1GW1A

Substrate distortion by beta-mannanase from pseudomonas cellulosa
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
376
structure length
375
Chain Sequence
KPVTVKLVDSQATMETRSLFAFMQEQRRHSIMFGHQHETTQGLTITRTDGTQSDTFNAVGDFAAVYGWDTLSIVAPKAEGDIVAQVKKAYARGGIITVSSHFDNPKTDTQKGVWPVGTSWDQTPAVVDSLPGGAYNPVLNGYLDQVAEWANNLKDEQGRLIPVIFRLYHANTGSWFWWGDKQSTPEQYKQLFRYSVEYLRDVKGVRNFLYAYSPNNFWDVTEANYLERYPGDEWVDVLGFDTYGPVADNADWFRNVVANAALVARMAEARGKIPVISEIGIRAPDIEAGLYDNQWYRKLISGLKADPDAREIAFLLVWRNAPQGVPGQVPHYWVPANRPENINNGTLEDFQAFYADEFTAFNRDIEQVYQRPTLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords MANNAN ENDO-1,4-BETA-MANNOSIDASE
publication title Substrate Distortion by a Beta-Mannanase: Snapshots of the Michaelis and Covalent-Intermediate Complexes Suggest a B2,5 Conformation for the Transition State
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas cellulosa
total genus 152
structure length 375
sequence length 376
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2002-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1gw1A00
2DQXA 2GJPA 3WELA 2UY2A 3AS1A 3RJXA 1K9FA 1CGVA 1HVXA 1ISVA 3CZ8A 3RO8A 4C7DA 1XH2A 3SCNA 1V02A 3VOCA 1CNVA 3K46A 5HBFA 1EHNA 4UFLA 1CLXA 4M24A 1QI5A 3T2QA 5I77A 1OGBA 2XIBA 1UWSA 5LYRA 2QMKA 1CEOA 5DEZA 4EE9A 2TAAA 3WF3A 1J18A 5IFTA 2WMIA 5A1AA 3U7BA 3AZSA 4RL3A 3B9DA 4ZXOA 1LG1A 1CGTA 1NWRA 2C7FA 4HOXA 4AZCB 1EO7A 3OIHA 1KBKA 3OLEA 4J28A 3GXMA 2NT1A 1ZBCA 3VIPA 2G3MA 3SCVA 3VIFA 2XYLA 4DWSA 1NP0A 2DIJA 5HDRA 2VZOA 5E6ZA 3WH9A 2WLZA 3AIRA 1G01A 1GOOA 5LA1A 2WMFA 1W3LA 1HJUA 1ZBVA 5I2UA 3T09A 3OLGA 1MYRA 4W85A 3N9KA 1J0YA 1MW2A 3OLDA 3ZJ8A 4Z2KA 4MPKA 3QHMA 1W32A 1OWQA 1VFFA 1HKKA 3AHZA 4W5ZA 5AY7A 4P7QA 1LF1A 3IJ8A 2DEPA 3SURA 2J8GA 3U5UA 4AD1A 3BAWA 4HZ7A 2XVGA 4UFKA 1MW1A 1VB9A 1BYBA 3B8SA 4D72A 2WWCA 1WZLA 3TTSA 5CG0A 4AEFA 5IHRA 3VMPA 3RMEA 4D71A 4AZ5A 5ABFA 2GFTA 2A3BA 