1GLCG

Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphotransferase
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
publication title Cation-promoted association of a regulatory and target protein is controlled by protein phosphorylation.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 165
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1994-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glcG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glcG01
2YHWA 4M63C 2QM1A 4BRDA 4BRFA 3D2FB 1NGFA 5AZJA 2E8AA 4BREA 4WQ4C 4IO8A 4RWTA 4H0XB 3WEEB 4FOIA 4A2BA 2A41A 2FXUA 1LCUA 1NGIA 1TUUA 2YJEA 3ZX0A 1GLJO 2QXLA 5CE3A 4JD2B 4K25A 1XUPO 2BUPA 1KAZA 3CIPA 1IJJA 4FPBA 3G25A 4QS8A 3GOIA 1C0GA 5AQNA 3WQUA 5JLHA 4K41A 4A61A 1EQYA 3AAQA 3CJAA 3A8YA 3DXMA 3QFUA 3KHYA 1E4FT 5KQDA 5E26A 2Q2RA 3IDHA 3M3ZA 2I7PA 1V4SA 3D2EB 5BN9A 4FWPA 3D7EO 4A2AA 1KAXA 1TYQB 3VEWA 3O4WA 5BPLA 5ADXA 1HUXA 1JCEA 2P9LB 3C7NA 3LM9A 4JAXA 2FSKA 4BRAA 2Q0UA 5JMVA 1NGGA 1NWKA 3VETA 1D4XA 2IVPA 3GG4A 1NGJA 2ITMA 4B1ZA 2Q0RA 1MDUB 2A3ZA 4BRGA 4B1XB 3AY9A 4M7YA 2PBDA 2GTDA 4PL8A 2YHYA 1RGIA 5AQYA 1NMDA 2IVOA 3A5NC 5E84A 4FWOA 5KPRA 1GLLO 2A42A 2GELA 3GE1A 1HKBA 4XH5A 2NLXA 2Q97A 2UYTA 4QS7A 3ENHA 2GEMA 3R6MA 5BPNA 4MO5A 1T6DA 1KXPA 1X3MA 3ZETB 1MWKA 4PKHA 3FFKB 5KPTA 3VEXA 4CD3A 3M6GA 5LY3A 3VGMA 3SLCA 3MN6A 5F0XA 3UKUB 3H1VX 2QWPA 3R8EA 4H5TA 5LJWA 3J8AA 2E1YA 3FZKA 4K43A 5JICA 2GWJA 1ZC6A 1HPMA 3ATVA 3D2FA 3OHRA 5ADXH 4BG8A 1GLBG 2P9IB 1GLCG 3WEEA 3ZX2A 5JLFA 3FZHA 5EY4A 4FL9A 4CZFA 1NGAA 4YDUA 1DGKN 2QWMA 4JD2A 4XH4A 2ZWHA 4I6MB 5AQRA 1X3NA 4EIAA 3SJHA 5AZIB 1RDWX 3VF2A 3H45C 2H3GX 3LL3A 4H03B 4O8KA 1NGEA 2ASMA 3HTVA 1CZAN 5AQGA 4EHTA 4FWQA 1SQKA 1J6ZA 2E20A 3I33A 2QWLA 4GY2B 4O5FA 3D2EA 5AQPA 4EHUA 3RSEB 1TYQA 4BQZA 4CJ7A 2P9LA 1YAGA 3EL2A 3LDLA 4EFHA 4H0VB 3MDQA 2GUPA 5BRHA 4BC4A 4BG9A 3LDQA 1GLEG 4BR2A 2FSJA 4H0PA 4JN4A 3U9DA 1S22A 4FOEA 5AQUA 4DQ8A 4J8FA 4BRKA 2BTFA 5I9EB 3H46O 4BC5A 1K8KB 1QHAA 1HKCA 3KVGA 