1GLBG

Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphotransferase
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
publication title Structure of the regulatory complex of Escherichia coli IIIGlc with glycerol kinase.
pubmed rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 155
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1992-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG01
3FZKA 1NGJA 1TYQA 4BGAA 2A41A 1NBWA 2IVOA 3QB0A 2Q97A 2P9KB 1U2VA 4L3QA 2PAVA 3ATUA 2YHXA 5AQYA 3VEOA 1NGGA 4IO8A 4I6MA 4BR2A 1HKCA 5CE3A 2QWMA 3H1QA 3IFRA 3MMVA 1GLAG 4NB4A 3CQXA 5LJWA 2CGLA 4CZJA 1S22A 1P8ZA 1NGFA 1JCFA 3D2EA 2P9NB 3FR0A 3M3ZA 4BRMA 1GLFO 3LDPA 4XH1A 3M1FA 4LC9B 4B1WB 5BPLA 3ZETB 3WQTA 4J8FA 1QZ5A 3BEXA 4JN4A 5AQLA 3SK3A 2A6AA 4BQLA 4JAXA 1BA0A 2FXUA 3U8XA 2QW9A 2P9SA 2E2NA 2Q0RA 3F9MA 1MWMA 2QWOA 3OHRA 1BU6O 4MO5A 3VENA 2IVPA 4BRNA 3SMSA 5B8HA 2Q1NA 2V7ZA 4CJ7A 1HKGA 5ELZA 4BRKA 3WEEA 3O8MA 3LM9A 3CETA 5AZJA 4KBOA 3GG4A 2V7YA 1BWFO 5LY3A 5AQUA 5AQXA 2V52B 4CBXA 3UKUB 2A40A 3ZX0A 4CZFA 3DJCA 3IDHA 4MLHA 3VOVA 1GLCG 2J4RA 3O1WA 3C7NA 4BRIA 3MN9A 1KAYA 3P4IA 2IIRA 1KAZA 4BC5A 2P9UB 4K25A 2P9IA 3WUHA 2QWNA 3ZEUB 3D2EB 4PL8A 4BRHA 5AQIA 5AQKA 4BG9A 3CQYA 1GLJO 3QFPA 3FGUA 4M7YA 2E1ZA 2HMPA 4Y0WA 1QQOA 3U4LA 5EX5A 4B1UB 5EY4A 4EFHA 1NGHA 2P9KA 3H1VX 2DPNA 2GUPA 5LJVA 4BRCA 4FWPA 4CI6A 2ZF5O 4H0YB 4CZGA 3ULEA 1MA9B 4PKGA 4BR7A 5KQ8A 4XH5A 1LCUA 1YVNA 1WUAA 4DCHA 5BREA 4BGBA 2ASPA 5FPDA 3QBWA 3O80A 4FWRA 4QS9A 2IVNA 2E2OA 4WQ4C 4FO0A 2HF3A 2P9NA 3L6QA 5AZJB 4E1JA 3A0IX 1NLVA 1NGBA 4BC2A 1MWKA 3ZETA 4B1VA 5AQFA 1HJOA 3MCPA 4CZIA 5F0XA 3RSEA 3EL2A 4DB3A 2GELA 3EKSA 3AARA 3M6GA 3MK6A 3HTVA 4O8KA 1HX1A 4CZKA 2D1KA 1E4FT 1S3XA 5AQJA 2KHOA 3ENOA 3C7NB 4H5TA 1WOQA 2I7PA 2QWPA 3EZWA 4FWSA 3BP8A 2FSJA 3L4IA 2EWSA 2GEMA 2YHYA 2ZWHA 2QWRA 3DXMA 5BPMA 1DKGD 1BO5O 4BQZA 5AZIB 3JS6A 1JCGA 3LL3A 5JLFA 3WQUA 3GDQA 3WXIA 3I33A 3UKUA 4BRAA 1X9JA 3KZBA 5TKYA 5JMVA 3R6MA 4H0TB 