2Y2WA 4MNJA 2WMHA 3PZQA 1ODUA 2JEQA 3EYPA 1JZ4A 4HZ8A 3CZJA 2CXGA 1SR0A 4Y7EA 1UR8A 1E43A 1GNXA 3AQUA 4W84A 2OWCA 1BLIA 1M7XA 4D6HA 4GKLA 2YDQA 2A3CA 3WMBA 4ZFMA 3HN3A 1V6YA 2X05A 3T0DA 1E4LA 3ECQA 1E0VA 4UFHA 3HU7A 1FA2A 5AC5A 2YIHA 1WB0A 4V28A 1JL8A 4QLKA 1PAMA 5I24A 3IAPA 4N0RA 4D6JA 2FHFA 5AYIA 2XGIA 1R7OA 2YA0A 2ZX5A 4XZWA 3OZPA 4HOWA 3L4VA 1G94A 1FP8A 1W3HA 3OZOA 1UKOA 1MXDA 2ZXBA 3BC9A 1E5JA 3KWXA 3K8LA 3QHNA 1UD6A 1TA3A 1UR9A 1VFMA 2VTFA 3WDHA 1PIFA 2WCAA 4TVDA 3PZOA 1KXQA 2RGMA 5GQBA 1D3CA 3CO4A 4CCCA 3ZT7A 1Q6EA 4N42A 1J11A 3DC0A 2DSKA 2OLHA 3BAJA 3BMWA 3AS0A 1EDTA 3FNDA 4RE3A 1SFSA 1CIUA 4GINA 1NOWA 3EMCA 1LJYA 3A6OA 1GPFA 1XYFA 1XD1A 4P8WA 3W37A 2F61A 3CZEA 4QLJA 3VGGA 1O7AA 5IHSA 5CSUA 4AIUA 3BCFA 1XC6A 4JHOA 4OZOA 4AIOA 4FLOA 3QOMA 1GQKA 1EH9A 1VBRA 4X9YA 1MQPA 1C8XA 4ATWA 4AEEA 5CGMA 2VCBA 1BSIA 5FD0A 2VX4A 1UA7A 2YA2A 5D9OA 3TONA 4JIEA 1MQRA 3G6LA 1CXKA 1K9TA 2QPSA 3AXXA 3THCA 1KGUA 1QHPA 4D6CA 3WD1A 3ARSA 4LYPA 3CUJA 4M56A 3FAXA 1OB0A 5BROA 5JBDA 1ZL1A 2VNCA 2WC3A 3VKKA 3VIIA 4URIA 1M04A 4D1JA 1OD0A 2JF6A 3GH4A 2DSVA 1BHGA 4U5KA 3WF0A 4F9JA 2WHMA 3UESA 5GNYA 2DT0A 2JEPA 3VGBA 4PN2A 4UQBA 3OLIA 2WZIA 3WN6A 1KGWA 5TD4A 1ZBWA 2WC4A 1H0IA 3RILA 2DSZA 3RPMA 2D2OA 4OOUA 2YLLA 5DMYA 2J7CA 4FF5A 2FHCA 2WCGA 3MV11 3IK2A 4NF7A 2GSJA 2O9OA 3W38A 3M7SA 5A94A 4FLRA 3WEOA 5I79A 1BYCA 2VZSA 3CPUA 4HU8A 2V3FA 2ZX8A 2E4TA 4TX8A 2A3HA 1XRVA 3N18A 4AZ7A 1TFVA 3CZLA 5CLWA 3ZJ7A 1C8QA 1UD2A 3WDIA 2VRJA 1WCGA 4CN4A 1CGUA 1EGZA 1QVBA 2BHYA 4ZE5A 1W1PA 1BVZA 1PX3A 2VJXA 3UCQA 4Z2GA 1WDPA 5GNZA 5M03A 1K9DA 2VCCA 3LPFA 3AROA 4GIAA 1ISXA 4TX6A 1E4MM 3CLWA 4AZCA 2ZUTA 1BAGA 2GJXB 5I23A 2WANA 5HXMA 1TZ7A 3OB8A 5D9MA 3BSGA 1FHDA 2WVUA 3SIMA 5A6KA 2V3DA 4PMDA 2ZUNA 4PCTA 4X0NA 4A4AA 2V5DA 3POHA 3CBWA 1GUVA 3MMWA 2ZWZA 4J27A 4AIEA 3SUTA 3KL5A 2WK2A 2GVYA 3GXFA 1JI2A 4J3WA 3K8MA 1A47A 3A4AA 3MUZ1 8CGTA 1ZJBA 2XVKA 1BVNP 