1GHSA

The three-dimensional structures of two plant beta-glucan endohydrolases with distinct substrate specificities
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
IGVCYGVIGNNLPSRSDVVQLYRSKGINGMRIYFADGQALSALRNSGIGLILDIGNDQLANIAASTSNAASWVQNNVRPYYPAVNIKYIAAGNEVQGGATQSILPAMRNLNAALSAAGLGAIKVSTSIRFDEVANSFPPSAGVFKNAYMTDVARLLASTGAPLLANVYPYFAYRDNPGSISLNYATFQPGTTVRDQNNGLTYTSLFDAMVDAVYAALEKAGAPAVKVVVSESGWPSAGGFAASAGNARTYNQGLINHVGGGTPKKREALETYIFAMFNENQKTGDATERSFGLFNPDKSPAYNIQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords 1,3-BETA-GLUCANASE
publication title Three-dimensional structures of two plant beta-glucan endohydrolases with distinct substrate specificities.
pubmed doi rcsb
source organism Hordeum vulgare
total genus 100
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date 1993-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ghsA00
2GK1B 3DYPA 4CKQA 3M46A 2BY3A 4ATLA 3KWXA 3ARZA 1MW1A 5DEZA 4AZ5A 3GTNA 4OJYA 4AY1A 5D9OA 4FLOA 4PMDA 1JDCA 2F8QA 3AIEA 4W8LA 1XGZA 1XSJA 4H41A 3UETA 4U3AA 5A6AA 3HU7A 2Z1KA 3TTSA 1SFSA 4WSKA 7CGTA 4WSJA 3A6OA 4UR9A 3HJEA 3POHA 1EOMA 2OLHA 4J3UA 2D2OA 4S3JA 3GNRA 4AZCB 4OOUA 4JKKA 2VNCA 3EMZA 3VX1A 3TONA 1XYZA 4OBSA 3IAPA 3WDQA 2XIIA 4GPNA 5KEZA 4AZ7A 4YHEA 1MVYA 3MV11 5IFPA 4LXFA 3EDKA 2HISA 3ARRA 2A3AA 4M24A 5BXRA 4HPGA 1E4LA 1X6NA 3VIOA 4MADA 3PZIA 2VCCA 3TA9A 3VIFA 3MSGA 2V3EA 2PWGA 2J7DA 1R7AA 3ZJ8A 1TVNA 4FF5A 2CBVA 1QBAA 5AC5A 2BVYA 1PIFA 1OCQA 3FHAA 4KH2A 1C92A 2J8GA 3MKKA 2DPEA 1MWOA 2BXYA 2V5DA 3U7BA 1B2YA 5FL1A 3ARVA 5GQBA 4PCSA 5FD0A 1GZJA 2WHKA 2WHLA 4IPLA 4HOXA 4UFJA 1HL8A 1V3JA 3SCRA 1HVQA 1CENA 2QPSA 3WN6A 4JFWA 1UWQA 4CD7A 2FH8A 1NM9A 4B3KA 1C7TA 3FNDA 3BLPX 2DDXA 5E6ZA 2WW5A 2WSKA 3FN9A 3CHEA 4M56A 3T0BA 4PN2A 5D4YA 2VI0A 2JEPA 2J7BA 3QGVA 4C7GA 3AIUA 4TVUA 1TCMA 4W87A 1V3KA 1O6IA 3WQVA 3KZSA 3K46A 