3SMPA 3VGMA 2FF6A 3ULEB 1YUWA 3CJBA 3VPZA 4BRDA 3BF3A 2ASMA 2VWBA 1R59O 2NRHA 4BR9A 2P9UA 4IJAA 3ZEUA 3SJHA 3TPQA 2Q36A 1SZ2A 2PBDA 3MN7A 1NM1A 3U9DA 4BC4A 5JICA 5AQWA 4A62A 3RSEB 3H45C 5ADXH 3W0LA 4F9OA 1CZAN 1Q18A 4B9QA 2QXLA 5KPTA 4ISEA 4CZEA 2D0PA 3MN5A 3GL1A 4FWOA 2OANA 1IJJA 1RDWX 3QFUA 3CJAA 3ENHA 3VEXA 4RTFD 3CJ9A 1KAXA 3DXMB 1SQKA 1TUUA 3GBTA 2BTFA 3A5OC 5AQHA 5AQTA 3LDNA 4MO4A 5AQOA 4Z94A 1NGAA 3KHYA 3O5BA 5KPRA 2ZGYA 1ATSA 3C0BA 3CHWA 2F9WA 5FPMA 4EHTA 1NGEA 1X3NA 4H0XB 4CBUA 4YDUC 2E1YA 3GE1A 4ISFA 1QQMA 2QWQA 4A61A 1ZBSA 3DWLA 1RGIA 1XC3A 2D4WA 2P9LB 4JNEA 3QDKA 1H1VA 1HUXA 2GWJA 3JXUA 4FPBA 1EQYA 4BR0A 4FWMA 1C0FA 5AZIA 4BG8A 1G99A 3LDQA 3O08A 5E26A 3WXKA 3LM2A 4FOEA 4BREA 2E88A 3H46O 3A5LC 3J8AA 4IJNA 3ID8A 4H5RA 3IUCA 4RWTA 4FWLA 3UE5A 2UYTA 3VETA 4CBWA 2QWLA 1JCEA 1ATRA 3HBTA 5AQPA 4H03B 3FE1A 3VEZA 3B8AX 3D2FB 4FWQA 3HM8A 1RFQA 2F9TA 3VERA 3AAQA 1V4TA 4EIAA 2HF4A 4B1XB 1GLLO 2Q2RA 3HI0A 2YI1A 4GNIA 1Y64A 2Q0UA 1U6ZA 2CH6A 2ZGZA 4K42A 2FLOA 5BN9A 2W40A 3U9ZA 2A42A 5EOYA 3UKRB 1V4SA 3ATVA 4H5NA 5FPNA 1XQSC 4BRQA 4PKIA 1LOTB 5AFUH 1HLUA 2YHWA 1Z6RA 5BN8A 4ISGA 1K8KB 4FSVA 3QBXA 3FZLA 3FFKB 3VGKA 5EXWA 4H0PA 3EKUA 4BVPA 5JLHA 3AY9A 4AM6A 5AQRA 4NO7A 1ZC6A 1HPMA 3ZX3A 3MDQA 5AQQA 1BUPA 4A2BA 5BRHA 1BG3A 2CGJA 4FWKA 2VYPA 3GOIA 3G25A 4HWIA 5BPNA 2P9LA 3TU5A 2WUSA 3SLCA 5AQGA 4XH4A 3A5NC 4IZ9A 4WQ5C 2NLXA 3WXLA 5FPEA 2E2PA 1NGCA 3FZHA 2AA4A 1GLBG 2ASOA 2D0OA 4AM7A 1TUYA 3LDLA 4K41A 3W3DA 3CJCA 4BRFA 4BR4A 3HSCA 4IWVA 2A3ZA 1D4XA 5BRDA 4PL7A 3VEWA 5ADXA 3S41A 2P9PB 3D2FA 1NWKA 1BDGA 4H0VB 3AAPA 4QS8A 1T6CA 2HOEA 3FZMA 2V51B 5AQSA 4CD1A 3CIPA 3IMXA 3QMLA 2BUPA 1HKBA 1T6DA 1YAGA 4YDUA 4K43A 3VESA 3MN6A 4H0OA 2YJFA 3O4WA 2NZTA 3VF4A 3ZX2A 3VF6A 2VCPA 4QS7A 1MDUB 3DXKA 4JHDB 3UKRA 1YXQA 1J6ZA 4JD2A 4BRPA 2E2QA 3BUZB 1OKJA 1NGDA 4CD3A 2A5XA 3QICA 4O5FA 1BOTO 5AR0A 3CI5A 4BRGA 2W41A 4H5WA 3VEYA 1QQNA 1XUPO 4GY2B 5AQMA 2I7NA 2CH5A 4B1YB 5BRFA 1X3MA 4XEIA 1TYQB 3I8BA 3VF2A 3KVGA 