1H1NA 3N12A 3PTQA 4HMCA 3PHAA 2J78A 3PZMA 1AQHA 3WNMA 3ARTA 4S3JA 2X0HA 1OIFA 1JD9A 5BXPA 1CGYA 3ZT5A 2XM1A 2XSBA 3WQWA 1V3LA 4CD4A 2D24A 3RDKA 4JFVA 2CBJA 4WK9A 2BV9A 1XHGA 2J62A 4JCMA 1H41A 4AWEA 1AVAA 3WFLA 4DWSD 3I3BA 3WD3A 3ZT6A 2DIEA 3WMCA 1HIZA 3N1AA 4P8VA 4W7VA 1HXJA 5E6YA 2C8NA 2WC7A 4DM1A 1OBAA 3O9NA 4RE2A 5E0CA 1JIBA 4PMUA 5GNXA 1BYDA 3T0BA 3T2OA 3AJ7A 2J75A 3RM8A 2V38A 4MJ2A 1HJQA 4KGJA 4W7WA 1GW1A 1B3VA 4PTMA 3WQVA 2DDXA 1JXKA 2CKRA 4PTXA 4BS0A 4D6GA 4JCLA 4UFMA 1UKTA 3CGTA 4JFUA 1UH2A 2X8RA 4AZBA 1E4IA 1L8NA 3L4UA 3UG3A 1JZ8A 2YKKA 1DEDA 5A8MA 3GXIA 3WH5A 4CU7A 1B31A 4NZCA 2O92A 1LL7A 2PI6A 4TVUA 2EEXA 4JFSA 2VRKA 3F5JA 1OIMA 1PZ3A 4W87A 1J9YA 1B9ZA 1DP0A 3MUIA 5A8NA 4L4OA 1U30A 1TG7A 4W5UA 5CPSA 4H7VA 2EPMX 2FGZA 4AZIA 4TVCA 2J7GA 4CU6A 1WP6A 3CHEA 3K8KA 2ZX6A 5IFPA 5IDIA 4R27A 3WSUA 4A3YA 2ZE0A 3W6LA 4LXFA 3EBVA 3MS8A 1ITCA 2Y5EA 4AISA 2CPUA 1P6WA 2WNWA 4BQ3A 2WVVB 3OG2A 1XYZA 1QOXA 3VGDA 5D9NA 1KQYA 1GOIA 1XH0A 2BXZA 1V6WA 3TTQA 3DHPA 2ZUMA 1NWTA 1BTCA 3M07A 4D1IA 1FHLA 1BG9A 3WNLA 2DSWA 4QLLA 1PZ2A 1YHTA 2PF0A 3AHXA 3KL3A 1HP5A 2D3LA 3BMVA 5GPRA 4E2OA 1NOUA 2WHJA 2D1ZA 2CEQA 1EQPA 2BNJA 1MQQA 3F4VA 4KH2A 1GQIA 3MMUA 1TMQA 4CGTA 1E6XM 5CGTA 2BY0A 3GM8A 1E56A 5HPOA 3PZIA 2QPUA 4QP0A 2WPGA 4DWSC 3GZAA 3BLPX 2DH3A 1CXEA 3A4XA 4J3UA 2BVDA 4D6EA 1KXVA 4JFTA 5CZKA 1CXHA 3QGVA 4GO8A 2BHUA 3GTNA 1KXHA 2VX7A 1ECEA 2D0HA 4KRUA 3DYPA 2Z1KA 3OGVA 1W9UA 3AISA 3ZOAA 1JZ3A 2W66A 3VIJA 1J0JA 2O9RA 4PMVA 5CPQA 5E09A 5A6BD 3SUUA 3FHQA 2YBTA 5A6MA 4MB4A 2CESA 4AYSA 1B90A 5EFFA 3WDPP 1JGIA 1TUXA 3AIUA 4HA3A 2WBGA 5FL1A 3VINA 1RP9A 3AZTA 4C7GA 5A8OA 4WF7A 3PBGA 2VZTA 1V0NA 5CJ5A 5BYWA 1Z32X 2GDVA 4TTUA 1K6AA 1CYGA 3CUGA 3AIWA 3VDAA 4TOQA 3GNRA 1E5NA 4OBRA 3M46A 1E9LA 3AIBA 4MNKA 4QAWA 3AFBA 2VX5A 4CD8A 1V3JA 3ARRA 3WD0A 1CGWA 1AMYA 1LL4A 1R7AA 4ML4A 2PWFA 3OA5A 4W93A 3AYSA 4YPJA 1W2PA 5HOSA 3L4WA 3WQ4A 2VR4A 