 4FSS A; 3VS4 A; 3VS0 A; 2YUP A; 2D8J A; 1RUW A; 4OMO A; 1SHF A; 2KRS A; 2GTO A; 2SRC A; 2O9V A; 2JTE A; 2EYZ A; 4JJB A; 3EG3 A; 1VYT A; 3I35 A; 2FRW A; 2A37 A; 3PVL A; 5I22 A; 3I9Q A; 1E6G A; 1LCK A; 1BB9 A; 1NM7 A; 4J9D A; 2ED0 A; 3EG0 A; 2GGR A; 3KFV A; 4J9B A; 2FO0 A; 4AFZ C; 4LUD A; 3O5Z A; 2DBM A; 2GNC A; 3UA6 A; 2LJ1 A; 1JXO A; 1ABQ A; 2CH4 A; 2B86 A; 2LNH B; 1TUD A; 3UA7 A; 4X1V A; 3QWY A; 1M3A A; 3IQL A; 3VS5 A; 2L0A A; 4A63 B; 1Y0M A; 3M0S A; 2DRK A; 1YWP A; 2PNI A; 4RTZ A; 2E5K A; 1WA7 A; 3M0P A; 2CUD A; 1S1N A; 3I5R A; 5IH2 A; 2FEI A; 3LH5 A; 1UJY A; 1GFC A; 2J06 A; 2PTK A; 1X43 A; 2C0T A; 1UHF A; 1T0H A; 2AZV A; 2KEA A; 1WI7 A; 1X6G A; 4RTU A; 2RQV A; 4F14 A; 2DRM A; 1NG2 A; 1SPK A; 1AEY A; 2F2X A; 5FWB A; 2QDL A; 1YWO A; 4EIK A; 2NUZ A; 1ZUY A; 1H8K A; 2JW4 A; 1GCQ C; 1SEM A; 1KIK A; 4D8K A; 2KT1 A; 1PKS A; 1JQQ A; 2JXB A; 4Z88 A; 1WXT A; 1YP5 A; 2DLP A; 2GTJ A; 2HEQ A; 4OML A; 1MV0 B; 1HSQ A; 2D0N A; 2DL7 A; 3C0C A; 4J9G A; 3U23 A; 2CSI A; 4JZ3 A; 2KYB A; 4AG2 C; 1ZUU A; 1AWJ A; 4AFQ C; 1SRM A; 1UHC A; 2DBK A; 1W70 A; 4LE9 A; 1UDL A; 1OOT A; 5L23 A; 3NGP A; 2NWM A; 4K11 A; 2C0I A; 1ZX6 A; 1K0X A; 1KJW A; 5GJV B; 5IHK A; 2L2P A; 1U3O A; 1QWF A; 2J6F A; 1QKX A; 2P4R A; 2DE0 X; 1BK2 A; 2H8H A; 2SEM A; 2AK5 A; 1TUC A; 2RNA A; 1GL5 A; 1AOJ A; 5IHN A; 2RQU A; 4HVU A; 1JO8 A; 1NLO C; 3R6N A; 3REB B; 1K9A A; 1QWE A; 2DL4 A; 5FW9 A; 3PE0 A; 3PVQ A; 1PWT A; 1SSH A; 1M8M A; 1BU1 A; 2BTT A; 2JS0 A; 2D1X A; 2CT3 A; 4OMM A; 1NYF A; 2RPN A; 4Y92 A; 1NYG A; 1HD3 A; 1WX6 A; 5ECA A; 2KR3 A; 1RI9 A; 2A36 A; 1N5Z A; 1AWO A; 2HBW A; 1OPK A; 2LJ0 A; 2KRN A; 1X2Q A; 2FPF A; 3JV3 A; 2CSQ A; 2GBQ A; 2JMA A; 2YUQ A; 2CT4 A; 3A98 A; 3NMZ C; 1PKT A; 2YDL A; 4HVV A; 4R0K A; 1GRI A; 2V1R A; 2BZY A; 3ZL7 C; 4F17 A; 1I0C A; 2KBT A; 4AFS C; 2LZ6 B; 1W6X A; 3H0H A; 1T3S A; 3I5S A; 3CQT A; 