3N04A 3M6DA 1WAWA 5CG0A 1UD2A 1GVIA 1UHVA 1XV8A 3WQ5A 4OKDA 4BCEA 1E0XA 2A3EA 5CPSA 3VDHA 3MS8A 5EBAA 4GINA 2YKKA 5CGMA 5A6KA 3ZSSA 2WMFA 3AHXA 4XZBA 3EMQA 1H5VA 4B15A 3RO8A 4D6GA 1W3HA 4GZEA 3AYSA 1GONA 4JFUA 5E6YA 1GOKA 3RMEA 1IT0A 3ARWA 4JL2A 2AOSA 1J12A 2O9RA 4PMRA 3A4WA 2WWDA 2CESA 2WVSA 1W3KA 1BLIA 1BAGA 3SIMA 2GDUA 4TUFA 3UR7A 3FHQA 4Q22A 3WFZA 4WIWA 2BVDA 4CU6A 3W28A 4JFTA 2NT0A 3N11A 2DEPA 3ALFA 1OD0A 1CXEA 2VQUA 1UWTA 1GOMA 2WYSA 1KB3A 4JZ5A 4OZOA 2VJXA 1LF1A 4UQDA 4J27A 5A69A 1G1YA 3EYPA 1ZBCA 3VPLA 3L4VA 4PUDA 3AJ7A 1E70M 1A3HA 4R5EA 1V3LA 3S2CA 3AMLA 2YA2A 3CUHA 1MW3A 2WB5A 3CIVA 4FK9A 1UKQA 5BWFA 4CU8A 5I23A 2XVKA 2ZUMA 5DFAA 1AMYA 2WC7A 5HNNA 2JIEA 4CD6A 1SMDA 4DWSD 1GCYA 5A95A 2E8ZA 4E8CA 5I3DA 4AD5A 4A4AA 1E1FA 3SCSA 2NT1A 2WBGA 3RDKA 2ZUSA 1HJSA 3AROA 4LX4A 2O9TA 5GNYA 1JNDA 4LYQA 2EEXA 5D9NA 3IK2A 1PAMA 2BS9A 3GYCA 4HPHA 4UFKA 3OGRA 3VGHA 1UR9A 3UCQA 2VO5A 3HMCA 3PTMA 2FGLA 3G6LA 1E0WA 4GI6A 3DECA 2J77A 3AIWA 2QV4A 2BVTA 4PTMA 4P8VA 3CHCA 4KGJA 5A8MA 2CERA 1RH9A 3CZJA 1R86A 2QMKA 2DH3A 1JFXA 2YL6A 3CZLA 1QNPA 3RPMA 1H1NA 1UWSA 3CHFA 3ZOAA 1UH3A 3GDBA 1U30A 3MO4A 5CQ1A 1MQRA 1SMAA 5LA0A 2E0PA 2GJXA 1GVYA 4D1IA 1XSKA 4AIUA 1MQQA 5CJ5A 3HN3A 3W0KA 3B8SA 4E8DA 1HP4A 2DIJA 4V28A 2J75A 1GOWA 3NIYA 2XFRA 2MANA 4W84A 1EDQA 2J7FA 3T2PA 1MQPA 2XIBA 3CZEA 3PZUA 3ARXA 4D6EA 3CUGA 2OYMA 4UFMA 3SCWA 4U2ZA 4HOWA 3VIMA 1W2VA 1FH7A 2C8NA 1S46A 4K68A 4QCEA 1ISYA 3PZVA 1TUXA 2FGZA 1NP0A 4XUYA 2O92A 1H4PA 3DC0A 3W25A 2PWHA 2EPNA 3VILA 3I3DA 3OZOA 3GH5A 3CPUA 3U57A 4PSRA 5EFFA 4PEEA 5C8BB 4H8UA 4W7VA 1UZ4A 1VRXA 2CBUA 4ZXOA 3ARTA 3L4WA 1FH8A 1D3CA 2Z1SA 4NZCA 5CSUA 4XZWA 5DO8A 1UH2A 2BY1A 1CBGA 3F5KA 3VINA 1OBAA 1HL9A 2X2YA 1GHSA 1MYRA 3SCQA 4UTFA 1E40A 2E3ZA 2WK2A 1Q6FA 4MAVA 3RM4A 1JDAA 2JF6A 1UWIA 2DGAA 2W5FA 4JCLA 1Q6DA 2EBNA 3PTKA 2GFTA 5BCAA 1E4IA 3AHYA 3W4RA 3UG3A 