1GOKA

Thermostable xylanase i from thermoascus aurantiacus- crystal form ii
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EAAQSVDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKQWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVAITELDVAGASPTDYVNVVNACLNVQSCVGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQDLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
publication title Substrate Specificity and Subsite Mobility in T. Aurantiacus Xylanase 10A
pubmed doi rcsb
total genus 127
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1gokA00
4MPKA 2VQUA 4DM2A 2ZXDA 1FP8A 1V0MA 4M81A 5A8PA 5CLTA 1OD8A 2E8YA 4ATLA 5A1AA 2DEPA 1ISWA 3MKKA 2QMJA 4AC1X 4TX8A 1C91A 3GXMA 4DUWA 3VOCA 1XH0A 1B9ZA 1WE5A 3VMNA 2X05A 1HP4A 2PWHA 4KGLA 1EXPA 5GNXA 5FCZA 2CBUA 4CUCA 1HJQA 2XVKA 1BYBA 1CIUA 2ZXBA 3CO4A 3L4TA 3AMCA 4QP0A 4HOWA 1CXHA 4P8XA 4ATWA 4OKDA 4A3HA 2E9BA 4BQ3A 2CETA 2Y8KA 2YLAA 2GSJA 5HDRA 4AD4A 4XB3A 1FFQA 2BY0A 1QNOA 3ZJ8A 4ATDA 1E5JA 1BLIA 1MW0A 2VX6A 3MV11 3ARTA 5HBFA 2W5FA 3WF0A 2WHJA 3PZGA 5FKYA 1CLVA 1E72M 4NRSA 1E0VA 1JF5A 2BVYA 4WLCA 4ZE4A 1W1YA 5D9PA 1QI2A 1RP8A 5ABGA 4B9YA 5I0DA 2CCRA 1JF6A 5IFPA 4CU7A 3ZT5A 2Z1SA 3ZJ6A 3GM8A 1W9VA 4D6GA 3SUSA 1XH1A 5CG0A 3IAQA 2YDQA 1QPKA 1CTNA 3EDKA 1JZ7A 4XZWA 5AY7A 4EKJA 3CUGA 3CZGA 1OT1A 5FOOA 2EBNA 3WF3A 5I3DA 2GJXA 4M82A 2UY4A 1X1NA 5LA2A 3NSXA 3F5JA 6CGTA 5A6BA 3CZKA 3WENA 4D71A 3UR7A 3BLPX 3RJYA 4BF7A 3WFZA 1V3IA 4B16A 5IHSA 2RGLA 5BYWA 2WZEA 5EMYA 3NSNA 4MDOA 3BXWA 2YA2A 3BMWA 2WVVA 2VI0A 3BC9A 4YHGA 3PZIA 1W3KA 2YL6A 3CHDA 1Q6GA 1DHKA 1PIGA 4CD8A 1QBAA 3KE0A 4BQ4A 1DWGM 1E6SM 1ISYA 1V3KA 2J62A 2PB1A 3K4DA 2XFYA 4DWSC 1GQKA 1XSKA 1I1WA 2X0YA 2BNJA 4L4PA 4JFTA 5A6SA 1EO7A 3MU7A 1UD2A 3WELA 4UQDA 1US3A 3UETA 1CYGA 1FH9A 5IFTA 3WD3A 2OLHA 4AZ7A 