4AM6A 3BUZB 2ZF5O 4LC9B 1QZ6A 4IJNA 1JCFA 3ATUA 4Z94A 3HZ6A 4PKGA 3QDKA 4JHDB 4BC3A 2IVNA 5F1XA 4ISFA 1ESVA 2NRHA 3A5LC 2CH6A 1YUWA 2V51B 2FLOA 3S41A 3ZETA 5BN8A 4MLEA 2D4WA 3DWLA 3VEVA 5TKYA 3R9PA 1Q18A 2W41A 2YHXA 4CZHA 3UKUA 4BRPA 5KPZA 2NZTA 3IMXA 4YDUC 2FSNA 4H0YB 4WYBA 2HF3A 3SK3A 5FPNA 4CD1A 1KAYA 1NGCA 5AQTA 5BR9A 3U4LA 4AM7A 3GBTA 4FWKA 4QS9A 1XQSC 2P9IA 4MO4A 4H0TB 3BF3A 3L0QA 1OKJA 1T44A 4BRLA 3I8BA 4PKIA 2J4RA 4CZGA 4B1UB 3WQTA 4BR4A 3AAPA 1MA9B 3FE1A 2YCHA 2VYPA 1WOQA 4I6MA 4K42A 3VEOA 3VEZA 2P9PB 5AQHA 4E1JA 4CZMA 5FPDA 5BREA 5AZIA 1GLAG 5AQVA 3BF1A 3EKSA 5AQFA 2Q36A 2PAVA 5EX5A 3WT0A 1SZ2A 3GDQA 3VF6A 3CJ1A 1Z6RA 5AQOA 4ISGA 3DAWA 3VGKA 4IJAA 4BRCA 5B8HA 5AQWA 3MN5A 2DPNA 3FZMA 2D0PA 3W0LA 2V52B 4GNIA 2P9KB 1JCGA 3RSEA 4FO0A 4B9QA 4CZKA 5LJVA 4RCHA 3MMVA 4B1YB 1S3XA 1ZXOA 1ATRA 4KBOA 1GLFO 1SAZA 1QQOA 3B8AX 1HLUA 4FWLA 5AQKA 3GL1A 3FR0A 4HTLA 3QBWA 1K8KA 3EZWA 2QW9A 4FWNA 3VENA 1DEJA 2HMPA 5AQZA 3L4IA 1HJOA 4H5VA 1HX1A 3H3OB 3KZBA 1BA0A 3WXIA 4JHDA 3H1QA 4RTFD 4F9OA 3UE5A 3EN9A 1Z05A 4L3QA 3MCPA 2EWSA 2IIRA 1IG8A 3UKRB 2A6AA 2V7YA 3IUCA 4JNEA 3ZEUB 2Q1NA 1NGBA 3JXUA 5BRDA 3ENOA 2CGLA 2E88A 1XC3A 4CBUA 3CI5A 3CERA 3ULEB 5AFUA 3FGUA 5AQLA 1GLDG 3MN9A 3O80A 3VGLA 3O8MA 2E2PA 4MLHA 1BWFO 3LDNA 2YJFA 1NBWA 5AQMA 1WUAA 2A40A 2ZGYA 3JS6A 3WXLA 2OANA 2P9SB 3EO3A 3P4IA 2VWBA 4M7XA 1QQMA 5F2RA 2P9NB 4BRNA 1NGDA 4XEIA 2P9PA 4BR5A 1R59O 4XH1A 3HBTA 1HKGA 5EVZA 4IXCA 2A5XA 5BRFA 2ASOA 4C23A 4BROA 3LM2A 1ATSA 4H5RA 3VOVA 1RFQA 1BOTO 2QWOA 3U9ZA 2P9KA 4FSVA 5KQ8A 4H0OA 3HI0A 2P9UB 4ISEA 5FPEA 3M1FA 3VESA 1NLVA 3MK6A 3DXKB 1U2VB 4BQLA 4BR9A 3LDOA 3U8XA 3LDPA 1P8ZA 1TUYA 1YVNA 5ELZA 2ZGZA 1T6CA 5AFUH 2I7NA 2E2QA 3QICA 2YI1A 1G99A 3QBXA 1E4GT 2E2OA 4FWMA 3C0BA 4NB4A 1ATNA 3CJCA 4A62A 1BDGA 4BGAA 4BRQA 2FF3B 1LOTB 3ID8A 4H5NA 4Y0WA 4B1WB 2W40A 4CZLA 3L6QA 5AZJB 2Q31A 3CQXA 4DHYA 3H3NO 3VF4A 2FF6A 3A5MC 4NO7A 4CBWA 4WQ5C 2HF4A 1BU6O 3EKUA 2ASPA 4FWSA 3F9MA 3FZLA 2E2NA 3CQYA 5AQSA 1V4TA 3UKRA 3BEXA 