3W81A 2JIWA 2V3FA 3PZQA 3WBAA 3QHNA 3VIJA 3LPGA 3WNKA 1V3MA 2V3DA 4PRWA 1J0ZA 2XSBA 2YL8A 3WH5A 4JAWA 2OWWA 4WLCA 3VX0A 1HXJA 1UR8A 1XCWA 4U2YA 4DUWA 4AZHA 2WKGA 1OD8A 2Y4SA 1FA2A 2ZOXA 2WLZA 2V5CA 1WDRA 3VD3A 3D3AA 5EFDA 2CNCA 5CPQA 4EAMA 3PZTA 1E4NA 1LJYA 1QW9A 3AI0A 2PWEA 1EA9C 1G9HA 1E9LA 1MW2A 1HJQA 2WMJA 2VCAA 3VGBA 4PMVA 3N12A 1AQ0A 6A3HA 5E70A 1E56A 2WZEA 4NSBA 4PMZA 1NP2A 1TG7A 3VDCA 4Z2IA 3BGAA 1NOUA 5BYWA 1VF8A 3WF3A 2E40A 2VX6A 4RE4A 1GQLA 3WMBA 3ZT5A 1JZ2A 1EOKA 3PZGA 5DT5A 1W1TA 1M04A 3KEHA 3AIBA 5CLTA 1X1NA 1V0MA 4AZIA 4F9DA 4GZIA 4GO8A 1UR4A 4HA1A 3WMSA 1H0GA 1VAHA 4BA0A 5AY7A 3AMGA 4UNIA 3VU2A 1DP0A 3AS3A 7A3HA 1CPUA 2UY2A 3K1DA 5ABFA 2VC9A 1WZMA 4WKAA 5E9AA 1BTCA 2DSVA 3W6LA 1U2YA 3PZOA 2D1ZA 4L4PA 4IISA 4QCFA 3WBEA 3WUBA 3S6TA 3VIGA 4UQBA 5M03A 2G4FA 1VFOA 4QLKA 3I3EA 1GPFA 1PX3A 1V3HA 4DM2A 1ODUA 4Q7NA 1U33A 4IM4A 3L4ZA 1XH2A 1KGXA 3O6AA 3ZJKA 5IDIA 3WQ6A 1WO2A 4LYPA 4N0RA 1E0VA 3VD5A 1OB0A 1PEZA 1BF2A 2BY2A 3FAXA 1E3XA 1E43A 5IHRA 3BC9A 4MB4A 1JXKA 4LYRA 5E0FA 3ZSTA 5JUVA 1MW0A 1OSEA 1F4AA 2D23A 5A8OA 3IJ7A 2OSXA 1B3ZA 4AEEA 3PZNA 3B9AA 2GJRA 3ECQA 1B31A 3AOFA 5FL0A 3WNOA 2CHNA 2DH2A 4HU8A 1EDTA 1ZB5A 2YOCA 3VOCA 3AXXA 4J3XA 3B9EA 2WZIA 1FHLA 4AISA 3CH9A 3L4UA 3BAIA 4PMUA 1QVBA 2YBTA 4KMQA 2WMGA 1H11A 1C90A 1QHZA 1C8YA 1HP5A 1JZ6A 1V6UA 4W5UA 3FW6A 2E8YA 3AYRA 3N9KA 5BXSA 3PHAA 4FLQA 1TE1A 4P8WA 1BVZA 1J01A 3QR3A 4OBRA 4CVWA 3OA5A 1KWGA 1KBBA 4W93A 1B3YA 2WBKA 4GKLA 2OYKA 1ISVA 2ZUTA 3VGFA 4NF7A 5ABFB 1MFVA 2UWFA 2WLYA 1JGIA 2JE8A 3MMDA 3VD4A 3EBVA 1VEMA 3WQWA 2XVPA 4X0VA 3W26A 5ABGA 1WDSA 4PTVA 2ZIDA 4F79A 1QNRA 4F9JA 4QP0A 4AIEA 4U3CA 1US3A 4DWSA 1C93A 1UQZA 1VJZA 1W32A 1WP6A 2XSAA 4IPNB 4J28A 3SUWA 1IV8A 3NDYA 1DWAM 3EDEA 1V08A 1EQPA 2G8ZA 4RE2A 3W53A 4EE9A 4PTWA 2XPKA 3MANA 2A3BA 3J7HA 1TZ7A 3CGTA 1IZKA 3K4AA 4W88A 3PZMA 1CGXA 1KCLA 2O9OA 4UZUA 