5IHI A; 2LCS A; 2L3S A; 4IIO A; 2CH4 W; 2KGT A; 4RTX A; 2LX7 A; 2LMJ A; 1UGV A; 1U06 A; 2EKH A; 4DEY A; 1Z9Q A; 1UG1 A; 1I07 A; 2BZX A; 1X6B A; 4OMP A; 1CKA A; 2EYW A; 3SEM A; 3NHN A; 4CC7 A; 1M30 A; 3RBB B; 4CC2 A; 3EG2 A; 1MUZ A; 2OAW A; 4WCI A; 2X3X D; 4E6R A; 1YNZ A; 5I11 A; 1G2B A; 1T3L A; 1ZUK A; 2YT6 A; 3M0U A; 3EGU A; 3GBQ A; 3EHR A; 2EGE A; 1B3Q A; 1X27 A; 2AKL A; 2DNU A; 1JXM A; 1IO6 A; 1U5S A; 2DM1 A; 2EGA A; 2ESW A; 2EYX A; 5EC7 A; 2RQT A; 4M4Z A; 1W1F A; 5GJW B; 3NPF A; 2EVR A; 4GLM A; 1M27 C; 4J9H A; 4RTT A; 1RLQ C; 1FMK A; 1CSK A; 4HCK A; 1WFW A; 2VKN A; 2DL8 A; 2K7A A; 1AVZ C; 1GFD A; 1KSW A; 2K6D A; 1GBQ A; 2FG0 A; 2I0N A; 2RN8 A; 2MOX A; 4LN2 A; 2DL5 A; 2ENM A; 1GBR A; 2JM8 A; 1H3H A; 2YUN A; 2HDA A; 3H0F A; 1SRL A; 2FPD A; 2BZ8 A; 1UFF A; 2O2O A; 4JPB W; 4Z8A A; 1AD5 A; 1UTI A; 1Z9Z A; 3VS3 A; 3VS2 A; 2O31 A; 4J9E A; 3UAT A; 1PNJ A; 1VYV A; 2CUB A; 1NEG A; 2K79 A; 4AG1 C; 1VA7 A; 1WXB A; 2RQW A; 1X69 A; 2LQN A; 4RTW A; 1Y57 A; 2DA9 A; 3REA B; 2O88 A; 1ZSG A; 3QWX X; 1B07 A; 2J6K A; 5IXF A; 2KRM A; 4J9F A; 2DF6 A; 2RQR A; 2ROT A; 5HCK A; 1SHG A; 4GBQ A; 4CC3 A; 1JEG A; 4LNP A; 1EFN A; 4OMQ A; 3SHW A; 4AFU C; 2HSP A; 2YSQ A; 2ABL A; 3VRY A; 2K9G A; 1J3T A; 1T0J A; 1V1C A; 2VWF A; 3M0R A; 2JS2 A; 4RTY A; 2ED1 A; 1WIE A; 1OEB A; 2EGC A; 3FJ5 A; 2DL3 A; 2LP5 A; 1BBZ A; 2AKK A; 2KXC A; 2EQI A; 2DIL A; 2L3Q A; 2DVJ A; 3THK A; 1OV3 A; 2ROL A; 3VS6 A; 2J7I A; 3TVT A; 3H0I A; 1E6H A; 4DEX A; 2FRY A; 1ABO A; 2F2V A; 2V1Q A; 1PRL C; 4HVW A; 1HJD A; 2JT4 A; 4CC4 B; 1TG0 A; 1VYU A; 1NEB A; 4QT7 A; 1JU5 C; 4OMN A; 1ARK A; 2YUO A; 2EPD A; 2A08 A; 4RTV A; 2KNB B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ORZ A; 1VQO A; 3E1S A; 3EGD A; 4X9D A; 3TRE A; 2OI3 A; 2QEX A; 3TSW A; 3VS7 A; 4M7A B; 4JS4 A; 3JCM c; 1AWW A; 2XMF A; 3E9G A; 2JMC A; 1TTH B; 3QDR B; 2QQS A; 2ATC