3VEYA 3SMPA 4BGBA 1MWMA 4DB3A 3ZEUA 3IFRA 3FZFA 4HWIA 5EOYA 2WUSA 4WQ4A 4PL7A 3HSCA 3O1WA 3ULEA 3MN7A 2F9WA 3TPQA 4BRHA 3DXMB 3QMLA 4CBXA 3QFPA 1NGHA 1DKGD 3TU5A 1YXQA 4BC2A 3UB5A 2KHOA 1BG3A 2CGJA 5AQQA 2P9SA 3A0IX 3CJ9A 2QWQA 3C7NB 3CHWA 1H1VA 2P9NA 4CZJA 4IWVA 1BO5O 4B1VA 5BPMA 4BRMA 3H6EA 3HM8A 3WXJA 5AQXA 2F9TA 3FLCO 5FPMA 2CH5A 4H5WA 4CI6A 4IZ9A 1BUPA 4BRIA 1QQNA 3VERA 3DJCA 4BR7A 1BA1A 3O08A 2QWRA 4DCHA 4FWRA 3QB0A 2D0OA 1ZBSA 5AQIA 1U6ZA 3O5BA 2D1KA 2GWKA 1NM1A 3WUHA 3WXKA 3O6WA 4BR0A 2VCPA 4EAHD 2P9UA 3ZX3A 4WQ5A 5EXWA 4BVPA 3BP8A 3DXKA 2V7ZA 1U2VA 1QZ5A 3SMSA 3A5OC 5AR0A 2HOEA 5AQJA 2AP1A 2E1ZA 2AA4A 3CJ7A 2QWNA 1Y64A 3CETA 4CZEA 2CGKA 1C0FA 3CJBA 3W3DA 1X9JA 3AARA 3VPZA 4BVOA 4FPAA 3O1BA 4CZIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZT4A 4M63C 4Z4HA 4BRDA 1NGFA 3VA0A 5HBMA 1TKXA 4BREA 3TTFA 2NUBA 1RBRA 4N56A 4RWTA 4W5NA 1JL2A 4FOIA 4A2BA 2A41A 3RWUA 1YF5L 4CEQA 4HHTA 1TKZA 2YJEA 4DSFA 4OLAA 3T1AA 3C6AA 3V1OA 4JD2B 4JI1K 3SV3A 1KVCA 1FKPA 1KAZA 3K5OA 1NK5A 3QEPA 4QS8A 1C0GA 4ZTJA 5AQNA 3J7YP 1EQYA 3VQ5A 3AAQA 2BANA 1S1VA 2B5JA 4A5BA 2KFZA 3QNNA 2JGUA 3SBTA 3QNOA 4B3OA 3D7EO 5H1SQ 1W97L 5ADXA 1HUXA 3LM9A 5JMVA 2FSKA 1IBLK 4QCLA 1NWKA 4CJEA 4O4GA 3VETA 5M1FA 3LZIA 2IVPA 3HVTA 2G8UA 3E9OA 1NGJA 3CPWM 1RDUA 1Q9YA 1MDUB 1EXQA 5JS2A 1EKEA 3TAQA 4F2RA 4A59A 1VRTA 3VA3A 1HNZK 2GTDA 4PL8A 4FJKA 3SUQA 4FYDA 1M1KO 3P39A 2YHAA 1VAZA 5E84A 4M45A 4FWOA 1GLLO 2A42A 1KFDA 2GELA 3K2PA 3SQ4A 4QS7A 2HNZA 3ENHA 1C0MA 4FK4A 4DMNA 3ZETB 1MWKA 3CFOA 4AHCA 2OPQA 3RRGA 5SZTA 1JL1A 1TKDA 3TWHA 5LY3A 1ASUA 4X62K 3OYKA 2ZJRL 1VQ5N 2E1YA 5M1KA 1NK7A 1ZC6A 2KKZA 1HPMA 3ATVA 3D2FA 3OHRA 1U45A 2P1JA 1RNHA 5JLFA 3FZHA 5EY4A 4I2QA 1YITN 4KFBA 4CZFA 2RHKA 3V9UA 3ZSRA 1IKVA 4U7BA 1HMVA 3NVKA 1VSJA 4EIAA 2VG5A 3ZSWA 4KB1A 4H03B 5AQGA 1NJXA 2R7YA 3V9SA 4EHTA 4FWQA 1J6ZA 3I33A 3AO1A 5AQPA 4HUEA 2B6AA 3L2VA 2BH1A 4DQSA 2P9LA 4FLUA 3MDQA 4C1NI 2GUPA 4CJ3A 3OYJA 4CJRA 1CXQA 2X6SA 4DU4A 3AO5A 3LDQA 2E4LA 2FSJA 4CHYA 