2YLAA 4UOJA 3VX1A 1OGGA 3PZVA 3L2LA 2BY1A 4V27A 1UWUA 5C71A 2GDUA 1WZAA 3KE0A 2ZX9A 1IZJA 1WO2A 1HJWA 1UWQA 5D8WA 1H2JA 1CENA 2VC9A 3RIKA 1TCMA 2YL9A 2X2YA 4BQ4A 1V3IA 4MTVA 3GBEA 5I3DA 2X0YA 1U2YA 1Q6GA 4UZSA 2G3NA 1JFXA 1WKYA 3WBEA 3BGAA 1PJ9A 2OSXA 3AMLA 3WQ5A 4MDOA 2G4FA 3OGSA 5EFDA 1ESWA 1PPIA 1VEOA 5KZ6A 1GQLA 3NDYA 1HVQA 2VURA 3VNZA 2E0PA 1BFNA 1FH9A 1WAWA 1B3WA 2BS9A 2Y8VA 2D23A 4XX6A 1W9XA 2VRQA 3NYDA 1EDGA 2VZUA 1L0PA 3KL0A 3WDQA 1V3KA 1HL9A 1IT0A 5I6SA 1A3HA 2VO5A 4ATDA 3WDRA 1XH1A 2C0HA 3TA9A 2G8ZA 4OUEA 2XWEA 1E6SM 1QNQA 4PBGA 1US3A 3WUGA 1M03A 1E55A 3AICA 3PZGA 4J3SA 1VEPA 3VX0A 4UQEA 1N82A 4QDMA 2AMGA 3ZQ9A 1GJUA 4Z2LA 2E9BA 2PWGA 1I1XA 3ZM8A 4J7RA 4HA1A 1W9VA 4ZE4A 1HNYA 2Z1SA 2ZICA 3CUHA 1MXGA 4OBSA 4CVWA 3CTTA 4BZYA 2AOSA 4PUEA 2XIIA 2GK1B 3GDBA 1Q6DA 2VMFA 3CMJA 4PMNA 4J3TA 3WENA 4GI6A 4GZIA 1UD5A 3N17A 3WL0A 4PRWA 3WQ8A 1JF6A 2YL6A 4UQDA 3AZRA 2UY3A 1WNOA 4JHZA 2CHOA 3WQ6A 4MADA 1XSIA 4NI3A 3VIKA 3PZTA 1I1WA 1XV8A 2XVLA 1JZ7A 1EO5A 3VUPA 1Q6FA 3VIMA 5JBEA 4M8UA 3AIEA 9CGTA 2ZUUA 1JDDA 3BXWA 1XCWA 1CPUA 1KFWA 5M17A 2EBNA 5E9AA 1VBUA 4GPNA 1JFHA 3FXYA 1CWYA 4NRRA 3W81A 4CCEA 4YHEA 3SUWA 4ACZB 1V0KA 4GQQA 3SCOA 1JI1A 4WLCA 2WMJA 3LMYA 4ZXLA 1LWJA 3F5KA 3ZO9A 1RH9A 1QW8A 3WH8A 2E8ZA 4Z2HA 4ZEPA 5A69A 1QNRA 2J7DA 6A3HA 2WVVA 4JZ5A 2W4XA 1C92A 2XWDA 1JAKA 1E70M 1V6XA 2JIWA 5KEZA 8A3HA 3WUEA 1XD0A 1V0LA 3O6AA 3B9AA 3UR7A 3E1F1 1DWHM 3GNPA 4WSJA 3ARQA 4QCEA 3VTRA 6TAAA 1GJWA 3AXIA 2PB1A 5HPCA 1QI2A 2FHBA 3AHTA 1V08A 1HKMA 1WE5A 3L4XA 3ARPA 3D5HA 1R85A 1QI3A 1V6UA 3TTOA 1E3ZA 3HMCA 2XSAA 1DHKA 2WCSA 3ZR5A 1CXLA 5AYBA 1JNDA 3QR3A 1HP4A 5BWFA 2DT2A 4KMQA 4D6FA 3IJ7A 2WVSA 3A47A 3AS3A 4KRTA 3VM7A 1MWOA 4PMOA 4B9ZA 3AHVA 3VNYA 2A3EA 2VUYA 2YA1A 4AD4A 1UR4A 5ABFB 5ABEA 2WB5A 2FH6A 1VJSA 1Q4NX 1NWSA 1JD7A 3MKKA 2V5CA 1OINA 1OSEA 1UZ1A 2W62A 5CSYA 3WNKA 1NWUA 4AD5A 2J7EA 2BVTA 2WWDA 2UY4A 4CN6A 4MB5A 