B; 2CRE A; 5GAM g; 3EG9 A; 2YRV A; 2BIV A; 2DTI A; 2K5F A; 3JCM X; 1ZLM A; 5LJ3 g; 4JRP A; 1N8R C; 3JB9 F; 3CD6 T; 2KYM A; 1W2B S; 4C5G A; 1WJQ A; 4PNO A; 2ZPI B; 2FZG B; 4OMF B; 4B9X A; 3HRU A; 1MMA A; 2ECZ A; 4XTZ A; 3WXM B; 3S3N A; 5D6X A; 4FYW B; 3OMC A; 2R58 A; 2LQW A; 1OI1 A; 3ER0 A; 2Y90 A; 4IUP A; 2HNI A; 2M0Y A; 2RK1 A; 1JJ2 P; 4MDX A; 2RB6 A; 4FYY B; 2DO3 A; 4M7D A; 1VQP Q; 1E7O A; 1JJ2 A; 3RMQ A; 1G3S A; 4IIM A; 2JVV A; 1WHG A; 1QLY A; 1A0N B; 4CRI A; 1YCY A; 1S72 T; 2K3B A; 3LH0 A; 4NL2 A; 4XTW A; 4M78 E; 1G83 A; 3ASK A; 3HTR A; 3QXE B; 2CP6 A; 2W10 A; 4M7D D; 3HFN A; 1YJ9 A; 2YHT A; 3M59 A; 5KYX A; 3CCL A; 5KYW A; 4E7K A; 1GCQ A; 1K76 A; 1K1Z A; 2DD5 A; 2MWP A; 3M53 A; 1VQ7 T; 2YLB A; 4C92 C; 4J8O A; 2GQI A; 2F5T X; 1UEB A; 1KD1 U; 1WYX A; 3CCU Q; 1H92 A; 1K0S A; 2W0Z A; 1WDX A; 5C6S A; 3I56 T; 2Y4Y A; 4D8D A; 1G5V A; 2AZS A; 1I81 A; 3VV0 A; 3LX7 A; 4OF1 A; 2KRO A; 2RO0 A; 2L3R A; 4M7A A; 3HFO A; 2RHX A; 2KRS A; 3ZFJ A; 2JTE A; 4JJB A; 4C8Q B; 1K9M U; 2BE9 B; 3EG3 A; 5KCO A; 1F1B B; 2RHY A; 4M7D G; 3PVL A; 3CCS A; 1NM7 A; 4J9D A; 2ED0 A; 4J9B A; 1ZSZ B; 5IN1 A; 4QVC A; 2Z0W A; 2GNC A; 3NTK A; 4BI3 A; 3LGL A; 2LJ1 A; 1ABQ A; 2CH4 A; 2CZ6 B; 2LNH B; 1I5L A; 3QWY A; 1M3A A; 5FU7 B; 5GMK m; 2QG9 B; 3VS5 A; 2L0A A; 2ZPE B; 1YWP A; 2PNI A; 3LYI A; 3HRS A; 4HKE A; 2HAX A; 1QCO A; 4N4I A; 2CUD A; 4JUV A; 4LDW A; 3LH5 A; 1NPR A; 1KK7 A; 3OW2 P; 1LPL A; 2RH2 A; 1VQ8 Q; 1UHF A; 2AZV A; 4NS5 A; 1WI7 A; 2JN0 A; 3OW2 A; 2QA4 A; 4F14 A; 4C0Z A; 2DRM A; 4M7A G; 4VUB A; 1M90 U; 1YI2 Q; 5FWB A; 1WPY A; 4EIK A; 4PLL A; 4PJO F; 2NLU A; 5GAM e; 2JW4 A; 1VQ9 T; 5GAN 8; 1PKS A; 1WNL A; 1JQQ A; 2QQR A; 5LJ3 e; 1YP5 A; 1VQN Q; 3PTA A; 3G4S Q; 2E10 A; 3CBP A; 4OML A; 1MV0 B; 3JB9 D; 2CP5 A; 2CSI A; 4JZ3 A; 3E9F A; 2QQB A; 3OYA A; 1SRM A; 2DBK A; 3ME9 A; 5GAN f; 1W70 A; 3CC2 T; 2LCC A; 