3U9DA 1DTQA 1HYZA 3PSIA 4BRKA 1MU2A 2BTFA 2O8BB 1QHAA 2W42A 4B3RK 1QZ6A 3OY9A 3SYZA 1JCFA 1ZBFA 4W5TA 3HZ6A 3K5LA 4BC3A 4LF4K 4NLCA 4LSNA 4DQPA 1WSGA 5BN8A 4E19A 1FJGK 5GAHP 5D3GA 4CJ4A 2HHXA 3R9PA 1Q18A 4IBNA 2W41A 2YHXA 1NG9A 2OPRA 4YDUC 2I5JA 2FSNA 4WYBA 3RMCA 1S5JA 4CD1A 3EY1A 5AQTA 4B9TA 3SNNA 3GBTA 1WAJA 2P9IA 2G8KA 4DTRA 4PWDA 3BF3A 3VMFB 5C24A 4BRLA 3CPEA 3I8BA 2J4RA 1X9SA 4DWIA 3AAPA 1TKTA 4I6MA 4LF8K 4K42A 3OYFA 5FPDA 3NCIA 4CZMA 3ZSXA 5LMUK 3OYBA 4RG8A 2QKKA 3T19A 3PV8A 1SKRA 3WT0A 3VF6A 4ISGA 4A5AA 4EZ9A 4IJAA 4TSXA 4CHPA 3EZ5A 4B9UA 3W0LA 5HRRA 3QESA 4DQQA 1JCGA 3RSEA 4DFMA 2DFFA 4RCHA 2X74A 3OVNA 4KBOA 1GLFO 1SAZA 1GOAA 4CEFA 1QQOA 3NH0A 5AQKA 3QEXA 5MLCQ 3FR0A 4GVEA 4CEAA 3O3HA 4FWNA 3VENA 1W7AA 3R3LA 4CEOA 2HMPA 4DSKA 3L4IA 1VQ9N 3AVKA 4F9OA 1BL3A 2O8FB 3VTIA 1BCOA 2A6AA 1W9HA 4QAGA 3IUCA 2UXDK 1NGBA 5DK5A 3CCJN 1NKBA 3AA4A 2CGLA 4CBUA 3CERA 1T05A 4CEDA 1GLDG 3PIOL 4YNQA 2KQ2A 1A5VA 3OYIA 1SL1A 1EWRA 4OPJA 5AQMA 3WXLA 3QIOA 3KTQA 3P4IA 2VWBA 2KFNA 5F2RA 4BRNA 2ZJQL 3E1YA 4BR5A 4FLVA 2KZZA 4M3UA 3LAMA 3THYB 1UA0A 2X6NA 1C1BA 2YV0X 4A57A 4C23A 4BROA 5LMNK 1J54A 3ZYYX 4CJQA 4BDPA 3NH1A 4E7JA 4CIGA 3DLHA 1U47A 3DLLL 1RFQA 1VQ7N 2QWOA 4IG0A 4FSVA 4M3ZA 5FPEA 3VQQA 3NGYA 4CEEA 1U2VB 3ZSYA 4CJUA 3LDOA 3LDPA 1P8ZA 4DFPA 1N8RO 2ZGZA 1T6CA 2BDPA 3L3VA 4CE9A 4X66K 4O5BA 4FWMA 5A2QO 4BGAA 1RDAA 1D9DA 4BRQA 4PA1A 3QEIA 1NU0A 4KHNA 2D5RA 2VG7A 4IFVA 3MECA 3ZSZA 3M5RA 3L6QA 4DHYA 3CQXA 3NGIA 3KLFA 3NF9A 3VF4A 3CC2N 3A5MC 3FFIA 4YORA 1RDBA 4E1MA 3EKUA 3PY8A 1NNEA 1J5OA 4OJRA 3G4SN 5C12A 3V1QA 4KHWA 3UKRA 4CHZA 3NFAA 3SMPA 1MWMA 3IFRA 3ZSQA 4DFJA 5EOYA 2D0AA 4WQ4A 3TABA 3VQCA 2A1RA 3EE8A 3TPQA 4H8KA 3KK1A 4CBXA 5I42A 3Q7BA 3PX0A 1YXQA 3UB5A 4WFAL 4IKFA 4FM1A 2BE2A 5TKWA 5J2PA 4KRFA 3CJ9A 1RDDA 4CIEA 1WSFA 3C65A 4IWVA 4B1VA 5BPMA 5KRTA 3HM8A 5IWAK 3B6PA 1S1TA 1L3TA 3O3GA 5FPMA 3LDSA 2Q3SA 4H5WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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