4JHOA 3VILA 4HOXA 4UFLA 4CN1A 1W3JA 4HOZA 2DQXA 3GNOA 2WSPA 2XIIA 3BAXA 1VIWA 3CZJA 1ISXA 3VIIA 4OBRA 1OD0A 3K1DA 2G3MA 1XYZA 2QV4A 4LGXA 1UH4A 2PI6A 5IDIA 5LA1A 3VD3A 1GJUA 1QNPA 1MVYA 2WMHA 2DSWA 2YL8A 1YQ2A 1GW1A 1W9DM 3K8LA 2ZUVA 1XD0A 3PZ9A 4P8UA 4PMRA 4WKHA 4CU6A 4AD2A 2NT1A 3AROA 1UR2A 5CSYA 1ISZA 4AMCA 3EMZA 2DT1A 1HJUA 1JAKA 2XHYA 3ARWA 2J79A 2HVMA 4UQCA 1XSJA 1JNDA 2WMIA 1HN1A 5BCAA 4PSRA 1ZJBA 3WUGA 4OIFA 3CZLA 3B9AA 3VGDA 1B2YA 1UHVA 3W24A 1WZAA 2WBGA 2D1ZA 3K8MA 1HL9A 4WKAA 3GBEA 4UQEA 3A6OA 1UA3A 4WSJA 3WUFA 2XFRA 2PF0A 4PTXA 1W1VA 1LQ0A 3AS2A 3NDZA 1QOXA 3U7VA 4Z2IA 1XGZA 2JIEA 1B3VA 4JCMA 1OBAA 3AHVA 4DWSA 1E6NA 1EO5A 3RM9A 1US2A 1BGAA 2GJPA 1H4PA 3F4VA 1ZS2A 6TAAA 3UEQA 1CXFA 1C8XA 1KXTA 2ZWYA 1PZ2A 2DIJA 1UKSA 1ESWA 1GJWA 2OYMA 3MUIA 4UQAA 4E4PA 1E70M 1ISVA 2NT0A 1HVXA 1DEDA 2YA0A 1UZ1A 4Z2LA 2DSVA 2GK1B 5FD0A 3TTYA 3DHUA 2DH2A 3W4RA 3ARZA 5M5DA 1WAWA 4NZCA 1VF8A 3VKKA 4RE4A 3T0BA 2WYSA 4ACZB 3SCUA 2A3CA 4JFWA 3WF4A 1GOOA 5I77A 3UG4A 3ZMRA 4PBGA 4MNKA 1XYFA 4U2YA 3WH9A 1RPKA 4U3AA 1V03A 5I6SA 5DT5A 1NQ6A 1LWHA 2Y4SA 1JZ8A 3M6DA 4U31A 2QPUA 3T2QA 2XUCA 5FL1A 2O9OA 4F66A 3OB8A 1HJSA 5JIPA 1KXQA 5A6LA 4HU0A 2JE8A 1MW2A 4GI8A 2VZTA 3N15A 3NDYA 1VEPA 4P8VA 1DWIM 5CPTA 3WBEA 5AC4A 5ABFA 5I24A 1C92A 2V38A 2WB5A 3W6MA 4GIAA 4W7WA 3NSMA 4XV0A 1GORA 2FHFA 1E0WA 1UQZA 4CGTA 1JYXA 4W8BA 1XH2A 2O92A 3WQ5A 3SCRA 3ZT6A 4B3LA 3LPFA 1V6YA 3A4WA 3ARQA 5KZ6A 3KEHA 2CHNA 2J7FA 4Z2KA 3OLGA 1DWFM 1UWTA 3NIYA 4P7QA 2J8FA 3TTQA 1V0KA 1KR0A 2XM2A 3VINA 1R7OA 1PIFA 3BH4A 3VU2A 4EK7A 3WDHA 4XX6A 4C7FA 2DSUA 1NM9A 2WXDM 2VNCA 1UWSA 2O9TA 3PZTA 3VNZA 2XVLA 2EPMX 3A4XA 1Q6FA 2QLYA 1QW8A 5D9OA 4GXPA 1MXDA 3RIKA 4KWUA 3PZQA 4W87A 2G8ZA 3QOKA 3B9DA 2W91A 1R8LA 1JI1A 1UKOA 5DO8A 3EDFA 4WK9A 2W92A 2J7GA 2E40A 4AD3A 3GNRA 4CD7A 