5E84A 1K8KA 4FOIA 1U2VB 2ITMA 3UB5A 4FWNA 3O6WA 3WT0A 4I6MB 1GLDG 5F1XA 4WQ4A 3CJ1A 3VGLA 4M7XA 4A2AA 4BVOA 1BA1A 1KXPA 1DEJA 1NMDA 4CZMA 1C0GA 4PKHA 4BC3A 3FZFA 4HTLA 2GTDA 3H6EA 3VEVA 1DGKN 4BROA 1ESVA 4CZLA 3H3NO 3EN9A 2P9SB 1E4GT 4WYBA 4EAHD 3O1BA 4IXCA 3HZ6A 1ZXOA 3DXKB 2AP1A 5AQVA 4JD2B 5KPZA 3DAWA 5BR9A 4CZHA 1SAZA 3WEEB 5F2RA 1NGIA 2P9PA 4DHYA 4H5VA 4M63C 2Q31A 4DQ8A 3A8YA 1Z05A 3R8EA 2FF3B 2FSKA 3EO3A 4EHUA 2CGKA 5I9EB 5AQNA 5AFUA 2FSNA 2YJEA 3CERA 1QHAA 4B1ZA 2H3GX 1IG8A 5EVZA 3H3OB 4BR5A 2GWKA 1ATNA 4BRLA 3BF1A 1T44A 3FLCO 5AQZA 3L0QA 4FL9A 5KQDA 4JHDA 3D7EO 4C23A 4RCHA 3WXJA 2QM1A 2E20A 2P9IB 3R9PA 4MLEA 4WQ5A 3LDOA 1QZ6A 2E8AA 3A5MC 1GLEG 4FPAA 3CJ7A 2YCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Z4HA 3FZKA 4DTOA 3QB0A 3ATUA 1CZBA 2HHHK 4IO8A 1S1TA 4DF8A 4B9VA 1FW6A 2IOCA 4NB4A 2FBYA 1C1BA 2ATQA 5LJWA 4KH6A 1ZBIA 4CZJA 1WSJA 4JKBA 1NGFA 3TSQA 3D2EA 4H8KA 1RILA 4JLHA 4DTPA 3OJSA 4BRMA 1IBLK 3I56N 4CJRA 3O9RA 5AQLA 1IKVA 3CCSN 1VK0A 3U8XA 3LPUA 2Q0RA 4LFCK 3EEQA 4GVEA 1BU6O 2YHAA 3C65A 3QIOA 4KV8A 5B8HA 2V7ZA 4CJ7A 3HOSA 1ILYA 5GAGP 5ELZA 4CJ4A 2OTLN 4FLVA 4GV3A 3WEEA 1XHXA 1QVFM 2V7YA 5LY3A 3HRGA 3HVRA 1RT3A 3P39A 3AA5X 2A40A 4ID1A 3ZT0A 2KZZA 2O8FB 4JKFA 3VQBA 3AVGA 3VOVA 1HMVA 3K5LA 4IKFA 2J4RA 3C7NA 1TKZA 3P4IA 1KAZA 3AO4A 3VQDA 1YVUA 3L2VA 4J2AA 4BRHA 4M7YA 1Q8IA 1T7PA 2HMPA 2ZQBA 5EX5A 5C12A 1BI4B 2A1RA 3H1VX 4F2SA 4CJSA 4CFCA 2D0CA 4BRCA 4FWPA 2ZF5O 3TAPA 1Q7YO 4CZGA 3ULEA 1MA9B 3BZCA 4XH5A 1YVNA 3CXCM 2YNFA 4CF2A 4MQ3A 5FPDA 4QS9A 4B08A 2E2OA 4WQ4C 4FO0A 2P9NA 2NRTA 4YOXA 2G8VA 3DM2A 3ZETA 3RTVA 5SWMA 4CZIA 4I2PA 4CJ3A 2GELA 1YI2N 4I7FA 1VSHA 4CHNA 1WOQA 2I7PA 3EZWA 2EWSA 3AO2A 2GEMA 4DFPA 1NK0A 3VTHA 1FXXA 4DUZK 1HQEA 3ZSQA 5AZIB 3JS6A 5GINA 1K8AO 4ILJA 1RT5A 1RTDA 4E7HA 1X1PA 4U7BA 3WNEA 5JMVA 3DLBA 3VGMA 4DQSA 3BF3A 1R59O 2NRHA 4IJAA 3TSUA 2D5RA 5LMNK 1SUQA 4J2EA 4FLZA 3SJHA 5FROA 3DOKA 1SZ2A 2D0AA 2JWKA 1NM1A 2PBDA 3MN7A 4FW1A 1SKWA 3SUQA 1LWFA 