3F5LA 2XVGA 3AFBA 3THDA 1E6XM 2XHYA 2GJPA 1UZ1A 1E6QM 1KGWA 2VR4A 2WWCA 1QOXA 1VJSA 2G41A 2W63A 1NWSA 2WMHA 2ZICA 4ZXLA 3OIHA 5A3HA 2IXVA 8CGTA 1DWHM 3PTQA 4H2CA 2FHFA 5A8QA 1KXVA 3MMUA 1E6RA 4KRUA 1OGBA 3W6MA 3CO4A 4UQ9A 5DT7A 4P7NA 1ITXA 5D8WA 3AIRA 3M7SA 3WDRA 2BNJA 4MTVA 3N17A 2DT1A 3W38A 1UA3A 2CHOA 4HZ6A 1KBKA 4NI3A 2DT3A 3AXHA 4LPCA 3CTTA 3N18A 1HKJA 4OOZA 1PX8A 2FHBA 1M01A 2WZHA 1JZ3A 3NCOA 4M82A 4ZE4A 1V0LA 3WF1A 1JL8A 1E6NA 1AQMA 1V02E 3WD2A 1NWUA 4D6IA 2CYGA 3T0DA 4JIEA 1H41A 5CXPA 1XH0A 4WJXA 3ZQ9A 2EPKX 2X0HA 3L2MA 4AXNA 5A6BD 1EDGA 2CBJA 4DWSB 1HVXA 3WDPP 2EPOA 1WB0A 2X09A 3SEPA 4QLLA 1HKMA 4EANA 4M80A 4WF7A 1NWTA 4DUXA 4LQ1A 2E9MA 3T2QA 3WKZA 4JFSA 1E1EA 1H49A 4GQRA 4FLSA 4P7RA 1QPKA 3BSGA 1EXPA 1GW1A 1CIUA 3WUEA 1R8LA 1H3GA 1KFWA 1NARA 4HMDA 1JF5A 1JAEA 2ZXBA 4PMQA 1E6SM 3VM7A 3SUVA 1PX4A 2YL5A 4MB1A 5A6SA 1SR0A 2C7FA 5GPRA 1VBRA 1KQZA 3I3BA 3WNMA 1W2PA 3AQUA 1J0HA 1EHAA 1QHOA 2VZTA 1B3XA 3QHOA 3OGSA 2ZX8A 2G3JA 5F7UA 1FOBA 4CGTA 4BQ3A 2XTKA 4F66A 5C71A 4AZ6A 2WMIA 2J47A 1B9ZA 1J11A 2XVNA 3FXYA 1W3JA 2J7GA 2DSKA 1HJVA 2J7HA 3AICA 2UY3A 3WIJA 1CWYA 4A3YA 4MPKA 1EO7A 3K8KA 5I6SA 2BFGA 1JXJA 4ZENA 5JBFA 4QLJA 1B3VA 3NSXA 1V6WA 3VIIA 1GQIA 1HJWA 2J7EA 2XM2A 4D72A 1K9EA 2W4XA 3RILA 2GDVA 3BCDA 1C8QA 1BYAA 3N1AA 1TR1A 3W29A 4YHGA 1WNOA 3SCUA 5CLWA 1XD1A 2CKSA 4UFLA 1CXLA 1C7SA 2ZX5A 1JD9A 1R85A 3CMGA 1K6AA 2DT0A 1KR0A 1JG9A 4KWUA 5CSYA 2WM0A 1UD5A 3N15A 2ZX9A 6TAAA 2DQXA 2XGBA 1NWRA 5A8PA 4JFVA 1KR1A 1QI3A 1HNYA 4Z2HA 4RL3A 2Y2WA 4A3HA 4PMOA 1JZ7A 2ZUWA 2UY4A 1FFQA 1VB9A 1W1YA 2EPLX 4BQ4A 1ESWA 3FAWA 3WH8A 4FMVA 2JEQA 3ZIZA 1UUQA 1K9TA 2WHJA 3AS1A 5LA2A 1GHRA 2VOTA 3AMKA 4AD3A 2WMIB 1B90A 3ARUA 1CGUA 3CLWA 5I0DA 4Z2KA 4MB3A 1BYBA 1GNXA 1JD7A 2VQTA 3WH7A 8A3HA 1NOWA 1V02A 3K8LA 3GZAA 2ZX6A 4U31A 2E4TA 4PUEA 1J0JA 3DYMA 1LG2A 1VFUA 4UOQA 5JBDA 4PYSA 4YPJA 2WCSA 