5JBFA 1IZJA 7A3HA 4H2CA 1UYQA 3T08A 3WD1A 2GFTA 3OLEA 3GTNA 4LQ1A 4X0NA 4TVCA 1V0NA 1BF2A 1NWRA 1WZKA 2ZXQA 2IXVA 3AICA 1UUQA 3ZQ9A 4AZBA 4X0VA 2G41A 4W8LA 3PHAA 1HP5A 4H8VA 4PMDA 1V3MA 4U33A 3DC0A 1KBKA 4RL3A 2OSWA 5CPSA 4F9DA 3MUZ1 1G01A 3GXFA 4P8WA 2OWWA 3GH5A 1CXLA 1JZ3A 1B0IA 4TTUA 1KWGA 1U30A 1UKTA 3F5KA 5A95A 3VX0A 1GQJA 2EXOA 3ZM8A 4M29A 1DP0A 5CJ5A 2A3EA 1QW9A 5I79A 2IXUA 2X8RA 1N82A 1G5AA 3WD0A 5E09A 2O9RA 3KWXA 3BMVA 4JAWA 3SUWA 4PUEA 1OGBA 4UZSA 1KGUA 2V5CA 5ABFB 5DMYA 2BXYA 2VMFA 4GI9A 2WCSA 3SUUA 4CD6A 2VCCA 4M24A 3WQWA 1FH8A 2DIEA 5CSUA 6A3HA 1NWUA 2PWGA 2W4XA 4D1JA 1J12A 2J77A 3CUJA 3KL0A 4TX6A 4IPNB 3AIBA 1C3FA 2ZWZA 1NP2A 3A47A 4C7GA 3W0KA 3QGVA 2Y8VA 2W62A 5C8BB 4J3VA 4JIEA 2WZHA 3AIVA 2EEXA 4LPCA 2ZUSA 4JFUA 3AMLA 2V5DA 3CMJA 2DSZA 2FHBA 2CKRA 4UOQA 3KZSA 3SCOA 2J7DA 4HZ7A 2Y24A 3ZR6A 4KMQA 3SCVA 2EPNA 1W9PA 1MYRA 1CWYA 4AY1A 1G0CA 4D6FA 3IK2A 3QR3A 5A6AA 4H8HA 3VIPA 1GNXA 2QF8A 4URIA 2CERA 2VZUA 3EYPA 2ZUTA 1V08A 2BHYA 1UKPA 3IJ8A 1E6ZA 4AYSA 4JHZA 4HMEA 4R27A 1JD7A 2WMFA 3DHPA 3IJ9A 3TA9A 4H41A 3VIFA 4PTMA 1QI3A 2CEQA 1VENA 4S3KA 3A4AA 3WNKA 4Z2GA 3N11A 1R86A 5ABEA 2D20A 4MDPA 5CGTA 3ARRA 3WNNA 4J3TA 3WFLA 5IXEA 1UKQA 3RM4A 1KGXA 2O9PA 1DWHM 1YHTA 2E9LA 2D23A 1BAGA 4IM4A 5A8OA 1JFHA 2XWDA 2DT3A 3AI0A 2BFGA 3PN8A 3UG5A 1W9UA 2A3BA 2HISA 3L2LA 2GJRA 1UR1A 3AMKA 4E8DA 1G9HA 3BSGA 2WVTA 3ARPA 3FHAA 3EDEA 1JAEA 4JFVA 3CHEA 3VIKA 4HA3A 4U3CA 2JF7A 3SUTA 1M04A 2VC9A 2VUYA 1TUXA 4HA4A 4Z2JA 1L8NA 1J11A 4F8XA 5TD4A 4W86A 3MV01 1HJVA 2YA1A 1B1YA 1ZJAA 2NW0A 2AOSA 4IISA 4N42A 1IV8A 2W67A 4AEEA 2JF6A 2CBJA 3WBAA 3WUBA 3W53A 1XV8A 4K68A 1PEZA 2EJ1A 2FH8A 1LG1A 3HMCA 1J0IA 4WF7A 3OIHA 1V6WA 2BY1A 3SCNA 2WWCA 3L2MA 3MUY1 2PBOA 1UH2A 1W2VA 4PMQA 5A2BA 4MB5A 3ARVA 2VJXA 4Y7EA 5DT7A 1SYTA 1CXEA 4B9ZA 1FOBA 