3LP0A 3RSEB 5ADXH 3W0LA 5KPTA 4DR5K 3RMDA 4M3XA 1B9DA 4AQYK 3ENHA 1XHZA 4CJ5A 5CZ2A 1TUUA 2BTFA 1OH7A 1JLQA 2HHVA 4TSXA 2YNGA 3LDNA 3O9UA 3AVMA 1NGAA 4NXMK 3ZSVA 2O4GA 3DRPA 4AHRA 3RVCA 2F9WA 1XI1A 4CBUA 5CY4A 4OPKA 4A61A 2O8BB 1ZBSA 4ID5A 1NK7A 4YOVA 1O13A 4CJVA 2IS3A 1JL2A 3C95A 3MECA 1HUXA 3JXUA 1S9GA 4BR0A 1C0FA 3MEDA 1NU0A 1M90O 3AO1A 3OBYA 4Z4FA 5EU7A 4LF5K 3J8AA 2B6AA 4FWLA 1L5UA 2X74A 2VGMA 3HBTA 3ISNC 4NXNK 1HQUA 5J1EA 3OTOK 3OYAA 1MU2A 3B8AX 4FWQA 1SS6A 4DV4K 1V4TA 4R79A 4EIAA 2Q2RA 1HYSA 4BY9C 3O4NA 3O3GA 2YI1A 4GNIA 3HPOA 4FJNA 3VQ9A 3CFRA 1G15A 3CM5A 4K42A 3EY1A 4BE2A 3M5RA 3U9ZA 1EX4A 1V4SA 1RT7A 1KVAA 5DM7L 4PQUA 3CC7N 2HBJA 3ATVA 4PKIA 5CYMA 5C25A 4DR4K 2I5JA 2IC3A 5DK5A 2YHWA 1Z6RA 2OZMA 5BN8A 1CXQA 1D8YA 5HRNA 3QETA 4RW8A 1TK8A 4FSVA 3VGKA 2LSNA 3KWGA 3A2FA 4CECA 4ELTA 4EP4A 4CHPA 3DLGA 3NE6A 4BVPA 5JLHA 1U47A 3OYDA 2PFUA 1HPMA 3E9PA 1A5VA 3SQ2A 3PX0A 3ZSXA 1BUPA 5BRHA 3QO9A 4CESA 2FBTA 2P9LA 2WUSA 1OH6A 1CZ9A 3NGYA 5DM6L 1C6VA 4C8LA 4CJPA 5FPEA 5I3UA 3TABA 4JKCA 2D0OA 4O0IA 4PY5A 4BE0A 3HVTA 4BRFA 5C2DA 5HROA 3J7AP 1R0AA 2A3ZA 1D4XA 5ADXA 1RBUA 1ZYQA 2NUBA 3D2FA 1HYVA 2V51B 4DTXA 3V9XA 1HKBA 4FJ9A 4CF8A 4H0OA 5GIPA 1Q9XA 5C0YA 3VF4A 2Q3SA 2VCPA 4NCGA 4HUEA 4JD2A 3PX4A 4BRPA 3HT3A 3VQ6A 1EKEA 1ASUA 5J2PA 3D0PA 3CYMA 2O8EB 3QICA 4O5FA 1J5OA 4MDAA 4FJ8A 5AQMA 2I7NA 1B92A 1Q82O 5BRFA 3NF6A 1X3MA 3I8BA 4CF9A 4KHUA 1WAFA 3PV8A 4FWNA 2Z1IA 3F9KA 3K58A 3WT0A 3KLGA 4FK4A 2HNYA 1J9AA 5F1XA 2YHBA 3CJ1A 3VGLA 2G8HA 2GX9A 5GADP 4LH4A 4BVOA 3KD5E 4DTMA 3ITHA 4WFNL 4KFBA 2QI2A 4HTLA 3ZSOA 2GTDA 1YJ9N 1J54A 5M1KA 3VEVA 4E3SA 4DWIA 3NF7A 3HZ6A 1C1AA 2AP1A 3DAWA 3MWPA 1SAZA 3WEEB 4DU3A 2Q31A 3R8EA 4C1NI 3TARA 3EO3A 3TI0A 2KFNA 2CGKA 1WSIA 4M45A 4IDHA 4DS5A 2YJEA 4IFVA 4B1ZA 3CMAN 2H3GX 5FLXO 5EVZA 1P90A 4BACA 4BR5A 2ZJQL 5AQZA 5KQDA 3WXJA 4HVJA 4B3SK 4KO0A 2QEXN 4E1MA 2E8AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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