3AZRA 1BYCA 2WNWA 4ZE5A 2JFEX 5A6MA 1E3ZA 3N13A 4GQQA 2YIHA 4ACZA 4XV0A 1E6PA 2VZUA 2XFFA 4J7RA 4J3TA 3WQ8A 1XC6A 4UQEA 4IUGA 3W82A 1OM0A 4UZSA 1CGYA 5BRQA 2RGLA 3MUIA 3WH9A 3SCPA 1KXQA 3VNYA 1KXTA 2PF0A 1CTNA 3NUKA 4AWEA 3CZGA 1AQHA 6CGTA 1C3FA 3RIKA 1J0IA 2ESCA 3WNLA 1MXDA 4M29A 4TOQA 2OWXA 1NH6A 5AYIA 5E09A 3WEZA 2YDRA 3WD4A 5A6JA 1ZL1A 5HOSA 1LWHA 3OBAA 1GQJA 3MMWA 2VRQA 4M1RA 4BF7A 1FFRA 4UFIA 5HXMA 3KL5A 4PMYA 4BQ5A 1RD6A 4U5IA 1I75A 5A2BA 4TVDA 2O9PA 3NSNA 4AD0A 3BAYA 2YJQA 1WE5A 4Y7EA 3ZJ7A 3VGEA 2BHYA 2J7CA 1UOKA 1XYFA 4UCFA 3VMNA 1TMQA 1XH1A 4BS0A 1WZLA 3L4XA 2WVUA 4GI8A 5M5DA 1DWFM 3WNPA 4Z2GA 1YQ2A 3APGA 4JKMA 1UKPA 2VR5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2GK1 B;  3DYP A;  4CKQ A;  3M46 A;  2BY3 A;  4ATL A;  3KWX A;  3ARZ A;  1MW1 A;  5DEZ A;  4AZ5 A;  3GTN A;  4OJY A;  4AY1 A;  5D9O A;  4FLO A;  4PMD A;  1JDC A;  2F8Q A;  3AIE A;  4W8L A;  1XGZ A;  1XSJ A;  4H41 A;  3UET A;  4U3A A;  5A6A A;  3HU7 A;  2Z1K A;  3TTS A;  1SFS A;  4WSK A;  7CGT A;  4WSJ A;  3A6O A;  4UR9 A;  3HJE A;  3POH A;  1EOM A;  2OLH A;  4J3U A;  2D2O A;  4S3J A;  3GNR A;  4AZC B;  4OOU A;  4JKK A;  2VNC A;  3EMZ A;  3VX1 A;  3TON A;  1XYZ A;  4OBS A;  3IAP A;  3WDQ A;  2XII A;  4GPN A;  5KEZ A;  4AZ7 A;  4YHE A;  1MVY A;  3MV1 1;  5IFP A;  4LXF A;  3EDK A;  2HIS A;  3ARR A;  2A3A A;  4M24 A;  5BXR A;  4HPG A;  1E4L A;  1X6N A;  3VIO A;  4MAD A;  3PZI A;  2VCC A;  3TA9 A;  3VIF A;  3MSG A;  2V3E A;  2PWG A;  2J7D A;  1R7A A;  3ZJ8 A;  1TVN A;  4FF5 A;  2CBV A;  1QBA A;  5AC5 A;  2BVY A;  1PIF A;  1OCQ A;  3FHA A;  4KH2 A;  1C92 A;  2J8G A;  3MKK A;  2DPE A;  1MWO A;  2BXY A;  2V5D A;  3U7B A;  1B2Y A;  5FL1 A;  3ARV A;  5GQB A;  4PCS A;  5FD0 A;  1GZJ A;  2WHK A;  2WHL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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