4E2F B; 3OY9 A; 4D6W A; 2E4H A; 2O4X B; 1JJ2 S; 1PG5 B; 2L2P A; 2J6F A; 4OB1 B; 2P4R A; 3X20 B; 4Z02 A; 1D0Y A; 2AK5 A; 1TUC A; 1GL5 A; 3BY7 A; 1ZSZ A; 1KC8 U; 1NLO C; 4J7F A; 1M5Q 1; 5FW9 A; 1NBE B; 2X51 A; 3PE0 A; 1BI0 A; 3FB9 A; 3PIP A; 1VQL Q; 4PJO B; 2CT3 A; 3JB9 G; 3M55 A; 1WZO A; 3OYM A; 3R6O A; 2HBW A; 1U1S A; 4IUU A; 3CCV Q; 3OYD A; 2LCL A; 4F04 B; 2LJ0 A; 1X2Q A; 2FPF A; 2EKO A; 3SFM A; 2EWN A; 2CSQ A; 3EFO A; 2YUQ A; 4A4F A; 1PKT A; 3VYH B; 3KUF A; 3M56 A; 4R0K A; 1GRI A; 3ZL7 C; 4QKU A; 1Q7Y C; 3G71 A; 3CME Q; 4X34 A; 4AFS C; 2ZAE A; 3CQT A; 3WVD B; 3QO3 A; 2L3S A; 2RHZ A; 4IIO A; 2CH4 W; 3CCE A; 2KGT A; 2LX7 A; 4C92 E; 1UGV A; 2GF7 A; 4B9W A; 4O6J A; 4WTO B; 1KHC A; 2DER A; 1MMD A; 2DEQ A; 4OMP A; 1RAH B; 4OP0 A; 4RG2 A; 4WCI A; 1VQ4 Q; 2X3X D; 2OTL Q; 3CMA Q; 1YJN T; 1TOV A; 1G2B A; 1T3L A; 5GMK e; 3EHR A; 1B3Q A; 5I2M A; 1JXM A; 1IO6 A; 1WQW A; 5EC7 A; 3BW1 A; 3WVE B; 1C0M A; 2RQT A; 1W1F A; 3NPF A; 1MND A; 2MAM A; 8AT1 B; 1M27 C; 4C0G A; 4RTT A; 2COZ A; 3L1A A; 1WFW A; 5CKB A; 2K7A A; 2KI7 A; 2D0Q B; 5KYU B; 3OW2 S; 2RN8 A; 2DL5 A; 1H3H A; 1LNX A; 4XQ3 A; 2FL7 A; 3N5B B; 2DXC A; 3G6E T; 4RCC A; 1QVF P; 2BZ8 A; 4QVD A; 1UTI A; 3VUZ A; 2LVM A; 2V26 A; 2O31 A; 4RG8 A; 4DOV A; 1VYV A; 1K8A U; 1RAA B; 3NTH A; 3JSC A; 1VQ6 T; 1VA7 A; 1IHV A; 1WXB A; 5GAM j; 2RI3 A; 4KT0 E; 3BDU A; 2F5K A; 5LJ3 j; 4OB3 B; 3CCR Q; 4ZGD B; 4M77 F; 2DZ9 A; 1FX7 A; 1R0C B; 1YJ9 T; 2J6K A; 2ROT A; 5HCK A; 4ZGE B; 3GNF B; 4OGE A; 2RD1 A; 4PJM A; 3ZBD A; 1YIT Q; 1JEG A; 4EMK C; 4DBR A; 1EFN A; 1I4K 1; 2HSP A; 2YSQ A; 2ABL A; 3VRY A; 1WHH A; 3SB2 A; 3KBG A; 1VQ5 Q; 1ZBX A; 4OB0 B; 1AT1 B; 4ZTJ A; 1RAC B; 3SWN C; 1VQP A; 1Q82 U; 3BDL A; 3CEY A; 4IKF A; 1G3W A; 3M4G A; 4KGV B; 3CCQ Q; 3FJ5 A; 2EJ9 A; 2LP5 A; 1BBZ A; 2OTJ Q; 4IUQ A; 4J6W A; 3THK A; 1OV3 A; 2ROL A; 3CC4 Q; 1QQJ A; 1E6H A; 