2AAAA 3N11A 1UWTA 3WF4A 5LA2A 3ARZA 4WSKA 1ZS2A 3HJEA 5BXRA 1W3KA 2DT3A 1OT2A 5C70A 4BA0A 4AD2A 5I78A 3BAKA 2QHAA 3T08A 3ZSSA 2PBGA 1E6QM 3WY1A 4H8VA 1G1YA 4JL2A 2J7BA 4XV0A 4WIWA 2F8QA 3UG5A 1GHSA 5A6LA 2OWXA 2OSYA 1G0CA 2CBIA 4NRSA 2WZHA 1MFVA 1VIWA 1WDRA 1C8YA 3AMGA 3O2LA 2OSWA 3VD4A 1FOBA 2Y8KA 2XJ7A 2Y24A 2RGLA 1CGXA 5M5DA 1JYXA 1UR0A 3NDZA 4P8UA 2EPLX 2VVNA 3VIGA 3U57A 1C7SA 2YBUA 3AXHA 1MW0A 4H2CA 4K68A 1YQ2A 2W91A 4M81A 1DWAM 1CXFA 3MO4A 3BAXA 2VI0A 1GVYA 3TTYA 2CETA 1JG9A 4J3VA 1PBGA 1AQMA 1QI4A 5A6SA 1IV8A 3AS2A 1B2YA 2WKLA 2XGBA 1G9HA 1B1YA 1RD6A 1HKIA 5A2AA 1KCKA 1R86A 2XVPA 1JXJA 1UQZA 3GBDA 2D22A 3ZJKA 1H5VA 1EDQA 4HP5A 4C7FA 1XCXA 3VMOA 4IPNB 1W9BM 2JF7A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DQX A;  2GJP A;  3WEL A;  2UY2 A;  3AS1 A;  3RJX A;  1K9F A;  1CGV A;  1HVX A;  1ISV A;  3CZ8 A;  3RO8 A;  4C7D A;  1XH2 A;  3SCN A;  1V02 A;  3VOC A;  1CNV A;  3K46 A;  5HBF A;  1EHN A;  4UFL A;  1CLX A;  4M24 A;  1QI5 A;  3T2Q A;  5I77 A;  1OGB A;  2XIB A;  1UWS A;  5LYR A;  2QMK A;  1CEO A;  5DEZ A;  4EE9 A;  2TAA A;  3WF3 A;  1J18 A;  5IFT A;  2WMI A;  5A1A A;  3U7B A;  3AZS A;  4RL3 A;  3B9D A;  4ZXO A;  1LG1 A;  1CGT A;  1NWR A;  2C7F A;  4HOX A;  4AZC B;  1EO7 A;  3OIH A;  1KBK A;  3OLE A;  4J28 A;  3GXM A;  2NT1 A;  1ZBC A;  3VIP A;  2G3M A;  3SCV A;  3VIF A;  2XYL A;  4DWS A;  1NP0 A;  2DIJ A;  5HDR A;  2VZO A;  5E6Z A;  3WH9 A;  2WLZ A;  3AIR A;  1G01 A;  1GOO A;  5LA1 A;  2WMF A;  1W3L A;  1HJU A;  1ZBV A;  5I2U A;  3T09 A;  3OLG A;  1MYR A;  4W85 A;  3N9K A;  1J0Y A;  1MW2 A;  3OLD A;  3ZJ8 A;  4Z2K A;  4MPK A;  3QHM A;  1W32 A;  1OWQ A;  1VFF A;  1HKK A;  3AHZ A;  4W5Z A;  5AY7 A;  4P7Q A;  1LF1 A;  3IJ8 A;  2DEP A;  3SUR A;  2J8G A;  3U5U A;  4AD1 A;  3BAW A;  4HZ7 A;  2XVG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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