1V6VA 3AZRA 1SMDA 2VQTA 1QI0A 2WKLA 3PZMA 1E4NA 2VR5A 3AJ7A 2G3NA 1IZKA 2WSKA 1E6PA 3CUHA 5BXPA 4GO8A 5EB8A 1UD8A 1W91A 2E4TA 2GK1A 3TONA 3E1F1 5BXTA 1KQZA 3FXYA 1BG9A 2RGMA 1A47A 2XGIA 1VFFA 2CHOA 1Q6DA 3WKZA 1IT0A 5BWFA 4ACZA 1JXJA 2VURA 1U33A 4V2XA 1O6IA 1LL7A 2WVUA 2ZXAA 3MO4A 1E3XA 1KWKA 3WQ6A 1J01A 3THDA 2OWCA 1GUVA 8CGTA 1ODUA 3RILA 3VDAA 2QMKA 5JIWA 3U7BA 1GVIA 4HZ8A 2YLLA 2YL5A 1AQHA 2XSBA 1TFVA 2UWFA 4W7UA 2PC8A 1U2YA 5AC5A 4GINA 4TUFA 2CIPA 4NRRA 1MXGA 4PCSA 4B3KA 2X0HA 3VIJA 1JIBA 2ZUWA 4JL1A 3AIRA 3M46A 5IHRA 4C7DA 4UNIA 2D2OA 1EHAA 1E1FA 3FAWA 1BFNA 1E3ZA 1OSEA 2XJ7A 1TR1A 2Y5EA 1C7TA 3EDDA 4Q7NA 1OGSA 1HNYA 1GONA 1EH9A 2OSXA 3OGSA 1HF6A 3SIMA 4BQ5A 1PAMA 1TA3B 3FN9A 4CN6A 4KGJA 1EGZA 2ZOXA 1MQQA 5KEZA 4AWEA 3MUAA 1UD3A 2VCBA 3SURA 9CGTA 4CCCA 3WEMA 4A3YA 1OIMA 1HX0A 3U5UA 2ZX6A 2YJQA 4GQQA 1UD5A 4JKMA 1Y7VA 1ZBVA 5GQBA 1BHGA 2XYLA 3EMCA 5D8WA 3WD4A 1EA9C 1V02A 4JCLA 4EAMA 1KBBA 4J27A 4MNLA 1H0GA 2V3FA 2FH6A 1AQMA 1E6QM 4RE2A 4OBSA 4FK9A 2XPKA 1J0ZA 3ZT7A 4CN4A 5DF0A 1JDDA 2D22A 3ALFA 4CVWA 4UQBA 2DDXA 1M03A 1WZLA 1HKIA 1R7AA 4UFMA 1CGVA 5I5RA 2GDVA 5EFDA 3EMQA 4GZJA 4FF5A 1MW1A 1XCWA 5F7UA 3CGTA 2CBVA 1BSIA 4DUXA 5A6BD 1EIBA 1JD9A 3LPOA 1K9DA 1LG2A 1A3HA 4TVDA 4OUEA 2MANA 2VRJA 4D1IA 4CCEA 2YDRA 1G94A 5CPQA 1HKMA 2WMKA 4YHEA 2E0PA 3N18A 3QHMA 4A4AA 3M7SA 3BCFA 3GXIA 1GOIA 3GYCA 3SUVA 2VR4A 3M07A 4QFUA 1D2KA 2Y2WA 1FHDA 2X1IA 2D0GA 1HT6A 4WKFA 2WHLA 2BVDA 5C71A 3CIVA 2VT0A 1PX4A 4ZE5A 4AXNA 4U5IA 4AZGA 3LPGA 1E40A 4PUDA 4PMVA 4UFJA 1VRXA 1Q4NX 1CXIA 1L0PA 1FA2A 2VVSA 5A2AA 2CESA 2XG9A 4MB4A 3NYDA 4OOUA 4CKQA 3L4VA 5DEZA 2D24A 2E8ZA 2DH3A 3GNPA 4XUYA 2VZSA 4CD5A 3WMBA 3GH7A 4ZXOA 3AYRA 1GCYA 1PZ3A 2C8NA 4NI3A 1MWOA 1W3LA 3PTMA 3CPUA 4WJXA 1UD6A 5I23A 2PWDA 5E0FA 2CPUA 1E9LA 4QCEA 2WWDA 2CNCA 1GQIA 