1LJO A; 1YJW T; 4DEX A; 3CC7 T; 2DTO A; 3NTI A; 4M77 B; 1PRL C; 4HVW A; 4JRI A; 1WJR A; 2M0O A; 2JT4 A; 3CCU A; 1VYU A; 1ARK A; 5KYU A; 2HZY A; 5CCA A; 3OB9 A; 1M1K C; 4PK4 A; 2DIG A; 2A08 A; 4FL6 A; 2ZPB B; 3MHX A; 2D9T A; 4Z89 A; 3J81 E; 3OS2 A; 1JBM A; 1YBY A; 1HYO A; 1VIF A; 5FWC A; 1M90 C; 1V29 B; 2K5L A; 1KFZ A; 3OS5 A; 2RMO A; 4J83 A; 2J05 A; 2IG0 A; 4XTX A; 3RNJ A; 2RF0 A; 2JM9 A; 1FWZ A; 3OYI A; 3EFS A; 4PFP A; 1R77 A; 2L3P A; 4IUV A; 1B34 B; 2HL3 A; 3JCM f; 1RLP C; 4RUG A; 3X24 B; 3QZ5 B; 2YWW A; 2CDT A; 2QAS A; 4ESR A; 3F70 A; 1X2K A; 3M4Y A; 2YXY A; 1YIJ T; 5HY6 A; 4FCY A; 4MDW A; 4LDY A; 2QI2 A; 2E12 A; 1SSF A; 4F16 A; 4XU1 A; 2JJ9 A; 4JJD A; 1ZBJ A; 1WLP B; 1M2V A; 2RHU A; 2HCK A; 2PQW A; 3OS1 A; 3M58 A; 1UGP B; 1KC8 C; 1UEC A; 1KQ2 A; 1YN8 A; 1VQ8 A; 1GCP A; 3MP1 A; 5A0L A; 2FPE A; 3TSZ A; 1OPL A; 5CR2 A; 3VS1 A; 4JLG A; 3MEW A; 1AZG B; 1MGQ A; 1NLP C; 1YI2 A; 2DJQ A; 2BUD A; 4J9I A; 2VGN A; 2DMO A; 2M51 A; 3V7C A; 2IIM A; 4DBH A; 2A28 A; 1VQN A; 3G4S A; 1Q7Y R; 1V76 A; 2FZC B; 2X4J A; 5IT9 E; 3VUB A; 1VQK T; 3VS4 A; 1SHF A; 1I8F A; 3LWH A; 7AT1 B; 1NJI R; 4R55 A; 3X28 B; 2WSE E; 2FRW A; 2PU9 B; 2K2V A; 4F7U E; 3RDV A; 4QQD A; 4ELY C; 5GAN 2; 3KFV A; 3CD6 Q; 1AHJ B; 4AFZ C; 3QII A; 4PKC C; 5A2Q E; 1PSF A; 2RHI A; 1D1B A; 1Q81 R; 1VQL A; 3I55 T; 4WF2 A; 1RAI B; 2HMA A; 4A63 B; 6AT1 B; 2DRK A; 5KH6 A; 1WA7 A; 3HHT B; 3CCV A; 3HSB A; 2ZGW A; 2LT1 A; 2X4W A; 3L2R A; 4M7D C; 1Y7X A; 3RES A; 2PTK A; 1X43 A; 2C0T A; 1IRX A; 2KEA A; 5D6W A; 2EYQ A; 1S72 Q; 4RTU A; 5CIU A; 3OYE A; 2M02 A; 3CME A; 1GXI E; 1RAF B; 1XQH A; 4C92 B; 4LDX A; 4A53 A; 5DM7 R; 1K8A C; 2QDL A; 3TCJ A; 1YWO A; 2NUZ A; 3URG A; 4KGZ B; 1YHQ T; 4LDU A; 4PJL A; 1H8K A; 1GCQ C; 1VQ7 Q; 2RI5 A; 4C8Q F; 2JXB A; 3FRN A; 3VYG A; 2DLP A; 5DLQ E; 1WQ7 A; 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