3W28A 3BGAA 3CUIA 1CECA 5FL0A 5HPCA 2ESCA 4AZ6A 1J9YA 4PSPA 2WMGA 3OZPA 4AD5A 2XIBA 5EFFA 1C8QA 5LYRA 3CZ8A 4W7VA 5M3WA 2J78A 2QPSA 1NWSA 1KQYA 5CLWA 1WDPA 1OCQA 1H11A 2WLZA 1UR4A 1BGGA 1JG9A 3OBAA 1WDQA 4QDMA 3ZJ7A 2J7BA 3VD9A 5A94A 5DFAA 1VFUA 1MFUA 5A6KA 3ZO9A 1LF1A 2UY2A 1GOQA 5A2CA 4W84A 4ZEPA 4GI6A 5E70A 4OJYA 2XVNA 3LPPA 3N9KA 2WC4A 1JDAA 5CXPA 4D72A 4HP5A 2EPOA 1R87A 3W82A 3WL0A 1UG6A 1B3XA 2CBIA 5HNNA 4J3XA 4RE3A 5A8NA 1FH7A 3L4YA 4PMXA 4NSBA 4DWSD 1SMAA 1KGWA 2WBKA 3VM7A 4PTWA 3OGVA 2AAAA 4UOJA 1FP9A 4MJ4A 2TAAA 1WNOA 4D6HA 1SR0A 5E9AA 4W93A 1JZ4A 1V3JA 4F9JA 5A6MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MPK A;  2VQU A;  4DM2 A;  2ZXD A;  1FP8 A;  1V0M A;  4M81 A;  5A8P A;  5CLT A;  1OD8 A;  2E8Y A;  4ATL A;  5A1A A;  2DEP A;  1ISW A;  3MKK A;  2QMJ A;  4AC1 X;  4TX8 A;  1C91 A;  3GXM A;  4DUW A;  3VOC A;  1XH0 A;  1B9Z A;  1WE5 A;  3VMN A;  2X05 A;  1HP4 A;  2PWH A;  4KGL A;  1EXP A;  5GNX A;  5FCZ A;  2CBU A;  4CUC A;  1HJQ A;  2XVK A;  1BYB A;  1CIU A;  2ZXB A;  3CO4 A;  3L4T A;  3AMC A;  4QP0 A;  4HOW A;  1CXH A;  4P8X A;  4ATW A;  4OKD A;  4A3H A;  2E9B A;  4BQ3 A;  2CET A;  2Y8K A;  2YLA A;  2GSJ A;  5HDR A;  4AD4 A;  4XB3 A;  1FFQ A;  2BY0 A;  1QNO A;  3ZJ8 A;  4ATD A;  1E5J A;  1BLI A;  1MW0 A;  2VX6 A;  3MV1 1;  3ART A;  5HBF A;  2W5F A;  3WF0 A;  2WHJ A;  3PZG A;  5FKY A;  1CLV A;  1E72 M;  4NRS A;  1E0V A;  1JF5 A;  2BVY A;  4WLC A;  4ZE4 A;  1W1Y A;  5D9P A;  1QI2 A;  1RP8 A;  5ABG A;  4B9Y A;  5I0D A;  2CCR A;  1JF6 A;  5IFP A;  4CU7 A;  3ZT5 A;  2Z1S A;  3ZJ6 A;  3GM8 A;  1W9V A;  4D6G A;  3SUS A;  1XH1 A;  5CG0 A;  3IAQ A;  2YDQ A;  1QPK A;  1CTN A;  3EDK A;  1JZ7 A;  4XZW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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